Block details | |
---|---|
fasta | C_difficile_CD00145_1A_021022.fasta |
contig | u00000crpx_c_021022 |
start | 3205189 |
length | 14683 |
strand | + |
type | core |
seq | tcttttaaactcactactattcatatcattagtcttatattcaagtacatttacttctac acttattgaggtagtctttccaccaatatcagtagcttttatagtaactttgtatttacc aaccttatcagtattaatatttcctataagctctggtgtcaaatcattaccattgctatc ctttgctacgatattcagtttacttatatcaaacttatcaccttgataaatatttaaatt tccaacagttattgttggtgcacttgcatccagtgatgatgcacttaaacattgttctag tgttttttcatctattcctcctagtgctgtaatcttatcagcacttctaagtacagactt atcactatttccatcaaccaatacaataggtgcatttttagctatagaagaaccagcaac tgcatctactaattgataacctttagaaagataaaattcttttgctgaactataaaaatg ttttataacttttttattagtctcaaatctatcttctccagctaatctaactgcattagt ttttttaactaaatcattacttattatctcctctgaaccaagagcataacattgcacacc ttcttttttctcaaatggaacatttttaccattagttaaaattataggtgctccatctct tgatgctactgatgacgcactcatagcatctgcttcacctgtataaccattagttataaa aaccttatctataggttttattgaagctatttcttttgctataagataacttgtttcaat tctatcattaccacctattcttttaacttctattcctttttgctttaattcattttcaac tgattttcctattgaatcttcagtccctattatataagccttctttacatcttttaacat tttttctgtgtctgatggtatactgtttctttgtgataataatataggtgctttaactgt tcctgctaatccacttgcacttaatccatcagctagtgtattatctgtatttactaatac tacattttcatatgtttgtttctgtgcaattttggcagctgtctcatatctatctttccc ttgtatcttttctatacttgaaagtgcattgatatttggtgctcctgccattattaatga tattgtcaatcctattgataatactctcttatttaccttcatcgaactcctcctactaat ttttttatataattcagctaatcataaattacatcctcagtagtgattccctcaaaattt ataaactcctaaaacaaaaaacacctaaaataccataacctgtaaatcaataacaaaaca gattacaaaaagtactttagatgtgattttcattttataatatcagtaaattaacaaaaa aacaagatttatggaattttttacaagctaccttcattgccatttaaaaactcttgagta gcatgcacttgaccatcagataatatataaagcccaaatccagtactataaaactcatta ctaagcatgtttgcattgtactctggagacttcttccacacctcaaatatagcctttgcc aagtcttttgcatcttgtgtcgtttgaacgttcttagaatctatataaatatatgctata ttttcctcacttctcattccaaactcagaaaatacttgtggagcattttttccatctata taatgtgcaaatacttttttatccatcatatacttagaccatgcatttgccataccttct agcttactagatactaccaaaggctctttgcctttttcttttctataggaattgattaag ttatacatttcagtagataccatttttttaaattctgggctgttgtaatcatgagatttg tcatccaacacttttatttctactctttttcctgtgctttttccccattcgtctgtagct tttaatgtcaatatgtatgtacctactctatttgtatctataaacccatcaacttctatt ggtaataccttcccagtgttatctttagctactatatttaacttgccagtgtcaaacttt tcacccttatatatctctgtacttccaactgtaattgttggtggttgtctatttgacttt gaagcatttatacactgttgtattaccttctcatttatttcacctacagaggttatattc ttagctccttctaatacagtcttatcgcttccatcatttactagtaccattggagagttt ttagtaagtggtgcagctgctattgcatctactaattggtatccatctgatacatagaat ccatctgcactattaaaaaagtagtctattacgtttttgttagtttcaaatcggtcagtt ccttctattcttactgagtttgtatttttaactaaaggattactcattatctcctctgaa cctatacaatatgattgaatattttttacatcaaaaggcacactctttccatctgtaagt atgattggagctccatctctagtagctactgatgatacactcattgcgtctgcttctccg ctatatgcattagttaatagtactttatctactttttttatagttgctatttctttagct attaaatagcttgtttttagcctatcttctccaccaattcttttaacttctatattttta gaatctagttctttttctactgatttacttatggtatcttctgtacctattatatatgct tttttgatattttttaaacatctatttgtatctgctggtatcttattttgttgagtaaat agtattggcgcttttgtagcacctgataatccacttacacttaatccatctgcaagtgat ttttctgtatttactaaaattactgtttcataagtctgtctatcagctatctttgctgct gtttcatatctatctttaccgtatattttttctactactgatgatgcatttacacttttg aagtttactaagattaatgatactgctagacctaatgataatatttttttgttcattttc atatccccctgatgatttttatattttatatttatattgtgattattttccatttatttt ctctttattttccatatattatagagtatatatgatatgaatatatctcgtctatatatt agtgttttattttattaaatttaaaaaattatttttaacttctttttgaacatattcaaa attgaatttatatttatatatataaaagatatctgctttatttaaaattaaacttaatat agctcaaattattatacattttaacctcaatattattagattgttaagataatgaaaata aaataagaatgcatttaaatatataactttatatctaaatacattcttattttctattta cttaatatttatttttcaattaaactcttaatcttgtctattacagatgaggctattcct ccacctacttcaaacaactttgatgaatttttaccttttaatgacgattcttgtgattta tctaacgtatttgtagcaagtataactggtgaattgtttttagctgctaatggtccaact gctaaagcatctataagtttatcttgatttgcaactacaactccatctagtttagattga gagtagaatttatctattactttggcattcgtctcttgtctagtttgacctgccacccta ttttttgatatatctttgtttgctatttttccaacttgttcaatagccttgttagatatt ttttctattccaccaataaagtatatatttgacaccttatttgatttaataaattgttca gcttcattatctacaccatctttttgtgtaagtactattggagttttttctttaccagcc agtgatgctattgataatgaatcagcttctccatttcctgcccctatatacaacttgctt acattattcgtcttatctatttcttttgctatattaatagaagtttgatatcttgtatct ccacctattctttgtactgatatttttgaatttacagctttgatagcttcaacaactgaa tttggcattgagttgtttccacctatcacaattacttttgatggatttagccttttcaat tcttctacagttttttgaggaagcttttcatttgatgataaaagaatcggtgagtttttt acactagcaagtggtgtagctgtaagcccatccaccatacttttatcttctccatttact attacaactgtatctgattttgtccaaccactttgagatattttgatagctgtctcaaat ctatcagcaccttttaattttttgattgtgacattagatgtagaatcacttgaatttcct cctccagagcttccaccactagatgagccacctgaattacttcctccaccattatttcca ccattgccattatctggtggtaattcatccggttttgataattcattttcaactatgtat tctaaactttttggaagtgtaacttcaacatacttgtttattgtagcttttcttccctta gttgttttttgtgctaatccaagttttaatattacatttgaaccactttcttgtgtttct ttactaacaatagaatagtttatcctaatattgtttaataaatattcaagtgcttcactt ttctctaccttatacttttcagggtcatttttactagaaccagttccaccaattggtttt acttcactctcattaataagggtaaatactaatccttcatcagagtttatattctcataa cccactgttttgttgttatatgttacaatttttaaggctggtttatcgcttgttcctttt cctaaaactttatagtcagcatttgagttactgccagatttttttacagatattcttcct atattcaatctatttccgtctagtaaatcttcatttgatgtaacatatatatctaatgta gttgtattacttgatttgttgtattctgctctacaagtagcatttgcatttccacttttt atctgagattttatattatcagaccaagtaatcttttctttctgctcattatctactact tcaacctcaccttgtacttttatactggcttgaaatgaatatactatattttctactgag tccacagatatatctatagtatttactttctcatacgtttttgttccttgtaaaactgga gctgcatatgcacatgtagcactaccaattacagctactgccatagttgatactgctata gttcttataaaagattttcttttactcattaacacccgtccttatctatcattaactaag tggataaatttacttatccacctagcttttatatttaatttataaattaccctaaactta tggttacatttatatactttacttttaatatctactattttaaaactattctagtaccta atcatattagatatacaatgttagtgttagtattttcacgtttttagagttccacctact atttatctctaacaatattaccctttactttattgcttacagttataaccttcttattgc tgatatcaatagaatttcttgtagcttttctagctttactattactatcagtaagactta ttgtctttaactcatcataattcttagctcctacaggtacatacattgtatcacttacaa atctttgacctactggagtatctccttgaaggtcattgtatctatatagttcagccttaa ccttatcacttaaagaatcaaagttttcttttggcatatagtaaacccatgtacctttac tgatttcacctagttcacctttttctggaacttctgcaaataaaagtgcttctccagata tagtcttattgtttttatctataagtagtggtaaattaaatgctggatttccactgtatt cacctgtaataactattgaacccgctggaatcttacctgtttcatcttcacttgtgctag agtcatcactttgatatacataatcttctgctaattttccaattccattagtacgagttt cgtctgcattatttattatgccaatttctatattatcacctggaggtcctattatatcta attctgcaacttctatattagacttattatttgagattagttttacatatctagcttggt atgtccaaagtttaccatctttattaaatgtaactctagcttcattatcttggtcttttc ctccaccaactaaatcttgtccatattcaaaagttccttgacttacatcttcccagttct ttttatcattacttacttgtatcttgtaattagttaaaggattgtatgttgtgctagtat tctttctaaagttaaataatccttttaatgagaactttctagcttctgtctctggttttg tatattttagtcctactataggtaatgtttctttcatgtctactattatatatggatttt cttctacatttatatcagggtctttttgagggtctttgttccactctgctttacttatta tctttcctttatatgtagtacttgcatcattatcttttatattatcaatttcaggatttt gtaatggtccatgtgagtcattttcagttctaacatcaccgtcagaaacagtatttgtta tgaatgaccatgctgatttatttattttcccttcatctgataattttacagtaccaactt caaattcttctgttggatttaggtgataatcatatgcaactaccttatatgtaaatgctc tgttattaagaggagatatattatcagtaaatttagtcttgctatttccttttgcatcca caaatccaactgttctgtattttacctgtgttccattttcaccatctaaataatttccat cacttcttattatttcgtatcctagtatcttatctttatccttatctacatctaggtcta tagatattttattagatttaactagagaaccactttgtattccatcagaaaaactagcac ttactttagtatcttttgccatactagctatattttcatttaaaatctttcttctagctt catcatttacatattgtatctttcttgattctttttcgtagttcttgctatccattatac tgtttaattctggtgtaatttctactccccatgccttaaagtaatctcttaaatcttttt caacaacacttgatgccattgctactagcatttggtcttttggtaaactattaattgggt cactacttgaaagtgctctgtattttcttgaaatctttgcatagaatgtatcattactta aatcagcatctgagttattctttaacattgaacccgtaaaatcatcatcataagctagat gtaattgccataacattccaagcctttcaaatacattgcttggtatacctaagctatttg aagttacatgctcatatatcttatccattgttgaaccttcaagtcttgaatgtgtcttat catcaaaggtctgagcaagtaaagcaagtacattgttactagtttcgctatatgtcatct ttccaatatctgtaacatgtcctatctcatgacctattccccatccaaataagtttcctc ctgtagcttttccactatcatctatttggaaaggtactccattcataagccctggaactg aaccatattctactcctacatgtaatccagaagcatacataaatgctccaataaacattc tttggtattttatgttcatacgagattttggagccatatcatttttagttaagttaaatt cattatcatctacagttccattaccatctaaatcttgtgttttaaatactcctctttctg agtaaactaaatccattatttgttcccatgcaagcatactattatataatctatctactt gtgtatttaaatcagaatttccttttgatatctcttgatatactgctgttgcaggaacat ttaatgttactttatcactttcaatatctgtagtgtttaacacaccagttttttctgaat atccatatgaattaccaacatttgttcctggataatatggttctccttttacagcatctt tatatttagctaattcttctatatatgcttttatctttttcttagattcagaaactcccg caggactcttatcatttattgttccatttagattaagatgtggtatcttagtagctcctg ctacacgtacttttatatctcctccacttggagtatcttcagcgtatcttatgtataaac ttcctccacattctatatctaaactatgaagtttgcttaattgaattacattttttccag tgttaagatttatttctccactcttatatgcaccagattctccatagtactgtgtatata tcaacttaggagtttttccacttttacttccaacatatactgtgatttcatctcctgctc tagcagctactcctaatgcctgccagtcattttgcatacctaaattattggaatttacag tatactgtccgtttttatctttatattttcctaatttatttatttcttgatttacagtag ttacatcagtaagtgtggctctatcattatataagtcttgagctaattttaattctctct caataactgtcttatatggatgatattctccactagctttatctggagtatttaatctat cttttaattcagttattttttcttgagttacatcttcttttaattcaacttgtaggccat ccataaatagatttcttacatcatcttctatactgtcatactcataaaacttaagttctg atatattagacttatatgaataggatgaacaaacacttacttgtatcttggtagcagtta ttggttcttttaatctaaccattacatacttattattatttacagggtctgtctttgttt caaaaggaacatcccccagattgtgtaattgaccattttcatcccaatatcgtacctcaa agtcatttattgtcttatcagaaacatcaaaacgaggtgtagccataaaagtatccatag tataagatttatcaaaagttattattggtcctctattcgttccctcagctgcattatatg ttgggaatgtccaatgtgttgtaaagtccccatctactacattgaatttatcaaatggat ttttatcactatattcacttttgtcatatccatctggataaacaacatctacaatgtgat ttgttggtattccaaatccaccattttctttaggagtattaattaatctatagttaggtg ttgttggtgcatccatgctttcagttgtacctatatatgttttagacattccactagttc ccaagtggttagtagctgtcattctgacttcatatgttgtattatccttaagaccttcta tctttgaacttgtcccacgaataagcttatcattgtattttatccaagacccattagagc ctttttctttatagtacaagtcaaaatctttagcttgtttatgatttttccagcttacat caagagatttaaatttacctttaacatttataccttctggtggttctggttttgtgtctg gaacaacttgaaattctaatatactatctgggctaaattgtataggtttatagtttgaat ctacattttctggtactccgtctaagttttctggtgttgcatctttataaccactagacc aatctccatttaaagattgtatgctaactctatatagtccatatgcttctatatctctaa cttctattgtatttttactagtttgtaattttttagtagataatacttttcccttactat caattttgtctagtataagttcgtatgctgatacatttacttcattattccaataaaaag atactttttcatttccaacagcagtgctagtcgatattttatttattttaggtatgttca tctctggctttggtatttctttatatacattgtttaaaaattcaacttttgatatttctg caagatttctatcgtttgctgttgtagctgttatttttatagttatcttttttactgcta cttgtttaccaagatttattactatatcactattttgaacatctgcatatgtttctaatg ctgacctactatatgtagatgttgtagagttatcatctttactgatattaccctcttctt ttggagtatcttcatctgaattaggtttatccattgatgaattttctttatcattatttt tatcttgattggtattagagtttgcttcttgtttatcgctattttcctgttgtttatcat tattttcatctttattatttgagttattatcagtctggtttatattttcatctttattat ttacttcttcttgatttacttcttcttgttcgttatttacttcctcttgttgctcctcat cttttaagtttttcatatattctttgttttcataaggaatctgttgaacattaccatctt tgtcagtaacctcaactattccttttgctggagcagtaccttctggagcttttatattga tgacttccatattaagtgcttctgataaagctatatccattactgctggtttttcctcag atatttcatcattttttgaagatattgtaactccattattttctccactaaataaatttt ctacattaccattaatatctacatcactatttccttttaattcaaccttacttgtatcta ctataggattggtagatactatactttctaggctttttgcatcttcactttgtcctaaat ttttctgtacataatctaagtcaacaatatctacctttccatctctatttaaatcaaatt ctcttttatttgaatctatattctctaaaaccttattataatcactcttatctactttac cgtctccatttacatcacccattaagaacaattcataatttaaaggtttatttttattat ctacacttgctctattgcttaataagactctttgtgaataacttgatatatcaatgtctt taatttctttgttcttaaatccatctccagagacttctacattgtattttccaacaggta aattattaaatacaatattataatatgatatattctcatctttattttttatttcacttc tacttgcagataatttttttatagtatattctatattatctgtcccaacatttactgttc ctgaatctttttctccaagctttattattccactattgttactatcatcttttaatcgta actgcatattagtcatactttctgactcgctattttttattggcagtgaaaaatttaaat ctacttcaagactcccccttaacttttctgtaactgatttttcaactgcccttagcttcc cctctaatataggttctgcaaaaacgtttagtggtgcactacacatagatactgctagta cacaagatattgcctttttcatgaaataacaatcctcccttaataaatatctaatttttc atgaatttaaatactataagtttcagacaataaaaaaagacactcaaagagaatcttaat tataaaataaaaagactttactctttttagcaactggctgatatggctttaaaagcttta atccctatagttttgcgtcattagatttccctaattttgccatttaattttcactacttt cttacccattttatactatatttaaactttttaatataatttttttagattaaattataa aaaaataacatttatattaatttattaatataaatgctattttccattataatttaatta tttatatagcttccttacaagcataattttgtgtatattttcttattctttatatcttcc ataaaattcatgtgtagcatatagattcttatctcctgttatagctataccaaatcccat tatttcataccctttatgcaacatattagttccttcttctggatttgtcttccactcatt aaaaataaagtttcctatatcatctgcatctctatttgtatatacaggtttatctggaat tttatatttaattatattttcaccttgaactgctatatatccaggtttaatctcactcca atctaagtatttcaaaaaagtagaatatgaattttttccatttatcgtatgagataaagt cttcttatttgccattaaattagaccaatcatttgctagaccctctaatctgcttgctac agataacgctcttactccattctcttttctatactgctttgtaagagcatatactttacc ctttattctctctttaaatgctctatcatttggattgtaatataaaccttgttgatttgg tgaagcttgatttatacattgcttgataacattctgatttatgcctcctagtacagtcaa tttgtctgcaccacttaaaatactcttgttactgccattttcaactaaaactacaggagc attttttgctattgtagaggcagccaaagcgtctgttaattgtaagcctttacttagata aaattctttactatttttataaaactcttgtataactatcttattagtttcaaatctatc tgtgccacccaatctaatagaatttgtgctcttaactaattcgtcgcttattatttcact agaaccaagcgcataactctttaagcctgtcgtgtcaaatcccacactatttccatctgt aagtattataggtactccatctctagcagctactggtgatgcacttatcgcatctgcttc tcctgtaaatccattggctataattactttatctattggcttaatttctttgattttttc agctatttttatacttgtatcaaatctattttcaccaaatattctttgtacaaccttctt tttggatagtaactgattctcaacatttttacttattgttgattctgaacctattatata cacagtctttgctttgtttaatctttccatagttgtgtttggaatctggttttgttttgt catcaaaataggcgcatttaaggctccagctaaaccacttgcacttagaccatctgctaa gctattatctgagttgattagtattgctgtattgtagttttgcttatctgctatttttgc tgctgtctcatatctgtcattcccttttatttgctcaactgatgtcaacgcatttaccat aggagtatttaccattactaaaaatagtgtaagtcctatagctaatatctttttactatt cttcatattattttctacccccaatgtacttttcatattttttattagtactcatactta tttttaatcaaaagttacaattttgttaccatattttatatatgataccatagttatcca tacaactcaaacaatatacctaaagtttttattctctataaattcaaaacattataattt attttatttaattacgttataagttcaaaataatttatgttagtaatatgtttaatcatt ataagaagtatctttttataataatttttgcaatatgaatttctcaacattataatcaaa aaataaaataaggtatctcaatctaattctaaatgagacaccttatttttattattttat cttgttatttgtatattttataatatctacactatgtcttacatattaacgcattgtata atcatatattatctaaataaacttttaatattaattcctatatcttattagttcttagta aataagtttattttttctgctattttttcaatagcgtttttagctattccttcacctatt tgtactaacttagtagcattcttaagtcttaactcaactacttcttcttgtgatttagaa agttcttctgtagttaatactattggagcctttgaactagctgcaagtggtgctgctgta agtgcatcaactaattgtccatttccacctacataaccatcttttgctacatatgcttta gttgcacctgcatagtatttattgattactttagcattagtatcttttctattttctcca gctaatctttcaactttattatttaaatctatatcaactaatttgtcttcaacttctttt gatacagaattttctccacccactatttctaattcttttccttttaataatttttcagca tttgcatctaattcgttacctgtaactattattggagcaccaaattgagcagctctagct gatatactcatagcatcagcttctccatttccacctactacaaaagcagtcttaaatgta tcttttaattgttttgctatttctaaagaagtttcaaatctatcttctccagaaactctc tcaactttacttacacctaatttagaaagtttttcttcagtttcttttgatactttagat tctccacctactatatatattttcttagaagatagattacttccaagtactcttaatatt tcagcttctatttctgatggtagtgaatcttttttagataataatattggtgcatttttt tgagaggcaagtggtgctgatgctaatccatcaactatagcatcttctccaactaaaatt atagcttctgcttctccatctttaaatctctctttactaacttctactgctgttgtaaat cttgaatcaccagataaaacttctacttttaattcttttccatcttttacatcagttaat actttgtgtaagtctctaactaacttatggtttttacttgaaac |