Block details
fasta C_difficile_CD00129_1A_020478.fasta
contig u00000crpx_c_020478
start 2889957
length 10382
strand +
type core
seq aaagataaagaaaaggagaaagaaaagatcaaaaacttgaaaaatctgaaaaaggagtat
taggatcatataaaaaagattctatagagataagcaaatattctcagacaagaaattatt
tttatgattatcaaatagaagcaaattcttgagaaaaagaatatagagaacttcgaaatg
ctatatcaaaaaataaaatagataaacctatgtatgtatatcattttgaatctccagaaa
aatttgcatttaataaagtaataagaacaaaaaatcaaaacgaaatttcattagaaaaat
ttaatgagtttaaagaaactatacaagacaaattattaccatacaacagataattcaact
gctgttcaaaatagcaatggataatcatgaaatactggattaagtataaacaaaggagaa
tctgcatatataaatgcaaatattagatactacaacacaggtactgcacctatgtacaaa
gtgacaccaacaacaaatttagtgttagatggagatgcattatcaactatcaaagcacaa
gaaaatcaaattggcaataatctatctcctggaaatacttatctcaaaaaaggattttca
cctatggctcttaacacaatgtatcaatttagttctagactgattcctataaattataat
taattaaaaaaattagatgatggaaagcaaattaaattagaaacaacacaagtaagtgga
aattttggtacaaaaaatggttctggacaaatagtaacagaatgaaatagttggtaagac
gatataggtcaaattgacagtatttctgtatctattatattagatacagaaaatgaatct
tacaaaagaagaattactgctaaaagtttacaggtcccagaagataaaacacctgaactt
acaattggagaagcaattgaaaaaacttttggcactactaaaaaagatggtttgttatat
tttaataatataccaatagatgaaagttgtgttgaactcatatttgatgataatataggc
aataagattaaagacagtttaaaaactttgtctgataaacaaatatgtaatgttaaactt
gaaagaggaatgaatatacttataaaaacaccaacttactttactaattttgatgattac
aataattaccctagtatatggagtaatgttaatactacaaatcaagatggtttaaaaggc
tcagcaaatagattaaatggtgagacgaagattaaaatacctatgtctgaactaaaacct
tataaacgttatgtttttagtaaaattcaaaaaatcctttaacatataattcaataattg
taaatataaaagtaaaagaagaaaaaacggattatttggtactagaacaaggatatacaa
aatttagttatgaatttgaaactactgaaaaagattcttctaatatagatataacattaa
ttgatagtgatacaatatacttagataacttatctattacagagctaaatagtactcctg
aaatacttgatgaaccagaagttaaaattccaactgttcaagaaataatagttacacata
aaatatattctgcagattttaaatttaatccaagtacaataaatgcttatataaatggta
tgtattttacaccaacataaactaataaagaagctctcgattatgtccaaaaatatagag
ttgaagctactttacaatattttggatttaaagatattggaactaaagataaagaattgc
gtaattatttaggagatacaaatcaacctaaaactgattgtgttaatcttaggagttatt
ttacaggtggagaaaatattatgacatacaagaaattaagaatatatacaattactcaag
atgatagagagttattggttcttagtgttgattagtatcaaatgatttaaatttatcccc
acaatacaatatgtatttaccttataaagtattaaaaaattaactttataaggtattttt
tatttaaatattatcttcttctaatatattcttttttagaactatattgtattaaaaaga
taattatctgtatcatatcacctatatataaacataaattcatttaattatataaattta
aaaaatatttttttgatatattattgacaattttcattataagagttaaaattaactcat
aaattacatattgggtataaaatacaatgtatgttagaagttgtttcagaaggctatggt
tttctgatttttttatgctcagtagtgatatgcaaaaaagacaaagttgacatcagttaa
cttttacctttattctactttccccaaagtaagaataatctaacccctttgagatgagca
aaagctcatctttttttattatcaaaagatgctgtctcaaaatagagataatcctctttt
tcattgttgaaatgattaaaatatattttatttcatacaaaaaagagtgcctcatgaaca
aaagttcactttgagactctctctttcatatcatatacctttttaataactttaaaattt
atttatcaagtaaagatagctaataattagtatcttctctctataaatccaactttttta
taaacttttctaagagtttttctagcttgtttttcggctttttctgctcccatactatat
attttttctaaataatctttattattaagaaggtcaacatatttttctcttataggtctt
aaagcttctgatactacttcagccacatcttctttaaatatgccataaccctttccttca
tacatgtttacaatctcttctacactctttttacttaaattagaatatatatcaattaga
tttttaatacctggttgttcatcattgtattttacaacacctaaagaatcagtaacactt
ctttttatctttctctttatagaatctgaatcatctgctaatagtataaatgcattttca
tttgaatcggatttactcatttttttagttggctcttgcaaactcatcactcttgctcca
ccttttgggtagtatccttctggaactacaaaagtaggtgaaaatctattattaaatcta
tttgctaaatcacgagctaattctaaatgttgtttttggtcatctccaactggaactagg
tcagtttgatacaacaatatgtcagcagccataagaactggatatgtgaataaacctgca
tttagatttgcttcactcttttgtgatttatctttgaattgagtcattctacttaattca
cccatataagtcatagtattcaatacccacataagttcaacatgctctttgacatgtgat
tgtataaatatagtatttttttctgggtctaatccacaagctatatattgagcaagtaat
tctatagtattggctcttaaaactttagggtcttgaggtactgttattgcatgcaaatca
actatactataataacaatcataattgtcttgaagttcagtccagttttttatagctcct
aaataatttcctaaagtcattttgcctgatggctgtgcaccacttaatataacttttttt
tcactcatttttttgtacctccttatatatttatattgattttaacatatttaaaactat
gtctttagagttattggcagcatcatgtacaaatacatcataagtaacatcagcacttcc
atctgccttatcagacattgctcttattattacaaatggagtattatttaaatagcatac
atgagctatagctccaccttccatttctccacaatatccaccaaaatcatttactaattc
ttcttttaattctttagaatttataaatttatctcctgtaactactcttccttttaatac
tttatgagtctttacttcttccacagaagatttgtaagcagcatctataagtctttcatc
tgctttaaatacagaagtcttcattcttggtataactcccttagggtctccaaatgctgt
agtgtctacatcatactgtatagcatcagttgatattactatatcattaacatcaagttt
ttcgtttaaagctcctgcaacacctgtattaacaatagcatcaaccttaaattcgcttat
tagtatctgggcacaaagagcagagttaaccttacctatgccacactttactaacactac
attcttaccttccaaaattcccttataaaattctaagctagctttttttatagtctctct
aatatccattaaatcaactaaaatactaacttcttcatccattgcacctataattcctat
tacgttcatttttcctcctaaattttctatattaaaaaatccgtcctaaatcaataggac
ggatatattttccgtggtaccacctaaatttatatacactcaaaattgaatatatatatc
ttaatatatgctataacgtgcatacacgatatcaaatactctgtaatcttaaattacatt
tcattttactcctcaaagacccattcaataaatactttttattaagttctcagcatcctt
aattctctgtgcaaaaatatatttatttactatttcttatctcaggatttaatttattaa
tttctttattttataatattccttacactataaattgtcaactatatattataatatcca
aaagaaatttttaaaatacattttatttagctgttttcttttcatatctattccataacc
atagaccagataatataactagaagacctccaccaatcatctctatctcatatataacat
tttcagcaaatgtaggcataactggtgctgcagataataatatacccactacagttacaa
ctaaaaccatttttgctaaacctaggcaagtacttgttgattttgccatagtataaggtc
taatttcatctggtctctcttttcttagtttaatataagaagcatataacaatacatatg
ggaataatgcagttaatgctgtcatagttacaagaacattgtatatagcatcaacagaag
gcattaatgtagtcaccaatagtattatagtaactattattgcttgaagtataactgctt
tagaaggtatcttgtgttcatttacctctactaaactatctggaaatattccttttttaa
cactaccaaataacatttttattggtgatgctatgtaaagaactattgctcctaatactg
aaaaagctataccaaaagctattaattgaaccaaccaagaaccaattcctaaagacgcac
aaacagcagaaagtgcatctaatacacctttagaagcagtaatttggtctggtggtatta
tcattgttattgcaattgaacctaatacatataatgaagctactattccagctgatatta
atattgccttagggaagttcttttcaggcttatctatttctgttatgaagttagcagcag
tctctgctcctgctaaaccaaacattatagctgatatagcaacaaatgcatccatattaa
gttttggagtcattgaagctattgtgtatgtagaagctatatcatgttttttcaatacaa
atactgctacaaatgaaaatattataagtatagcacttggtattgttgaacctaatgcac
ctgtattagtaaatatttttgtaaaacttattcctttagttgctataagagataatgccc
agaatattattaaagataatataagtacaaacatcttattatcagcaagggctggatttc
ctattgtataagaaacatttactgctaagaaagttaaaaatgaagaataccaaaatattt
tagctgtccagtttaaccaagaaactaaaaatccatacttttctccaaaggcttccttaa
cccaatcgtaaagacctccatcacctttttgatatgtagaagctaattcagcacaaatta
aagctcctggtacaaagtatataaatgagaataataaccacataggtattgcacctaatc
ctaaaccaaagcttgatgctgtagatttagctatccatcttataccatataaagctgata
cattcataaataccaaactccataggcctatttttttcttttccatcctaatttaatttc
ccctctctattaattattttaaatttaatttcaaaattaataaaatagattcattattat
taaactgatatttttcaaaatatttgcatattcaaaaacagttttaataataaaccttaa
atactttgaaatcaaatcttattaaaaatgataaatttaaaagttttaccactttaattc
taatgatactaaatttttaaaattgtttcaatattattttattataaaattttatttatt
atttttcattagtatataaaaagataaaatacataactttatagacttaatttattactt
ttatagaattttcacaataaaaagtcattttacttccgtatttaatgcaaaagtagagat
taaacttaatataaaaaatatataacaaattttttttatatttctagaagaaaagtatac
tcttttttgtttaataatgctaaaattgatttgtattgaattttgattaggaggaaatta
ttatgaaagctcaaagattaaatgctgtacttgaacaaatgaaaaaagatgatatttctc
aaatgttagtaagtgaccctacttctatattttatcttacaggagtactaatccatccag
gcgaaagactattagcattatacttaaatttaaatggcaataataaattatttataaatg
aattattcccagtttcagaagatttaggtgttgaaatggtttggtttaatgatactcaaa
atccagtagaaataataactgaacatatagacaaaaatgctactatgggtgttgataaaa
actggccagctagattcttattaaacttaatagaattaggtggaggaagtaagtttgtaa
attcatcttatataatagatactttaagaatgtgtaaagatgaagaagaaaaagagttaa
tgagaatagcttcaaaattaaatgacaaggctatggaacaacttaaagctactgtttctg
gtgaacttacagaaaaacaacttgttggtaaattatctaaaatatatgaagacctaggta
ctgatggattttcatttgaccctattataggttttggacctaatggagctaatccacatg
gtgaacctggaaatgcacttgtgaaaccaggagatgcaataatattagatataggttgta
taaaagataactattgtgctgatatgacaaggactgtattctataaagaaatacctgaaa
aaggtagagaaatatttgaaatagttcttgaagctaataagagagctgaagctattgtaa
aaccaggtgttagattctgtgatatagatgctgctgctcgtgactacataactgaaaagg
gatatggacagtacttcactcatagaactggtcactctataggacttgaagttcatgata
aaggagatgtatcttctataaatacagatactgtacaaccaggaatgatattctctatag
agccaggtatatatttaccaggtgagttcggagttagaatagaagatttagtacttgtta
ctgaagatggttgtgagatattaaacaagcatgacaaagaaatatgtgtagttggttaat
tctaaaatcaatttgataaaattaaaaagccatataaaaatgttttaaacatttttatat
ggctttaatttctcaatctattatttatttcaatccattatttatattgcagtatttata
ttgcagttattaagattgcaccctttgaagtatatgtccccatcactgaaccaatttcac
agattacaacatctttgtattttacattcttttccataactttccttaccttttgagcct
tttctgggcaattagcatgtcctataaataaaaccttttcttctttatctttaatttttg
actctactaaagtaattagctttttcaaactgtttccttcacctcttgccttatctatag
gagttacaacgccatctgcaacttgtattatcgccttaaaatttaaggtatttataattt
ttcctgctattggatttattctaccacccttaatagcattttctaaagtttcaagtgttc
caaaaaatggaggattatctttatatttatttattattgaaacaatctcttcaatttctt
ttccttcttttattaatattgctgcttttaacactaattgtcctattccaattgacccac
taagtgaatctataacctcaactttcttgttatttccttccttttcaaacatatcttttg
ctaaaagtgcactattataagtcccagataatcctgaacttatattaatcactaatacac
tttcttcctgacaatggtatgcttctaaaaatttatcaggagaaggacatgatgtttttg
gtagtactttactctcactcatttttctatagaaagtttcattatctatttcctttccag
atatataactttcttctccaaaagatacatttaaaccaacaacttctatgttgtattttt
ctattatatcatcaggtaagtcacatgcactgtccactatcaattttattttatccatat
taacctcactataagatattattttatttattcagtcggtcgtacgaccgatttaattat
tattttatatattgaatgaaaaaaagtcaatagatatagattctcgctttattgacaata
aatatccataagcttataatgttattaatttgttataaatatacatggaaaggtaggttt
tatgaaaacaaataatatgaaacaggctattttatcatctgcaaccaatttaatagccaa
aaatggagttcaaaatactagccttgctgatattgcaaaagatgtaaatataagtaaagg
tactttgtattatcactacgcatctaaagatgatattatatatgatattgcggatactca
tttagaagttataactagtgctatactaaactgtgtaaaaaatgtcaaatcaaaaaattc
tcaaatagaaatggttaacttaatcttagagaaaatatctactatagaaagtcgtggtag
ggtacatatgtatcttatttgtgaggcaattacttcaaataatgatttaaaggaaagaat
aagattaaaatatattgaatggagaactactcttaaatctgaaattgttgaatcactaga
aaaatataatagtagcgaaaatgaacaggatgctgaatcattttcttttttactcatgtc
aatagttgatggtttagttgtccaaagtttattaaaaacagaaaaaataccttatgaaaa
tatagcttcttttttagttaatcattggatttaaacttaatacttagataattaataaaa
gtgaactatttaagttatctactttaacagttcactttcttatttattctcaataatttt
tacttaaaacattcaatttttatttaaaccttcatggaatcacaaaataaaaatctctta
taaatttaaaatgtttttatttatgttcatgtgtatgcccatctgaatgttcatgaccat
gtgtatgtgtatgctcatgagtacctgaaaaaccatcatcatgattatggtcgtgaccta
caccatttacatgctcatgttcatgcccatgactgtgagaatgttgatgtgaatgttcat
ggttatctcctccacagcatccttctcctccagtcccacaacacccacttgtatgtggat
tatgatgatttcttactacaaatctctctcttaacataattcttatacctcctagtatat
tattgagtacttcatgtaccccattaactacagtatacatctaactaggtataatctcaa
tacatatggcattttttaacatatataatcttaaagaaatttatccttaaaacctccacc
ttttacttcttcaacgttattgacagaaataaaagcttcactatccatatcataaattaa
atctttaaatttacctatttcatttgcagatattatgcaataaatcatctttttcttatt
ttgtgtatatgcaccttctgcctccaaaaaagtgactcctctacccattttattcattat
cactttggatatttcatcatatttatttgatattaaaagtatagatttttttctatcaaa
gcaatcttttcctatatccatagtaaaagaaattatatacattgtaattaaagtgtacat
caccaatttagctccaaataaaaaagctcctgcacatactacaaaaaaattaataaataa
aaatgtatttttcataggtatatcatactttcttttcattatggctgctattatatcaag
tcctccagcagtagctcttgctttaaaagttaaccccatacctataccagttaatgcacc
acc