Block details
fasta C_difficile_CD00300_1A_020709.fasta
contig u00000crpx_c_020709
start 3124866
length 14684
strand +
type core
seq ttcttttaaactcactactattcatatcattagtcttatattcaagtacatttacttcta
cacttattgaggtagtctttccaccaatatcagtagcttttatagtaactttgtatttac
caaccttatcagtattaatatttcctataagctctggtgtcaaatcattaccattgctat
cctttgctacgatattcagtttacttatatcaaacttatcaccttgataaatatttaaat
ttccaacagttattgttggtgcacttgcatccagtgatgatgcacttaaacattgttcta
gcgtcttttcatctattcctcctagtgctgtaatcttatcagcacttctaagtacagact
tatcactatttccatcaaccaatacaataggtgcatttttagctatagaagaaccagcaa
ctgcatctactaattgataacctttagaaagataaaattcttttgctgaactataaaaat
gttttataacttttttattagtctcaaatctatcttctccagctaatctaactgaattag
tttttttaactaaatcattacttattatctcctctgaaccaagagcataacattgcacac
cttcttttttctcaaatggaacatttttaccattagttaaaattataggtgctccatctc
ttgatgctactgatgacgcactcatagcatctgcttcacctgtataaccattagttataa
aaaccttatctataggttttattgaagctatttcttttgctataagataacttgtttcaa
ttctatcattaccacctattcttttgacttctatccctttttgctttaattcattttcaa
ctgattttcctattgaatcttcagttcctattatataaaccttctttacatcttttaaca
ttttttctgtgtctgatggtatactgtttctttgtgataataatataggtgctttaactg
ttcctgctaatccacttgcacttaatccatcagctagtgtattatctgtatttactaata
ctacattttcatatgtttgtttctgtgcaattttggcagctgtctcatatctatctttcc
cttgtatcttttctatacttgaaagtgcattgatatttggtgctcctgccattattaatg
atattgccaatcctattgataatactctcttatttaccttcatcaaactcctcctactaa
tttttttatataattcagctaatcataaattacatcctcagtagtaattccctcaaaatt
tataaactactaaaacaaaaaacacctaaaataccataacctgtaaagcaataacaaaac
agattacaaaaagtactttagatgtgattttcattttataatatcagtaaattaacaaaa
aaacaagatttatggaattttttacaagctaccttcattgccatttaaaaactcttgagt
agcatgcacttgaccatcagataatatataaagcccaaatccagtactataaaactcatc
actaagcatgtttgcattgtactctggagatttcttccacacctcaaatatagcctttgc
caagtcttttgcatcttgtgtagtttgaacgttcttagaatctatataaatatatgctat
attttcctcacttctcattccaaactcagaaaatacttgtggagcattttttccatctat
ataatgtgcaaatacttttttatccatcatatacttagaccatgcatttgccataccttc
tagcctactagacactaccaaaggctctttgcctttttcttttctataggaattgattaa
gttatacatttcagtagataccatttttttaaattctgggctgttgtaatcatgagattt
gtcatccaacacttttatttctactctttttcctgtactttttccccattcgtctgtagc
ttttaatgtcaatatatatgtacctactctatttgtatctataaacccatcaacttctat
tggtaataccttccctgtgttatctttagctactatatttaacttgccagtgtcaaactt
ttcacccttatatacctctgtacttccaactgtaattgttgggggttgtccatttgactt
tgaagcatttatacactgttgtattaccttctcatttatttcacctacagaggttatatt
cttagctccttctaatacagttttatcgcttccatcatttactagtaccattggagagtt
tttagtaagtggtgcagctgctattgcatctactaattggtatccatctgatacatagaa
tccatctgcactattaaaaaagtagtctattacgtttttgttagtttcaaatcggtcagt
tccttctattcttactgagtttgtatttttaactagaggattactcattatctcctctga
acctatacaatatgattgaatattttttacatcaaaaggcacactctttccatctgtaag
tatgattggagctccatctctagtagctactgatgatacactcattgcatctgcttctcc
actatatgcattagttaatagtactttatccactttttttatagttgctatttctttagc
tattaaatagcttgtttttagtctatcttctccaccaattctttttacttctatattttt
agaatctagttctttttctactgatttacttatagtatcttctgtacctattatatatgc
ttttttgatattttttagacatctatttgtgtctgctggtatcttattttgttgtgtaaa
tagtattggagcttttgtagctcctgataatccacttgcacttaatccatctgcaagtga
tttttctgtatttactaaaattactgtttcataagtctgtttatcagctatctttgctgc
tgtttcatatctatctttaccgtatattttttctactactgatgatgcatttacactttt
gaagtttactaagattaatgatactgctagacctaatgataatatttttttgttcatttt
catatccccctgatgatttttatattttatatttatattgtgattattttccatttattt
tctctttattttccatatattatagagtatatatgatatgaatatatctcgtctatatat
tagtgttttattttattaaatttaaaaaattatttttaacttctttttaaacatattcaa
aattgaatttatatttatatatataaaagatatctgctttatttaaaattaaacttaata
tagctcaaattattatacattttaacctcaatattattagattgttaagataatgaaaat
aaaataagaatgcatttaaatatataactttatatctaaatacattcttattttctattt
acttaatatttatttttcaattaaactcttaatcttgtctattacagatgaggctattcc
tccacctacttcaaacaactttgatgaatttttaccttttaatgacgattcttgtgattt
atctaacgtatttgtagcaagtataactggtgaattgtttttagctgctaatggtccaac
tgctaaagcgtctataagtttgtcttgatttgcaactacaactccatctagcttagattg
agagtagaatttatctattactttggcattcgtctcttgtctagtttgacctgccaccct
attgtttgatatatctttgtttgctatttttccaacttgttcaatagccttgttagatat
tttttctactccaccaataaaatatatatttgacaccttatttgatttaataaattgttc
agcttcattatctacaccatctttttgtgtaagtactattggagttttttctttaccagc
cagtgatgctattgataatgaatcagcttctccatttcctgctcctatatacaacttgct
cacattattcgtcctatctatttcttttgctatattaatagaagtttgatatcttgtatc
tccacctattctttgtactgatatttttgaatttacagctttgatagcttcaacaactga
atttggcattgagttgtttccacctatcacaactacttttgatggatttagccttttcaa
ttcttctacagttttttgaggaagcttttcatttgatgataaaagaatcggtgagttttt
tacactagcaagtggtgtagctgtaagcccatccaccatacttttatcttctccatttac
tattacaactgtatctgattttgtccaaccactttgagatattttgatagctgtctcaaa
tctatcagcaccttttaattttttgactgtgacattagatgtagaatcacttgaatttcc
tcctccagagcttccaccactagatgagccgcctgaattacttcctccaccattatttcc
accactaccattatctggtggtaattcatccggttttgataattcattttcaactatgta
ttctaaactttttggaagtgtaacttcaacatatttgtttattgtagcttttcttccctt
agttgttttttgtgctaatccaagttttaatattacatttgaaccactttcttgtgtttc
tttactaacaatagaatagtttatcctaatattgtttaataaatattcaagtgcttcact
tttctctaccttatacttttcagggtcatttttactagaaccagttccaccaattggttt
tacttcactctcattaataagggtaaatattaatccttcatcagagcttatattttcata
atccactgttttgttgttatatgttacaatttttaaagctggtttatcacttgttccttt
tcctaaaactttatagtcagcatttgagttactgccagatttttttacagatattcttcc
tatattcaatctatttccgtctagtaaatcttcatttgatgtaacgtatatatctaatgt
agttgtattacttgatttgttgtattctgctctacaagtagcatttgcatttccactttt
tatctgagattttatattatcagaccaagtaatcttttctttctgctcattatctactac
ttcaacctcaccttgtacttttatactggcttgaaatgaatatactatgttttctactga
gtccacagatatatctatagtatttactttctcatacgtttttgttccttgtaaaactgg
agctgcatatgcacatgtagcactaccagttacagctactgccatagttgatactgctat
agttcttataaaagattttcttttattcattaacacccgtccttatctatcattaactaa
gtggataaatttacttatccacctagcttttatatttaatttataaattaccttaaactt
atagttacatttatatactttacttttaatatctactattttaaaactattctagtacct
aatcttattagatatacaatgttagtgttagtatttttacgtttttagagttccacctac
tatttatctctaacaatattaccctttactttattgcttacagttataaccttcttatta
ctgatatcaatagcatttcttgtagcttttctagctttactattactatcagtaagactt
attgtctttaactcatcataattcttagctcctacaggtacatacattgtatcacttaca
aatctttgacctactggagtatctccttgaaggtcattgtatctatatagttcagcctta
accttatcacttaaagaatcaaagttttcttttggcatatagtaaacccatgtaccttta
ctgatttcacctagttcacctttttctggaacttctgcaaataaaagtgcttctccagat
atagtcttattgtttttatctataagtagtggtaaattaaatgctggatttccactgtat
tcacctgtaataactattgaacctgctggaatcttacctgtttcatcttcacttgtgcta
gagtcatcactttgatatacataatcttctgctaattttccaattccattagtacgagtt
tggtctgcattattcattgtgccaatttctatattatcacctggaggtcctattatatct
aattctgcaacttctatattagacttattatttgagattagttttacatatctagcttgg
tatgtccaaagtttaccatctttattaaatgtaactctagcttcattatcttggtctttt
cctccaccaactaaatcttgtccatattcaaaagttccttgacttacatcttcccagttc
tttttatcattacttacttgtatcttgtaattagttaaaggattgtatgttgtgctagta
ttctttctaaagttaaataatccttttaatgaaaacttcctagcttctgcctctggtttt
gtatattttagtcctactataggtaatgtttctttcatgtctactattatatatggattt
tcttctacatttatatcagggtctttttgagggtctttgttccactctgctttacttatt
atctttcctttatatgtagtacttgcatcattatcttttatattatcaatttcaggattt
tgtaatggtccatgtgagtcattttcagttctaacatcaccgtcagaaacagtatttgtt
atgaatgaccatgctgatttatttattttcccttcatctgataattttacagtaccaact
tcaaattcttctgttggatttaggtgataatcatatgcaactaccttatatgtaaatgct
ctgttattaagaggagatatattatcagtaaatttagtcttactatttccttttgcatcc
acaaatccaactgttctgtattttacctgtgttccattttcaccatctaaataatttcca
tcacttcttattatttcgtatcctagtatcttatctttatccttatctacatctaggtct
atagatattttattagatttaactagagaaccactttgtattccatcagaaaaactagca
cttactttagtatcttttgccatactagctatattttcatttaaaatctttcttctagct
tcgtcatttacatattgtatctttcttgattctttttcgtagttcttactatccattata
ctgtttaattctggtgtaatttctactccccatgccttaaagtaatctcttaaatctttt
tcaacaacacttgatgccattgctactagcatttggtcttttggtaaactattaattggg
tcactacttgaaagtgctctgtattttcttgaaatctttgcataaaatgtatcattactt
aaatcagcatctgagttattctttaacattgaacccgtaaaatcatcatcataagctaga
tgtaattgccataacattccaagcctttcaaatacattgcttggtatacctaagctattt
gaagttacatgctcatatatcttatccattgttgaaccttcaagtcttgaatgtgtctta
tcatcaaaggtctgagcaagtaaagcaagtacattgttactagtttcgctatatgtcatc
tttccaatatctgtaacatgtcctatctcatgacctattccccatccaaataagtttcct
cctgtagcttttccactatcatctatttggaaaggtactccattcataagccctggaact
gaaccatattctactcctacatgtaatccagaagcatacataaatgctccaataaacatt
ctttggtattttatgttcatacgagattttggagccatatcatttttagttaagttaaat
tcattatcatctacagttccattaccatctaaatcttgtgttttaaatactcctctttct
gagtaaactaaatccattatttgttcccatgcaagcatactattatataatctatctact
tgtgtatttaaatcagcatttccttttgatatcccttgatatacagctgttgcaggaaca
tttaatgttactttatcactttcaatatctgtagtgtttaacacaccagttttttctgaa
tatccatatgaattaccaacatttgttcctggataatatggttctccttttacagcatct
ttatatttagctaattcttctatatatgcttttatctttttcttagattcagaaactccc
gcaggactcttatcatttattgttccatttagattaagatgtggtatcttagtagctcct
gctacacgtacttttatatctcctccacttggagtatcttcagcatatcttatgtataaa
cttcctccacattctatatctaaactatgaagtttgcttaattgaattacattttttcca
gttttaagatttatttctccactcttatatgcaccagattctccatagtactgtgtatat
atcaacttaggagtttttccacttttacttccaacatatactgtgatttcatctcctgct
ctagcagctactcctaatgcctgccagtcattttgcatacctaaattattggaatttaca
gtatactgtccgtttttatctttatattttcctaatttatttatttcttgatttacagtc
gttacatcagtaagtgtggctctatcattatataagtcttgagctaattttaattctctc
tcaataactgtcttatatggatgatattctccactagctttatctggagtatttaatcta
tcttttaattcagttattttttcttgagttacatcttcttttaattcaacttgtaggtca
tccataaatagatttcttacatcatcttctatactgtcatactcataaaacttaagttct
gatatattagacttatatgaataggatgaacaaacacttacttgtatcttggtagcagtt
attggttcttttaatctaaccattacatacttattattatttacagggtctgtctttgtt
tcaaaaggaacatcccccagattgtgtaattgaccattttcatcccaatatcgtacctca
aagtcatttattgtcttatcagaaacatcaaaacgaggtgtagccataaaagtatccata
gtataagatttatcaaaagttattattggtcctctattcgttccctcagctgcattatat
gttgggaatgtccaatgtgttgtaaagtccccatctactacattgaatttatcaaatgga
tttttatcactatattcacttttgtcatatcctgctggataagtaacatctacaatgtga
tttgttggtattccaaatccaccattctctttaggagtattaattaatctatagttaggt
gttgttggtgcatccatgctttcagttgtacctatatatgttttagacattccactagtt
cccaagtggttagtagctgtcattctaacttcatatgttgtattatccttaagaccttct
atctttgaacttgtcccacgaataagcttatcattgtattttatccaagacccattagag
cctttttctttatagtacaagtcaaaatctttagcttgtttatgatttttccagcttaca
tcaagagatttaaatttacctttaacatttataccttctggtggttctggttttgtgtct
ggaacaacttgaaattctaatatactatctgggctaaattgtataggtttatagtttgaa
tctacattttctggtactccgtctaagttttctggtgttgcatctttataaccactagac
caatctccatttaaagattgtatgctaactctatatagtccatatgcttctatatctcta
acttctattgtatttttactagtttgtaattttttagtagataatacttttcccttacta
tcaattttgtctagtataagttcgtatgctgatacatttacttcattattccaataaaaa
gatactttttcatttccaacagcagtgctagtcaatattttatttattttaggtatgttc
atctctggctttggtatttctttatatacattgtttaaaaattcaacttttgatatttct
gcaagatttctatcgtttgctgttgtagctgttatttttatagttatcttttttactgct
acttgtttaccaagatttattactatatcactattttgaacatctgcatatgtttctaat
gctgacctactatatgtagatgttgtagagttatcatctttactgatattaccctcttct
tttggagtatcttcatctgaattaggtttatccattgatgaattttctttatcattattt
ttatcttgattggtattagagtttacttcttgtttatcgctattttcctgttgtttatca
ttactttcatctttattatttgagttattatcagtctggtttatattttcatctttatta
tttacttcttcttgatttacttcttcttgttcgttatttacttcctcttgttgctcctca
tcttttaagtttttcatatattctttgttttcataaggaatctgttgaacattaccatcc
ttgtcagtaacctcaactattccttttgctggagcagtaccttctggagcttttatattg
atgacttccatattaagtgcttctgataaagctatatccattactgctggtttttcctca
gatatttcatcattttttgaagatattgtaactccattattttctccactaaataaattt
tctacattaccattaatatctacatcactatttccttttaattcaaccttacttgtatct
actataggattggtagatactatactttctaggctttttgcatcttcactttgtcctaaa
tttttctgtacataatctaagtcaacaatatctacctttccatctctatttaaatcaaat
tctcttttatttgaatctatattctctaaaaccttattataatcactcttatctacttta
ccgtctccatttacatcacccattaagaacaattcataatttaaaggtttatttttatta
tctacacttgctctattgcttaataagactctttgtgaataacttgatatatcaatgtct
ttaatttctttgttcttaaatccagctccagagacttctacattgtattttccaacaggt
aaattattaaatacaatattataatatgatacattctcatctttattttttatttcactt
ctacttgcagataatttttttatagtatattctatattatctgtcccaacatttactgtt
cctgaatctttttctccaagctttattattccactattgttactatcatcttttaatcgt
aactgcatattagtcatactttctgactcgttattttttattggcagtgaaaaatttaaa
tctacttcaagactcccccttaacttttctgtaactgatttttcaactgcccttagcttc
ccctctaatataggttctgcaaaaacgtttagtggtgcactacacatagatactgctagt
acacaagatattgcctttttcatgaaataacaatcctcccttaataaatatctaattttt
catgaatttaaatactataagtttcagacaataaaaaaagacactcaaagagaatcttaa
ttataaaataaaaagactttactctttttagcaactggctgatatggctttaaaagcttt
aatccctatagttttgcgtcattagatttccctaattttgccatttaattttcactactt
tcttacccattttatactatatttaaactttttaatacaatttttttagattaaattata
aaaaaataacatttatattaatttattaatataaatgttattttccattataatttaatt
atttatatagcttccttacaagcataattttgtgtatattttcttattctttatatcttc
cataaaattcatgtgtagcatatagattcttatctcctgttatagctataccaaatccca
ttatttcataccctttatgcaacatattagttccttcttctggatttgtcttccactcat
taaaaataaagtttcctatatcatctgcatctctatttgtatatacaggtttatctggaa
ttttatatttaattatattttcaccttgaactgctatatatccaggtttaatctcactcc
aatctaagtatttcaaaaaagtagaatatgaattttttccatttatcgtatgagataaag
tcttcttatttgccattaaattagaccaatcatttgctagaccctctaatctgcttgcta
cagataacgctcttactccattctcttttctatactgctttgtaagagcatatactttac
cctttattctctctttaaatgctctatcatttggattgtaatataaaccttgttgatttg
gtgaagcttgatttatacattgcttgataacattctgatttatacctcctagtacagtca
atttgtctgcaccacttaaaatactcttgttactgccattttcaactaaaactacaggag
cattttttgctattgtagaggcagccaaagcgtctgttaattgtaagcctttacttagat
aaaattctttactatttttataaaactcttgtataactatcttattagtttcaaatctat
ctgtgccacccaatctaatagaatttgtgctcttaactaattcgtcgctgattatttcac
tagaaccaagcgcataactctttaagcctgtcgtgtcaaatcccacactatttccatctg
taagtattataggtactccatctctagcagctactggtgatgcacttatcgcatctgctt
ctcctgtaaagccattggctataattactttatctattggcttaatttctttgatttttt
cagctatttttatacttgtatcaaatctattttcaccaaagattctttgtacaatcttct
ttttggatagtaactgattctcaacatttttacttattgttgattctgagcctattatat
acacagtctttgctttgtttaatctttccatagttgtgtttggaatctggttttgttttg
tcatcaaaataggcgcatttaaggctccagctaaaccacttgcacttagaccatctgcta
agctattatctgagttgactagtattgctgtattgtagttttgcttatctgctatttttg
ctgctgtctcgtatctgtcattcccttttatttgctcaacggatgtcaacgcatttacca
taggagtatttaccattactaaaaatagtgtaagtcctatagctaatatctttttactat
tcttcatattattttctacccccaatgtacttttcatattttttattagtactcatactt
atttttaatcaaaagttacaattttgttaccatattttatatatgataccatagttatcc
atacaactcaaacaatatacctaaagtttttattctctataaattcaaaacattataatt
tattttatttaattaagttataagttcaaaataatttatgttagtaatatgtttaatcat
tataagaagtatctttttataataatttttgcaatatgaatttctcaacattataatcaa
aaaataaaataaggtatctcaatctaattctaaatgagacaccttatttttattatttta
tcttgttatttgtatattttataatatctacactatatcttacatattaacgcattgtat
aatcatatattatctaaataaacttttaatattaattcctatatcttattagttcttagt
aaataagtttattttttctgctattttttcaatagcgtttttagctattccttcacctat
ttgtactaacttagtagcattcttaagtcttaactcaactacttcttcttgtgatttaga
aagttcttctgtagttaatactattggagcctttgaactagctgcaagtggtgctgctgt
aagtgcatcaactaattgtccatttccacctacataaccatcttttgctacatatgcttt
agttgcacctgcatagtatttattgattactttagcattagtatcttttctattttctcc
agctaatctttcaactttattatttaaatctatatcaactaatttgtcttcaacttcttt
tgatacagaattttctccacccactatttctaattcttttccttttaataatttttcagc
atttgcatctaattcgttacctgtaactattattggagcaccaaattgagcagctctagc
tgatatactcatagcatcagcttctccatttccacctactacaaaagcagtcttaaatgt
atcttttaattgttttgctatttctaaagaagtttcaaatctatcttctccagaaactct
ctcaactttacttacacctaatttagaaagtttttcttcagtttcttttgatactttaga
ttctccacctactatatatattttcttagaagatagattacttccaagtactcttaatat
ttcagcttctatttctgatggtagtgaatcttttttagataataatattggtgcattttt
ttgagaggcaagtggtgctgatgctaatccatcaactatagcatcttctccaactaaaat
tatagcttctgcttctccatctttgaatctctctttactaacttctactgctgttgtaaa
tcttgaatcaccagataaaacttctacttttaattcttttccaccttttacatcagttaa
tactttgtgtaagtctctaactaacttatgttttttacttgaaac