Block details | |
---|---|
fasta | C_difficile_CD00035_1A_022456.fasta |
contig | u00000crpx_c_022456 |
start | 3388050 |
length | 16898 |
strand | + |
type | core |
seq | aattgaaacttcactatctaataatttaattaatgagatgctattacatttatctatttc ataaccaccataaatcccaggtgttgaatttataaatataccagcttgctctaaatacat cttgtaactttttatttgcctttcacttacttccaactcttctgataattctttgcattt cattttgcctctgctttgaattaatatcatcattctaagtgtattagctaatttactaat gagtaacccccccctaataacattaattgatatttttattatttatttctacacatatgt acatataacctctttatattttatataagtagaatttttttataattttgacatttacca tattatattttatatttgtacaaaattttaatagttaatacaataaaaaatattactgaa aaaataaacatctataattccagtaatattaattaattttaaaccctttttattatcatt taataatagtaactaaaaattgactaaatttaaccttatctcttttaaataattatttct tacaattaaaaaataaactatttgaaccaagaacaagcttcccattaccaaaacagctga tgatgctacttctatatcaaaagaatttttaagtgcagtaagtgcaaatattgaatgtat aacagccactacataaggaaacaaaaatactattccaatctcaattgttgaagctttttt aatctcattatatgtcatacccaatttatttaactgttcatactttttcttatcaacttg gcaatccatataaaatttattatataaaaaactacttgtggtaacaaagaaaattaaacc tataaatattgctaaaaatataaatgtagaatacattaatttcccagttcctatcattaa ttctttagagaaaaacaaatatggttgcatccctgactcattattaaatttattttcaaa ttctctgcatatctctatagttttacttgaatcctctacttcaaatgcagtaaatctatc cactataaattttgattctatactatcataaaaattatcctttaccacatacatattttt gtaatatgctggcataacacattcttccacttgttttgccacctttaaacctctattccc tacaataatattttctttgacgttcttatttcctggtaaacttgatgataataatgatat acattcattatcttcaaaacttataggcttaatccctatagtttctgtaatttctaagta cttagattctttcataattctgacattaaaatcacttttcttgggaaatacagttttaaa ttcaccattaatccttgtatagtctacattctctttttttagattattttctataaacat cattctttccttgtctttttctttgctatcaggctttttagtgtcattatgcaatgtcat tgttgaataatatattgtgttaggatatattaaattaatttgacgctctacatctttcca aaaggaataaactgtacctatagcagtaaatgccactgcagaagttatagttatcaagaa aaatattctagcattatcctttaccttataaatcaagttcgaaatccaaagcatatttgt attttttctataaaatctcttgtttaattttagcttcttcataaaaaatacactaaattg agaaaagaacaagtaagttgctactatagtaagggatgtaactggaactaagcgcagata tgttgtatattggtcggttgaggtaatagcattataatacgctattataaacaaacaaat acttaatatagcaagcattagtgatgttttaggctctggttttggagtttttgtaccttt aagtaacttcaacacctgattttctttaactataaaagaagtaaatattgatgttaatac agctaaaatcataaaatagattaaagtagacaatatcgcattaaatggtatatagaattt taatggcgataattctaaaaaagtagacataaccactaaaaatatctttgcaaagattaa gcctattattattccaattacagaagatactatatttattatcatattttctataaagat taatttcattacttggcgctttgatatacctgtaatataaagtattccaaattctttata tctacttttaagaaacacactaactgaataaaacacaaagaagaataagaatagatatgc aattatcttactcatcttgagaccttcttttaaataatcaggaaattgagatacatctaa atctggatgacttgtaaacataataaaagaaaatagcagtgaagatgatataacaatact tgctaagtatcctaaatacgctttaatatttcttgaaatattgttaatagcaaactgttt tatattcattagttatcgcctcccaataatgtgagtacatccattatctcttgataaaac tgctctctactactacccttatatatttcattatatatagacccatcttttatgaataag attctactacagtagctcgctgctaatgggtcatgagttaccatcatagtagtaacttta ttttctttatttatcttttgaaatagctccattacaacctttgatgactttgaatctaaa ttacctgttggttcatctgctaaaagtattgatggattgttaatcaatgctctagcaata gcagtcctctgagcttgaccacctgatacttcaaaagttctttttcctaataaatctttt atacctaatattgtagatacttcattcaatctctcatcttgctcttttacactgacctta tctaatgtcaatggcaatactatattttctcctatagttaatgtatccaataaattaaaa tcctgaaatacaaaacctaactctcttcttctaaataatgcaagttcctcacctcttaac aataaaggattcttgccctttaattccatagttcctgtggttggcttgtcaatagtagaa atcatatttaaaagagtagtttttccactaccagatggacccataattcctacaaattct ccatcttctatactaaaatttatgtcatttaatgcgttgaaaattatttttttaccatat actttacttaaattatttacagttaaaattttcattatttaactatccttcctaatttaa tttttgaaataacatatatataattgttaattataatttatcttagtttaatttttatag ataataaatctattttttctatacactaattatgttagtaaaagctaatactgcaagtac tacacccatgattattctgtatacagcaaacactctcattggttttttctttaaaaaatt cacgaatttttccataactattattgatacaataaaagctactataaacccaactaccaa agcaatccacaatgttggtgtcattattgaataatcaaattcaaataaatcttttcctga agaagccaccatagctggtactgctaaaaagaaagaaaactcagctgctgtaggagaatt aagtcctgctatccatccacccataatagtagatgcactccttgacatacctggccatgc agacaaaacttgtaatgtcccaacctttaaagcttgtattggagtaattttatctatatt atctgtggaatgattcttttttctaaacaaagtttctactactaataataaaatcccacc cactataaatcctataattacagattgtaaattaaacaatgattttatattatcgtaaaa tagaactcctataatcgcaaatggtatacaacctataattacattcattccaaatctaaa accaatctttccttcttttccaccagtaaatataaatttaaaaaattctataacgctatc ttttatctttttccaataaagtactactactgctaatatagccccaagttgtattacaac ctcaaacatttcagcaaattgccccttaaaatctattaaattaccaaccaaaatcatatg acctgtagatgaaactggaataaattctgtaagcccctctactatagctattatgactga tttcaatataaaaataacatctaaactcatcaataaacatccttccttttttacaaaatt tctttttttatgttatttctcttatgttatttcttatattaattgtaatttagattagaa aatttaactatctgcaaacattacacaaaccttacatctatgtaaggtttgcaaataaac tctcttaaattttgattatttaactatgaatatttcatttaataaattgtataataaaaa agtacaattaactaaaaaccctattgtaacagataatttacacctttattaaactattta catctttattaaagtagattgaaacttctgtaccttttcctacttctgattttatactta ctttatgacctaaatcatcacataccttttttactagataaagacccatacctgtagatt ctccaaacttacgaccattttctcctgtaaaaaatgggtcaaataccctttttaaatctt tagaaacaattccaattccttcatctattatacttaaaattacatatttattattttctt cagattttatagttaggtagttactataatctttagaatatttcactccatttgtaatta attgacctattataaatttcatccattttacatctgtataaacataagtaaatttgtcta cttgaatcttaggaatcattccactttttataaataaccttttttcttcatttacaatac tagatacaatttcatttaatttggctttttcaactataaagtctttctgaaaattatctg cccttgcaaaatgcatagccatatctaaccctttatttaatctatctatttcttttctta tattttcagttacttcttctccctcataatcttgaagctgaaggcttataactgatattg gtgttttcatctgatgaatccattggttgatgaaagttaaatgttcactatgtatctttt tatgctcttgtatcattgattgatacaatttatgttgttgttttaaaataactgatatat ttctccccaagaatgagcttcctaaatacaaaaatgactcctccaaagaatgtactcctt tttcaaacagattatatacttctctatttttataatacttatatattaaaaaacataaca atataaaagaactaaataaaagaatatataaactctctccaaaactaataaacttcataa gattacagtaaataattgtcataactatgcctatataatatataaaaatataacctttat aatcttttaaaaataacttcatactttctccttaccaattcttatttaatttatatccta accctcggacagtctgaacagcattatctatacctaattcctcaaatcttttccttatcc tgctaacatttacatttaaagtattttcctctacaaactcaatatcatcccatatctttt ctaaaagataatctctacttactacttttgggtatctcttgataagacattcaatcagta taccttcttttttagttataattagattctcaccatttaattctagttctaacctttctg gataaaactttaatccatctagctccactattctttcgtctattttaggtgaatattcac catatacccttcttatatgactctttatttttgccattactacatcatagtaaaaaggtt ttgttatataatcatctgctccactttctaaagctctaatttggtctacattaccatctc tagctgatataaaaattataggtaaattcgactgttgcctaatacatctacaccagtaga aaccatcaaatttaggtaaatttacatctaatagaactaagtgtggcttaaaactttcaa atgtaatcattatatcatcaaagttctcttcaacaatcacttcaaatccatatttctcaa tataatctttaagtaatgtacttattgatatatcatcttccacaatatatactttataac tcatataattcctcctaatatacctatttactcatcatataacagtccaattttaatata ttataatctttttacaatatataaatttaatcatattactaacttcacaattactgactt cataagtataaccatattattatacatcttaataaaactctataaaaaagtatcttttta tgattaattaatcattattatcaactaatcattctaaaataaattgaaattactaattca aaatagaaaaagttaccttaataaggtaacttaaacttttattatatttcttacttagta ttattttatcatagtttctacttagcattatagattaatccttttatgttcacttttttc tcttgtaacttattttttattaagaagtcttgtgtatcttcaagcgaagatatgtcttta tctgttatatctaaactaaaatcataccaagcatataattctttagtttcttcaagactt aaatcaacttctttagctactttttccatagcttcatcaaaattattatttacatattct aaagtttccttttcaaccttcataaatctttcaactatttctggatgtttctctgcaaag tctgtgctaacagcagttactattataccatctactaaaccttcaccatttgctacaagt ttactacctgacttcatagctttaagagctgctggaccagcaatcaatgcagcatctacg ctgccatcagaaagagctgctgatgcctctggaatacccatattaacaaattccacatca tccatacttaatccttctttatcaagtgctgaaatcaatacctgatgtaatatagtccct tttgggcctgccaccttcttacctactaaatctgctgctgattttattgaattattatta gtcaaaatcataaatccttttggtgacctgctataagtgtttaatatctttaactctact ccattagatgcagctattaaagctgatgtaccacctagtgcatgtaagaagtctatttct ccagcagctaaagcttgtgtttgctctggacctgtagtaatttcgtggaagttaactttt atattatcctttttaaattcctttccaaataaatcatcctgtttctgaattatagaagga acatttaatggtgattttacataagttaaatttatttctgaaagtttttctccattattt tttttagcacatccagctaaagatgctgttgcaagtgttaatatcgttatacctatcaat agcttttttaatttcatttactttactccttaaaatattattaatttctttaaatgcctt tatttgacttcattgtcattaaaatatctttttttaatttaatatagtaatctgaagtta aatctctattataaccatcttctatattaaattcttttacttttctttcgtctgtgaaaa caactattttcttgcctatctttaacgcttcatcaatatcatgagttacaaatatcacgc ctttattagttgacttatgtattcttataacttcattttgcatatcaatccttgtaaaat aatctaatgccgaaaaaggctcgtccataagcaacatatctggattgaaagaaagagctc tagctatgcttactctctgcgccatacctcctgacaattcatttggataagagtttttaa atttctgcaagttcatcatcttaagatatttttctacatcaatattacttttcctattat atttatttgatttgttcaaattatcatttgtttctaagcttctaaaattatcatttataa ttttactcctaattcttttattgtgtttaaattttctaagcaccttgtttaaaatagtat tttttctttgattatgaaaagctatattttcacttacgtttaaccaaggcattaatctac tctcctgaaaaacaaaaccaacattaggtctatactctttattatcattaataaacctaa tttcaccactatttataccttcaagtgatgcaattgctctaagcaaggtagtctttccac aaccactttcacctaaaattactgttatatggtttctatctatgtttaaagagatatcac taagaactacatgttctttattgtcaactttataacttttatataaatttctaattatat atccagagtcacatactaaattattcatatgcttccaccatctttcccttacttaccttc ttcacaataatcgaaaatatgtaatctgtaattattcctaaaagtccaattacgattatc cctacaataacaacatctgttctagacatttcttttccatcagatatcaagtatccaaga ccagatgaagctgctacaagttctgccccaataattgctctaaagctatatccaagagct aactttaacccaacagcaatatcaagaatggcatttggtattattattttaaatattatc tgaagctttgaaaactcaaatactctacccacttcaatcagttttgagtcacaattttta atccctttcaatgtgcttgtaaagattgggaaaaaagatgctaaaactataattataatt tttgattcctctcctataccaaaccataatataagcattggtattaaagcaaggggaggt gtattccttaaaaaatttattagagatttaaagtattcgtatactccactataaattcca aagaatatccctaaaggcacacctatagcagtacttattgcaaaacctatcaaaactctt ttcatacttgcatatacattaataaatattgaaccatcacttatcatatttaaaaatgta ctatataccttttcaggtgatggtaatatataatcactccaaataccaagataatttgta attttccataataaaagaattataaaaaatatcagaacactctttactagccttaaaaac ttattattaaatttattgaccatttacaaaccatctccattattacaaccatctttacaa taaaacatttctactatgtcatacttatcttcaaaaccatttcttattttttgtatttca cttaatatttcgtcttcacttgatacttcaagaactttttcaaaagtatctttgaaatat cctaatggaattggtgattcatctatttttccaagtgattttacaccttcttgttcagca aactctttccatgtataaaacatagcattacccttatccttaaacttttcacttgcaaag tctcttaattgtgtacatggacaggttactaccaacatatcatctttactttttatatat ttatcgtataaaaccctacaagtccttactaatattggttctatcataggtacttcaaaa ttatttatcaaattatttctttttaaaagacttatactttctggacatctacaatccaac attgtattttcagtcttttttgtatactctttgtactgcttttttacatattctaactgt ggttcacattctgttattatgtaccccttttttatcaaatttgctttaataaggtgaaac ttttctccatacattctttctgccactggatttattagaagatatttattcataacgcct cctattatttaatattgaatattattatcaattaatagtttaaatgagcacttaaatttt gtcaatatattaattttttcttaataaaacaatttttatctacattttttaatattttaa atgaaatattaaatagtatatgtaatttattttaattaataatgcatacatcttactaat aatctatttatataataatctataaatattatataataatacttatataattagtattat tatttaatagcaacagttattcacactaataaaagtagaaagtttttaaaatattatgaa acatcaaatttaattttaaaattgcatcaaaaaatgaagtctcaacagacttcacttttt ataactcttataaattattcaaaatatttatacttccctttctacttcaaaacgtaaaac cgtcttcaatgattcaggcgatacttttctagcatcacttatataaatttcacgatgtgt gtaagattttcttataagtttattttttttgcaaaattcgttcataatgtcaaagctttc tggttcattatcatatgaacctatatgaagcatttgaacacatagcccttcattaataga cccaaatctaactttttcaagaagattatgaggttttttcttctttactatatcagtagc tttatccaacaggtcttgtgtaacaaaatctggctgacgtatcattatagtgtaaattaa atcttctttaataagtacatctaagcctttacttttttctcccttatcccatataccttc taaaggaaaaaccgtatagtcaaaatacccttctggtacaattccttttttaggcatggt ttttattgcatatgccaaagaataaagtactcctattgcttcagtaaattctttagaatt tgggtctccactcccttttaacatgataaatttctgttctggtatttcaactattacagg attctttttaggtaaatataactctttatctctttttctccattcatatttcataaaaat acctccatatatattttatacattgatattatcacgctaaaagtgacaacagtgtgtcat aattataaattatattataaaatcttcatcctctaattcctcatacactcctttttggta tccattacccttagttgaaaaaaaatcatgtgttttggtttcagtgctaagaccatttaa tacaattggatttatagcatctacagtatatagcttctcaaaccctagattttctaaagc tctatttgcattgtattttaaaaagttcacaacctctttttcaagcccactttctctgta tataacatttgtatactctatctcattctccataaggctataaagtatagaatacatctt ctcttctaacatctccttatccattttatcaaatgaatcgtatatttcttgtgctagcaa tcctatatacttaccatgtaaagactcatctctaagaataagcgatattatttctccact agctaccatctttccttgaccagatagatacaatggataaaagaatcctgaataaaacaa gaaactctctaaaaatacacttgtaaccattgataggtataatccctcttgatttgtagt attttcgtattgagctaaaactaaatcagcctttctttgtaatgttggttctgtttctat ccattcaaataattcatctatttctaaattagaaagtagagtcataaatatagaagaata actttttgcatgtatttcttccatagtccccataaaagacaagacagcttttctttgtag gttttctgttaaactcatcatagatggtattccattattcccctgttttgtatccagtaa tgttaaaccacccaatacttttttatataattccttttctttattacttagttcattcca tacctttatgtctttagaaacagatatttcttcaggaagccaaaattgttttacattttg ttcccaaaaagcttgtgtaaatccatcttcttctctattccagttaactgcattatgtat tttatgtaaattaaatgtcatatatttctctccctatactgaacacactagacactcatg agtatctcttgtcatctttgttcttgtgtaatataaacttttcaaaccttttttataggc atatatgtaatgtctagctatatctctagttgtcttttcatctgtaacaaacagtgttgt tgatataccttggtcaacatggttttgaactgttgccactaaatctatgacctttctcat atccatcctgtatgctgattgataatacaacatattatcatttgttaaaaatggcattgg atatattgtagtagagtctccatatgttcttacttctactggctcagtaattggcattat acttgatgtagcattttgaacataactaatgctttgagttggtgctactgccattaaata tgcattatatatccctttttcttttacctcatccaataattttgtccagtcttcttttgt tggtatataaatcccttcaaataatgctcttaccttttctgacttaggtagataagattg ttcatagtattttgataaaaccttgctatttcttcccttaacatattctgatttatcaaa tccttcaaaagtttgatttctttctatagctattttcatagaagctttaattgaatagta tctaaccattgcaaaaaatacattagaaaaatctatagcatcatctgaagtatataaaat attttctcttactaagtatccatgtaaattcatagctcctaatcctatagaatgagactt gctgttactattgcttaccgttggcactggttttatatctgtgctatctgctacaaatga cagtgctcttattgctgtttcaactgtactttctatagttttattatccattacattagc tatgtttaaagaacctaggttacaacttatatcttgtccccattcattttttcctccata cccctctatttctgaaggtgtttgatattgaaatatctcacaacataagttagacatttt aataattccaacatcttttaatgtatgttctctattagctgtatctatgtacactacata tggatatccactttcttgttgcatctgtgctatttttgtcaacatctgcctaggatttat ttctttttttcttatatcactatcattaaccaatttatcataccactcatccatttctat ctcatcaagagaaactccatatttcttatacacagtatgaggataaaatgcatatgctac ttcatttttttctgccaactccataaatttatctggtattatagctcctaatgataatgt agcaagtcttattttttcatctgcatttatctttttagtatccatcaacaattcaaaatc aggatggaatacagtaaggtacaccgcaccagaaccttgtctagctcccatttgattaaa gtaactaaatgattgttctaacattttagctactccaacaacacctccagctgcaccttc tatatctttgatagattcgccagatgctctaagtttagataaatttagtgcaactcctcc accaatctttgataagtgatttgatgaagatatagcatacgatataccttctgtactatc ttctacagatagtaaaaaacatgataccatttctccagccctttttcttccagcatttaa aaaagtaggtgtagctggttgaaattcttgttttactattttatctgccaagtttaaagc taaatctttatcgccatttcctagtgtcaaagctacaattaacactttatcattatatgt ttctaatatttcctttccatcattgctctttaatgcataattttgataaaacttatttgc actcatatatgattgaaattcaaacttatgtttatcaatcatatcatatatatttttaat aacatctatgctatactgatttattacttcttttgaataataaccttcatctattaaata cttcaatctttcttctaggttattaaattttctcaactttggctgtataaattcttctat gtaactacttaaggcttccttatccttttccaattggtacttgccttgttcatttttaat tatcacttgattgttaagctctatccaattcattatttaccgtccttttaacataatctt gtgccataatttcacttaatttgcttattatttcttttggtacttatcagttgaaatccc aaaattaatctataattatagaaatgcaataagtatttttcaaaaacaaaagcactacat atagtcagtgctttatctattatatactacatatagtatatacacaaatttttttatatc taaacttttattactttataattgacattatttttatttaaagaaatttttatcaactca aatataaaacaatacaagcttattatgtcctgtttaaaaatttaaattatctctaaatag cttaaaaatatattctgatatattgaaaaaagtactttcaagatgatattttatatatta tttagaagttttttatttattgttatataattaaatatatgactattttgctactacata tataaaaataaatttatgaaggtgattttaatgaaaactatttctaaacaagaattagaa aaaacacttgagaaacattatttatggcttaaaaacaataatgctggagaaaaggcagat ttaaaagaattaagattagaaaatatggacttaagaggatactgcttaagtaatattgac ttttcgtggtctgaccttatcaatttaaatttagaaaaagcagatttagaaaactctatt tttaataattcttatctttcggattgttcattaaaaaattctatattaaaaaatgcagac ttaagtggtgcaagttttagattttgtgacttatctaactcagatattagaggagctaat ttagaaaattcaaatttagaacatgctactttaaatggagtaatatcagatgaaagtacc cgtttttttaaattgtattgtcctgaaacaggagcatttataggctataaaaaatgtttt aattttagaatggtacaattattaatacccagcgacgcaaaaagagtgtctgctacatca aacgcttgtagatgtgataaggcaaaagtactgtcaattactagtatagatggtaaagaa tcttttaaaagtgctcgtgcatatgctgatgaaaattttatatatagagtaggagaaacg attgtagctgaagattttaatgaaaatagatggaaagaatcgactacagggattcacttt tttttaactagagaggaagctattggttatctataaaatgctaaagttttataaatatat aaatacataaacaaaataacaaaagagtatagattgtaatttcaaaaaaattataatcta tactcttttttctatagcacataagtacattttatttcataaattataataaattattta tatctgcactattgattatttgagaaactttatctatatgttctatcttactatccaaac tgtcataatacttcttactctcatctctatttctaaaagaataaacttttttatccaatt ttaaagcctcttttataatatctatattcctcttatttgtctctcctacactaaatcctg tatctattataatcttggaatcatttaaatttctaatagccaaatcgaaactctcatcac ttataggctcaaatggattttctgtaaacatctttatccccatagttctaccaatttcat aatcaatatcattttcatgtattattccagaatacagacctataccttttttagtaaaag ctctataaattggtgttgctttacccccaccaccaattataaaaacttcatttttagatt tattactaatttctactgaacctaaaagactattaaagtttttatcatccaattcataaa gcgaatttataatatcctcatctactacatcttcaggctgaccataagctatgactttat tattttttataagagcaactttatcacaactttttaatgctatgtctatttcatgcaatg aaagtattactgatattgacttttctttacttaattttttcagtatgtttatgagttcca atctatgttttatatccaagtgagttgtaggctcatctaatataattatttctggttctt gaacaagagcccttgcaaccaacaccttttgtttttctccatcacttagttcatcaaaat atcttttctttaaatgtaaggcatctacagactccaatgcttcatctaccattattaaat ctttcttagatagactcccaaaaaatcctgtatatggataccttcctatattgactatat cttgtacagtcattaaatcacctaataatctatttgtaagtactaaagccattttttttg ataatgcttttcttgatatacaatttatgtttacaccattcaaatatatttcacctttta ttggtgatataagtttagataaggaccttaatagggtagtttttccagctccattacttc ccaaaagacatagtatttctccattttttacttctacatttatattacttataacaactt tgttattgtatcctacacttaaattattagttttcaacatgtctaagccctatccttcct tttcaccaataacattactacaattggagctcctaataaagatgttatcgtacttattgg taattctactggtgataaaattactcttgatattaaatcacaaagagctgtaactatact gcctaaaaatattactactggtatcaaaactctattatctgatgttttaaatatcatttt tgaaatttgtggcactgcaagtccaataaaccctataggtcctgcaaatgctgatactat tgctgctaatatactagatataaatactatcaaaactctaaaaaatcttatatttatgcc aatactttttgcatactcttctcctagtaaaaaagcatttaaaggttttattatgaatac agtcatcaaaagacctaatataccaactattataagtatttctaccttttcccatgtaaa tccagaaaaacttcccatagaccacatagtaaattcttttaatttatcactatttgcaaa tgattgtaacacatttgttataccactacatacatatcc |