| Block details | |
|---|---|
| fasta | C_difficile_CD00035_1A_022456.fasta |
| contig | u00000crpx_c_022456 |
| start | 2417541 |
| length | 14863 |
| strand | + |
| type | core |
| seq | tatttattaaaaattaatcaatttgaaagaagctatgatataggaatttttaaaaatgaa caatcaatatataaatttattgaaaaaataccctttgtaaaaaaagataatagtaatttt aattatacaaattactatatggaatttgaagatattcctgaatattatgaagtaaatttc aataattatttatatattattaccaggttttcattcattccagatggaactgagatattt tttacttgggaagaaatccattgttgggatgaaaaagttgctaccgagaaaacttttata aatggcgaaacattagtggattcatataactttccaaataatgaagtgaaagactacata caaaagcgagaatcactatatatagaaacaaaaaaatattatgaagaaaaaggattaaaa attgagagacatgcactcggttcagaagatggtgaatatgttgaacttacaaatgattct atactttatttactagatatagaagcagttgaaataagagaacaatcaaaaaatatagaa gaatttctatataagtacaaaaaacgttttaaataatttatattttaaaatacataacaa tacattgagtcatttaacgaaatataaaatgactcaatgtatagactaataaaaataatt atattattttttagttacatatttgttaaaaaattctttttcttctatcggtttagaaaa ataaaacccttgtcctacatcacatttaactgtatttaaaaattccaagtcttttttagt ttcaataccttcacatacaacagacatgcctatacgatgtgacatttcaataatacattg aataatactatatactttctcccggttaaaggtttctttaagtaagcttttatctaactt caatccattaatagatagagaacataaaagacttaatgaagagtatcctgaaccaaaatc atccattgaaattaaaaatcctaactttttaagctcctctaaaatcgaaataactggttg agatatttcattaaaagcactttcagttacctctatctctatatacttaaaaggaatttc atattctttaacagtatctaaaaacctttgataaaaactattttggtaaatagtaaccct tgaaaaattaactgcaatcggatatgtatattgattttttttcataaacgttttttttac aaatgaacacgctttttttaacatataaaagtccaattcaataataaatccacttttttc aaacaatggaataaattcatctggtgataaaaaaccaagttctggagaaaaccatcttac aagagcttctgcgctcacaacatttaaagaagatatttgaaatttaggttgcaaatacat atgaaattcttcattttctatcgctttatacatataattataaatactattttccatttg taactgttttaacagattttcattataccatactgtagaagaaattcctcttgttttact taccttgtgtgcaatatttgccttatccattatagaattgatagatttataacctaaatt atcaatttcaactaagtaagctcctatacaataagatatagtttgagttacattcatatc taattcagagattatagcattagttagcatttcccgaatatcctctaaaagagaatctct atattttgcaagtattacaaaattatctgaacaaattcttgcacaagtttcttttatatt aaaagttttagaaagaacagttgcaactattattagaactttatctccatattcatatcc atgtgtatcattaatatatttaaaattgtcaatatcaatatttagcagtacatactcttt gttagatgcattgtgcaaaatttcaatcgctctgttttcaaatgcaacctgattttttat ttttgttaaattatcagtataaaatattcttttaaacctttttttattataatattccca aattaaaagacttattgttgagaatataagataaataaatagtgcagtagcaaaagaata caattttgcattagagtgtttttcagatataaaaacaatttgattagacaacacagaata ctcttcactcaatttatataatttatcacctgaagcaccatttctaacttttataatttc tttcttcatagattcccacatagaatccatttgatttagtttttgttgaaattctttatt atcacatctttgaaatccattttctccattacctgttcttagctttatcagaatattatc cagtcgttttatcaagtcatcatttctttcattattcaattcttgcttaacaaccttttg agtttcactgcgaatagtaccagtgtgacttataattttaatatgctctatactgtgata tagagaaaatataaaaagaataataataactagccaaatagcagaataaattaaaaaatc atattttttcttcattattgttacctcatttgtaatatatataatttgcaaataatcaat ctcttataaaaaatgattatcaatattttacagtgatatgtatttatcttaaatagttta atcatttataccctataaattctacaaattcatcacctccaacacaaacagcaatatacg tttttctaaaatttctttttaaacattcatcaacactatcattaaatcatttttaaattg ctcaattaatttactgcatcacttcttttcttataaaatatcaccccaataatatatttg tataatgtctttatgtctctttttaaatttggcatatacataatctatattttaataaat aattaaaatactatttacctacaatttaactctttgaatttattttatcatattatgtaa atatattccttttttttggtatattacttaaattatatctatttttgtgcaataagacca ataatttacttatctcttattaattatatttaaaaataaaatttataaatgtataataaa ttagttacatttatacatatatattataaatatataataaagctaaaaatatcgaaatta ttaaacaaaaaaatattttttaatgatagttatagtataaaaaatatactcactacaaat atagtatactattataaagtaatacctattcttatacaattccccaaggtcttctaaatt tttgaacaatgaaaatagccatgtaactaataactgcagaatatctctgcatttaaaagt tacatagctattttcattactagcaattatagattgctcttttaaatccaaccaatcttt atctaataaaaaatttaatcgcactatatacaaaaggtgcaactaatataacactatcaa atctatctaatatacccccatgaccaggtattatctttccataatcctttatccctacat atctctttatagaagatgcaaataaatctcctaattgagctattacacttcctatacttc ctattatcgctaattgaagcaaatcaatgccaaataaatatccaaataaaatacaacaaa gtgtacttcctattattcctccaatagctccttctatagtctttttaggactaactttag gaattagcttatgttttccaagtaaataaccactaaaatatgcaaatatatctgtcataa aagatatcacaaatataagccatacatatatactacctttttcaaatccatttatagtta taattataaaatctaaaaatactcctatataaaaaactcctaaaaacgtaatcgaaacat ctataacattgtttttgcccatcaacatataaattatacttgctaaaaataaaataaaaa ttactgcataagtatattctaatggtaaattaaaaatattttttacagctaaataaatag aaaataaatatcctataatgaatattggatgtacatcttttattttaaatgccttataaa actcatgcaatgcaatataaactattgctgtctcagctatatatagaggaatacctccat atacaacaaatagaaataatggaaccagagctagtgaagcaataattcttgtaagcataa aataatctccttacttaagtcctccaaatcttctatcccttctttgatatacgtatatag ccttctgtagttcttcttttttaaaatcaggccaatgtatatcagtaaagtaaaactcag aataagcaacttcccaaagtaaaaagttactcaatctttgttcaccacttgttcttatta ccaagtctggatctggtatagactttgtgcttaaatagttttttataatatcttcatcaa tattgtttatatctattttaccactttcacaattttttactatatctataagagcatttt ttatatctgctctacttccgtagtttaatgctaaatttaagttaactcctgtattgtttt ttgtcagttccttagctgagtttaattctcttatacaagtttttggtaaagcacttatat ctcctatagcagttacttttacattgttttggtgaagttcagctatttcatttcttaagt atgtagataataagttcataagtgtgtcaacttcaagtttcggtcttttccagttttctg ttgaaaatgcatataatgttaagtgcttaacacctaattttgagcattcttttactatat ctcttatagtttctactccagccttatgtcctgcagttcttggaagaaatctagcttttg cccatcttccatttccatccattataatagcaatatgagtaggtatgttatttaagtcta tatcatatataatgttgttattcatattttgcctccaatattgttctgactccttaaact aaggagtcagaaaagtatgtgattatcagttctacactatcacctatctcagatattttt ataactctaggaactacaagtttttctttatcctttttaccttcaatagattttacggta taatttatattttgctcatcaaaatattgttttacctcatctacatgaagacctaaaagg ttataatattttttcaatattatacctccattatgtccttttcttttttagataataatg tatctatttcttttataaatttatcagtcattttttgaacttcatcttgtgcttttttta attcatcttcagttaattctccgcctttttccatctttttaattttctcattggcgtctc ttctttcatttcttattctaactttaaattcttctgcagctttactagcttttttagcta attcttttcttctttcttctgttaaagcaggtacagaaagtcttataacctcaccatcat ttgatggatttaatcctaagtctgagttagctatcgctttttctatttcatgcatagcag atttatcccaaggagatatcattaatattcttggttctggtacagatatagcacctattt gatttattggagttggagttccataataatcaactcttattttgtctagcatttgtgcat tagctcttcctgctcttatagttccaaattcaaactttaaagcatcaattgtcccattca ttttctcttctaattgcttatgtatttccagtttcataattttactcctccttcattctt cattattttacagtagttcctatattttcgccttttactgctcttattatattctctgtt gtaagctcaaatacctttattggaattttattatccatacataaagatgtagctgtagaa tccattacttttaattctttctgtataacttccatgtaacttaattctgtaaatttctta gcatctgcatgtacttttggatccttgtcatatactgcatcaacatttttagctaacaat ataacttctgcttccatctcagcagcacgtaaagcagcagttgtatctgttgtaaagtaa gggtttcctgttcctgcaccaaatataacaactctttccttttctaagtgtctaactgct cttcttcttatatatggttctgcaatttgtctcatgtctatagcagtttgaactcttgta gcaacatctatattttctagtgcatcctgtagcgccattgcattcataactgtagctaac attcctatatagtcagcagtagttctgtccattccttcactggttctgcctctccagaag tttcctccacctactactacagctacttcaacacctatttcttgtattttttttatagca atagcaatatcattaactacatcattatttataccaaaacctctttctcctgctaatgct tctccacttaattttaacaatacccttttgtacattggtttatccatcagaaacctccta tttcaatccttcatatccaattttttctattttttaaaaaagagaacacctgcgtgttct ctctttggttattacttaagttgcttagcaacttcttctgcaaagttttcttctctcttt tgtataccttcaccaacttcgaatctcacaactttaacaacttttatatcagaacctact gccttagcaacatcagcaactaattgtttaacagttatatctggatttttaacgaaagtt tgctctaataaacaaacctcttttaattctttttctaatcttcctttaaccattttttca actatattagctggttttccttcatttaaagcttgttgagttaatacttctgtttcatgt gctatgtattcagcatctacttcatctcttgaaacatacttaggattcatagcagcaact tgcatagctacatctttacctaattctaaaactttagcatctctagcttctgtttccatt tcaacaagaacacctatttttccaccaccgtgaatgtatccagcaacttgtccattagtt acaactttagcaaatcttctaaagtctaatttctcacctatttttgcaactctattattt aaaacttcttgtaaagttattccctctttatgagtttcacctaataaagaagctatatct tctttatcagtagctaatgccatacaagcagcatctttaacgaacactttgaagtcttcg tttttagcaacgaaatctgtctctgagttaacttctaccatagaagcaactgtattatca tcattcatttctattgcaactagaccttcagcagcaactctaccagcttttttagcagct tttgataatcctttttctcttaataaatctactgctttttccatgtttccttcagcttct tgtaaagctttcttgcagtccatcattcctgcgcctgtactttctcttaactcttttacc atttgagcagttatattagccattttttaagtttcctcctacttattctattccatatta taaatggtaagggcgacccttaccatttaattgtcaaattattattcttggtcttcagct acttcttcctcagcaccttgtctaccttcaattacagctgttgccatagcaccagttatt aattttacggctcttatagcgtcatcatttcctggtatagcaaagtctaattgttctggg tcacagttagtatcaactataccaactactggtatacctaatctatgagcttcttgaata gctatgttttcttttcttgggtcaactacgaacattgcacctggtaattcaggcatgtct tttattccacctaagtatttttctagtttttctttttcagctcttaattttataacttct tttttaggaagaacattaaatacgccttcttcttccattttttctaattctcttaattta tttattcttgtttttatagttttgtggtttgttaacattccacctaaccatctttcatta acaaagtacattccacatctttcagcttcatcttttatcgcatcttgagcttgtttttta gttcctacgaataagattggctttcctgtttcagctacttctttagtgaacttgtaagct tcttcaacttttttaactgttttttgtaagtcgattatatatattccatttctctctgtg aatatatacttagccattttagggttccatcttcttgtttggtgaccaaagtgaacacct gcttctaataattgtttcattgatattactgacatatcttacctcctggttttatacctc cagcttgatcttctccctaaaaaaccatgtaataggcaccttttaaggatcccaatgctg tgtgtgatttattttattttttcacctctagtagtatatcacagaggtgaagaaataaca atattttttccatattttctatttttatatttttttgtgtattttataccattttttgaa tttaatttgcaaatttcatttttaattttgtttttaatgatacgttatctatactattat tacttactatatctacacttccaagtaagtcacctgaattagtataatattttataatac ccatagtatcaccttttttaacagggtactctatatttttaatcttaacttctgatttta tactttcatcatcttttaatattgtataaagttcatcttttgcttttaatgtaacctcta actctttcattccttttatatatttcttaccaataaagctatctttatcaattacttttt tcatattgaaattttcttttccatatttcagtagagctaatgaagcagaggttcttttat ttttatggttagtacctaatacaacccctattactctacgttttttctcatttttatcat ttttatttacaaccatagaaaatgataagcaatatccagcattgccagtatatccagttt ttataccatctacttctggtataattcttaataatgcatttgtattgcttttttcaaaac ttctatctgaatttgtatatgtctccatatcagttatagctgttacttgtttttcataat ggtcaaacatgtattttccaagaatagctatatcttttgcagtagagatattttcttttg ctggttttttggggttgcttaaatcgtatattggaagaccatttggatttagaaaatgtg tattactcattcctatttcttttgcttttttattcattctatctacaaatgcttctttcg ttttacaaatatgttttgctatagcaattgccgcatcatttcctgatacaatcataagac ctctcataagctctataagtggcacttcttcaccatctttaagtttataacttgaccctt ttactgatgcaatagatttgtctatttttactttatcagtttcttttacttctttatttt caatagcttctattgcaagtaaaaaagtcatcatcttacttaaactagctaatggtacct tcatatcaggttctttactatataaaactctacctgtttcttggtctataagtatagatg tttttgaatacttgtctacagatttatcatctgcatatgaataatttggtattataaaaa ctagaatcatggctaatgatataattttttttagtgcatttttcaaatttttcaccttct tggattattaagtatatttatatttaaattttccctatttagtccaatttatatctagta attaatacctatccatatttacacaaatattaccttatcattcttttaataatcacagat gcccaaattgctcctattgtaactccaaaaaatacttctatacctgccaatgctttccca atcaaacttgtagcaaccatatctccatatcctactgtactaaatgtagccatgctaaaa taccataaatccatatacattttgaaaatctcacttagtgagtaatcacctatattgttt atatctaaagctacaagtgtgctatttgaactttctatgcctacaaataagtataataaa gcaaaaacacttattattgctataataactaataatatattccatggcttttctccataa cctgttgtgtaacgtgctatttggtcaaaaaatttttcaactaaataatcactgaaagta ggataattagaacgtttcattattttactactataaattctttccttataatagtaagat cctatcatctcatattctccaatttttgttgcttgatttctagctattctataatttatc ttgccatgctcatactcactttttccatattcaacattctttaacacaaattttgtacac atgctaaaaattattccatccattcgtggaaaattttctactttattaactaccaaatca ggtcctttaaatttcactttttcaaatatacggtcatttatatagtgtttactaaatatg gttctattaaaatcacagttttctaagaatacacaaccattaaataaaactttatctcta aattctgtatagttaaaaataatattctttttaaaaatatattttttaaaatttgctttt tgtttaaatatggattcagaaaaatccagtattttataattgtaagttaatatttcttcc gcattaaattcattttcaaaaacaaatccattaaattcacttatctcttctttatgaaga gtatccatcatcaactgtatctcttcatcagacttattttctttatgaaagatacaatat ccagaagaatctgcttctctatgacatttttttctctcatctattttagatatccattta caattcataaatatatatcctccagtacaaaacaattattactattttgtattagtttgg atattattttattttatatacttaaatagttacaaaatatatattagattcttagtttta aatttttaatctacttcattgtgcttttaatttgtttcatataaaaaataataaatttta tatactttgatttatttatatattaaatatgattctaaaacttacttatcatttttaagt aattttgtaactatatttaatgctactaaatcatccataaatcctattgggaacacgaag tctggaatcacatctgttgatataacaaagtaaagtagcatacttccaatcaataaatat ttctttattgtaagtccatctgtacaaaaatcagcatacatttgtcttaatctgtctgta aattgaccttgtttttcaatagaatctatttttttattaaaattatcaaaaagtaatttt ttaccttcatctgtttggacatataacttacacttactcaactctttttcaatatttcca ttaaagttcttatcattgattaaatttgcaaatccaagaatatcatcaaagttactaaaa tcactatctgcattaaatatttgattattgctgtttctaaattcatatcctgaagctttc aacagttcttctaggttaatatttaaatgtattgccatcttttctaaatgatttatattt ggcttttgtttattattagctatacgagatatagtagatttatcaattccacttttttta cttagttctcccattgataattctttttcatctaataaaatcttcaacaaatcaccgaaa ttcccaaccttattattttgttccattattttcacccgctttattatgattggttttata ttattatatgatatgattcttttgttatttaggtgttgtatgatgttggaattttatcaa caatttattggattatctgtaacaatttatccatttttacaatactataactaatataag tacaaaatttaagagaaaggatgttaatctactgtgattgaatcaattttattagttact tctctttgtatagatgcctttgtgacaagctttggatatggcgtaaataaagttaaagtt cccttatattcaaatataattatcagcgtagtttgttcagctattttagcaatatcgctt tttgcaggtacaatagttagagactttttacctcaaaatataacaatgttaatatgtttc tttattttatttttattaggaagtgctagactaattgaaagtttttttaaatcttatttt aagaaaaaatctatacactcaaagaattataattttaatatgttagaccttaaattaaat tttaatgtaagtatcgaacctgatgtcttagatacaagtaaatctaaagtgcttaaatct gctgaagcatttacacttgcacttgctttaagtttagatggattagctatcggttttggt agtggccttgtaggtgtgaattatatacaagttattctattttctttaatatcaaatata attgcagtattacttggttgtttactaggaaatatgtttgttaaaaacgtaaatttaaac ttatcttggttaagtggtttaatcttgttagtcattggatttatgaagatatgttaataa gaaagcaatctaaagataaactttgctctttagattgctttcttttgtgctttttatatt tattttctattctctctaatttctttctgaatctttttaagagctttttttgaacctctt tgaatatctttttctaattttctttctttaaaactagtaaataatacatctaaatcatac tcttctggatacaattctgatgcttttatgctaagttgtaatctttttatatttactgaa ataaaattatcattaaacaatacttctacattattaaacttgtccataggtttatataca attccaaaatcatcttcatctagtaattttaccttatcccctacattataatctgtatag tttaaaatgacttcagaactatttttatcttcaatattagattgtagcttacttctttta actaaatctaaattgtagtttctatcaattacatattctttagctctatctaaaactcta ttttttattcccatttttttagaaataaaaagagcattactatcttcagattttccaata gttaacttatacaatggttctaacgtttctttatcaaacatcataccagcattttcaaat tctggatgcaatgtagcaaacttttttatctctccataatgagttgatgctatagttata catcccattttgtaaaactcttctaataatgatattgctaaaccagctccttcattaggt tcagttccacttcctatttcatcaaacagaacaagagtagaattatttgataaactcata atctctgcaatattttttatatgtgatgaaaaagtacttaaggcattttcaatactttga ttatcccctatatctacaaaaactttttcaaatacactaaattcactaccttcttttgca gaaatatcaaatccacattgaaccattaaagttagtaaaccaacagtcttaagggttaca gtttttcctcctgcattaggacctgttattataagacttctataatttttgcctatttca aaatctaaaggtactgcatctcctgttagaagtggatgtttacctttaattatttttata tagccattattatttatttttggagtaattccttttattttttgactatacttagctttt gcaaataccatatcgtattctgaaagtatctctatatttaattttatctgacttatcttc tcaaatataagttctgttaaataagataatattttgtattcttcaatagtttcatcagct tttagcatagttaactctgtacttaaatttgaaacactaataggttcaataaatacagta tttccttttgatgatgtatctaatatagtaccattaacttcatttttataagaagattta attggtattacatatcgatcatttcttttacttattataaactcttgtatatacttttta tttacagttgatgttataaatttatttaatctatcttttatctttccttctgtaatttct atatttcgtcttatcttttttaattctttactagcattagaatcaactttattagatttt atacagtaatttatctcatcttctatacttttacattctgttatatttaaggcataagaa cttaatgtaggtgaataaaattctttttctaacataaaagctttcatcttcctacaacct cttaaaaaatcttcaatatttacaagttcaacaggttctattatcattcctttttcaatt ttatctattgtagaacctgcattaaacaatccttcaagtggtatgtgattactattttca attatctttctagcttctttattttctgctaatttccttcttactactccaatattccca ctaggagttaatttatctattaaattttttcctagtgaacttacacaatgtatttttatt aattctttaacttcatttagttgtaatctttcaaatgtattactattcattattttttct cctttatttataagttatcgtcttttaaatcaccctatcatttactttgataatagttat tttgcgaacaacttaataaataaggagttattatatatcaaactccttatttattaagaa gtttaactccggactcattaatgttagtattttttttcataaaacacttctccttttcta ttcttatttaaacacttatatcagtgcatctaatattattccataaattatatatttatg tcaataaaaataatgtcattaatgtttttgtacagtgaaaatttttatagtgaaaataag cttataccttcatttatattttagaatcacttatattgtcatcaattcatgtatgtgcat tttccaatacagtctaactttgtaatcattatatatcaaagaatttagctctataaatta tcgtctctacaaaataaaaaaatagctaataataaaacacttttaaatgttccataaaat tagctatttataatataattttaatcttttttaactttaaaaat |