Block details | |
---|---|
fasta | C_difficile_CD00028_1A_020475.fasta |
contig | u00000crpx_c_020475 |
start | 2845322 |
length | 12733 |
strand | + |
type | core |
seq | aagataaagaaaaggctaaagaatgggaaagaaaagaagcagaaagaatagagcaaaaac ttgaaagatctgaaaaagaagcattagaatcatataaaaaagattctgtagaaataagta aatattctcagacaagaaattatttttatgattatcaaatagaagcaaattctcgagaaa aagaatataaagaacttcgaaatgctatatcaaaaaataaaatagataaacctatgtatg tctattattttgaatctccagaaaaatttgcatttaataaagtaataagaacagaaaatc aaaacgaaatttcattagaaaaatttaatgagtttaaagaaactatacaaaacaaattat ttaagcaagatggatttaaagatatttctttatatgaacctggaaaaggtgatgaaaaac ctacaccattacttatgcacttaaaattacctagaaatactggtatgttaccatatacaa atactaacaatgtaagtacattaatagagcaaggatatagtataaaaatagataaaattg ttcgtatagttatagatgggaagcactatattaaagcagaagcatctgttgtaagtagtc ttgattttaaagatgatgtaagtaagggggattcttggggtaaagcaaattataatgatt ggagtaataaattaacacctaatgaacttgctgatgtaaatgattatatgcgtggaggat atactgcaattaataattatttaatatcaaatggtccagtaaataatcctaacccagaat tagattctaaaatcacaaacattgaaaatgcattaaaacgtgaacctattccaactaatt taactgtatatagaagatctggtcctcaagaatttggtttaactcttacttcccctgaat atgattttaacaaactagaaaatatagatgcttttaaatcaaaatgggaaggacaagcac tgtcttatccaaactttattagtactagtattggtagtgtgaatatgagtgcatttgcta aaagaaaaatagtactacgtataactatacctaaaggttctcctggagcttatctatcag ctattccaggttatgcaggtgaatatgaagtgcttttaaatcatggaagcaaatttaaaa tcaataaaattgattcttacaaagatggtactataacaaaattaattgttgatgcaacat tgataccttaatattttttcacataaataatttaatatttttcaaatttaaggaggagaa acaatgaaaatacaaatgaggaataaaaaggtattaagttttttaacacttacagctata gttagtcaagcactagtatatcctgtatatgctcaaactagtacaagtaatcattctaat aagaaaaaagaaattgtaaatgaagatatactcccaaacaatggattaatgggatattat ttcacagatgagcactttaaagatttaaaattaatggcacccataaaagatggtaattta aaatttgaagaaaagaaagtagataaacttctggataaagacaaatcagatgtaaaatct atacgatggacaggaagaataattccttctaaggatggtgaatatacattatcaactgat agagatgatgtcttaatgcaagtaaatactgagagtactatatcaaatacacttaaagtt aatatgaaaaagggtaaagaatataaagttagaatagagctacaagataaaaatttaggt tcaatagataatttatcatcacctaatctttattgggaattagatggtatgaagaaaatt ataccagaagaaaatttattcttaagagattattctaatatagaaaaagatgatccattt atcccaaataacaatttctttgacccaaagttgatgtctgattgggaagacgaagatttg gatacagataatgataatataccagattcatatgaacgaaatggatatactattaaggac ttaattgcagttaagtgggaagatagttttgcagaacaaggctataagaaatatgtatca aattatttagagtcaaatactgctggagatccatatacagattatgaaaaagcttcaggt tcttttgacaaggctataaagactgaagcaagagatccgttagttgcagcatatccaatt gttggagtaggtatggaaaaattaattatatctacaaatgaacatgcctctactgatcaa ggtaaaactgtttccagagctactactaacagtaaaactgaatctaatacagctggtgtg tctgttaatgtaggatatcaaaatggattcacagctaatgtaactacaaattattcccat acaacagataattcaactgctgttcaagatagtaatggagaatcatggaatactggatta agtataaacaaaggagaatctgcatatataaatgcaaatgttagatattacaacacaggt actgcacctatgtacaaagtgacaccaacaacaaatttagtgttagatggagatacatta tcaactatcaaagcacaagaaaatcaaattggcaataatctatctcctggagatacttat cccaaaaaagggctttcacctctagctcttaacacaatggatcaatttagctctagactg attcctataaattatgatcaattaaaaaaattagatgctggaaagcaaattaaattagaa acaacacaagtaagtggaaattttggtacaaaaaatagttctggacaaatagtaacagaa ggaaatagttggtcagactatataagtcaaattgacagtatttctgcatctattatatta gatacagagaatgaatcttacgaaagaagagttactgctaaaaatttacaggatccagaa gataaaacacctgaacttacaattggagaagcaattgaaaaagcttttggcgctactaaa aaagatggtttgttatattttaatgatataccaatagatgaaagttgtgttgaactcata tttgatgataatacagccaataagattaaagatagtttaaaaactttgtctgataaaaag atatataatgttaaacttgaaagaggaatgaatatacttataaaaacaccaacttacttt actaattttgatgattataataattaccctagtacatggagtaatgtcaatactacgaat caagatggtttacaaggctcagcaaataaattaaatggtgagacgaagattaaaatccct atgtctgagctaaaaccttataaacgttatgtttttagtggatattcaaaggatccttta acatctaattcaataattgtaaagataaaagcaaaagaagagaaaacggattatttggta ccagaacaaggatatacaaaatttagttatgaatttgaaactactgaaaaagattcttct aatatagagataacattaattggtagtggtacaacatacttagataacttatctattaca gagctaaatagtactcctgaaatacttgatgaaccagaagttaaaattccaactgaccaa gaaataatggatgcacataaaatatattttgcagatttaaattttaatccaagtacagga aatacttatataaatggtatgtattttgcaccaacacaaactaataaagaagctctcgat tatatccaaaaatatagagttgaagctactttacaatattctggatttaaagatattgga actaaagataaagaaatgcgtaattatttaggagatccaaatcagcctaaaactaattat gttaatcttaggagttattttacaggtggagaaaatattatgacatacaagaaattaaga atatatgcaattactccagacgatagagagttattagttcttagtgttgattagtatcaa atgatttaaatttgtccccacaatacaatatatatttaccttataaagtactaaaaaatt aactttataaggtattttttatttaaatattctcttcttctaacatattcttttttagaa ctatattgtattataaagataattatctgtatcatatcacctatatataaacataaattc atttaattatataaatttaaaaaatatttttttgatatattattgacaatttccattata agagttaaaattaactcataaattacatattgggtataaaatacaatgtatgttagaagt tgtttcagaaggctatggttttctgatttttttatgctcagtagtgatatgcaaaaaaga caaagttgacatcagttaacttttacctttattctactttccccaaagtaagaataatct aacccctttgagatgagcaaaagctcatctttttttattatcaaaagatgctgtctcaaa atagagataatcctctttttcattgttgaagtgattaaaatatattttatttcatacaaa aaagagtgtctcatgaacaaaagttcactttgagactctctctttcatatcatatacctt tttaataactttaaaatttatttatcaagtaaagatagctaataattagtatcttctctc tataaatccaacttttttataaacttttctaagagtttttctagcttgtttttcggcttt ttctgctcccatactatatattttttctaaataatctttattattaagaaggtcaacata tttttctcttataggtcttaaagcttctgatactacttcagccacatcttctttaaatat gccataaccctttccttcatacatgtttacaatctcttctacactctttttacttaaatt agaatatatatcaattagatttttaatacctggttgttcatcattgtattttacaacacc taaagaatcagtaacacttctttttatctttctctttatagaatctgaatcatctgctaa tagtataaatgcattttcatttgaatcggatttactcatttttttagttggctcttgcaa actcatcactcttgctccaccttttgggtagtatccttctggaactacaaaagtaggtga aaatctattattaaacctatttgctaaatcacgagctaattctaaatgttgtttttggtc atctccaactggaactaggtcagtttgatacaacaatatgtcagcggccataagaactgg atatgtgaataaacctgcatttagatttgcttcactcttttgtgatttatctttgaattg agtcattctacttaattcacccatataagtcatagtattcaatacccacataagttcaac atgctctttgacatgtgattgtataaatatagtatttttttctgggtctaatccacaagc tatatattgagcaagtaattctatagcattcgctcttaaaactttagggtcctgaggtac tgttattgcatgtaaatcaactatactataatagcaatcataattatcttgaagttcagt ccagttttttatagctcctaaataatttcctaaagtcattttgcctgatggctgtgctcc actaaatataacttttttttcactcatttttttgtacctccttatatatttatattgatt ttaacatatttaaaactatgtctttagagttattggcagcatcatgtacaaatacatcat aagtaacatcagcacttccatctgccttatcagacattgctcttattattacgaatggag tattatttaaatagcatacatgagctatagctccaccttccatttctccacaatatccac caaaatcatttactaattcttcttttaattctttagaatttataaatttatctcctgtaa ctactcttccttttaatactttatgagtctttacttcttccacagaagatttgtaagcag catctataagtctttcatctgctttaaatacagaagtcttcattcttggtataactccct tagggtctccaaatgctgtagtatctacatcatactgtatagcatcagttgatattacta tatcattaacatcaagtttttcatttaaagctcctgcaacacctgtattaacaatagcat caaccttaaattcgcttattagtatctgggcacaaagagcagagttaaccttacctatac cacactttactaacactacattcttacctttcaaaattcccttataaaattctaagctag ctttttttatagtctctctaatatccattaaatcaactaaaatactaacttcttcatcca ttgcacctataattcctattacgttcatttttcctcctaaattttctatattaaaaaatc cgtcctaaatcaataggacggatatattttccgtggtaccacctaaatttatatacactc aaaactgaatatatatatcttaatatatgctataacgtgcatacacgatatcaaatactc tgtaatcttaaattacatttcattttactcctcaaagacccattcaataaatacttttta ttaagttctcagcatccttaattctctgtgcaaaaatatatttatttactatttcttatc tcaggatttaatttattaatttctttattttataatattccttacactataaattgtcaa ctatatattataatatccaaaagaaatttttaaaatacattttatttagctgttttcttt tcatatctattccataaccatagaccagataatataactagaagacctccaccaatcatc tctatctcatatataacattttcagcaaatgtcggcataactggtgctgcagataataat ataccaactacagttacaactaaaaccatttttgctaaacctaggcaagtacttgttgat tttgccatagtataaggtctaatttcatctggtctctcttttcttagtttaatataagaa gcatataataatacatatgggaataatgcagttaatgctgtcatagttacaagaacattg tatatagcatcaacagaaggcattaatgtagtcaccaatagtattatagtaactattatt gcttgaagtataactgctttagaaggtatcttgtgttcatttacctctaccaaactatct ggaaatattccttttttaacactaccaaataacatttttattggtgatgctatataaaga actattgctcctaatactgagaaagctataccaaaagctattaattgaaccaaccaagaa ccaattcctaaagacgtacaaacagcagaaagtgcatctaatacacctttagaagcagta atttggtctggtggtattatcattgttattgcaattgaacctaatacatataatgaagct actattccagctgatattaatattgccttagggaagttcttttcaggcttatctatttct gttatgaagttagcagcagtctctgctcctgctaaaccaaacattatagctgatatagca acaaatgcatccatattaagttttggagtcattgaagctattgtatatgtagaagctata tcatgttttttcaacataaatactgctacaaatgaaaatattataagtatagcacttggt attgttgaacctaatgcacctgtattagtaaatatttttgtaaaacttattcctttagtt gctataagagataatgcccagaatattattaaagataatataagtacaaacatcttatta tcagcaagagctggatttcctattgtataagaaacatttactgctaagaaagttaaaaat gaagaataccaaaatattttagctgtccagtttaaccaagaaactaaaaatccatacttt tctccaaaggcttccttaacccaatcgtaaagacctccatcacccttttgatatgtagaa gctaattcagcgcaaattaaagctcctggtacaaagtatataaatgagaataataaccac ataggtattgcacctaatcctaaaccaaagcttgatgctgtagacttagctatccatctt ataccatataaagctgatacattcataaataccaaactccataggcctatttttttcttt tccatcctaatttcatttcccctctctattaattattttaaatttaatttcaaaattaat aaaatagattcattattattaaactgatatttttcaaaatatttgcatattcaaaaacag ttttaataataaaccttaaatactttgaaatcaaatcttattaaaaatgataaatttaaa agttttaccactttaattctaatgatactaaatttttaaaattgtttcaatattatttta ttataaaattttatttattatttttcattagtatataaaaagataaaatacataacttta tagacttaatttattacttttatagaattttcacaataaaaagtcattttacttccgtat ttaatgcaaaagtagagattaaacttaatataaaaaatatataacaaactttttttatat ttctagaagaaaagtatactcttttttgtttaataatgctaaaattgatttgtattgaat tttgattaggaggaaattattatgaaagctcaaagattaaatgctgtacttgaacaaatg aaaaaagatgatatttctcaaatgttagtaagtgaccctacttctatattttatcttaca ggagtactaatccatccaggtgaaagattattagcattatacttaaatttaaatggcaat aataaattatttataaatgaattattcccagtttcagaagatttaggtgttgaaatggtt tggtttaatgatactcaaaatccagtagaaataataactgaacatatagacaaaaatgct actatgggtgttgataaaaactggccagctagattcttattaaacttaatagaattaggt ggaggaagtaagtttgtaaattcatcttatataatagatactttaagaatgtgtaaagat gaagaagaaaaagagttaatgagaatagcttcaaaattaaatgacaaggctatggaacaa cttaaagctactgtttctggtgaacttacagagaaacaacttgttggtaaattatctaaa atatatgaagacctaggtactgatggattttcatttgaccctattataggttttggacct aatggagctaatccacatggtgaacctggaaatgcacttgtgaaaccaggagatgcaata atattagatataggttgtataaaagataactattgtgctgatatgacaagaactgtattc tataaagaaatacctgaaaaaggtagagaaatatttgaaatagttcttgaagctaataag agagctgaagctattgtaaaaccaggtgttagattctgtgatatagatgctgctgctcgt gactacataactgaaaagggatatggacagtacttcactcatagaactggtcactctata ggacttgaagttcatgataaaggagatgtatcttctataaatacagatactgtacaacca ggaatgatattctctatagagccaggtatatatttaccaggtgagttcggagttagaata gaagatttagtacttgttactgaagatggttgtgagatattaaacaaacatgacaaagaa atatgtgtagttggttaattctaaaatcaatttgataaaattaaaaagccatataaaaat gttttaaacatttttatatggctttttaatttctcaatctatgatttatttcaatccatt atttatattgcagttattaagattgcaccctttgaagtatatgtccccatcactgaacca atttcacagattacaacatctttgtattttacatccttttccataacttcccttaccttt tgagccttttctgggcaattagcatgtcctataaataaaaccttttcttctttatcttta atttttgactctactaaagtaatcagctttttcaaactgtttccttcacctcttgcctta tctataggagttacaacgccatctgcaacttgtattatcgccttaaaattcaaggtattt ataatttttcctgctattggatttattctaccacccttaatagcattttctaaagtttca agtgttccaaaaaatggaggattatctttatatttatttattattgaaacaatctcttca atttcttttccttcttttattaatattgctgcttttaacactaattgtcctattccaatt gacccactaagtgaatctataacctcaacttttttgttatttccttccttttcaaacata tcttttgctaaaagtgcactattataagtcccagataatcctgaacttatattaatcacc aatacactttcttcctgacaatggtatgcttctaaaaatttatcaggagaaggacatgat gtttttggtagtactttactctcactcatttttctatagaaagtttcattatctatttcc tttccagatatataactttcttctccaaaagatacatttaaaccaacaacttctatgttg tatttttctattatatcatcaggtaagtcacatgcactgtccactatcaattttatttta tccatattaacctcactataagatattattttatttattcagtcggtcgtacgaccgatt taattattattttatatattgaatgaaaaaaagtcaatagatatagattctcgctttatt gacaataaatattcataagcttataatgttattaatttgttataaatatacatggaaagg taggttttatgaaaacaaataatatgaaacaggctattttatcatctgcaaccaatttaa tagccaaaaatggagttcaaaatactagccttgctgatattgcaaaagatgtaaatataa gtaaaggtactttgtattatcactacgcatctaaagatgatattatatatgatattgcgg atactcatttagaagttataactagtgctatactaaactgtgtaaaaaatgtcaaatcaa aaaattctcaaatagaaatggttaacttaatcttagagaaaatatctactatagaaagtc gtggtagggtacatatgtatcttatttgtgaggcaattacttcaaataatgatttaaagg aaagaataagattaaaatatattgaatggagaactactcttaaatctgaaattgttgaat cactagaaaaatataatagtagcgaaaatgaacaggatgctgaatcattttcttttttac tcatgtcaatagttgatggtttagttgtccaaagtttattaaaaacagaaaaaatacctt atgaaaatatagcttcttttttagttaatcattggatttaaacttaatacttagataatt aataaaagtgaactatttaagttatctactttaacagttcactttcttatttattctcaa taatttttacttaaaacattcaatttttatttaaaccttcatggaatcacaaaataaaaa tctcttataaatttaaaatgtttttatttatgttcatgtgtatgcccatctgaatgttca tgaccatgtgtatgtgtatgctcatggctatgctcatgagtacctgaaaaaccatcatca tgattatggtcgtgacctacaccatttacatgctcatgttcatgcccatgactgtgagaa tgttgatgtgaatgttcatggttatctcctccacagcatccttctcctccagtcccacaa cacccacttgtatgtggattatgatgatttcttactacaaatctctctcttaacataatt cttatacctcctagtatattattgagtacttcatgtaccccattaactacagtatacatc taactaggtataatctcaatacatatggcattttttaacatatataattaacatatataa tcttaaagaaatttatccttaaaacctccaccttttacttcttcaacgttattgacagaa ataaaagcttcactatccatatcataaattaaatctttaaatttacctatttcatttgca gatattatgcaataaatcatctttttcttattttgtgtatatgcaccttctgcctccaaa aaagtgactcctctacccattttattcattatcactttggatatttcatcatatttattt gatattaaaagtatagatttttttctatcaaagcaatcttttcctatatccatagtaaaa gaaattatatacattgtaattaaagtgtacatcaccaatttagctccaaataagaaagct cctgcacatactacaaaaaaattaataaataaaaatgtatttttcataggtatatcatac tttcttttcattatggctgctattatatcaagtcctccagcagtagctcttgctttaaaa gttaaccccatacctataccagttaatgcaccaccataaatacactgtagcatagtatca tctattgggaaatatttagcaatatcttgtgttagccccagtgctagagaaaacagtaac atattgacaaaacttattagcaaaaatttattatcaaaatactttctagctataataaat attggtatgttcatcaagaaacttgatattccctgatttataccaaataatttgtataat ataacacaaattccagctactcctccacttaataacttggctggtgctagatataaattt attcctaaggttgatagaatcatacccaatataatcagaccatattgtaaaaatatgtta ttctgaacctccca |