Block details
fasta C_difficile_CD00084_1A_020911.fasta
contig u00000crpx_c_020911
start 3119074
length 14741
strand +
type core
seq tgcctttttcttttctatatgaattaactaaatcatacatctcattagataccatagcct
taaactcataactattagagtcttttgtactcgcatttacaactaccttaacatttacac
taatctcactcttctgacctaaattatccactacacttatatttaaaacatatgttccag
ccttgttaatatcaacatttcctttaatatttgcctttaaatcatttccataataatcag
tagcaactatattcaacatactattatcaaacttatcccctacagaaatctctacatcat
tagcagtaattgtaggcattgtatttttatcagatgcagaactaatacattggtcaacaa
ccttcttatccattccacctaaagaagtaacttcatcagcacctctaagcacactcttat
cacttccatcattaacaagtactataggtttgtccttagccaacggagaaccagccacag
catcaactaacttatacccttgagaaacataaaacttctttgttcctttataaaagcgtt
gtataaccttcttattagtttcaaacctatccttaccagcaatcctaactgaattagtct
tactcacaagttcattactcattatctcctctgacccaagagaatagcactgaacgccat
caactttaaatggtatactctttccatcagtaagtatcacaggaactccatctctagcag
ctacagaagatacactcattgcatcagcctcacctgtgtatccatttacaagaaaaacct
tatcaccatcatttactggtttaatagctgaaatctccttagctataagatagctagtct
ttattctatcttccccaccaattcttttaacttcaatccctttattcttaagttgatttt
ctacagatttacctattgtatcctctgtacctataacataagcattcttaacatccttta
gtcttttttcaacatctgttggtatcttatctctttgcaccaacattataggagcttttg
caactccagataatccacttgcacttaatccatctactatagaattatcagtatttacta
atatgattgtatcatatatttgtttatctgctatcaatgcagaagtctcatatctatctt
tcccctgtatcttttctatgctcgaaagtgcattgatatttggtgctcctgccattatta
atgatattgtcaatcctattgataatactctcttatttaccttcatcaaactcctcctac
taatttttttatataattcagctaatcataaattacatcctcagtagtgattccctcaaa
atctataaactactaaaacaaaaaacacctaaaataccatagcctgtaaagcaataacaa
aacagattacaaaaagtactttagatgtgattttcattttataatatcagtaaattaaca
aaaaaacaagatttatggaattttttacaagctaccttcatttccatttaaaaactcctg
agtagcatgcacttgaccatcagataatatataaagcccaaatccagtactataaaactc
attactaagcatgtttgcattgtactctggagacttcttccacacctcaaatatagcctt
tgccaagtcttttgcatcttgtgtcgtttgaacgttcttagaatctatataaatatatgc
tatattttcctcacttctcattccaaattcagaaaatacttgtggagcattttttccatc
tatataatgtgcaaatacttttttatccatcatatacttagaccatgcatttgccatacc
ttctagcctactagacactagcaaaggctctttgcctttttcttttctataggaattgat
taagttatacatttcagtagataccatttttttaaattctgggctgttgtaatcatgaga
tttgtcatccaacacttttatttctactctttttcctgtgctttttccccattcgtctgt
agcttttaatgtcaatatgtatgtacctactctatttgtatctataaacccatcaacttc
tattggtaataccttccctgtgttatctttagctactatatttaacttgccagtgtcaaa
cttttcacccttatatacctctgtacttccaactgtaattgttgggggttgcccatttga
atttgaagcatttatacactgttgtattaccttctcatttatttcacctacagaggttat
attcttagctccttctaatacagttttatcgcttccatcatttactagtaccattggaga
gtttttagtaagtggtgcagctgctattgcatctactaattggtatccatctgatacata
gaatccatctgcactattaaaaaagtagtctattacgtttttgttagtttcaaatcggtc
agttccttctattcttactgagtttgtatttttaactagaggattactcattatctcctc
tgaacctatacaatatgattgaatattttttacatcaaaaggcacactctttccatctgt
aagtatgattggagctccatctctagtagctactgatgatacactcattgcatctgcttc
tccactatatgcattagttaatagtactttatccactttttttatagttgctatttcttt
agctattaaatagcttgtttttagtctatcttctccaccaattcttttgacttctatatt
tttagaatctagttctttttctactgatttacttatagtatcttctgtacctattatata
tgcttttttgatattttttagacatctatttgtgtctgctggtatcttattttgttgtgt
aaatagtattggagcttttgtagctcccgataatccacttgcacttaatccatctgcaag
tgatttttctgtatttactaaaattactgtttcataagtctgtttatcagctatctttgc
tgctgtttcatatctatctttaccgtatattttttctactactgatgatgcatttacact
tttgaagtttactaagattaatgatactgctagacctaatgataatatttttttgttcat
tttcatatccccctgatgatttttatattttatatttatattgtgattattttccattta
ttttctctttattttccatatattatagagtatatatgatatgaatatatctcgtctata
tattagtgttttattttattaaatttaaaaaattatttttaacttctttttaaacatatt
caaaattgaatttatatttatatatataaaagatatctgctttatttaaaattaaactta
atatagctcaaattattatacattttaacctcaatattattagattgttaagataatgaa
aataaaataagaatgcatttaaatatataactttatatctaaatacattcttattttcta
tttacttaatatttatttttcaattaaactcttaatcttgtctattacagatgaggctat
tcctccacctacttcaaacaactttgatgaatttttaccttttaatgacgattcttgtga
tttatctaacgtatttgtagcaagtataactggtgaattgtttttagctgctaatggtcc
aactgctaaagcatctataagtttatcttgatttgcaactacaactccatctagcttaga
ttgagagtagaatttatctattactttggcattcgtctcttgtctagtttgacctgccac
cctattgtttgatatatctttgtttgctatttttccaacttgttcaatagccttgttaga
tattttttctactccaccaataaaatatatatttgacaccttatttgatttaataaattg
ttcagcttcattatctacaccatctttttgtgtaagtactattggagttttttctttacc
agccagtgatgctattgataatgaatcagcttctccatttcctgctcctatatacaactt
gcttacattattcgtcttatctatttcttttgctatattaatagaagtttgatatcttgt
atctccacctattctttgtactgatatttttgaatttacagctttgatagcttcaacaac
tgaatttggcattgagttgtttccacctatcacaattacttttgatggatttagcctttt
caattcttctacagttttttgaggaagcttttcatttgatgataaaagaattggtgagtt
ttttacactagcaagtggtgtagctgtaagcccatccaccatacttttatcttctccatt
tactattacaactgtatctgattttgtccaaccactttgagatattttgatagctgtctc
aaatctatcagcaccttttaattttttgactgtgacattagatgtagaatcacttgaact
tcctcctccagagcttccaccactagatgagccgcctgaattacttcctccaccattatt
tccaccattgccattatctggtggtaattcatccggttttgataattcattttcaactat
gtattctaaactttttggaagtgtaacttcaacatatttgtttattgtagcttttcttcc
cttagttgttttttgtgctaatccaagttttaatattacatttgaaccactttcttgtgt
ttctttactaacaatagaatagtttatcctaatattgtttaataaatattcaagtgcttc
acttttctctaccttatacttttcagggtcatttttactagaaccagttccaccaattgg
ttttacttcactctcattaataagggtaaatattaatccttcatcagagcttatattttc
ataatccactgttttgttgttatatgttacaatttttaaagctggtttatcatttgttcc
ttttcctaaaactttatagtcagcatttgagttactgccagatttttttacagatattct
tcctatattcaatctatttccgtctagtaaatcttcatttgatgtaacatatatatctaa
tgtagttgtattacttgatttgttgtattctactctacaagtagcatttgcatttccact
ttttatctgagattttatattatcagaccaagtaatcttttctttctgctcattatctac
tacttcaacctcaccttgtacttttatactggcttgaaatgaatatactatgttttctac
tgagtccacagatatatctatagtatttactttctcatacgtttttgttccttgtaaaac
tggagctgcatatgcacatgtagcactaccagttacagctactgccatagttgatactgc
tatagttcttataaaagattttcttttactcattaacacccgtccttatctatcattaac
taagtggataaatttacttatccacctagcttttatatttaatttataaattaccctaaa
tttatggttacatttatatactttacttttaatatctactattttaaaactattctagta
cctaatcttattagatatacaatgttagtatttttacgtttttagagttccacctactat
ttatctctaacaatattaccctttactttattgcttacagttataaccttcttattactg
atatcaatagaatttcttgtagcttttctagctttactattactatcagtaagacttatt
gtctttaactcatcataattcttagctcctacaggtacatacattgtatcacttacaaat
ctttgacctactggagtatctccttgaaggtcattgtatctatatagttcagccttaacc
ttatcacttaaagaatcaaagttttcttttggcatatagtaaacccatgtacctttactg
atttcacctagttcacctttttctggaacttctgcaaataaaagtgcttctccagatata
gtcttattgtttttatctataagtagtggtaaattaaatgctggatttccactgtattca
cctgtaataactattgaacccgctggaatcttacctgtttcatcttcacttgtgctagag
tcatcactttgatatacataatcttctgctaattttccaattccattagtacgagtttcg
tctgcattatttattatgccaatttctatattatcacctggaggtcctattatatctaat
tctgcaacttctatattagacttattatttgagattagttttacatatctagcttggtat
gtccaaagtttaccatctttattaaatgtaactctagcttcattatcttggtcttttcct
ccaccaactaaatcttgtccatattcaaaagttccttgacttacatcttcccagttcttt
ttatcattacttacttgtatcttgtaattagttaaaggattgtatgttgtgctagtattc
tttctaaagttaaataatccttttaatgagaactttctagcttctgtctctggttttgta
tattttagtcctactataggtaatgtttctttcatgtctactattatatatggattttct
tctacatttatatcagggtctttttgagggtctttgttccactctgctttacttattatc
tttcctttatatgtagtacttgcatcattatcttttatattatcaatttcaggattttgt
aatggtccatgtgagtcattttcagttctaacatcaccgtcagaaacagtatttgttatg
aatgaccatgctgatttatttattttcccttcatctgataattttacagtaccaacttca
aattcttctgttggatttaggtgataatcatatgcaactaccttatatgtaaatgctctg
ttattaagaggagatatattatcagtaaatttagtcttgctatttccttttgcatccaca
aatccaactgttctgtattttacctgtgttccattttcaccatctaaataatttccatca
cttcttattatttcgtatcctagtatcttatctttatccttatctacatctaggtctata
gatattttattagatttaactagagaaccactttgtattccatcagaaaaactagcactt
actttagtatcttttgccatactagctatattttcatttaaaatctttcttctagcttca
tcatttacatattgtatctttcttgattctttttcgtagttcttgctatccattatactg
tttaattctggtgtaatttctactccccatgccttaaagtaatctcttaaatctttttca
acaacacttgatgccattgctactagcatttggtcttttggtaaactattaattgggtca
ctacttgaaagtgctctgtattttcttgaaatctttgcatagaatgtatcattacttaaa
tcagcatctgagttattctttaacattgaacccgtaaaatcatcatcataagctagatgt
aattgccataacattccaagcctttcaaatacattgcttggtatacctaagctatttgaa
gttacatgctcatatatcttatccattgttgaaccttcaagtcttgaatgtgtcttatca
tcaaaggtctgagcaagtaaagcaagtacattgttactagtttcgctatatgtcatcttt
ccaatatctgtaacatgtcctatctcatgacctattccccatccaaataagtttcctcct
gtagcttttccactatcatctatttggaaaggtactccattcataagccctggaactgaa
ccatattctactcctacatgtaatccagaagcatacataaatgctccaataaacattctt
tggtattttatgttcatacgagattttggagccatatcatttttagttaagttaaattca
ttatcatctacagttccattaccatctaaatcttgtgttttaaatactcctctttctgag
taaactaaatccattatttgttcccatgcaagcatactattatataatctatctacttgt
gtatttaaatcagaatttccttttgatatctcttgatatactgctgttgcaggaacattt
aatgttactttatcactttcaatatctgtagtgtttaacacaccagttttttctgaatat
ccatatgaattaccaacatttgttcctggataatatggttctccttttacagcatcttta
tatttagctaattcttctatatatgcttttatctttttcttagattcagaaactcccgca
ggactcttatcatttattgttccatttagattaagatgtggtatcttagtagctcctgct
acacgtacttttatatctcctccacttggagtatcttcagcgtatcttatgtataaactt
cctccacattctatatctaaactatgaagtttgcttaattgaattacattttttccagtg
ttaagatttatttctccactcttatatgcaccagattctccatagtactgtgtatatatc
aacttaggagtttttccacttttacttccaacatatactgtgatttcatctcctgctcta
gcagctactcctaatgcctgccagtcattttgcatacctaaattattggaatttacagta
tactgtccgtttttatctttatattttcctaatttatttatttcttgatttacagtagtt
acatcagtaagtgtggctctatcattatataagtcttgagctaattttaattctctctca
ataactgtcttatatggatgatattctccactagctttatctggagtatttaatctatct
tttaattcagttattttttcttgagttacatcttcttttaattcaacttgtaggccatcc
ataaatagatttcttacatcatcttctatactgtcatactcataaaacttaagttctgat
atattagacttatatgaataggatgaacaaacacttacttgtatcttggtagcagttatt
ggttcttttaatctaaccattacatacttattattatttacagggtctgtctttgtttca
aaaggaacatcccccagattgtgtaattgaccattttcatcccaatatcgtacctcaaag
tcatttattgtcttatcagaaacatcaaaacgaggtgtagccataaaagtatccatagta
taagatttatcaaaagttattattggtcctctattcgttccctcagctgcattatatgtt
gggaatgtccaatgtgttgtaaagtccccatctactacattgaatttatcaaatggattt
ttatcactatattcacttttgtcatatccatctggataaacaacatctacaatgtgattt
gttggtattccaaatccaccattttctttaggagtattaattaatctatagttaggtgtt
gttggtgcatccatgctttcagttgtacctatatatgttttagacattccactagttccc
aagtggttagtagctgtcattctgacttcatatgttgtattatccttaagaccttctatc
tttgaacttgtcccacgaataagcttatcattgtattttatccaagacccattagagcct
ttttctttatagtacaagtcaaaatctttagcttgtttatgatttttccagcttacatca
agagatttaaatttacctttaacatttataccttctggtggttctggttttgtgtctgga
acaacttgaaattctaatatactatctgggctaaattgtataggtttatagtttgaatct
acattttctggtactccgtctaagttttctggtgttgcatctttataaccactagaccaa
tctccatttaaagattgtatgctaactctatatagtccatatgcttctatatctctaact
tctattgtatttttactagtttgtaattttttagtagataatacttttcccttactatca
attttgtctagtataagttcgtatgctgatacatttacttcattattccaataaaaagat
actttttcatttccaacagcagtgctagtcgatattttatttattttaggtatgttcatc
tctggctttggtatttctttatatacattgtttaaaaattcaacttttgatatttctgca
agatttctatcgtttgctgttgtagctgttatttttatagttatcttttttactgctact
tgtttaccaagatttattactatatcactattttgaacatctgcatatgtttctaatgct
gacctactatatgtagatgttgtagagttatcatctttactgatattaccctcttctttt
ggagtatcttcatctgaattaggtttatccattgatgaattttctttatcattattttta
tcttgattggtattagagtttgcttcttgtttatcgctattttcctgttgtttatcatta
ttttcatctttattatttgagttattatcagtctggtttatattttcatctttattattt
acttcttcttgatttacttcttcttgttcgttatttacttcctcttgttgctcctcatct
tttaagtttttcatatattctttgttttcataaggaatctgttgaacattaccatctttg
tcagtaacctcaactattccttttgctggagcagtaccttctggagcttttatattgatg
acttccatattaagtgcttctgataaagctatatccattactgctggtttttcctcagat
atttcatcattttttgaagatattgtaactccattattttctccactaaataaattttct
acattaccattaatatctacatcactatttccttttaattcaaccttacttgtatctact
ataggattggtagatactatactttctaggctttttgcatcttcactttgtcctaaattt
ttctgtacataatctaagtcaacaatatctacctttccatctctatttaaatcaaattct
cttttatttgaatctatattctctaaaaccttattataatcactcttatctactttaccg
tctccatttacatcacccattaagaacaattcataatttaaaggtttatttttattatct
acacttgctctattgcttaataagactctttgtgaataacttgatatatcaatgtcttta
atttctttgttcttaaatccatctccagagacttctacattgtattttccaacaggtaaa
ttattaaatacaatattataatatgatatattctcatctttattttttatttcacttcta
cttgcagataatttttttatagtatattctatattatctgtcccaacatttactgttcct
gaatctttttctccaagctttattattccactattgttactatcatcttttaatcgtaac
tgcatattagtcatactttctgactcgctattttttattggcagtgaaaaatttaaatct
acttcaagactcccccttaacttttctgtaactgatttttcaactgcccttagcttcccc
tctaatataggttctgcaaaaacgtttagtggtgcactacacatagatactgctagtaca
caagatattgcctttttcatgaaataacaatcctcccttaataaatatctaatttttcat
gaatttaaatactataagtttcagacaataaaaaaagacactcaaagagaatcttaatta
taaaataaaaagactttactctttttagcaactggctgatatggctttaaaagctttaat
ccctatagttttgcgtcattagatttccctaattttgccatttaattttcactactttct
tacccattttatactatatttaaactttttaatataatttttttagattaaattataaaa
aaataacatttatattaatttattaatataaatgctattttccattataatttaattatt
tatatagcttccttacaagcataattttgtgtatattttcttattctttatatcttccat
aaaattcatgtgtagcatatagattcttatctcctgttatagctataccaaatcccatta
tttcataccctttatgcaacatattagttccttcttctggatttgtcttccactcattaa
aaataaagtttcctatatcatctgcatctctatttgtatatacaggtttatctggaattt
tatatttaattatattttcaccttgaactgctatatatccaggtttaatctcactccaat
ctaagtatttcaaaaaagtagaatatgaattttttccatttatcgtatgagataaagtct
tcttatttgccattaaattagaccaatcatttgctagaccctctaatctgcttgctacag
ataacgctcttactccattctcttttctatactgctttgtaagagcatatactttaccct
ttattctctctttaaatgctctatcatttggattgtaatataaaccttgttgatttggtg
aagcttgatttatacattgcttgataacattctgatttatgcctcctagtacagtcaatt
tgtctgcaccacttaaaatactcttgttactgccattttcaactaaaactacaggagcat
tttttgctattgtagaggcagccaaagcgtctgttaattgtaagcctttacttagataaa
attctttactatttttataaaactcttgtataactatcttattagtttcaaatctatctg
tgccacccaatctaatagaatttgtgctcttaactaattcgtcgcttattatttcactag
aaccaagcgcataactctttaagcctgtcgtgtcaaatcccacactatttccatctgtaa
gtattataggtactccatctctagcagctactggtgatgcacttatcgcatctgcttctc
ctgtaaatccattggctataattactttatctattggcttaatttctttgattttttcag
ctatttttatacttgtatcaaatctattttcaccaaatattctttgtacaaccttctttt
tggatagtaactgattctcaacatttttacttattgttgattctgaacctattatataca
cagtctttgctttgtttaatctttccatagttgtgtttggaatctggttttgttttgtca
tcaaaataggcgcatttaaggctccagctaaaccacttgcacttagaccatctgctaagc
tattatctgagttgattagtattgctgtattgtagttttgcttatctgctatttttgctg
ctgtctcatatctgtcattcccttttatttgctcaactgatgtcaacgcatttaccatag
gagtatttaccattactaaaaatagtgtaagtcctatagctaatatctttttactattct
tcatattattttctacccccaatgtacttttcatattttttattagtactcatacttatt
tttaatcaaaagttacaattttgttaccatattttatatatgataccatagttatccata
caactcaaacaatatacctaaagtttttattctctataaattcaaaacattataatttat
tttatttaattacgttataagttcaaaataatttatgttagtaatatgtttaatcattat
aagaagtatctttttataataatttttgcaatatgaatttctcaacattataatcaaaaa
ataaaataaggtatctcaatctaattctaaatgagacaccttatttttattattttatct
tgttatttgtatattttataatatctacactatgtcttacatattaacgcattgtataat
catatattatctaaataaacttttaatattaattcctatatcttattagttcttagtaaa
taagtttattttttctgctattttttcaatagcgtttttagctattccttcacctatttg
tactaacttagtagcattcttaagtcttaactcaactacttcttcttgtgatttagaaag
ttcttctgtagttaatactattggagcctttgaactagctgcaagtggtgctgctgtaag
tgcatcaactaattgtccatttccacctacataaccatcttttgctacatatgctttagt
tgcacctgcatagtatttattgattactttagcattagtatcttttctattttctccagc
taatctttcaactttattatttaaatctatatcaactaatttgtcttcaacttcttttga
tacagaattttctccacccactatttctaattcttttccttttaataatttttcagcatt
tgcatctaattcgttacctgtaactattattggagcaccaaattgagcagctctagctga
tatactcatagcatcagcttctccatttccacctactacaaaagcagtcttaaatgtatc
ttttaattgttttgctatttctaaagaagtttcaaatctatcttctccagaaactctctc
aactttacttacacctaatttagaaagtttttcttcagtttcttttgatactttagattc
tccacctactatatatattttcttagaagatagattacttccaagtactcttaatatttc
agcttctatttctgatggtagtgaatcttttttagataataatattggtgcatttttttg
agaggcaagtggtgctgatgctaatccatcaactatagcatcttctccaactaaaattat
agcttctgcttctccatctttaaatctctctttactaacttctactgctgttgtaaatct
tgaatcaccagataaaacttctacttttaattcttttccatcttttacatcagttaatac
tttgtgtaagtctctaactaacttatggtttttacttgaaac