Block details | |
---|---|
fasta | C_difficile_CD00129_1A_020478.fasta |
contig | u00000crpx_c_020478 |
start | 2889957 |
length | 10382 |
strand | + |
type | core |
seq | aaagataaagaaaaggagaaagaaaagatcaaaaacttgaaaaatctgaaaaaggagtat taggatcatataaaaaagattctatagagataagcaaatattctcagacaagaaattatt tttatgattatcaaatagaagcaaattcttgagaaaaagaatatagagaacttcgaaatg ctatatcaaaaaataaaatagataaacctatgtatgtatatcattttgaatctccagaaa aatttgcatttaataaagtaataagaacaaaaaatcaaaacgaaatttcattagaaaaat ttaatgagtttaaagaaactatacaagacaaattattaccatacaacagataattcaact gctgttcaaaatagcaatggataatcatgaaatactggattaagtataaacaaaggagaa tctgcatatataaatgcaaatattagatactacaacacaggtactgcacctatgtacaaa gtgacaccaacaacaaatttagtgttagatggagatgcattatcaactatcaaagcacaa gaaaatcaaattggcaataatctatctcctggaaatacttatctcaaaaaaggattttca cctatggctcttaacacaatgtatcaatttagttctagactgattcctataaattataat taattaaaaaaattagatgatggaaagcaaattaaattagaaacaacacaagtaagtgga aattttggtacaaaaaatggttctggacaaatagtaacagaatgaaatagttggtaagac gatataggtcaaattgacagtatttctgtatctattatattagatacagaaaatgaatct tacaaaagaagaattactgctaaaagtttacaggtcccagaagataaaacacctgaactt acaattggagaagcaattgaaaaaacttttggcactactaaaaaagatggtttgttatat tttaataatataccaatagatgaaagttgtgttgaactcatatttgatgataatataggc aataagattaaagacagtttaaaaactttgtctgataaacaaatatgtaatgttaaactt gaaagaggaatgaatatacttataaaaacaccaacttactttactaattttgatgattac aataattaccctagtatatggagtaatgttaatactacaaatcaagatggtttaaaaggc tcagcaaatagattaaatggtgagacgaagattaaaatacctatgtctgaactaaaacct tataaacgttatgtttttagtaaaattcaaaaaatcctttaacatataattcaataattg taaatataaaagtaaaagaagaaaaaacggattatttggtactagaacaaggatatacaa aatttagttatgaatttgaaactactgaaaaagattcttctaatatagatataacattaa ttgatagtgatacaatatacttagataacttatctattacagagctaaatagtactcctg aaatacttgatgaaccagaagttaaaattccaactgttcaagaaataatagttacacata aaatatattctgcagattttaaatttaatccaagtacaataaatgcttatataaatggta tgtattttacaccaacataaactaataaagaagctctcgattatgtccaaaaatatagag ttgaagctactttacaatattttggatttaaagatattggaactaaagataaagaattgc gtaattatttaggagatacaaatcaacctaaaactgattgtgttaatcttaggagttatt ttacaggtggagaaaatattatgacatacaagaaattaagaatatatacaattactcaag atgatagagagttattggttcttagtgttgattagtatcaaatgatttaaatttatcccc acaatacaatatgtatttaccttataaagtattaaaaaattaactttataaggtattttt tatttaaatattatcttcttctaatatattcttttttagaactatattgtattaaaaaga taattatctgtatcatatcacctatatataaacataaattcatttaattatataaattta aaaaatatttttttgatatattattgacaattttcattataagagttaaaattaactcat aaattacatattgggtataaaatacaatgtatgttagaagttgtttcagaaggctatggt tttctgatttttttatgctcagtagtgatatgcaaaaaagacaaagttgacatcagttaa cttttacctttattctactttccccaaagtaagaataatctaacccctttgagatgagca aaagctcatctttttttattatcaaaagatgctgtctcaaaatagagataatcctctttt tcattgttgaaatgattaaaatatattttatttcatacaaaaaagagtgcctcatgaaca aaagttcactttgagactctctctttcatatcatatacctttttaataactttaaaattt atttatcaagtaaagatagctaataattagtatcttctctctataaatccaactttttta taaacttttctaagagtttttctagcttgtttttcggctttttctgctcccatactatat attttttctaaataatctttattattaagaaggtcaacatatttttctcttataggtctt aaagcttctgatactacttcagccacatcttctttaaatatgccataaccctttccttca tacatgtttacaatctcttctacactctttttacttaaattagaatatatatcaattaga tttttaatacctggttgttcatcattgtattttacaacacctaaagaatcagtaacactt ctttttatctttctctttatagaatctgaatcatctgctaatagtataaatgcattttca tttgaatcggatttactcatttttttagttggctcttgcaaactcatcactcttgctcca ccttttgggtagtatccttctggaactacaaaagtaggtgaaaatctattattaaatcta tttgctaaatcacgagctaattctaaatgttgtttttggtcatctccaactggaactagg tcagtttgatacaacaatatgtcagcagccataagaactggatatgtgaataaacctgca tttagatttgcttcactcttttgtgatttatctttgaattgagtcattctacttaattca cccatataagtcatagtattcaatacccacataagttcaacatgctctttgacatgtgat tgtataaatatagtatttttttctgggtctaatccacaagctatatattgagcaagtaat tctatagtattggctcttaaaactttagggtcttgaggtactgttattgcatgcaaatca actatactataataacaatcataattgtcttgaagttcagtccagttttttatagctcct aaataatttcctaaagtcattttgcctgatggctgtgcaccacttaatataacttttttt tcactcatttttttgtacctccttatatatttatattgattttaacatatttaaaactat gtctttagagttattggcagcatcatgtacaaatacatcataagtaacatcagcacttcc atctgccttatcagacattgctcttattattacaaatggagtattatttaaatagcatac atgagctatagctccaccttccatttctccacaatatccaccaaaatcatttactaattc ttcttttaattctttagaatttataaatttatctcctgtaactactcttccttttaatac tttatgagtctttacttcttccacagaagatttgtaagcagcatctataagtctttcatc tgctttaaatacagaagtcttcattcttggtataactcccttagggtctccaaatgctgt agtgtctacatcatactgtatagcatcagttgatattactatatcattaacatcaagttt ttcgtttaaagctcctgcaacacctgtattaacaatagcatcaaccttaaattcgcttat tagtatctgggcacaaagagcagagttaaccttacctatgccacactttactaacactac attcttaccttccaaaattcccttataaaattctaagctagctttttttatagtctctct aatatccattaaatcaactaaaatactaacttcttcatccattgcacctataattcctat tacgttcatttttcctcctaaattttctatattaaaaaatccgtcctaaatcaataggac ggatatattttccgtggtaccacctaaatttatatacactcaaaattgaatatatatatc ttaatatatgctataacgtgcatacacgatatcaaatactctgtaatcttaaattacatt tcattttactcctcaaagacccattcaataaatactttttattaagttctcagcatcctt aattctctgtgcaaaaatatatttatttactatttcttatctcaggatttaatttattaa tttctttattttataatattccttacactataaattgtcaactatatattataatatcca aaagaaatttttaaaatacattttatttagctgttttcttttcatatctattccataacc atagaccagataatataactagaagacctccaccaatcatctctatctcatatataacat tttcagcaaatgtaggcataactggtgctgcagataataatatacccactacagttacaa ctaaaaccatttttgctaaacctaggcaagtacttgttgattttgccatagtataaggtc taatttcatctggtctctcttttcttagtttaatataagaagcatataacaatacatatg ggaataatgcagttaatgctgtcatagttacaagaacattgtatatagcatcaacagaag gcattaatgtagtcaccaatagtattatagtaactattattgcttgaagtataactgctt tagaaggtatcttgtgttcatttacctctactaaactatctggaaatattccttttttaa cactaccaaataacatttttattggtgatgctatgtaaagaactattgctcctaatactg aaaaagctataccaaaagctattaattgaaccaaccaagaaccaattcctaaagacgcac aaacagcagaaagtgcatctaatacacctttagaagcagtaatttggtctggtggtatta tcattgttattgcaattgaacctaatacatataatgaagctactattccagctgatatta atattgccttagggaagttcttttcaggcttatctatttctgttatgaagttagcagcag tctctgctcctgctaaaccaaacattatagctgatatagcaacaaatgcatccatattaa gttttggagtcattgaagctattgtgtatgtagaagctatatcatgttttttcaatacaa atactgctacaaatgaaaatattataagtatagcacttggtattgttgaacctaatgcac ctgtattagtaaatatttttgtaaaacttattcctttagttgctataagagataatgccc agaatattattaaagataatataagtacaaacatcttattatcagcaagggctggatttc ctattgtataagaaacatttactgctaagaaagttaaaaatgaagaataccaaaatattt tagctgtccagtttaaccaagaaactaaaaatccatacttttctccaaaggcttccttaa cccaatcgtaaagacctccatcacctttttgatatgtagaagctaattcagcacaaatta aagctcctggtacaaagtatataaatgagaataataaccacataggtattgcacctaatc ctaaaccaaagcttgatgctgtagatttagctatccatcttataccatataaagctgata cattcataaataccaaactccataggcctatttttttcttttccatcctaatttaatttc ccctctctattaattattttaaatttaatttcaaaattaataaaatagattcattattat taaactgatatttttcaaaatatttgcatattcaaaaacagttttaataataaaccttaa atactttgaaatcaaatcttattaaaaatgataaatttaaaagttttaccactttaattc taatgatactaaatttttaaaattgtttcaatattattttattataaaattttatttatt atttttcattagtatataaaaagataaaatacataactttatagacttaatttattactt ttatagaattttcacaataaaaagtcattttacttccgtatttaatgcaaaagtagagat taaacttaatataaaaaatatataacaaattttttttatatttctagaagaaaagtatac tcttttttgtttaataatgctaaaattgatttgtattgaattttgattaggaggaaatta ttatgaaagctcaaagattaaatgctgtacttgaacaaatgaaaaaagatgatatttctc aaatgttagtaagtgaccctacttctatattttatcttacaggagtactaatccatccag gcgaaagactattagcattatacttaaatttaaatggcaataataaattatttataaatg aattattcccagtttcagaagatttaggtgttgaaatggtttggtttaatgatactcaaa atccagtagaaataataactgaacatatagacaaaaatgctactatgggtgttgataaaa actggccagctagattcttattaaacttaatagaattaggtggaggaagtaagtttgtaa attcatcttatataatagatactttaagaatgtgtaaagatgaagaagaaaaagagttaa tgagaatagcttcaaaattaaatgacaaggctatggaacaacttaaagctactgtttctg gtgaacttacagaaaaacaacttgttggtaaattatctaaaatatatgaagacctaggta ctgatggattttcatttgaccctattataggttttggacctaatggagctaatccacatg gtgaacctggaaatgcacttgtgaaaccaggagatgcaataatattagatataggttgta taaaagataactattgtgctgatatgacaaggactgtattctataaagaaatacctgaaa aaggtagagaaatatttgaaatagttcttgaagctaataagagagctgaagctattgtaa aaccaggtgttagattctgtgatatagatgctgctgctcgtgactacataactgaaaagg gatatggacagtacttcactcatagaactggtcactctataggacttgaagttcatgata aaggagatgtatcttctataaatacagatactgtacaaccaggaatgatattctctatag agccaggtatatatttaccaggtgagttcggagttagaatagaagatttagtacttgtta ctgaagatggttgtgagatattaaacaagcatgacaaagaaatatgtgtagttggttaat tctaaaatcaatttgataaaattaaaaagccatataaaaatgttttaaacatttttatat ggctttaatttctcaatctattatttatttcaatccattatttatattgcagtatttata ttgcagttattaagattgcaccctttgaagtatatgtccccatcactgaaccaatttcac agattacaacatctttgtattttacattcttttccataactttccttaccttttgagcct tttctgggcaattagcatgtcctataaataaaaccttttcttctttatctttaatttttg actctactaaagtaattagctttttcaaactgtttccttcacctcttgccttatctatag gagttacaacgccatctgcaacttgtattatcgccttaaaatttaaggtatttataattt ttcctgctattggatttattctaccacccttaatagcattttctaaagtttcaagtgttc caaaaaatggaggattatctttatatttatttattattgaaacaatctcttcaatttctt ttccttcttttattaatattgctgcttttaacactaattgtcctattccaattgacccac taagtgaatctataacctcaactttcttgttatttccttccttttcaaacatatcttttg ctaaaagtgcactattataagtcccagataatcctgaacttatattaatcactaatacac tttcttcctgacaatggtatgcttctaaaaatttatcaggagaaggacatgatgtttttg gtagtactttactctcactcatttttctatagaaagtttcattatctatttcctttccag atatataactttcttctccaaaagatacatttaaaccaacaacttctatgttgtattttt ctattatatcatcaggtaagtcacatgcactgtccactatcaattttattttatccatat taacctcactataagatattattttatttattcagtcggtcgtacgaccgatttaattat tattttatatattgaatgaaaaaaagtcaatagatatagattctcgctttattgacaata aatatccataagcttataatgttattaatttgttataaatatacatggaaaggtaggttt tatgaaaacaaataatatgaaacaggctattttatcatctgcaaccaatttaatagccaa aaatggagttcaaaatactagccttgctgatattgcaaaagatgtaaatataagtaaagg tactttgtattatcactacgcatctaaagatgatattatatatgatattgcggatactca tttagaagttataactagtgctatactaaactgtgtaaaaaatgtcaaatcaaaaaattc tcaaatagaaatggttaacttaatcttagagaaaatatctactatagaaagtcgtggtag ggtacatatgtatcttatttgtgaggcaattacttcaaataatgatttaaaggaaagaat aagattaaaatatattgaatggagaactactcttaaatctgaaattgttgaatcactaga aaaatataatagtagcgaaaatgaacaggatgctgaatcattttcttttttactcatgtc aatagttgatggtttagttgtccaaagtttattaaaaacagaaaaaataccttatgaaaa tatagcttcttttttagttaatcattggatttaaacttaatacttagataattaataaaa gtgaactatttaagttatctactttaacagttcactttcttatttattctcaataatttt tacttaaaacattcaatttttatttaaaccttcatggaatcacaaaataaaaatctctta taaatttaaaatgtttttatttatgttcatgtgtatgcccatctgaatgttcatgaccat gtgtatgtgtatgctcatgagtacctgaaaaaccatcatcatgattatggtcgtgaccta caccatttacatgctcatgttcatgcccatgactgtgagaatgttgatgtgaatgttcat ggttatctcctccacagcatccttctcctccagtcccacaacacccacttgtatgtggat tatgatgatttcttactacaaatctctctcttaacataattcttatacctcctagtatat tattgagtacttcatgtaccccattaactacagtatacatctaactaggtataatctcaa tacatatggcattttttaacatatataatcttaaagaaatttatccttaaaacctccacc ttttacttcttcaacgttattgacagaaataaaagcttcactatccatatcataaattaa atctttaaatttacctatttcatttgcagatattatgcaataaatcatctttttcttatt ttgtgtatatgcaccttctgcctccaaaaaagtgactcctctacccattttattcattat cactttggatatttcatcatatttatttgatattaaaagtatagatttttttctatcaaa gcaatcttttcctatatccatagtaaaagaaattatatacattgtaattaaagtgtacat caccaatttagctccaaataaaaaagctcctgcacatactacaaaaaaattaataaataa aaatgtatttttcataggtatatcatactttcttttcattatggctgctattatatcaag tcctccagcagtagctcttgctttaaaagttaaccccatacctataccagttaatgcacc acc |