Block details
fasta C_difficile_CD00148_1A_020479.fasta
contig u00000crpx_c_020479
start 3051052
length 14708
strand +
type core
seq tatatgaatttaccaaattatacatttcactagaaaccattcttttaaactcactactat
tcatatcattagtcttatattcaagtacatttacttctacacttattgatgtagtctttc
caccaatatcagtagcttttatagtaactttgtatttacctaccttatcagtatcaatat
ttcctataagctctggtgtcaaatcgttaccattgctatcctttgctacgatattaagtt
tacttatatcaaacttatcaccttgataaatatttaaatttccaacagttattgttggtg
cacttgcatccagtgatgatgcacttaaacattgttctagcgtcttttcatctattcctc
ctagtgctgtaatcttatcagcacttctaagtacagacttatcactatttccgtcaacta
atacaataggtgcattttttgctatagaagaaccagcaactgcatctactaattgataac
ctttagaaagataaaattcttttgccgaactataaaaatgttttataacttttttattag
tctcaaatctatcttctccagctaatctaactgcattagtttttttaactaaatcattac
ttattatctcctctgaaccaagagcatagcattgcacaccttcttttttctcaaatggaa
catttttaccattagttaaaattataggtgctccatctcttgatgctactgatgacgcac
tcatagcatctgcttcacctgtataaccattagttataaaaaccttatctataggtttta
ttgaagctatttcttttgctataagataacttgtttcaattctatcattaccacctattc
ttttaacttctatccctttttgctttaattcattttcaactgattttcctattgaatctt
cagttcctattatataagccttctttacatcttttaacattttttctgtgtctgatggta
tactgtttctttgtgataataatataggtgctttaactgttcctgctaatccacttgcac
ttaatccatcagctagtgtattatctgtatttactaatactacattttcatatgtttgtt
tctgtgcaattttggcagctgtctcatatctatctttcccttgtatcttttctatacttg
aaagtgcattgatatttggtgctcctgccattattaatgatattgtcaatcctattgata
atactctcttatttaccttcatcgaactcctcctactaatttttttatataattcagcta
atcataaattacatcctcagtagtgattccctcaaaatctataaactactaaaacaaaaa
acacctaaaataccataacctgtaaatcaataacaaaacagattacaaaaagtactttag
atgtgattttcattttataatatcagtaaattaacaaaaaaacaagatttatggaatttt
ttacaacctaccttcattgccatttaaaaactcctgagtagcatgcacttgaccatcaga
taatatataaagcccaaatccagtactataaaactcattactaagcatgtttgcattgta
ctctggagatttcttccacacctcaaatatagcctttgccaagtcttttgcatcttgtgt
agtttgaacgttcttagaatctatataaatatatgctatattttcctcacttctcattcc
aaattcagaaaatacttgtggagcattttttccatctatataatgtgcaaatactttttt
atccatcatatacttagaccatgcatttgccataccttctagcctactagacactaccaa
aggctctttgcctttttcttttctataggaattgattaagttatacatttcagtagatac
catttttttaaattctgggctgttgtaatcatgagatttgtcatccaacacttttatttc
tactctttttcctgtgctttttccccattcgtctgtagcttttaatgtcaatatgtatgt
acctactctatttgtatctataaacccatcaacttctattggtaataccttccctgtgtt
atctttagctactatatttaacttgccagtgtcaaacttttcacccttatatacctctgt
acttccaactgtaattgttgggggttgtccatttgaatttgaagcatttatacactgttg
tattaccttctcatttatttcacctacagaggttatattcttagctccttctaatacagt
tttattgcttccatcatttactagtaccattggagagtttttagtaagtggtgcagctgc
tattgcatctactaattggtatccatctgatacatagaatccatctgcactattaaaaaa
gtagtctattacgtttttgttagtttcaaatcggtcagttccttctattcttactgagtt
tgtatttttaactagaggattactcattatctcctctgaacctatacaatatgattgaat
attttttacatcaaaaggcacactctttccatctgtaagtatgattggagctccatctct
agtagctactgatgatacactcattgcatctgcttctccactatatgcattagttaatag
tactttatcaactttttttatagttgctatttctttagctattaaatagcttgtttttag
tctatcttctccaccaattcttttgacttctatatttttagaatctagttctttttctac
tgatttacttatagtatcttctgtacctattatatatgcttttttgatattttttagaca
tctatttgtgtctgctggtatcttattttgttgtgtaaatagtattggagcttttgtagc
tcccgataatccacttgcacttaatccatctgcaagtgatttttctgtatttactaaaat
tactgtttcataagtctgtttatcagctatctttgctgctgtttcatatctatctttacc
gtatattttttctactactgatgatgcatttacacttttgaagtttactaagattaatga
tactgctagacctaatgataatatttttttgttcattttcatatccccctgatgattttt
atattttatatttatattgtgattattttccatttattttctctttattttccatatatt
atagagtatatatgatatgaatatatctcgtctatatattagtgttttattttattaaat
ttaaaaaattatttttaacttctttttaaacatattcaaaagtgaatttatatttatata
tataaaagatatctgctttatttaaaattaaacttaatatagctcaaattattatacatt
ttaacctcaatattattagattgttaagataatgaaaataaaataagaatgcatttaaat
atataactttatatctaaatacattcttattttctatttacttaatatttatttttcaat
taaactcttaatcttatctattacagatgaggctattcctccacctacttcaaacaactt
tgatgaatttttaccttttaatgacgattcttgtgatttatctaacgtatttgtagcaag
tataactggtgaattgtttttagctgctaatggtccaactgctaaagcgtctataagttt
gtcttgatttgcaactacaactccatctagtttagattgagagtagaatttatctattac
tttggcattcgtctcttgtctagtttgacctgccaccctattgtttgatatatctttgtt
tgctatttttccaacttgttcaatagccttgttagatattttttctactccaccaataaa
atatatatttgacaccttatttgatttaataaattgttcagcttcattatctacaccatc
tttttgtgtaagtactattggagttttttctttaccagccagtgatgctattgataatga
atcagcttctccatttcctgctcctatatacaacttgcttacattattcgtcttatctat
ttcttttgctatattaatagaagtttgatatcttgtatctccacctattctttgtactga
tatttttgaatttacagctttgatagcttcaacaactgaatttggcattgagttgtttcc
acctatcacaattacttttgatggatttagccttttcaattcttctacggttttttgagg
aagcttttcatttgatgataaaagaatcggtgagttttttacactagcaagtggtgtagc
tgtaagcccatccaccatacttttatcttctccatttactattacaactgtatctgattt
tgtccaaccactttgagatattttgatagctgtttcaaatctatcagtaccttttaattt
tttgactgtgacattagatgtagaatcacttgaatttcctcctccagagcttccaccact
agatgagccacctgaattacttcctccgccattatttccaccattgccattatctggtgg
taattcatctggttttgataattcattttcaactatgtattctaaactttttggaagtgt
aacttcaacatatttgtttattgtagcttttcttcccttagttgttttttgtgctaatcc
aagttttaatattacatttgaaccactttcttgtgtttctttactaacaatagaatagtt
tatcctaatattgtttaataaatattcaagtgcttcacttttctctaccttatacttttc
agggtcatttttactagaaccagttccaccaattggttttacttcactctcattaataag
ggtaaatattaatccttcatcagagcttatattttcataatccactgttttgttgttata
tgttacaatttttaaagctggtttatggtttgttccttttcctaaaactttatagtcagc
atttgagttactgccagatttttttacagatattcttcctatattcaatctatttccgtc
tagtaaatcttcatttgatgtaacatatatatctaatgtagttgtattacttgatttgtt
gtattctactctacaagtagcatttgcatttccactttttatctgagattttatattatc
agaccaagtaatcttttctttctgctcattatctactacttcaacctcaccttgtacttt
tatactggcttgaaatgaatatactatgttttctactgagtccacagatatatctatagt
atttactttctcatacgtttttgttccttgtaaaactggagctgcatatgcacatgtagc
actaccagttacagctactgccatagttgatactgctatagttcttataaaagattttct
tttactcattaacacccgtccttatctatcattaactaagtggataaatttacttatcca
cctagcttttatatttaatttataaattaccctaaatttatggttacatttatatacttt
acttttaatatctactattttaaaactattctagtacctaatcttattagatatacaatg
ttagtgttagtatttttacgtttttagagttccacctactatttatctctaacaatatta
ccctttactttattgcttacagttataaccttcttattactgatatcaatagaatttctt
gtagcttttctagctttactattactatcagtaagacttattgtctttaactcatcataa
ttcttagctcctacaggtacatacattgtatcacttacaaatctttgacctactggagta
tctccttgaaggtcattgtatctatatagttcagccttaaccttatcacttaaagaatca
aagttttcttttggcatatagtaaacccatgtacctttactgatttcacctagttcacct
ttttctggaacttctgcaaataaaagtgcttctccagatatagtcttattgtttttatct
ataagtagtggtaaattaaatgctggatttccactgtattcacccgtaataactattgaa
cctgctggaatcttacctgtttcatcttcacttgtgctagagtcatcactttgatataca
taatcttctgctaattttccaattccattagtacgagtttcgtctgcattattcattgtg
ccaatttctatattatcacctggaggtcctattatatctaattctgcaacttctatatta
gacttattatttgagattagttttacatatctagcttggtatgtccaaagtttaccatct
ttattaaatgtaactctagcttcattatcttggtcttttcctccaccaactaaatcctgt
ccatattcaaaagttccttgacttacatcttcccagttctttttatcattacttacttgt
attttgtaattagttaaaggattgtatgttgtgctagtattctttctaaagttaaataat
ccttttaatgagaactttctagtttctgcctctggttttgtatattttagtcctactata
ggtaatgtttctttcatgtctactattatatatggattttcttctacatttatatcaggg
tctttttgagggtctttgttccactctgctttacttattatctttcctttatatgtagta
cttgcatcattatcttttatattatcaatttcaggattttgtaatggtccatgtgagtca
ttttcagttctaacatcaccgtcagaaacagtatttgttatgaatgaccatactgattta
tttattttcccttcatctgataattttacagtaccaacttcaaattcttctgttggattt
aggtgataatcatatgcaactaccttatatgtaaatgctctgttattaagaggagatata
ttatcagtaaatttagtcttactatttccttttgcatccacaaatccaactgttctgtat
tttacctgtgttccattttcaccatctaaataatttccatcacttcttattatttcgtat
cctagtatcttatctttatccttatctacatctaggtctatagatattttattagattta
actagagaaccactttgtattccatcagaaaaactagcacttactttagtatcttttgcc
atactagctatattttcatttaaaatctttcttctagcttcgtcatttacatattgtatc
tttcttgattctttttcgtagttcttactatccattatactgtttaattctggtgtaatt
tctactccccatgccttaaagtaatctcttaaatctttttcaacaacacttgatgccatt
gctactagcatttggtcttttggtaaactattaattgggtcactacttgaaagtgctctg
tattttcttgaaatctttgcatagaatgtatcattacttaaatcagcatctgagttattc
tttaacattgaacccgtaaaatcatcatcataagctaaatgtaattgccataacattcca
agcctttcaaatacattgcttggtatacctaagctatttgaagttacatgctcatatatc
ttatccattgttgaaccttcaagtcttgaatgtgtcttatcatcaaaagtctgagcaagt
aaagcaagtacattgttactagtttcgctatatgtcatctttccaatatctgtaacatgt
cctatttcatgacctattccccatccaaataagtttcctcctgtagcttttccactatca
tctatttggaaaggtactccattcataagccctggaactgaaccatattctactcctaca
tgtaatccagaagcatacataaatgctccaataaacattctttggtattttatgttcata
cgagattttggagccatatcatttttagttaagttaaattcattatcatctacagttcca
ttaccatctaaatcttgtgttttaaatactcctctttctgagtaaactaaatccattatt
tgttcccatgcaagcatactattatataatctatctacttgtgtatttaaatcagcattt
ccttttgatatcccttgatatacagctgttgcaggaacatttaatgttactttatcactt
tcaatatctgtagtgtttaacacaccagttttttctgaatatccatatgaattaccaaca
tttgttcctggataatatggttccccttttacagcatctttatatttagctaattcttct
atatatgcttttatctttttcttagattcagaaactcccgcaggactcttatcatttatt
gttccatttagattaagatgtggtatcttagtagctcctgctacacgtacttttatatct
cctccacttggagtatcttcagcatatcttatgtataaacttcctccacattctatatct
aaactatgaagtttgcttaattgaattacattttttccagtgttaagatttatttctcca
ctcttatatgcaccagattctccatagtactgtgtatatatcaacttaggagtttttcca
cttttacttccaacatatactgtgatttcatctcctgctctagcagctactcctaatgcc
tgccagtcattttgcatacctaaattattggaatttacagtatactgtccgtttttatct
ttatattttcctaatttatttatttcttgatttacagtagttacatcagtaagtgtggct
ctatcattatataagtcttgagctaattttaattctctctcaataactgtcttatatgga
tgatattctccactagctttatctggagtatttaatctatcttttaattcagttattttt
tcttgagttacatcttcttttaattcaacttgtaggtcatccataaatagatttcttaca
tcatcttctatactgtcatactcataaaacttaagttctgatatattagacttatatgaa
taggatgaacaaacacttacttgtatcttggtagcagttattggttcttttaatctaacc
attacatacttattattatttacagggtctgtctttgtttcaaaaggaacatcccccaga
ttgtgtaattgaccattttcatcccaatatcgtacctcaaagtcatttattgtcttatca
gaaacatcaaaacgaggtgtagccataaaagtatccatagtataagatttatcaaaagtt
attattggtcctctattcgttccctcagctgcattatatgttgggaatgtccaatgtgtt
gtaaagtccccatctactacattgaatttatcaaatggatttttatcactatattcactt
ttgtcatatccatctggataaacaacatctacaatgtgatttgttggtattccaaatcca
ccattttctttaggagtattaattaatctatagttaggtgttgttggtgcatccatgctt
tcagttgtacctatatatgttttagacattccactagttcccaagtggttagtagctgtc
attctgacttcatatgttgtattatccttaagaccttctatctttgaacttgtcccacga
ataagcttatcattgtattttatccaagacccattagaacctttttctttatagtacaag
tcaaaatctttagcttgtttatgatttttccagcttacatcaagagatttaaatttacct
ttaacatttataccttctggtggttctggttttgtgtctggaacaacttgaaattctaat
atactatctgggctaaattgtataggtttatagtttgaatctacattttctggtactccg
tctaagttttctggtgttgcatctttataaccactagaccaatctccatttaaagattgt
atgctaactctatatagtccatatgcttctatatctctaacttctattgtatttttactg
gtttgtaattttttagtagataatacttttcccttactatcaattttgtctagtataagt
tcgtatgctgatacatttacttcattattccaataaaaagatactttttcatttccaaca
gcagtgctagtcaatattttatttattttaggtatattcatctctggctttggtatttct
ttatatacattgtttaaaaattcaacttttgatatttctgcaagatttctatcatttgct
gttgtagctgttatttttatagttatcttttttactgctacttgtttaccaagatttatt
actatatcactattttgaacatctgcatatgtttctaatgctgacctactatatgtagat
gttgtagagttatcatctttactgatattaccctcttcttttggagtatcttcatctgaa
ttaggtttatccattgatgaattttctttatcattatttttatcttgattggtattagag
tttgcttcttgtttatcgctattttcctgttgtttatcattattttcatctttattattt
gagttattatcagtctggtttatattttcatctttattatttacttcttcttgttcgtta
tttacttcctcttgttgctcctcatcttttaagtttttcatatattctttgttttcataa
ggaatctgttgaacattaccatctttgtcagtaacctcaactattccttttgctggagca
gtaccttctggagcttttatattgatgacttccatattaagtgcttctgataaagctata
tccattactgctggtttttcctcagatatttcatcattttttgaagatattgtaactcca
ttattttctccactaaataaattttctacattaccattaatatctacatcactatttcct
tttaattcaaccttacttgtatctactataggattggtagatactatactttctaggctt
tttgcatcttcactttgtcctaaatttttctgtacataatctaagtcaacaatatctacc
tttccatctctatttaaatcaaattctcttttatttgaatctatattctctaaaacctta
ttataatcactcttatctactttaccgtctccatttacatcacccattaagaataattca
taatttaaaggtttatttttattatctacacttgctctattgcttaataagactctttgt
gaataacttgatatatcaatgtctttaacttctttgttcttaaatccagctccagagact
tctacattgtattttccaacaggtaaattattaaatacaatattataatatgatacattc
tcatctttattttttatttcacttctacttgcagataatttttttatagtatattctata
ttatctgtcccaacatttactgttcctgaatctttttctccaagctttattattccacta
ttgttactatcatcttttaatcgtaactgcatattagtcatactttctgactcgctattt
tttattggcagtgaaaaatttaaatctacttcaagactcccccttaacttttctgtaact
gatttttcaactgcccttagcttcccctctaatataggttctgcaaaaacgtttagtggt
gcactacacatagatactgctagtacacaagatattgcctttttcatgaaataacaatcc
tcccttaataaatatctaatttttcatgaatttaaatactataagtttcagacaataaaa
aaagacactcaaagagaatcttaattataaaataaaaagactttactctttttagcaact
ggctgatatggctttaaaagctttaatccctatagttttgcgtcattagatttccctaat
tttgccatttaattttcaatactttcttacccattttatactatatttaaactttttaat
acaatttttttacattaaattataaaaaaataacatttatattaatttattaatataaat
gttattttccattataatttaattatttatatagcttccttacaagcataattttgtgta
tattttcttattctttatatcttccataaaattcatgtgtagcatatagattcttatctc
ctgttatagctataccaaatcccattatttcataccctttatgcaacatattagtgcctt
cttctggatttgtcttccactcattaaaaataaagtttcctatatcatctgcatctctat
ttgtatatacaggtttatctggaattttatatttaattatattttcaccttgaactgcta
tatatccaggtttaatctcactccaatctaagtatttcaaaaaagtagaatatgaatttt
ttccatttatcgtatgagataaagtcttcttatttgccattaaattagaccaatcatttg
ctagaccctctaatctgcttgctacagataacgctcttactccattctcttttctatact
gctttgtaagagcatatactttaccctttattctctctttaaatgctctatcatttggat
tgtaatataaaccttgttgatttggtgaagcttgatttatacattgcttgataacattct
gatttatgcctcctagtacagtcaatttgtctgcaccacttaaaatactcttgttactgc
cattttcaactaaaactacaggagcattttttgctattgtagaggcagccaaagcgtctg
ttaattgtaagcctttacttagataaaattctttactatttttataaaactcttgtataa
ctatcttattagtttcaaatctatctgtgccacccaatctaatagaatttgtgctcttaa
ctaattcgtcgctgattatttcactagaaccaagcgcataactctttaagcctgtcgtgt
caaatcccacactatttccatctgtaagtattataggtactccatctctagcagctactg
gtgatgcacttatcgcatctgcttctcctgtaaatccattggctataattactttatcta
ttggcttaatttctttgattttttcagctatttttatacttgtatcaaatctattttcac
caaatattctttgtacaaccttctttttggatagtaactgattctcaacatttttactta
ttgttgattctgagcctattatatacacagtctttgctttgtttaatctttccatagttg
tgtttggaatctggttttgttttgtcatcaaaataggcgcatttaaggctccagctaaac
cacttgcacttagaccatctgctaagctattatctgagttgattagtattgctgtattgt
agttttgcttatctgctatttttgctgctgtctcatatctgtcattcccttttatttgct
caactgatgtcaacgcatttaccataggagtatttaccattactaaaaatagtgtaagtc
ctatagctaatatctttttactattcttcatattattttctacccccaatgtacttttca
tattttttattagtactcatacttatttttaatcaaaagttacaattttgttaccatatt
ttatatatgataccatagttatccatacaactcaaacaatatacctaaagtttttattct
ctataaattcaaaacattataatttattttatttaattaagttataagttcaaaataatt
tacgttaataagatgtttaatcattataagaagtatctttttataataatttttgcaata
tgaatttctcaacattataatcaaaaaataaaataaggtatctcaatctaattctaaatg
agacaccttatttttattattttatcttgttatttgtatattttataatatctacactat
gtcttacatattaacgcattgtataatcatatattatctaaataaacttttaatattaat
tcctatatcttattagttcttagtaaataagtttattttttctgctattttttcaatagc
gtttttagctattccttcacctatttgtactaacttagtagcattcttaagtcttaactc
aactacttcttcttgtgatttagaaagttcttctgtagttaatactattggagcctttga
actagctgcaagtggtgctgctgtaagtgcatcaactaattgtccatttccacctacata
accatcttttgctacatatgctttagttgcacctgcatagtatttattgattactttagc
attagtatcttttctattttctccagctaatctttcaactttattatttaaatctatatc
aactaatttgtcttcaacttcttttgacacagaattttctccacccactatttctaattc
ttttccttttaataatttttcagcatttgcatctaattcgttacctgtaactattattgg
agcaccaaattgagcagctctagctgatatactcatagcatcagcttctccatttccacc
tactacaaaagcagtcttaaatgtatcttttaattgttttgctatttctaaagaagtttc
aaatctatcttctccagaaactctctcaactttacttacacctaatttagaaagtttttc
ttcagtttcttttgatactttagattctccacctactatatatattttcttagaagatag
attacttccaagtactcttaatatttcagcttctatttctgatggtagtgaatctttttt
agataataatattggtgcatttttttgagaggcaagtggtgctgatgctaatccatcaac
tatagcatcttctccaactaaaattatagcttctgcttctccatctttgaatctctcttt
actaacttctactgctgttgtaaatcttgaatcaccagataaaacttctacttttaattc
ttttccatcttttacattagttaatactttgtgtaagtctctaactaacttatggttttt
acttgaaac