Block details
fasta C_difficile_CD00003_1A_021026.fasta
contig u00000crpx_c_021026
start 3292680
length 16553
strand +
type core
seq aattgaaacttcactatctaataatttaattaatgatatgctattacatttatctatttc
ataaccaccataaatcccaggtgttgaatttataaatataccagcttgctctaaatacat
cttgtaactttttatttgcctttcacttacttccaactcttctgataattctttgcattt
cattttgcctctgctttgaattaatatcatcattctaagtgtattagctaatttactaat
gagtaaccccccctaataacattaattgatatttttattatttatttctacacatatgta
catataacctctttatattttatataagtagaatttttttataattttgacatttaccat
attatattttatatttgtacaaaattttaatagttaatacaataaaaaatattactgaaa
aaataaacatctataattccagtaatattaattaattttaaaccctttttattatcattt
aataatagtaactaaaaattgactaaatttaaccttatctcttttaaataattatttctt
acaattaaaaaataaactatttgaaccaagaacaagcttcccattaccaaaacagctgat
gatgctacttctatatcaaaagaatttttcagtgcagtaagggcaaatattgaatgtata
acagccactacataaggaaacaaaaatactattccaatctcaattgttgaagctttttta
atctcattatatgtcatccccaatttatttaattgctcatactttttcttatcaacttgg
caatccatataaaatttattatataaaaaactacttgtagtaacaaagaaaattaaacct
ataaatattgctaaaaatataaatgtagaatatattaatttcccagttcctatcattaat
tctttagagaaaaacaaatatggttgcatccctgactcattattaaatttattttcaaat
tctctgcatatctctatagttttacttgaatcctctacttcaaatgcagtaaatctatcc
actataaattttgattctatactatcataaaaattatcctttaccacatacatatttttg
taatatgctggcataacacattcttccacttgttttgccacctttaaacctctattccct
acaataatattttctttgacgttattatttcctggtaaacttgatgataataatgatatg
cattcattatcttcaaaacttataggcttaacccctatagtttctgtaatttctaagtac
ttagattctttcataattctgacattaaaatcacttttcttgggaaatacagttttaaat
tcaccattagtccttgtatagtctacattctctttttttagattattttctataaacatc
attctttccttgtctttttctttgctatcaggctttttagggtcattatgcaatgtcatt
gttgaataatatattgtgttaggatatattaaattaatttgacgctctacatctttccaa
aaggaataaactgtacctatagcagtaaatgctactgcagaagttatagttatcaagaaa
aatattctagcattatcctttaccttataaatcaagttcgaaatccaaagcatatttgta
ttttttctataaaatctcttgtttagttttagcttcttcataaaaaatacactaaattga
gaaaagaacaagtaagttgctactatagtaagggatgtaactggaactaagcgcagatat
gttgtatattggtcggttgaggtaatagcattataatacgctattataaacaaacaaata
cttaatatagcaagcattagtgatgttttaggctctggttttggagtttttgtaccttta
agtaacttcaacacctgattttctttaactataaaataagtaaatattgatgttaataca
gctaaaatcataaaatagattaaagtagacaatatcgcattaaatggtatatagaatttt
aatggcgataattctaaaaaagtagacataaccactaaaaatatctttgcaaagattaag
cctattattattccaattacagaagatactatatttattatcatattttctataaagatt
aatttcattacttggcgttttgatatacctgtaatataaagtattccaaattctttatat
ctacttttaagaaacacactaactgaataaaacacaaagaagaataagaatagatatgca
attatcttactcatcttgagaccttcttttaaataatcaggaaattgagatacatctaaa
tctggatgacttgtaaacataataaaagaaaatagcagtgaagatgatataacaatactt
gctaagtatcctaaatacgctttaatatttcttgaaatattgttaatagcaaactgtttt
atattcattagttatcgcctcccaataatgtaagtacatccattatctcttgataaaact
gctctctactactacccttatatatttcattatatatagacccatcttttatgaataaga
ttctactacagtagctcgctgctaatgggtcatgagttaccatcatagtagtaactttat
tttctttatttatcttttgaaatagctccattacaacctttgatgactttgaatctaaat
tacctgttggttcatctgctaaaagtattgatggattgttaatcaatgctctagcaatag
cagtcctctgagcttgaccacctgatacttcaaaagttctttttcctaataaatctttta
tacctaatattgtagatacttcattcaatctctcatcttgctcttttacactgaccttat
ctaatgtcaatggcaatactatattttctcctatagttaatgtatccaataaattaaaat
cctgaaatacaaaacctaactctcttcttctaaataatgcaagttcctcacctcttaaca
ataaaggattctttccctttaattccatagttcctgtagttggcttgtcaatagtagaaa
tcatatttaaaagagtagtttttccactaccagatggacccataattcctacaaattctc
catcttctatactaaaatttatgtcatttaatgcgttgaaaattatttttttaccatata
ctttacttaaattatttacagttaaaattttcattatttaactatccttcctaatttaat
ttttgaaataacatatatataattgttaattataatttatcttagtttaatttttataga
taataaatctattttttctatacactaattatgttagtaaaagctaatactgcaagtact
acacccatgattattctgtatacagcaaacactctcattggttttttctttaaaaaattc
acgaatttttccataactattattgatacaataaaagctactataaacccaactaccaaa
gcaatccacaatgttggtgtcattattgaataatcaaattcaaataaatcttttcctgaa
gaagccaccatagctggtactgctaaaaagaaagaaaactcagctgctgtaggagaatta
agtcctgctatccatccacccataatagtagatgcactccttgacatacctggccatgca
gacaaaacttgtaatgtcccaacctttaaagcttgtattggagtaattttatctatatta
tctgttgaatgattcttttttctaaacaaagtttctactactaataataaaatcccaccc
actataaatcctataattacagattgtaaattaaacaatgattttatattatcataaaat
agaactcctataatcgcaaatggtatacaacctataattacattcattccaaatctaaaa
ccaatctttccttcttttccgccagtaaatataaatttaaaaaattctataacgctatct
tttatctttttccaataaagtactactactgctaatatagccccaagttgtattacaacc
tcaaacatttcagcaaattgccccttaaaatctattaaattaccaaccaaaatcatatga
cctgtagatgaaactggaataaattctgtaaacccctctactatagctattatgactgat
ttcaatataaaaataacatctaaactcatcaataaacatccttccttttttacaaaattt
ctttttttatgttatttctctcatgttatttcttatattaattgtaatttagattagaaa
atttaactatctgcaaacattacacaaaccttacatctatgtaaggtttgcaaataaact
ctcttaaattttgattatttaactatgaatatttcatttaataaattgtataataaaaaa
gtacaattaactaaaaaccctattgtaacagataatttacatctttatcaaactatttac
atctttattaaagtagattgaaacttctgtaccttttcctacttctgattttatacttac
tttatgacctaaatcatcacataccttttttactagataaagacccatacctgtagattc
tccaaacttacgaccattttctcctgtaaaaaatgggtcaaataccctttttaaatcttt
agaaacaattccaattccttcatctattatacttaaaattacatatttattattttcttc
agattttatagttaggtagttactataatctttagaatatttcactccatttgtaattaa
ttgacctattataaatttcatccattttacatctgtataaacataagtaaatttgtctac
ttgaatcttaggaatcattccactttttataaataaccttttttcttcatttacaatact
agatacaatttcatttaatttggctttttcaactataaagtctttctgaaaattatctgc
ccttgcaaaatgcatagccatatctaaccctttatttaatctatctatttcttttcttat
attttcagttacttcttctccctcataatcttgaagctgaaggcttataactgatattgg
tgttttcatctgatgaatccattggttgatgaaagttaaatgttcactatgtatcttttt
atgctcttgtatcattgattgatacaatttatgttgttgttttaaaataactgatatatt
tctccccaagaatgagcttcctaaatacaaaaatgactcctccaaagaatgtattccttt
ttcaaacagattatatacttctctatttttataatacttatatattaaaaaacataacaa
tataaaagaactaaataaaagaatatataaactctctccaaaactaataaacttcataag
attacagtaaataattgtcataactatgcctatataatatataaaaatataacctttata
atcttttaaaaataacttcatactttctccttaccaattcttatttaatttatatcctaa
ccctcggacagtctgaacagcattatctatacctaattcctcaaatcttttccttatcct
gctaacatttacatttaaagtattttcttctacaaactcaatatcatcccatatcttttc
taaaagataatctctacttactacttttgggtatctcttgataagacattcaatcagtat
accttcttttttagttataattagattttcaccatttaattctagttctaacctttctgg
ataaaactttaatccatctagctccactattctttcgtctattttaggtgaatattcacc
atatacccttcttatatgactctttatttttgccattactacatcatagtaaaaaggttt
tgttatataatcatctgctccactttctaaagctctaatttggtctacattgccatctct
agctgatataaaaattataggtaaattcgactgttgtctaatacatctacaccagtagaa
accatcaaatttaggtaaatttacatctaatagaactaagtgtggcttaaaactttcaaa
tgtaatcattatatcatcaaagttctcttcaacaatcacttcaaatccatatttctcaat
ataatctttaagtaatgtacttattgatatatcatcttccacaatatatactttataact
catataattcctcctaatatacctatttactcatcatataacagtccaattttaatatat
tataatctttttacaatatataaatttaatcatattattaacttcacaattactgacttc
ataagtataaccatattattagacatcttaataaaactctataaaaaagtatctttttat
gattaattaatcattattatcaactaatcattctaaaataaattgaaattactaattcaa
aatagaaaaagttaccttaataaggtaacttaaacttttattatatttcttacttagtat
tattttagcatagtttctacttagcattatagattaattcttttatattcacttttttct
cttgtaacttattttttattaagaagtcttgtgtatcttcaagcgaagatatatctttat
ctgttatatctaaactaaaatcataccaagcatataattctttagtttcttcaagactta
aatcaacttctttagctactttttccatagcttcatcaaaattattatttacatattcta
aagtttccttttcaaccttcataaatctttcaactatttctgggtgtttctctgcaaagt
ctgtgctaacagcagttactattataccatctactaaaccttcaccatttgctacaagtt
tactacctgacttcatagctttaagagctgctggaccagcaatcaatgcaacatctacgc
taccatcagaaagagctgctgatgcttctggaatacccatattaacaaattccacatcat
ccatacttaatccttctttatcaagtgctgaaatcaatacctgatgtaatatagtccctt
ttggacctgccaccttcttacctactaaatctgctgctgattttattgaattattattag
tcaaaatcataaatccttttggtgacctgctataagtgtttaatatctttaactctactc
cattagatgcagctattaaagctgacgtaccacctagtgcatgtaagaagtctatttctc
cagcagctaaagcctgtgtttgctctggacctgtagtaatttcgtgaaagttaactttta
tattatcctttttaaattcctttccaaataaatcatcctgtttctgaattatagaaggaa
catttaatggtgattttacataagttaaatttatttctgaaagtttttctccattatttt
ttttagcacatccagctaaagatgctgttgcaagtgttaatatcgttatacctatcaata
gcttttttaatttcatttactctactccttaaaatattattaatttctttaaatgtcttt
atttgatttcattgtcattaaaatatctttttttaatttaatatagtactctgaagttaa
atctctattataaccatcttctatattaaattcttttatttttctttcgtctgtgaaaac
aactatttttttgcctatctttaacgcttcatcaatatcatgagttacaaatattacgcc
tttattagttgacttatgtatttttataacttcattttgcatatcaatccttgtaaaata
atctaatgccgaaaaaggctcgtccataagcaacatatctggattgaaagaaagagctct
agctatgcttactctctgtgccatacctcctgacaattcatttggataagagtttttaaa
tttctgcaagttcatcatcttaagatatttttctacatcaatattacttttcctattata
tttatttgatttgttcaaattatcatttgtttctaagcttctaaaattatcatttataat
tttaccaataattcttttattgtgtttaaattttctaagcaccttgtttaaaatagtatt
ttttctttgattatgaaaagctatattttcacttacgtttaaccaaggcattaatctgct
ctcctgaaaaacaaaaccaacattaggtctatactctttattatcattaataaacctaat
ctcaccactatttataccttcaagtgatgcaattgctctaagcaaggtagtctttccaca
accactttcacctaaaattactgttatatggtttctatctatgtttaaagagatatcact
aagaactacatgttcttcattgtcaactttataacttttatataaatttctaattatata
tccagagtcacatactaaattattcatatgcttccaccatctttcccttacttaccttct
tcacaataatcgaaaatatgtaatctgtaattattcctaaaagtccaattacgattatac
ctacaataacaacatctgttctagacatttcttttccatcagatatcaagtatccaagac
cagatgaagctgctacaagttctgccccaataattgctctaaagctatatccaagagcta
actttaacccaacagcaatatcaagaatggcatttggtattattattttaaatattatct
gaagctttgaaaactcaaatactctacccacttcaatcagttttgagtcacaatttttaa
tccctttcaatgtgcttgtaaagattgggaaaaaggatgctaaaactataattataattt
ttgattcctctcctataccaaaccataatataagcattggtattaaagcaaggggaggtg
tattccttaaaaaatttattagagatttaaagtattcgtatactccactataaattccaa
agaatatccctaaaggcacacctatagcagtatttattgcaaaacctatcaaaactcttt
tcatacttgcatatacattaataaatattgaaccatcacttatcatatttaaaaatgtac
tatataccttttcgggtgatggtaatatataatcactccaaataccaagataatttgtaa
ttttccataataaaagaattataaaaaatatcagaacactctttactagccttaaaaact
tattattaaatttattgaccatttacaaaccatctccattattacaaccatctttacaat
aaaacatttctactatgtcatacttatcttcaaagccatttcttattttttgtatttcac
ttaatatttcgtcttcacttgatacttcaagaactttttcaaaagtatctttgaaatatc
ctaatggaattggtgattcatctatttttccaagtgattttacaccttcttgttcagcaa
actctttccatgtataaaacatagcattacccttatccttaaacttttcacttgcaaagt
ctcttaattgtgtacatggacaggttactaccaacatatcatctttactttttatatatt
tatcgtataaaaccctacaagtccttactaatattggttctatcataggtacttcaaaat
tatttatcaaattatttctttttaaaagacttatactttctggacatctacaatccaaca
ttgtattttcagtcttttttgtatactctttgtactgcttttttacatattctaactgtg
gttcacattctgctattatgtaccccttttttatcaaatttgctttaataaggtgaaact
tttctccatacattctttctgccactggatttattagaagatatttattcataacgcctc
ctattatttaatattgaatattattatcaattaatagtttaaatgagcacttaaattttg
tcaatatattaatttttccttaataaaacaatttttatctacattttttaatattttaaa
tgaaatattaaatagtatatgtaatttattttaattaataatgcatacatcttactaata
atctatttatataataatctataaatattatataataatacttatataattagtattatt
atttaatagcaacagttattcacactaataaaagtagaaagtttttaaaatattatgaaa
catcaaatttaattttaaaattgcatcaaaaaatgaagtctcaacagacttcacttttta
taactcttataaattattcaaaatatttatacttccctttctacttcaaaacgtaaaacc
gtcttcaatgattcaggcgatacttttctagcatcacttatataaatttcacgatgtgtg
taagattttcttataagtttattttttttgcaaaattcgttcataatgtcaaaactttct
ggttcattatcatatgaacctatatgaagcatttgaacacatagcccttcattaatagac
ccaaacctaactttttcaagaagattatgaggtttcttcttctttactatatcagtagct
ttatccaacaggtcttgtgtaacaaaatctggctgacgtatcattatagtgtaaattaaa
tcttctttaataagtacatctaagcctttacttttttctcccttatcccatataccttct
aaaggaaaaaccgtatagtcaaaatacccttctggtacaattccttttttaggcatggtt
tttattgcatatgccaaagaataaagtactcctattgcttcaataaattctttagaattt
gggtctccactcccttttaacatgataaatttctgttctggtatttcaattattacagga
ttctttttaggtaaatataactctttatctctttttctccattcatatttcataaaaata
cctccatatatattttatacattgatattatcacgctaaaagtgacaacagtgtgtcata
attataaattatattataaaatcttcatcctctaattcctcatacactcctttttggtat
ccattacccttagttgaaaagaaatcatgtgttttggtttcagtgctaagaccatttaat
acaattggatttatagcatctacagtatatagcttctcaaaccctagattttctaaagct
ctattcgcattgtattttaaaaagttcacaacctctttttcaagcccactttctctgtat
ataacatttgtatactctatctcattctccataaggctataaagtatagaatacatcttc
tcttctaacatcttcttatccattttatcaaatgaatcgtatatttcttgtgctagcaat
cctatatacttaccatgtaaagactcatctctaagaataagcgatattatttctccacta
gctaccatctttccttgaccagatagatacaatggataaaagaatcctgaataaaacaag
aaactctctaaaaatacacttgtaaccattgataggtataatccctcttgatttgtagta
ttttcgtattgagctaaaactaaatcagcctttctttgtaatgttggttctgtttctatc
cattcaaataattcatctatttctaaattagaaagtagagtcataaatatagaagaataa
ctttttgcatgtatttcttccatagtccccataaaagacaagacagcttttctttgtagg
ttttctgttaaactcatcatagatggtattccattattcccctgttttgtatccagtaat
gttaaaccacccaatacttttttatataattccttttctttattacttagttcattccat
acctttatgtctttagaaacagatatttcttcaggaagccaaaattgttttacattttgt
tcccaaaaagcttgtgtaaatccatcttcttctctattccagttaactgcattatgtatt
ttatgtaaattaaatgtcatatatttctctccctatactgaacacactagacactcatga
gtatctcttgtcatctttgttcttgtgtaatataaacttttcaaaccttttttataggca
tatatgtaatgtctagctatatctctagttgtcttttcatctgtaacaaacagtgttgtt
gatataccttggtcaacatggttttgaactgttgccactaaatctatgacctttctcata
tccatcctgtatgctgattgataatacaacatattatcatttgttaaaaatggcattgga
tatattgtagtagagtctccatatgttcttacttctactggctcagtaattggcattata
cttgatgtagcattttgaacataactaatgctttgagttggtgctactgccattaaatat
gcattatatatccctttttcttttacttcatccaataattttgtccaatcttcttttgtt
ggtatataaatcccttcaaataatgctcttaccttttctgacttaggtagataagattgt
tcatagtattttgataaaaccttgctatttcttcccttaacatattctgatttatcaaat
ccttcaaaagtttgatttctttctatggctattttcatagaagctttaattgaatagtat
ctaaccattgcaaaaaatacattagaaaaatctatagcatcatctgaagtatataaaata
ttttctcttactaagtatccatgtaaattcatagctcctaatcctatagaatgagacttg
ctgttactattgcttaccgttggcactggttttatatctgtgctatctgctacaaatgac
agtgctcttattgctgtttcaactgtactttctatagttttattatccattacattggct
atgtttaaagaacctaggttacaacttatatcttgtccccattcattttttcctccatac
ccctctatttctgaaggtgtttgatattgaaatatctcacaacataagttagacatttta
ataattccaacatcttttaatgtatgttctctattagctgtatctatgtacactacatat
ggatatccactttcttgttgcatttgtgctatttttgtcaacatctgcctaggatttatt
tctttttttcttatatcactatcattaaccaatttatcataccactcatccatttctatc
tcatcaagagaaactccatatttcttatacacagtatgaggataaaatgcatatgctact
tcatttttttctgccaactccataaatttatctggtattatagctcctaatgataatgta
gcaagtcttattttttcatctgcatttatctttttagtatccatcaacaattcaaaatca
ggatggaatacagtaaggtacaccgcaccagaaccttgtctagctcccatttgattaaag
taactaaatgattgttctaacattttagctactccaacaacacctccagctgcaccttct
atatctttgatagattcgccagatgctctaagtttagataaatttagtgcaactcctcca
ccaatctttgataagtgatttgatgaagatatagcatatgatataccttctgtactatct
tctacagatagtaaaaaacatgataccatttctccagccctctttcttccagcatttaaa
aaagtaggtgtagctggttgaaattcttgttttactattttatctgccaagtttaaagct
aaatctttatcgccatttcctagtgtcaaagctacaattaacactttatcattatatgtt
tctaatatttcctttccatcattgctctttaatgcataattttgataaaacttatttgca
ctcatatatgattgaaattcaaacttatgtttatcaatcatatcatatatatttttaata
acatctatgctatactgatttattacttcttttaaataataaccttcatctattaaatac
ttcaatctttcttctaggttattaaattttctcaactttggttgtataaattcttctatg
taactacttaaggcttccttatccttttccaattggtacttaccttgttcatttttaatt
atcacttgattgttaagctctatccaattcattatttaccgtccttttaacataatcttg
tgccataatttcacttaatttgcttattatttcttttggtacttatcagttgaaatccca
aaattaatctataattatagaaatgcaataagtatttttcaaaaacaaaagcactacata
tagtcagtgctttatctattatatactacatatagtatatacacaaattttttatatcta
aacttttattactttataattgacattatttttatttaaagaaatttttatcaactcaaa
tataaaaaaatacaagcttattatgtcctgtttaaaaatttaaattatctctaaatagct
taaaaatatattctgatatattgaaaaaagtactttcaagatgatattttatatattatt
tagaagttttttatttattgttatataattaaatatatgactattttgctactacatata
taaaaataaatttatgaaggtgattttaatgaaaactatttctaaacaagaattagaaaa
aacacttgagaaacattatttatggcttaaaaacaataatgctggagaaaaggcagattt
aaaagaattaagattagaaaatatggacttaagaggatactgcttaagtaatattgactt
ttcgtggtctgaccttatcaatttaaatttagaaaaagcagatttagaaaactctatttt
taataattcttatctttcggattgttcattaaaaaattctatattaaaaaatgcagactt
aagtggtgcaaattttagattttgtgacttatctaactcagatattagaggagctaattt
agaaaattccaatttagaacatgctactttaaatggagtaatatcagatgaaagtacccc
tttttttaaattgtattgtcctgaaacaggagcatttataggctataaaaaatgttttaa
tttcagaatggtacaattattaatacccagcgacgcaaaaagagtgtctgctacatcaaa
tgcttgtagatgtgataaggcaaaagtactgtcaattactagtatagatggtaaagaatc
ttttaaaagtgctcgtgcatatgctgatgaaaattttatatatagagtaggagaaacgat
tgtagctgaagattttaatgaaaatagatggaaagaatcgactacagggattcacttttt
tttaactagagaggaagctattggttatctataaaatgctaaagttttataaatatataa
acaaaataacaaaagagtatagattgtaatttcaaaaaaattataatctatactcttttt
tctatagcacataagtacattttatttcataaattataataaattatttatatctgcact
attgattatttgagaaactttatctatatgttctatcttactatccaaactgtcataata
cttcttactctcatctctatttctaaaagaataaacttttttatccagttttaaagcctc
ttttataatatctatattcctcttatttgtctctcctacactaaatcctgtatctattat
aatcttggaatcatttaaatttctaatagccaaatcgaaactctcatcacttatcggctc
aaatggattttctgtaaacatctttatccccatagttctaccaatttcataatcaatatc
attttcatgtattattccagaatacagacctataccttttttagtaaaagctctataaat
tggtgttgctttacccccaccaccaattataaaaacttcatttttagatttattactaat
ttctactgaacctaaaagactattaaagtttttatcatccaattcataaagcgaatttat
aatatcctcatctactacatcttcaggctgaccataagctatgactttattattttttat
aagagcaactttatcacaactttttaatgctatgtctatttcatgcaatgaaagtattac
tgatattgacttttctttacttaattttttcagtatgtttatgagctccaatctatgttt
tatatccaagtgagttgtaggctcatctaatataattatttctggttcttgaacaagagc
tcttgcaaccaacaccttttgtttttctccatcacttagttcatcaaaatatcttttctt
taaatgtaaggcatctacagactccaatgcttcatctaccattattaaatctttcttaga
tagactcccaaaaaatcctgtatatggataccttcctatattgactatatcttgtacagt
cattaaatcacctaataatctatttgtaagtactaaagccattttttttgataatgcttt
tcttgatatacaatttatgtttacaccattcaaatatatttcaccttttattggtgatat
aagtttagataaggaccttaatagggtagtttttccagctccattacttcccaaaagaca
tagtatttctccattttttacttctacatttatattacttataactaccttgttattgta
tcctacacttaaattattagttttcaacatgtctaagccctatccttccttttcaccaat
aacattactacaattggagctcctaataaagatgttatcgtgcttattggtaattctact
ggtgataaaattactcttgatattaaatcacaaagagctgtaactatactgcctaaaaat
attactactggtatcaaaactctattatctgatgttttaaatctgaacctccca