| Block details | |
|---|---|
| fasta | C_difficile_CD00275_1A_021018.fasta |
| contig | u00000crpx_c_021018 |
| start | 3323672 |
| length | 16897 |
| strand | + |
| type | core |
| seq | aattgaaacttcactatctaataatttaattaatgagatgctattacatttatctatttc ataaccaccataaatcccaggtgttgaatttataaatataccagcttgctctaaatacat cttataactttttatttgcctttcacttacttccaactcttctgataattctttgcattt cattttgcctctactttgaattaatatcatcattctaagtgtattagctaatttactaat gagtaaccccccctaataacattaattgatatttttattatttatttctacacatatgta catataacctctttatattttatataagtagaatttttttataattttgacatttaccat attatattttatatttgtacaaaattttaatagttaatacaataaaaaatattactgaaa aaataaacatctataattccagtaatattaattaattctaaaccctttttattatcattt aataatagtaactaaaaattgactaaatttaaccttatctcttttaaataattatttctt acaattaaaaaataaactatttgaaccaagaacaagcttcccattaccaaaacagctgat gatgctacttctatatcaaaagaatttttaagtgcagtaagtgcaaatattgaatgtata acagccactacataaggaaacaaaaatactattccaatctcaattgttgaagctttttta atctcattatatgtcatccccaatttatttaattgctcatactttttcttatcaacttgg caatccatataaaatttattatataaaaaactacttgtagtaacaaagaaaattaaacct ataaatattgctaaaaatataaatgtagaatacattaatttcccagttcctatcattaat tctttagagaaaaacaaatatggttgcatccctgactcattattaaatttattttcaaat tctctgcatatctctatagttttacttgaatcctctacttcaaatgcagtaaatctatcc actataaattttgattctatactatcataaaaattatcctttaccacatacatatttttg taatatgctggcataacacattcttccacttgttttgccacctttaaacctctattccct acaataatattttctttgacgttattatttcctggtaaacttgatgataataatgatata cattcattatcttcaaaacttataggcttaacccctatagtttctgtaatttctaagtac ttagattctttcataattctgacattaaaatcacttttcttgggaaatacagttttaaat tcaccattagtccttgtatagtttacattctctttttttagattattttctataaacatc attctttccttgtctttttctttgctatcaggctttttagggtcattatgcaatgtcatt gttgaataatatattgtgttaggatatattaaattaatttgacgctctacatctttccaa aaggaataaactgtacctatagcagtaaatgctactgcagaagttatagttatcaagaaa aatattctagcattatcctttaccttataaatcaagttcgaaatccaaagcatatttgta ttttttctataaaatctcttgtttagttttagcttcttcataaaaaatacactaaattga gaaaagaacaagtaagttgctactatagtaagggatgtaactggaactaagcgcagatat gttgtatattggtcggttgaggtaatagcattataatacgctattataaacaaacaaata cttaatatagcaagcattagtgatgttttaggctctgattttggagtttttgtaccttta agtaacttcaacacctgattttctttaactataaaagaagtaaatattgatgttaataca gctaaaatcataaaatagattaaagtagacaatatcgcattaaatggtatatagaatttt aatggtgataattctaaaaaagtagacataaccactaaaaatatctttgcaaagattaag cctattattattccaattacagaagatactatatttattatcatattttctataaagatt aatttcattacttggcgctttgatatacctgtaatataaagtattccaaattctttatat ctacttttaagaaacacactaactgaataaaacacaaagaagaataagaatagatatgca attatcttactcatcttgagaccttcttttaaataatcaggaaattgagatacatctaaa tctggatgacttgtaaacataataaaagaaaatagcagtgaagatgatataacaatactt gctaagtatcctaaatacgctttaatatttcttgaaatattgttaatagcaaactgtttt atattcattagttatcgcctcccaataatgtaagtacatccattatctcttgataaaact gctctctactactacccttatatatttcattatatatatacccatcttttatgaataaga ttctactacagtagctcgctgctaatgggtcatgagttaccatcatagtagtaactttat tttctttatttatcttttgaaatagctccattacaacctttgatgactttgaatctaaat tacctgttggttcatctgctaaaagtattgatggattgttaatcaatgctctagcaatag cagtcctctgagcttgaccacctgatacttcaaaagttctttttcctaataaatctttta tacctaatattgtagatacttcattcaatctctcatcttgctcttttacactgaccttat ctaatgtcaatggcaatactatattttctcctatagttaatgtatccaataaattaaaat cctgaaatacaaaacctaactctcttcttctaaataatgcaagttcctcacctcttaaca ataaaggattcttgccctttaattccatagttcctgtagttggcttgtcaatagtagaaa tcatatttaaaagagtagtttttccactaccagatggacccataattcctacaaattctc catcttctatactaaaatttatgtcatttaatgcgttgaaaattatttttttaccatata ctttacttaaattatttacagttaaaattttcattatttaactatccttcctaatttaat ttttgaaataacatatatataattgttaattataatttatcttagtttaatttttataga taataaatctattttttctatacactaattatgttagtaaaagctaatactgcaagtact acacccatgattattctgtatacagcaaacactctcattggttttttctttaaaaaattc acgaatttttccataactattattgatacaataaaagctactataaacccaactaccaaa gcaatccacaatgttggtgtcattattgaataatcaaattcaaataaatcttttcctgaa gaagccaccatagctggtactgctaaaaagaaagaaaactcagctgctgtaggagaatta agtcctgctatccatccacccataatagtagatgcactccttgacatacctggccatgca gacaaaacttgtaatgtcccaacctttaaaacttgtattggagtaattttatctatatta tctgtggaatgattcttttttctaaacaaagtttctactactaataataaaatcccaccc actataaatcctataattacagattgtaaattaaacaatgattttatattatcgtaaaat agaactcctataatcgcaaatggtatacaacctataattacattcattccaaatctaaaa ccaatctttccttcttttccgccagtaaatataaatttaaaaaattctataacgctatct tttatctttttccaataaagtactactactgctaatatagccccaagttgtattacaacc tcaaacatttcagcaaattgccccttaaaatctattaaattaccaaccaaaatcatatga cctgtagatgaaactggaataaattctgtaagcccctctactatagctattatgactgat ttcaatataaaaataacatctaaactcatcaataaacatccttccttttttacaaaattt ctttttttatgttatttctcttatgttatttcttatattaattgtaatttagattagaaa atttaactatctgcaaacattacacaaaccttacatctatgtaaggtttgcaaataaact ctcttaaattttgattatttaactatgaatatttcatttaataaattgtataataaaaaa gtacaattaactaaaaaccctattgtaacagataatttacacctttattaaactatttac atctttattaaagtagattgaaacttctgtaccttttcctacttctgattttatacttac tttatgacctaaatcatcacataccttttttactagataaagacccatacctgtagattc tccaaacttacgaccattttctcctgtaaaaaatgggtcaaataccctttttaaatcttt agaaacaattccaattccttcatctattatacttaaaattacatatttattattttcttc agattttatagttaggtagttactataatctttagaatatttcactccatttgtaattaa ttgacctattataaatttcatccattttacatctgtataaacataagtaaatttgtctac ttgaatcttaggaatcattccactttttataaataaccttttttcttcatttacaatact agatacaatttcatttaatttggctttttcaactataaagtctttctgaaaattatctgc ccttgcaaaatgcatagccatatctaaccctttatttaatctatctatttcttttcttat attttcagttacttcttctccctcataatcttgaagctgaaggcttataactgatattgg tgttttcatctgatgaatccattggttgatgaaagttaaatgttcactatgtatcttttt atgctcttgtatcattgattgatacaatttatgttgttgttttaaaataactgatatatt tctccccaagaatgagcttcctaaatacaaaaatgactcctccaaagaatgtactccttt ttcaaacagattatatacttctctatttttataatacttatatattaaaaaacataacaa tataaaagaactaaataaaagaatatataaactctctccaaaactaataaacttcataag attacagtaaataattgtcataactatgcctatataatatataaaaatataacctttata atcttttaaaaataacttcatactttctccttaccaattcttatttaatttatatcctaa ccctcggacagtctgaacagcattatctatacctaattcctcaaatcttttccttatcct gctaacatttacatttaaagtattttcctctacaaactcaatatcatcccatatcttttc taaaagataatctctacttactacttttgggtatctcttgataagacattcaatcagtat accttcttttttagttataattagattctcaccatttaattctagttctaacctttctgg ataaaactttaatccatctagctccactattctttcgtctattttaggtgaatattcacc atatacccttcttatatgactctttatttttgccattactacatcatagtaaaaaggttt tgttatataatcatctgctccactttctaaagctctaatttggtctacattaccatctct agctgatataaaaattataggtaaattcgactgttgcctaatacatctacaccagtagaa accatcaaatttaggtaaatttacatctaatagaactaagtgtggcttaaaactttcaaa tgtaatcattatatcatcaaagttttcttcaacaatcacttcaaatccatatttctcaat ataatctttaagtaatgtacttattgatatatcatcttccacaatatatactttataact catataattcctcctaatatacctatttactcattatataacagtccaattttaatatat tataatctttttacaatatataaatttaatcatattactaacttcacaattactgacttc ataagtataaccatattattagacatcttaataaaactctataaaaaagtatctttttat gattaattaatcattattatcaactaatcattctaaaataaattgaaattactaattcaa aatagaaaaagttaccttaataaggtaacttaaacttttattatatttcttacttagtat tattttatcatagtttctacttagcattatagattaattcttttatgttcacttttttct cttgtaacttattttttattaagaagtcttgtgtatcttcaagcgaagatatgtctttat ctgttatatctaaactaaaatcataccaagcatataattctttagtttcttcaagactta aatcaacttctttagctactttttccatagcttcatcaaaattattatttacatattcta aagtttccttttcaaccttcataaatctttcaactatttctggatgtttctctgcaaagt ctgtgctaacagcagttactattataccatctactaaaccttcaccatttgctataagtt tactacctgacttcatagctttaagagctgctggaccagcaatcaatgcagcatctacgc tgccatcagaaagagctgctgatgcctctggaatacccatattaacaaattccacatcat ccatacttaatccttctttatcaagtgctgaaatcaatacctgatgtaatatagtccctt ttgggcctgccaccttcttacctactaaatctgctgctgattttattgaattattattag tcaaaatcataaatccttttggtgacctgctataagtgtttaatatctttaactctactc cattagatgcagctattaaagctgatgtaccacctagtgcatgtaagaagtctatttctc cagcagctaaagcttgtgtttgctctggacctgtagtaatttcgtggaagttaactttta tattatcctttttaaattcctttccaaataaatcatcctgtttctgaattatagaaggaa catttaatggtgattttacataagttaaatttatttctgaaagtttttctccattatttt ttttagcacatccagctaaagatgctgttgcaagtgttaatatcgttatacctatcaata gcttttttaatttcatttactttactccttaaaatattattaatttctttaaatgccttt atttgatttcattgtcattaaaatatctttttttaatttaatatagtaatctgaagttaa atctctattataaccatcttctatattaaattcttttatttttctttcgtctgtgaaaac aactattttcttgcctatctttaacgcttcatcaatatcatgagttacaaatatcacgcc tttattagttgacttatgtattcttataacttcattttgcatatcaatccttgtaaaata atctaatgccgaaaaaggctcgtccataagcaacatatctggattgaaagaaagagctct agctatgcttactctctgtgccatacctcctgacaattcatttggataagagtttttaaa tttctgcaagttcatcatcttaagatatttttctacatcaatattacttttcctattata tttatttgatttgttcaaattatcatttgtttctaagcttctaaaattatcatttataat tttactgctaattcttttattgtgtttaaattttctaagcaccttgtttaaaatagtatt ttttctttgattatgaaaagctatattttcacttacgtttaaccaaggcattaatctgct ctcctgaaaaacaaaaccaacattaggtctatactctttattatcattaataaacctaat ttcaccactatttataccttcaagtgatgcaattgctctaagcaaggtagtctttccaca accactttcacctaaaattactgttatatggtttctatctatgtttaaagagatatcact aagaactacatgttcttcattgtcaactttataacttttatataaatttctaattatata tccagagtcacatactaaattattcatatgcttccaccatctttcccttacttaccttct tcacaataatcgaaaatatgtaatctgtaattattcctaaaagtccaattacgattatac ctacaataacaacatctgttctagacatttcttttccatcagatatcaagtatccaagac cagatgaagctgctacaagttctgccccaataattgctctaaagctatatccaagagcta actttaacccaacagcaatatcaagaatggcatttggtattattattttaaatattatct gaagctttgaaaactcaaatactctacccacttcaatcagttttgagtcacaatttttaa tccctttcaatgtgcttgtaaagattgggaaaaaggatgctaaaactataattataattt ttgattcctctcctataccaaaccataatataagcattggtattaaagcaaggggaggtg tattccttaaaaaatttattagagatttaaagtattcatatactccactataaattccaa agaatatccctaaaggcacacctatagcagtacttattgcaaaacctatcaaaactcttt tcatacttgcatatacattaataaatattgaaccatcacttatcatatttaaaaatgtac tatataccttttcgggtgatggtaatatataatcactccaaataccaagataatttgtaa ttttccataataaaagaattataaaaaatatcagaacactctttactagccttaaaaact tattattaaatttattgaccatttacaaaccatctccattattacaaccatctttacaat aaaacatttctactatgtcatacttatcttcaaagccatttcttattttttgtatttcac ttaatatttcgtcttcacttgatacttcaagaactttttcaaaagtatctttgaaatatc ctaatggaattggtgattcatctatttttccaagtgattttacaccttcttgttcagcaa actctttccatgtataaaacatagcattacccttatccttaaacttttcacttgcaaagt ctcttaattgtgtacatggacaggttactaccaacatatcatctttactttttatatatt tatcgtataaaaccctacaagtccttactaatattggttctatcataggtacttcaaaat catttatcaaattatttctttttaaaagacttatactttctggacatctacaatccaaca ttgtatttttagtcttttttgtatactctttgtactgcttttttacatattctaactgtg gttcacattctgctattatgtaccccttttttatcaaatttgctttaataaggtgaaact tttctccatacattctttctgccactggatttattagaagatatttattcataacgcctc ctattatttaatattgaatattattatcaattaatagtttaaatgagcacttaaattttg tcaatatattaattttttcttaataaaacaatttttatctacattttttaatattttaaa tgaaatattaaatagtatatgtaatttattttaattaataatgcatacatcttactaata atctacttatataataatctataaatattatataataatacttatataattagtattatt atttaatagcaacagttattcacactaataaaagtagaaagtttttaaaatattatgaaa catcaaatttaattttaaaattgcatcaaaaaatgaagtctcaacagacttcacttttta taactcttataaattattcaaaatatttatacttccctttctacttcaaaacgtaaaacc gtcttcaatgattcaggcgatacttttctagcatcacttatataaatttcacgatgtgtg taagattttcttataagtttattttttttgcaaaattcgttcataatgtcaaagctttct ggttcattatcatatgaacctatatgaagcatttgaacacatagcccttcattaatagac ccaaatctaactttttcaagaagattatgaggttttttcttctttactatatcagtagct ttatccaacaggtcttgtgtaacaaaatctggctgacgtatcattatagtgtaaattaaa tcttctttaataagtacatctaagcctttacttttttctcccttatcccatataccttct aaaggaaaaaccgtatagtcaaaatacccttctggtacaattccttttttaggcatggtt tttattgcatatgccaaagaataaagtactcctattgcttcagtaaattctttagaattt gggtctccactcccttttaacatgataaatttctgttctggtatttcaactattacagga ttctttttaggtaaatataactctttatctctttttctccattcatatttcataaaaata cctccatatatattttatacattgatattatcacgctaaaagtgacaacagtgtgtcata attataaattatattataaaatcttcatcctctaattcctcatacactcctttttggtat ccattacccttagttgaaaagaaatcatgtgttttggtttcagtgctaagaccatttaat acaattggatttatagcatctacagtatatagcttctcaaaccctagattttctaaagct ctattcgcattgtattttaaaaagtttacaacctctttttcaagcccactttctctgtat ataacatttgtatactctatctcattctccataaggctataaagtatagaatacatcttc tcttctaacatctccttatccattttatcaaatgaatcgtatatttcttgtgctagcaat cctatatacttaccatgtaaagactcatctctaagaataagcgatattatttctccacta gctaccatctttccttgaccagatagatacaatggataaaagaatcctgaataaaacaag aaactctctaaaaatacacttgtaaccattgataggtataatccctcttgatttgtagta ttttcgtattgagctaaaactaaatcagcctttctttgtaatgttggttctgtttctatc cattcaaataattcatctatttctaaattagaaagtagagtcataaatatagaagaataa ctttttgcatgtatttcttccatagtccccataaaagacaagacagcttttctttgtagg ttttctgttaaactcatcatagatggtattccattatttccctgttttgtatccagtaat gttaaaccacccaatacttttttatataattccttttctttattacttagttcattccat acctttatgtctttagaaacagatatttcttcaggaagccaaaattgttttacattttgt tcccaaaaagcttgtgtaaatccatcttcttctctattccagttaactgcattatgtatt ttatgtaaattaaatgtcatatatttctctccctatactgaacacactagacactcatga gtatctcttgtcatctttgttcttgtgtaatataaacttttcaaaccttttttataggca tatatgtaatgtctagctatatctctagttgtcttttcatctgtaacaaacagtgttgtt gatataccttggtcaacatggttttgaactgttgccactaaatctatgacctttctcata tccatcctgtatgctgattgataatacaacatattatcatttgttaaaaatggcattgga tatattgtagtagagtctccatatgttcttacttctactggctcagtaattggcattata cttgatgtagcattttgaacataactaatgctttgagttggtgctactgccattaaatat gcattatatatccctttttcttttacctcatccaataattttgtccagtcttcttttgtt ggtatataaatcccttcaaataatgctcttaccttttctgacttaggtagataagattgt tcatagtattttgataaaaccttgctatttcttcccttaacatattctgatttatcaaat ccttcaaaagtttgatttctttctatagctattttcatagaagctttaattgaatagtat ctaaccattgcaaaaaatacattagaaaaatctatagcatcatctgaagtatataaaata ttttctcttactaagtatccatgtaaattcatagctcctaatcctatagaatgagacttg ctgttactattgcttaccgttggcactggttttatatctgtgctatctgctacaaatgac agtgctcttattgctgtttcaactgtactttctatagttttattatccattacattggct atgtttaaagaacctaggttacaacttatatcttgtccccattcattttttcctccatat ccctctatttctgaaggtgtttgatattgaaatatctcacaacataagttagacatttta ataattccaacatcttttaatgtatgttctctattagctgtatctatgtacactacatat ggatatccactttcttgttgcatctgtgctatttttgtcaacatctgcctaggatttatt tctttttttcttatatcactatcattaaccaatttatcataccactcatccatttctatc tcatcaagagaaactccatatttcttatacacagtatgaggataaaatgcatatgctact tcatttttttctgccaactccataaatttatctggtattatagctcctaatgataatgta gcaagccttattttttcatctgcatttatctttttagtatccatcaacaattcaaaatca ggatggaatacagtaaggtacaccgcaccagaaccttgtctagctcccatttgattaaag taactaaatgattgttctaacattttagctactccaacaacacctccagctgcaccttct atatctttgatagattcgccagatgctctaagtttagataaatttagtgcaactcctcca ccaatctttgataagtgatttgatgaagatatagcatacgatataccttctgtactatct tctacagatagtaaaaaacatgataccatttctccagccctttttcttccagcatttaaa aaagtaggtgtagctggttgaaattcttgttttactattttatctgccaagtttaaagct aaatctttatcgccatttcctagtgtcaaagctacaattaacactttatcattatatgtt tctaatatttcctttccatcattgctctttaatgcataattttgataaaacttatttgca ctcatatatgattgaaattcaaacttatgtttatcaatcatatcatatatatttttaata acatctatgctatactgatttattacttcttttgaataataaccttcatctattaaatac ttcaatctttcttctaggttattaaattttctcaactttggctgtataaatgcttctatg taactacttaaggcttccttatccttttccaattggtacttgccttgttcatttttaatt atcacttgattgttaagctctatccaattcattatttaccgtccttttaacataatcttg tgccataatttcacttaatttgcttattatttcttttggtacttatcagttgaaatccca aaattaatctataattatagaaatgcaataagtatttttcaaaaacaaaagcactacata tagtcagtgctttatctattatatactacatatagtatatacacaaatttttttatatct aaacttttattactttataattgacattatttttatttaaagaaatttttatcaactcaa atataaaacaatacaagcttattatgtcctgtttaaaaatttaaattatctctaaatagc ttaaaaatatattctgatatattgaaaaaagtactttcaagatgatattttatatattat ttagaagttttttatttattgttatataattaaatatatgactattttgctactacatat ataaaaataaatttatgaaggtgattttaatgaaaactatttctaaacaagaattagaaa aaacacttgagaaacattatttatggcttaaaaacaataatgctggagaaaaggcagatt taaaagaattaagattagaaaatatggacttaagaggatactgcttaagtaatattgact tttcgtggtctgaccttatcaatttaaatttagaaaaagcagatttagaaaactctattt ttaataattcttatctttcggattgttcattaaaaaattctatattaaaaaatgcagact taagtggtgcaagttttagattttgtgacttatctaactcagatattagaggagctaatt tagaaaattcaaatttagaacatgctactttaaatggagtaatatcagatgaaagtaccc gtttttttaaattgtattgtcctgaaacaggagcatttataggctataaaaaatgtttta attttagaatggtacaattattaatacccagcgacgcaaaaagagtgtctgctacatcaa acgcttgtagatgtgataaggcaaaagtactgtcaattactagtatagatggtaaagaat cttttaaaagtgctcgtgcatatgctgatgaaaattttatatatagagtaggagaaacga ttgtagctgaagattttaatgaaaatagatggaaagaatcgactacagggattcactttt ttttaactagagaggaagctattggttatctataaaatgctaaagttttataaatatata aatacataaacaaaataacaaaagagtatagattgtaatttcaaaaaaattataatctat actcttttttctatagcacataagtacattttatttcataaattataataaattatttat atctgcactattgattatttgagaaactttatctatatgttctatcttactatccaaact gtcataatacttcttactctcatctctatttctaaaagaataaacttttttatccaattt taaagcctcttttataatatctatattcctcttatttgtctctcctacactaaatcctgt atctattataatcttggaatcatttaaatttctaatagccaaatcgaaactctcatcact tataggctcaaatggattttctgtaaacatctttatccccatagttctaccaatttcata atcaatatcattttcatgtattattccagaatacagacctataccttttttagtaaaagc tctataaattggtgttgctttacccccaccaccaattataaaaacttcatttttagattt attactaatttctactgaacctaaaagactattaaagtttttatcatccaattcataaag cgaatttataatatcctcatctactacatcttcaggctgaccataagctatgactttatt attttttataagagcaactttatcacaactttttaatgctatgtctatttcatgcaatga aagtattactgatattgacttttctttacttaattttttcagtatgtttatgagttccaa tctatgttttatatccaagtgagttgtaggctcatctaatataattatttctggttcttg aacaagagcccttgcaaccaacaccttttgtttttctccatcacttagttcatcaaaata tcttttctttaaatgtaaggcatctacagactccaatgcttcatctaccattattaaatc tttcttagatagactcccaaaaaatcctgtatatggataccttcctatattgactatatc ttgtacagtcattaaatcacctaataatctatttgtaagtactaaagccattttttttga taatgcttttcttgatatacaatttatgtttacaccattcaaatatatttcaccttttat tggtgatataagtttagataaggaccttaatagggtagtttttccagctccattacttcc caaaagacatagtatttctccattttttacttctacatttatattacttataacaacttt gttattgtatcctacacttaaattattagttttcaacatgtctaagccctatccttcctt ttcaccaataacattactacaattggagctcctaataaagatgttatcgtacttattggt aattctactggtgataaaattactcttgatattaaatcacaaagagctgtaactatactg cctaaaaatattactactggtatcaaaactctattatctgatgttttaaatatcattttt gaaatttgtggcactgcaagtccaataaaccctataggtcctgcaaatgctgatactatt gctgctaatatactagatataaatactatcaaaactctaaaaaatcttatatttatgcca atactttttgcatactcttctcctagtaaaaaagcatttaaaggttttattatgaataca gtcatcaaaagacctaatataccaactattataagtatttctaccttttcccatgtaaat ccagaaaaacttcccatagaccacatagtaaattcttttaatttatcactatttgcaaat gattgtaacacatttgttataccactacatacatatcc |