| Block details | |
|---|---|
| fasta | C_difficile_CD00028_1A_020475.fasta |
| contig | u00000crpx_c_020475 |
| start | 3289119 |
| length | 16553 |
| strand | + |
| type | core |
| seq | aattgaaacttcactatctaataatttaattaatgatatgctattacatttatctatttc ataaccaccataaatcccaggtgttgaatttataaatataccagcttgctctaaatacat cttgtaactttttatttgcctttcacttacttccaactcttctgataattctttgcattt cattttgcctctgctttgaattaatatcatcattctaagtgtattagctaatttactaat gagtaacccccctaataacattaattgatatttttattatttatttctacacatatgtac atataacctctttatattttatataagtagaatttttttataattttgacatttaccata ttatattttatatttgtacaaaattttaatagttaatacaataaaaaatattactgaaaa aataaacatctataattccagtaatattaattaattttaaaccctttttattatcattta ataatagtaactaaaaattgactaaatttaaccttatctcttttaaataattatttctta caattaaaaaataaactatttgaaccaagaacaagcttcccattaccaaaacagctgatg atgctacttctatatcaaaagaatttttcagtgcagtaagggcaaatattgaatgtataa cagccactacataaggaaacaaaaatactattccaatctcaattgttgaagcttttttaa tctcattatatgtcatccccaatttatttaattgctcatactttttcttatcaacttggc aatccatataaaatttattatataaaaaactacttgtagtaacaaagaaaattaaaccta taaatattgctaaaaatataaatgtagaatatattaatttcccagttcctatcattaatt ctttagagaaaaacaaatatggttgcatccctgactcattattaaatttattttcaaatt ctctgcatatctctatagttttacttgaatcctctacttcaaatgcagtaaatctatcca ctataaattttgattctatactatcataaaaattatcctttaccacatacatatttttgt aatatgctggcataacacattcttccacttgttttgccacctttaaacctctattcccta caataatattttctttgacgttattatttcctggtaaacttgatgataataatgatatgc attcattatcttcaaaacttataggcttaacccctatagtttctgtaatttctaagtact tagattctttcataattctgacattaaaatcacttttcttgggaaatacagttttaaatt caccattagtccttgtatagtctacattctctttttttagattattttctataaacatca ttctttccttgtctttttctttgctatcaggctttttagggtcattatgcaatgtcattg ttgaataatatattgtgttaggatatattaaattaatttgacgctctacatctttccaaa aggaataaactgtacctatagcagtaaatgctactgcagaagttatagttatcaagaaaa atattctagcattatcctttaccttataaatcaagttcgaaatccaaagcatatttgtat tttttctataaaatctcttgtttagttttagcttcttcataaaaaatacactaaattgag aaaagaacaagtaagttgctactatagtaagggatgtaactggaactaagcgcagatatg ttgtatattggtcggttgaggtaatagcattataatacgctattataaacaaacaaatac ttaatatagcaagcattagtgatgttttaggctctggttttggagtttttgtacctttaa gtaacttcaacacctgattttctttaactataaaataagtaaatattgatgttaatacag ctaaaatcataaaatagattaaagtagacaatatcgcattaaatggtatatagaatttta atggcgataattctaaaaaagtagacataaccactaaaaatatctttgcaaagattaagc ctattattattccaattacagaagatactatatttattatcatattttctataaagatta atttcattacttggcgttttgatatacctgtaatataaagtattccaaattctttatatc tacttttaagaaacacactaactgaataaaacacaaagaagaataagaatagatatgcaa ttatcttactcatcttgagaccttcttttaaataatcaggaaattgagatacatctaaat ctggatgacttgtaaacataataaaagaaaatagcagtgaagatgatataacaatacttg ctaagtatcctaaatacgctttaatatttcttgaaatattgttaatagcaaactgtttta tattcattagttatcgcctcccaataatgtaagtacatccattatctcttgataaaactg ctctctactactacccttatatatttcattatatatagacccatcttttatgaataagat tctactacagtagctcgctgctaatgggtcatgagttaccatcatagtagtaactttatt ttctttatttatcttttgaaatagctccattacaacctttgatgactttgaatctaaatt acctgttggttcatctgctaaaagtattgatggattgttaatcaatgctctagcaatagc agtcctctgagcttgaccacctgatacttcaaaagttctttttcctaataaatcttttat acctaatattgtagatacttcattcaatctctcatcttgctcttttacactgaccttatc taatgtcaatggcaatactatattttctcctatagttaatgtatccaataaattaaaatc ctgaaatacaaaacctaactctcttcttctaaataatgcaagttcctcacctcttaacaa taaaggattctttccctttaattccatagttcctgtagttggcttgtcaatagtagaaat catatttaaaagagtagtttttccactaccagatggacccataattcctacaaattctcc atcttctatactaaaatttatgtcatttaatgcgttgaaaattatttttttaccatatac tttacttaaattatttacagttaaaattttcattatttaactatccttcctaatttaatt tttgaaataacatatatataattgttaattataatttatcttagtttaatttttatagat aataaatctattttttctatacactaattatgttagtaaaagctaatactgcaagtacta cacccatgattattctgtatacagcaaacactctcattggttttttctttaaaaaattca cgaatttttccataactattattgatacaataaaagctactataaacccaactaccaaag caatccacaatgttggtgtcattattgaataatcaaattcaaataaatcttttcctgaag aagccaccatagctggtactgctaaaaagaaagaaaactcagctgctgtaggagaattaa gtcctgctatccatccacccataatagtagatgcactccttgacatacctggccatgcag acaaaacttgtaatgtcccaacctttaaagcttgtattggagtaattttatctatattat ctgttgaatgattcttttttctaaacaaagtttctactactaataataaaatcccaccca ctataaatcctataattacagattgtaaattaaacaatgattttatattatcataaaata gaactcctataatcgcaaatggtatacaacctataattacattcattccaaatctaaaac caatctttccttcttttccgccagtaaatataaatttaaaaaattctataacgctatctt ttatctttttccaataaagtactactactgctaatatagccccaagttgtattacaacct caaacatttcagcaaattgccccttaaaatctattaaattaccaaccaaaatcatatgac ctgtagatgaaactggaataaattctgtaaacccctctactatagctattatgactgatt tcaatataaaaataacatctaaactcatcaataaacatccttccttttttacaaaatttc tttttttatgttatttctctcatgttatttcttatattaattgtaatttagattagaaaa tttaactatctgcaaacattacacaaaccttacatctatgtaaggtttgcaaataaactc tcttaaattttgattatttaactatgaatatttcatttaataaattgtataataaaaaag tacaattaactaaaaaccctattgtaacagataatttacatctttatcaaactatttaca tctttattaaagtagattgaaacttctgtaccttttcctacttctgattttatacttact ttatgacctaaatcatcacataccttttttactagataaagacccatacctgtagattct ccaaacttacgaccattttctcctgtaaaaaatgggtcaaataccctttttaaatcttta gaaacaattccaattccttcatctattatacttaaaattacatatttattattttcttca gattttatagttaggtagttactataatctttagaatatttcactccatttgtaattaat tgacctattataaatttcatccattttacatctgtataaacataagtaaatttgtctact tgaatcttaggaatcattccactttttataaataaccttttttcttcatttacaatacta gatacaatttcatttaatttggctttttcaactataaagtctttctgaaaattatctgcc cttgcaaaatgcatagccatatctaaccctttatttaatctatctatttcttttcttata ttttcagttacttcttctccctcataatcttgaagctgaaggcttataactgatattggt gttttcatctgatgaatccattggttgatgaaagttaaatgttcactatgtatcttttta tgctcttgtatcattgattgatacaatttatgttgttgttttaaaataactgatatattt ctccccaagaatgagcttcctaaatacaaaaatgactcctccaaagaatgtattcctttt tcaaacagattatatacttctctatttttataatacttatatattaaaaaacataacaat ataaaagaactaaataaaagaatatataaactctctccaaaactaataaacttcataaga ttacagtaaataattgtcataactatgcctatataatatataaaaatataacctttataa tcttttaaaaataacttcatactttctccttaccaattcttatttaatttatatcctaac cctcggacagtctgaacagcattatctatacctaattcctcaaatcttttccttatcctg ctaacatttacatttaaagtattttcttctacaaactcaatatcatcccatatcttttct aaaagataatctctacttactacttttgggtatctcttgataagacattcaatcagtata ccttcttttttagttataattagattttcaccatttaattctagttctaacctttctgga taaaactttaatccatctagctccactattctttcgtctattttaggtgaatattcacca tatacccttcttatatgactctttatttttgccattactacatcatagtaaaaaggtttt gttatataatcatctgctccactttctaaagctctaatttggtctacattgccatctcta gctgatataaaaattataggtaaattcgactgttgtctaatacatctacaccagtagaaa ccatcaaatttaggtaaatttacatctaatagaactaagtgtggcttaaaactttcaaat gtaatcattatatcatcaaagttctcttcaacaatcacttcaaatccatatttctcaata taatctttaagtaatgtacttattgatatatcatcttccacaatatatactttataactc atataattcctcctaatatacctatttactcatcatataacagtccaattttaatatatt ataatctttttacaatatataaatttaatcatattattaacttcacaattactgacttca taagtataaccatattattagacatcttaataaaactctataaaaaagtatctttttatg attaattaatcattattatcaactaatcattctaaaataaattgaaattactaattcaaa atagaaaaagttaccttaataaggtaacttaaacttttattatatttcttacttagtatt attttagcatagtttctacttagcattatagattaattcttttatattcacttttttctc ttgtaacttattttttattaagaagtcttgtgtatcttcaagcgaagatatatctttatc tgttatatctaaactaaaatcataccaagcatataattctttagtttcttcaagacttaa atcaacttctttagctactttttccatagcttcatcaaaattattatttacatattctaa agtttccttttcaaccttcataaatctttcaactatttctgggtgtttctctgcaaagtc tgtgctaacagcagttactattataccatctactaaaccttcaccatttgctacaagttt actacctgacttcatagctttaagagctgctggaccagcaatcaatgcaacatctacgct accatcagaaagagctgctgatgcttctggaatacccatattaacaaattccacatcatc catacttaatccttctttatcaagtgctgaaatcaatacctgatgtaatatagtcccttt tggacctgccaccttcttacctactaaatctgctgctgattttattgaattattattagt caaaatcataaatccttttggtgacctgctataagtgtttaatatctttaactctactcc attagatgcagctattaaagctgacgtaccacctagtgcatgtaagaagtctatttctcc agcagctaaagcctgtgtttgctctggacctgtagtaatttcgtgaaagttaacttttat attatcctttttaaattcctttccaaataaatcatcctgtttctgaattatagaaggaac atttaatggtgattttacataagttaaatttatttctgaaagtttttctccattattttt tttagcacatccagctaaagatgctgttgcaagtgttaatatcgttatacctatcaatag cttttttaatttcatttactctactccttaaaatattattaatttctttaaatgtcttta tttgatttcattgtcattaaaatatctttttttaatttaatatagtactctgaagttaaa tctctattataaccatcttctatattaaattcttttatttttctttcgtctgtgaaaaca actatttttttgcctatctttaacgcttcatcaatatcatgagttacaaatattacgcct ttattagttgacttatgtatttttataacttcattttgcatatcaatccttgtaaaataa tctaatgccgaaaaaggctcgtccataagcaacatatctggattgaaagaaagagctcta gctatgcttactctctgtgccatacctcctgacaattcatttggataagagtttttaaat ttctgcaagttcatcatcttaagatatttttctacatcaatattacttttcctattatat ttatttgatttgttcaaattatcatttgtttctaagcttctaaaattatcatttataatt ttaccaataattcttttattgtgtttaaattttctaagcaccttgtttaaaatagtattt tttctttgattatgaaaagctatattttcacttacgtttaaccaaggcattaatctgctc tcctgaaaaacaaaaccaacattaggtctatactctttattatcattaataaacctaatc tcaccactatttataccttcaagtgatgcaattgctctaagcaaggtagtctttccacaa ccactttcacctaaaattactgttatatggtttctatctatgtttaaagagatatcacta agaactacatgttcttcattgtcaactttataacttttatataaatttctaattatatat ccagagtcacatactaaattattcatatgcttccaccatctttcccttacttaccttctt cacaataatcgaaaatatgtaatctgtaattattcctaaaagtccaattacgattatacc tacaataacaacatctgttctagacatttcttttccatcagatatcaagtatccaagacc agatgaagctgctacaagttctgccccaataattgctctaaagctatatccaagagctaa ctttaacccaacagcaatatcaagaatggcatttggtattattattttaaatattatctg aagctttgaaaactcaaatactctacccacttcaatcagttttgagtcacaatttttaat ccctttcaatgtgcttgtaaagattgggaaaaaggatgctaaaactataattataatttt tgattcctctcctataccaaaccataatataagcattggtattaaagcaaggggaggtgt attccttaaaaaatttattagagatttaaagtattcgtatactccactataaattccaaa gaatatccctaaaggcacacctatagcagtatttattgcaaaacctatcaaaactctttt catacttgcatatacattaataaatattgaaccatcacttatcatatttaaaaatgtact atataccttttcgggtgatggtaatatataatcactccaaataccaagataatttgtaat tttccataataaaagaattataaaaaatatcagaacactctttactagccttaaaaactt attattaaatttattgaccatttacaaaccatctccattattacaaccatctttacaata aaacatttctactatgtcatacttatcttcaaagccatttcttattttttgtatttcact taatatttcgtcttcacttgatacttcaagaactttttcaaaagtatctttgaaatatcc taatggaattggtgattcatctatttttccaagtgattttacaccttcttgttcagcaaa ctctttccatgtataaaacatagcattacccttatccttaaacttttcacttgcaaagtc tcttaattgtgtacatggacaggttactaccaacatatcatctttactttttatatattt atcgtataaaaccctacaagtccttactaatattggttctatcataggtacttcaaaatt atttatcaaattatttctttttaaaagacttatactttctggacatctacaatccaacat tgtattttcagtcttttttgtatactctttgtactgcttttttacatattctaactgtgg ttcacattctgctattatgtaccccttttttatcaaatttgctttaataaggtgaaactt ttctccatacattctttctgccactggatttattagaagatatttattcataacgcctcc tattatttaatattgaatattattatcaattaatagtttaaatgagcacttaaattttgt caatatattaatttttccttaataaaacaatttttatctacattttttaatattttaaat gaaatattaaatagtatatgtaatttattttaattaataatgcatacatcttactaataa tctatttatataataatctataaatattatataataatacttatataattagtattatta tttaatagcaacagttattcacactaataaaagtagaaagtttttaaaatattatgaaac atcaaatttaattttaaaattgcatcaaaaaatgaagtctcaacagacttcactttttat aactcttataaattattcaaaatatttatacttccctttctacttcaaaacgtaaaaccg tcttcaatgattcaggcgatacttttctagcatcacttatataaatttcacgatgtgtgt aagattttcttataagtttattttttttgcaaaattcgttcataatgtcaaaactttctg gttcattatcatatgaacctatatgaagcatttgaacacatagcccttcattaatagacc caaacctaactttttcaagaagattatgaggtttcttcttctttactatatcagtagctt tatccaacaggtcttgtgtaacaaaatctggctgacgtatcattatagtgtaaattaaat cttctttaataagtacatctaagcctttacttttttctcccttatcccatataccttcta aaggaaaaaccgtatagtcaaaatacccttctggtacaattccttttttaggcatggttt ttattgcatatgccaaagaataaagtactcctattgcttcaataaattctttagaatttg ggtctccactcccttttaacatgataaatttctgttctggtatttcaattattacaggat tctttttaggtaaatataactctttatctctttttctccattcatatttcataaaaatac ctccatatatattttatacattgatattatcacgctaaaagtgacaacagtgtgtcataa ttataaattatattataaaatcttcatcctctaattcctcatacactcctttttggtatc cattacccttagttgaaaagaaatcatgtgttttggtttcagtgctaagaccatttaata caattggatttatagcatctacagtatatagcttctcaaaccctagattttctaaagctc tattcgcattgtattttaaaaagttcacaacctctttttcaagcccactttctctgtata taacatttgtatactctatctcattctccataaggctataaagtatagaatacatcttct cttctaacatcttcttatccattttatcaaatgaatcgtatatttcttgtgctagcaatc ctatatacttaccatgtaaagactcatctctaagaataagcgatattatttctccactag ctaccatctttccttgaccagatagatacaatggataaaagaatcctgaataaaacaaga aactctctaaaaatacacttgtaaccattgataggtataatccctcttgatttgtagtat tttcgtattgagctaaaactaaatcagcctttctttgtaatgttggttctgtttctatcc attcaaataattcatctatttctaaattagaaagtagagtcataaatatagaagaataac tttttgcatgtatttcttccatagtccccataaaagacaagacagcttttctttgtaggt tttctgttaaactcatcatagatggtattccattattcccctgttttgtatccagtaatg ttaaaccacccaatacttttttatataattccttttctttattacttagttcattccata cctttatgtctttagaaacagatatttcttcaggaagccaaaattgttttacattttgtt cccaaaaagcttgtgtaaatccatcttcttctctattccagttaactgcattatgtattt tatgtaaattaaatgtcatatatttctctccctatactgaacacactagacactcatgag tatctcttgtcatctttgttcttgtgtaatataaacttttcaaaccttttttataggcat atatgtaatgtctagctatatctctagttgtcttttcatctgtaacaaacagtgttgttg atataccttggtcaacatggttttgaactgttgccactaaatctatgacctttctcatat ccatcctgtatgctgattgataatacaacatattatcatttgttaaaaatggcattggat atattgtagtagagtctccatatgttcttacttctactggctcagtaattggcattatac ttgatgtagcattttgaacataactaatgctttgagttggtgctactgccattaaatatg cattatatatccctttttcttttacttcatccaataattttgtccaatcttcttttgttg gtatataaatcccttcaaataatgctcttaccttttctgacttaggtagataagattgtt catagtattttgataaaaccttgctatttcttcccttaacatattctgatttatcaaatc cttcaaaagtttgatttctttctatggctattttcatagaagctttaattgaatagtatc taaccattgcaaaaaatacattagaaaaatctatagcatcatctgaagtatataaaatat tttctcttactaagtatccatgtaaattcatagctcctaatcctatagaatgagacttgc tgttactattgcttaccgttggcactggttttatatctgtgctatctgctacaaatgaca gtgctcttattgctgtttcaactgtactttctatagttttattatccattacattggcta tgtttaaagaacctaggttacaacttatatcttgtccccattcattttttcctccatacc cctctatttctgaaggtgtttgatattgaaatatctcacaacataagttagacattttaa taattccaacatcttttaatgtatgttctctattagctgtatctatgtacactacatatg gatatccactttcttgttgcatttgtgctatttttgtcaacatctgcctaggatttattt ctttttttcttatatcactatcattaaccaatttatcataccactcatccatttctatct catcaagagaaactccatatttcttatacacagtatgaggataaaatgcatatgctactt catttttttctgccaactccataaatttatctggtattatagctcctaatgataatgtag caagtcttattttttcatctgcatttatctttttagtatccatcaacaattcaaaatcag gatggaatacagtaaggtacaccgcaccagaaccttgtctagctcccatttgattaaagt aactaaatgattgttctaacattttagctactccaacaacacctccagctgcaccttcta tatctttgatagattcgccagatgctctaagtttagataaatttagtgcaactcctccac caatctttgataagtgatttgatgaagatatagcatatgatataccttctgtactatctt ctacagatagtaaaaaacatgataccatttctccagccctctttcttccagcatttaaaa aagtaggtgtagctggttgaaattcttgttttactattttatctgccaagtttaaagcta aatctttatcgccatttcctagtgtcaaagctacaattaacactttatcattatatgttt ctaatatttcctttccatcattgctctttaatgcataattttgataaaacttatttgcac tcatatatgattgaaattcaaacttatgtttatcaatcatatcatatatatttttaataa catctatgctatactgatttattacttcttttaaataataaccttcatctattaaatact tcaatctttcttctaggttattaaattttctcaactttggttgtataaattcttctatgt aactacttaaggcttccttatccttttccaattggtacttaccttgttcatttttaatta tcacttgattgttaagctctatccaattcattatttaccgtccttttaacataatcttgt gccataatttcacttaatttgcttattatttcttttggtacttatcagttgaaatcccaa aattaatctataattatagaaatgcaataagtatttttcaaaaacaaaagcactacatat agtcagtgctttatctattatatactacatatagtatatacacaaatttttttatatcta aacttttattactttataattgacattatttttatttaaagaaatttttatcaactcaaa tataaaaaaatacaagcttattatgtcctgtttaaaaatttaaattatctctaaatagct taaaaatatattctgatatattgaaaaaagtactttcaagatgatattttatatattatt tagaagttttttatttattgttatataattaaatatatgactattttgctactacatata taaaaataaatttatgaaggtgattttaatgaaaactatttctaaacaagaattagaaaa aacacttgagaaacattatttatggcttaaaaacaataatgctggagaaaaggcagattt aaaagaattaagattagaaaatatggacttaagaggatactgcttaagtaatattgactt ttcgtggtctgaccttatcaatttaaatttagaaaaagcagatttagaaaactctatttt taataattcttatctttcggattgttcattaaaaaattctatattaaaaaatgcagactt aagtggtgcaaattttagattttgtgacttatctaactcagatattagaggagctaattt agaaaattccaatttagaacatgctactttaaatggagtaatatcagatgaaagtacccc tttttttaaattgtattgtcctgaaacaggagcatttataggctataaaaaatgttttaa tttcagaatggtacaattattaatacccagcgacgcaaaaagagtgtctgctacatcaaa tgcttgtagatgtgataaggcaaaagtactgtcaattactagtatagatggtaaagaatc ttttaaaagtgctcgtgcatatgctgatgaaaattttatatatagagtaggagaaacgat tgtagctgaagattttaatgaaaatagatggaaagaatcgactacagggattcacttttt tttaactagagaggaagctattggttatctataaaatgctaaagttttataaatatataa acaaaataacaaaagagtatagattgtaatttcaaaaaaattataatctatactcttttt tctatagcacataagtacattttatttcataaattataataaattatttatatctgcact attgattatttgagaaactttatctatatgttctatcttactatccaaactgtcataata cttcttactctcatctctatttctaaaagaataaacttttttatccagttttaaagcctc ttttataatatctatattcctcttatttgtctctcctacactaaatcctgtatctattat aatcttggaatcatttaaatttctaatagccaaatcgaaactctcatcacttatcggctc aaatggattttctgtaaacatctttatccccatagttctaccaatttcataatcaatatc attttcatgtattattccagaatacagacctataccttttttagtaaaagctctataaat tggtgttgctttacccccaccaccaattataaaaacttcatttttagatttattactaat ttctactgaacctaaaagactattaaagtttttatcatccaattcataaagcgaatttat aatatcctcatctactacatcttcaggctgaccataagctatgactttattattttttat aagagcaactttatcacaactttttaatgctatgtctatttcatgcaatgaaagtattac tgatattgacttttctttacttaattttttcagtatgtttatgagctccaatctatgttt tatatccaagtgagttgtaggctcatctaatataattatttctggttcttgaacaagagc tcttgcaaccaacaccttttgtttttctccatcacttagttcatcaaaatatcttttctt taaatgtaaggcatctacagactccaatgcttcatctaccattattaaatctttcttaga tagactcccaaaaaatcctgtatatggataccttcctatattgactatatcttgtacagt cattaaatcacctaataatctatttgtaagtactaaagccattttttttgataatgcttt tcttgatatacaatttatgtttacaccattcaaatatatttcaccttttattggtgatat aagtttagataaggaccttaatagggtagtttttccagctccattacttcccaaaagaca tagtatttctccattttttacttctacatttatattacttataactaccttgttattgta tcctacacttaaattattagttttcaacatgtctaagccctatccttccttttcaccaat aacattactacaattggagctcctaataaagatgttatcgtgcttattggtaattctact ggtgataaaattactcttgatattaaatcacaaagagctgtaactatactgcctaaaaat attactactggtatcaaaactctattatctgatgttttaaatctgaacctccca |