Block details | |
---|---|
fasta | C_difficile_CD00084_1A_020911.fasta |
contig | u00000crpx_c_020911 |
start | 2282290 |
length | 14862 |
strand | + |
type | core |
seq | tatttattaaaaattaatcaatttgaaaaaagttatgatataggaatttttaaaaatgaa caatcaatatataaatttattgcaaaaataccctttgtaaaaaaagataatagtaatttt aattatacaaattactatatggaatttgaagatattcctgaatattatgaagtaaatttc aataattatttatatattattaccaggttttcattcattccagatggaactgagatattt tttacttgggaagaaatccattgttgggatgaaaaagttgctaccgagaaaacttttata aatggcgaaacattagtggattcatataactttccaaataatgaagtgaaagactacata caaaagcgagaatcattatatatagaaacaaaaaaatattatgaagaaaaaggattaaaa attgagagacatgcactcggttcagaagatggtgaatatgttgaacttacaaatgattct atactttatttactagatatagaagcagttgaaataagagaacaatcaaaaaatatagaa gaatttctatataagtataaaaaacgttttaaataatttatattttaaaatacataacag tacattgagtcatttaacgagatataaaatgactcaatgtatagactgataaaaataatt atattattttttagttacatatttgttaaaaaattctttttcttctatcggtttagaaaa ataaaacccttgtcctacatcacatttaactgtatttaaaaattccaagtcttttttagt ttcaataccttcacatacaacagacatgcctatacgatgtgacatttcaataatacattg aataatactatatactttctcccggttaaaggtttctttaagtaagcttttatctaactt caatccattaatagatagagaacataaaagacttaatgaagagtatcctgaaccaaaatc atccattgaaattaaaaatcctaactttttaagttcctctaaaattgaaataactggttg agatatttcattaaaagcactttcagttacctctatctctatatacttaaaaggaatttc atattctttaacagtatctaaaaacctttgataaaaactattttggtaaatagtaaccct tgaaaaattaactgcaatcggatatgtatattgattttttttcataaacgtttttcttac aaatgaacacgctttttttaacatataaaagtccaattcaataataaatccacttttttc aaacaatggaataaattcatctggtgataaaaaaccaagttctggagaaaaccatcttac aagagcttctgcgcttacaacatttaaagaagatatttgaaatttaggttgcaaatacat atgaaattcttcattttctatcgctttatacatataattataaatactattttccatttg taactgttttaacagattttcattataccatactgtggaggaaattcctcttgttttact taccttgtgtgcaatatttgccttatccattatagaattgatggatttataacctaaatt atcaatttcaactaagtacgctcctatacaataagatatagtttgagttacattcatatc taattcagagattatagcattagttagcatttcccgaatatcctctaaaagagaatctct atattttgcaagtattacaaaattatctgaaccaattcttgcacaagtttctttgatatt aaaagttttagaaagtgcagctgcaactattattagaactttatctccatattcatatcc atgtgtatcattaatatatttaaaattgtcaatatcaatatttagcagtacatactcttt gttagatgcattgtgcaaaatttcaatcgctctgttttcaaatgcaacctgattttttat ttttgttaaattatcagtataaaatattcttttaaacctttttttattataatattccca aattaaaagacttattgttgagaatataagataaataaatagtgcagtagcaaaagaata caattttgcattagagtgtttttcagatataaaaacaatttgattagacaacacagaata ctcttcactcaatttatataatttatcacctgaagcaccatttctaacttttataatttc tttcttcatagattcccacatagaatccatttgatttagtttttgttgaaattctttatt atcacatctttgaaatccattttctccattacctgttcttagctttatcagaatattatc cagtcgttttatcaagtcatcatttctttcattattcaattcttgcttaacaaccttttg agtttcactgcgaatagtaccagtgtgacttataattttaatatgctctatactgtgata tagagaaaatataaaaagaataataataactagccaaatagcagaataaattaaaaaatc atattttttcttcattattgttacctcatttgtaatatatataatttgcaaataatcaat ctcttataaaaaatgattatcaatattttacagtgatatgtatttatcttaaatagttta atcatttatatcctataaattatacaaattcatcacctccaacacaaacagcaatatacg tttttctaaaatttctttttaaacattcatcaacactatcattaaatcatttttaaattg ctcaattaatttactgcatcacttcttttcttataaaatatcaccccaataatatatttg tataatgtctttatgtctctttttaaatttggcatatacataatctatattttaataaat aattaaaatactatttacctacaatttaactctttgaatttattttatcatattatgtaa atatattccttttttttggtatattacttaaattatatctatttttgtgtaataagacca ataatttacttatttcttattaattatatttaaaaataaaatttataaatggataataaa ttagttacatttatacatatatattataaatatataatatagctaaaaatatcgaaatta ttaaacaaaaaaatattttttaatgatagttatagtataaaaaatatactcactacaaat atagtatactattataaagtaatacctattcttatacaattcccaaggtcttctaaattt ttgaacaatgaaaatagccatgtaactaataactgcagaatatctctgcatttaaaagtt acatagctattttcattactagcaattatagattgctcttttaaatccaaccaatcttta tctaataaaaaatttaatcgcactatatacaaaaggtgcaactaatataacactatcaaa tctatctaatatacccccatgaccaggtattatctttccataatcctttatccctacata tctctttatagaagatgcaaataaatctcctaattgagctattacacttcctatacttcc tattatcgctaattgaagcaaatcaatgccaaataaatatccaaataaaatacaacaaag tgtacttcctattattcctccaatagctccttctatagtctttttaggactaactttagg aattagcttatgttttccaagtaaataaccactaaaatatgcaaatatatctgtcataaa agatatcacaaatataagccatacatatatactacctttttcaaatccatttatagttat aattataaaatctaaaaatactcctatataaaaaactcctaaaaacgtaatcgaaacatc tataacattgtttttgcccatcaacatataaattatacttgctaaaaataaaataaaaat tactgcataagtatattctaatggtaaattaaaaatattttttacagctaaataaataga aaataaatatcctataatgaatattggatgtacatcttttattttaaatgccttataaaa ctcatgcaatgcaatataaactattgctgtctcagctatatatagaggaatacctccata tacaacaaatagaaataatggaaccagagctagtgaagcaataattcttgtaagcataaa ataatctccttacttaagtcctccaaatcttctatcccttctttgatatacgtatatagc cttctgtagttcttcttttttaaaatcaggccaatgtatatcagtaaagtaaaactcaga ataagcaacttcccaaagtaaaaagttactcaatctttgttcaccacttgttcttattac caagtctggatctggtatagactttgtgcttaaatagttttttataatatcttcatcaat attgtttatatctattttaccactttcacaattttttactatatctataagagcattttt tatatctgctctacttccgtagtttaatgctaaatttaagttaactcctgtattgttttt tgtcagttccttagctgagtttaattctcttatacaagtttttggtaaagcacttatatc tcctatagcagttacttttacattgttttggtgaagttcagctatttcatttcttaagta tgtagataataagttcataagtgtgtcaacttcaagtttcggtcttttccagttttctgt tgaaaatgcatataatgttaagtgcttaacacctaattttgagcattcttttactatatc tcttatagtttctactccagccttatgtcctgcagttcttggaagaaatctagcttttgc ccatcttccatttccatccattataatagcaatatgagtaggtatgttatttaagtctat atcatatataatgttgttattcatattttgcctccaatattgttctgactccttaaacta aggagtcagaaaagtatgtgattatcagttctacactatcacctatctcagatattttta taactctaggaactacaagtttttctttatcctttttaccttcaatagattttacggtat aatttatattttgctcatcaaaatattgttttacctcatctacatgaagacctaaaaggt tataatattttttcaatattatacctccattatgtccttttcttttttagataataatgt atctatttcttttataaatttatcagtcattttttgaacttcatcttgtgctttttttaa ttcatcttcagttaattctccgcctttttccatctttttaattttctcattggcgtctct tctttcatttcttattctaactttaaattcttctgcagctttactagcttttttagctaa ttcttttcttctttcttctgttaaagcaggtacagaaagtcttataacctcaccatcatt tgatggatttaatcctaagtctgagttagctatcgctttttctatttcatgcatagcaga tttatcccaaggagatatcattaatattcttggttctggtacagatatagcacctatttg atttattggagttggagttccataataatcaactcttattttgtctagcatttgtgcatt agctcttcctgctcttatagttccaaattcaaactttaaagcatcaattgtcccattcat tttctcttctaattgcttatgtatttccagtttcataattttactcctccttcattcttc attattttacagtagttcctatattttcgccttttactgctcttattatattctctgttg taagctcaaatacctttattggaattttattatccatacataaagatgtagctgtagaat ccattacttttaattctttctgtataacttccatgtaacttaattctgtaaatttcttag catctgcatgtacttttggatccttgtcatatactgcatcaacatttttagctaacaata taacttctgcttccatctcagcagcacgtaaagcagcagttgtatctgttgtaaagtaag ggtttcctgttcctgcaccaaatataacaactctttccttttctaagtgtctaactgctc ttcttcttatatatggttctgcaatttgtctcatgtctatagcagtttgaactcttgtag caacatctatattttctagtgcatcctgtagcgccattgcattcataactgtagctaaca ttcctatatagtcagcagtagttctgtccattccttcactggttctgcctctccagaagt ttcctccacctactactacagctacttcaacacctatttcttgtattttttttatagcaa tagcaatatcattaactacatcattatttataccaaaacctctttctcctgctaatgctt ctccacttaattttaacaatacccttttgtacattggtttatccatcagaaacctcctat ttcaatccttcatatccaattttttctattttttaaaaaagagaacacctgcgtgttctc tctttggttattacttaagttgcttagcaacttcttctgcaaagttttcttctctctttt gtataccttcaccaacttcgaatctcacaactttaacaacttttatatcagaacctactg ccttagcaacatcagcaactaattgtttaacagttatatctggatttttaacgaaagttt gctctaataaacaaacctcttttaattctttttctaatcttcctttaaccattttttcaa ctatattagctggttttccttcatttaaagcttgttgagttaatacttctgtttcatgtg ctatgtattcagcatctacttcatctcttgaaacatacttaggattcatagcagcaactt gcatagctacatctttacctaattctaaaactttagcatctctagcttctgtttccattt caacaagaacacctatttttccaccaccgtgaatgtatccagcaacttgtccattagtta caactttagcaaatcttctaaagtctaatttctcacctatttttgcaactctattattta aaacttcttgtaaagttattccttctttatgagtttcacctaataaagaagctatatctt ctttatcagtagctaatgccatacaagcagcatctttaacgaacactttgaagtcttcgt ttttagcaacgaaatctgtctctgagttaacttctaccatagaagcaactgtattatcat cattcatttctattgcaactagaccttcagcagcaactctaccagcttttttagcagctt ttgataatcctttttctcttaataaatctactgctttttccatgtttccttcagcttctt gtaaagctttcttgcagtccatcattcctgcgcctgtactttctcttaactcttttacca tttgagcagttatattagccattttttaagtttcctcctacttattctattccatattat aaatggtaagggcgacccttaccatttaattgtcaaattattattcttggtcttcagcta cttcttcctcagcaccttgtctaccttcaattacagctgttgccatagcaccagttatta attttacggctcttatagcgtcatcatttcctggtatagcaaagtctaattgttctgggt cacagttagtatcaactataccaactactggtatacctaatctatgagcttcttgaatag ctatgttttcttttcttgggtcaactacgaacattgcacctggtaattcaggcatgtctt ttattccacctaagtatttttctagtttttctttttcagctcttaattttataacttctt ttttaggaagaacattaaatacgccttcttcttccattttttctaattctcttaatttat ttattcttgtttttatagttttgtggtttgttaacattccacctaaccatctttcattaa caaagtacattccacatctttcagcttcatcttttatcgcatcttgagcttgttttttag ttcctacgaataagattggctttcctgtttcagctacttctttagtgaacttgtaagctt cttcaacttttttaactgttttttgtaagtcgattatatatattccatttctctctgtga atatatacttagccattttagggttccatcttcttgtttggtgaccaaagtgaacacctg cttctaataattgtttcattgatattactgacatatcttacctcctggttttatacctcc agcttgatcttctccctaaaaaaccatgtaataggcaccttttaaggatcccaatgctgt gtgtgatttattttattttttcacctctagtagtatatcacagaggtgaagaaataacaa tattttttccatattttctatttttatatttttttgtgtattttataccattttttgaat ttaatttgcaaatttcatttttaattttgtttttaatgatacgttatctatactattatt acttactatatctacacttccaagtaagtcacctgaattagtataatattttataatacc catagtatcaccttttttaacagggtactctatatttttaatcttaacttctgactttat actttcatcatcttttaatattgtataaagttcatcttttgcttttaatgtaacctctaa ctctttcgttccttttatatatttcttaccaataaagctatctttatcaattactttttt catattgaaattttcttttccatatttcagtagagctaatgaagcagaggttcttttatt tttatggttagtacctaatacaacccctattactctacgttttttctcatttttatcatt tttatttacaaccatagaaaatgataagcaatatccagcattgccagtatatccagtttt tataccatctacttctggtataattcttaataatgcatttgtattgcttttttcaaaact tctatctgaatttgtatatgtctccatatcagttatagctgttacttgtttttcataatg gtcaaacatgtattttccaagaatagctatatcttttgcagtagagatattttcttttgc tggttttttggggttgcttaaatcgtatattggaagaccatttggatttagaaaatgtgt attactcattcctatttcttttgcttttttattcattctatctacaaatgcttctttcgt tttacaaacatgttttgctatagcaattgccgcatcatttcctgatacaatcataagacc tctcataagctctataagtggcacttcttcaccatctttaagtttataacttgacccttt tactgatgcaatagatttgtctatttttaccttatcagtttcttttacttctttattttc aatagcttctattgcaagtaaaaaagtcatcatcttacttaaactagctaatggtacctt catatcaggttctttactatataaaactctacctgtttcttggtctataagtatagatgt ttttgaatacttgtctacagatttatcatctgcatatgaataatttggtattataaaaac tagaatcatggctaatgatataattttttttagtgcatttttcaaatttttcaccttctt ggattattaagtatatttatatttaaattttccctatttagtccaatttatatctagtaa ttaatacctatccatatttacacaaatattaccttatcattcttttaataatcacagatg cccaaattgctcctattgtaactccaaaaaatacttctatacctgccaatgctttcccaa tcaaacttgtagcaaccatatctccatatcctactgtactaaatgtagccatgctaaaat accataaatccatatacattttgaaaatctcacttagtgagtaatcacctatattattta tatctaaagctacaagtgtgctatttgaactttctatgcctacaaataagtataataaag caaaaacacttattattgctataataactaataatatattccatggcttttctccataac ctgttgtgtaacgtgctatttggtcaaaaaatttttcaactaaataatcactgaaggtag gataattagaacgtttcattattttactactataaattctttccttataatagtaaaatc ctatcatctcatattctccaatttttgttgcttgatttctagctattctataatttatct tgccatgctcatactcactttttccatattcaacattctttaacacaaattttgtacaca tgctaaaaattattccatccattcgtggaaaattttctactttattaactaccaaatcag gtcctttaaatttcactttttcaaatatacggtcatttatatagtgtttactaaatatgg ttctattaaaatcacagttttctaagaatacacaaccattaaataaaactttatctctaa attctgtatagttaaaaataatattctttttaaaaatatattttttaaaatttgcttttt gtttaaatatggattcagaaaaatccagtattttataattgtaagttaatatttcttccg cattaaattcattttcaaaaacaaatccattaaattcacttatctcttctttatgaagag tatccatcatcaactgtatctcttcatcagacttattttctttatgaaagatacaatatc cagaagaatctgcttctctatgacatttttttctctcatctattttagatatccatttac aattcataaatatatatcctccagtacaaaacaattattactattttgtattagtttgga tattattttattttatatacttaaatagttacaaaatatatattagattcttagttttaa atttttaatctacttcattgtgcttttaatttgtttcatataaaaaataataaattttat atactttgatttatttatatattaaatatgattctaaaacttacttatcatttttaagta attttgtaactatatttaatgctactaaatcatccataaatcctattgggaacacgaagt ctggaatcacatctgttgatataacaaagtaaagtagcatacttccaatcaataaatatt tctttattgtaagtccatctgtacaaaaatcagcatacatttgtcttaatctatctgtaa attgaccttgtttttcaatagaatctatttttttattaaaattatcaaaaagtaattttt taccttcatctgtttggacatataacttacacttacttaactctttttcaatatttccat taaagttcttatcattgattaaatttgcaaatccaagaatatcatcaaagttactaaaat cactatctgcattaaatatttgattattgctgtttctaaattcatatcctgaagctttca acagttcttctaggttaatatttaaatgtattgccatcttttctaaatgatttatatttg gcttttgtttattattagctatacgagatatagtagatttatcaattccactttttttac ttagttctcccattgataattctttttcatctaataaaatcttcaacaaatcaccgaaat tcccaaccttattattttgttccattattttcacccgctttattatgattggttttatat tattatatgatatgattcttttgttatttaggtgttgtatgatgttggaattttatcaac aatttattggattatctgtaacaatttatccatttttacaatactataactaatataagt acaaaatttaagagaaaggatgttaatctactgtgattgaatcaattttattagttactt ctctttgtatagatgcctttgtgacaagctttggatatggtgtaaataaagttaaagttc ccttatattcaaatataattatcagcgtagtttgttcagctattttagcaatatcgcttt ttgcaggtacaatagttagagattttttacctcaaaatataacaatgttaatatgtttct ttattttatttttattaggaagtgctagactaattgaaagtttttttaaatcttatttta agaaaaaatctatacactcaaagaattataattttaatatgttagaccttaaattaaatt ttaatgtaagtatcgaacctgatgtcttagatacaagtaaatctaaagtgcttaaatctg ctgaagcatttacacttgcacttgctttaagtttagatggattagctatcggttttggta gtggccttgtaggtgtgaattatatacaagttattctattttctttaatatcaaatataa ttgcagtattacttggttgtttactaggaaatatgtttgttaaaaacgtaaatttaaact tatcttggttaagtggtttaatcttgttagtcattggatttatgaagatatgttaataag aaagcaatctaaagataaacttttctctttagattgctttcttttgtgctttttatattt attttctattctctctaatttctttctgaatctttttaagagctttttttgaacctcttt gaatatctttttctaattttctttctttaaaactagtaaataatacatctaaatcatacc cttctggatacaattctgatgcttttatgctaagttgtaatctttttatatttactgaaa caaaattatcattaaacaatacttctacattattaaacttgtccataggcttatatacaa ttccaaaatcatcttcatctagtaattttaccttatcccctacattataatctgtatagt ttaaaatgacttcagaactatttttatcttcaatattagattgtagcttacttcttttaa ctaaatctaaattgtagtttctatcaattacatattctttagctctatctaaaactctat tttttattcccatttttttagaaataaaaagagcattactatcttcagattttccaatag ttaacttatacaatggttctaacgtttctttatcaaacatcataccagcattttcaaatt ctggatgcaatgtagcaaacttttttatctctccataatgagttgatgctatagttatac atcccattttgtaaaactcttctaataatgatattgctaaaccagctccttcattaggtt cagttccacttcctatttcatcaaacagaacaagagtagaattatttgataaactcataa tctctgcaatattttttatatgtgatgaaaaagtacttaaggcattttcaatactttgat tatcccctatatctacaaaaactttttcaaatacactaaattcactaccttcttttgcag aaatatcaaatccacattgaaccattaaagttagtaaaccaacagtcttaagggttacag tttttcctcctgcattaggacctgttattataagacttctataatttttgcctatttcaa aatctaaaggtactgcatctcctgttagaagtggatgtttacctttaattatttttatat agccattattatttatttttggagtaattccttttattttttgactatacttagcttttg caaataacatatcgtattctgaaagtatctctatatttaattttatctgacttatcttct caaatataagttctgttaaataagataatattttgtattcttcaatagtttcatcagctt ttagcatagttaactctgtacttaaatttgaaacactaataggttcaataaatacagtat ttccttttgatgatgtatctaatatagtaccattaacttcatttttataagaagatttaa ttggtattacatatctatcatttcttttacttattataaactcttgtatatactttttat ttacagttgatgttataaatttatttaatctatcttttatctttccttctgtaatttcta tatttcgtcttatcttttttaattctttactagcattagaatcaactttattagatttta tacagtaatttatctcatcttctatacttttacattctgttatatttaaggcataagaac ttaatgtaggtgaataaaattctttttctaacataaaagctttcatcttcctacaacctc ttaaaaaatcttcaatatttacaagttcaacaggttctattatcattcctttttcaattt tatctattgtagaacctgcattaaacaatccttcaagtggtatgtgattactattttcaa ttatctttctagcttctttattttctgctaatttccttcttactactccaatattcccac taggagttaatttatctattaaattttttcctagtgaacttacacaatgtatttttatta attctttaacttcatttagttgtaatctttcaaatgtattactattcattattttttctc ctttatttataagttatcgtcttttaaatcaccctatcatttactttgataatagttatt ttgcgaacaacttaataaataaggagttattatatatcaaactccttatttattaagaag tttaactccggactcattaatgttagtattttttttcataaaacacttctccttttctat ccttatttaaacacttatatcagtgcttctaatattattccataaattatatatttatgt caataaaaataatgtcattaatgtttttgtacagtgaaaatttttatagtgaaaataagc ttatactttcatttatattttggaatcacttatattgtcatcaattcatgtatgtgcagt ttccaatacagtctaactttgtaatcattatatatcaaagaatttagctctataaattat cgtctctacaaaataaaaaaatagctaataataaaacacttttaaatgttccataaaatt agctatttataatataattttaatcttttttaactttaaaaat |