Block details | |
---|---|
fasta | C_difficile_CD00148_1A_020479.fasta |
contig | u00000crpx_c_020479 |
start | 3051052 |
length | 14708 |
strand | + |
type | core |
seq | tatatgaatttaccaaattatacatttcactagaaaccattcttttaaactcactactat tcatatcattagtcttatattcaagtacatttacttctacacttattgatgtagtctttc caccaatatcagtagcttttatagtaactttgtatttacctaccttatcagtatcaatat ttcctataagctctggtgtcaaatcgttaccattgctatcctttgctacgatattaagtt tacttatatcaaacttatcaccttgataaatatttaaatttccaacagttattgttggtg cacttgcatccagtgatgatgcacttaaacattgttctagcgtcttttcatctattcctc ctagtgctgtaatcttatcagcacttctaagtacagacttatcactatttccgtcaacta atacaataggtgcattttttgctatagaagaaccagcaactgcatctactaattgataac ctttagaaagataaaattcttttgccgaactataaaaatgttttataacttttttattag tctcaaatctatcttctccagctaatctaactgcattagtttttttaactaaatcattac ttattatctcctctgaaccaagagcatagcattgcacaccttcttttttctcaaatggaa catttttaccattagttaaaattataggtgctccatctcttgatgctactgatgacgcac tcatagcatctgcttcacctgtataaccattagttataaaaaccttatctataggtttta ttgaagctatttcttttgctataagataacttgtttcaattctatcattaccacctattc ttttaacttctatccctttttgctttaattcattttcaactgattttcctattgaatctt cagttcctattatataagccttctttacatcttttaacattttttctgtgtctgatggta tactgtttctttgtgataataatataggtgctttaactgttcctgctaatccacttgcac ttaatccatcagctagtgtattatctgtatttactaatactacattttcatatgtttgtt tctgtgcaattttggcagctgtctcatatctatctttcccttgtatcttttctatacttg aaagtgcattgatatttggtgctcctgccattattaatgatattgtcaatcctattgata atactctcttatttaccttcatcgaactcctcctactaatttttttatataattcagcta atcataaattacatcctcagtagtgattccctcaaaatctataaactactaaaacaaaaa acacctaaaataccataacctgtaaatcaataacaaaacagattacaaaaagtactttag atgtgattttcattttataatatcagtaaattaacaaaaaaacaagatttatggaatttt ttacaacctaccttcattgccatttaaaaactcctgagtagcatgcacttgaccatcaga taatatataaagcccaaatccagtactataaaactcattactaagcatgtttgcattgta ctctggagatttcttccacacctcaaatatagcctttgccaagtcttttgcatcttgtgt agtttgaacgttcttagaatctatataaatatatgctatattttcctcacttctcattcc aaattcagaaaatacttgtggagcattttttccatctatataatgtgcaaatactttttt atccatcatatacttagaccatgcatttgccataccttctagcctactagacactaccaa aggctctttgcctttttcttttctataggaattgattaagttatacatttcagtagatac catttttttaaattctgggctgttgtaatcatgagatttgtcatccaacacttttatttc tactctttttcctgtgctttttccccattcgtctgtagcttttaatgtcaatatgtatgt acctactctatttgtatctataaacccatcaacttctattggtaataccttccctgtgtt atctttagctactatatttaacttgccagtgtcaaacttttcacccttatatacctctgt acttccaactgtaattgttgggggttgtccatttgaatttgaagcatttatacactgttg tattaccttctcatttatttcacctacagaggttatattcttagctccttctaatacagt tttattgcttccatcatttactagtaccattggagagtttttagtaagtggtgcagctgc tattgcatctactaattggtatccatctgatacatagaatccatctgcactattaaaaaa gtagtctattacgtttttgttagtttcaaatcggtcagttccttctattcttactgagtt tgtatttttaactagaggattactcattatctcctctgaacctatacaatatgattgaat attttttacatcaaaaggcacactctttccatctgtaagtatgattggagctccatctct agtagctactgatgatacactcattgcatctgcttctccactatatgcattagttaatag tactttatcaactttttttatagttgctatttctttagctattaaatagcttgtttttag tctatcttctccaccaattcttttgacttctatatttttagaatctagttctttttctac tgatttacttatagtatcttctgtacctattatatatgcttttttgatattttttagaca tctatttgtgtctgctggtatcttattttgttgtgtaaatagtattggagcttttgtagc tcccgataatccacttgcacttaatccatctgcaagtgatttttctgtatttactaaaat tactgtttcataagtctgtttatcagctatctttgctgctgtttcatatctatctttacc gtatattttttctactactgatgatgcatttacacttttgaagtttactaagattaatga tactgctagacctaatgataatatttttttgttcattttcatatccccctgatgattttt atattttatatttatattgtgattattttccatttattttctctttattttccatatatt atagagtatatatgatatgaatatatctcgtctatatattagtgttttattttattaaat ttaaaaaattatttttaacttctttttaaacatattcaaaagtgaatttatatttatata tataaaagatatctgctttatttaaaattaaacttaatatagctcaaattattatacatt ttaacctcaatattattagattgttaagataatgaaaataaaataagaatgcatttaaat atataactttatatctaaatacattcttattttctatttacttaatatttatttttcaat taaactcttaatcttatctattacagatgaggctattcctccacctacttcaaacaactt tgatgaatttttaccttttaatgacgattcttgtgatttatctaacgtatttgtagcaag tataactggtgaattgtttttagctgctaatggtccaactgctaaagcgtctataagttt gtcttgatttgcaactacaactccatctagtttagattgagagtagaatttatctattac tttggcattcgtctcttgtctagtttgacctgccaccctattgtttgatatatctttgtt tgctatttttccaacttgttcaatagccttgttagatattttttctactccaccaataaa atatatatttgacaccttatttgatttaataaattgttcagcttcattatctacaccatc tttttgtgtaagtactattggagttttttctttaccagccagtgatgctattgataatga atcagcttctccatttcctgctcctatatacaacttgcttacattattcgtcttatctat ttcttttgctatattaatagaagtttgatatcttgtatctccacctattctttgtactga tatttttgaatttacagctttgatagcttcaacaactgaatttggcattgagttgtttcc acctatcacaattacttttgatggatttagccttttcaattcttctacggttttttgagg aagcttttcatttgatgataaaagaatcggtgagttttttacactagcaagtggtgtagc tgtaagcccatccaccatacttttatcttctccatttactattacaactgtatctgattt tgtccaaccactttgagatattttgatagctgtttcaaatctatcagtaccttttaattt tttgactgtgacattagatgtagaatcacttgaatttcctcctccagagcttccaccact agatgagccacctgaattacttcctccgccattatttccaccattgccattatctggtgg taattcatctggttttgataattcattttcaactatgtattctaaactttttggaagtgt aacttcaacatatttgtttattgtagcttttcttcccttagttgttttttgtgctaatcc aagttttaatattacatttgaaccactttcttgtgtttctttactaacaatagaatagtt tatcctaatattgtttaataaatattcaagtgcttcacttttctctaccttatacttttc agggtcatttttactagaaccagttccaccaattggttttacttcactctcattaataag ggtaaatattaatccttcatcagagcttatattttcataatccactgttttgttgttata tgttacaatttttaaagctggtttatggtttgttccttttcctaaaactttatagtcagc atttgagttactgccagatttttttacagatattcttcctatattcaatctatttccgtc tagtaaatcttcatttgatgtaacatatatatctaatgtagttgtattacttgatttgtt gtattctactctacaagtagcatttgcatttccactttttatctgagattttatattatc agaccaagtaatcttttctttctgctcattatctactacttcaacctcaccttgtacttt tatactggcttgaaatgaatatactatgttttctactgagtccacagatatatctatagt atttactttctcatacgtttttgttccttgtaaaactggagctgcatatgcacatgtagc actaccagttacagctactgccatagttgatactgctatagttcttataaaagattttct tttactcattaacacccgtccttatctatcattaactaagtggataaatttacttatcca cctagcttttatatttaatttataaattaccctaaatttatggttacatttatatacttt acttttaatatctactattttaaaactattctagtacctaatcttattagatatacaatg ttagtgttagtatttttacgtttttagagttccacctactatttatctctaacaatatta ccctttactttattgcttacagttataaccttcttattactgatatcaatagaatttctt gtagcttttctagctttactattactatcagtaagacttattgtctttaactcatcataa ttcttagctcctacaggtacatacattgtatcacttacaaatctttgacctactggagta tctccttgaaggtcattgtatctatatagttcagccttaaccttatcacttaaagaatca aagttttcttttggcatatagtaaacccatgtacctttactgatttcacctagttcacct ttttctggaacttctgcaaataaaagtgcttctccagatatagtcttattgtttttatct ataagtagtggtaaattaaatgctggatttccactgtattcacccgtaataactattgaa cctgctggaatcttacctgtttcatcttcacttgtgctagagtcatcactttgatataca taatcttctgctaattttccaattccattagtacgagtttcgtctgcattattcattgtg ccaatttctatattatcacctggaggtcctattatatctaattctgcaacttctatatta gacttattatttgagattagttttacatatctagcttggtatgtccaaagtttaccatct ttattaaatgtaactctagcttcattatcttggtcttttcctccaccaactaaatcctgt ccatattcaaaagttccttgacttacatcttcccagttctttttatcattacttacttgt attttgtaattagttaaaggattgtatgttgtgctagtattctttctaaagttaaataat ccttttaatgagaactttctagtttctgcctctggttttgtatattttagtcctactata ggtaatgtttctttcatgtctactattatatatggattttcttctacatttatatcaggg tctttttgagggtctttgttccactctgctttacttattatctttcctttatatgtagta cttgcatcattatcttttatattatcaatttcaggattttgtaatggtccatgtgagtca ttttcagttctaacatcaccgtcagaaacagtatttgttatgaatgaccatactgattta tttattttcccttcatctgataattttacagtaccaacttcaaattcttctgttggattt aggtgataatcatatgcaactaccttatatgtaaatgctctgttattaagaggagatata ttatcagtaaatttagtcttactatttccttttgcatccacaaatccaactgttctgtat tttacctgtgttccattttcaccatctaaataatttccatcacttcttattatttcgtat cctagtatcttatctttatccttatctacatctaggtctatagatattttattagattta actagagaaccactttgtattccatcagaaaaactagcacttactttagtatcttttgcc atactagctatattttcatttaaaatctttcttctagcttcgtcatttacatattgtatc tttcttgattctttttcgtagttcttactatccattatactgtttaattctggtgtaatt tctactccccatgccttaaagtaatctcttaaatctttttcaacaacacttgatgccatt gctactagcatttggtcttttggtaaactattaattgggtcactacttgaaagtgctctg tattttcttgaaatctttgcatagaatgtatcattacttaaatcagcatctgagttattc tttaacattgaacccgtaaaatcatcatcataagctaaatgtaattgccataacattcca agcctttcaaatacattgcttggtatacctaagctatttgaagttacatgctcatatatc ttatccattgttgaaccttcaagtcttgaatgtgtcttatcatcaaaagtctgagcaagt aaagcaagtacattgttactagtttcgctatatgtcatctttccaatatctgtaacatgt cctatttcatgacctattccccatccaaataagtttcctcctgtagcttttccactatca tctatttggaaaggtactccattcataagccctggaactgaaccatattctactcctaca tgtaatccagaagcatacataaatgctccaataaacattctttggtattttatgttcata cgagattttggagccatatcatttttagttaagttaaattcattatcatctacagttcca ttaccatctaaatcttgtgttttaaatactcctctttctgagtaaactaaatccattatt tgttcccatgcaagcatactattatataatctatctacttgtgtatttaaatcagcattt ccttttgatatcccttgatatacagctgttgcaggaacatttaatgttactttatcactt tcaatatctgtagtgtttaacacaccagttttttctgaatatccatatgaattaccaaca tttgttcctggataatatggttccccttttacagcatctttatatttagctaattcttct atatatgcttttatctttttcttagattcagaaactcccgcaggactcttatcatttatt gttccatttagattaagatgtggtatcttagtagctcctgctacacgtacttttatatct cctccacttggagtatcttcagcatatcttatgtataaacttcctccacattctatatct aaactatgaagtttgcttaattgaattacattttttccagtgttaagatttatttctcca ctcttatatgcaccagattctccatagtactgtgtatatatcaacttaggagtttttcca cttttacttccaacatatactgtgatttcatctcctgctctagcagctactcctaatgcc tgccagtcattttgcatacctaaattattggaatttacagtatactgtccgtttttatct ttatattttcctaatttatttatttcttgatttacagtagttacatcagtaagtgtggct ctatcattatataagtcttgagctaattttaattctctctcaataactgtcttatatgga tgatattctccactagctttatctggagtatttaatctatcttttaattcagttattttt tcttgagttacatcttcttttaattcaacttgtaggtcatccataaatagatttcttaca tcatcttctatactgtcatactcataaaacttaagttctgatatattagacttatatgaa taggatgaacaaacacttacttgtatcttggtagcagttattggttcttttaatctaacc attacatacttattattatttacagggtctgtctttgtttcaaaaggaacatcccccaga ttgtgtaattgaccattttcatcccaatatcgtacctcaaagtcatttattgtcttatca gaaacatcaaaacgaggtgtagccataaaagtatccatagtataagatttatcaaaagtt attattggtcctctattcgttccctcagctgcattatatgttgggaatgtccaatgtgtt gtaaagtccccatctactacattgaatttatcaaatggatttttatcactatattcactt ttgtcatatccatctggataaacaacatctacaatgtgatttgttggtattccaaatcca ccattttctttaggagtattaattaatctatagttaggtgttgttggtgcatccatgctt tcagttgtacctatatatgttttagacattccactagttcccaagtggttagtagctgtc attctgacttcatatgttgtattatccttaagaccttctatctttgaacttgtcccacga ataagcttatcattgtattttatccaagacccattagaacctttttctttatagtacaag tcaaaatctttagcttgtttatgatttttccagcttacatcaagagatttaaatttacct ttaacatttataccttctggtggttctggttttgtgtctggaacaacttgaaattctaat atactatctgggctaaattgtataggtttatagtttgaatctacattttctggtactccg tctaagttttctggtgttgcatctttataaccactagaccaatctccatttaaagattgt atgctaactctatatagtccatatgcttctatatctctaacttctattgtatttttactg gtttgtaattttttagtagataatacttttcccttactatcaattttgtctagtataagt tcgtatgctgatacatttacttcattattccaataaaaagatactttttcatttccaaca gcagtgctagtcaatattttatttattttaggtatattcatctctggctttggtatttct ttatatacattgtttaaaaattcaacttttgatatttctgcaagatttctatcatttgct gttgtagctgttatttttatagttatcttttttactgctacttgtttaccaagatttatt actatatcactattttgaacatctgcatatgtttctaatgctgacctactatatgtagat gttgtagagttatcatctttactgatattaccctcttcttttggagtatcttcatctgaa ttaggtttatccattgatgaattttctttatcattatttttatcttgattggtattagag tttgcttcttgtttatcgctattttcctgttgtttatcattattttcatctttattattt gagttattatcagtctggtttatattttcatctttattatttacttcttcttgttcgtta tttacttcctcttgttgctcctcatcttttaagtttttcatatattctttgttttcataa ggaatctgttgaacattaccatctttgtcagtaacctcaactattccttttgctggagca gtaccttctggagcttttatattgatgacttccatattaagtgcttctgataaagctata tccattactgctggtttttcctcagatatttcatcattttttgaagatattgtaactcca ttattttctccactaaataaattttctacattaccattaatatctacatcactatttcct tttaattcaaccttacttgtatctactataggattggtagatactatactttctaggctt tttgcatcttcactttgtcctaaatttttctgtacataatctaagtcaacaatatctacc tttccatctctatttaaatcaaattctcttttatttgaatctatattctctaaaacctta ttataatcactcttatctactttaccgtctccatttacatcacccattaagaataattca taatttaaaggtttatttttattatctacacttgctctattgcttaataagactctttgt gaataacttgatatatcaatgtctttaacttctttgttcttaaatccagctccagagact tctacattgtattttccaacaggtaaattattaaatacaatattataatatgatacattc tcatctttattttttatttcacttctacttgcagataatttttttatagtatattctata ttatctgtcccaacatttactgttcctgaatctttttctccaagctttattattccacta ttgttactatcatcttttaatcgtaactgcatattagtcatactttctgactcgctattt tttattggcagtgaaaaatttaaatctacttcaagactcccccttaacttttctgtaact gatttttcaactgcccttagcttcccctctaatataggttctgcaaaaacgtttagtggt gcactacacatagatactgctagtacacaagatattgcctttttcatgaaataacaatcc tcccttaataaatatctaatttttcatgaatttaaatactataagtttcagacaataaaa aaagacactcaaagagaatcttaattataaaataaaaagactttactctttttagcaact ggctgatatggctttaaaagctttaatccctatagttttgcgtcattagatttccctaat tttgccatttaattttcaatactttcttacccattttatactatatttaaactttttaat acaatttttttacattaaattataaaaaaataacatttatattaatttattaatataaat gttattttccattataatttaattatttatatagcttccttacaagcataattttgtgta tattttcttattctttatatcttccataaaattcatgtgtagcatatagattcttatctc ctgttatagctataccaaatcccattatttcataccctttatgcaacatattagtgcctt cttctggatttgtcttccactcattaaaaataaagtttcctatatcatctgcatctctat ttgtatatacaggtttatctggaattttatatttaattatattttcaccttgaactgcta tatatccaggtttaatctcactccaatctaagtatttcaaaaaagtagaatatgaatttt ttccatttatcgtatgagataaagtcttcttatttgccattaaattagaccaatcatttg ctagaccctctaatctgcttgctacagataacgctcttactccattctcttttctatact gctttgtaagagcatatactttaccctttattctctctttaaatgctctatcatttggat tgtaatataaaccttgttgatttggtgaagcttgatttatacattgcttgataacattct gatttatgcctcctagtacagtcaatttgtctgcaccacttaaaatactcttgttactgc cattttcaactaaaactacaggagcattttttgctattgtagaggcagccaaagcgtctg ttaattgtaagcctttacttagataaaattctttactatttttataaaactcttgtataa ctatcttattagtttcaaatctatctgtgccacccaatctaatagaatttgtgctcttaa ctaattcgtcgctgattatttcactagaaccaagcgcataactctttaagcctgtcgtgt caaatcccacactatttccatctgtaagtattataggtactccatctctagcagctactg gtgatgcacttatcgcatctgcttctcctgtaaatccattggctataattactttatcta ttggcttaatttctttgattttttcagctatttttatacttgtatcaaatctattttcac caaatattctttgtacaaccttctttttggatagtaactgattctcaacatttttactta ttgttgattctgagcctattatatacacagtctttgctttgtttaatctttccatagttg tgtttggaatctggttttgttttgtcatcaaaataggcgcatttaaggctccagctaaac cacttgcacttagaccatctgctaagctattatctgagttgattagtattgctgtattgt agttttgcttatctgctatttttgctgctgtctcatatctgtcattcccttttatttgct caactgatgtcaacgcatttaccataggagtatttaccattactaaaaatagtgtaagtc ctatagctaatatctttttactattcttcatattattttctacccccaatgtacttttca tattttttattagtactcatacttatttttaatcaaaagttacaattttgttaccatatt ttatatatgataccatagttatccatacaactcaaacaatatacctaaagtttttattct ctataaattcaaaacattataatttattttatttaattaagttataagttcaaaataatt tacgttaataagatgtttaatcattataagaagtatctttttataataatttttgcaata tgaatttctcaacattataatcaaaaaataaaataaggtatctcaatctaattctaaatg agacaccttatttttattattttatcttgttatttgtatattttataatatctacactat gtcttacatattaacgcattgtataatcatatattatctaaataaacttttaatattaat tcctatatcttattagttcttagtaaataagtttattttttctgctattttttcaatagc gtttttagctattccttcacctatttgtactaacttagtagcattcttaagtcttaactc aactacttcttcttgtgatttagaaagttcttctgtagttaatactattggagcctttga actagctgcaagtggtgctgctgtaagtgcatcaactaattgtccatttccacctacata accatcttttgctacatatgctttagttgcacctgcatagtatttattgattactttagc attagtatcttttctattttctccagctaatctttcaactttattatttaaatctatatc aactaatttgtcttcaacttcttttgacacagaattttctccacccactatttctaattc ttttccttttaataatttttcagcatttgcatctaattcgttacctgtaactattattgg agcaccaaattgagcagctctagctgatatactcatagcatcagcttctccatttccacc tactacaaaagcagtcttaaatgtatcttttaattgttttgctatttctaaagaagtttc aaatctatcttctccagaaactctctcaactttacttacacctaatttagaaagtttttc ttcagtttcttttgatactttagattctccacctactatatatattttcttagaagatag attacttccaagtactcttaatatttcagcttctatttctgatggtagtgaatctttttt agataataatattggtgcatttttttgagaggcaagtggtgctgatgctaatccatcaac tatagcatcttctccaactaaaattatagcttctgcttctccatctttgaatctctcttt actaacttctactgctgttgtaaatcttgaatcaccagataaaacttctacttttaattc ttttccatcttttacattagttaatactttgtgtaagtctctaactaacttatggttttt acttgaaac |