Block details
fasta C_difficile_CD00108_1A_020476.fasta
contig u00000crpx_c_020476
start 2281912
length 14863
strand +
type core
seq tatttattaaaaattaatcaatttgaaagaagctatgatataggaatttttaaaaatgaa
caatcaatatataaatttattgagaaaataccatttgtaaaaaaagatagtagtaacttt
aattatacaaattactatatggaatttgaagctattcctgaatattatgaagtaaatttc
aataattatttatatattattaccaggttttcattcattccagatggaactgagatattt
tttacttgggaagaaatccattgttgggatgaaaaagttgctaccgagaaaacttttata
aatggcgaaacattagtggattcatataactttccaaataatgaagtgaaagactacata
caaaagcgagaatcattatatatagaaacaaaaaaatattatgaagaaaaaggattaaaa
attgagagacatgcactcggttcagaagatggtgaatatgttgaacttacaaatgattct
atactttatttactagatatagaagcagttgaaataagagaacaatcaaaaaatatagaa
gaatttctatataagtataaaaaacgttttaaataatttatattttaaaatacataacag
tgcattgagtcatttaacgagatataaaatgactcaatgtatagactgataaaaataatt
atattattttttagttacatatttgttaaaaaattctttttcttctatcggtttagaaaa
ataaaacccttgtcctacatcacatttaactgtatttaaaaattccaagtcttttttagt
ttcaataccttcacatacaacagacatgcctatacgatgtgacatttcaataatacactg
aataatactatatactttctcccggttaaatgtttctttaagtaagcttttatctaactt
caatccattaatagatagagaacataaaagacttaatgaagagtatcctgatccaaaatc
atccatagaaattaaaaatcctaactttttaagttcctctaaaattgaaataactggttg
agatatttcattaaaagcactttcagttacctctatctctatatacttaaaaggaatttc
atattctttaacagtatctaaaaacctttgataaaaactattttggtaaatagtaaccct
tgaaaaattaactgcaatcggatatgtatattgattttttttcataaacgttttttttac
aaatgaacacgctttttttaacatataaaagtccaattcaataataaatccacttttttc
aaacaatggaataaattcatctggtgataaaaaaccaagttctggagaaaaccatcttac
aagagcttctgcgctcacaacatttaaagaagatatttgaaatttaggttgcaaatacat
atgaaattcttcattttctatcgctttatacatataattataaatactattttccatttg
taactgttttaacagattttcattataccatactgtggaggaaattcctcttgttttact
taccttgtgtgcaatatttgccttatccatcatagaattgatagatttataacctaaatt
atcaatttcaactaagtaagctcctatacaataagatatagtttgagttacattcatatc
taattcagagattatagcattagttagcatttcccgaatatcctctaaaagagaatctct
atattttgcaagtattacaaaattatctgaacaaattcttgcacaagtttcttttatatt
aaaagttttagaaagaacagttgcaactattattagaactttatctccatattcatatcc
atgtgtatcattaatatatttaaaattgtcaatatcaatatttagcagtacatactcttt
gttagatgcattgtgcaaaatttcaatcgctctgttttcaaatgcaacctgattttttat
ttttgttaaattatcagtataaaatattcttttaaacctttttttattataatattccca
aattaaaagacttattgttgagaatataagataaataaatagtgcagtagcaaaagaata
caattttgcattagagtgtttttcagatataaaaacaatttgattagacaacacagaata
ctcttcactcaatttatataatttatcacctgaagcaccatttctaacttttataatttc
tttcttcatagattcccacatagaatccatttgatttagtttttgttgaaattctttatt
atcacatctttgaaatccattttctccattacctgttcttagctttatcagaatattatc
cagtcgttttatcaagtcatcatttctttcattattcaattcttgcttaacaaccttttg
agtttcactgcgaatagtaccagtgtgacttataattttaatatgctctatactatgata
tagagaaaatataaaaagaataataataactagccaaatagcagaataaattaaaaaatc
atattttttcttcattattgttacctcatttgtaatatatataatttgcaaataatcaat
ctcttataaaaaatgattatcaatattttacagtgatatgtatttatcttaaatagttta
atcatttataccctataaattctacaaattcatcacctccaacacaaacagcaatatacg
tttttctaaaatttctttttaaacattcatcaacattatcattaaatcatttttaaatta
ctcaattaatttactgcatcacttcttttcttacaaaatatcaccccaataatatatttg
tataatgtctttatgtctctttttaaatttggcatatacataatctatattttaataaat
aattaaaatactatttacctacaatttaactctttgaatttattttatcatattatgtaa
atatattccttttttttggtatattacttaaattatatctatttttgtgcaataagacca
ataatttacttatctcttattaattatatttaaaaataaaatttataaatggataataaa
ttagttacatttatacatatatattataaatatataataaagctaaaaatatcgaaatta
ttaaacaaaaaaatattttttaatgatagttacagtataaaaaatatactcactacaaat
atagtatactattataaagtaatacctattcttatacaattccccaaggtcttctaaatt
tttgaacaatgaaaatagccatgtaactaataactgcagaatatctctgcatttaaaagt
tacatagctattttcattactagcaattatagattgctcttttaaatccaaccaatcttt
atctaataaaaaatttaatcgcactatatacaaaaggtgcaactaatataacactatcaa
atctatctaatatacccccatgaccaggtattatctttccataatcctttatccctacat
atctctttatagaagatgcaaataaatctcctaattgagctattacacttcctatacttc
ctattatcgctaattgaagcaaatcaatgccaaataaatatccaaataaaatacaacaaa
gtgtacttcctattattcctccaatagctccttctatagtctttttaggactaactttag
gaattagcttatgttttccaagtaaataaccactaaaatatgcaaatatatctgtcataa
aagatatcacaaatataagccatacatatatactacctttttcaaatccatttatagtta
taattataaaatctaaaaatactcctatataaaaaactcctaaaaacgtaatcgaaacat
ctataacattgtttttgcccatcaacatataaattatacttgctaaaaataaaataaaaa
ttactgcataagtatattctaatggtaaattaaaaatattttttacagctaaataaatag
aaaataaatatcctataatgaatattggatgtacatcttttattttaaatgccttataaa
actcatgcaatgcaatataaactattgctgtctcagctatatatagaggaatacctccat
atacaacaaatagaaataatggaaccagagctagtgaagcaataattcttgtaagcataa
aataatctccttacttaagtcctccaaatcttctatcccttctttgatatacgtatatag
ccttctgtagttcttcttttttaaaatcaggccaatgtatatcagtaaagtaaaactcag
aataagcaacttcccaaagtaaaaagttactcaatctttgttcaccacttgttcttatta
ccaagtctggatctggtatagactttgtgcttaaatagttttttataatatcttcatcaa
tattgtttatatctattttaccactttcacaattttttactatatctataagagcatttt
ttatatctgctctacttccgtagtttaatgctaaatttaagttaactcctgtattgtttt
ttgtcagttccttagctgagtttaattctcttatacaagtttttggtaaagcacttatat
ctcctatagcagttacttttacattgttttggtgaagttcagctatttcatttcttaagt
atgtagataataagttcataagtgtgtcaacttcaagtttcggtcttttccagttttctg
ttgaaaatgcatataatgttaagtgcttaacacctaattttgagcattcttttactatat
ctcttatagtttctactccagccttatgtcctgcagttcttggaagaaatctagcttttg
cccatcttccatttccatccattataatagcaatatgagtaggtatgttatttaagtcta
tatcatatataatgttgttattcatattttgcctccaatattgttctgactccttaaact
aaggagtcagaaaagtatgtgattatcagttctacactatcacctatctcagatattttt
ataactctaggaactacaagtttttctttatcctttttaccttcaatagattttacggta
taatttatattttgctcatcaaaatattgttttacctcatctacatgaagacctaaaagg
ttataatattttttcaatattatacctccattatgtccttttcttttttagataataatg
catctatttcttttataaatttatcagtcattttttgaacttcatcttgtgcttttttta
attcatcttcagttaattctccgcctttttccatctttttaattttctcattggcgtctc
ttctttcatttcttattctaactttaaattcttctgcagctttactagcttttttagcta
attcttttcttctttcttctgttaaagcaggtacagaaagtcttataacctcaccatcat
ttgatggatttaatcctaagtctgagttagctatcgctttttctatttcatgcatagcag
atttatcccaaggagatatcattaatattcttggttctggtacagatatagcacctattt
gatttattggagttggagttccataataatcaactcttattttgtctagcatttgtgcat
tagctcttcctgctcttatagttccaaattcaaactttaaagcatcaattgtcccattca
ttttctcttctaattgcttatgtatttccagtttcataattttactcctccttcattctt
cattattttacagtagttcctatattttcgccttttactgctcttattatattctctgtt
gtaagctcaaatacctttattggaattttattatccatacataaagatgtagctgtagaa
tccattacttttaattctttctgtataacttccatgtaacttaattctgtaaatttctta
gcatctgcatgtacttttggatccttgtcatatactgcatcaacatttttagctaacaat
ataacttctgcttccatctcagcagcacgtaaagcagcagttgtatctgttgtaaagtaa
gggtttcctgttcctgcaccaaatataacaactctttccttttctaagtgtctaactgct
cttcttcttatatatggttctgcaatttgtctcatgtctatagcagtttgaactcttgta
gcaacatctatattttctagtgcatcctgtagcgccattgcattcataactgtagctaac
attcctatatagtcagcagtagttctgtccattccttcactggttctgcctctccagaag
tttcctccacctactactacagctacttcaacacctatttcttgtattttttttatagca
atagcaatatcattaactacatcattatttataccaaaacctctttctcctgctaatgct
tctccacttaattttaacaatacccttttgtacattggtttatccatcagaaacctccta
tttcaatccttcatatccaattttttctattttttaaaaaagagaacacctgcgtgttct
ctctttggttattacttaagttgcttagcaacttcttctgcaaagttttcttctctcttt
tgtataccttcaccaacttcgaatctcacaactttaacaacttttatatcagaacctact
gccttagcaacatcagcaactaattgtttaacagttatatctggatttttaacgaaagtt
tgctctaataaacaaacctcttttaattctttttctaatcttcctttaaccattttttca
actatattagctggttttccttcatttaaagcttgttgagttaatacttctgtttcatgt
gctatgtattcagcatctacttcatctcttgaaacatacttaggattcatagcagcaact
tgcatagctacatctttacctaattctaaaactttagcatctctagcttctgtttccatt
tcaacaagaacacctatttttccaccaccgtgaatgtatccagcaacttgtccattagtt
acaactttagcaaatcttctaaagtctaatttctcacctatttttgcaactctattattt
aaaacttcttgtaaagttattccctctttatgagtttcacctaataaagaagctatatct
tctttatcagtagctaatgccatacaagcagcatctttaacgaacactttgaagtcttcg
tttttagcaacgaaatctgtctctgagttaacttctaccatagaagcaactgtattatca
tcattcatttctattgcaactagaccttcagcagcaactctaccagcttttttagcagct
tttgataatcctttttctcttaataaatctactgctttttccatgtttccttcagcttct
tgtaaagctttcttgcagtccatcattcctgcgcctgtactttctcttaactcttttacc
atttgagcagttatattagccattttttaagtttcctcctacttattctattccatatta
taaatggtaagggcgacccttaccatttaattgtcaaattattattcttggtcttcagct
acttcttcctcagcaccttgtctaccttcaattacagctgttgccatagcaccagttatt
aattttacggctcttatagcgtcatcatttcctggtatagcaaagtctaattgttctggg
tcacagttagtatcaactataccaactactggtatacctaatctatgagcttcttgaata
gctatgttttcttttcttgggtcaactacgaacattgcacctggtaattcaggcatgtct
tttattccacctaagtatttttctagtttttctttttcagctcttaattttataacttct
tttttaggaagaacattaaatacgccttcttcttccattttttctaattctcttaattta
tttattcttgtttttatagttttgtggtttgttaacattccacctaaccatctttcatta
acaaagtacattccacatctttcagcttcatcttttatcgcatcttgagcttgtttttta
gttcctacgaataagattggctttcctgtttcagctacttctttagtgaacttgtaagct
tcttcaacttttttaactgttttttgtaagtcgattatatatattccatttctctctgtg
aatatatacttagccattttagggttccatcttcttgtttggtgaccaaagtgaacacct
gcttctaataattgtttcattgatattactgacatatcttacctcctggttttatacctc
cagcttgatcttctccctaaaaaaccatgtaataggcaccttttaaggatcccaatgctg
tgtgtgatttattttattttttcacctctagtagtatatcacagaggtgaagaaataaca
atattttttccatattttctatttttatatttttttgtgtattttataccattttttgaa
tttaatttgcaaatttcatttttaattttgtttttaatgatacgttatctatactattat
tacttactatatctacacttccaagtaagtcacctgaattagtataatattttataatac
ccatagtatcaccttttttaacagggtactctatatttttaatcttaacttctgatttta
tactttcatcatcttttaatattgtataaagttcatcttttgcttttaatgtaacctcta
actctttcattccttttatatatttcttaccaataaagctatctttatcaattacttttt
tcatattgaaattttcttttccatatttcagtagagctaatgaagcagaggttcttttat
ttttatggttagtacctaatacaacccctattactctacgttttttctcatttttatcat
ttttatttacaatcatagaaaatgataagcaatatccagcattgccagtatatccagttt
ttataccatctacttctggtataattcttaataatgcatttgtattgcttttttcaaaac
ttctatctgaatttgtatatgtctccatatcagttatagctgttacttgtttttcataat
ggtcaaacatgtattttccaagaatagctatatcttttgcagtagagatattttcttttg
ctggttttttggggttgcttaaatcgtatattggaagaccatttggatttagaaaatgtg
tattactcattcctatttcttttgcttttttattcattctatctacaaatgcttctttcg
ttttacaaatatgttttgctatagcaattgccgcatcatttcctgatacaatcataagac
ctctcataagctctataagtggcacttcttcaccatctttaagtttataacttgaccctt
ttactgatgcaatagatttgtctatttttactttatcagtttcttttacttctttatttt
caatagcttctattgcaagtaaaaaagtcatcatcttacttaaactagctaatggtacct
tcatatcaggttctttactatataaaactctacctgtttcttggtctataagtatagatg
tttttgaatacttgtctacagatttatcatctgcatatgaataatttggtattataaaaa
ctagaatcatggctaatgatataattttttttagtgcatttttcaaatttttcaccttct
tggattattaagtatatttatatttaaattttccctatttagtccaatttatatctagta
attaatacctatccatatttacacaaatattaccttatcattcttttaataatcacagat
gcccaaattgctcctattgtaactccaaaaaatacttctatacctgccaatgctttccca
atcaaacttgtagcaaccatatctccatatcctactgtactaaatgtagccatgctaaaa
taccataaatccatatacattttgaaaatctcacttagtgagtaatcacctatattattt
atatctaaagctacaagtgtgctatttgaactttctatgcctacaaataagtataataaa
gcaaaaacacttattattgctataataactaataatatattccatggcttttctccataa
cctgttgtgtaacgtgctatttggtcaaaaaatttttcaactaaataatcactgaaagta
ggataattagaacgtttcattattttactactataaattctttccttataatagtaaaat
cctatcatctcatattctccaatttttgttgcttgatttctagctattctataatttatc
ttgccatgctcatactcactttttccatattcaacattctttaacacaaattttgtacac
atgctaaaaattattccatccattcttggaaaattttctactttattaactaccaaatca
ggtcctttaaatttcactttttcaaatatacggtcatttatatagtttttactaaatatg
cttctattaaaatcacagttttctaagaatacacaaccattaaataaaactttatctcta
aattctgtatagttaaaaataatattctttttaaaaatatattttttaaaatttgctttt
tgtttaaatatggattcagaaaaatccagtattttataattgtaagttaatatttcttcc
gcattaaattcattttcaaaaacaaatccattaaattcacttatctcttctttatgaata
gtatccatcatcaactgtatttcttcatcagacttattttctttatgaaagatacaatat
ccagaagaatctgcttctctatgacatttttttctctcatctattttagatatccattta
caattcataaatatatatcctccagtacaaaacaattattactattttgtattagtttgg
atattattttattttatatacttaaatagttacaaaatatatattagattcttagtttta
aatttttaatctacttcattgtgcttttaatttgtttcatataaaaaataataaatttta
tatactttgatttatttatatattaaatatgattctaaaacttacttatcatttttaagt
aattttgtaactatatttaatgctactaaatcatccataaatcctattgggaatacgaag
tctggaatcacatctgttgatataacaaaataaagtagcatacttccaatcaataaatat
ttctttattgtaagtccatctgtacaaaaatcagcatacatttgtcttaatctatctgta
aattgaccttgtttttcaatagaatctatttttttattaaaattatcaaaaagtaatttt
ttaccttcatctgtttggacatataacttacacttacttaactctttttcaatatttcca
ttaaagttcttatcattgattaaatttgcaaatccaagaatatcatcaaagttactaaaa
tcactatctgcattaaatatttgattattgctgtttctaaattcatatcctgaagctttc
aacagttcttctaggttaatatttaaatgtattgccatcttttctaaatgatttatattt
ggcttttgtttattattagctatacgagatatagtagatttatcaattccacttttttta
cttagttctcccattgataattctttttcatctaataaaatcttcaacaaatcaccgaaa
ttcccaaccttattattttgttccattattttcacccgctttattatgattggttttata
ttattatatgatatgattcttttgttatttaggtgttgtatgatgttggaattttatcaa
caatttattggattatctgtaacaatttatccatttttacaatactataactaatataag
tacaaaatttaagagaaaggatgttaatctactgtgattgaatcaattttattagttact
tctctttgtatagatgcctttgtgacaagctttggatatggcgtaaataaagttaaagtt
cccttatattcaaatataattatcagcgtagtttgttcagctattttagcaatatcgctt
tttgcaggtacaatagttagagactttttacctcaaaatataacaatgttaatatgtttc
tttattttatttttattaggaagtgctagactaattgaaagtttttttaaatcttatttt
aagaaaaaatctatacactcaaagaattataattttaatatgttagaccttaaattaaat
tttaatgtaagtatcgaacctgatgtcttagatacaagtaaatctaaagtgcttaaatct
gctgaagcatttacacttgcacttgctttaagtttagatggattagctatcggttttggt
agtggccttgtaggtgtgaattatatacaagttattctattttctttaatatcaaatata
attgcagtattacttggttgtttactaggaaatatgtttgttaaaaacgtaaatttaaac
ttatcttggttaagtggtttaatcttgttagtcattggatttatgaagatatgttaataa
gaaagcaatctaaagataaacttttctctttagattgctttcttttgtgctttttatatt
tattttctattctctctaatttctttctgaatctttttaagagctttttttgaacctctt
tgaatatctttttctaattttctttctttaaaactagtaaataatacatctaaatcatac
ccttctggatacaattctgatgcttttatgctaagttgtaatctttttatatttactgaa
ataaaattatcattaaacaatacttctacattattaaacttgtccataggtttatataca
attccaaaatcatcttcatctagtaattttaccttatcccctacattataatctgtatag
tttaaaatgacttcagaactatttttatcttcaatattagattgtagcttacttctttta
actaaatctaaattgtagtttctatcaattacatattctttagctctatctaaaactcta
ttttttattcccatttttttagaaataaaaagagcattactatcttcagattttccaata
gttaacttatacaatggttctaacgtttctttatcaaacatcataccagcattttcaaat
tctggatgcaatgtagcaaacttttttatctctccataatgagttgatgctatagttata
catcccattttgtaaaactcttctaataatgatattgctaaaccagctccttcattaggt
tcagttccacttcctatttcatcaaacagaacaagagtagaattatttgataaactcata
atctctgcaatattttttatatgtgatgaaaaagtacttaaggcattttcaatactttga
ttatcccctatatctacaaaaactttttcaaatacactaaattcactaccttcttttgca
gaaatatcaaatccacattgaaccattaaagttagtaaaccaacagtcttaagggttaca
gtttttcctcctgcattaggacctgttattataagacttctataatttttgcctatttca
aaatctaaaggtactgcatctcctgttagaagtggatgtttacctttaattatttttata
tagccattattatttatttttggagtaattccttttattttttgactatacttagctttt
gcaaataccatatcgtattctgaaagtatctctatatttaattttatctgacttatcttc
tcaaatataagttctgttaaataagataatattttgtattcttcaatagtttcatcagct
tttagcatagttaactctgtacttaaatttgaaacactaataggttcaataaatacagta
tttccttttgatgatgtatctaatatagtaccattaacttcatttttataagaagattta
attggtattacatatctatcatttcttttacttattataaactcttgtatatacttttta
tttacagttgatgttataaatttatttaatctatcttttatctttccttctgtaatttct
atatttcgtcttatcttttttaattctttactagcattagaatcaactttattagatttt
atacagtaatttatctcatcttctatacttttacattctgttatatttaaggcataagaa
cttaatgtaggtgaataaaattctttttctaacataaaagctttcatcttcctacaacct
cttaaaaaatcttcaatatttacaagttcaacaggttctattatcattcctttttcaatt
ttatctattgtagaacctacattaaacaatccttcaagtggtatgtgattactattttca
attatctttctagcttctttattttctgctaatttccttcttactactccaatattccca
ctaggagttaatttatctattaaattttttcctagcgaacttacacaatgtatttttatt
aagtctttaacttcatttagttgtaatctttcaaatgtattactattcattattttttct
cctttatttataagtcatcgtcttttaaatcaccctatcatttactttgataatagttat
tttgcgaacaacttaataaataaggagttattatatatcaaactccttatttattaagaa
gtttaactccggactcattaatgttagtattttttttcataaaacacttctccttttcta
ttcttatttaaacacttatatcagtgcttctaatattattccataaattatatatttatg
tcaataaaaataatgtcattaatgtttttgtacagtgaaaatttttatagtaaaaataag
cttatactttcatttatatttgggaatcacttatattgtcatcaattcatgtatgtgcag
tttccaatacagtctaactttgtaatcattatatatcaaagaatttagctctataaatta
tcgtctctacaaaataaaaaaatagctaataataaaacacttttaaatgttccataaaat
tagctatttataatataattttaatcttttttaactttaaaaat