| Block details | |
|---|---|
| fasta | C_difficile_CD00002_4A_024063.fasta |
| contig | u00000crpx_c_024063 |
| start | 3276296 |
| length | 16918 |
| strand | + |
| type | core |
| seq | aattgaaacttcactatctaataatttaattaatgatatgctattacatttatctatttc ataaccaccataaatcccaggtgttgaatttataaatatacctgcttgctctaaatacat cttgtaactttttatttgcctttcacttacttccaactcttctgataattctttgcattt cattttgcctctgctttgaattaatatcatcattctaagtgtattagctaatttactaat gagtaaccccccctaataacattaattgatatttttattatttatttctacacatatgta catataacctctttatattttatataagtagaatttttttataattttgacatttaccat attatattttatatttgtacaaaattttaatagttaatacaataaaaaatattactgaaa aaataaacatctataattccagtaatattaattaattctaaaccctttttattatcattt aataatagtaactaaaaattgactaaatttaaccttatctcttttaaataattatttctt acaattaaaaaataaactatttgaaccaagaacaagcttcccattaccaaaacagctgat gatgctacttctatatcaaaagaatttttcagtgcagtaagtgcaaatattgaatgtata acagccactacataaggaaacaaaaatactattccaatctcaattgttgaagctttttta atctcattatatgtcatccccaatttatttaactgttcatactttttcttatcaacttgg caatccatataaaatttattatataaaaaactacttgtagtaacaaagaaaattaaacct ataaatattgctaaaaatataaatgtagaatacattaatttcccagttcctatcattaat tctttagagaaaaacaaatatggttgcatccctgactcattattaaatttattttcaaat tctctgcatatctctatagttttacttgaatcctctacttcaaatgcagtaaatctatcc actataaattttgattctatactatcataaaaattatcctttaccacatacatatttttg taatatgctggcataacacattcttccacttgttttgccacctttaaacctctattccct acaataatattttctttgacgttattatttcctggtaaacttgatgataataatgatata cattcattatcttcaaaacttataggcttaacccctatagtttctgtaatttctaagtac ttagattctttcataattctgacattaaaatcacttttcttgggaaatacagttttaaat tcaccattagtccttgtatagtctacattctctttttttagattattttctataaacatc attctttccttgtctttttctttgctatcaggctttttagggtcattatgcaatgtcatt gttgaataatatattgtgttaggatatattaaattaatttgacgctctacatctttccaa aaggaataaactgtacctatagcagtaaatgctactgcagaagttatagttatcaagaaa aatattctagcattatcctttaccttataaatcaagttcgaaatccaaagcatatttgta ttttttctataaaatctcttgtttaattttagcttcttcataaaaaatacactaaattga gaaaagaacaagtaagttgctactatagtaagggatgtaactggaactaagcgcagatat gttgtatattggtcggttgaggtaatagcattataatacgctattataaacaaacaaata cttaatatagcaagcattagtgatgttttaggctctggttttggagtttttgtaccttta agtaacttcaacacctgattttctttaactataaaagaagtaaatattgatgttaataca gctaaaatcataaaatagattaaagtagacaatatcgcattaaatggtatatagaatttt aatggtgataattctaaaaaagtagacataaccactaaaaatatctttgcaaagattaag cctattattattccaattacagaagatactatatttattatcatattttctataaagatt aatttcattacttggcgctttgatatacctgtaatataaagtattccaaattctttatat ctacttttaagaaacacactaactgaataaaacacaaagaagaataagaatagatatgca attatcttactcatcttgagaccttcttttaaataatcaggaaattgagatacatctaaa tctggatgacttgtaaacataataaaagaaaatagcagtgaagatgatataacaatactt gctaagtatcctaaatacgctttaatatttcttgaaatattgttaatagcaaactgtttt atattcattagttatcgcctcccaataatgtaagtacatccattatctcttgataaaact gctctctactactacccttatatatttcattatatatagacccatcttttatgaataaga ttctactacagtagctcgctgctaatgggtcatgagttaccatcatagtagtaactttat tttctttatttatcttttgaaatagctccattacaacctttgatgactttgaatctaaat tacctgttggttcatctgctaaaagtattgatggattgttaatcaatgctctagcaatag cagtcctctgagcttgaccacctgatacttcaaaagttctttttcctaataaatctttta tacctaatattgtagatacttcattcaatctctcatcttgctcttttacactgaccttat ctaatgtcaatggcaatactatattttctcctatagttaatgtatccaataaattaaaat cctgaaatacaaaacctaactctcttcttctaaataatgcaagttcctcacctcttaaca ataaaggattcttgccctttaattccatagttcctgtagttggcttgtcaatagtagaaa tcatatttaaaagagtagtttttccactaccagatggacccataattcctacaaattctc catcttctatactaaaatttatgtcatttaatgcgttgaaaattatttttttaccatata ctttacttaaattatttacagttaaaattttcattatttaactatccttcctaatttaat ttttgaaataacatatatataattgttaattataatttatcttagtttaatttttataga taataaatctattttttctatacactaattatgttagtaaaagctaatactgcaagtact acacccatgattattctgtatacagcaaacactctcattggttttttctttaaaaaattc acgaatttttccataactattattgatacaataaaagctactataaacccaactaccaaa gcaatccacaatgttggtgtcattattgaataatcaaattcaaataaatcttttcctgaa gaagccaccatagctggtactgctaaaaagaaagaaaactcagctgctgtaggagaatta agtcctgctatccatccacccataatagtagatgcactccttgacatacctggccatgca gacaaaacttgtaatgtcccaacctttaaagcttgtattggagtaattttatctatatta tctgtggaatgattcttttttctaaacaaagtttctactactaataataaaatcccaccc actataaatcctataattacagattgtaaattaaacaatgattttatattatcgtaaaat agaactcctataatcgcaaatggtatacaacctataattacattcattccaaatctaaaa ccaatctttccttcttttccaccagtaaatataaatttaaaaaattctataacgctatct tttatctttttccaataaagtactactactgctaatatagccccaagttgtattacaacc tcaaacatttcagcaaattgccccttaaaatctattaaattaccaaccaaaatcatatga cctgtagatgaaactggaataaattctgtaagcccctctactatagctattatgactgat ttcaatataaaaataacatctaaactcatcaataaacatccttccttttttacaaaattt ctttttttatgttatttctcttatgttatttcttatattaattgtaatttagattagaaa atttaactatctgcaaacattacacaaaccttacatctatgtaaggtttgcaaataaact ctcttaaattttgattatttaactatgaatatttcatttaataaattgtataataaaaaa gtacaattaactaaaaaccctattgtaacagataatttacatctttatcaaactatttac acctttattaaactatttacatctttattaaagtagattgaaacttctgtaccttttcct acttctgattttatacttactttatggcctaaatcatcacataccttttttactagataa agacccatacctgtagattctccaaacttacgaccattttctcctgtaaaaaatgggtca aataccctttttaaatctttagaaacaattccaattccttcatctattatacttaaaatt acatatttattattttcttcagattttatagttaggtagttactataatctttagaatat ttcactccatttgtaattaattgacctattataaatttcatccattttacatctgtataa acataagtaaatttgtctacttgaatcttaggaatcattccactttttataaataacctt ttttcttcatttacaatactagatacaatttcatttaatttggctttttcaactataaag tctttctgaaaattatctgcccttgcaaaatgcatagccatatctaaccctttatttaat ctatctatttcttttcttatattttcagttacttcttctccctcataatcttgaagctga aggcttataactgatattggtgttttcatctgatgaatccattggttgatgaaagttaaa tgttcactatgtatctttttatgctcttgtatcattgattgatacaatttatgttgttgt tttaaaataactgatatatttctccccaagaatgagcttcctaaatacaaaaatgactcc tccaaagaatgtactcctttttcaaacagattatatacttctctatttttataatactta tatattaaaaaacataacaatataaaagaactaaataaaagaatatataaactctctcca aaactaataaacttcataagattacagtaaataattgtcataactatgcctatataatat ataaaaatataacctttataatcttttaaaaataacttcatactttctccttaccaattc ttatttaatttatatcctaaccctcggacagtctgaacagcattatctatacctaattcc tcaaatcttttccttatcctgctaacatttacatttagagtattttcctctacaaactca atatcatcccatatcttttctaaaagataatctctacttactacttttgggtatctcttg ataagacattcaatcagtataccttcttttttagttataattagatgctcaccatttaat tctagttctaacctttctggataaaactttaatccatctagctccactattctttcgtct attttaggtgaatattcaccatatacccttcttatatgactctttatttttgccattact acatcatagtaaaaaggttttgttatataatcatctgctccactttctaaagctctaatt tggtctacattaccatctctagctgatataaaaattataggtaaattcgactgttgccta atacatctacaccagtagaaaccatcaaatttaggtaaatttacatctaatagaactaag tgtggcttaaaactttcaaatgtaatcattatatcatcaaagttatcttcaacaatcact tcaaatccatatttctcaatataatctttaagtaatgtacttattgatatatcatcttcc acaatatatactttataactcatataattcctcctaatatacctatttactcatcatata acagtccaattttaatatattataatctttttacaatatataaatttaatcatattgcta acttcacaattactgacttcataagtataaccatattattagacatcttaataaaactct ataaaaaagtatctttttatgattaattaatcattattatcaactaatcattctaaaata aattgaaattactaattcaaaatagaaaaagttaccttaataaggtaacttaaactttta ttatatttcttacttagtattattttatcatagtttctactcagcattatagattaattc ttttatgttcacttttttctcttgtaacttattttttattaagaagtcttgtgtatcttc aagcgaagatatgtctttatctgttatatctaaactaaaatcataccaagcatataattc tttagtttcttcaagacttaaatcaacttctttagctactttttccatagcttcatcaaa attattatttacatattctaaagtttccttttcaaccttcataaatctttcaactatttc tggatgtttctctgcaaagtctgtgctaacagcagttactattataccatctactaaacc ttcaccatttgctacaagtttactacctgacttcatagctttaagagctgctggaccagc aatcaatgcagcatctacgctgccatcagaaagagctgctgatgcctctggaatacccat attaacaaattccacatcatccatacttaatccttctttatcaagtgctgaaatcaatac ctgatgtaatatagtcccttttgggcctgccaccttcttacctactaaatctgctgctga ttttattgaattattattagtcaaaatcataaatccttttggtgacctgctataagtgtt taatatctttaactctactccattagatgcagctattaaagctgatgtaccacctagtgc atgtaagaagtctatttctccagcagctaaagcttgtgtttgctctggacctgtagtaat ttcgtggaagttaacttttatattatcctttttaaattcctttccaaataaatcatcctg tttctgaattatagaaggaacatttaatggtgactttacataagttaaatttatttctga aagtttttctccattattttttttagcacatccagctaaagatgctgttgcaagtgttaa tatcgttatacctatcaatagcttttttaatttcatttactttactccttaaaatattat taatttctttaaatgcctttatttgatttcattgtcattaaaatatctttttttaattta atatagtaatctgaagttaaatctctattataaccatcttctatattaaattcttttact tttctttcgtctgtgaaaacaactattttcttgcctatctttaacgcttcatcaatatca tgagttacaaatatcacgcctttattagttgacttatgtattcttataacttcattttgc atatcaatccttgtaaaataatctaatgccgaaaaaggctcgtccataagcaacatatct ggattgaaagaaagagctctagctatgcttactctctgtgccatacctcctgacaattca tttggataagagtttttaaatttctgcaagttcatcatcttaagatatttttctacatca atattacttttcctattatatttatttgatttgttcaaattatcatttgtttctaagctt ctaaaattatcatttataattttactgctaattcttttattgtgtttaaattttctaagc accttgtttaaaatagtattttttctttgattatgaaaagctatattttcacttacgttt aaccaaggcattaatctgctctcctgaaaaacaaaaccaacattaggtctatactcttta ttatcattaataaacctaatttcaccactatttataccttcaagtgatgcaattgctcta agcaaggtagtctttccacaaccactttcacctaaaattactgttatatggtttctatct atgtttaaagagatatcactaagaactacatgttcttcattgtcaactttataactttta tataaatttctaattatatatccagagtcacatactaaattattcatatgcttccaccat ctttcccttacttaccttcttcacaataatcgaaaatatgtaatctgtaattattcctaa aagtccaattacgattatacctacaataacaacatctgttctagacatttcttttccatc agatatcaagtatccaataccagatgaagctgctacaagttctgccccaataattgctct aaagctatatccaagagctaactttaacccaacagcaatatcaagaatggcatttggtat tattattttaaatattatctgaagctttgaaaactcaaatactctacccacttcaatcag ttttgagtcacaatttttaatccctttcaatgtgcttgtaaagattgggaaaaaagatgc taaaactataattataatttttgattcctctcctataccaaaccataatataagcattgg tattaaagcaaggggaggtgtattccttaaaaaatttattagagatttaaagtattcgta tactccactataaattccaaagaatatccctaaaggcacacctatagcagtacttattgc aaaacctatcaaaactcttttcatacttgcatatacattaataaatattgaaccatcact tatcatatttaaaaatgtactatataccttttcgggtgatggtaatatataatcactcca aataccaagataatttgtaattttccataataaaagaattataaaaaatatcagaacact ctttactagccttaaaaacttattattaaatttattgaccatttacaaaccatctccatt attacaaccatctttacaataaaacatttctactatgtcatacttatcttcaaagccatt tcttattttttgtatttcacttaatatttcgtcttcacttgatacttcaagaactttttc aaaagtatctttgaaatatcctaatggaattggtgattcatctatttttccaagtgattt tacaccttcttgttcagcaaactctttccatgtataaaacataacattacccttatcctt aaacttttcacttgcaaagtctcttaattgtgtacatggacaggttactaccaacatatc atctttactttttatatatttatcgtataaaaccctacaagtccttactaatattggttc tatcataggtacttcaaaatcatttatcaaattatttctttttaaaagacttatactttc tggacatctacaatccaacattgtattttcagtcttttttgtatactctttgtactgctt ttttacatattctaactgtggttcacattctgctattatgtaccccttttttatcaaatt tgctttaataaggtgaaacttttctccatacattctttctgccactggatttattagaag atatttattcataacgcctcctattatttaatattgaatattattatcaattaatagttt aaatgagcacttaaattttgtcaatatattaattttttcttaataaaacaatttttatct acattttttaatattttaaatgaaatattaaatagtatatgtaatttattttaattaata atgcatacatcttactaataatctatttatataataatctataaatattatataataata cttatataattagtattattatttaatagcaacagttattcacactaataaaagtagaaa gtttttaaaatattatgaaacatcaaatttaattttaaaattgcatcaaaaaatgaagtc tcaacagacttcactttttataactcttataaattattcaaaatatttatacttcccttt ctacttcaaaacgtaaaaccgtcttcaatgattcaggcgatacttttctagcatcactta tataaatttcacgatgtgtgtaagattttcttataagtttatttttttttgcaaaattcg ttcataatgtcaaagctttctggttcattatcatatgaacctatatgaagcatttgaaca catagcccttcattaatagacccaaatctaactttttcaagaagattatgaggttttttc ttctttactatatcagtagctttatccaacaggtcttgtgtaacaaaatctggctgacgt atcattatagtgtaaattaaatcttctttaataagtacatctaagcctttacttttttct cccttatcccatataccttctaaaggaaaaaccgtatagtcaaaatacccttctggtaca attccttttttaggcatggtttttattgcatatgccaaagaataaagtactcctattgct tcagtaaattctttagaatttgggtctccactcccttttaacatgataaatttctgttct ggtatttcaactattacaggattctttttaggtaaatataactctttatctctttttctc cattcatatttcataaaaatacctccatatatattttatacattgatattatcacgctaa aagtgacaacagtgtgtcataattataaattatattataaaatctttatcctctaattcc tcatacactcctttttggtatccattacccttagttgaaaagaaatcatgtgttttggtt tcagtgctaagaccatttaatacaattggatttatagcatctacagtatatagcttctca aaccctagattttctaaagctctattcgcattgtattttaaaaagtttacaacctctttt tcaagcccactttctctgtatataacatttgtatactctatctcattctccataaggcta taaagtatagaatacatcttctcttctaacatctccttatccattttatcaaatgaatcg tatatttcttgtgctagcaatcctatatacttaccatgtaaagactcatctctaagaata agcgatattatttctccactagctaccatctttccttgaccagatagatacaatggataa aagaatcctgaataaaacaagaaactctctaaaaatacacttgtaaccattgataggtat aatccctcttgatttgtagtattttcgtattgagctaaaactaaatcagcctttctttgt aatgttggttctgtttctatccattcaaataattcatctatttctaaattagaaagtaga gtcataaatatagaagaataactttttgcatgtatttcttccatagtccccataaaagac aagacagcttttctttgtaggttttctgttaaactcatcatagatggtattccattattc ccctgttttgtatccagtaatgttaaaccacccaatacttttttatataattccttttct ttattacttagttcattccatacctttatgtctttagaaacagatatttcttcaggaagc caaaattgttttacattttgttcccaaaaagcttgtgtaaatccatcttcttctctattc cagttaactgcattatgtattttatgtaaattaaatgtcatatatttctctccctatact gaacacactagacactcatgagtatctcttgtcatctttgttcttgtgtaatataaactt ttcaaaccttttttataggcatatatgtaatgtctagctatatctctagttgtcttttca tctgtaacaaacagtgttgttgatataccttggtcaacatggttttgaactgttgccact aaatctatgacctttctcatatccatcctgtatgctgattgataatacaacatattatca tttgttaaaaatggcattggatatattgtagtagagtctccatatgttcttacttctact ggctcagtaattggcattatacttgatgtagcattttgaacataactaatgctttgagtt ggtgctactgccattaaatatgcattatatatccctttttcttttacctcatccaataat tttgtccagtcttcttttgttggtatataaatcccttcaaataatgctcttaccttttct gacttaggtagataagattgttcatagtattttgataaaaccttgctatttcttccctta acatattctgatttatcaaatccttcaaaagtttgatttctttctatagctattttcata gaagctttaattgaatagtatctaaccattgcaaaaaatacattagaaaaatctatagca tcatctgaagtatataaaatattttctcttactaagtatccatgtaaattcatagctcct aatcctatagaatgagacttgctgttactattgcttaccgttggcactggttttatatct gtgctatctgctacaaatgacagtgctcttattgctgtttcaactgtactttctatagtt ttattatccattacattagctatgtttaaagaacctaggttacaacttatatcttgtccc cattcattttttcctccatacccctctatttctgaaggtgtttgatattgaaatatctca caacataagttagacattttaataattccaacatcttttaatgtatgttctctattagct gtatctatgtacactacatatggatatccactttcttgttgcatctgtgctatttttgtc aacatctgcctaggatttatttctttttttcttatatcactatcattaaccaatttatca taccactcatccatttctatctcatcaagagaaactccatatttcttatacacagtatga ggataaaatgcatatgctacttcatttttttctgccaactccataaatttatctggtatt atagctcctaatgataatgtagcaagtcttattttttcatctgcatttatctttttagta tccatcaacaattcaaaatcaggatggaatacagtaaggtacaccgcaccagaaccttgt ctagctcccatttgattaaagtaactaaatgattgttctaacattttagctactccaaca acacctccagctgcaccttctatatctttgatagattcgccagatgctctaagtttagat aaatttagtgcaactcctccaccaatctttgataagtgatttgatgaagatatagcatat gatataccttctgtactatcttctacagatagtaaaaaacatgataccatttctccagcc ctttttcttccagcatttaaaaaagtaggtgtagctggttgaaattcttgttttactatt ttatctgccaagtttaaagctaaatctttatcgccatttcctagtgtcaaagctacaatt aacactttatcattatatgtttctaatatttcctttccatcattgctctttaatgcataa ttttgataaaacttatttgcactcatatatgattgaaattcaaacttatgtttatcaatc atatcatatatatttttaataacatctatgctatactgatttattacttcttttgaataa taaccttcatctattaaatacttcaatctttcttctaggttattaaattttctcaacttt ggctgtataaattcttctatgtaactacttaaggcttccttatccttttccaattggtac ttgccttgttcatttttaattatcacttgattgttaagctctatccaattcattatttac cgtccttttaacataatcttgtgccataatttcacttaatttgcttattatttcttttgg tacttatcagttgaaatcccaaaattaatctataattatagaaatgcaataagtattttt caaaaacaaaagcactacatatagtcagtgctttatctattatatactacatatagtata tacacaaatttttttatatctaaacttttattactttataattgacattatttttattta aagaaatttttatcaactcaaatataaaacaatacaagcttattatgtcctgtttaaaaa tttaaattatctctaaatagcttgaaaatatattctgatatattgaaaaaagtactttca agatgatattttatatattatttagaagttttttatttattgttatataattaaatatat gactattttgctactacatatataaaaataaatttatgaaggtgattttaatgaaaacta tttctaaacaagaattagaaaaaacacttgagaaacattatttatggcttaaaaacaata atgctggagaaaaggcagatttaaaagaattaagattagaaaatatggacttaagaggat actgcttaagtaatattgacttttcgtggtctgaccttatcaatttaaatttagaaaaag cagatttagaaaactctatttttaataattcttatctttcggattgttcattaaaaaatt ctatattaaaaaatgcagacttaagtggtgcaagttttagattttgtgacttatctaact cagatattagaggagctaatttagaaaattcaaatttagaatatgctactttaaatggag taatatcagatgaaagtacccgtttttttaaattgtattgtcctgaaacaggagcattta taggctataaaaaatgttttaattttagaatggtacaattattaatacccagcgacgcaa aaagagtgtctgctacatcaaatgcttgtagatgtgataaggcaaaagtactgtcaatta ctagtatagatggtaaagaatcttttaaaagtgctcgtgcatatgctgatgaaaatttta tatatagagtaggagaaacgattgtagctgaagattttaatgaaaatagatggaaagaat caactacagggattcacttttttttaactagagaggaagctattggttatctataaaatg ctaaagttttataaatatataaatacataaacaaaataacaaaagagtatagattgtaat ttcaaaaaaattataatctatactcttttttctatagcacataagtacattttatttcat aaattataataaattatttatatctgcactattgattatttgagaaactttatctatatg ttctatcttactatccaaactgtcataatacttcttactctcatctctatttctaaaaga ataaacttttttatccaattttaaagcctcttttataatatctatattcctcttatttgt ctctcctacactaaatcctgtatctattataatcttggaatcatttaaatttctaatagc caaatcgaaactctcatcacttataggctcaaatggattttctgtaaacatctttatccc catagttctaccaatttcataatcaatatcattttcatgtattattccagaatacagacc tataccttttttagtaaaagctctataaattggtgttgctttacccccaccaccaattat aaaaacttcatttttagatttattactaatttctactgaacctaaaagactattaaagtt tttatcatccaattcataaagcgaatttataatatcctcatctactacatcttcaggctg accataagctatgactttattattttttataagagcaactttatcacaactttttaatgc tatgtctatttcatgcaatgaaagtattactgatattgacttttctttacttaatttttt cagtatgtttatgagttccaatctatgttttatatccaagtgagttgtaggctcatctaa tataattatttctggttcttgaacaagagcccttgcaaccaacaccttttgtttttctcc atcacttagttcatcaaaatatcttttctttaaatgtaaggcatctacagactccaatgc ttcatctaccattattaaatctttcttagatagactcccaaaaaatcctgtatatggata ccttcctatattgactatatcttgtacagtcattaaatcacctaataatctatttgtaag tactaaagccattttttttgataatgcttttcttgatatacaatttatgtttacaccatt caaatatatttcaccttttattggtgatataagtttagataaggaccttaatagggtagt ttttccagctccattacttcccaaaagacatagtatttctccattttttacttctacatt tatattacttataacaactttgttattgtatcctacacttaaattattagttttcaacat gtctaagccctatccttccttttcaccaataacattactacaattggagctcctaataaa gatgttatcgtacttattggtaattctactggtgataaaattactcttgatattaaatca caaagagctgtaactatactgcctaaaaatattactactggtatcaaaactctattatct gatgttttaaatatcatttttgaaatttgtggcactgcaagtccaataaaccctataggt cctgcaaatgctgatactattgctgctaatatactagatataaatactatcaaaactcta aaaaatcttatatttatgccaatactttttgcatactcttctcctagtaaaaaagcattt aaaggttttattatgaatacagtcatcaaaagacctaatataccaactattataagtatt tctaccttttcccatgtaaatccagaaaaacttcccatagaccacatagtaaattctttt aatttatcactatttgcaaatgattgtaacacatttgttataccactacatacatatcc |