Block details
fasta C_difficile_CD00075_1A_020265.fasta
contig u00000crpx_c_020265
start 3088174
length 14785
strand +
type core
seq ggaattagaaagtccttctaagtttttagaaacttgtaatggctctttacctttttcttt
tctatatgaatttaccaaactatacatttcactagaaaccattcttttaaactcactact
attcatatcattagtcttatattcaagtacatttacttctacacttattgatgtagtctt
tccaccaatatcagtagcttttatagtaactttgtatttacccaccttatcagtatcaat
atttcctataagctctggtgtcaaatcgttaccattgctatcctttgctacgatattcag
tttacttatatcaaacttatcaccttgataaatatttaaatttccaacagttattgttgg
tgcacttgcatccagtgatgatgcacttaaacattgttctagtgtcttttcatctattcc
tcctagtgctgtaatcttatcagcacttctaagtacagacttatcactatttccgtcaac
taatacaataggtgcattttttgctatagaagaaccagcaactgcatctactaattgata
acctttagaaagataaaattcttttgccgaactataaaaatgttttataacttttttatt
agtctcaaatctatcttctccagctaatctaactgcattagtttttttaactaaatcatt
acttattatctcctctgaaccaagagcataacattgcacaccttcttttttctcaaatgg
aacatttttaccattagttaaaattataggtgatccatctcttgatgctactgatgacgc
actcatagcatctgcttcacctgtataaccattagttataaaaaccttatctataggttt
tattgaagctatttcttttgctataagataacttgtttcaattctatcattaccacctat
tcttttaacttctattcctttttgctttaattcattttcaactgattttcctattgaatc
ttcagttcctattatataaaccttctttacatcttttaacattttttctgtgtctgatgg
tatactgtttctttgtgataataatataggtgctttaactgttcctgctaatccacttgc
acttaatccatcagctagtgtattatctgtatttactaatactacattttcatatgtttg
tttctgtgcaattttggcagctgtctcatatctatctttcccttgtatcttttctatgct
cgaaagtgcattgatatttggtgctcctgccattattaatgatattgtcaatcctattga
taatactctcttatttaccttcatcgaactcctcctactaatttttttatataattcagc
taatcataaattacatcctcagtagtgattccctcaaaatctataaactactaaaacaaa
aaacacctaaaataccatagcctgtaaagcaataacaaaacagattacaaaaagtacttt
agatgtgattttcattttataatatcagtaaattaacaaaaaaacaagatttatggaatt
ttttacaaactaccttcattgccatttaaaaactcctgagtagcatgcacttgaccatca
gataatatataaagcccaaatccagtactatagaactcatcactaagcatgtttgcattg
tactctggagacttcttccacacttcaaatatagcctttgccaagttttttgcatcttgt
gtcgtttgaacgttcttagaatctatataaatatatgctatattttcctcacttctcatt
ccaaactcagaaaatacttgtggagcattttttccatctatataatgtgcaaatactttt
ttatccatcatatacttagaccatgcatttgccataccttctagcctactagatactacc
aaaggctctttgcctttttcttttctataggaattgattaagttatacatttcagtagat
accatttttttaaattctgggctgttgtaatcataggatttatcatccaacacttttatt
tctactctttttcctgtactttttccccattcgtctgtagcttttaatgtcaatatgtat
gtacctactctatttgtatctataaacccatcaacttctattggtaataccttcccagtg
ttatctttagccactatgtttaacttgccagtgtcaaacttttcacccttatatatctct
gtacttccaactgtaattgttggtggttgtccatttgactttgaagcatttatacactgt
tgtattaccttctcatttatttcacctacagaagttatattcttagctccttctaataca
gttttatcgcttccatcatttactagtaccattggagagtttttagtaagtggtgcagct
gctattgcatctactaattggtatccatctgatacatagaatccatctgcactattaaaa
aagtagtctattacatttttgttagtttcaaatcggtcagttccttctattcttactgag
tttgtatttttaactagagggttactcattatctcctctgaacctatacaatatgattga
atattttttacatcaaaaggcacactctttccatctgtaagtatgattggagctccatct
ctagtagctactgatgatacactcattgcgtctgcttctccactatatgcgttagttaat
agtactttatccactttttttatagttgctatttctttagctattaaatagcttgttttt
agtctatcttctccaccaattcttttgacttctatatttttagaatctagttctttttct
actgatttacttatagtatcttctgtacctattatatatgcttttttgatattttttaga
catctatttgtgtctgctggtatcttattttgttgtgtaaatagtattggagcttttgta
gctcccgataatccacttgcacttaatccatctgcaagtgatttttctgtatttactaaa
attactgtttcataagtctgtctatcagctatctttgctgctgtttcatatctatcttta
ccgtatattttttctactactgatgatgcatttacacttttgaagtttactaagattaat
gatactgctagacctaatgataatatttttttgttcattttcatatccccctgatgattt
ttatattttatatttatattgtgattattttctatttattttctctttattttccatata
ttatagagtatatatgatatgaatatatctcgtctatatattagtgttttattttattaa
atttaaaaaattatttttaacttctttttaaacatattcaaaattgaatttatatttata
tatataaaagatatctgctttatttaaaattaaacttaatatagctcaaattattataca
ttttaacctcaatattattaaattgttaagataatgaaaataaaataagaatgcatctaa
atatataactttatatctaaatacattcttattttcgatttacttaatatttatttttca
attaaactcttaatcttatctactacagatgaggctattcctccacctacttcaaacaac
tttgatgaatttttaccttttaatgatgattcttgtgatttatctaacgtatttgtagca
agtataactggtgaattgtttttagctgctaatggtccaactgctaaagcatctataagt
ttatcttgatttgcaactacaactccatctagtttagattgagagtagaatttatctatt
actttggcattcgtctcttgtctagtttgacctgccaccctattgtttgatatatctttg
tttgctatttttccaacttgttcaatagccttgttagatattttttctattccaccaata
aagtatatatttgacaccttatttgatttaataaattgtacagcttcattatctacacca
tctttttgtgtaagtactattggagttttttctttaccggccagtgatgctattgataat
gaatctgcttctccatttcctgcccctatatacaatttgcttacattattcgtcttatct
atttcttttgctatattaatagaagtttgatatcttgtatctccacctattctctgtact
gatatttttgaatttacagctttgatagcttcaacaactgaatttggcattgagttgttt
ccacctatcacaattacttttgatggatttagccttttcaattcttctacagttttttga
ggaagcttttcatttgatgataaaagaatcggtgagttttttacactagcaagtggtgta
gctgtaagcccatccaccatgcttttatcttctccatttactattacaactgtatctgat
tttgtccaaccactttgagatattttggtagctgtctcaaatctatcagcaccttttaat
tttttgactgtgacattagatgtagaattacttgaacttcctcctccagaacttccacca
ctagacgagccgcctgaattacttccaccaccattatttccaccattgccattatctggt
ggtaattcatccggttttgataattcattttcaactatgtattctaaactttttggaagt
gtaacttcaacatatttatttattgtagcttttcttcccttagttattttttgtgctaat
ccaagttttaatattacatttgaaccactttcttgtgtttctttactaacaatagaatag
tttatcctaatattgtttaataaatattcaagtgcttcacttttctctaccttatacttc
tcagggtcatttttactagaaccagttccaccaattggttttacttcactctcattaata
agggtaaatattaatccttcatcagagtttatattttcataatccactgttttgttgtta
tatgttacaatttttaaagctggtttatcgcttgttccttttcctaaaactttatagtca
gcatttgagttactgccagatttttttacagatattcttcctatattcaatctatttccg
tctagtaaatcttcatttgatgtaacatatatatctaatgtagttgtattacttgatttg
ttgtattctactctacaagtagcatttgcatttccactttttatctgagattttatatta
tcagaccaagtaatcttttctttctgctcattatctactacttcaacctcaccttgtact
tttatactggcttgaaatgaatatactatgttttctactgagtccacagatatatctata
gtatttactttctcatacgtttttgttccttgtaaaactggagctgcatatgcacatgta
acactaccagttacagctactgccatagttgatactgctatagttcttataaaagatttt
cttttactcattaacacccgtccttatctatcattaactaagtggataaatttacttatc
cacctagcttttatatttaatttataaattaccctaaacttatagttacatttatatact
ttgcttttaatatctactattttaaaactattctagtacctaatcatattagatatacaa
tgttagtattagtatttttacgtttttagagttccacctactatttatctctaacaatat
taccctttactttattgcttacagttataaccttcttattactgacatcaatagcatttc
ttgtagcttttctagctttactattactatcagtaagacttattgtctttaactcatcat
aattcttagctcctacaggtacatacattgtatcacttacaaatctttgacctactggcg
tatctccttgaaggtcattgtatctatatagttcagccttaaccttatcacttaaagaat
caaagttttcttttggcatatagtaaacccatgtacctttactgatttcacctaattcac
ctttttctggaacttctgcaaataaaagtgcttctccagatatagtcttattgtttttat
ctataagtagtggtaaattaaatgctggatttccactgtattcacctgtaataattattg
aacctgctggaatcttacctgtttcatcttcacttgtgctagggtcatcactttgatata
cataatcttctgctaactttccaattccattagtacgagtttggtctgcattattcattg
tgccaatttctatattatcacctggaggtcctattatatctaattctgcaacttctatat
tagacttattgtttgagattagttttacatatctagcttggtatgtccaaagtttatcat
ctttattaaatgtaactctagcttcattatcttggtcttttcctccaccaactaaatctt
gtccatattcaaaagttccttgacttacatcttcccagttctttttatcattacttactt
gtatcttgtaattagttaaaggattgtatgttgtgctagtattctttctaaagttaaata
atccttttaatgagaacttcctagtttctgcctctggttttgtatattttagtcctacta
taggtaatgtttctttcatgtctactattatatatggattttcttctacatttatatcag
ggtctttttgagggtctttgttccactctgctttacttattatctttcctttatatgtag
tacttacatcattatcttttatattatcaatttcaggattttgtaatggtccatgtgagt
cattttcagttctaacatcaccgtcagaaacagtatttgttatgaatgaccatgctgatt
tatttattttcccttcatctgataattttacagtgccaacttcaaattcttctgttggat
ttaggtgataatcatatgcaactaccttatatgtaaatgctctgttattaagaggagata
tactatcagtaaatttggccttactatttccttttgcatccacaaatccaactgttctgt
attttacctgtgttccattttcaccatctaaataatttccatcacttcttattatttcgt
atcctagtatcttatctttatccttatctacatctaggtctatagatattttattagatt
taactagagaaccactttgtattccatcagaaaaactagcacttactttagtatcttttg
ccatactagctatattttcatttaaaatctttcttctagcttcgtcatttacatattgta
tctttcttgattctttttcatagttcttactatccattatactgtttaattctggtgtaa
tttctactccccatgccttaaagtaatctcttaaatctttttcaacaacacttgatgcca
ttgctactagcatttggtcttttggtaaactattaattgggtcactacttgaaagtgctc
tgtattttcttgaaatctttgcatagaatgtatcattacttaaatcagcatctgagttat
tctttaacattgaacccgtaaaatcatcatcataagctagatgtaattgccataacattc
caagcctttcaaatacattgcttggtatacctaagctatttgaagttacatgctcatata
tcttatccattgttgaaccttcaagtcttgaatgtgtcttatcatcaaaggtctgagcaa
gtaaagcaagtacattgttactagtttcgctatatgtcatctttccaatatctgtaacat
gtcctatttcatgacctattccccatccaaataagtttcctcctgtagcttttccactat
catctatttggaaaggtactccattcataagccctggaactgaaccatattctactccta
catgtaatccagaagcatacataaatgctccaataaacattctttggtattttatgttca
tacgagattttggagccatatcatttttagttaagttaaattcattatcatctacagttc
cattaccatctaaatcttgtgttttaaatactcctctttctgagtaaactaaatccatta
tttgttcccatgcaagcatactattatataatctatctacttgtgtatttaaatcagcat
ttccttttgatattccttgatatacagctgttgcaggaacatttaatgttactttatcac
tttcaatatctgtagtgtttaacacaccagttttttctgaatattcatatgaattaccaa
tatttgttcctggataatatggttctccttttacagcatctttatatttagctaattctt
ctatatatgcttttatctttttcttagattcagaaactcccgcaggactcttatcattta
ttgttccatttagattaagatgtggtatcttagtagctcctgctacacgtacttttatat
ctcctccacttggagtatcttcagggtatcttatgtataaacttcctccacattctatat
ctaaactatgaagtttgcttaattgaattacattttttccagttttaagatttatttctc
cactcttatatgcaccagattctccatagtactgtgtatatatcaacttaggagtttttc
cacttttacttccaacatatactgttatttcatctcctgctctagcagctactcctaatg
cctgccagtcattttgcatgcctaagttattggaatttacagtatactgtccgtttttat
ctttatattttcctgatttatttatttcttgatttacagtagttacatcagtaagtgtgg
ctctatcattatataagtcttgagctaattttaattctctatcaataactgtcttatatg
gatgatattctccactagctttatctggagtatttaatctatcttttaattcagttattt
tttcttgagttacatcttcttttaattcaacttgtaggtcatccataaatagatttctta
catcatcttctatactgtcatactcataaaacttaagttctgatatattagacttatatg
aataagatgaacaaacacttacttgtatcttagtagcagttattggttcttttaatctaa
ccattacatacttattattatttacagggtctgtctttgtttcaaaaggaacatccccca
gattgtgtaattgaccattttcatcccaatatcgtatctcaaagtcatttattgtcttat
cagaaacatcaaaacgaggtgtagccataaaagtatccatagtataagatttatcaaaag
ttattattggtcctctattcgttccctcagctgcattatatgttgggaatgtccaatgtg
ttgtgaagtctccatctactacattgaatttatcaaatggatttttatcactatattcac
ttttgtcatatcctgctggataaacaacatctacaatgtgatttgttggtattccaaatc
caccattctccttaggagtattaattaatctatagttaggtgttgttggtgcatctatgc
tttcagttgtacctatatatgttttagacattccactagttcccaagtggttagtagctg
tcattctaacttcatatgttgtgttatccttaagaccttctatttttaaacttgtcccac
gaataagcttatcattgtattttatccaagacccattagagcctttttctttatagtaca
agtcaaagtctttagcttgtttatgatttttccagcttacatcaagagatttaaatttac
ctttaacatttataccttctggtggttctggttttgtgtctggaacaacttgaaattcta
atatgctatctgggctaaattgtataggtttatagtttgagtctacattttctggtactc
catctaagttttctggcgttgcatctttataaccactagaccaatctccatttaaagatt
gtatgctaaccctatatagtccatatgcttctatatctctaacttctattgtatttttac
tagtttgtaattttttagtagataatacttttcccttactatcaattttatctagtataa
gttcgtatgctgatacatttacttcattattccaataaaaagatactttttcatttccaa
cagcagtgctagtcgatattttatttattttaggtatgttcatctctggctttggtattt
ctttatatacattgtttaaaaattcaacttttgatatttctgcaagatttctatcgtttg
ctgttgtagctgttatttttatagttatcttttttactgctacttgtttaccaagattta
ttactatatcgctattttgaacatctgtatatgtttctaatgctgccctactatatgtag
atgttgtagagttatcatctttactgatattatccccttcttttggagtatcttcatctg
aattaggtttatccattgatgaattttctttatcattatttttatcttgattggtattag
agtttacttcttgtttatcgctattttcctgttgtttatcattattttcatctttattat
ttgaattattatcagtctgatttttattttcatctttattatttacttcttcttgattta
cttcttcttgttcgttatttacttcctcttgttgctccttatcttttaagtttttcatat
attctttattttcataaggaatctgttgaacattaccatcttcgtcagtaacctcaacta
ttccttttgctggagcagtaccttctggagcttttatattgatgacttccatattaagtg
cttctgataaagctatatccattactgctggtttttcctcagatatttcatcattttttg
aagatattgtaactccattattttctccactaaataaattttctacattaccattaatat
ctacatcactatttccttttaattcaaccttacttgtatctactataggattggtagata
ctatactttctaggctttttgcatcttcactttgtcctaaatttttctgtacataatcta
agtcaacaatatctacctttccatctctatttaaatcaaattctcttttatttgaatcta
tattctctaaaaccttattataatcactcttatctactttaccgtctccatttacatcac
ccattaagaataattcataatttaaaggtttatttttattatctacacttgctctattgc
ttaataagactctttgtgaataacttgatatatcaatgtctttaatttctttgttcttaa
atccagctccagagacttctatattgtattttccaacaggtaaattattaaatacaatat
tataatatgatacattctcatctttattttttatttcacttctacttgcagataattttt
ttatagtatattctatattatctgtcccaatatttactgttcctgaatctttttctccaa
gctttattattccactattgttactatcatcttttaatcgtaactgcatattagtcatac
tttctgactcgctattttttattggcagtgaaaaatttaaatctacttcaagattccccc
ttaacttttctgtaactgatttttcaactgcccttagcttcccctctaatataggttctg
caaaaacatttagtggtgcactacacatagatactgctagtacacaagatattgcctttt
tcatgaaacaacaatcctcccttaataaatctctaatttttcatgaatttaaatactata
agtttcagacaataaaaaaagacactcaaagagaatcttaattataaaataaaaagactt
tactctttttagcaactggctgatatggctttaaaagctttaatccctatagttttgcgt
cattagatttccctaattttgccatttaattttcactactttcttacccattttatacta
tatttaaactttttaatacaatttttttacattaaattataaaaaaataacatttatatt
aataaattaatataaatgttattttccattataatttaattatttatatagcttccttac
aagcataattttgtgtatattttcttattctttatatcttccataaaattcatgtgtagc
atatagattcttatctcctgttatagctataccaaatcccattatttcataccctttatg
caacatattagttccttcttctggatttgtcttccactcattaaaaataaagtttcctat
atcatctgcatctctatttgtatatacaggtttatctgaaattttatatttaattatatt
ttcaccttgaactgctatatatccaggtttaatctcactccaatctaagtatttcaaaaa
agtagaatatgaattttttccatttatcgtatgagataaagtcttcttatttgccattaa
attagaccaatcatttgctagaccctctaatctgcttgctacagataacgctcttactcc
attatcttttctatactgctttgtaagagcatatactttaccctttattctctctttaaa
tgctctatcatttggattgtaatataacccttgttgatttggtgaagcttgatttataca
ttgcttgataacattctgatttatgcctcctagtacagtcaatttgtctgcaccacttaa
aatactcttgttactgccattttcaactaaaactacaggagcattttttgctattgtaga
ggcgaccaaagcgtctgttaattgcaagcctttacttagataaaattctttactattttt
ataaaactcttgtataactatcttattagtttcaaatctatctgtgccacccaatctaat
agaatttgtgctcttaactaattcgtcgctgattatttcactagaaccaagcgcataact
ctttaagcctgtcgtgtcaaatcccacactatttccatctataagtattataggtactcc
atctctagcagctactggtgatgcacttatcgcatctgcttctcctgtaaatccattggc
tataattactttatctattggcttaatttctttgattttttcagctatttttatacttgt
atcaaatctattttcaccaaatattctttgtacaaccttctttttggataataactgatt
ctcaacatttttacttattgttgattctgagcctattatatacacagtctttgctttgtt
taatctttccatagttgtgtttggaatctgattttgctttgtcattaaaataggcgcatt
taaggctccagctaaaccacttgcacttagaccatctgctaagctattatctgagttgat
tagtattgctgtattgtagttttgcttatctgctatttttgctgctgtctcatatctgtc
attcccttttatttgctcaactgatgtcaacgcatttaccataggagtatttaccattac
taaaaatagtgtaagtcctatagctaatatctttttactattcttcatattattttctac
ccccaatgtacttttcatattttttattagtactcatacttatttttaatcaaaagttac
aattttgttaccatattttatatatgataccatagttatccatacaactcaaacaatata
cctaaagtttttattctctataaattcaaaacattataatttattttatttaattaagtt
ataagttcaaaataatttatgttagtaatatgtttaatcattataagaagtatcttttta
taataatttttgcaatatgaatttctccacattataatcaaaaaataaaataaggtatct
caatctaattctaaatgagacaccttatttttattattttatcttgttatttgtatattt
tataatatctacactatgtcttacatattaacgcattgtataatcatatattatctaaat
aaacttttaatattaattcctatatcttattagttcttagtaaataagtttattttttct
gctattttttcaatagcgtttttagctattccttcacctatttgtactaacttagtagca
ttcttaagtcttaactcaactacttcttcttgtgatttagaaagttcttctgtagttaat
actattggagcctttgaactagctgcaagtggtgctgctgtaagtgcatcaactaattgt
ccatttccacctacataaccatcttttgctacatatgctttagttgcacctgcatagtat
ttattgattactttagcattagtatcttttctattttctccagctaatctttcaacttta
ttatttaaatctatatcaactaatttgtcttcaacttcttttgatacagaattttctcca
cccactatttctaattcttttccttttaataatttttcagcatttgcatctaattcgtta
cctgtaactattattggagcaccaaattgagcagctctagctgatatactcatagcatca
gcttctccatttccacctactacaaaagcagtcttaaatgtatcttttaattgttttgct
atttctaaagaagtttcaaatctatcttctccagaaactctctcaactttacttacacct
aatttagaaagtttttcttcagtttcttttgatactttagattctccacctactatatat
attttcttagaagatagattacttccaagtactcttaatatttcagcttctatttctgat
ggtagtgaatcttttttagataataatattggtgcatttttttgagaggcaagtggtgct
gatgctaatccatcaactatagcatcttctccaactaaaattatagcttctgcttctcca
tctttgaatctctctttactaacttctactgctgttgtaaatcttgaatcaccagataaa
acctctacttttaattcttttccatcttttacatcagttaatactttgtgtaagtctcta
actaacttatggtttttacttgaaac