Block details
fasta C_difficile_CD00076_1A_020700.fasta
contig u00000crpx_c_020700
start 3061188
length 14710
strand +
type core
seq catttcattagataccatagccttaaactcataactattagggtcttttgtacttgtgtt
tataattactttgacatttacattaatctcacacttttgcccaaaattatcaaaagcact
tacatttaaaacatacgttcctgccttactggtatccacagttccctcaatattaggctt
caaattatttccataataatcagtggcaactatattcaacatactattatcaaacttatc
ccctacagaaatctctacatcattagcagtgattgtaggcattgtatttttatcagatgc
agaactaatacattggtcagcaaccttcttatccattccacctaaagaagtaacttcatc
agcacctctaagcacactcttatcacttccatcattaacaagtactataggtttgtcctt
agccaacggagaaccagccacagcatcaactaacttatacccttgagaaacataaaactt
ctttgttcctttataaaagcgttgtataaccttcttattagtttcaaatctatctttacc
agcaatcctaacagaattagtcttactcacaagttcattactcattatctcctctgaccc
aagagaataacattgaacgccatcaaccttaaatggtatactctttccatcagtaagtat
aacaggaactccatctctagcagctacagaagatacactcattgcatcagcctcacctgt
gtatccatttacaagaaaaaccttatcaccatcatttactggtttaatagctgaaatctc
cttagctataagatagctagtctttattctatcttccccaccaattcttttaacttcaat
ccctttattcttaagttgattttctacagatttacctattgtatcctctgtacctataac
ataagcattcttaacatcctttagtcttttttcaacatctgttggtatcttatctctttg
cactaacattataggagcttttacaactccagataatccacttgcacttaatccatctac
tatagaattatcagtatttactaatatgactgtatcatatatttgtttatctgctatcaa
tgcagaagtctcatatctatctttcccttgtatcttttctatactcgaaagtgcattgat
atttggtgctcctgccattattaatgatattgtcaatcctattgataatactctcttatt
taccttcatcgaactcctcctactaatttttttatataattcagctaatcataaattaca
ccctcagtagtgattccctcaaaatttataaactactaaaacaaaaaacacctaaaatac
cataacctgtaaagcaataataaaacagattacaaaaagtactttagatgtgattttcat
tttataatatcagtaaattaacaaaaaaacaagatttatggaattttttacaagctacct
tcattgccatttaaaaactcttgagtagcatgcacttgaccatcagataatatataaagc
ccaaatccagtactataaaactcatcactaagcatgtttgcattgtattctggagatttc
ttccacacttcaaatatagcctttgccaagtcttttgcatcttgagttgtttgaacactc
ttagaatctatataaatatatgctatattttcctcacttctcattccaaactcagaaaat
acttgtggagcatttttgccatctatataatgttcaaaaactttgttatccatcatatac
ttagaccatgcatttgccataccttctagcttactagatactaccaaaggctctttacct
ttttcttttctataggaattgattaagttatacatttcagtagataccatttttttaaat
tctgggctgttgtaatcatgagatttatcatccaacacttttatttctactctttttcct
gtactttttccccattcgtctgtagcttttaatgtcaatatgtatgtacctactctattt
gtatctataaacccatcaacttctattggtaataccttcccagtgttatctttagctact
atatttaacttgccagtgtcaaacttttcacccttatatacctctgtacttccaactgta
attgctgggggttgtccatttgactttgaagcacttatacattgttgtattaccttctca
tctatttcacctacagaggttatattcttagctccttctaatacagttttatcgcttcca
tcatttactagtaccattggagagtttttagtaagtggtgcagctgctattgcatctact
aattggtatccatctgatacatagaatccatctgcactattaaaaaagtagtctattacg
tttttgttagtttcaaatcggtcagttccttctattcttactgagtttgtatttttaact
agaggattactcattatctcctctgaacctatacaatatgattgaatattttttacatca
aaaggcacactctttccatctgtaagtatgattggagctccatctctagtagctactgat
gatacactcattgcatctgcttctccactatatgcattagttagtagtactttatcaact
ttttttatagttgctatttctttagctattaaatagcttgtttttagtctatcttctcca
ccaattcttttgacttctatatttttagaatctagttctttttctactgatttacttata
gtatcttctgtacctattatatatgcttttttgatattttttagacatctatttgtgtct
gctggtatcttattttgttgtgtaaatagtattggagcttttgtagctcccgataatcca
cttgcacttaatccatctgcaagtgatttttctgtatttactaaaattactgtttcataa
gtctgtttatcagctatctttgctgctgtttcatatctatctttaccgtatattttttct
actactgatgatgcatttacacttttgaagtttactaagattaatgatactgctagacct
aatgataatatttttttgttcattttcatatccccctgatgatttttatattttatattt
atattgtgattattttccatttattttctctttattttccatatattatagagtatatat
gatatgaatatatctcgtctatatattagtgttttattttattaaatttaaaaaattatt
tttaacttctttttaaacatattcaaaattgaatttatatttatatatataaaagatatc
tgctttatttaaaattaaacttaatatagctcaaattattatacattttaacctcaatat
tattagattgttaagataatgaaaataaaataagaatgcatttaaatatataactttata
tctaaatacattcttattttctatttacttaatatttatttttcaattaaactcttaatc
ttgtctattacagatgaggctattcctccacctacttcaaacaactttgatgaattttta
ccttttaatgacgattcttgtgatttatctaacgtatttgtagcaagtataactggtgaa
ttgtttttagctgctaatggtccaactgctaaagcatctataagtttatcttgatttgca
actacaactccatctagcttagattgagagtagaatttatctattactttggcattcgtc
tcttgtctagtttgacctgccaccctattgtttgatatatctttgtttgctatttttcca
acttgttcaatagccttgttagatattttttctactccaccaataaaatatatatttgac
accttatttgatttaataaattgttcagcttcattatctacaccatctttttgtgtaagt
actattggagttttttctttaccagccagtgatgctattgataatgaatcagcttctcca
tttcctgctcctatatacaacttgcttacattattcgtcttatctatttcttttgctata
ttaatagaagtttgatatcttgtatctccacctattctttgtactgatatttttgaattt
acagctttgatagcttcaacaactgaatttggcattgagttgtttccacctatcacaact
acttttgatggatttagccttttcaattcttctacagttttttgaggaagtttatcattt
gatgataaaagaatcggtgagttttttacactagcaagtggtgtagctgtaagcccatcc
accatacttttatcttctccatttactattacaactgtatctgattttgtccaaccactt
tgagatattttgatagctgtctcaaatctatcatcaccttttaattttttgactgtgaca
ttagatgtagaatcacttgaatttcctcctccagagcttccaccactagatgagccgcct
gaattacttcctccaccattatttccaccactaccattatctggtggtaattcatccggt
tttgataattcattttcaactatgtattctaaactttttggaagtgtaacttcaacatat
ttgtttattgtaacttttcttcccttagttgttttttgtgctaatccaagttttaatatt
acatttgaaccactttcttgtgtttctttactaacaatagaatagtttatcctaatattg
tttaataaatattcaagtgcttcacttttctctaccttatacttttcagggtcattttta
ctagaaccagttcccccaatcggttttacttcactctcattaataagggtaaatattaat
ccttcatcagagcttatattttcataatccactgttttgttgttatatgttacaattttt
aaagctggtttatcatttgttccttttcctaaaactttatagtcagcatttgagttactt
ccagatttttttacagatattcttcctatattcaatctatttccgtctagtaagtcttca
tttgatgtaacatatatatctaatgtagttgtattacttgatttgttgtattctgctcta
caagtagcatttgcatttccactttttatctgagattttatattatcagaccaagtaatc
ttttctttctgctcattatctactacttcaacctcaccttgtacttttatactggcttga
aatgaatatactatgttttctactgagtccacagatatatctatagtatttactttctca
tacgtttttgttccttgtaaaactggagctgcatatgcacatgtagcactaccagttaca
gctactgccatagttgatactgctatagttcttataaaagattttcttttactcattaac
acccgtccttatctatcattaactaagtggataaatttacttatccacctagcttttata
tttaatttataaattaccctaaatttatgattacatttatatactttacttttaatatct
actattttaaaactattctagtacctaatcttattagatatacaatgttagtgttagtat
ttttacgtttttagagttccacctactatttatctctaacaatattaccctttactttat
tgcttacagttataaccttcttattactgatatcaatagaatttcttgtagcttttctag
ctttactattactatcagtaagacttattgtctttaactcatcataattcttagctccta
caggtacatacattgtatcacttacaaatctttgacctactggagtatctccttgaaggt
cattgtatctatatagttcagccttaaccttatcacttaaagaatcaaagttttcttttg
gcatatagtaaacccatgtacctttactgatttcacctagttcacctttttctggaactt
ctgcaaataaaagtgcttctccagatatagtcttattgtttttatctataagtagtggta
aattaaatgctggatttccactgtattcacctgtaataactattgaacccgctggaatct
tacctgtttcatcttcacttgtgctagagtcatcactttgatatacataatcttctgcta
attttccaattccattagtacgagtttcgtctgcattattcattgtgccaatttctatat
tatcacctggaggtcctattatatctaattctgcaacttctatattagacttattatttg
agattagttttacatatctagcttggtatgtccaaagtttaccatctttattaaatgtaa
ctctagcttcattatcttggtcttttcctccaccaactaaatcttgtccatattcaaaag
ttccttgacttacatcttcccagttctttttatcattacttacttgtattttgtaattag
ttaaaggattgtatgttgtgctagtattctttctaaagttaaataatccttttaatgaga
acttcctagcttctgtctctggttttgtatattttagtcctactataggtaatgtttctt
tcatgtctactattatatatggattttcctctacatttatatcagggtctttttgagggt
ctttgttccactctgctttacttattatctttcctttatatgtagtatttgcatcattat
cttttatattatcaatttcaggattttgtaatggtccatgtgagtcattttcagttctaa
catcaccgtcagaaacagtatttgttatgaatgaccatgctgatttatttattttccctt
catctgataattttacagtaccaacttcaaattcttctgttggatttaggtgataatcat
atgcaactaccttatatgtaaatgctctgttattaagaggagatatattatcagtaaatt
tagtcttactatttccttttgcatccacaaatccaactgttctgtattttacctgtgttc
cattttcaccatctaaataatttccatcacttcttattatttcgtatcctagtatcttat
ctttatccttatctacatctaggtctatagatattttattagatttaactagagaaccac
tttgtattccatcagaaaaactagcacttactttagtatcttttgccatactagctatat
tttcatttaaaatctttcttctagcttcgtcatttacatattgtatctttcttgattctt
tttcgtagttcttactatccattatactgtttaattctggtgtaatttctactccccatg
ccttaaagtaatctcttaaatctttttcaacaacacttgatgccattgctactagcattt
ggtcttttggcaaactattaattgggtcactacttgaaagtgctctgtattttcttgaaa
tctttgcatagaatgtatcattacttaaatcagcatctgagttattctttaacattgaac
ccgtaaaatcatcatcataagctagatgtaattgccataacattccaagcctttcaaata
cattgcttggtatacctaagctatttgaagttacatgctcatatatcttatccattgttg
aaccttcaattcttgaatgtgtcttatcatcaaaggtctgagcaagtaaagcaagtacat
tgttactagtttcgctatatgtcatctttccaatatctgtaacatgtcctatctcatgac
ctattccccatccaaataagtttcctcctgtagcttttccactatcatctatttggaaag
gtactccattcataagccctggaactgaaccatattctactcctacatgtaatccagaag
catacataaatgctccaataaacattctttggtattttatgttcatacgagattttggag
ccatatcatttttagttaagttaaattcattatcatctacagttccattaccatctaaat
cttgtgttttaaatactcctctttctgagtaaactaaatccattatttgttcccatgcaa
gcatactattatataatctatctacttgtgtatttaaatcagcatttccttttgatatcc
cttgatatacagctgttgcaggaacatttaatgttactttatcactttcaatatctgtag
tgtttaacacaccagttttttctgaatatccatatgaattaccaacatttgttcctggat
aatatggttctccttttacagcatctttatatctagctaattcttctatatatgctttta
tctttttcttagattcagaaactcccgcaggactcttatcatttattgttccatttagat
taaggtgtggtatcttagtagctcctgctacacgtacttttatatctcctccacttggag
tatcttcagcgtatcttatgtataaacttcctccacattctatatctaaactatgaagtt
tgcttaattgaattacattttttccagtgttaagatttatttctccactcttatatgcac
cagattctccatagtactgtgtatatatcaacttaggagtttttccacttttacttccaa
catatactgtgatttcatctcctgctctagcagctactcctaatgcctgccagtcatttt
gcatacctaaattattggaatttacagtatactgtccgtttttatctttatattttccta
atttatttatttcttgatttacagtagttacatcagtaagtgtggctctatcattatata
agtcttgagctaattttaattctctctcaataactgtcttatatggatgatattctccac
tagctttatctggagtatttaatctatcttttaattcagttattttttcttgagttacat
cttcttttaattcaacttgtaggtcatccataaatagatttcttacatcatcttctatac
tgtcatactcataaaacttaagttctgatatattagacttatatgaataggatgaacaaa
cacttacttgtatcttggtagcagttattggttcttttaatctaaccattacatacttat
tattatttacagggtctgtctttgtttcaaaaggaacatcccccagattgtgtaattgac
cattttcatcccaatatcgtacctcaaagtcatttattgtcttatcagaaacatcaaaac
gaggtgtagccataaaagtatccatagtataagatttatcaaaagttattattggtcctc
tattcgttccctcagctgcattatatgttgggaatgtccaatgtgttgtaaagtccccat
ctactacattgaatttatcaaatggatttttatcactatattcacttttgtcatatcctg
ctggataagtaacatctacaatgtgatttgttggtattccaaatccaccattctctttag
gagtattaattaatctatagttaggtgttgttggtgcatccatgctttcagttgtaccta
tatatgttttagacattccactagttcccaagtggttagtagctgtcattctaacttcat
atgttgtattatccttaagaccttctatctttgaacttgtcccacgaataagcttatcat
tgtattttatccaagacccattagagcctttttctttatagtacaagtcaaaatctttag
cttgtttatgatttttccagcttacatcaagagatttaaatttacctttaacatttatac
cttctggtggttctggttttgtgtctggaacaacttgaaattctaatatactatctgggc
taaattgtataggtttatagtttgaatctacattttctggtactccgtctaagttttctg
gtgttgcatctttataaccactagaccaatctccatttaaagattgtatgctaaccctat
atagtccatatgcttctatatctctaacttctattgtatttttactggtttgtaattttt
tagtagataatacttttcccttactatcaattttatctagtataagttcgtatgctgata
catttacttcattattccaataaaaagatactttttcatttccaacagcagtgctagtcg
atattttatttattttaggtatattcatctctggctttggtatttctttatatacattgt
ttaaaaattcaacttttgatatttctgcaagatttctatcgtttgctgttgtagctgtta
tttttatagttatcttttttactgctacttgtttaccaagatttattactatatcactat
tttgaacatctgcatatgtttctaatgttgacttactatatgtagatgttgtagagttat
catctttactgatattaccctcttcttttggagtatcttcatctgaattaggtttatcca
ttgatgaattttctttatcattatttttatcttgattggtattagagtttacttcttgtt
tatcgctattttcctgttgttcatcattattttcatctttattatttgagttattatcag
tctggtttatattttcatctttattatttacttcttcttgatttacttcttcttgttcgt
tatttacttcctcttgttgctcctcatcttttaagtttttcatatattctttgttttcat
aaggaatctgttgaacattaccatctttgtcagtaacctcaactattccttttgctggag
cagtaccttctggagcttttatattgatgacttccatattaagtgcttctgataaagcta
tatccattactgctggtttttcctcagatatttcatcattttttgaagatattgtaactc
cattattttctccactaaataaattttctacattaccattaatatctacatcactatttc
cttttaattcaaccttacttgtatctactataggattggtagatactatactttctaggc
tttttgcatcttcactttgtcctaaatttttctgtacataatctaagtcaacaatatcta
cctttccatctctatttaaatcaaattctcttttatttgaatctatattctctaaaacct
tattataatcactcttatctactttaccgtctccatttacatcacccattaagaacaatt
cataatttaaaggtttatttttattatctacacttgctctattgcttaataagactcttt
gtgaataacttgatatatcaatgtctttaatttctttgttcttaaatccatctccagaga
cttctacattgtattttccaacaggtaaattattaaatacaatattataatatgatatat
tctcatctttattttttatttcacttctacttgcagataatttttttatagtatattcta
tattatctgtcccaacatttactgttcctgaatctttttctccaagctttattattccac
tattgttactatcatcttttaatcgtaactgcatattagtcatactttctgaatcgctat
tttttattggcagtgaaaaatttaaatctacttcaagactcccccttaacttttctgtaa
ctgatttttcaactgcccttagcttcccctctaatataggttctgcaaaaacgtttagtg
gtgcactacacatagatactgctagtacacaagatattgcctttttcatgaaataacaat
cctcccttaataaatatctaatttttcatgaatttaaatactataagtttcagacaataa
aaaaagacactcaaagagaatcttaattataaaataaaaagactttactctttttagcaa
ctggctgatatggctttaaaagctttaatccctatagttttgcgtcattagatttcccta
attttgccatttaattttcactactttcttacccattttatactatatttaaacttttta
atacaatttttttagattaaattataaaaaaataacatttatattaatttattaatataa
atgttattttccattataatttaattatttatatagcttccttacaagcataattttgtg
tatattttcttattctttatatcttccataaaattcatgtgtagcatatagattcttatc
tcctgttatagctataccaaatcccattatttcataccctttatgcaacatgttagttcc
ttcttctggatttgtcttccactcattaaaaataaagtttcctatatcatctgcatctct
atttgtatatacaggtttatctggaattttatatttaattatattttcaccttgaactgc
tatatatccaggtttaatctcactccaatctaagtatttcaaaaaagtagaatatgaatt
ttttccatttatcgtatgagataaagtcttcttatttgccattaaattagaccaatcatt
tgctaaaccctctaatctgcttgctacagataacgctcttactccattctcttttctata
ctgctttgtaagagcatatactttaccctttattctctctttaaatgctctatcatttgg
attgtaatataaaccttgttgatttggtgaagcttgatttatacattgcttgataacatt
ctgatttatgcctcctagtacagtcaatttgtctgcaccacttaaaatactcttgttact
gccattttcaactaaaactacaggagcattttttgctattgtagaggcagccaaagcgtc
tgttaattgtaagcctttacttagataaaattctttactatttttataaaactcttgtat
aactatcttattagtttcaaatctatctgtgccacccaatctaatagaatttgtgctctt
aactaattcgtcgctgattatttcactagaaccaagcgcataactctttaagcctgtcgt
gtcaaatcccacactatttccatctgtaagtattataggtactccatctctagcagctac
tggtgatgcacttatcgcatctgcttctcctgtaaatccattggctataattactttatc
tattggcttaatttctttgattttttcagctatttttatacttgtatcaaatctattttc
accaaagattctttgtacaaccttctttttggatagtaactgattctcaacatttttact
tattgttgattctgagcctattatatacacagtctttgctttgtttaatctttccatagt
tgtgtttggaatctgattttgttttgtcatcaaaataggcgcatttaaggctccagctaa
accacttgcacttagaccatctgctaagctattatctgagttgattagtattgctgtatt
gtagttttgcttatctgctatttttgctgctgtctcatatctgtcattcccttttatttg
ctcaactgatgtcaacgcatttaccataggagtatttaccattactaaaaatagtgtaag
tcctatagctaatatctttttactattcttcatattattttctacccccaatgtactttt
catattttttattagtactcatacttatttttaatcaaaagttacaattttgttaccata
ttttatatatgataccatagttatccatacaactcaaacaatatacctaaagtttttatt
ctctataaattcaaaacattataatttattttatttaattaagttataagttcaaaataa
tttatgttaataagatgtttaatcattataagaagtatctttttataataatttttgcaa
tatgaatttctcaacattataatcaaaaaataaaataaggtatctcaatctaattctaaa
tgagacaccttatttttattattttatcttgttatttgtatattttataatatctacact
atgtcttacatattaacgcattgtataatcatatattatctaaacaaacttttaatatta
attcctatatcttattagttcttagtaaataagtttattttttctgctattttttcaata
gcgtttttagctattccttcacctatttgtactaacttagtagcattcttaagtcttaac
tcaactacttcttcttgtgatttagaaagttcttctgtagttaatactattggagccttt
gaactagctgcaagtggtgctgctgtaagtgcatcaactaattgtccatttccacctaca
taaccatcttttgctacatatgctttagttgcacctgcatagtatttattgattacttta
gcattagtatcttttctattttctccagctaatctttcaactttattatttaaatctata
tcaactaatttgtcttcaacttcttttgatacagaattttctccacccactatttctaat
tcttttccttttaataatttttcagcatttgcatctaattcgttacctgtaactattatt
ggagcaccaaattgagcagctctagctgatatactcatagcatcagcttctccatttcca
cctactacaaaagcagtcttaaatgtatcttttaattgttttgctatttctaaagaagtt
tcaaatctatcttctccagaaactctctcaactttacttacacctaatttagaaagtttt
tcttcagtttcttttgatactttagattctccacctactatatatattttcttagaagat
agattacttccaagtactcttaatatttcagcttctatttctgatggtagtgaatctttt
ttagataataatattggtgcatttttttgagaggcaagtggtgctgatgctaatccatca
actatagcatcttctccaactaaaattatagcttctgcttctccatctttgaatctctct
ttactaacttctactgctgttgtaaatcttgaatcaccagataaaacttctacttttaat
tcttttccaccttttacatcagttaatactttgtgtaagtctctaactaacttatggttt
ttacttgaaac