Block details | |
---|---|
fasta | C_difficile_CD00077_4A_024066.fasta |
contig | u00000crpx_c_024066 |
start | 3192071 |
length | 14742 |
strand | + |
type | core |
seq | ttgcctttttcttttctatatgaattaactaaatcatacatctcattagataccatagcc ttaaactcataactattagagtcttttgtactcgcatttacaactaccttaacatttaca ctaatctcactcttctgacctaaattatccactacacttatatttaaaacatatgttcca gccttgttaatatcaacatttcctttaatatttgcctttaaatcatttccataataatca gtagcaactatattcaacatactattatcaaacttatcccctacagaaatctctacatca ttagcagtaattgtaggcattgtatttttatcagatgcagaactaatacattggtcaaca accttcttatccattccacctaaagaagtaacttcatcagcacctctaagcacactctta tcacttccatcattaacaagtactataggtttgtccttagccaacggagaaccagccaca gcatcaactaacttatacccttgagaaacataaaacttctttgttcctttataaaagcgt tgtataaccttcttattagtttcaaacctatccttaccagcaatcctaactgaattagtc ttactcacaagttcattactcattatctcctctgacccaagagaatagcactgaacgcca tcaactttaaatggtatactctttccatcagtaagtatcacaggaactccatctctagca gctacagaagatacactcattgcatcagcctcacctgtgtatccatttacaagaaaaacc ttatcaccatcatttactggtttaatagctgaaatctccttagctataagatagctagtc tttattctatcttccccaccaattcttttaacttcaatccctttattcttaagttgattt tctacagatttacctattgtatcctctgtacctataacataagcattcttaacatccttt agtcttttttcaacatctgttggtatcttatctctttgcaccaacattataggagctttt gcaactccagataatccacttgcacttaatccatctactatagaattatcagtatttact aatatgattgtatcatatatttgtttatctgctatcaatgcagaagtctcatatctatct ttcccctgtatcttttctatgctcgaaagtgcattgatatttggtgctcctgccattatt aatgatattgtcaatcctattgataatactctcttatttaccttcatcaaactcctccta ctaatttttttatataattcagctaatcataaattacatcctcagtagtgattccctcaa aatctataaactactaaaacaaaaaacacctaaaataccatagcctgtaaagcaataaca aaacagattacaaaaagtactttagatgtgattttcattttataatatcagtaaattaac aaaaaaacaagatttatggaattttttacaagctaccttcatttccatttaaaaactcct gagtagcatgcacttgaccatcagataatatataaagcccaaatccagtactataaaact cattactaagcatgtttgcattgtactctggagacttcttccacacctcaaatatagcct ttgccaagtcttttgcatcttgtgtcgtttgaacgttcttagaatctatataaatatatg ctatattttcctcacttctcattccaaattcagaaaatacttgtggagcattttttccat ctatataatgtgcaaatacttttttatccatcatatacttagaccatgcatttgccatac cttctagcctactagacactagcaaaggctctttgcctttttcttttctataggaattga ttaagttatacatttcagtagataccatttttttaaattctgggctgttgtaatcatgag atttgtcatccaacacttttatttctactctttttcctgtgctttttccccattcgtctg tagcttttaatgtcaatatgtatgtacctactctatttgtatctataaacccatcaactt ctattggtaataccttccctgtgttatctttagctactatatttaacttgccagtgtcaa acttttcacccttatatacctctgtacttccaactgtaattgttgggggttgcccatttg aatttgaagcatttatacactgttgtattaccttctcatttatttcacctacagaggtta tattcttagctccttctaatacagttttatcgcttccatcatttactagtaccattggag agtttttagtaagtggtgcagctgctattgcatctactaattggtatccatctgatacat agaatccatctgcactattaaaaaagtagtctattacgtttttgttagtttcaaatcggt cagttccttctattcttactgagtttgtatttttaactagaggattactcattatctcct ctgaacctatacaatatgattgaatattttttacatcaaaaggcacactctttccatctg taagtatgattggagctccatctctagtagctactgatgatacactcattgcatctgctt ctccactatatgcattagttaatagtactttatccactttttttatagttgctatttctt tagctattaaatagcttgtttttagtctatcttctccaccaattcttttgacttctatat ttttagaatctagttctttttctactgatttacttatagtatcttctgtacctattatat atgcttttttgatattttttagacatctatttgtgtctgctggtatcttattttgttgtg taaatagtattggagcttttgtagctcccgataatccacttgcacttaatccatctgcaa gtgatttttctgtatttactaaaattactgtttcataagtctgtttatcagctatctttg ctgctgtttcatatctatctttaccgtatattttttctactactgatgatgcatttacac ttttgaagtttactaagattaatgatactgctagacctaatgataatatttttttgttca ttttcatatccccctgatgatttttatattttatatttatattgtgattattttccattt attttctctttattttccatatattatagagtatatatgatatgaatatatctcgtctat atattagtgttttattttattaaatttaaaaaattatttttaacttctttttaaacatat tcaaaattgaatttatatttatatatataaaagatatctgctttatttaaaattaaactt aatatagctcaaattattatacattttaacctcaatattattagattgttaagataatga aaataaaataagaatgcatttaaatatataactttatatctaaatacattcttattttct atttacttaatatttatttttcaattaaactcttaatcttgtctattacagatgaggcta ttcctccacctacttcaaacaactttgatgaatttttaccttttaatgacgattcttgtg atttatctaacgtatttgtagcaagtataactggtgaattgtttttagctgctaatggtc caactgctaaagcatctataagtttatcttgatttgcaactacaactccatctagcttag attgagagtagaatttatctattactttggcattcgtctcttgtctagtttgacctgcca ccctattgtttgatatatctttgtttgctatttttccaacttgttcaatagccttgttag atattttttctactccaccaataaaatatatatttgacaccttatttgatttaataaatt gttcagcttcattatctacaccatctttttgtgtaagtactattggagttttttctttac cagccagtgatgctattgataatgaatcagcttctccatttcctgctcctatatacaact tgcttacattattcgtcttatctatttcttttgctatattaatagaagtttgatatcttg tatctccacctattctttgtactgatatttttgaatttacagctttgatagcttcaacaa ctgaatttggcattgagttgtttccacctatcacaattacttttgatggatttagccttt tcaattcttctacagttttttgaggaagcttttcatttgatgataaaagaattggtgagt tttttacactagcaagtggtgtagctgtaagcccatccaccatacttttatcttctccat ttactattacaactgtatctgattttgtccaaccactttgagatattttgatagctgtct caaatctatcagcaccttttaattttttgactgtgacattagatgtagaatcacttgaac ttcctcctccagagcttccaccactagatgagccgcctgaattacttcctccaccattat ttccaccattgccattatctggtggtaattcatccggttttgataattcattttcaacta tgtattctaaactttttggaagtgtaacttcaacatatttgtttattgtagcttttcttc ccttagttgttttttgtgctaatccaagttttaatattacatttgaaccactttcttgtg tttctttactaacaatagaatagtttatcctaatattgtttaataaatattcaagtgctt cacttttctctaccttatacttttcagggtcatttttactagaaccagttccaccaattg gttttacttcactctcattaataagggtaaatattaatccttcatcagagcttatatttt cataatccactgttttgttgttatatgttacaatttttaaagctggtttatcatttgttc cttttcctaaaactttatagtcagcatttgagttactgccagatttttttacagatattc ttcctatattcaatctatttccgtctagtaaatcttcatttgatgtaacatatatatcta atgtagttgtattacttgatttgttgtattctactctacaagtagcatttgcatttccac tttttatctgagattttatattatcagaccaagtaatcttttctttctgctcattatcta ctacttcaacctcaccttgtacttttatactggcttgaaatgaatatactatgttttcta ctgagtccacagatatatctatagtatttactttctcatacgtttttgttccttgtaaaa ctggagctgcatatgcacatgtagcactaccagttacagctactgccatagttgatactg ctatagttcttataaaagattttcttttactcattaacacccgtccttatctatcattaa ctaagtggataaatttacttatccacctagcttttatatttaatttataaattaccctaa atttatggttacatttatatactttacttttaatatctactattttaaaactattctagt acctaatcttattagatatacaatgttagtatttttacgtttttagagttccacctacta tttatctctaacaatattaccctttactttattgcttacagttataaccttcttattact gatatcaatagaatttcttgtagcttttctagctttactattactatcagtaagacttat tgtctttaactcatcataattcttagctcctacaggtacatacattgtatcacttacaaa tctttgacctactggagtatctccttgaaggtcattgtatctatatagttcagccttaac cttatcacttaaagaatcaaagttttcttttggcatatagtaaacccatgtacctttact gatttcacctagttcacctttttctggaacttctgcaaataaaagtgcttctccagatat agtcttattgtttttatctataagtagtggtaaattaaatgctggatttccactgtattc acctgtaataactattgaacccgctggaatcttacctgtttcatcttcacttgtgctaga gtcatcactttgatatacataatcttctgctaattttccaattccattagtacgagtttc gtctgcattatttattatgccaatttctatattatcacctggaggtcctattatatctaa ttctgcaacttctatattagacttattatttgagattagttttacatatctagcttggta tgtccaaagtttaccatctttattaaatgtaactctagcttcattatcttggtcttttcc tccaccaactaaatcttgtccatattcaaaagttccttgacttacatcttcccagttctt tttatcattacttacttgtatcttgtaattagttaaaggattgtatgttgtgctagtatt ctttctaaagttaaataatccttttaatgagaactttctagcttctgtctctggttttgt atattttagtcctactataggtaatgtttctttcatgtctactattatatatggattttc ttctacatttatatcagggtctttttgagggtctttgttccactctgctttacttattat ctttcctttatatgtagtacttgcatcattatcttttatattatcaatttcaggattttg taatggtccatgtgagtcattttcagttctaacatcaccgtcagaaacagtatttgttat gaatgaccatgctgatttatttattttcccttcatctgataattttacagtaccaacttc aaattcttctgttggatttaggtgataatcatatgcaactaccttatatgtaaatgctct gttattaagaggagatatattatcagtaaatttagtcttgctatttccttttgcatccac aaatccaactgttctgtattttacctgtgttccattttcaccatctaaataatttccatc acttcttattatttcgtatcctagtatcttatctttatccttatctacatctaggtctat agatattttattagatttaactagagaaccactttgtattccatcagaaaaactagcact tactttagtatcttttgccatactagctatattttcatttaaaatctttcttctagcttc atcatttacatattgtatctttcttgattctttttcgtagttcttgctatccattatact gtttaattctggtgtaatttctactccccatgccttaaagtaatctcttaaatctttttc aacaacacttgatgccattgctactagcatttggtcttttggtaaactattaattgggtc actacttgaaagtgctctgtattttcttgaaatctttgcatagaatgtatcattacttaa atcagcatctgagttattctttaacattgaacccgtaaaatcatcatcataagctagatg taattgccataacattccaagcctttcaaatacattgcttggtatacctaagctatttga agttacatgctcatatatcttatccattgttgaaccttcaagtcttgaatgtgtcttatc atcaaaggtctgagcaagtaaagcaagtacattgttactagtttcgctatatgtcatctt tccaatatctgtaacatgtcctatctcatgacctattccccatccaaataagtttcctcc tgtagcttttccactatcatctatttggaaaggtactccattcataagccctggaactga accatattctactcctacatgtaatccagaagcatacataaatgctccaataaacattct ttggtattttatgttcatacgagattttggagccatatcatttttagttaagttaaattc attatcatctacagttccattaccatctaaatcttgtgttttaaatactcctctttctga gtaaactaaatccattatttgttcccatgcaagcatactattatataatctatctacttg tgtatttaaatcagaatttccttttgatatctcttgatatactgctgttgcaggaacatt taatgttactttatcactttcaatatctgtagtgtttaacacaccagttttttctgaata tccatatgaattaccaacatttgttcctggataatatggttctccttttacagcatcttt atatttagctaattcttctatatatgcttttatctttttcttagattcagaaactcccgc aggactcttatcatttattgttccatttagattaagatgtggtatcttagtagctcctgc tacacgtacttttatatctcctccacttggagtatcttcagcgtatcttatgtataaact tcctccacattctatatctaaactatgaagtttgcttaattgaattacattttttccagt gttaagatttatttctccactcttatatgcaccagattctccatagtactgtgtatatat caacttaggagtttttccacttttacttccaacatatactgtgatttcatctcctgctct agcagctactcctaatgcctgccagtcattttgcatacctaaattattggaatttacagt atactgtccgtttttatctttatattttcctaatttatttatttcttgatttacagtagt tacatcagtaagtgtggctctatcattatataagtcttgagctaattttaattctctctc aataactgtcttatatggatgatattctccactagctttatctggagtatttaatctatc ttttaattcagttattttttcttgagttacatcttcttttaattcaacttgtaggccatc cataaatagatttcttacatcatcttctatactgtcatactcataaaacttaagttctga tatattagacttatatgaataggatgaacaaacacttacttgtatcttggtagcagttat tggttcttttaatctaaccattacatacttattattatttacagggtctgtctttgtttc aaaaggaacatcccccagattgtgtaattgaccattttcatcccaatatcgtacctcaaa gtcatttattgtcttatcagaaacatcaaaacgaggtgtagccataaaagtatccatagt ataagatttatcaaaagttattattggtcctctattcgttccctcagctgcattatatgt tgggaatgtccaatgtgttgtaaagtccccatctactacattgaatttatcaaatggatt tttatcactatattcacttttgtcatatccatctggataaacaacatctacaatgtgatt tgttggtattccaaatccaccattttctttaggagtattaattaatctatagttaggtgt tgttggtgcatccatgctttcagttgtacctatatatgttttagacattccactagttcc caagtggttagtagctgtcattctgacttcatatgttgtattatccttaagaccttctat ctttgaacttgtcccacgaataagcttatcattgtattttatccaagacccattagagcc tttttctttatagtacaagtcaaaatctttagcttgtttatgatttttccagcttacatc aagagatttaaatttacctttaacatttataccttctggtggttctggttttgtgtctgg aacaacttgaaattctaatatactatctgggctaaattgtataggtttatagtttgaatc tacattttctggtactccgtctaagttttctggtgttgcatctttataaccactagacca atctccatttaaagattgtatgctaactctatatagtccatatgcttctatatctctaac ttctattgtatttttactagtttgtaattttttagtagataatacttttcccttactatc aattttgtctagtataagttcgtatgctgatacatttacttcattattccaataaaaaga tactttttcatttccaacagcagtgctagtcgatattttatttattttaggtatgttcat ctctggctttggtatttctttatatacattgtttaaaaattcaacttttgatatttctgc aagatttctatcgtttgctgttgtagctgttatttttatagttatcttttttactgctac ttgtttaccaagatttattactatatcactattttgaacatctgcatatgtttctaatgc tgacctactatatgtagatgttgtagagttatcatctttactgatattaccctcttcttt tggagtatcttcatctgaattaggtttatccattgatgaattttctttatcattattttt atcttgattggtattagagtttgcttcttgtttatcgctattttcctgttgtttatcatt attttcatctttattatttgagttattatcagtctggtttatattttcatctttattatt tacttcttcttgatttacttcttcttgttcgttatttacttcctcttgttgctcctcatc ttttaagtttttcatatattctttgttttcataaggaatctgttgaacattaccatcttt gtcagtaacctcaactattccttttgctggagcagtaccttctggagcttttatattgat gacttccatattaagtgcttctgataaagctatatccattactgctggtttttcctcaga tatttcatcattttttgaagatattgtaactccattattttctccactaaataaattttc tacattaccattaatatctacatcactatttccttttaattcaaccttacttgtatctac tataggattggtagatactatactttctaggctttttgcatcttcactttgtcctaaatt tttctgtacataatctaagtcaacaatatctacctttccatctctatttaaatcaaattc tcttttatttgaatctatattctctaaaaccttattataatcactcttatctactttacc gtctccatttacatcacccattaagaacaattcataatttaaaggtttatttttattatc tacacttgctctattgcttaataagactctttgtgaataacttgatatatcaatgtcttt aatttctttgttcttaaatccatctccagagacttctacattgtattttccaacaggtaa attattaaatacaatattataatatgatatattctcatctttattttttatttcacttct acttgcagataatttttttatagtatattctatattatctgtcccaacatttactgttcc tgaatctttttctccaagctttattattccactattgttactatcatcttttaatcgtaa ctgcatattagtcatactttctgactcgctattttttattggcagtgaaaaatttaaatc tacttcaagactcccccttaacttttctgtaactgatttttcaactgcccttagcttccc ctctaatataggttctgcaaaaacgtttagtggtgcactacacatagatactgctagtac acaagatattgcctttttcatgaaataacaatcctcccttaataaatatctaatttttca tgaatttaaatactataagtttcagacaataaaaaaagacactcaaagagaatcttaatt ataaaataaaaagactttactctttttagcaactggctgatatggctttaaaagctttaa tccctatagttttgcgtcattagatttccctaattttgccatttaattttcactactttc ttacccattttatactatatttaaactttttaatataatttttttagattaaattataaa aaaataacatttatattaatttattaatataaatgctattttccattataatttaattat ttatatagcttccttacaagcataattttgtgtatattttcttattctttatatcttcca taaaattcatgtgtagcatatagattcttatctcctgttatagctataccaaatcccatt atttcataccctttatgcaacatattagttccttcttctggatttgtcttccactcatta aaaataaagtttcctatatcatctgcatctctatttgtatatacaggtttatctggaatt ttatatttaattatattttcaccttgaactgctatatatccaggtttaatctcactccaa tctaagtatttcaaaaaagtagaatatgaattttttccatttatcgtatgagataaagtc ttcttatttgccattaaattagaccaatcatttgctagaccctctaatctgcttgctaca gataacgctcttactccattctcttttctatactgctttgtaagagcatatactttaccc tttattctctctttaaatgctctatcatttggattgtaatataaaccttgttgatttggt gaagcttgatttatacattgcttgataacattctgatttatgcctcctagtacagtcaat ttgtctgcaccacttaaaatactcttgttactgccattttcaactaaaactacaggagca ttttttgctattgtagaggcagccaaagcgtctgttaattgtaagcctttacttagataa aattctttactatttttataaaactcttgtataactatcttattagtttcaaatctatct gtgccacccaatctaatagaatttgtgctcttaactaattcgtcgcttattatttcacta gaaccaagcgcataactctttaagcctgtcgtgtcaaatcccacactatttccatctgta agtattataggtactccatctctagcagctactggtgatgcacttatcgcatctgcttct cctgtaaatccattggctataattactttatctattggcttaatttctttgattttttca gctatttttatacttgtatcaaatctattttcaccaaatattctttgtacaaccttcttt ttggatagtaactgattctcaacatttttacttattgttgattctgaacctattatatac acagtctttgctttgtttaatctttccatagttgtgtttggaatctggttttgttttgtc atcaaaataggcgcatttaaggctccagctaaaccacttgcacttagaccatctgctaag ctattatctgagttgattagtattgctgtattgtagttttgcttatctgctatttttgct gctgtctcatatctgtcattcccttttatttgctcaactgatgtcaacgcatttaccata ggagtatttaccattactaaaaatagtgtaagtcctatagctaatatctttttactattc ttcatattattttctacccccaatgtacttttcatattttttattagtactcatacttat ttttaatcaaaagttacaattttgttaccatattttatatatgataccatagttatccat acaactcaaacaatatacctaaagtttttattctctataaattcaaaacattataattta ttttatttaattacgttataagttcaaaataatttatgttagtaatatgtttaatcatta taagaagtatctttttataataatttttgcaatatgaatttctcaacattataatcaaaa aataaaataaggtatctcaatctaattctaaatgagacaccttatttttattattttatc ttgttatttgtatattttataatatctacactatgtcttacatattaacgcattgtataa tcatatattatctaaataaacttttaatattaattcctatatcttattagttcttagtaa ataagtttattttttctgctattttttcaatagcgtttttagctattccttcacctattt gtactaacttagtagcattcttaagtcttaactcaactacttcttcttgtgatttagaaa gttcttctgtagttaatactattggagcctttgaactagctgcaagtggtgctgctgtaa gtgcatcaactaattgtccatttccacctacataaccatcttttgctacatatgctttag ttgcacctgcatagtatttattgattactttagcattagtatcttttctattttctccag ctaatctttcaactttattatttaaatctatatcaactaatttgtcttcaacttcttttg atacagaattttctccacccactatttctaattcttttccttttaataatttttcagcat ttgcatctaattcgttacctgtaactattattggagcaccaaattgagcagctctagctg atatactcatagcatcagcttctccatttccacctactacaaaagcagtcttaaatgtat cttttaattgttttgctatttctaaagaagtttcaaatctatcttctccagaaactctct caactttacttacacctaatttagaaagtttttcttcagtttcttttgatactttagatt ctccacctactatatatattttcttagaagatagattacttccaagtactcttaatattt cagcttctatttctgatggtagtgaatcttttttagataataatattggtgcattttttt gagaggcaagtggtgctgatgctaatccatcaactatagcatcttctccaactaaaatta tagcttctgcttctccatctttaaatctctctttactaacttctactgctgttgtaaatc ttgaatcaccagataaaacttctacttttaattcttttccatcttttacatcagttaata ctttgtgtaagtctctaactaacttatggtttttacttgaaac |