Block details | |
---|---|
fasta | C_difficile_CD00148_1A_020479.fasta |
contig | u00000crpx_c_020479 |
start | 2270065 |
length | 14863 |
strand | + |
type | core |
seq | tatttattaaaaattaatcaatttgaaaaaagttatgatataggaatttttaaaaatgaa caatcaatatataaatttattgaaaaaataccctttgtaaaaaaagataatagtaatttt aattatacaaattactatatggaatttgaagatattcctgaatattatgaagtaaatttc aataattatttatatattattaccaggttttcattcattccagatggaactgagatattt tttacttgggaagaaatccattgttgggatgaaaaagttgctaccgagaaaacttttata aatggcgaaacattagtggattcatataactttccaaataatgaagtgaaagactacata caaaagcgagaatcactatatatagaaacaaaaaaatattatgaagaaaaaggattaaaa attgagagacatgcactcggttcagaagatggtgaatatgttgaacttacaaatgattct atactttatttactagatatagaagcagttgaaataagagaacaatcaaaaaatatagaa gaatttctatataagtacaaaaaacgttttaaataatttatattttaaaatacataacag tacattgagtcatttaacgagatataaaatgactcaatgtatagactgataaaaataatt atattattttttagttacatatttgttaaaaaattctttttcttctatcggtttagaaaa ataaaacccttgtcctacatcacatttaactgtatttaaaaattccaagtcttttttagt ttcaataccttcacatacaacagacatgcctatacgatgtgacatttcaataatacactg aataatactatatactttctcccggttaaatgtttctttaagtaagcttttatctaactt caatccattaatagatagagaacataaaagacttaatgaagagtatcctgatccaaaatc atccatcgaaattaaaaatcctaactttttaagctcctctaaaatcgaaataactggttg agatatttcattaaaagcactttcagttacctctatctctatatacttaaaaggaatttc atattctttaacagtatctaaaaacctttgataaaaactattttggtaaatagtaaccct tgaaaaattaactgcaatcggatatgtatattgattttttttcataaacgttttttttac aaatgaacacgctttttttaacatataaaagtccaattcaataataaatccacttttttc aaacaatggaataaattcatctggtgataaaaaaccaagttctggagaaaaccatcttac aagagcttctgcgctcacaacatttaaagaagatatttgaaatttaggttgcaaatacat atgaaattcttcattttctatcgctttatacatataattataaatactattttctatttg taactgttttaacagattttcattataccatactgtggaggaaattcctcttgttttact taccttgtgtgcaatatttgccttatccatcatagaattgatggatttataacctaaatt atcaatttcaactaagtacgctcctatacaataagatatagtttgagttacattcatatc taattcagagattatagcattagttagcatttcccgaatatcctctaaaagagaatctct atattttgcaagtattacaaaattatctgaaccaattcttgcacaagtttctttgatatt aaaagttttagaaagtgcagctgcaactattattagaactttatctccatattcatatcc atgtgtatcattaatatatttaaaattgtcaatatcaatatttagcagtacatactcttt gttagatgcattgtgcaaaatttcaatcgctctgttttcaaatgcaacctgattttttat ttttgttaaattatcagtataaaatattcttttaaacctttttttattataatattccca aattaaaagacttattgttgagaatataagataaataaatagtgcagtagcaaaagaata caattttgcattagagtgtttttcagatataaaaacaatttgattagacaacacagaata ctcttcactcaatttatataatttatcacctgaagcaccatttctaacttttataatttc tttcttcatagattcccacatagaatccatttgatttagtttttgttgaaattctttatt atcacatctttgaaatccattttctccattacctgttcttagctttatcagaatattatc cagtcgttttattaagtcatcatttctttcattattcaattcttgcttaacaaccttttg agtttcactgcgaatagtaccagtgtgacttataattttaatatgctctatactgtgata tagagaaaatataaaaagaataataataactagccaaatagcagaataaattaaaaaatc atattttttcttcattattgttacctcatttgtaatatatataatttgcaaataatcaat ctcttataaaaaatgattatcaatattttacagtgatatgtatttatcttaaatagttta atcatttataccctataaattatacaaattcatcacctccaacacaaacagcaatatacg tttttctaaaatttctttttaaacattcatcaacactatcattaaatcatttttaaattg ctcaattaatttactgcatcacttcttttcttataaaatatcaccccaataatatatttg tataatgtctttatgtctctttttaaatttggcatatacataatctatattttaataaat aattaaaatactatttacctacaatttaactctttgaatttattttatcatattatgtaa atatattccttttttttggtatattacttaaattatatctatttttatgaaataagacca ataatttacttatttcttattaattatatttaaaaataaaatttataaatggataataaa ttagttacatttatacatatatattataaatatataataaagctaaaaatatcgaaatta ttaaacaaaaaaatattttttaatgatagttatagtataaaaaatatactcactacaaat atagtatactattataaagtaatacctattcttatacaattccccaaggtcttctaaatt tttgaacaatgaaaatagccatgtaactaataactgcagaatatctctgcatttaaaagt tacatagctattttcattactagcaattatagattgctcttttaaatccaaccaatcttt atctaataaaaaatttaatcgcactatatacaaaaggtgcaactaatataacactatcaa atctatctaatatacccccatgaccaggtattatctttccataatcctttatccctacat atctctttatagaagatgcaaataaatctcctaattgagctattacacttcctatacttc ctattatcgctaattgaagcaaatcaatgccaaataaatatccaaataaaatacaacaaa gtgtacttcctattattcctccaatagctccttctatagtctttttaggactaactttag gaattagcttatgttttccaagtaaataaccactaaaatatgcaaatatatctgtcataa aagatatcacaaatataagccatacatatatactacctttttcaaatccatttatagtta taattataaaatctaaaaatactcctatataaaaaactcctaaaaacgtaatcgaaacat ctataacattgtttttgcccatcaacatataaattatacttgctaaaaataaaataaaaa ttactgcataagtatattctaatggtaaattaaaaatattttttacagctaaataaatag aaaataaatatcctataatgaatattggatgtacatcttttattttaaatgccttataaa actcatgcaatgcaatataaactattgctgtctcagctatatatagaggaatacctccat atacaacaaatagaaataatggaaccagagctagtgaagcaataattcttgtaagcataa aataatctccttacttaagtcctccaaatcttctatcccttctttgatatacgtatatag ccttctgtagttcttcttttttaaaatcaggccaatgtatatcagtaaagtaaaactcag aataagcaacttcccaaagtaaaaagttactcaatctttgttcaccacttgttcttatta ccaagtctggatctggtatagactttgtgcttaaatagttttttataatatcttcatcaa tattgtttatatctattttaccactttcacaattttttactatatctataagagcatttt ttatatctgctctacttccgtagtttaatgctaaatttaagttaactcctgtattgtttt ttgtcagttccttagctgagtttaattctcttatacaagtttttggtaaagcacttatat ctcctatagcagttacttttacattgttttggtgaagttcagctatttcatttcttaagt atgtagataataagttcataagtgtgtcaacttcaagtttcggtcttttccagttttctg ttgaaaatgcatataatgttaagtgcttaacacctaattttgagcattcttttactatat ctcttatagtttctactccagccttatgtcctgcagttcttggaagaaatctagcttttg cccatcttccatttccatccattataatagcaatatgagtaggtatgttatttaagtcta tatcatatataatgttgttattcatattttgcctccaatattgttctgactccttaaact aaggagtcagaaaagtatgtgattatcagttctacactatcacctatctcagatattttt ataactctaggaactacaagtttttctttatcctttttaccttcaatagattttacggta taatttatattttgctcatcaaaatattgttttacctcatctacatgaagacctaaaagg ttataatattttttcaatattatacctccattatatccttttcttttttagataataatg tatctatttcttttataaatttatcagtcattttttgaacttcatcttgtgcttttttta attcatcttcagttaattctccgcctttttccatctttttaatcttctcattggcgtctc ttctttcatttcttattctaactttaaattcttctgcagctttactagcttttttagcta attcttttcttctttcttctgttaaagcaggtacagaaagtcttataacctcaccatcat ttgatggatttaatcctaagtctgagttagctattgctttttctatttcatgcatagcag atttatcccaaggagatatcattaatattcttggttctggtacagatatagcacctattt gatttattggagttggagttccataataatcaactcttattttgtctagcatttgtgcat tagctcttcctgctcttatagttccaaattcaaactttaaagcatcaattgtcccattca ttttctcttctaattgcttatgtatttccagtttcataattttactcctccttcattctt cattattttacagtagttcctatattttcgccttttactgctcttattatattctctgtt gtaagctcaaatacctttattggaattttattatccatacataaagatgtagctgtagaa tccattacttttaattctttctgtataacttccatgtaacttaattctgtaaatttctta gcatctgcatgtacttttggatccttgtcatatactgcatcaacatttttagctaacaat ataacttctgcttccatctcagcagcacgtaaagcagcagttgtatctgttgtaaagtaa gggtttcctgttcctgcaccaaatataacaactctttccttttctaagtgtctaactgct cttcttcttatatatggttctgcaatttgtctcatgtctatagcagtttgaactcttgta gcaacatctatattttctagtgcatcctgtagcgccattgcattcataactgtagctaac attcctatatagtcagcagtagttctgtccattccttcactggttctgcctctccagaag tttcctccacctactactacagctacttcaacacctatttcttgtattttttttatagca atagcaatatcattaactacatcattatttataccaaaacctctttctcctgctaatgct tctccacttaattttaacaatacccttttgtacattggtttatccatcagaaacctccta tttcaatccttcatatccaattttttctattttttaaaaaagagaacacctgcgtgttct ctctttggttattacttaagttgcttagcaacttcttctgcaaagttttcttctctcttt tgtataccttcaccaacttcgaatctcacaactttaacaacttttatatcagaacctact gccttagcaacatcagcaactaattgtttaacagttatatctggatttttaacgaaagtt tgctctaataaacaaacctcttttaattctttttctaatcttcctttaaccattttttca actatattagctggttttccttcatttaaagcttgttgagttaatacttctgtttcatgt gctatgtattcagcatctacttcatctcttgaaacatacttaggattcatagcagcaact tgcatagctacatctttacctaattctaaaactttagcatctctagcttctgtttccatt tcaacaagaacacctatttttccaccaccgtgaatgtatccagcaacttgtccattagtt acaactttagcaaatcttctaaagtctaatttctcacctatttttgcaactctattattt aaaacttcttgtaaagttattccctctttatgagtttcacctaataaagaagctatatct tctttatcagtagctaatgccatacaagcagcatctttaacgaacactttgaagtcttcg tttttagcaacgaaatctgtctctgagttaacttctaccatagaagcaactgtattatca tcattcatttctattgcaactagaccttcagcagcaactctaccagcttttttagcagct tttgataatcctttttctcttaataaatctactgctttttccatgtttccttcagcttct tgtaaagctttcttgcagtccatcattcctgcgcctgtactttctcttaactcttttacc atttgagcagttatattagccattttttaagtttcctcctacttattctattccatatta taaatggtaagggcgacccttaccatttaattgtcaaattattattcttggtcttcagct acttcttcctcagcaccttgtctaccttcaattacagctgttgccatagcaccagttatt aattttacggctcttatagcgtcatcatttcctggtatagcaaagtctaattgttctggg tcacagttagtatcaactataccaactactggtatacctaatctatgagcttcttgaata gctatgttttcttttcttgggtcaactacgaacattgcacctggtaattcaggcatgtct tttattccacctaagtatttttctagtttttctttttcagctcttaattttataacttct tttttaggaagaacattaaatacgccttcttcttccattttttctaattctcttaattta tttattcttgtttttatagttttgtggtttgttaacattccacctaaccatctttcatta acaaagtacattccacatctttcagcttcatcttttatcgcatcttgagcttgtttttta gttcctacgaataagattggctttcctgtttcagctacttctttagtgaacttgtaagct tcttcaacttttttaactgttttttgtaagtcgattatatatattccatttctctctgtg aatatatacttagccattttagggttccatcttcttgtttggtgaccaaagtgaacacct gcttctaataattgtttcattgatattactgacatatcttacctcctggttttatacctc cagcttgatcttctccctaaaaaaccatgtaataggcaccttttaaggatcccaatgctg tgtgtgatttattttattttttcacctctagtagtatatcacagaggtgaagaaataaca atattttttccatattttctatttttatatttttttgtgtattttataccattttttgaa tttaatttgcaaatttcatttttaattttgtttttaatgatacgttatctatactattat tacttactatatctacacttccaagtaagtcacctgaattagtataatattttataatac ccatagtatcaccttttttaacagggtactctatatttttaatcttaacttctgacttta tactttcatcatcttttaatattgtataaagttcatcttttgcttttaatgtaacctcta actctttcattccttttatatatttcttaccaataaagctatctttatcaattacttttt tcatattgaaattttcttttccatatttcagtagagctaatgaagcagaggttcttttat ttttatggttagtacctaatacaacccctattactctacgttttttctcatttttatcat ttttatttacaaccatagaaaatgataagcaatatccagcattgccagtatatccagttt ttataccatctacttctggtataattcttaataatgcatttgtattgcttttttcaaaac ttctatctgaatttgtatatgtctccatatcagttatagctgttacttgtttttcataat ggtcaaacatgtattttccaagaatagctatatcttttgcagtagagatattttcttttg ctggttttttggggttgcttaaatcgtatattggaagaccatttggatttagaaaatgtg tattactcattcctatttcttttgcttttttattcattctatctacaaatgcttctttcg ttttacaaatatgttttgctatagcaattgccgcatcatttcctgatacaatcataagac ctctcataagctctataagtggcacttcttcaccatctttaagtttataacttgaccctt ttactgatgcaatagatttgtctatttttaccttatcagtttcttttacttctttatttt caatagcttctattgcaagtaaaaaagtcatcatcttacttaaactagctaatggtacct tcatatcaggttctttactatataaaactctacctgtttcttggtctataagtatagatg tttttgaatacttgtctacagatttatcatctgcatatgaataatttggtattataaaaa ctagaatcatagctaatgatataattttttttagtgcatttttcaaatttttcaccttct tggattattaagtatatttatatttaaattttccctatttagtccaatttatatctagta attaatacctatccatatttacacaaatattaccttatcattcttttaataatcacagat gcccaaattgctcctattgtaactccaaaaaatacttctatacctgccaatgctttccca atcaaacttgtagcaaccatatctccatatcctactgtactaaatgtagccatgctaaaa taccataaatccatatacattctgaaaatctcacttagtgagtaatcacctatattgttt atatctaaagctacaagtgtgctatttgaactttctatgcctacaaataagtataataaa gcaaaaacacttattattgctataataactaataatatattccatggcttttctccataa cctgttgtgtaacgtgctatttggtcaaaaaatttttcaactaaataatcactgaaagta ggataattagaacgtttcattattttactactataaattctttccttataatagtaaaat cctatcatctcatattctccaatttttgttgcttgatttctagctattctataatttatc ttgccatgctcatactcactttttccatattcaacattctttaacacaaattttgtacac atactaaaaattattccatccattcgtggaaaattttctactttattaactaccaaatca ggtcctttaaatttcactttttcaaatatacggtcatttatatagtgtttactaaatatg gttctattaaaatcacagttttctaagaatacacaagcattaaataaaactttatctcta aattctgtatagttaaaaataatattctttttaaaaatatattttttaaaatttgctttt tgtttaaatatggattcagaaaaatccagtattttataattgtaagttaatatttcttcc gcattaaattcattttcaaaaacaaatccattaaattcacttatctcttctttatgaaga gtatccatcatcaactgtatctcttcatcagacttattttctttatgaaagatacaatat ccagaagaatctgcttctctatgacatttttttctctcatctattttagatatccattta caattcataaatatatatcctccagtacaaaacaattattactattttgtattagtttgg atattattttattttatatacttaaatagttacaaaatatatattagattcttagtttta aatttttaatctacttcattgtgcttttaatttgtttcatataaaaaataataaatttta tatactttgatttatttatatattaaatatgattctaaaacttacttatcatttttaagt aattttgtaactatatttaatgctactaaatcatccataaatcctattgggaacacgaag tctggaatcacatctgttgatataacaaagtaaagtagcatacttccaatcaataaatat ttctttattgtaagtccatctgtacaaaaatcagcatacatttgtcttaatctatctgta aattgaccttgtttttcaatagaatctatttttttattaaaattatcaaaaagtaatttt ttaccttcatctgtttggacatataacttacacttacttaactctttttcaatatttcca ttaaagttcttatcattgattaaatttgcaaatccaagaatatcatcaaagttactaaaa tcactatctgcattaaatatttgattattgctgtttctaaattcatatcctgaagctttc aacagttcttctaggttaatatttaaatgtattgccatcttttctaaatgatttatattt ggcttttgtttattattagctatacgagatatagtagatttatcaattccacttttttta cttagttctcccattgataattctttttcatctaataaaatcttcaacaaatcaccgaaa ttcccaaccttattattttgttccattattttcacctgctttattatgattggttttata ttattatatgatatgattcttttgttatttaggtgttgtatgatgttggaattttatcaa caatttattggattatctgtaacaatttatccatttttacaatactataactaatataag tacaaaatttaagagaaaggatgttaatctactgtgattgaatcaattttattagttact tctctttgtatagatgcctttgtgacaagctttggatatggtgtaaataaagttaaagtt cccttatattcaaatataattatcagcgtagtttgttcagctattttagcaatatcgctt tttgcaggtacaatagttagagattttttacctcaaaatataacaatgttaatatgtttc tttattttatttttattaggaagtgctagactaattgaaagtttttttaaatcttatttt aagaaaaaatctatacactcaaagaattataattttaatatgttagaccttaaattaaat tttaatgtaagtatcgaacctgatgtcttagatacaagtaaatctaaagtgcttaaatct gctgaagcatttacacttgcacttgctttaagtttagatggattagctatcggttttggt agtggccttgtaggtgtgaattatatacaagttattctattttctttaatatcaaatata attgcagtattacttggttgtttactaggaaatatgtttgttaaaaacgtaaatttaaac ttatcttggttaagtggtttaatcttgttagtcattggatttatgaagatatgttaataa gaaagcaatctaaagataaacttttctctttagattgctttcttttgtgctttttatatt tattttctattctctctaatttctttctgaatctttttaagagctttttttgaacctctt tgaatatctttttctaattttctttctttaaaactagtaaataatacatctaaatcatac ccttctggatacaattctgatgcttttatgctaagttgtaatctttttatatttactgaa ataaaattatcattaaacaatacttctacattattaaacttgtccataggcttatataca attccaaaatcatcttcatctagtaattttaccttatcccctacattataatctgtatag tttaaaatgacttcagaactatttttatcttcaatattagattgtagtttacttctttta actaaatctaaattgtagtttctatcaattacatattctttagctctatctaaaactcta ttttttattcccatttttttagaaataaaaagagcattactatcttcagattttccaata gttaacttatacaatggttctaacgtttctttatcaaacatcataccagcattttcaaat tctggatgcaatgtagcaaacttttttatctctccataatgagttgatgctatagttata catcccattttgtaaaactcttctaataatgatattgctaaaccagctccttcattaggt tcagttccacttcctatttcatcaaacagaacaagagtagaattatttgataaactcata atctctgcaatattttttatatgtgatgaaaaagtacttaaggcattttcaatactttga ttatcccctatatctacaaaaactttttcaaatacactaaattcactaccttcttttgca gaaatatcaaatccacattgaaccattaaagttagtaaaccaacagtcttaagggttaca gtttttcctcctgcattaggacctgttattataagacttctataatttttgcctatttca aaatctaaaggtactgcatctcctgttagaagtggatgtttacctttaattatttttata tagccattattatttatttttggagtaattccttttattttttgactatacttagctttt gcaaataccatatcgtattctgaaagtatctctatatttaattttatctgacttatcttc tcaaatataagttctgttaaataagataatattttgtattcttcaatagtttcatcagct tttagcatagttaactctgtacttaaatttgaaacactaataggttcaataaatacagta tttccttttgatgatgtatctaatatagtaccattaacttcatttttataagaagattta attggtattacatatctatcatttcttttacttattataaactcttgtatatacttttta tttacagttgatgttataaatttatttaatctatcttttatctttccttctgtaatttct atatttcgtcttatcttttttaattctttactagcattagaatcaactttattagatttt atacagtaatttatctcatcttctatacttttacattctgttatatttaaggcataagaa cttaatgtaggtgaataaaattctttttctaacataaaagctttcatcttcctacaacct cttaaaaaatcttcaatatttacaagttcaacaggttctattatcattcctttttcaatt ttatctattgtagaacctgcattaaacaatccttcaagtggtatgtgattactattttca attatctttctagcttctttattttctgctaatttccttcttactactccaatattccca ctaggagttaatttatctattaaattttttcctagcgaacttacacaatgtatttttatt aattctttaacttcatttagttgtaatctttcaaatgtattactattcattattttttct cctttatttataagttatcgtcttttaaatcaccctatcatttactttgataatagttat tttgcgaacaacttaataaataaggagttattatatatcaaactccttatttattaagaa gtttaactccggactcattaatgttagtattttttttcataaaacacttctccttttcta ttcttatttaaacacttatatcagtgcttctaatattattccataaattatatatttatg tcaataaaaataatgtcattaatgtttttgtacagtgaaaatttttatagtgaaaataag cttatactttcatttatatttgggaatcacttatattgtcatcaattcatgtatgtgcat tttccaatacagtctaactttgtaatcattatatatcaaagaatttagctctataaatta tcgtctctacaaaataaaaaaatagctaataataaaacacttttaaatgttctataaaat tagctatttataatataattttaatcttttttaactttaaaaat |