Block details
fasta C_difficile_CD00300_1A_020709.fasta
contig u00000crpx_c_020709
start 2340998
length 14864
strand +
type core
seq tatttattaaaaattaatcaatttgaaaaaagttatgatataggaatttttaaaaatgaa
caatcaatatataaatttattgaaaaaataccctttgtaaaaaaagataatagtaatttt
aattatacaaattactatatggaatttgaagatattcctgaatattatgaagtaaatttc
aataattatttatatattattaccaggttttcattcattccagatggaactgagatattt
tttacttgggaagaaatccattgttgggatgaaaaagttgctaccgagaaaacttttata
aatggcgaaacattagtggattcatataactttccaaataatgaagtgaaagactacata
caaaagcgagaatcactatatatagaaacaaaaaaatattatgaagaaaaaggattaaaa
attgagagacatgcactcggttcagaagatggtgaatatgttgaacttacaaatgattct
atactttatttactagatatagaagcagttgaaataagagaacaatcaaaaaatatagaa
gaatttctatataagtacaaaaaacgttttaaataatttatattttaaaatacataacag
tacattgagtcatttaacgagatataaaatgactcaatgtatagactgataaaaataatt
atattattttttagttatatatttgttaaaaaattctttttcttctatcggtttagagaa
ataaaacccttgtcctacatcacatttaactgtatttaaaaattccaagtcttttttagt
ttcaataccttcacatacaacagacatgcctatacgatgtgacatttcaataatacactg
aataatactatatactttctcccggttaaatgtttctttaagtaagcttttatctaactt
caatccattaatagatagagaacataaaagacttaatgaagagtatcctgatccaaaatc
atccatcgaaattaaaaatcctaactttttaagctcctctaaaatcgaaataactggttg
agatatttcattaaaagcactttcagttacctctatctctatatacttaaaaggaatttc
atattctttaacagtatctaaaaacctttgataaaaactattttggtaaatagtaaccct
tgaaaaattaactgcaatcggatatgtatattgattttttttcataaacgttttttttta
caaatgaacacgctttttttaacatataaaagtccaattcaataataaatccactttttt
caaacaatggaataaattcatctggtgataaaaaaccaagttctggagaaaaccatctta
caagagcttctgcgctcacaacatttaaagaagatatttgaaatttaggttgcaaataca
tatgaaattcttcattttctatcgctttatacatataattataaatactattttccattt
gtaactgttttaacagattttcattataccatactgtggaggaaattcctcttgttttac
ttaccttgtgtgcaatatttgccttatccatcatagaattgatagatttataacctaaat
tatcaatttcaactaagtaagctcctatacaataagatatagtttgagttacattcatat
ctaattcagagattatagcattagttagcatttcccgaatatcctctaaaagagaatctc
tatattttgcaagtattacaaaattatctgaaccaattcttgcacaagtttctttgatat
taaaagttttagaaagtgcagctgcaactattattagaactttatctccatattcatatc
catgtgtatcattaatatatttaaaattgtcaatatcaatatttagcagtacatactctt
tgttagatgcattgtgcaaaatttcaatcgctctgttttcaaatgcaacctgatttttta
tttttgttaaattatcagtataaaatattcttttaaacctttttttattataatattccc
aaattaaaagacttattgttgagaatataagataaataaatagtgcagtagcaaaagaat
acaattttgcattagagtgtttttcagatataaaaacaatttgattagacaacacagaat
actcttcactcaatttatataatttatcacctgaagcaccatttctaacttttataattt
ctttcttcatagattcccacatagaatccatttgatttagtttttgttgaaattctttat
tatcacatctttgaaatccattttctccattacctgttcttagctttatcagaatattat
ccagtcgttttatcaagtcatcatttctttcattattcaattcttgcttaacaacctttt
gagtttcactgcgaatagtaccagtgtgacttataattttaatatgctctatactatgat
atagagaaaatataaaaagaataataataactagccaaatagcagaataaattaaaaaat
catattttttcttcattattgttacctcatttgtaatatatataatttgcaaataatcaa
tctcttataaaaaatgattatcaatattttacagtgatatgtatttatcttaaatagttt
aatcatttataccctataaattctacaaattcatcacctccaacacaaacagcaatatac
gtttttctaaaatttctttttaaacattcatcaacattatcattaaatcatttttaaatt
gctcaattaatttactgcatcacttcttttcttacaaaatatcaccccaataatatattt
gtataatgtctttatgtctctttttaaatttggcatatacataatctatattttaataaa
taattaaaatactatttacctacaatttaactctttgaatttattttatcatattatgta
aatatattccttttttttggtatattacttaaattatatctatttttgtgcaataagacc
aataatttacttatctcttattaattatatttaaaaataaaatttataaatggataataa
attagttacatttatacatatatattataaatatataataaagctaaaaatatcgaaatt
attaaacaaaaaaatattttttaatgatagttacagtataaaaaatatactcactacaaa
tatagtatactattataaagtaatacctattcttatacaattccccaaggtcttctaaat
ttttgaacaatgaaaatagccatgtaactaataactgcagaatatctctgcatttaaaag
ttacatagctattttcattactagcaattatagattgctcttttaaatccaaccaatctt
tatctaataaaaaatttaatcgcactatatacaaaaggtgcaactaatataacactatca
aatctatctaatatacccccatgaccaggtattatctttccataatcctttatccctaca
tatctctttatagaagatgcaaataaatctcctaattgagctattacacttcctatactt
cctattatcgctaattgaagcaaatcaatgccaaataaatatccaaataaaatacaacaa
agtgtacttcctattattcctccaatagctccttctatagtctttttaggactaacttta
ggaattagcttatgttttccaagtaaataaccactaaaatatgcaaatatatctgtcata
aaagatatcacaaatataagccatacatatatactacctttttcaaatccatttatagtt
ataattataaaatctaaaaatactcctatataaaaaactcctaaaaacgtaatcgaaaca
tctataacattgtttttgcccatcaacatataaattatacttgctaaaaataaaataaaa
attactgcataagtatattctaatggtaaattaaaaatattttttacagctaaataaata
gaaaataaatatcctataatgaatattggatgtacatcttttattttaaatgccttataa
aactcatgcaatgcaatataaactattgctgtctcagctatatatagaggaatacctcca
tatacaacaaatagaaataatggaaccagagctagtgaagcaataattcttgtaagcata
aaataatctccttacttaagtcctccaaatcttctatcccttctttgatatacgtatata
gccttctgtagttcttcttttttaaaatcaggccaatgtatatcagtaaagtaaaactca
gaataagcaacttcccaaagtaaaaagttactcaatctttgttcaccacttgttcttatt
accaagtctggatctggtatagactttgtgcttaaatagttttttataatatcttcatca
atattgtttatatctattttaccactttcacaattttttactatatctataagagcattt
tttatatctgctctacttccgtagtttaatgctaaatttaagttaactcctgtattgttt
tttgtcagttccttagctgagtttaattctcttatacaagtttttggtaaagcacttata
tctcctatagcagttacttttacattgttttggtgaagttcagctatttcatttcttaag
tatgtagataataagttcataagtgtgtcaacttcaagtttcggtcttttccagttttct
gttgaaaatgcatataatgttaagtgcttaacacctaattttgagcattcttttactata
tctcttatagtttctactccagccttatgtcctgcagttcttggaagaaatctagctttt
gcccatcttccatttccatccattataatagcaatatgagtaggtatgttatttaagtct
atatcatatataatgttgttattcatattttgcctccaatattgttctgactccttaaac
taaggagtcagaaaagtatgtgattatcagttctacactatcacctatctcagatatttt
tataactctaggaactacaagtttttctttatcctttttaccttcaatagattttacggt
ataatttatattttgctcatcaaaatattgttttacctcatctacatgaagacctaaaag
gttataatattttttcaatattatacctccattatgtccttttcttttttagataataat
gtatctatttcttttataaatttatcagtcattttttgaacttcatcttgtgcttttttt
aattcatcttcagttaattctccgcctttttccatctttttaattttctcattggcgtct
cttctttcatttcttattctaactttaaattcttctgcagctttactagcttttttagct
aattcttttcttctttcttctgttaaagcaggtacagaaagtcttataacctcaccatca
tttgatggatttaatcctaagtctgagttagctatcgctttttctatttcatgcatagca
gatttatcccaaggagatatcattaatattcttggttctggtacagatatagcacctatt
tgatttattggagttggagttccataataatcaactcttattttgtctagcatttgtgca
ttagctcttcctgctcttatagttccaaattcaaactttaaagcatcaattgtcccattc
attttctcttctaattgcttatgtatttccagtttcataattttactcctccttcattct
tcattattttacagtagttcctatattttcgccttttactgctcttattatattctctgt
tgtaagctcaaatacctttattggaattttattatccatacataaagatgtagctgtaga
atccattacttttaattctttctgtataacttccatgtaacttaattctgtaaatttctt
agcatctgcatgtacttttggatccttgtcatatactgcatcaacatttttagctaacaa
tataacttctgcttccatctcagcagcacgtaaagcagcagttgtatctgttgtaaagta
agggtttcctgttcctgcaccaaatataacaactctttccttttctaagtgtctaactgc
tcttcttcttatatatggttctgcaatttgtctcatatctatagcagtttgaactcttgt
agcaacatctatattttctagtgcatcctgtagcgccattgcattcataactgtagctaa
cattcctatatagtcagcagtagttctgtccattccttcactggttcttcctctccagaa
gtttcctccacctactactacagctacttcaacacctatttcttgtattttttttatagc
aatagcaatatcattaactacatcattatttataccaaaacctctttctcctgctaatgc
ttctccacttaattttaacaatacccttttgtacattggtttatccatcagaaacctcct
atttcaatccttcatatccaattttttctattttttaaaaaagagaacacctgcgtgttc
tctctttggttattacttaagttgcttagcaacttcttctgcaaagttttcttctctctt
ttgtataccttcaccaacttcgaatctcacaactttaacaacttttatatcagaacctac
tgccttagcaacatcagcaactaattgtttaacagttatatctggatttttaacgaaagt
ttgctctaataaacaaacctcttttaattctttttctaatcttcctttaaccattttttc
aactatattagctggttttccttcatttaaagcttgttgagttaatacttctgtttcatg
tgctatgtattcagcatctacttcatctcttgaaacatacttaggattcatagcagcaac
ttgcatagctacatctttacctaattctaaaactttagcatctctagcttctgtttccat
ttcaacaagaacacctatttttccaccaccgtgaatgtatccagcaacttgtccattagt
tacaactttagcaaatcttctaaagtctaatttctcacctatttttgcaactctattatt
taaaacttcttgtaaagttattccctctttatgagtttcacctaataaagaagctatatc
ttctttatcagtagctaatgccatacaagcagcatctttaacgaacactttgaagtcttc
gtttttagcaacgaaatctgtctctgagttaacttctaccatagaagcaactgtattatc
atcattcatttctattgcaactagaccttcagcagcaactctaccagcttttttagcagc
ttttgataatcctttttctcttaataaatctactgctttttccatgtttccttcagcttc
ttgtaaagctttcttgcagtccatcattcctgcgcctgtactttctcttaactcttttac
catttgagcagttatattagccattttttaagtttcctcctacttattctattccatatt
ataaatggtaagggcgacccttaccatttaattgtcaaattattattcttggtcttcagc
tacttcttcctcagcaccttgtctaccttcaattacagctgttgccatagcaccagttat
taattttacggctcttatagcgtcatcatttcctggtatagcaaagtctaattgttctgg
gtcacagttagtatcaactataccaactactggtatacctaatctatgagcttcttgaat
agctatgttttcttttcttgggtcaactacgaacattgcacctggtaattcaggcatgtc
ttttattccacctaagtatttttctagtttttctttttcagctcttaattttataacttc
ttttttaggaagaacattaaatacgccttcttcttccattttttctaattctcttaattt
atttattcttgtttttatagttttgtggtttgttaacattccacctaaccatctttcatt
aacaaagtacattccacatctttcagcttcatcttttatcgcatcttgagcttgtttttt
agttcctacgaataagattggctttcctgtttcagctacttctttagtgaacttgtaagc
ttcttcaacttttttaactgttttttgtaagtcgattatatatattccatttctctctgt
gaatatatacttagccattttagggttccatcttcttgtttggtgaccaaagtgaacacc
tgcttctaataattgtttcattgatattactgacatatcttacctcctggttttatacct
ccagcttgatcttctccctaaaaaaccatgtaataggcaccttttaaggatcccaatgct
gtgtgtgatttattttattttttcacctctagtagtatatcacagaggtgaagaaataac
aatattttttccatattttctatttttatatttttttgtgtattttataccattttttga
atttaatttgcaaatttcatttttaattttgtttttaatgatacgttatctatactatta
ttacttactatatctacacttccaagtaagtcacctgaattagtataatattttataata
cccatagtatcaccttttttaacagggtactctatatttttaatcttaacttctgatttt
atactttcatcatcttttaatattgtataaagttcatcttttgcttttaatgtaacctct
aactctttcattccttttatatatttcttaccaataaagctatctttatcaattactttt
ttcatattgaaattttcttttccatatttcagtagagctaatgaagcagaggttctttta
tttttatggttagtacctaatacaacccctattactctacgttttttctcatttttatca
tttttatttacaaccatagaaaatgataagcaatatccagcattgccagtatatccagtt
tttataccatctacttctggtataattcttaataatgcatttgtattgcttttttcaaaa
cttctatctgaatttgtatatgtctccatatcagttatagctgttacttgtttttcataa
tggtcaaacatgtattttccaagaatagctatatcttttgcagtagagatattttctttt
gctggttttttggggttgcttaaatcgtatattggaagaccatttggatttagaaaatgt
gtattactcattcctatttcttttgcttttttattcattctatctacaaatgcttctttc
gttttacaaatatgttttgctatagcaattgccgcatcatttcctgatacaatcataaga
cctctcataagctctataagtggcacttcttcaccatctttaagtttataacttgaccct
tttactgatgcaatagatttgtctatttttactttatcagtttcttttacttctttattt
tcaatagcttctattgcaagtaaaaaagtcatcatcttacttaaactagctaatggtacc
ttcatatcaggttctttactatataaaactctacctgtttcttggtctataagtatagat
gtttttgaatacttgtctacagatttatcatctgcatatgaataatttggtattataaaa
actagaatcatggctaatgatataattttttttagtgcatttttcaaatttttcaccttc
ttggattattaagtatatttatatttaaattttccctatttagtccaatttatatctagt
aattaatacctatccatatttacacaaatattaccttatcattcttttaataatcacaga
tgcccaaattgctcctattgtaactccaaaaaatacttctatacctgccaatgctttccc
aatcaaacttgtagcaaccatatctccatatcctactgtactaaatgtagccatgctaaa
ataccataaatccatatacattttgaaaatctcacttagtgagtaatcacctatattgtt
tatatctaaagctacaagtgtgctatttgaactttctatgcctacaaataagtataataa
agcaaaaacacttattattgctataataactaataatatattccatggcttttctccata
acctgttgtgtaacgtgctatttggtcaaaaaatttttcaactaaataatcactgaaagt
aggataattagaacgtttcattattttactactataaattctttccttataatagtaaaa
tcctatcatctcatattctccaatttttgttgcttgatttctagctattctataatttat
cttgccatgctcatactcactttttccatattcaacattctttaacacaaattttgtaca
catgctaaaaattattccatccattcgtggaaaattttctactttattaactaccaaatc
aggtcctttaaatttcactttttcaaatatacggtcatttatatagtgtttactaaatat
ggttctattaaaatcacagttttctaagaatacacaaccattaaataaaactttatctct
aaattctgtatagttaaaaataatattctttttaaaaatatattttttaaaatttgcttt
ttgtttaaatatggattcagaaaaatccagtattttataattgtaagttaatatttcttc
cgcattaaattcattttcaaaaacaaatccattaaattcacttatctcttctttatgaag
agtatccatcatcaattgtatctcttcatcagacttattttctttatgaaagatacaata
tccagaagaatctgcttctctatgacatttttttctctcatctattttagatatccattt
acaattcataaatatatatcctccagtacaaaacaattattactattttgtattagtttg
gatattattttattttatatacttaaatagttacaaaatatatattagattcttagtttt
aaatttttaatctacttcattgtgcttttaatttgtttcatataaaaaataataaatttt
atatactttgatttatttatatattaaatatgattctaaaacttacttatcatttttaag
taattttgtaactatatttaatgctactaaatcatccataaatcctattgggaacacgaa
gtctggaatcacatctgttgatataacaaagtaaagtagcatacttccaatcaataaata
tttctttattgtaagtccatctgtacaaaaatcagcatacatttgtcttaatctatctgt
aaattgaccttgtttttcgatagaatctatttttttattaaaattatcaaaaagtaattt
tttaccttcatctgtttggacatataacttacacttactcaactctttttcaatatttcc
attaaagttcttatcattgattaaatttgcaaatccaagaatatcatcaaagttactaaa
atcactatctgcattaaatatttgattattgctgtttctaaattcatatcctgaagcttt
caacagttcttctaggttaatatttaaatgtattgccatcttttctaaatgatttatatt
tggcttttgtttattattagctatacgagatatagtagatttatcaattccacttttttt
acttagttctcccattgataattctttttcatctaataaaatcttcaacaaatcaccgaa
attcccaaccttattattttgttccattattttcacccgctttattatgattggttttat
attattatatgatatgattcttttgttatttaggtgttgtatgatgttggaattttatca
acaatttattggattatctgtaacaatttatccatttttacaatactataactaatataa
gtacaaaatttaagagaaaggatgttaatctactgtgattgaatcaattttattagttac
ttctctttgtatagatgcctttgtgacaagctttggatatggcgtaaataaagttaaagt
tcccttatattcaaatataattatcagcgtagtttgttcagctattttagcaatatcgct
ttttgcaggtacaatagttagagactttttacctcaaaatataacaatgttaatatgttt
ctttattttatttttattaggaagtgctagactaattgaaagtttttttaaatcttattt
taagaaaaaatctatacactcaaagaattataattttaatatgttagaccttaaattaaa
ttttaatgtaagtatcgaacctgatgtcttagatacaagtaaatctaaagtgcttaaatc
tgctgaagcatttacacttgcacttgctttaagtttagatggattagctatcggttttgg
tagtggccttgtaggtgtgaattatatacaagttattctattttctttaatatcaaatat
aattgcagtattacttggttgtttactaggaaatatgtttgttaaaaacgtaaatttaaa
cttatcttggttaagtggtttaatcttgttagtcattggatttatgaagatatgttaata
agaaagcaatctaaagataaacttttctctttagattgctttcttttgtgctttttatat
ttattttctattctctctaatttctttctgaatctttttaagagctttttttgaacctct
ttgaatatctttttctaattttctttctttaaaactagtaaataatacatctaaatcata
cccttctggatacaattctgatgcttttatgctaagttgtaatctttttatatttactga
aataaaattatcattaaacaatacttctacattattaaacttgtccataggtttatatac
aattccaaaatcatcttcatctagtaattttaccttatcccctacattataatctgtata
gtttaaaatgacttcagaactatttttatcttcaatattagattgtagcttacttctttt
aactaaatctaaattgtagtttctatcaattacatattctttagctctatctaaaactct
attttttattcccatttttttagaaataaaaagagcattactatcttcagattttccaat
agttaacttatacaatggttctaacgtttctttatcaaacatcataccagcattttcaaa
ttctggatgcaatgtagcaaacttttttatctctccataatgagttgatgctatagttat
acatcccattttgtaaaactcttctaataatgatattgctaaaccagctccttcattagg
ttcagttccacttcctatttcatcaaacagaacaagagtagaattatttgataaactcat
aatctctgcaatattttttatatgtgatgaaaaagtacttaaggcattttcaatactttg
attatcccctatatctacaaaaactttttcaaatacactaaattcactaccttcttttgc
agaaatatcaaatccacattgaaccattaaagttagtaaaccaacagtcttaagggttac
agtttttcctcctgcattaggacctgttattataagacttctataatttttgcctatttc
aaaatctaaaggtactgcatctcctgttagaagtggatgtttacctttaattatttttat
atagccattattatttatttttggagtaattccttttattttttgactatacttagcttt
tgcaaataccatatcgtattctgaaagtatctctatatttaattttatctgacttatctt
ctcaaatataagttctgttaaataagataatattttgtattcttcaatagtttcatcagc
ttttagcatagttaactctgtacttaaatttgaaacactaataggttcaataaatacagt
atttccttttgatgatgtatctaatatagtaccattaacttcatttttataagaagattt
aattggtattacatatctatcatttcttttacttattataaactcttgtatatacttttt
atttacagttgatgttataaatttatttaatctatcttttatctttccttctgtaatttc
tatatttcgtcttatcttttttaattctttactagcattagaatcaactttattagattt
tatacagtaatttatctcatcttctatacttttacattctgttatatttaaggcataaga
acttaatgtaggtgaataaaattctttttctaacataaaagctttcatcttcctacaacc
tcttaaaaaatcttcaatatttacaagttcaacaggttctattatcattcctttttcaat
tttatctattgtagaacctgcattaaacaatccttcaagtggtatgtgattactattttc
aattatctttctagcttctttattttctgctaatttccttcttactactccaatattccc
actaggagttaatttatctattaaattttttcctagtgaacttacacaatgtatttttat
taattctttaacttcatttagttgtaacctttcaaatgtattactattcattattttttc
tcctttatttataagttatcgtcttttaaatcaccctatcatttactttgataatagtta
ttttgcgaacaacttaataaataaggagttattatatatcaaactccttatttattaaga
agtttaactccggactcattaatgttagtattttttttcataaaacacttctccttttct
attcttatttaaacacttatatcagtgcttctaatattattccataaattatatatttat
gtcaataaaaataatgtcattaatgtttttgtacagtgaaaatttttatagtgaaaataa
gcttatgctttcatttatatttgggaatcacttatattgtcatcaattcatgtatgtgca
gtttccaatacagtctaactttgtaatcattatatatcaaagaatttagctctataaatt
atcgtctctacaaaataaaaaaatagctaataataaaacacttttaaatgttccataaaa
ttagctatttataatataattttaatcttttttaactttaaaaat