Block details | |
---|---|
fasta | C_difficile_CD00300_1A_020709.fasta |
contig | u00000crpx_c_020709 |
start | 3276440 |
length | 16917 |
strand | + |
type | core |
seq | aattgaaacttcactatctaataatttaattaatgatatgctattacatttatctatttc ataaccaccataaatcccaggtgttgaatttataaatatacctgcttgctctaaatacat cttgtaactttttatttgcctttcacttacttccaactcttctgataattctttgcattt cattttgcctctgctttgaattaatatcatcattctaagtgtattagctaatttactaat gagtaaccccccctaataacattaattgatatttttattatttatttctacacatatgta catataacctctttatattttatataagtagaatttttttataattttgacatttaccat attatattttatatttgtacaaaattttaatagttaatacaataaaaaatattactgaaa aaataaacatctataattccagtaatattaattaattctaaaccctttttattatcattt aataatagtaactaaaaattgactaaatttaaccttatctcttttaaataattatttctt acaattaaaaaataaactatttgaaccaagaacaagcttcccattaccaaaacagctgat gatgctacttctatatcaaaagaatttttcagtgcagtaagtgcaaatattgaatgtata acagccactacataaggaaacaaaaatactattccaatctcaattgttgaagctttttta atctcattatatgtcatccccaatttatttaactgttcatactttttcttatcaacttgg caatccatataaaatttattatataaaaaactacttgtagtaacaaagaaaattaaacct ataaatattgctaaaaatataaatgtagaatacattaatttcccagttcctatcattaat tctttagagaaaaacaaatatggttgcatccctgactcattattaaatttattttcaaat tctctgcatatctctatagttttacttgaatcctctacttcaaatgcagtaaatctatcc actataaattttgattctatactatcataaaaattatcctttaccacatacatatttttg taatatgctggcataacacattcttccacttgttttgccacctttaaacctctattccct acaataatattttctttgacgttattatttcctggtaaacttgatgataataatgatata cattcattatcttcaaaacttataggcttaacccctatagtttctgtaatttctaagtac ttagattctttcataattctgacattaaaatcacttttcttgggaaatacagttttaaat tcaccattagtccttgtatagtctacattctctttttttagattattttctataaacatc attctttccttgtctttttctttgctatcaggctttttagggtcattatgcaatgtcatt gttgaataatatattgtgttaggatatattaaattaatttgacgctctacatctttccaa aaggaataaactgtacctatagcagtaaatgctactgcagaagttatagttatcaagaaa aatattctagcattatcctttaccttataaatcaagttcgaaatccaaagcatatttgta ttttttctataaaatctcttgtttaattttagcttcttcataaaaaatacactaaattga gaaaagaacaagtaagttgctactatagtaagggatgtaactggaactaagcgcagatat gttgtatattggtcggttgaggtaatagcattataatacgctattataaacaaacaaata cttaatatagcaagcattagtgatgttttaggctctggttttggagtttttgtaccttta agtaacttcaacacctgattttctttaactataaaagaagtaaatattgatgttaataca gctaaaatcataaaatagattaaagtagacaatatcgcattaaatggtatatagaatttt aatggtgataattctaaaaaagtagacataaccactaaaaatatctttgcaaagattaag cctattattattccaattacagaagatactatatttattatcatattttctataaagatt aatttcattacttggcgctttgatatacctgtaatataaagtattccaaattctttatat ctacttttaagaaacacactaactgaataaaacacaaagaagaataagaatagatatgca attatcttactcatcttgagaccttcttttaaataatcaggaaattgagatacatctaaa tctggatgacttgtaaacataataaaagaaaatagcagtgaagatgatataacaatactt gctaagtatcctaaatacgctttaatatttcttgaaatattgttaatagcaaactgtttt atattcattagttatcgcctcccaataatgtaagtacatccattatctcttgataaaact gctctctactactacccttatatatttcattatatatagacccatcttttatgaataaga ttctactacagtagctcgctgctaatgggtcatgagttaccatcatagtagtaactttat tttctttatttatcttttgaaatagctccattacaacctttgatgactttgaatctaaat tacctgttggttcatctgctaaaagtattgatggattgttaatcaatgctctagcaatag cagtcctctgagcttgaccacctgatacttcaaaagttctttttcctaataaatctttta tacctaatattgtagatacttcattcaatctctcatcttgctcttttacactgaccttat ctaatgtcaatggcaatactatattttctcctatagttaatgtatccaataaattaaaat cctgaaatacaaaacctaactctcttcttctaaataatgcaagttcctcacctcttaaca ataaaggattcttgccctttaattccatagttcctgtagttggcttgtcaatagtagaaa tcatatttaaaagagtagtttttccactaccagatggacccataattcctacaaattctc catcttctatactaaaatttatgtcatttaatgcgttgaaaattatttttttaccatata ctttacttaaattatttacagttaaaattttcattatttaactatccttcctaatttaat ttttgaaataacatatatataattgttaattataatttatcttagtttaatttttataga taataaatctattttttctatacactaattatgttagtaaaagctaatactgcaagtact acacccatgattattctgtatacagcaaacactctcattggttttttctttaaaaaattc acgaatttttccataactattattgatacaataaaagctactataaacccaactaccaaa gcaatccacaatgttggtgtcattattgaataatcaaattcaaataaatcttttcctgaa gaagccaccatagctggtactgctaaaaagaaagaaaactcagctgctgtaggagaatta agtcctgctatccatccacccataatagtagatgcactccttgacatacctggccatgca gacaaaacttgtaatgtcccaacctttaaagcttgtattggagtaattttatctatatta tctgtggaatgattcttttttctaaacaaagtttctactactaataataaaatcccaccc actataaatcctataattacagattgtaaattaaacaatgattttatattatcgtaaaat agaactcctataatcgcaaatggtatacaacctataattacattcattccaaatctaaaa ccaatctttccttcttttccaccagtaaatataaatttaaaaaattctataacgctatct tttatctttttccaataaagtactactactgctaatatagccccaagttgtattacaacc tcaaacatttcagcaaattgccccttaaaatctattaaattaccaaccaaaatcatatga cctgtagatgaaactggaataaattctgtaagcccctctactatagctattatgactgat ttcaatataaaaataacatctaaactcatcaataaacatccttccttttttacaaaattt ctttttttatgttatttctcttatgttatttcttatattaattgtaatttagattagaaa atttaactatctgcaaacattacacaaaccttacatctatgtaaggtttgcaaataaact ctcttaaattttgattatttaactatgaatatttcatttaataaattgtataataaaaaa gtacaattaactaaaaaccctattgtaacagataatttacatctttatcaaactatttac acctttattaaactatttacatctttattaaagtagattgaaacttctgtaccttttcct acttctgattttatacttactttatggcctaaatcatcacataccttttttactagataa agacccatacctgtagattctccaaacttacgaccattttctcctgtaaaaaatgggtca aataccctttttaaatctttagaaacaattccaattccttcatctattatacttaaaatt acatatttattattttcttcagattttatagttaggtagttactataatctttagaatat ttcactccatttgtaattaattgacctattataaatttcatccattttacatctgtataa acataagtaaatttgtctacttgaatcttaggaatcattccactttttataaataacctt ttttcttcatttacaatactagatacaatttcatttaatttggctttttcaactataaag tctttctgaaaattatctgcccttgcaaaatgcatagccatatctaaccctttatttaat ctatctatttcttttcttatattttcagttacttcttctccctcataatcttgaagctga aggcttataactgatattggtgttttcatctgatgaatccattggttgatgaaagttaaa tgttcactatgtatctttttatgctcttgtatcattgattgatacaatttatgttgttgt tttaaaataactgatatatttctccccaagaatgagcttcctaaatacaaaaatgactcc tccaaagaatgtactcctttttcaaacagattatatacttctctatttttataatactta tatattaaaaaacataacaatataaaagaactaaataaaagaatatataaactctctcca aaactaataaacttcataagattacagtaaataattgtcataactatgcctatataatat ataaaaatataacctttataatcttttaaaaataacttcatactttctccttaccaattc ttatttaatttatatcctaaccctcggacagtctgaacagcattatctatacctaattcc tcaaatcttttccttatcctgctaacatttacatttagagtattttcctctacaaactca atatcatcccatatcttttctaaaagataatctctacttactacttttgggtatctcttg ataagacattcaatcagtataccttcttttttagttataattagatgctcaccatttaat tctagttctaacctttctggataaaactttaatccatctagctccactattctttcgtct attttaggtgaatattcaccatatacccttcttatatgactctttatttttgccattact acatcatagtaaaaaggttttgttatataatcatctgctccactttctaaagctctaatt tggtctacattaccatctctagctgatataaaaattataggtaaattcgactgttgccta atacatctacaccagtagaaaccatcaaatttaggtaaatttacatctaatagaactaag tgtggcttaaaactttcaaatgtaatcattatatcatcaaagttatcttcaacaatcact tcaaatccatatttctcaatataatctttaagtaatgtacttattgatatatcatcttcc acaatatatactttataactcatataattcctcctaatatacctatttactcatcatata acagtccaattttaatatattataatctttttacaatatataaatttaatcatattgcta acttcacaattactgacttcataagtataaccatattattagacatcttaataaaactct ataaaaaagtatctttttatgattaattaatcattattatcaactaatcattctaaaata aattgaaattactaattcaaaatagaaaaagttaccttaataaggtaacttaaactttta ttatatttcttacttagtattattttatcatagtttctactcagcattatagattaattc ttttatgttcacttttttctcttgtaacttattttttattaagaagtcttgtgtatcttc aagcgaagatatgtctttatctgttatatctaaactaaaatcataccaagcatataattc tttagtttcttcaagacttaaatcaacttctttagctactttttccatagcttcatcaaa attattatttacatattctaaagtttccttttcaaccttcataaatctttcaactatttc tggatgtttctctgcaaagtctgtgctaacagcagttactattataccatctactaaacc ttcaccatttgctacaagtttactacctgacttcatagctttaagagctgctggaccagc aatcaatgcagcatctacgctgccatcagaaagagctgctgatgcctctggaatacccat attaacaaattccacatcatccatacttaatccttctttatcaagtgctgaaatcaatac ctgatgtaatatagtcccttttgggcctgccaccttcttacctactaaatctgctgctga ttttattgaattattattagtcaaaatcataaatccttttggtgacctgctataagtgtt taatatctttaactctactccattagatgcagctattaaagctgatgtaccacctagtgc atgtaagaagtctatttctccagcagctaaagcttgtgtttgctctggacctgtagtaat ttcgtggaagttaacttttatattatcctttttaaattcctttccaaataaatcatcctg tttctgaattatagaaggaacatttaatggtgactttacataagttaaatttatttctga aagtttttctccattattttttttagcacatccagctaaagatgctgttgcaagtgttaa tatcgttatacctatcaatagcttttttaatttcatttactttactccttaaaatattat taatttctttaaatgcctttatttgatttcattgtcattaaaatatctttttttaattta atatagtaatctgaagttaaatctctattataaccatcttctatattaaattcttttact tttctttcgtctgtgaaaacaactattttcttgcctatctttaacgcttcatcaatatca tgagttacaaatatcacgcctttattagttgacttatgtattcttataacttcattttgc atatcaatccttgtaaaataatctaatgccgaaaaaggctcgtccataagcaacatatct ggattgaaagaaagagctctagctatgcttactctctgtgccatacctcctgacaattca tttggataagagtttttaaatttctgcaagttcatcatcttaagatatttttctacatca atattacttttcctattatatttatttgatttgttcaaattatcatttgtttctaagctt ctaaaattatcatttataattttactgctaattcttttattgtgtttaaattttctaagc accttgtttaaaatagtattttttctttgattatgaaaagctatattttcacttacgttt aaccaaggcattaatctgctctcctgaaaaacaaaaccaacattaggtctatactcttta ttatcattaataaacctaatttcaccactatttataccttcaagtgatgcaattgctcta agcaaggtagtctttccacaaccactttcacctaaaattactgttatatggtttctatct atgtttaaagagatatcactaagaactacatgttcttcattgtcaactttataactttta tataaatttctaattatatatccagagtcacatactaaattattcatatgcttccaccat ctttcccttacttaccttcttcacaataatcgaaaatatgtaatctgtaattattcctaa aagtccaattacgattatacctacaataacaacatctgttctagacatttcttttccatc agatatcaagtatccaataccagatgaagctgctacaagttctgccccaataattgctct aaagctatatccaagagctaactttaacccaacagcaatatcaagaatggcatttggtat tattattttaaatattatctgaagctttgaaaactcaaatactctacccacttcaatcag ttttgagtcacaatttttaatccctttcaatgtgcttgtaaagattgggaaaaaagatgc taaaactataattataatttttgattcctctcctataccaaaccataatataagcattgg tattaaagcaaggggaggtgtattccttaaaaaatttattagagatttaaagtattcgta tactccactataaattccaaagaatatccctaaaggcacacctatagcagtacttattgc aaaacctatcaaaactcttttcatacttgcatatacattaataaatattgaaccatcact tatcatatttaaaaatgtactatataccttttcgggtgatggtaatatataatcactcca aataccaagataatttgtaattttccataataaaagaattataaaaaatatcagaacact ctttactagccttaaaaacttattattaaatttattgaccatttacaaaccatctccatt attacaaccatctttacaataaaacatttctactatgtcatacttatcttcaaagccatt tcttattttttgtatttcacttaatatttcgtcttcacttgatacttcaagaactttttc aaaagtatctttgaaatatcctaatggaattggtgattcatctatttttccaagtgattt tacaccttcttgttcagcaaactctttccatgtataaaacataacattacccttatcctt aaacttttcacttgcaaagtctcttaattgtgtacatggacaggttactaccaacatatc atctttactttttatatatttatcgtataaaaccctacaagtccttactaatattggttc tatcataggtacttcaaaatcatttatcaaattatttctttttaaaagacttatactttc tggacatctacaatccaacattgtattttcagtcttttttgtatactctttgtactgctt ttttacatattctaactgtggttcacattctgctattatgtaccccttttttatcaaatt tgctttaataaggtgaaacttttctccatacattctttctgccactggatttattagaag atatttattcataacgcctcctattatttaatattgaatattattatcaattaatagttt aaatgagcacttaaattttgtcaatatattaattttttcttaataaaacaatttttatct acattttttaatattttaaatgaaatattaaatagtatatgtaatttattttaattaata atgcatacatcttactaataatctatttatataataatctataaatattatataataata cttatataattagtattattatttaatagcaacagttattcacactaataaaagtagaaa gtttttaaaatattatgaaacatcaaatttaattttaaaattgcatcaaaaaatgaagtc tcaacagacttcactttttataactcttataaattattcaaaatatttatacttcccttt ctacttcaaaacgtaaaaccgtcttcaatgattcaggcgatacttttctagcatcactta tataaatttcacgatgtgtgtaagattttcttataagtttattttttttgcaaaattcgt tcataatgtcaaagctttctggttcattatcatatgaacctatatgaagcatttgaacac atagcccttcattaatagacccaaatctaactttttcaagaagattatgaggttttttct tctttactatatcagtagctttatccaacaggtcttgtgtaacaaaatctggctgacgta tcattatagtgtaaattaaatcttctttaataagtacatctaagcctttacttttttctc ccttatcccatataccttctaaaggaaaaaccgtatagtcaaaatacccttctggtacaa ttccttttttaggcatggtttttattgcatatgccaaagaataaagtactcctattgctt cagtaaattctttagaatttgggtctccactcccttttaacatgataaatttctgttctg gtatttcaactattacaggattctttttaggtaaatataactctttatctctttttctcc attcatatttcataaaaatacctccatatatattttatacattgatattatcacgctaaa agtgacaacagtgtgtcataattataaattatattataaaatctttatcctctaattcct catacactcctttttggtatccattacccttagttgaaaagaaatcatgtgttttggttt cagtgctaagaccatttaatacaattggatttatagcatctacagtatatagcttctcaa accctagattttctaaagctctattcgcattgtattttaaaaagtttacaacctcttttt caagcccactttctctgtatataacatttgtatactctatctcattctccataaggctat aaagtatagaatacatcttctcttctaacatctccttatccattttatcaaatgaatcgt atatttcttgtgctagcaatcctatatacttaccatgtaaagactcatctctaagaataa gcgatattatttctccactagctaccatctttccttgaccagatagatacaatggataaa agaatcctgaataaaacaagaaactctctaaaaatacacttgtaaccattgataggtata atccctcttgatttgtagtattttcgtattgagctaaaactaaatcagcctttctttgta atgttggttctgtttctatccattcaaataattcatctatttctaaattagaaagtagag tcataaatatagaagaataactttttgcatgtatttcttccatagtccccataaaagaca agacagcttttctttgtaggttttctgttaaactcatcatagatggtattccattattcc cctgttttgtatccagtaatgttaaaccacccaatacttttttatataattccttttctt tattacttagttcattccatacctttatgtctttagaaacagatatttcttcaggaagcc aaaattgttttacattttgttcccaaaaagcttgtgtaaatccatcttcttctctattcc agttaactgcattatgtattttatgtaaattaaatgtcatatatttctctccctatactg aacacactagacactcatgagtatctcttgtcatctttgttcttgtgtaatataaacttt tcaaaccttttttataggcatatatgtaatgtctagctatatctctagttgtcttttcat ctgtaacaaacagtgttgttgatataccttggtcaacatggttttgaactgttgccacta aatctatgacctttctcatatccatcctgtatgctgattgataatacaacatattatcat ttgttaaaaatggcattggatatattgtagtagagtctccatatgttcttacttctactg gctcagtaattggcattatacttgatgtagcattttgaacataactaatgctttgagttg gtgctactgccattaaatatgcattatatatccctttttcttttacctcatccaataatt ttgtccagtcttcttttgttggtatataaatcccttcaaataatgctcttaccttttctg acttaggtagataagattgttcatagtattttgataaaaccttgctatttcttcccttaa catattctgatttatcaaatccttcaaaagtttgatttctttctatagctattttcatag aagctttaattgaatagtatctaaccattgcaaaaaatacattagaaaaatctatagcat catctgaagtatataaaatattttctcttactaagtatccatgtaaattcatagctccta atcctatagaatgagacttgctgttactattgcttaccgttggcactggttttatatctg tgctatctgctacaaatgacagtgctcttattgctgtttcaactgtactttctatagttt tattatccattacattagctatgtttaaagaacctaggttacaacttatatcttgtcccc attcattttttcctccatacccctctatttctgaaggtgtttgatattgaaatatctcac aacataagttagacattttaataattccaacatcttttaatgtatgttctctattagctg tatctatgtacactacatatggatatccactttcttgttgcatctgtgctatttttgtca acatctgcctaggatttatttctttttttcttatatcactatcattaaccaatttatcat accactcatccatttctatctcatcaagagaaactccatatttcttatacacagtatgag gataaaatgcatatgctacttcatttttttctgccaactccataaatttatctggtatta tagctcctaatgataatgtagcaagtcttattttttcatctgcatttatctttttagtat ccatcaacaattcaaaatcaggatggaatacagtaaggtacaccgcaccagaaccttgtc tagctcccatttgattaaagtaactaaatgattgttctaacattttagctactccaacaa cacctccagctgcaccttctatatctttgatagattcgccagatgctctaagtttagata aatttagtgcaactcctccaccaatctttgataagtgatttgatgaagatatagcatatg atataccttctgtactatcttctacagatagtaaaaaacatgataccatttctccagccc tttttcttccagcatttaaaaaagtaggtgtagctggttgaaattcttgttttactattt tatctgccaagtttaaagctaaatctttatcgccatttcctagtgtcaaagctacaatta acactttatcattatatgtttctaatatttcctttccatcattgctctttaatgcataat tttgataaaacttatttgcactcatatatgattgaaattcaaacttatgtttatcaatca tatcatatatatttttaataacatctatgctatactgatttattacttcttttgaataat aaccttcatctattaaatacttcaatctttcttctaggttattaaattttctcaactttg gctgtataaattcttctatgtaactacttaaggcttccttatccttttccaattggtact tgccttgttcatttttaattatcacttgattgttaagctctatccaattcattatttacc gtccttttaacataatcttgtgccataatttcacttaatttgcttattatttcttttggt acttatcagttgaaatcccaaaattaatctataattatagaaatgcaataagtatttttc aaaaacaaaagcactacatatagtcagtgctttatctattatatactacatatagtatat acacaaatttttttatatctaaacttttattactttataattgacattatttttatttaa agaaatttttatcaactcaaatataaaacaatacaagcttattatgtcctgtttaaaaat ttaaattatctctaaatagcttgaaaatatattctgatatattgaaaaaagtactttcaa gatgatattttatatattatttagaagttttttatttattgttatataattaaatatatg actattttgctactacatatataaaaataaatttatgaaggtgattttaatgaaaactat ttctaaacaagaattagaaaaaacacttgagaaacattatttatggcttaaaaacaataa tgctggagaaaaggcagatttaaaagaattaagattagaaaatatggacttaagaggata ctgcttaagtaatattgacttttcgtggtctgaccttatcaatttaaatttagaaaaagc agatttagaaaactctatttttaataattcttatctttcggattgttcattaaaaaattc tatattaaaaaatgcagacttaagtggtgcaagttttagattttgtgacttatctaactc agatattagaggagctaatttagaaaattcaaatttagaatatgctactttaaatggagt aatatcagatgaaagtacccgtttttttaaattgtattgtcctgaaacaggagcatttat aggctataaaaaatgttttaattttagaatggtacaattattaatacccagcgacgcaaa aagagtgtctgctacatcaaatgcttgtagatgtgataaggcaaaagtactgtcaattac tagtatagatggtaaagaatcttttaaaagtgctcgtgcatatgctgatgaaaattttat atatagagtaggagaaacgattgtagctgaagattttaatgaaaatagatggaaagaatc aactacagggattcacttttttttaactagagaggaagctattggttatctataaaatgc taaagttttataaatatataaatacataaacaaaataacaaaagagtatagattgtaatt tcaaaaaaattataatctatactcttttttctatagcacataagtacattttatttcata aattataataaattatttatatctgcactattgattatttgagaaactttatctatatgt tctatcttactatccaaactgtcataatacttcttactctcatctctatttctaaaagaa taaacttttttatccaattttaaagcctcttttataatatctatattcctcttatttgtc tctcctacactaaatcctgtatctattataatcttggaatcatttaaatttctaatagcc aaatcgaaactctcatcacttataggctcaaatggattttctgtaaacatctttatcccc atagttctaccaatttcataatcaatatcattttcatgtattattccagaatacagacct ataccttttttagtaaaagctctataaattggtgttgctttacccccaccaccaattata aaaacttcatttttagatttattactaatttctactgaacctaaaagactattaaagttt ttatcatccaattcataaagcgaatttataatatcctcatctactacatcttcaggctga ccataagctatgactttattattttttataagagcaactttatcacaactttttaatgct atgtctatttcatgcaatgaaagtattactgatattgacttttctttacttaattttttc agtatgtttatgagttccaatctatgttttatatccaagtgagttgtaggctcatctaat ataattatttctggttcttgaacaagagcccttgcaaccaacaccttttgtttttctcca tcacttagttcatcaaaatatcttttctttaaatgtaaggcatctacagactccaatgct tcatctaccattattaaatctttcttagatagactcccaaaaaatcctgtatatggatac cttcctatattgactatatcttgtacagtcattaaatcacctaataatctatttgtaagt actaaagccattttttttgataatgcttttcttgatatacaatttatgtttacaccattc aaatatatttcaccttttattggtgatataagtttagataaggaccttaatagggtagtt tttccagctccattacttcccaaaagacatagtatttctccattttttacttctacattt atattacttataacaactttgttattgtatcctacacttaaattattagttttcaacatg tctaagccctatccttccttttcaccaataacattactacaattggagctcctaataaag atgttatcgtacttattggtaattctactggtgataaaattactcttgatattaaatcac aaagagctgtaactatactgcctaaaaatattactactggtatcaaaactctattatctg atgttttaaatatcatttttgaaatttgtggcactgcaagtccaataaaccctataggtc ctgcaaatgctgatactattgctgctaatatactagatataaatactatcaaaactctaa aaaatcttatatttatgccaatactttttgcatactcttctcctagtaaaaaagcattta aaggttttattatgaatacagtcatcaaaagacctaatataccaactattataagtattt ctaccttttcccatgtaaatccagaaaaacttcccatagaccacatagtaaattctttta atttatcactatttgcaaatgattgtaacacatttgttataccactacatacatatcc |