Block details
fasta C_difficile_CD00084_1A_020911.fasta
contig u00000crpx_c_020911
start 2282290
length 14862
strand +
type core
seq tatttattaaaaattaatcaatttgaaaaaagttatgatataggaatttttaaaaatgaa
caatcaatatataaatttattgcaaaaataccctttgtaaaaaaagataatagtaatttt
aattatacaaattactatatggaatttgaagatattcctgaatattatgaagtaaatttc
aataattatttatatattattaccaggttttcattcattccagatggaactgagatattt
tttacttgggaagaaatccattgttgggatgaaaaagttgctaccgagaaaacttttata
aatggcgaaacattagtggattcatataactttccaaataatgaagtgaaagactacata
caaaagcgagaatcattatatatagaaacaaaaaaatattatgaagaaaaaggattaaaa
attgagagacatgcactcggttcagaagatggtgaatatgttgaacttacaaatgattct
atactttatttactagatatagaagcagttgaaataagagaacaatcaaaaaatatagaa
gaatttctatataagtataaaaaacgttttaaataatttatattttaaaatacataacag
tacattgagtcatttaacgagatataaaatgactcaatgtatagactgataaaaataatt
atattattttttagttacatatttgttaaaaaattctttttcttctatcggtttagaaaa
ataaaacccttgtcctacatcacatttaactgtatttaaaaattccaagtcttttttagt
ttcaataccttcacatacaacagacatgcctatacgatgtgacatttcaataatacattg
aataatactatatactttctcccggttaaaggtttctttaagtaagcttttatctaactt
caatccattaatagatagagaacataaaagacttaatgaagagtatcctgaaccaaaatc
atccattgaaattaaaaatcctaactttttaagttcctctaaaattgaaataactggttg
agatatttcattaaaagcactttcagttacctctatctctatatacttaaaaggaatttc
atattctttaacagtatctaaaaacctttgataaaaactattttggtaaatagtaaccct
tgaaaaattaactgcaatcggatatgtatattgattttttttcataaacgtttttcttac
aaatgaacacgctttttttaacatataaaagtccaattcaataataaatccacttttttc
aaacaatggaataaattcatctggtgataaaaaaccaagttctggagaaaaccatcttac
aagagcttctgcgcttacaacatttaaagaagatatttgaaatttaggttgcaaatacat
atgaaattcttcattttctatcgctttatacatataattataaatactattttccatttg
taactgttttaacagattttcattataccatactgtggaggaaattcctcttgttttact
taccttgtgtgcaatatttgccttatccattatagaattgatggatttataacctaaatt
atcaatttcaactaagtacgctcctatacaataagatatagtttgagttacattcatatc
taattcagagattatagcattagttagcatttcccgaatatcctctaaaagagaatctct
atattttgcaagtattacaaaattatctgaaccaattcttgcacaagtttctttgatatt
aaaagttttagaaagtgcagctgcaactattattagaactttatctccatattcatatcc
atgtgtatcattaatatatttaaaattgtcaatatcaatatttagcagtacatactcttt
gttagatgcattgtgcaaaatttcaatcgctctgttttcaaatgcaacctgattttttat
ttttgttaaattatcagtataaaatattcttttaaacctttttttattataatattccca
aattaaaagacttattgttgagaatataagataaataaatagtgcagtagcaaaagaata
caattttgcattagagtgtttttcagatataaaaacaatttgattagacaacacagaata
ctcttcactcaatttatataatttatcacctgaagcaccatttctaacttttataatttc
tttcttcatagattcccacatagaatccatttgatttagtttttgttgaaattctttatt
atcacatctttgaaatccattttctccattacctgttcttagctttatcagaatattatc
cagtcgttttatcaagtcatcatttctttcattattcaattcttgcttaacaaccttttg
agtttcactgcgaatagtaccagtgtgacttataattttaatatgctctatactgtgata
tagagaaaatataaaaagaataataataactagccaaatagcagaataaattaaaaaatc
atattttttcttcattattgttacctcatttgtaatatatataatttgcaaataatcaat
ctcttataaaaaatgattatcaatattttacagtgatatgtatttatcttaaatagttta
atcatttatatcctataaattatacaaattcatcacctccaacacaaacagcaatatacg
tttttctaaaatttctttttaaacattcatcaacactatcattaaatcatttttaaattg
ctcaattaatttactgcatcacttcttttcttataaaatatcaccccaataatatatttg
tataatgtctttatgtctctttttaaatttggcatatacataatctatattttaataaat
aattaaaatactatttacctacaatttaactctttgaatttattttatcatattatgtaa
atatattccttttttttggtatattacttaaattatatctatttttgtgtaataagacca
ataatttacttatttcttattaattatatttaaaaataaaatttataaatggataataaa
ttagttacatttatacatatatattataaatatataatatagctaaaaatatcgaaatta
ttaaacaaaaaaatattttttaatgatagttatagtataaaaaatatactcactacaaat
atagtatactattataaagtaatacctattcttatacaattcccaaggtcttctaaattt
ttgaacaatgaaaatagccatgtaactaataactgcagaatatctctgcatttaaaagtt
acatagctattttcattactagcaattatagattgctcttttaaatccaaccaatcttta
tctaataaaaaatttaatcgcactatatacaaaaggtgcaactaatataacactatcaaa
tctatctaatatacccccatgaccaggtattatctttccataatcctttatccctacata
tctctttatagaagatgcaaataaatctcctaattgagctattacacttcctatacttcc
tattatcgctaattgaagcaaatcaatgccaaataaatatccaaataaaatacaacaaag
tgtacttcctattattcctccaatagctccttctatagtctttttaggactaactttagg
aattagcttatgttttccaagtaaataaccactaaaatatgcaaatatatctgtcataaa
agatatcacaaatataagccatacatatatactacctttttcaaatccatttatagttat
aattataaaatctaaaaatactcctatataaaaaactcctaaaaacgtaatcgaaacatc
tataacattgtttttgcccatcaacatataaattatacttgctaaaaataaaataaaaat
tactgcataagtatattctaatggtaaattaaaaatattttttacagctaaataaataga
aaataaatatcctataatgaatattggatgtacatcttttattttaaatgccttataaaa
ctcatgcaatgcaatataaactattgctgtctcagctatatatagaggaatacctccata
tacaacaaatagaaataatggaaccagagctagtgaagcaataattcttgtaagcataaa
ataatctccttacttaagtcctccaaatcttctatcccttctttgatatacgtatatagc
cttctgtagttcttcttttttaaaatcaggccaatgtatatcagtaaagtaaaactcaga
ataagcaacttcccaaagtaaaaagttactcaatctttgttcaccacttgttcttattac
caagtctggatctggtatagactttgtgcttaaatagttttttataatatcttcatcaat
attgtttatatctattttaccactttcacaattttttactatatctataagagcattttt
tatatctgctctacttccgtagtttaatgctaaatttaagttaactcctgtattgttttt
tgtcagttccttagctgagtttaattctcttatacaagtttttggtaaagcacttatatc
tcctatagcagttacttttacattgttttggtgaagttcagctatttcatttcttaagta
tgtagataataagttcataagtgtgtcaacttcaagtttcggtcttttccagttttctgt
tgaaaatgcatataatgttaagtgcttaacacctaattttgagcattcttttactatatc
tcttatagtttctactccagccttatgtcctgcagttcttggaagaaatctagcttttgc
ccatcttccatttccatccattataatagcaatatgagtaggtatgttatttaagtctat
atcatatataatgttgttattcatattttgcctccaatattgttctgactccttaaacta
aggagtcagaaaagtatgtgattatcagttctacactatcacctatctcagatattttta
taactctaggaactacaagtttttctttatcctttttaccttcaatagattttacggtat
aatttatattttgctcatcaaaatattgttttacctcatctacatgaagacctaaaaggt
tataatattttttcaatattatacctccattatgtccttttcttttttagataataatgt
atctatttcttttataaatttatcagtcattttttgaacttcatcttgtgctttttttaa
ttcatcttcagttaattctccgcctttttccatctttttaattttctcattggcgtctct
tctttcatttcttattctaactttaaattcttctgcagctttactagcttttttagctaa
ttcttttcttctttcttctgttaaagcaggtacagaaagtcttataacctcaccatcatt
tgatggatttaatcctaagtctgagttagctatcgctttttctatttcatgcatagcaga
tttatcccaaggagatatcattaatattcttggttctggtacagatatagcacctatttg
atttattggagttggagttccataataatcaactcttattttgtctagcatttgtgcatt
agctcttcctgctcttatagttccaaattcaaactttaaagcatcaattgtcccattcat
tttctcttctaattgcttatgtatttccagtttcataattttactcctccttcattcttc
attattttacagtagttcctatattttcgccttttactgctcttattatattctctgttg
taagctcaaatacctttattggaattttattatccatacataaagatgtagctgtagaat
ccattacttttaattctttctgtataacttccatgtaacttaattctgtaaatttcttag
catctgcatgtacttttggatccttgtcatatactgcatcaacatttttagctaacaata
taacttctgcttccatctcagcagcacgtaaagcagcagttgtatctgttgtaaagtaag
ggtttcctgttcctgcaccaaatataacaactctttccttttctaagtgtctaactgctc
ttcttcttatatatggttctgcaatttgtctcatgtctatagcagtttgaactcttgtag
caacatctatattttctagtgcatcctgtagcgccattgcattcataactgtagctaaca
ttcctatatagtcagcagtagttctgtccattccttcactggttctgcctctccagaagt
ttcctccacctactactacagctacttcaacacctatttcttgtattttttttatagcaa
tagcaatatcattaactacatcattatttataccaaaacctctttctcctgctaatgctt
ctccacttaattttaacaatacccttttgtacattggtttatccatcagaaacctcctat
ttcaatccttcatatccaattttttctattttttaaaaaagagaacacctgcgtgttctc
tctttggttattacttaagttgcttagcaacttcttctgcaaagttttcttctctctttt
gtataccttcaccaacttcgaatctcacaactttaacaacttttatatcagaacctactg
ccttagcaacatcagcaactaattgtttaacagttatatctggatttttaacgaaagttt
gctctaataaacaaacctcttttaattctttttctaatcttcctttaaccattttttcaa
ctatattagctggttttccttcatttaaagcttgttgagttaatacttctgtttcatgtg
ctatgtattcagcatctacttcatctcttgaaacatacttaggattcatagcagcaactt
gcatagctacatctttacctaattctaaaactttagcatctctagcttctgtttccattt
caacaagaacacctatttttccaccaccgtgaatgtatccagcaacttgtccattagtta
caactttagcaaatcttctaaagtctaatttctcacctatttttgcaactctattattta
aaacttcttgtaaagttattccttctttatgagtttcacctaataaagaagctatatctt
ctttatcagtagctaatgccatacaagcagcatctttaacgaacactttgaagtcttcgt
ttttagcaacgaaatctgtctctgagttaacttctaccatagaagcaactgtattatcat
cattcatttctattgcaactagaccttcagcagcaactctaccagcttttttagcagctt
ttgataatcctttttctcttaataaatctactgctttttccatgtttccttcagcttctt
gtaaagctttcttgcagtccatcattcctgcgcctgtactttctcttaactcttttacca
tttgagcagttatattagccattttttaagtttcctcctacttattctattccatattat
aaatggtaagggcgacccttaccatttaattgtcaaattattattcttggtcttcagcta
cttcttcctcagcaccttgtctaccttcaattacagctgttgccatagcaccagttatta
attttacggctcttatagcgtcatcatttcctggtatagcaaagtctaattgttctgggt
cacagttagtatcaactataccaactactggtatacctaatctatgagcttcttgaatag
ctatgttttcttttcttgggtcaactacgaacattgcacctggtaattcaggcatgtctt
ttattccacctaagtatttttctagtttttctttttcagctcttaattttataacttctt
ttttaggaagaacattaaatacgccttcttcttccattttttctaattctcttaatttat
ttattcttgtttttatagttttgtggtttgttaacattccacctaaccatctttcattaa
caaagtacattccacatctttcagcttcatcttttatcgcatcttgagcttgttttttag
ttcctacgaataagattggctttcctgtttcagctacttctttagtgaacttgtaagctt
cttcaacttttttaactgttttttgtaagtcgattatatatattccatttctctctgtga
atatatacttagccattttagggttccatcttcttgtttggtgaccaaagtgaacacctg
cttctaataattgtttcattgatattactgacatatcttacctcctggttttatacctcc
agcttgatcttctccctaaaaaaccatgtaataggcaccttttaaggatcccaatgctgt
gtgtgatttattttattttttcacctctagtagtatatcacagaggtgaagaaataacaa
tattttttccatattttctatttttatatttttttgtgtattttataccattttttgaat
ttaatttgcaaatttcatttttaattttgtttttaatgatacgttatctatactattatt
acttactatatctacacttccaagtaagtcacctgaattagtataatattttataatacc
catagtatcaccttttttaacagggtactctatatttttaatcttaacttctgactttat
actttcatcatcttttaatattgtataaagttcatcttttgcttttaatgtaacctctaa
ctctttcgttccttttatatatttcttaccaataaagctatctttatcaattactttttt
catattgaaattttcttttccatatttcagtagagctaatgaagcagaggttcttttatt
tttatggttagtacctaatacaacccctattactctacgttttttctcatttttatcatt
tttatttacaaccatagaaaatgataagcaatatccagcattgccagtatatccagtttt
tataccatctacttctggtataattcttaataatgcatttgtattgcttttttcaaaact
tctatctgaatttgtatatgtctccatatcagttatagctgttacttgtttttcataatg
gtcaaacatgtattttccaagaatagctatatcttttgcagtagagatattttcttttgc
tggttttttggggttgcttaaatcgtatattggaagaccatttggatttagaaaatgtgt
attactcattcctatttcttttgcttttttattcattctatctacaaatgcttctttcgt
tttacaaacatgttttgctatagcaattgccgcatcatttcctgatacaatcataagacc
tctcataagctctataagtggcacttcttcaccatctttaagtttataacttgacccttt
tactgatgcaatagatttgtctatttttaccttatcagtttcttttacttctttattttc
aatagcttctattgcaagtaaaaaagtcatcatcttacttaaactagctaatggtacctt
catatcaggttctttactatataaaactctacctgtttcttggtctataagtatagatgt
ttttgaatacttgtctacagatttatcatctgcatatgaataatttggtattataaaaac
tagaatcatggctaatgatataattttttttagtgcatttttcaaatttttcaccttctt
ggattattaagtatatttatatttaaattttccctatttagtccaatttatatctagtaa
ttaatacctatccatatttacacaaatattaccttatcattcttttaataatcacagatg
cccaaattgctcctattgtaactccaaaaaatacttctatacctgccaatgctttcccaa
tcaaacttgtagcaaccatatctccatatcctactgtactaaatgtagccatgctaaaat
accataaatccatatacattttgaaaatctcacttagtgagtaatcacctatattattta
tatctaaagctacaagtgtgctatttgaactttctatgcctacaaataagtataataaag
caaaaacacttattattgctataataactaataatatattccatggcttttctccataac
ctgttgtgtaacgtgctatttggtcaaaaaatttttcaactaaataatcactgaaggtag
gataattagaacgtttcattattttactactataaattctttccttataatagtaaaatc
ctatcatctcatattctccaatttttgttgcttgatttctagctattctataatttatct
tgccatgctcatactcactttttccatattcaacattctttaacacaaattttgtacaca
tgctaaaaattattccatccattcgtggaaaattttctactttattaactaccaaatcag
gtcctttaaatttcactttttcaaatatacggtcatttatatagtgtttactaaatatgg
ttctattaaaatcacagttttctaagaatacacaaccattaaataaaactttatctctaa
attctgtatagttaaaaataatattctttttaaaaatatattttttaaaatttgcttttt
gtttaaatatggattcagaaaaatccagtattttataattgtaagttaatatttcttccg
cattaaattcattttcaaaaacaaatccattaaattcacttatctcttctttatgaagag
tatccatcatcaactgtatctcttcatcagacttattttctttatgaaagatacaatatc
cagaagaatctgcttctctatgacatttttttctctcatctattttagatatccatttac
aattcataaatatatatcctccagtacaaaacaattattactattttgtattagtttgga
tattattttattttatatacttaaatagttacaaaatatatattagattcttagttttaa
atttttaatctacttcattgtgcttttaatttgtttcatataaaaaataataaattttat
atactttgatttatttatatattaaatatgattctaaaacttacttatcatttttaagta
attttgtaactatatttaatgctactaaatcatccataaatcctattgggaacacgaagt
ctggaatcacatctgttgatataacaaagtaaagtagcatacttccaatcaataaatatt
tctttattgtaagtccatctgtacaaaaatcagcatacatttgtcttaatctatctgtaa
attgaccttgtttttcaatagaatctatttttttattaaaattatcaaaaagtaattttt
taccttcatctgtttggacatataacttacacttacttaactctttttcaatatttccat
taaagttcttatcattgattaaatttgcaaatccaagaatatcatcaaagttactaaaat
cactatctgcattaaatatttgattattgctgtttctaaattcatatcctgaagctttca
acagttcttctaggttaatatttaaatgtattgccatcttttctaaatgatttatatttg
gcttttgtttattattagctatacgagatatagtagatttatcaattccactttttttac
ttagttctcccattgataattctttttcatctaataaaatcttcaacaaatcaccgaaat
tcccaaccttattattttgttccattattttcacccgctttattatgattggttttatat
tattatatgatatgattcttttgttatttaggtgttgtatgatgttggaattttatcaac
aatttattggattatctgtaacaatttatccatttttacaatactataactaatataagt
acaaaatttaagagaaaggatgttaatctactgtgattgaatcaattttattagttactt
ctctttgtatagatgcctttgtgacaagctttggatatggtgtaaataaagttaaagttc
ccttatattcaaatataattatcagcgtagtttgttcagctattttagcaatatcgcttt
ttgcaggtacaatagttagagattttttacctcaaaatataacaatgttaatatgtttct
ttattttatttttattaggaagtgctagactaattgaaagtttttttaaatcttatttta
agaaaaaatctatacactcaaagaattataattttaatatgttagaccttaaattaaatt
ttaatgtaagtatcgaacctgatgtcttagatacaagtaaatctaaagtgcttaaatctg
ctgaagcatttacacttgcacttgctttaagtttagatggattagctatcggttttggta
gtggccttgtaggtgtgaattatatacaagttattctattttctttaatatcaaatataa
ttgcagtattacttggttgtttactaggaaatatgtttgttaaaaacgtaaatttaaact
tatcttggttaagtggtttaatcttgttagtcattggatttatgaagatatgttaataag
aaagcaatctaaagataaacttttctctttagattgctttcttttgtgctttttatattt
attttctattctctctaatttctttctgaatctttttaagagctttttttgaacctcttt
gaatatctttttctaattttctttctttaaaactagtaaataatacatctaaatcatacc
cttctggatacaattctgatgcttttatgctaagttgtaatctttttatatttactgaaa
caaaattatcattaaacaatacttctacattattaaacttgtccataggcttatatacaa
ttccaaaatcatcttcatctagtaattttaccttatcccctacattataatctgtatagt
ttaaaatgacttcagaactatttttatcttcaatattagattgtagcttacttcttttaa
ctaaatctaaattgtagtttctatcaattacatattctttagctctatctaaaactctat
tttttattcccatttttttagaaataaaaagagcattactatcttcagattttccaatag
ttaacttatacaatggttctaacgtttctttatcaaacatcataccagcattttcaaatt
ctggatgcaatgtagcaaacttttttatctctccataatgagttgatgctatagttatac
atcccattttgtaaaactcttctaataatgatattgctaaaccagctccttcattaggtt
cagttccacttcctatttcatcaaacagaacaagagtagaattatttgataaactcataa
tctctgcaatattttttatatgtgatgaaaaagtacttaaggcattttcaatactttgat
tatcccctatatctacaaaaactttttcaaatacactaaattcactaccttcttttgcag
aaatatcaaatccacattgaaccattaaagttagtaaaccaacagtcttaagggttacag
tttttcctcctgcattaggacctgttattataagacttctataatttttgcctatttcaa
aatctaaaggtactgcatctcctgttagaagtggatgtttacctttaattatttttatat
agccattattatttatttttggagtaattccttttattttttgactatacttagcttttg
caaataacatatcgtattctgaaagtatctctatatttaattttatctgacttatcttct
caaatataagttctgttaaataagataatattttgtattcttcaatagtttcatcagctt
ttagcatagttaactctgtacttaaatttgaaacactaataggttcaataaatacagtat
ttccttttgatgatgtatctaatatagtaccattaacttcatttttataagaagatttaa
ttggtattacatatctatcatttcttttacttattataaactcttgtatatactttttat
ttacagttgatgttataaatttatttaatctatcttttatctttccttctgtaatttcta
tatttcgtcttatcttttttaattctttactagcattagaatcaactttattagatttta
tacagtaatttatctcatcttctatacttttacattctgttatatttaaggcataagaac
ttaatgtaggtgaataaaattctttttctaacataaaagctttcatcttcctacaacctc
ttaaaaaatcttcaatatttacaagttcaacaggttctattatcattcctttttcaattt
tatctattgtagaacctgcattaaacaatccttcaagtggtatgtgattactattttcaa
ttatctttctagcttctttattttctgctaatttccttcttactactccaatattcccac
taggagttaatttatctattaaattttttcctagtgaacttacacaatgtatttttatta
attctttaacttcatttagttgtaatctttcaaatgtattactattcattattttttctc
ctttatttataagttatcgtcttttaaatcaccctatcatttactttgataatagttatt
ttgcgaacaacttaataaataaggagttattatatatcaaactccttatttattaagaag
tttaactccggactcattaatgttagtattttttttcataaaacacttctccttttctat
ccttatttaaacacttatatcagtgcttctaatattattccataaattatatatttatgt
caataaaaataatgtcattaatgtttttgtacagtgaaaatttttatagtgaaaataagc
ttatactttcatttatattttggaatcacttatattgtcatcaattcatgtatgtgcagt
ttccaatacagtctaactttgtaatcattatatatcaaagaatttagctctataaattat
cgtctctacaaaataaaaaaatagctaataataaaacacttttaaatgttccataaaatt
agctatttataatataattttaatcttttttaactttaaaaat