Block details | |
---|---|
fasta | C_difficile_CD00084_1A_020911.fasta |
contig | u00000crpx_c_020911 |
start | 3119074 |
length | 14741 |
strand | + |
type | core |
seq | tgcctttttcttttctatatgaattaactaaatcatacatctcattagataccatagcct taaactcataactattagagtcttttgtactcgcatttacaactaccttaacatttacac taatctcactcttctgacctaaattatccactacacttatatttaaaacatatgttccag ccttgttaatatcaacatttcctttaatatttgcctttaaatcatttccataataatcag tagcaactatattcaacatactattatcaaacttatcccctacagaaatctctacatcat tagcagtaattgtaggcattgtatttttatcagatgcagaactaatacattggtcaacaa ccttcttatccattccacctaaagaagtaacttcatcagcacctctaagcacactcttat cacttccatcattaacaagtactataggtttgtccttagccaacggagaaccagccacag catcaactaacttatacccttgagaaacataaaacttctttgttcctttataaaagcgtt gtataaccttcttattagtttcaaacctatccttaccagcaatcctaactgaattagtct tactcacaagttcattactcattatctcctctgacccaagagaatagcactgaacgccat caactttaaatggtatactctttccatcagtaagtatcacaggaactccatctctagcag ctacagaagatacactcattgcatcagcctcacctgtgtatccatttacaagaaaaacct tatcaccatcatttactggtttaatagctgaaatctccttagctataagatagctagtct ttattctatcttccccaccaattcttttaacttcaatccctttattcttaagttgatttt ctacagatttacctattgtatcctctgtacctataacataagcattcttaacatccttta gtcttttttcaacatctgttggtatcttatctctttgcaccaacattataggagcttttg caactccagataatccacttgcacttaatccatctactatagaattatcagtatttacta atatgattgtatcatatatttgtttatctgctatcaatgcagaagtctcatatctatctt tcccctgtatcttttctatgctcgaaagtgcattgatatttggtgctcctgccattatta atgatattgtcaatcctattgataatactctcttatttaccttcatcaaactcctcctac taatttttttatataattcagctaatcataaattacatcctcagtagtgattccctcaaa atctataaactactaaaacaaaaaacacctaaaataccatagcctgtaaagcaataacaa aacagattacaaaaagtactttagatgtgattttcattttataatatcagtaaattaaca aaaaaacaagatttatggaattttttacaagctaccttcatttccatttaaaaactcctg agtagcatgcacttgaccatcagataatatataaagcccaaatccagtactataaaactc attactaagcatgtttgcattgtactctggagacttcttccacacctcaaatatagcctt tgccaagtcttttgcatcttgtgtcgtttgaacgttcttagaatctatataaatatatgc tatattttcctcacttctcattccaaattcagaaaatacttgtggagcattttttccatc tatataatgtgcaaatacttttttatccatcatatacttagaccatgcatttgccatacc ttctagcctactagacactagcaaaggctctttgcctttttcttttctataggaattgat taagttatacatttcagtagataccatttttttaaattctgggctgttgtaatcatgaga tttgtcatccaacacttttatttctactctttttcctgtgctttttccccattcgtctgt agcttttaatgtcaatatgtatgtacctactctatttgtatctataaacccatcaacttc tattggtaataccttccctgtgttatctttagctactatatttaacttgccagtgtcaaa cttttcacccttatatacctctgtacttccaactgtaattgttgggggttgcccatttga atttgaagcatttatacactgttgtattaccttctcatttatttcacctacagaggttat attcttagctccttctaatacagttttatcgcttccatcatttactagtaccattggaga gtttttagtaagtggtgcagctgctattgcatctactaattggtatccatctgatacata gaatccatctgcactattaaaaaagtagtctattacgtttttgttagtttcaaatcggtc agttccttctattcttactgagtttgtatttttaactagaggattactcattatctcctc tgaacctatacaatatgattgaatattttttacatcaaaaggcacactctttccatctgt aagtatgattggagctccatctctagtagctactgatgatacactcattgcatctgcttc tccactatatgcattagttaatagtactttatccactttttttatagttgctatttcttt agctattaaatagcttgtttttagtctatcttctccaccaattcttttgacttctatatt tttagaatctagttctttttctactgatttacttatagtatcttctgtacctattatata tgcttttttgatattttttagacatctatttgtgtctgctggtatcttattttgttgtgt aaatagtattggagcttttgtagctcccgataatccacttgcacttaatccatctgcaag tgatttttctgtatttactaaaattactgtttcataagtctgtttatcagctatctttgc tgctgtttcatatctatctttaccgtatattttttctactactgatgatgcatttacact tttgaagtttactaagattaatgatactgctagacctaatgataatatttttttgttcat tttcatatccccctgatgatttttatattttatatttatattgtgattattttccattta ttttctctttattttccatatattatagagtatatatgatatgaatatatctcgtctata tattagtgttttattttattaaatttaaaaaattatttttaacttctttttaaacatatt caaaattgaatttatatttatatatataaaagatatctgctttatttaaaattaaactta atatagctcaaattattatacattttaacctcaatattattagattgttaagataatgaa aataaaataagaatgcatttaaatatataactttatatctaaatacattcttattttcta tttacttaatatttatttttcaattaaactcttaatcttgtctattacagatgaggctat tcctccacctacttcaaacaactttgatgaatttttaccttttaatgacgattcttgtga tttatctaacgtatttgtagcaagtataactggtgaattgtttttagctgctaatggtcc aactgctaaagcatctataagtttatcttgatttgcaactacaactccatctagcttaga ttgagagtagaatttatctattactttggcattcgtctcttgtctagtttgacctgccac cctattgtttgatatatctttgtttgctatttttccaacttgttcaatagccttgttaga tattttttctactccaccaataaaatatatatttgacaccttatttgatttaataaattg ttcagcttcattatctacaccatctttttgtgtaagtactattggagttttttctttacc agccagtgatgctattgataatgaatcagcttctccatttcctgctcctatatacaactt gcttacattattcgtcttatctatttcttttgctatattaatagaagtttgatatcttgt atctccacctattctttgtactgatatttttgaatttacagctttgatagcttcaacaac tgaatttggcattgagttgtttccacctatcacaattacttttgatggatttagcctttt caattcttctacagttttttgaggaagcttttcatttgatgataaaagaattggtgagtt ttttacactagcaagtggtgtagctgtaagcccatccaccatacttttatcttctccatt tactattacaactgtatctgattttgtccaaccactttgagatattttgatagctgtctc aaatctatcagcaccttttaattttttgactgtgacattagatgtagaatcacttgaact tcctcctccagagcttccaccactagatgagccgcctgaattacttcctccaccattatt tccaccattgccattatctggtggtaattcatccggttttgataattcattttcaactat gtattctaaactttttggaagtgtaacttcaacatatttgtttattgtagcttttcttcc cttagttgttttttgtgctaatccaagttttaatattacatttgaaccactttcttgtgt ttctttactaacaatagaatagtttatcctaatattgtttaataaatattcaagtgcttc acttttctctaccttatacttttcagggtcatttttactagaaccagttccaccaattgg ttttacttcactctcattaataagggtaaatattaatccttcatcagagcttatattttc ataatccactgttttgttgttatatgttacaatttttaaagctggtttatcatttgttcc ttttcctaaaactttatagtcagcatttgagttactgccagatttttttacagatattct tcctatattcaatctatttccgtctagtaaatcttcatttgatgtaacatatatatctaa tgtagttgtattacttgatttgttgtattctactctacaagtagcatttgcatttccact ttttatctgagattttatattatcagaccaagtaatcttttctttctgctcattatctac tacttcaacctcaccttgtacttttatactggcttgaaatgaatatactatgttttctac tgagtccacagatatatctatagtatttactttctcatacgtttttgttccttgtaaaac tggagctgcatatgcacatgtagcactaccagttacagctactgccatagttgatactgc tatagttcttataaaagattttcttttactcattaacacccgtccttatctatcattaac taagtggataaatttacttatccacctagcttttatatttaatttataaattaccctaaa tttatggttacatttatatactttacttttaatatctactattttaaaactattctagta cctaatcttattagatatacaatgttagtatttttacgtttttagagttccacctactat ttatctctaacaatattaccctttactttattgcttacagttataaccttcttattactg atatcaatagaatttcttgtagcttttctagctttactattactatcagtaagacttatt gtctttaactcatcataattcttagctcctacaggtacatacattgtatcacttacaaat ctttgacctactggagtatctccttgaaggtcattgtatctatatagttcagccttaacc ttatcacttaaagaatcaaagttttcttttggcatatagtaaacccatgtacctttactg atttcacctagttcacctttttctggaacttctgcaaataaaagtgcttctccagatata gtcttattgtttttatctataagtagtggtaaattaaatgctggatttccactgtattca cctgtaataactattgaacccgctggaatcttacctgtttcatcttcacttgtgctagag tcatcactttgatatacataatcttctgctaattttccaattccattagtacgagtttcg tctgcattatttattatgccaatttctatattatcacctggaggtcctattatatctaat tctgcaacttctatattagacttattatttgagattagttttacatatctagcttggtat gtccaaagtttaccatctttattaaatgtaactctagcttcattatcttggtcttttcct ccaccaactaaatcttgtccatattcaaaagttccttgacttacatcttcccagttcttt ttatcattacttacttgtatcttgtaattagttaaaggattgtatgttgtgctagtattc tttctaaagttaaataatccttttaatgagaactttctagcttctgtctctggttttgta tattttagtcctactataggtaatgtttctttcatgtctactattatatatggattttct tctacatttatatcagggtctttttgagggtctttgttccactctgctttacttattatc tttcctttatatgtagtacttgcatcattatcttttatattatcaatttcaggattttgt aatggtccatgtgagtcattttcagttctaacatcaccgtcagaaacagtatttgttatg aatgaccatgctgatttatttattttcccttcatctgataattttacagtaccaacttca aattcttctgttggatttaggtgataatcatatgcaactaccttatatgtaaatgctctg ttattaagaggagatatattatcagtaaatttagtcttgctatttccttttgcatccaca aatccaactgttctgtattttacctgtgttccattttcaccatctaaataatttccatca cttcttattatttcgtatcctagtatcttatctttatccttatctacatctaggtctata gatattttattagatttaactagagaaccactttgtattccatcagaaaaactagcactt actttagtatcttttgccatactagctatattttcatttaaaatctttcttctagcttca tcatttacatattgtatctttcttgattctttttcgtagttcttgctatccattatactg tttaattctggtgtaatttctactccccatgccttaaagtaatctcttaaatctttttca acaacacttgatgccattgctactagcatttggtcttttggtaaactattaattgggtca ctacttgaaagtgctctgtattttcttgaaatctttgcatagaatgtatcattacttaaa tcagcatctgagttattctttaacattgaacccgtaaaatcatcatcataagctagatgt aattgccataacattccaagcctttcaaatacattgcttggtatacctaagctatttgaa gttacatgctcatatatcttatccattgttgaaccttcaagtcttgaatgtgtcttatca tcaaaggtctgagcaagtaaagcaagtacattgttactagtttcgctatatgtcatcttt ccaatatctgtaacatgtcctatctcatgacctattccccatccaaataagtttcctcct gtagcttttccactatcatctatttggaaaggtactccattcataagccctggaactgaa ccatattctactcctacatgtaatccagaagcatacataaatgctccaataaacattctt tggtattttatgttcatacgagattttggagccatatcatttttagttaagttaaattca ttatcatctacagttccattaccatctaaatcttgtgttttaaatactcctctttctgag taaactaaatccattatttgttcccatgcaagcatactattatataatctatctacttgt gtatttaaatcagaatttccttttgatatctcttgatatactgctgttgcaggaacattt aatgttactttatcactttcaatatctgtagtgtttaacacaccagttttttctgaatat ccatatgaattaccaacatttgttcctggataatatggttctccttttacagcatcttta tatttagctaattcttctatatatgcttttatctttttcttagattcagaaactcccgca ggactcttatcatttattgttccatttagattaagatgtggtatcttagtagctcctgct acacgtacttttatatctcctccacttggagtatcttcagcgtatcttatgtataaactt cctccacattctatatctaaactatgaagtttgcttaattgaattacattttttccagtg ttaagatttatttctccactcttatatgcaccagattctccatagtactgtgtatatatc aacttaggagtttttccacttttacttccaacatatactgtgatttcatctcctgctcta gcagctactcctaatgcctgccagtcattttgcatacctaaattattggaatttacagta tactgtccgtttttatctttatattttcctaatttatttatttcttgatttacagtagtt acatcagtaagtgtggctctatcattatataagtcttgagctaattttaattctctctca ataactgtcttatatggatgatattctccactagctttatctggagtatttaatctatct tttaattcagttattttttcttgagttacatcttcttttaattcaacttgtaggccatcc ataaatagatttcttacatcatcttctatactgtcatactcataaaacttaagttctgat atattagacttatatgaataggatgaacaaacacttacttgtatcttggtagcagttatt ggttcttttaatctaaccattacatacttattattatttacagggtctgtctttgtttca aaaggaacatcccccagattgtgtaattgaccattttcatcccaatatcgtacctcaaag tcatttattgtcttatcagaaacatcaaaacgaggtgtagccataaaagtatccatagta taagatttatcaaaagttattattggtcctctattcgttccctcagctgcattatatgtt gggaatgtccaatgtgttgtaaagtccccatctactacattgaatttatcaaatggattt ttatcactatattcacttttgtcatatccatctggataaacaacatctacaatgtgattt gttggtattccaaatccaccattttctttaggagtattaattaatctatagttaggtgtt gttggtgcatccatgctttcagttgtacctatatatgttttagacattccactagttccc aagtggttagtagctgtcattctgacttcatatgttgtattatccttaagaccttctatc tttgaacttgtcccacgaataagcttatcattgtattttatccaagacccattagagcct ttttctttatagtacaagtcaaaatctttagcttgtttatgatttttccagcttacatca agagatttaaatttacctttaacatttataccttctggtggttctggttttgtgtctgga acaacttgaaattctaatatactatctgggctaaattgtataggtttatagtttgaatct acattttctggtactccgtctaagttttctggtgttgcatctttataaccactagaccaa tctccatttaaagattgtatgctaactctatatagtccatatgcttctatatctctaact tctattgtatttttactagtttgtaattttttagtagataatacttttcccttactatca attttgtctagtataagttcgtatgctgatacatttacttcattattccaataaaaagat actttttcatttccaacagcagtgctagtcgatattttatttattttaggtatgttcatc tctggctttggtatttctttatatacattgtttaaaaattcaacttttgatatttctgca agatttctatcgtttgctgttgtagctgttatttttatagttatcttttttactgctact tgtttaccaagatttattactatatcactattttgaacatctgcatatgtttctaatgct gacctactatatgtagatgttgtagagttatcatctttactgatattaccctcttctttt ggagtatcttcatctgaattaggtttatccattgatgaattttctttatcattattttta tcttgattggtattagagtttgcttcttgtttatcgctattttcctgttgtttatcatta ttttcatctttattatttgagttattatcagtctggtttatattttcatctttattattt acttcttcttgatttacttcttcttgttcgttatttacttcctcttgttgctcctcatct tttaagtttttcatatattctttgttttcataaggaatctgttgaacattaccatctttg tcagtaacctcaactattccttttgctggagcagtaccttctggagcttttatattgatg acttccatattaagtgcttctgataaagctatatccattactgctggtttttcctcagat atttcatcattttttgaagatattgtaactccattattttctccactaaataaattttct acattaccattaatatctacatcactatttccttttaattcaaccttacttgtatctact ataggattggtagatactatactttctaggctttttgcatcttcactttgtcctaaattt ttctgtacataatctaagtcaacaatatctacctttccatctctatttaaatcaaattct cttttatttgaatctatattctctaaaaccttattataatcactcttatctactttaccg tctccatttacatcacccattaagaacaattcataatttaaaggtttatttttattatct acacttgctctattgcttaataagactctttgtgaataacttgatatatcaatgtcttta atttctttgttcttaaatccatctccagagacttctacattgtattttccaacaggtaaa ttattaaatacaatattataatatgatatattctcatctttattttttatttcacttcta cttgcagataatttttttatagtatattctatattatctgtcccaacatttactgttcct gaatctttttctccaagctttattattccactattgttactatcatcttttaatcgtaac tgcatattagtcatactttctgactcgctattttttattggcagtgaaaaatttaaatct acttcaagactcccccttaacttttctgtaactgatttttcaactgcccttagcttcccc tctaatataggttctgcaaaaacgtttagtggtgcactacacatagatactgctagtaca caagatattgcctttttcatgaaataacaatcctcccttaataaatatctaatttttcat gaatttaaatactataagtttcagacaataaaaaaagacactcaaagagaatcttaatta taaaataaaaagactttactctttttagcaactggctgatatggctttaaaagctttaat ccctatagttttgcgtcattagatttccctaattttgccatttaattttcactactttct tacccattttatactatatttaaactttttaatataatttttttagattaaattataaaa aaataacatttatattaatttattaatataaatgctattttccattataatttaattatt tatatagcttccttacaagcataattttgtgtatattttcttattctttatatcttccat aaaattcatgtgtagcatatagattcttatctcctgttatagctataccaaatcccatta tttcataccctttatgcaacatattagttccttcttctggatttgtcttccactcattaa aaataaagtttcctatatcatctgcatctctatttgtatatacaggtttatctggaattt tatatttaattatattttcaccttgaactgctatatatccaggtttaatctcactccaat ctaagtatttcaaaaaagtagaatatgaattttttccatttatcgtatgagataaagtct tcttatttgccattaaattagaccaatcatttgctagaccctctaatctgcttgctacag ataacgctcttactccattctcttttctatactgctttgtaagagcatatactttaccct ttattctctctttaaatgctctatcatttggattgtaatataaaccttgttgatttggtg aagcttgatttatacattgcttgataacattctgatttatgcctcctagtacagtcaatt tgtctgcaccacttaaaatactcttgttactgccattttcaactaaaactacaggagcat tttttgctattgtagaggcagccaaagcgtctgttaattgtaagcctttacttagataaa attctttactatttttataaaactcttgtataactatcttattagtttcaaatctatctg tgccacccaatctaatagaatttgtgctcttaactaattcgtcgcttattatttcactag aaccaagcgcataactctttaagcctgtcgtgtcaaatcccacactatttccatctgtaa gtattataggtactccatctctagcagctactggtgatgcacttatcgcatctgcttctc ctgtaaatccattggctataattactttatctattggcttaatttctttgattttttcag ctatttttatacttgtatcaaatctattttcaccaaatattctttgtacaaccttctttt tggatagtaactgattctcaacatttttacttattgttgattctgaacctattatataca cagtctttgctttgtttaatctttccatagttgtgtttggaatctggttttgttttgtca tcaaaataggcgcatttaaggctccagctaaaccacttgcacttagaccatctgctaagc tattatctgagttgattagtattgctgtattgtagttttgcttatctgctatttttgctg ctgtctcatatctgtcattcccttttatttgctcaactgatgtcaacgcatttaccatag gagtatttaccattactaaaaatagtgtaagtcctatagctaatatctttttactattct tcatattattttctacccccaatgtacttttcatattttttattagtactcatacttatt tttaatcaaaagttacaattttgttaccatattttatatatgataccatagttatccata caactcaaacaatatacctaaagtttttattctctataaattcaaaacattataatttat tttatttaattacgttataagttcaaaataatttatgttagtaatatgtttaatcattat aagaagtatctttttataataatttttgcaatatgaatttctcaacattataatcaaaaa ataaaataaggtatctcaatctaattctaaatgagacaccttatttttattattttatct tgttatttgtatattttataatatctacactatgtcttacatattaacgcattgtataat catatattatctaaataaacttttaatattaattcctatatcttattagttcttagtaaa taagtttattttttctgctattttttcaatagcgtttttagctattccttcacctatttg tactaacttagtagcattcttaagtcttaactcaactacttcttcttgtgatttagaaag ttcttctgtagttaatactattggagcctttgaactagctgcaagtggtgctgctgtaag tgcatcaactaattgtccatttccacctacataaccatcttttgctacatatgctttagt tgcacctgcatagtatttattgattactttagcattagtatcttttctattttctccagc taatctttcaactttattatttaaatctatatcaactaatttgtcttcaacttcttttga tacagaattttctccacccactatttctaattcttttccttttaataatttttcagcatt tgcatctaattcgttacctgtaactattattggagcaccaaattgagcagctctagctga tatactcatagcatcagcttctccatttccacctactacaaaagcagtcttaaatgtatc ttttaattgttttgctatttctaaagaagtttcaaatctatcttctccagaaactctctc aactttacttacacctaatttagaaagtttttcttcagtttcttttgatactttagattc tccacctactatatatattttcttagaagatagattacttccaagtactcttaatatttc agcttctatttctgatggtagtgaatcttttttagataataatattggtgcatttttttg agaggcaagtggtgctgatgctaatccatcaactatagcatcttctccaactaaaattat agcttctgcttctccatctttaaatctctctttactaacttctactgctgttgtaaatct tgaatcaccagataaaacttctacttttaattcttttccatcttttacatcagttaatac tttgtgtaagtctctaactaacttatggtttttacttgaaac |