Block details
fasta C_difficile_CD00077_4A_024066.fasta
contig u00000crpx_c_024066
start 3192071
length 14742
strand +
type core
seq ttgcctttttcttttctatatgaattaactaaatcatacatctcattagataccatagcc
ttaaactcataactattagagtcttttgtactcgcatttacaactaccttaacatttaca
ctaatctcactcttctgacctaaattatccactacacttatatttaaaacatatgttcca
gccttgttaatatcaacatttcctttaatatttgcctttaaatcatttccataataatca
gtagcaactatattcaacatactattatcaaacttatcccctacagaaatctctacatca
ttagcagtaattgtaggcattgtatttttatcagatgcagaactaatacattggtcaaca
accttcttatccattccacctaaagaagtaacttcatcagcacctctaagcacactctta
tcacttccatcattaacaagtactataggtttgtccttagccaacggagaaccagccaca
gcatcaactaacttatacccttgagaaacataaaacttctttgttcctttataaaagcgt
tgtataaccttcttattagtttcaaacctatccttaccagcaatcctaactgaattagtc
ttactcacaagttcattactcattatctcctctgacccaagagaatagcactgaacgcca
tcaactttaaatggtatactctttccatcagtaagtatcacaggaactccatctctagca
gctacagaagatacactcattgcatcagcctcacctgtgtatccatttacaagaaaaacc
ttatcaccatcatttactggtttaatagctgaaatctccttagctataagatagctagtc
tttattctatcttccccaccaattcttttaacttcaatccctttattcttaagttgattt
tctacagatttacctattgtatcctctgtacctataacataagcattcttaacatccttt
agtcttttttcaacatctgttggtatcttatctctttgcaccaacattataggagctttt
gcaactccagataatccacttgcacttaatccatctactatagaattatcagtatttact
aatatgattgtatcatatatttgtttatctgctatcaatgcagaagtctcatatctatct
ttcccctgtatcttttctatgctcgaaagtgcattgatatttggtgctcctgccattatt
aatgatattgtcaatcctattgataatactctcttatttaccttcatcaaactcctccta
ctaatttttttatataattcagctaatcataaattacatcctcagtagtgattccctcaa
aatctataaactactaaaacaaaaaacacctaaaataccatagcctgtaaagcaataaca
aaacagattacaaaaagtactttagatgtgattttcattttataatatcagtaaattaac
aaaaaaacaagatttatggaattttttacaagctaccttcatttccatttaaaaactcct
gagtagcatgcacttgaccatcagataatatataaagcccaaatccagtactataaaact
cattactaagcatgtttgcattgtactctggagacttcttccacacctcaaatatagcct
ttgccaagtcttttgcatcttgtgtcgtttgaacgttcttagaatctatataaatatatg
ctatattttcctcacttctcattccaaattcagaaaatacttgtggagcattttttccat
ctatataatgtgcaaatacttttttatccatcatatacttagaccatgcatttgccatac
cttctagcctactagacactagcaaaggctctttgcctttttcttttctataggaattga
ttaagttatacatttcagtagataccatttttttaaattctgggctgttgtaatcatgag
atttgtcatccaacacttttatttctactctttttcctgtgctttttccccattcgtctg
tagcttttaatgtcaatatgtatgtacctactctatttgtatctataaacccatcaactt
ctattggtaataccttccctgtgttatctttagctactatatttaacttgccagtgtcaa
acttttcacccttatatacctctgtacttccaactgtaattgttgggggttgcccatttg
aatttgaagcatttatacactgttgtattaccttctcatttatttcacctacagaggtta
tattcttagctccttctaatacagttttatcgcttccatcatttactagtaccattggag
agtttttagtaagtggtgcagctgctattgcatctactaattggtatccatctgatacat
agaatccatctgcactattaaaaaagtagtctattacgtttttgttagtttcaaatcggt
cagttccttctattcttactgagtttgtatttttaactagaggattactcattatctcct
ctgaacctatacaatatgattgaatattttttacatcaaaaggcacactctttccatctg
taagtatgattggagctccatctctagtagctactgatgatacactcattgcatctgctt
ctccactatatgcattagttaatagtactttatccactttttttatagttgctatttctt
tagctattaaatagcttgtttttagtctatcttctccaccaattcttttgacttctatat
ttttagaatctagttctttttctactgatttacttatagtatcttctgtacctattatat
atgcttttttgatattttttagacatctatttgtgtctgctggtatcttattttgttgtg
taaatagtattggagcttttgtagctcccgataatccacttgcacttaatccatctgcaa
gtgatttttctgtatttactaaaattactgtttcataagtctgtttatcagctatctttg
ctgctgtttcatatctatctttaccgtatattttttctactactgatgatgcatttacac
ttttgaagtttactaagattaatgatactgctagacctaatgataatatttttttgttca
ttttcatatccccctgatgatttttatattttatatttatattgtgattattttccattt
attttctctttattttccatatattatagagtatatatgatatgaatatatctcgtctat
atattagtgttttattttattaaatttaaaaaattatttttaacttctttttaaacatat
tcaaaattgaatttatatttatatatataaaagatatctgctttatttaaaattaaactt
aatatagctcaaattattatacattttaacctcaatattattagattgttaagataatga
aaataaaataagaatgcatttaaatatataactttatatctaaatacattcttattttct
atttacttaatatttatttttcaattaaactcttaatcttgtctattacagatgaggcta
ttcctccacctacttcaaacaactttgatgaatttttaccttttaatgacgattcttgtg
atttatctaacgtatttgtagcaagtataactggtgaattgtttttagctgctaatggtc
caactgctaaagcatctataagtttatcttgatttgcaactacaactccatctagcttag
attgagagtagaatttatctattactttggcattcgtctcttgtctagtttgacctgcca
ccctattgtttgatatatctttgtttgctatttttccaacttgttcaatagccttgttag
atattttttctactccaccaataaaatatatatttgacaccttatttgatttaataaatt
gttcagcttcattatctacaccatctttttgtgtaagtactattggagttttttctttac
cagccagtgatgctattgataatgaatcagcttctccatttcctgctcctatatacaact
tgcttacattattcgtcttatctatttcttttgctatattaatagaagtttgatatcttg
tatctccacctattctttgtactgatatttttgaatttacagctttgatagcttcaacaa
ctgaatttggcattgagttgtttccacctatcacaattacttttgatggatttagccttt
tcaattcttctacagttttttgaggaagcttttcatttgatgataaaagaattggtgagt
tttttacactagcaagtggtgtagctgtaagcccatccaccatacttttatcttctccat
ttactattacaactgtatctgattttgtccaaccactttgagatattttgatagctgtct
caaatctatcagcaccttttaattttttgactgtgacattagatgtagaatcacttgaac
ttcctcctccagagcttccaccactagatgagccgcctgaattacttcctccaccattat
ttccaccattgccattatctggtggtaattcatccggttttgataattcattttcaacta
tgtattctaaactttttggaagtgtaacttcaacatatttgtttattgtagcttttcttc
ccttagttgttttttgtgctaatccaagttttaatattacatttgaaccactttcttgtg
tttctttactaacaatagaatagtttatcctaatattgtttaataaatattcaagtgctt
cacttttctctaccttatacttttcagggtcatttttactagaaccagttccaccaattg
gttttacttcactctcattaataagggtaaatattaatccttcatcagagcttatatttt
cataatccactgttttgttgttatatgttacaatttttaaagctggtttatcatttgttc
cttttcctaaaactttatagtcagcatttgagttactgccagatttttttacagatattc
ttcctatattcaatctatttccgtctagtaaatcttcatttgatgtaacatatatatcta
atgtagttgtattacttgatttgttgtattctactctacaagtagcatttgcatttccac
tttttatctgagattttatattatcagaccaagtaatcttttctttctgctcattatcta
ctacttcaacctcaccttgtacttttatactggcttgaaatgaatatactatgttttcta
ctgagtccacagatatatctatagtatttactttctcatacgtttttgttccttgtaaaa
ctggagctgcatatgcacatgtagcactaccagttacagctactgccatagttgatactg
ctatagttcttataaaagattttcttttactcattaacacccgtccttatctatcattaa
ctaagtggataaatttacttatccacctagcttttatatttaatttataaattaccctaa
atttatggttacatttatatactttacttttaatatctactattttaaaactattctagt
acctaatcttattagatatacaatgttagtatttttacgtttttagagttccacctacta
tttatctctaacaatattaccctttactttattgcttacagttataaccttcttattact
gatatcaatagaatttcttgtagcttttctagctttactattactatcagtaagacttat
tgtctttaactcatcataattcttagctcctacaggtacatacattgtatcacttacaaa
tctttgacctactggagtatctccttgaaggtcattgtatctatatagttcagccttaac
cttatcacttaaagaatcaaagttttcttttggcatatagtaaacccatgtacctttact
gatttcacctagttcacctttttctggaacttctgcaaataaaagtgcttctccagatat
agtcttattgtttttatctataagtagtggtaaattaaatgctggatttccactgtattc
acctgtaataactattgaacccgctggaatcttacctgtttcatcttcacttgtgctaga
gtcatcactttgatatacataatcttctgctaattttccaattccattagtacgagtttc
gtctgcattatttattatgccaatttctatattatcacctggaggtcctattatatctaa
ttctgcaacttctatattagacttattatttgagattagttttacatatctagcttggta
tgtccaaagtttaccatctttattaaatgtaactctagcttcattatcttggtcttttcc
tccaccaactaaatcttgtccatattcaaaagttccttgacttacatcttcccagttctt
tttatcattacttacttgtatcttgtaattagttaaaggattgtatgttgtgctagtatt
ctttctaaagttaaataatccttttaatgagaactttctagcttctgtctctggttttgt
atattttagtcctactataggtaatgtttctttcatgtctactattatatatggattttc
ttctacatttatatcagggtctttttgagggtctttgttccactctgctttacttattat
ctttcctttatatgtagtacttgcatcattatcttttatattatcaatttcaggattttg
taatggtccatgtgagtcattttcagttctaacatcaccgtcagaaacagtatttgttat
gaatgaccatgctgatttatttattttcccttcatctgataattttacagtaccaacttc
aaattcttctgttggatttaggtgataatcatatgcaactaccttatatgtaaatgctct
gttattaagaggagatatattatcagtaaatttagtcttgctatttccttttgcatccac
aaatccaactgttctgtattttacctgtgttccattttcaccatctaaataatttccatc
acttcttattatttcgtatcctagtatcttatctttatccttatctacatctaggtctat
agatattttattagatttaactagagaaccactttgtattccatcagaaaaactagcact
tactttagtatcttttgccatactagctatattttcatttaaaatctttcttctagcttc
atcatttacatattgtatctttcttgattctttttcgtagttcttgctatccattatact
gtttaattctggtgtaatttctactccccatgccttaaagtaatctcttaaatctttttc
aacaacacttgatgccattgctactagcatttggtcttttggtaaactattaattgggtc
actacttgaaagtgctctgtattttcttgaaatctttgcatagaatgtatcattacttaa
atcagcatctgagttattctttaacattgaacccgtaaaatcatcatcataagctagatg
taattgccataacattccaagcctttcaaatacattgcttggtatacctaagctatttga
agttacatgctcatatatcttatccattgttgaaccttcaagtcttgaatgtgtcttatc
atcaaaggtctgagcaagtaaagcaagtacattgttactagtttcgctatatgtcatctt
tccaatatctgtaacatgtcctatctcatgacctattccccatccaaataagtttcctcc
tgtagcttttccactatcatctatttggaaaggtactccattcataagccctggaactga
accatattctactcctacatgtaatccagaagcatacataaatgctccaataaacattct
ttggtattttatgttcatacgagattttggagccatatcatttttagttaagttaaattc
attatcatctacagttccattaccatctaaatcttgtgttttaaatactcctctttctga
gtaaactaaatccattatttgttcccatgcaagcatactattatataatctatctacttg
tgtatttaaatcagaatttccttttgatatctcttgatatactgctgttgcaggaacatt
taatgttactttatcactttcaatatctgtagtgtttaacacaccagttttttctgaata
tccatatgaattaccaacatttgttcctggataatatggttctccttttacagcatcttt
atatttagctaattcttctatatatgcttttatctttttcttagattcagaaactcccgc
aggactcttatcatttattgttccatttagattaagatgtggtatcttagtagctcctgc
tacacgtacttttatatctcctccacttggagtatcttcagcgtatcttatgtataaact
tcctccacattctatatctaaactatgaagtttgcttaattgaattacattttttccagt
gttaagatttatttctccactcttatatgcaccagattctccatagtactgtgtatatat
caacttaggagtttttccacttttacttccaacatatactgtgatttcatctcctgctct
agcagctactcctaatgcctgccagtcattttgcatacctaaattattggaatttacagt
atactgtccgtttttatctttatattttcctaatttatttatttcttgatttacagtagt
tacatcagtaagtgtggctctatcattatataagtcttgagctaattttaattctctctc
aataactgtcttatatggatgatattctccactagctttatctggagtatttaatctatc
ttttaattcagttattttttcttgagttacatcttcttttaattcaacttgtaggccatc
cataaatagatttcttacatcatcttctatactgtcatactcataaaacttaagttctga
tatattagacttatatgaataggatgaacaaacacttacttgtatcttggtagcagttat
tggttcttttaatctaaccattacatacttattattatttacagggtctgtctttgtttc
aaaaggaacatcccccagattgtgtaattgaccattttcatcccaatatcgtacctcaaa
gtcatttattgtcttatcagaaacatcaaaacgaggtgtagccataaaagtatccatagt
ataagatttatcaaaagttattattggtcctctattcgttccctcagctgcattatatgt
tgggaatgtccaatgtgttgtaaagtccccatctactacattgaatttatcaaatggatt
tttatcactatattcacttttgtcatatccatctggataaacaacatctacaatgtgatt
tgttggtattccaaatccaccattttctttaggagtattaattaatctatagttaggtgt
tgttggtgcatccatgctttcagttgtacctatatatgttttagacattccactagttcc
caagtggttagtagctgtcattctgacttcatatgttgtattatccttaagaccttctat
ctttgaacttgtcccacgaataagcttatcattgtattttatccaagacccattagagcc
tttttctttatagtacaagtcaaaatctttagcttgtttatgatttttccagcttacatc
aagagatttaaatttacctttaacatttataccttctggtggttctggttttgtgtctgg
aacaacttgaaattctaatatactatctgggctaaattgtataggtttatagtttgaatc
tacattttctggtactccgtctaagttttctggtgttgcatctttataaccactagacca
atctccatttaaagattgtatgctaactctatatagtccatatgcttctatatctctaac
ttctattgtatttttactagtttgtaattttttagtagataatacttttcccttactatc
aattttgtctagtataagttcgtatgctgatacatttacttcattattccaataaaaaga
tactttttcatttccaacagcagtgctagtcgatattttatttattttaggtatgttcat
ctctggctttggtatttctttatatacattgtttaaaaattcaacttttgatatttctgc
aagatttctatcgtttgctgttgtagctgttatttttatagttatcttttttactgctac
ttgtttaccaagatttattactatatcactattttgaacatctgcatatgtttctaatgc
tgacctactatatgtagatgttgtagagttatcatctttactgatattaccctcttcttt
tggagtatcttcatctgaattaggtttatccattgatgaattttctttatcattattttt
atcttgattggtattagagtttgcttcttgtttatcgctattttcctgttgtttatcatt
attttcatctttattatttgagttattatcagtctggtttatattttcatctttattatt
tacttcttcttgatttacttcttcttgttcgttatttacttcctcttgttgctcctcatc
ttttaagtttttcatatattctttgttttcataaggaatctgttgaacattaccatcttt
gtcagtaacctcaactattccttttgctggagcagtaccttctggagcttttatattgat
gacttccatattaagtgcttctgataaagctatatccattactgctggtttttcctcaga
tatttcatcattttttgaagatattgtaactccattattttctccactaaataaattttc
tacattaccattaatatctacatcactatttccttttaattcaaccttacttgtatctac
tataggattggtagatactatactttctaggctttttgcatcttcactttgtcctaaatt
tttctgtacataatctaagtcaacaatatctacctttccatctctatttaaatcaaattc
tcttttatttgaatctatattctctaaaaccttattataatcactcttatctactttacc
gtctccatttacatcacccattaagaacaattcataatttaaaggtttatttttattatc
tacacttgctctattgcttaataagactctttgtgaataacttgatatatcaatgtcttt
aatttctttgttcttaaatccatctccagagacttctacattgtattttccaacaggtaa
attattaaatacaatattataatatgatatattctcatctttattttttatttcacttct
acttgcagataatttttttatagtatattctatattatctgtcccaacatttactgttcc
tgaatctttttctccaagctttattattccactattgttactatcatcttttaatcgtaa
ctgcatattagtcatactttctgactcgctattttttattggcagtgaaaaatttaaatc
tacttcaagactcccccttaacttttctgtaactgatttttcaactgcccttagcttccc
ctctaatataggttctgcaaaaacgtttagtggtgcactacacatagatactgctagtac
acaagatattgcctttttcatgaaataacaatcctcccttaataaatatctaatttttca
tgaatttaaatactataagtttcagacaataaaaaaagacactcaaagagaatcttaatt
ataaaataaaaagactttactctttttagcaactggctgatatggctttaaaagctttaa
tccctatagttttgcgtcattagatttccctaattttgccatttaattttcactactttc
ttacccattttatactatatttaaactttttaatataatttttttagattaaattataaa
aaaataacatttatattaatttattaatataaatgctattttccattataatttaattat
ttatatagcttccttacaagcataattttgtgtatattttcttattctttatatcttcca
taaaattcatgtgtagcatatagattcttatctcctgttatagctataccaaatcccatt
atttcataccctttatgcaacatattagttccttcttctggatttgtcttccactcatta
aaaataaagtttcctatatcatctgcatctctatttgtatatacaggtttatctggaatt
ttatatttaattatattttcaccttgaactgctatatatccaggtttaatctcactccaa
tctaagtatttcaaaaaagtagaatatgaattttttccatttatcgtatgagataaagtc
ttcttatttgccattaaattagaccaatcatttgctagaccctctaatctgcttgctaca
gataacgctcttactccattctcttttctatactgctttgtaagagcatatactttaccc
tttattctctctttaaatgctctatcatttggattgtaatataaaccttgttgatttggt
gaagcttgatttatacattgcttgataacattctgatttatgcctcctagtacagtcaat
ttgtctgcaccacttaaaatactcttgttactgccattttcaactaaaactacaggagca
ttttttgctattgtagaggcagccaaagcgtctgttaattgtaagcctttacttagataa
aattctttactatttttataaaactcttgtataactatcttattagtttcaaatctatct
gtgccacccaatctaatagaatttgtgctcttaactaattcgtcgcttattatttcacta
gaaccaagcgcataactctttaagcctgtcgtgtcaaatcccacactatttccatctgta
agtattataggtactccatctctagcagctactggtgatgcacttatcgcatctgcttct
cctgtaaatccattggctataattactttatctattggcttaatttctttgattttttca
gctatttttatacttgtatcaaatctattttcaccaaatattctttgtacaaccttcttt
ttggatagtaactgattctcaacatttttacttattgttgattctgaacctattatatac
acagtctttgctttgtttaatctttccatagttgtgtttggaatctggttttgttttgtc
atcaaaataggcgcatttaaggctccagctaaaccacttgcacttagaccatctgctaag
ctattatctgagttgattagtattgctgtattgtagttttgcttatctgctatttttgct
gctgtctcatatctgtcattcccttttatttgctcaactgatgtcaacgcatttaccata
ggagtatttaccattactaaaaatagtgtaagtcctatagctaatatctttttactattc
ttcatattattttctacccccaatgtacttttcatattttttattagtactcatacttat
ttttaatcaaaagttacaattttgttaccatattttatatatgataccatagttatccat
acaactcaaacaatatacctaaagtttttattctctataaattcaaaacattataattta
ttttatttaattacgttataagttcaaaataatttatgttagtaatatgtttaatcatta
taagaagtatctttttataataatttttgcaatatgaatttctcaacattataatcaaaa
aataaaataaggtatctcaatctaattctaaatgagacaccttatttttattattttatc
ttgttatttgtatattttataatatctacactatgtcttacatattaacgcattgtataa
tcatatattatctaaataaacttttaatattaattcctatatcttattagttcttagtaa
ataagtttattttttctgctattttttcaatagcgtttttagctattccttcacctattt
gtactaacttagtagcattcttaagtcttaactcaactacttcttcttgtgatttagaaa
gttcttctgtagttaatactattggagcctttgaactagctgcaagtggtgctgctgtaa
gtgcatcaactaattgtccatttccacctacataaccatcttttgctacatatgctttag
ttgcacctgcatagtatttattgattactttagcattagtatcttttctattttctccag
ctaatctttcaactttattatttaaatctatatcaactaatttgtcttcaacttcttttg
atacagaattttctccacccactatttctaattcttttccttttaataatttttcagcat
ttgcatctaattcgttacctgtaactattattggagcaccaaattgagcagctctagctg
atatactcatagcatcagcttctccatttccacctactacaaaagcagtcttaaatgtat
cttttaattgttttgctatttctaaagaagtttcaaatctatcttctccagaaactctct
caactttacttacacctaatttagaaagtttttcttcagtttcttttgatactttagatt
ctccacctactatatatattttcttagaagatagattacttccaagtactcttaatattt
cagcttctatttctgatggtagtgaatcttttttagataataatattggtgcattttttt
gagaggcaagtggtgctgatgctaatccatcaactatagcatcttctccaactaaaatta
tagcttctgcttctccatctttaaatctctctttactaacttctactgctgttgtaaatc
ttgaatcaccagataaaacttctacttttaattcttttccatcttttacatcagttaata
ctttgtgtaagtctctaactaacttatggtttttacttgaaac