Block details | |
---|---|
fasta | C_difficile_CD00300_1A_020709.fasta |
contig | u00000crpx_c_020709 |
start | 3124866 |
length | 14684 |
strand | + |
type | core |
seq | ttcttttaaactcactactattcatatcattagtcttatattcaagtacatttacttcta cacttattgaggtagtctttccaccaatatcagtagcttttatagtaactttgtatttac caaccttatcagtattaatatttcctataagctctggtgtcaaatcattaccattgctat cctttgctacgatattcagtttacttatatcaaacttatcaccttgataaatatttaaat ttccaacagttattgttggtgcacttgcatccagtgatgatgcacttaaacattgttcta gcgtcttttcatctattcctcctagtgctgtaatcttatcagcacttctaagtacagact tatcactatttccatcaaccaatacaataggtgcatttttagctatagaagaaccagcaa ctgcatctactaattgataacctttagaaagataaaattcttttgctgaactataaaaat gttttataacttttttattagtctcaaatctatcttctccagctaatctaactgaattag tttttttaactaaatcattacttattatctcctctgaaccaagagcataacattgcacac cttcttttttctcaaatggaacatttttaccattagttaaaattataggtgctccatctc ttgatgctactgatgacgcactcatagcatctgcttcacctgtataaccattagttataa aaaccttatctataggttttattgaagctatttcttttgctataagataacttgtttcaa ttctatcattaccacctattcttttgacttctatccctttttgctttaattcattttcaa ctgattttcctattgaatcttcagttcctattatataaaccttctttacatcttttaaca ttttttctgtgtctgatggtatactgtttctttgtgataataatataggtgctttaactg ttcctgctaatccacttgcacttaatccatcagctagtgtattatctgtatttactaata ctacattttcatatgtttgtttctgtgcaattttggcagctgtctcatatctatctttcc cttgtatcttttctatacttgaaagtgcattgatatttggtgctcctgccattattaatg atattgccaatcctattgataatactctcttatttaccttcatcaaactcctcctactaa tttttttatataattcagctaatcataaattacatcctcagtagtaattccctcaaaatt tataaactactaaaacaaaaaacacctaaaataccataacctgtaaagcaataacaaaac agattacaaaaagtactttagatgtgattttcattttataatatcagtaaattaacaaaa aaacaagatttatggaattttttacaagctaccttcattgccatttaaaaactcttgagt agcatgcacttgaccatcagataatatataaagcccaaatccagtactataaaactcatc actaagcatgtttgcattgtactctggagatttcttccacacctcaaatatagcctttgc caagtcttttgcatcttgtgtagtttgaacgttcttagaatctatataaatatatgctat attttcctcacttctcattccaaactcagaaaatacttgtggagcattttttccatctat ataatgtgcaaatacttttttatccatcatatacttagaccatgcatttgccataccttc tagcctactagacactaccaaaggctctttgcctttttcttttctataggaattgattaa gttatacatttcagtagataccatttttttaaattctgggctgttgtaatcatgagattt gtcatccaacacttttatttctactctttttcctgtactttttccccattcgtctgtagc ttttaatgtcaatatatatgtacctactctatttgtatctataaacccatcaacttctat tggtaataccttccctgtgttatctttagctactatatttaacttgccagtgtcaaactt ttcacccttatatacctctgtacttccaactgtaattgttgggggttgtccatttgactt tgaagcatttatacactgttgtattaccttctcatttatttcacctacagaggttatatt cttagctccttctaatacagttttatcgcttccatcatttactagtaccattggagagtt tttagtaagtggtgcagctgctattgcatctactaattggtatccatctgatacatagaa tccatctgcactattaaaaaagtagtctattacgtttttgttagtttcaaatcggtcagt tccttctattcttactgagtttgtatttttaactagaggattactcattatctcctctga acctatacaatatgattgaatattttttacatcaaaaggcacactctttccatctgtaag tatgattggagctccatctctagtagctactgatgatacactcattgcatctgcttctcc actatatgcattagttaatagtactttatccactttttttatagttgctatttctttagc tattaaatagcttgtttttagtctatcttctccaccaattctttttacttctatattttt agaatctagttctttttctactgatttacttatagtatcttctgtacctattatatatgc ttttttgatattttttagacatctatttgtgtctgctggtatcttattttgttgtgtaaa tagtattggagcttttgtagctcctgataatccacttgcacttaatccatctgcaagtga tttttctgtatttactaaaattactgtttcataagtctgtttatcagctatctttgctgc tgtttcatatctatctttaccgtatattttttctactactgatgatgcatttacactttt gaagtttactaagattaatgatactgctagacctaatgataatatttttttgttcatttt catatccccctgatgatttttatattttatatttatattgtgattattttccatttattt tctctttattttccatatattatagagtatatatgatatgaatatatctcgtctatatat tagtgttttattttattaaatttaaaaaattatttttaacttctttttaaacatattcaa aattgaatttatatttatatatataaaagatatctgctttatttaaaattaaacttaata tagctcaaattattatacattttaacctcaatattattagattgttaagataatgaaaat aaaataagaatgcatttaaatatataactttatatctaaatacattcttattttctattt acttaatatttatttttcaattaaactcttaatcttgtctattacagatgaggctattcc tccacctacttcaaacaactttgatgaatttttaccttttaatgacgattcttgtgattt atctaacgtatttgtagcaagtataactggtgaattgtttttagctgctaatggtccaac tgctaaagcgtctataagtttgtcttgatttgcaactacaactccatctagcttagattg agagtagaatttatctattactttggcattcgtctcttgtctagtttgacctgccaccct attgtttgatatatctttgtttgctatttttccaacttgttcaatagccttgttagatat tttttctactccaccaataaaatatatatttgacaccttatttgatttaataaattgttc agcttcattatctacaccatctttttgtgtaagtactattggagttttttctttaccagc cagtgatgctattgataatgaatcagcttctccatttcctgctcctatatacaacttgct cacattattcgtcctatctatttcttttgctatattaatagaagtttgatatcttgtatc tccacctattctttgtactgatatttttgaatttacagctttgatagcttcaacaactga atttggcattgagttgtttccacctatcacaactacttttgatggatttagccttttcaa ttcttctacagttttttgaggaagcttttcatttgatgataaaagaatcggtgagttttt tacactagcaagtggtgtagctgtaagcccatccaccatacttttatcttctccatttac tattacaactgtatctgattttgtccaaccactttgagatattttgatagctgtctcaaa tctatcagcaccttttaattttttgactgtgacattagatgtagaatcacttgaatttcc tcctccagagcttccaccactagatgagccgcctgaattacttcctccaccattatttcc accactaccattatctggtggtaattcatccggttttgataattcattttcaactatgta ttctaaactttttggaagtgtaacttcaacatatttgtttattgtagcttttcttccctt agttgttttttgtgctaatccaagttttaatattacatttgaaccactttcttgtgtttc tttactaacaatagaatagtttatcctaatattgtttaataaatattcaagtgcttcact tttctctaccttatacttttcagggtcatttttactagaaccagttccaccaattggttt tacttcactctcattaataagggtaaatattaatccttcatcagagcttatattttcata atccactgttttgttgttatatgttacaatttttaaagctggtttatcacttgttccttt tcctaaaactttatagtcagcatttgagttactgccagatttttttacagatattcttcc tatattcaatctatttccgtctagtaaatcttcatttgatgtaacgtatatatctaatgt agttgtattacttgatttgttgtattctgctctacaagtagcatttgcatttccactttt tatctgagattttatattatcagaccaagtaatcttttctttctgctcattatctactac ttcaacctcaccttgtacttttatactggcttgaaatgaatatactatgttttctactga gtccacagatatatctatagtatttactttctcatacgtttttgttccttgtaaaactgg agctgcatatgcacatgtagcactaccagttacagctactgccatagttgatactgctat agttcttataaaagattttcttttattcattaacacccgtccttatctatcattaactaa gtggataaatttacttatccacctagcttttatatttaatttataaattaccttaaactt atagttacatttatatactttacttttaatatctactattttaaaactattctagtacct aatcttattagatatacaatgttagtgttagtatttttacgtttttagagttccacctac tatttatctctaacaatattaccctttactttattgcttacagttataaccttcttatta ctgatatcaatagcatttcttgtagcttttctagctttactattactatcagtaagactt attgtctttaactcatcataattcttagctcctacaggtacatacattgtatcacttaca aatctttgacctactggagtatctccttgaaggtcattgtatctatatagttcagcctta accttatcacttaaagaatcaaagttttcttttggcatatagtaaacccatgtaccttta ctgatttcacctagttcacctttttctggaacttctgcaaataaaagtgcttctccagat atagtcttattgtttttatctataagtagtggtaaattaaatgctggatttccactgtat tcacctgtaataactattgaacctgctggaatcttacctgtttcatcttcacttgtgcta gagtcatcactttgatatacataatcttctgctaattttccaattccattagtacgagtt tggtctgcattattcattgtgccaatttctatattatcacctggaggtcctattatatct aattctgcaacttctatattagacttattatttgagattagttttacatatctagcttgg tatgtccaaagtttaccatctttattaaatgtaactctagcttcattatcttggtctttt cctccaccaactaaatcttgtccatattcaaaagttccttgacttacatcttcccagttc tttttatcattacttacttgtatcttgtaattagttaaaggattgtatgttgtgctagta ttctttctaaagttaaataatccttttaatgaaaacttcctagcttctgcctctggtttt gtatattttagtcctactataggtaatgtttctttcatgtctactattatatatggattt tcttctacatttatatcagggtctttttgagggtctttgttccactctgctttacttatt atctttcctttatatgtagtacttgcatcattatcttttatattatcaatttcaggattt tgtaatggtccatgtgagtcattttcagttctaacatcaccgtcagaaacagtatttgtt atgaatgaccatgctgatttatttattttcccttcatctgataattttacagtaccaact tcaaattcttctgttggatttaggtgataatcatatgcaactaccttatatgtaaatgct ctgttattaagaggagatatattatcagtaaatttagtcttactatttccttttgcatcc acaaatccaactgttctgtattttacctgtgttccattttcaccatctaaataatttcca tcacttcttattatttcgtatcctagtatcttatctttatccttatctacatctaggtct atagatattttattagatttaactagagaaccactttgtattccatcagaaaaactagca cttactttagtatcttttgccatactagctatattttcatttaaaatctttcttctagct tcgtcatttacatattgtatctttcttgattctttttcgtagttcttactatccattata ctgtttaattctggtgtaatttctactccccatgccttaaagtaatctcttaaatctttt tcaacaacacttgatgccattgctactagcatttggtcttttggtaaactattaattggg tcactacttgaaagtgctctgtattttcttgaaatctttgcataaaatgtatcattactt aaatcagcatctgagttattctttaacattgaacccgtaaaatcatcatcataagctaga tgtaattgccataacattccaagcctttcaaatacattgcttggtatacctaagctattt gaagttacatgctcatatatcttatccattgttgaaccttcaagtcttgaatgtgtctta tcatcaaaggtctgagcaagtaaagcaagtacattgttactagtttcgctatatgtcatc tttccaatatctgtaacatgtcctatctcatgacctattccccatccaaataagtttcct cctgtagcttttccactatcatctatttggaaaggtactccattcataagccctggaact gaaccatattctactcctacatgtaatccagaagcatacataaatgctccaataaacatt ctttggtattttatgttcatacgagattttggagccatatcatttttagttaagttaaat tcattatcatctacagttccattaccatctaaatcttgtgttttaaatactcctctttct gagtaaactaaatccattatttgttcccatgcaagcatactattatataatctatctact tgtgtatttaaatcagcatttccttttgatatcccttgatatacagctgttgcaggaaca tttaatgttactttatcactttcaatatctgtagtgtttaacacaccagttttttctgaa tatccatatgaattaccaacatttgttcctggataatatggttctccttttacagcatct ttatatttagctaattcttctatatatgcttttatctttttcttagattcagaaactccc gcaggactcttatcatttattgttccatttagattaagatgtggtatcttagtagctcct gctacacgtacttttatatctcctccacttggagtatcttcagcatatcttatgtataaa cttcctccacattctatatctaaactatgaagtttgcttaattgaattacattttttcca gttttaagatttatttctccactcttatatgcaccagattctccatagtactgtgtatat atcaacttaggagtttttccacttttacttccaacatatactgtgatttcatctcctgct ctagcagctactcctaatgcctgccagtcattttgcatacctaaattattggaatttaca gtatactgtccgtttttatctttatattttcctaatttatttatttcttgatttacagtc gttacatcagtaagtgtggctctatcattatataagtcttgagctaattttaattctctc tcaataactgtcttatatggatgatattctccactagctttatctggagtatttaatcta tcttttaattcagttattttttcttgagttacatcttcttttaattcaacttgtaggtca tccataaatagatttcttacatcatcttctatactgtcatactcataaaacttaagttct gatatattagacttatatgaataggatgaacaaacacttacttgtatcttggtagcagtt attggttcttttaatctaaccattacatacttattattatttacagggtctgtctttgtt tcaaaaggaacatcccccagattgtgtaattgaccattttcatcccaatatcgtacctca aagtcatttattgtcttatcagaaacatcaaaacgaggtgtagccataaaagtatccata gtataagatttatcaaaagttattattggtcctctattcgttccctcagctgcattatat gttgggaatgtccaatgtgttgtaaagtccccatctactacattgaatttatcaaatgga tttttatcactatattcacttttgtcatatcctgctggataagtaacatctacaatgtga tttgttggtattccaaatccaccattctctttaggagtattaattaatctatagttaggt gttgttggtgcatccatgctttcagttgtacctatatatgttttagacattccactagtt cccaagtggttagtagctgtcattctaacttcatatgttgtattatccttaagaccttct atctttgaacttgtcccacgaataagcttatcattgtattttatccaagacccattagag cctttttctttatagtacaagtcaaaatctttagcttgtttatgatttttccagcttaca tcaagagatttaaatttacctttaacatttataccttctggtggttctggttttgtgtct ggaacaacttgaaattctaatatactatctgggctaaattgtataggtttatagtttgaa tctacattttctggtactccgtctaagttttctggtgttgcatctttataaccactagac caatctccatttaaagattgtatgctaactctatatagtccatatgcttctatatctcta acttctattgtatttttactagtttgtaattttttagtagataatacttttcccttacta tcaattttgtctagtataagttcgtatgctgatacatttacttcattattccaataaaaa gatactttttcatttccaacagcagtgctagtcaatattttatttattttaggtatgttc atctctggctttggtatttctttatatacattgtttaaaaattcaacttttgatatttct gcaagatttctatcgtttgctgttgtagctgttatttttatagttatcttttttactgct acttgtttaccaagatttattactatatcactattttgaacatctgcatatgtttctaat gctgacctactatatgtagatgttgtagagttatcatctttactgatattaccctcttct tttggagtatcttcatctgaattaggtttatccattgatgaattttctttatcattattt ttatcttgattggtattagagtttacttcttgtttatcgctattttcctgttgtttatca ttactttcatctttattatttgagttattatcagtctggtttatattttcatctttatta tttacttcttcttgatttacttcttcttgttcgttatttacttcctcttgttgctcctca tcttttaagtttttcatatattctttgttttcataaggaatctgttgaacattaccatcc ttgtcagtaacctcaactattccttttgctggagcagtaccttctggagcttttatattg atgacttccatattaagtgcttctgataaagctatatccattactgctggtttttcctca gatatttcatcattttttgaagatattgtaactccattattttctccactaaataaattt tctacattaccattaatatctacatcactatttccttttaattcaaccttacttgtatct actataggattggtagatactatactttctaggctttttgcatcttcactttgtcctaaa tttttctgtacataatctaagtcaacaatatctacctttccatctctatttaaatcaaat tctcttttatttgaatctatattctctaaaaccttattataatcactcttatctacttta ccgtctccatttacatcacccattaagaacaattcataatttaaaggtttatttttatta tctacacttgctctattgcttaataagactctttgtgaataacttgatatatcaatgtct ttaatttctttgttcttaaatccagctccagagacttctacattgtattttccaacaggt aaattattaaatacaatattataatatgatacattctcatctttattttttatttcactt ctacttgcagataatttttttatagtatattctatattatctgtcccaacatttactgtt cctgaatctttttctccaagctttattattccactattgttactatcatcttttaatcgt aactgcatattagtcatactttctgactcgttattttttattggcagtgaaaaatttaaa tctacttcaagactcccccttaacttttctgtaactgatttttcaactgcccttagcttc ccctctaatataggttctgcaaaaacgtttagtggtgcactacacatagatactgctagt acacaagatattgcctttttcatgaaataacaatcctcccttaataaatatctaattttt catgaatttaaatactataagtttcagacaataaaaaaagacactcaaagagaatcttaa ttataaaataaaaagactttactctttttagcaactggctgatatggctttaaaagcttt aatccctatagttttgcgtcattagatttccctaattttgccatttaattttcactactt tcttacccattttatactatatttaaactttttaatacaatttttttagattaaattata aaaaaataacatttatattaatttattaatataaatgttattttccattataatttaatt atttatatagcttccttacaagcataattttgtgtatattttcttattctttatatcttc cataaaattcatgtgtagcatatagattcttatctcctgttatagctataccaaatccca ttatttcataccctttatgcaacatattagttccttcttctggatttgtcttccactcat taaaaataaagtttcctatatcatctgcatctctatttgtatatacaggtttatctggaa ttttatatttaattatattttcaccttgaactgctatatatccaggtttaatctcactcc aatctaagtatttcaaaaaagtagaatatgaattttttccatttatcgtatgagataaag tcttcttatttgccattaaattagaccaatcatttgctagaccctctaatctgcttgcta cagataacgctcttactccattctcttttctatactgctttgtaagagcatatactttac cctttattctctctttaaatgctctatcatttggattgtaatataaaccttgttgatttg gtgaagcttgatttatacattgcttgataacattctgatttatacctcctagtacagtca atttgtctgcaccacttaaaatactcttgttactgccattttcaactaaaactacaggag cattttttgctattgtagaggcagccaaagcgtctgttaattgtaagcctttacttagat aaaattctttactatttttataaaactcttgtataactatcttattagtttcaaatctat ctgtgccacccaatctaatagaatttgtgctcttaactaattcgtcgctgattatttcac tagaaccaagcgcataactctttaagcctgtcgtgtcaaatcccacactatttccatctg taagtattataggtactccatctctagcagctactggtgatgcacttatcgcatctgctt ctcctgtaaagccattggctataattactttatctattggcttaatttctttgatttttt cagctatttttatacttgtatcaaatctattttcaccaaagattctttgtacaatcttct ttttggatagtaactgattctcaacatttttacttattgttgattctgagcctattatat acacagtctttgctttgtttaatctttccatagttgtgtttggaatctggttttgttttg tcatcaaaataggcgcatttaaggctccagctaaaccacttgcacttagaccatctgcta agctattatctgagttgactagtattgctgtattgtagttttgcttatctgctatttttg ctgctgtctcgtatctgtcattcccttttatttgctcaacggatgtcaacgcatttacca taggagtatttaccattactaaaaatagtgtaagtcctatagctaatatctttttactat tcttcatattattttctacccccaatgtacttttcatattttttattagtactcatactt atttttaatcaaaagttacaattttgttaccatattttatatatgataccatagttatcc atacaactcaaacaatatacctaaagtttttattctctataaattcaaaacattataatt tattttatttaattaagttataagttcaaaataatttatgttagtaatatgtttaatcat tataagaagtatctttttataataatttttgcaatatgaatttctcaacattataatcaa aaaataaaataaggtatctcaatctaattctaaatgagacaccttatttttattatttta tcttgttatttgtatattttataatatctacactatatcttacatattaacgcattgtat aatcatatattatctaaataaacttttaatattaattcctatatcttattagttcttagt aaataagtttattttttctgctattttttcaatagcgtttttagctattccttcacctat ttgtactaacttagtagcattcttaagtcttaactcaactacttcttcttgtgatttaga aagttcttctgtagttaatactattggagcctttgaactagctgcaagtggtgctgctgt aagtgcatcaactaattgtccatttccacctacataaccatcttttgctacatatgcttt agttgcacctgcatagtatttattgattactttagcattagtatcttttctattttctcc agctaatctttcaactttattatttaaatctatatcaactaatttgtcttcaacttcttt tgatacagaattttctccacccactatttctaattcttttccttttaataatttttcagc atttgcatctaattcgttacctgtaactattattggagcaccaaattgagcagctctagc tgatatactcatagcatcagcttctccatttccacctactacaaaagcagtcttaaatgt atcttttaattgttttgctatttctaaagaagtttcaaatctatcttctccagaaactct ctcaactttacttacacctaatttagaaagtttttcttcagtttcttttgatactttaga ttctccacctactatatatattttcttagaagatagattacttccaagtactcttaatat ttcagcttctatttctgatggtagtgaatcttttttagataataatattggtgcattttt ttgagaggcaagtggtgctgatgctaatccatcaactatagcatcttctccaactaaaat tatagcttctgcttctccatctttgaatctctctttactaacttctactgctgttgtaaa tcttgaatcaccagataaaacttctacttttaattcttttccaccttttacatcagttaa tactttgtgtaagtctctaactaacttatgttttttacttgaaac |