Block details
fasta C_difficile_CD00145_1A_021022.fasta
contig u00000crpx_c_021022
start 3205189
length 14683
strand +
type core
seq tcttttaaactcactactattcatatcattagtcttatattcaagtacatttacttctac
acttattgaggtagtctttccaccaatatcagtagcttttatagtaactttgtatttacc
aaccttatcagtattaatatttcctataagctctggtgtcaaatcattaccattgctatc
ctttgctacgatattcagtttacttatatcaaacttatcaccttgataaatatttaaatt
tccaacagttattgttggtgcacttgcatccagtgatgatgcacttaaacattgttctag
tgttttttcatctattcctcctagtgctgtaatcttatcagcacttctaagtacagactt
atcactatttccatcaaccaatacaataggtgcatttttagctatagaagaaccagcaac
tgcatctactaattgataacctttagaaagataaaattcttttgctgaactataaaaatg
ttttataacttttttattagtctcaaatctatcttctccagctaatctaactgcattagt
ttttttaactaaatcattacttattatctcctctgaaccaagagcataacattgcacacc
ttcttttttctcaaatggaacatttttaccattagttaaaattataggtgctccatctct
tgatgctactgatgacgcactcatagcatctgcttcacctgtataaccattagttataaa
aaccttatctataggttttattgaagctatttcttttgctataagataacttgtttcaat
tctatcattaccacctattcttttaacttctattcctttttgctttaattcattttcaac
tgattttcctattgaatcttcagtccctattatataagccttctttacatcttttaacat
tttttctgtgtctgatggtatactgtttctttgtgataataatataggtgctttaactgt
tcctgctaatccacttgcacttaatccatcagctagtgtattatctgtatttactaatac
tacattttcatatgtttgtttctgtgcaattttggcagctgtctcatatctatctttccc
ttgtatcttttctatacttgaaagtgcattgatatttggtgctcctgccattattaatga
tattgtcaatcctattgataatactctcttatttaccttcatcgaactcctcctactaat
ttttttatataattcagctaatcataaattacatcctcagtagtgattccctcaaaattt
ataaactcctaaaacaaaaaacacctaaaataccataacctgtaaatcaataacaaaaca
gattacaaaaagtactttagatgtgattttcattttataatatcagtaaattaacaaaaa
aacaagatttatggaattttttacaagctaccttcattgccatttaaaaactcttgagta
gcatgcacttgaccatcagataatatataaagcccaaatccagtactataaaactcatta
ctaagcatgtttgcattgtactctggagacttcttccacacctcaaatatagcctttgcc
aagtcttttgcatcttgtgtcgtttgaacgttcttagaatctatataaatatatgctata
ttttcctcacttctcattccaaactcagaaaatacttgtggagcattttttccatctata
taatgtgcaaatacttttttatccatcatatacttagaccatgcatttgccataccttct
agcttactagatactaccaaaggctctttgcctttttcttttctataggaattgattaag
ttatacatttcagtagataccatttttttaaattctgggctgttgtaatcatgagatttg
tcatccaacacttttatttctactctttttcctgtgctttttccccattcgtctgtagct
tttaatgtcaatatgtatgtacctactctatttgtatctataaacccatcaacttctatt
ggtaataccttcccagtgttatctttagctactatatttaacttgccagtgtcaaacttt
tcacccttatatatctctgtacttccaactgtaattgttggtggttgtctatttgacttt
gaagcatttatacactgttgtattaccttctcatttatttcacctacagaggttatattc
ttagctccttctaatacagtcttatcgcttccatcatttactagtaccattggagagttt
ttagtaagtggtgcagctgctattgcatctactaattggtatccatctgatacatagaat
ccatctgcactattaaaaaagtagtctattacgtttttgttagtttcaaatcggtcagtt
ccttctattcttactgagtttgtatttttaactaaaggattactcattatctcctctgaa
cctatacaatatgattgaatattttttacatcaaaaggcacactctttccatctgtaagt
atgattggagctccatctctagtagctactgatgatacactcattgcgtctgcttctccg
ctatatgcattagttaatagtactttatctactttttttatagttgctatttctttagct
attaaatagcttgtttttagcctatcttctccaccaattcttttaacttctatattttta
gaatctagttctttttctactgatttacttatggtatcttctgtacctattatatatgct
tttttgatattttttaaacatctatttgtatctgctggtatcttattttgttgagtaaat
agtattggcgcttttgtagcacctgataatccacttacacttaatccatctgcaagtgat
ttttctgtatttactaaaattactgtttcataagtctgtctatcagctatctttgctgct
gtttcatatctatctttaccgtatattttttctactactgatgatgcatttacacttttg
aagtttactaagattaatgatactgctagacctaatgataatatttttttgttcattttc
atatccccctgatgatttttatattttatatttatattgtgattattttccatttatttt
ctctttattttccatatattatagagtatatatgatatgaatatatctcgtctatatatt
agtgttttattttattaaatttaaaaaattatttttaacttctttttgaacatattcaaa
attgaatttatatttatatatataaaagatatctgctttatttaaaattaaacttaatat
agctcaaattattatacattttaacctcaatattattagattgttaagataatgaaaata
aaataagaatgcatttaaatatataactttatatctaaatacattcttattttctattta
cttaatatttatttttcaattaaactcttaatcttgtctattacagatgaggctattcct
ccacctacttcaaacaactttgatgaatttttaccttttaatgacgattcttgtgattta
tctaacgtatttgtagcaagtataactggtgaattgtttttagctgctaatggtccaact
gctaaagcatctataagtttatcttgatttgcaactacaactccatctagtttagattga
gagtagaatttatctattactttggcattcgtctcttgtctagtttgacctgccacccta
ttttttgatatatctttgtttgctatttttccaacttgttcaatagccttgttagatatt
ttttctattccaccaataaagtatatatttgacaccttatttgatttaataaattgttca
gcttcattatctacaccatctttttgtgtaagtactattggagttttttctttaccagcc
agtgatgctattgataatgaatcagcttctccatttcctgcccctatatacaacttgctt
acattattcgtcttatctatttcttttgctatattaatagaagtttgatatcttgtatct
ccacctattctttgtactgatatttttgaatttacagctttgatagcttcaacaactgaa
tttggcattgagttgtttccacctatcacaattacttttgatggatttagccttttcaat
tcttctacagttttttgaggaagcttttcatttgatgataaaagaatcggtgagtttttt
acactagcaagtggtgtagctgtaagcccatccaccatacttttatcttctccatttact
attacaactgtatctgattttgtccaaccactttgagatattttgatagctgtctcaaat
ctatcagcaccttttaattttttgattgtgacattagatgtagaatcacttgaatttcct
cctccagagcttccaccactagatgagccacctgaattacttcctccaccattatttcca
ccattgccattatctggtggtaattcatccggttttgataattcattttcaactatgtat
tctaaactttttggaagtgtaacttcaacatacttgtttattgtagcttttcttccctta
gttgttttttgtgctaatccaagttttaatattacatttgaaccactttcttgtgtttct
ttactaacaatagaatagtttatcctaatattgtttaataaatattcaagtgcttcactt
ttctctaccttatacttttcagggtcatttttactagaaccagttccaccaattggtttt
acttcactctcattaataagggtaaatactaatccttcatcagagtttatattctcataa
cccactgttttgttgttatatgttacaatttttaaggctggtttatcgcttgttcctttt
cctaaaactttatagtcagcatttgagttactgccagatttttttacagatattcttcct
atattcaatctatttccgtctagtaaatcttcatttgatgtaacatatatatctaatgta
gttgtattacttgatttgttgtattctgctctacaagtagcatttgcatttccacttttt
atctgagattttatattatcagaccaagtaatcttttctttctgctcattatctactact
tcaacctcaccttgtacttttatactggcttgaaatgaatatactatattttctactgag
tccacagatatatctatagtatttactttctcatacgtttttgttccttgtaaaactgga
gctgcatatgcacatgtagcactaccaattacagctactgccatagttgatactgctata
gttcttataaaagattttcttttactcattaacacccgtccttatctatcattaactaag
tggataaatttacttatccacctagcttttatatttaatttataaattaccctaaactta
tggttacatttatatactttacttttaatatctactattttaaaactattctagtaccta
atcatattagatatacaatgttagtgttagtattttcacgtttttagagttccacctact
atttatctctaacaatattaccctttactttattgcttacagttataaccttcttattgc
tgatatcaatagaatttcttgtagcttttctagctttactattactatcagtaagactta
ttgtctttaactcatcataattcttagctcctacaggtacatacattgtatcacttacaa
atctttgacctactggagtatctccttgaaggtcattgtatctatatagttcagccttaa
ccttatcacttaaagaatcaaagttttcttttggcatatagtaaacccatgtacctttac
tgatttcacctagttcacctttttctggaacttctgcaaataaaagtgcttctccagata
tagtcttattgtttttatctataagtagtggtaaattaaatgctggatttccactgtatt
cacctgtaataactattgaacccgctggaatcttacctgtttcatcttcacttgtgctag
agtcatcactttgatatacataatcttctgctaattttccaattccattagtacgagttt
cgtctgcattatttattatgccaatttctatattatcacctggaggtcctattatatcta
attctgcaacttctatattagacttattatttgagattagttttacatatctagcttggt
atgtccaaagtttaccatctttattaaatgtaactctagcttcattatcttggtcttttc
ctccaccaactaaatcttgtccatattcaaaagttccttgacttacatcttcccagttct
ttttatcattacttacttgtatcttgtaattagttaaaggattgtatgttgtgctagtat
tctttctaaagttaaataatccttttaatgagaactttctagcttctgtctctggttttg
tatattttagtcctactataggtaatgtttctttcatgtctactattatatatggatttt
cttctacatttatatcagggtctttttgagggtctttgttccactctgctttacttatta
tctttcctttatatgtagtacttgcatcattatcttttatattatcaatttcaggatttt
gtaatggtccatgtgagtcattttcagttctaacatcaccgtcagaaacagtatttgtta
tgaatgaccatgctgatttatttattttcccttcatctgataattttacagtaccaactt
caaattcttctgttggatttaggtgataatcatatgcaactaccttatatgtaaatgctc
tgttattaagaggagatatattatcagtaaatttagtcttgctatttccttttgcatcca
caaatccaactgttctgtattttacctgtgttccattttcaccatctaaataatttccat
cacttcttattatttcgtatcctagtatcttatctttatccttatctacatctaggtcta
tagatattttattagatttaactagagaaccactttgtattccatcagaaaaactagcac
ttactttagtatcttttgccatactagctatattttcatttaaaatctttcttctagctt
catcatttacatattgtatctttcttgattctttttcgtagttcttgctatccattatac
tgtttaattctggtgtaatttctactccccatgccttaaagtaatctcttaaatcttttt
caacaacacttgatgccattgctactagcatttggtcttttggtaaactattaattgggt
cactacttgaaagtgctctgtattttcttgaaatctttgcatagaatgtatcattactta
aatcagcatctgagttattctttaacattgaacccgtaaaatcatcatcataagctagat
gtaattgccataacattccaagcctttcaaatacattgcttggtatacctaagctatttg
aagttacatgctcatatatcttatccattgttgaaccttcaagtcttgaatgtgtcttat
catcaaaggtctgagcaagtaaagcaagtacattgttactagtttcgctatatgtcatct
ttccaatatctgtaacatgtcctatctcatgacctattccccatccaaataagtttcctc
ctgtagcttttccactatcatctatttggaaaggtactccattcataagccctggaactg
aaccatattctactcctacatgtaatccagaagcatacataaatgctccaataaacattc
tttggtattttatgttcatacgagattttggagccatatcatttttagttaagttaaatt
cattatcatctacagttccattaccatctaaatcttgtgttttaaatactcctctttctg
agtaaactaaatccattatttgttcccatgcaagcatactattatataatctatctactt
gtgtatttaaatcagaatttccttttgatatctcttgatatactgctgttgcaggaacat
ttaatgttactttatcactttcaatatctgtagtgtttaacacaccagttttttctgaat
atccatatgaattaccaacatttgttcctggataatatggttctccttttacagcatctt
tatatttagctaattcttctatatatgcttttatctttttcttagattcagaaactcccg
caggactcttatcatttattgttccatttagattaagatgtggtatcttagtagctcctg
ctacacgtacttttatatctcctccacttggagtatcttcagcgtatcttatgtataaac
ttcctccacattctatatctaaactatgaagtttgcttaattgaattacattttttccag
tgttaagatttatttctccactcttatatgcaccagattctccatagtactgtgtatata
tcaacttaggagtttttccacttttacttccaacatatactgtgatttcatctcctgctc
tagcagctactcctaatgcctgccagtcattttgcatacctaaattattggaatttacag
tatactgtccgtttttatctttatattttcctaatttatttatttcttgatttacagtag
ttacatcagtaagtgtggctctatcattatataagtcttgagctaattttaattctctct
caataactgtcttatatggatgatattctccactagctttatctggagtatttaatctat
cttttaattcagttattttttcttgagttacatcttcttttaattcaacttgtaggccat
ccataaatagatttcttacatcatcttctatactgtcatactcataaaacttaagttctg
atatattagacttatatgaataggatgaacaaacacttacttgtatcttggtagcagtta
ttggttcttttaatctaaccattacatacttattattatttacagggtctgtctttgttt
caaaaggaacatcccccagattgtgtaattgaccattttcatcccaatatcgtacctcaa
agtcatttattgtcttatcagaaacatcaaaacgaggtgtagccataaaagtatccatag
tataagatttatcaaaagttattattggtcctctattcgttccctcagctgcattatatg
ttgggaatgtccaatgtgttgtaaagtccccatctactacattgaatttatcaaatggat
ttttatcactatattcacttttgtcatatccatctggataaacaacatctacaatgtgat
ttgttggtattccaaatccaccattttctttaggagtattaattaatctatagttaggtg
ttgttggtgcatccatgctttcagttgtacctatatatgttttagacattccactagttc
ccaagtggttagtagctgtcattctgacttcatatgttgtattatccttaagaccttcta
tctttgaacttgtcccacgaataagcttatcattgtattttatccaagacccattagagc
ctttttctttatagtacaagtcaaaatctttagcttgtttatgatttttccagcttacat
caagagatttaaatttacctttaacatttataccttctggtggttctggttttgtgtctg
gaacaacttgaaattctaatatactatctgggctaaattgtataggtttatagtttgaat
ctacattttctggtactccgtctaagttttctggtgttgcatctttataaccactagacc
aatctccatttaaagattgtatgctaactctatatagtccatatgcttctatatctctaa
cttctattgtatttttactagtttgtaattttttagtagataatacttttcccttactat
caattttgtctagtataagttcgtatgctgatacatttacttcattattccaataaaaag
atactttttcatttccaacagcagtgctagtcgatattttatttattttaggtatgttca
tctctggctttggtatttctttatatacattgtttaaaaattcaacttttgatatttctg
caagatttctatcgtttgctgttgtagctgttatttttatagttatcttttttactgcta
cttgtttaccaagatttattactatatcactattttgaacatctgcatatgtttctaatg
ctgacctactatatgtagatgttgtagagttatcatctttactgatattaccctcttctt
ttggagtatcttcatctgaattaggtttatccattgatgaattttctttatcattatttt
tatcttgattggtattagagtttgcttcttgtttatcgctattttcctgttgtttatcat
tattttcatctttattatttgagttattatcagtctggtttatattttcatctttattat
ttacttcttcttgatttacttcttcttgttcgttatttacttcctcttgttgctcctcat
cttttaagtttttcatatattctttgttttcataaggaatctgttgaacattaccatctt
tgtcagtaacctcaactattccttttgctggagcagtaccttctggagcttttatattga
tgacttccatattaagtgcttctgataaagctatatccattactgctggtttttcctcag
atatttcatcattttttgaagatattgtaactccattattttctccactaaataaatttt
ctacattaccattaatatctacatcactatttccttttaattcaaccttacttgtatcta
ctataggattggtagatactatactttctaggctttttgcatcttcactttgtcctaaat
ttttctgtacataatctaagtcaacaatatctacctttccatctctatttaaatcaaatt
ctcttttatttgaatctatattctctaaaaccttattataatcactcttatctactttac
cgtctccatttacatcacccattaagaacaattcataatttaaaggtttatttttattat
ctacacttgctctattgcttaataagactctttgtgaataacttgatatatcaatgtctt
taatttctttgttcttaaatccatctccagagacttctacattgtattttccaacaggta
aattattaaatacaatattataatatgatatattctcatctttattttttatttcacttc
tacttgcagataatttttttatagtatattctatattatctgtcccaacatttactgttc
ctgaatctttttctccaagctttattattccactattgttactatcatcttttaatcgta
actgcatattagtcatactttctgactcgctattttttattggcagtgaaaaatttaaat
ctacttcaagactcccccttaacttttctgtaactgatttttcaactgcccttagcttcc
cctctaatataggttctgcaaaaacgtttagtggtgcactacacatagatactgctagta
cacaagatattgcctttttcatgaaataacaatcctcccttaataaatatctaatttttc
atgaatttaaatactataagtttcagacaataaaaaaagacactcaaagagaatcttaat
tataaaataaaaagactttactctttttagcaactggctgatatggctttaaaagcttta
atccctatagttttgcgtcattagatttccctaattttgccatttaattttcactacttt
cttacccattttatactatatttaaactttttaatataatttttttagattaaattataa
aaaaataacatttatattaatttattaatataaatgctattttccattataatttaatta
tttatatagcttccttacaagcataattttgtgtatattttcttattctttatatcttcc
ataaaattcatgtgtagcatatagattcttatctcctgttatagctataccaaatcccat
tatttcataccctttatgcaacatattagttccttcttctggatttgtcttccactcatt
aaaaataaagtttcctatatcatctgcatctctatttgtatatacaggtttatctggaat
tttatatttaattatattttcaccttgaactgctatatatccaggtttaatctcactcca
atctaagtatttcaaaaaagtagaatatgaattttttccatttatcgtatgagataaagt
cttcttatttgccattaaattagaccaatcatttgctagaccctctaatctgcttgctac
agataacgctcttactccattctcttttctatactgctttgtaagagcatatactttacc
ctttattctctctttaaatgctctatcatttggattgtaatataaaccttgttgatttgg
tgaagcttgatttatacattgcttgataacattctgatttatgcctcctagtacagtcaa
tttgtctgcaccacttaaaatactcttgttactgccattttcaactaaaactacaggagc
attttttgctattgtagaggcagccaaagcgtctgttaattgtaagcctttacttagata
aaattctttactatttttataaaactcttgtataactatcttattagtttcaaatctatc
tgtgccacccaatctaatagaatttgtgctcttaactaattcgtcgcttattatttcact
agaaccaagcgcataactctttaagcctgtcgtgtcaaatcccacactatttccatctgt
aagtattataggtactccatctctagcagctactggtgatgcacttatcgcatctgcttc
tcctgtaaatccattggctataattactttatctattggcttaatttctttgattttttc
agctatttttatacttgtatcaaatctattttcaccaaatattctttgtacaaccttctt
tttggatagtaactgattctcaacatttttacttattgttgattctgaacctattatata
cacagtctttgctttgtttaatctttccatagttgtgtttggaatctggttttgttttgt
catcaaaataggcgcatttaaggctccagctaaaccacttgcacttagaccatctgctaa
gctattatctgagttgattagtattgctgtattgtagttttgcttatctgctatttttgc
tgctgtctcatatctgtcattcccttttatttgctcaactgatgtcaacgcatttaccat
aggagtatttaccattactaaaaatagtgtaagtcctatagctaatatctttttactatt
cttcatattattttctacccccaatgtacttttcatattttttattagtactcatactta
tttttaatcaaaagttacaattttgttaccatattttatatatgataccatagttatcca
tacaactcaaacaatatacctaaagtttttattctctataaattcaaaacattataattt
attttatttaattacgttataagttcaaaataatttatgttagtaatatgtttaatcatt
ataagaagtatctttttataataatttttgcaatatgaatttctcaacattataatcaaa
aaataaaataaggtatctcaatctaattctaaatgagacaccttatttttattattttat
cttgttatttgtatattttataatatctacactatgtcttacatattaacgcattgtata
atcatatattatctaaataaacttttaatattaattcctatatcttattagttcttagta
aataagtttattttttctgctattttttcaatagcgtttttagctattccttcacctatt
tgtactaacttagtagcattcttaagtcttaactcaactacttcttcttgtgatttagaa
agttcttctgtagttaatactattggagcctttgaactagctgcaagtggtgctgctgta
agtgcatcaactaattgtccatttccacctacataaccatcttttgctacatatgcttta
gttgcacctgcatagtatttattgattactttagcattagtatcttttctattttctcca
gctaatctttcaactttattatttaaatctatatcaactaatttgtcttcaacttctttt
gatacagaattttctccacccactatttctaattcttttccttttaataatttttcagca
tttgcatctaattcgttacctgtaactattattggagcaccaaattgagcagctctagct
gatatactcatagcatcagcttctccatttccacctactacaaaagcagtcttaaatgta
tcttttaattgttttgctatttctaaagaagtttcaaatctatcttctccagaaactctc
tcaactttacttacacctaatttagaaagtttttcttcagtttcttttgatactttagat
tctccacctactatatatattttcttagaagatagattacttccaagtactcttaatatt
tcagcttctatttctgatggtagtgaatcttttttagataataatattggtgcatttttt
tgagaggcaagtggtgctgatgctaatccatcaactatagcatcttctccaactaaaatt
atagcttctgcttctccatctttaaatctctctttactaacttctactgctgttgtaaat
cttgaatcaccagataaaacttctacttttaattcttttccatcttttacatcagttaat
actttgtgtaagtctctaactaacttatggtttttacttgaaac