Block details | |
---|---|
fasta | C_difficile_CD00107_1A_020266.fasta |
contig | u00000crpx_c_020266 |
start | 2343397 |
length | 14863 |
strand | + |
type | core |
seq | tatttattaaaaattaatcaatttgaaaaaagttatgatataggaatttttaaaaatgaa caatcaatatataaatttattgaaaaaataccctttgtaaaaaaagataatagtaatttt aattatacaaattactatatggaatttgaagatattcctgaatattatgaagtaaatttc aataattatttatatattattaccaggttttcattcattccagatggaactgagatattt tttacttgggaagaaatccattgttgggatgaaaaagttgctaccgagaaaacttttata aatggcgaaacattagtggattcatataactttccaaataatgaagtgaaagactacata caaaagcgagaatcactatatatagaaacaaaaaaatattatgaagaaaaaggattaaaa attgagagacatgcactcggttcagaagatggtgaatatgttgaacttacaaatgattct atactttatttactagatatagaagcagttgaaataagagaacaatcaaaaaatatagaa gaatttctatataagtataaaaaacgttttaaataatttatattttaaaatacataacag tacattgagtcatttaacgagatataaaatgactcaatgtatagactgataaaaataatt atattattttttagttacatatttgttaaaaaattctttttcttctatcggtttagaaaa ataaaacccttgtcctacatcacatttaactgtatttaaaaattccaagtcttttttagt ttcaataccttcacatacaacagacatgcctatacgatgtgacatttcaataatacactg aataatactatatactttctcccggttaaatgtttctttaagtaagcttttatctaactt caatccattaatagatagagaacataaaagacttaatgaagagtatcctgatccaaaatc atccatcgaaattaaaaatcctaactttttaagctcctctaaaatcgaaataactggttg agatatttcattaaaagcactttcagttacctctatctctatatacttaaaaggaatttc atattctttaacagtatctaaaaacctttgataaaagctattttggtaaatagtaaccct tgaaaaattaactgcaatcggatatgtatattgattttttttcataaacgttttttttac aaatgaacacgctttttttaacatataaaagtccaattcaataataaatccacttttttc aaacaatggaataaattcatctggtgataaaaaaccaagttctggagaaaaccatcttac aagagcttctgcgctcacaacatttaaagaagatatttgaaatttaggttgcaaatacat atgaaattcttcattttctatcgctttatacatataattataaatactattttccatttg taactgttttaacagattctcattataccatactgtagaggaaattcctcttgttttact taccttgtgtgcaatatttgccttatccatcatagaattgatagatttataacctaaatt atcaatttcaactaagtacgctcctatacaataagatatagtttgagttacattcatatc taattcagagattatagcattagttagcatttcccgaatatcctctaaaagagaatctct atattttgcaagtattacaaagttatctgaaccaattcttgcacaagtttctttgatatt aaaagttttagaaagtgcagctgcaactattattagaactttatctccatattcatatcc atgtgtatcattaatatatttaaaattgtcaatatcaatatttagcagtacatactcttt gttagatgcattgtgcaaaatttcaatcgctctgttttcaaatgcaacctgattttttat ttttgttaaattatcagtataaaatattcttttaaacctttttttattataatattccca aattaaaagacttattgttgagaatataagataaataaatagtgcagtagcaaaagaata caattttgcattagagtgtttttcagatataaaaacaatttgattagacaacacagaata ctcttcactcaatttatataatttatcacctgaagcaccatttctaacttttataatttc tttcttcatagattcccacatagaatccatttgatttagtttttgttgaaattctttatt atcacatctttgaaatccattttctccattacctgttcttagctttatcagaatattatc cagtcgttttattaagtcatcatttctttcattattcaattcttgcttaacaaccttttg agtttcactgcgaatagtaccagtgtgacttataattttaatatgctctatactgtgata tagagaaaatataaaaagaataataataactagccaaatagcagaataaattaaaaaatc atattttttcttcattattgttacctcatttgtaatatatataatttgcaaataatcaat ctcttataaaaaatgattatcaatattttacagtgatatgtatttatcttaaatagttta atcatttataccctataaattctacaaattcatcacctccaacacaaacagcaatatacg tttttctaaaatttctttttaaacattcatcaacattatcattaaatcatttttaaatta ctcaattaatttactgcatcacttcttttcttacaaaatatcaccccaataatatatttg tataatgtctttatgtctctttttaaatttggcatatacataatctatattttaataaat aattaaaatactatttacctacaatttaactctttgaatttattttatcatattatgtaa atatattccttttttttggtatattacttaaattatatctatttttgtgtaataagacca ataatttacttatttcttattaattatatttaaaaataaaatttataaatggataataaa ttagttacatttatacatatatattataaatatataataaagctaaaaatatcgaaatta ttaaacaaaaaaatattttttaatgatagttatagtataaaaaatatactcactacaaat atagtatactattataaagtaatacctattcttatacaattccccaaggtcttctaaatt tttgaacaatgaaaatagccatgtaactaataactgcagaatatctctgcatttaaaagt tacatagctattttcattactagcaattatagattgctcttttaaatccaaccaatcttt atctaataaaaaatttaatcgcactatatacaaaaggtgcaactaatataacactatcaa atctatctaatatacccccatgaccaggtattatctttccataatcctttatccctacat atctctttatagaagatgcaaataaatctcctaattgagctattacacttcctatacttc ctattatcgctaattgaagcaaatcaatgccaaataaatatccaaataaaatacaacaaa gtgtacttcctattattcctccaatagctccttctatagtctttttaggactaactttag gaattagcttatgttttccaagtaaataaccactaaaatatgcaaatatatctgtcataa aagatatcacaaatataagccatacatatatactacctttttcaaatccatttatagtta taattataaaatctaaaaatactcctatataaaaaactcctaaaaacgtaatcgaaacat ctataacattgtttttgcccatcaacatataaattatacttgctaaaaataaaataaaaa ttactgcataagtatattctaatggtaaattaaaaatattttttacagctaaataaatag aaaataaatatcctataatgaatattggatgtacatcttttattttaaatgccttataaa actcatgcaatgcaatataaactattgctgtctcagctatatatagaggaatacctccat atacaacaaatagaaataatggaaccagagctagtgaagcaataattcttgtaagcataa aataatctccttacttaagtcctccaaatcttctatcccttctttgatatacgtatatag ccttctgtagttcttcttttttaaaatcaggccaatgtatatcagtaaagtaaaactcag aataagcaacttcccaaagtaaaaagttactcaatctttgttcaccacttgttcttatta ccaagtctggatctggtatagactttgtgcttaaatagttttttataatatcttcatcaa tattgtttatatctattttaccactttcacaattttttactatatctataagagcatttt ttatatctgctctacttccgtagtttaatgctaaatttaagttaactcctgtattgtttt ttgtcagttccttagctgagtttaattctcttatacaagtttttggtaaagcacttatat ctcctatagcagttacttttacattgttttggtgaagttcagctatttcatttcttaagt atgtagataataagttcataagtgtgtcaacttcaagtttcggtcttttccagttttctg ttgaaaatgcatataatgttaagtgcttaacacctaattttgagcattcttttactatat ctcttatagtttctactccagccttatgtcctgcagttcttggaagaaatctagcttttg cccatcttccatttccatccattataatagcaatatgagtaggtatgttatttaagtcta tatcatatataatgttgttattcatattttgcctccaatattgttctgactccttaaact aaggagtcagaaaagtatgtgattatcagttctacactatcacctatctcagatattttt ataactctaggaactacaagtttttctttatcctttttaccttcaatagattttacggta taatttatattttgctcatcaaaatattgttttacctcatctacatgaagacctaaaagg ttataatattttttcaatattatacctccattatgtccttttcttttttagataataatg tatctatttcttttataaatttatcagtcattttttgaacttcatcttgtgcttttttta attcatcttcagttaattctccgcctttttccatctttttaattttctcattggcgtctc ttctttcatttcttattctaactttaaattcttctgcagctttactagcttttttagcta attcttttcttctttcttctgttaaagcaggtacagaaagtcttataacctcaccatcat ttgatggatttaatcctaagtctgagttagctatcgctttttctatttcatgcatagcag atttatcccaaggagatatcattaatattcttggttctggtacagatatagcacctattt gatttattggagttggagttccataataatcaactcttattttgtctagcatttgtgcat tagctcttcctgctcttatagttccaaattcaaactttaaagcatcaattgtcccattca ttttctcttctaattgcttatgtatttccagtttcataattttactcctccttcattctt cattattttacagtagttcctatattttcgccttttactgctcttattatattctctgtt gtaagctcaaatacctttattggaattttattatccatacataaagatgtagctgtagaa tccattacttttaattctttctgtataacttccatgtaacttaattctgtaaatttctta gcatctgcatgtacttttggatccttgtcatatactgcatcaacatttttagctaacaat ataacttctgcttccatctcagcagcacgtaaagcagcagttgtatctgttgtaaagtaa gggtttcctgttcctgcaccaaatataacaactctttccttttctaagtgtctaactgct cttcttcttatatatggttctgcaatttgtctcatgtctatagcagtttgaactcttgta gcaacatctatattttctagtgcatcctgtagcgccattgcattcataactgtagctaac attcctatatagtcagcagtagttctgtccattccttcactggttctgcctctccagaag tttcctccacctactactacagctacttcaacacctatttcttgtattttttttatagca atagcaatatcattaactacatcattatttataccaaaacctctttctcctgctaatgct tctccacttaattttaacaatacccttttgtacattggtttatccatcagaaacctccta tttcaatccttcatatccaattttttctattttttaaaaaagagaacacctgcgtgttct ctctttggttattacttaagttgcttagcaacttcttctgcaaagttttcttctctcttt tgtataccttcaccaacttcgaatctcacaactttaacaacttttatatcagaacctact gccttagcaacatcagcaactaattgtttaacagttatatctggatttttaacgaaagtt tgctctaataaacaaacctcttttaattctttttctaatcttcctttaaccattttttca actatattagctggttttccttcatttaaagcttgttgagttaatacttctgtttcatgt gctatgtattcagcatctacttcatctcttgaaacatacttaggattcatagcagcaact tgcatagctacatctttacctaattctaaaactttagcatctctagcttctgtttccatt tcaacaagaacacctatttttccaccaccgtgaatgtatccagcaacttgtccattagtt acaactttagcaaatcttctaaagtctaatttctcacctatttttgcaactctattattt aaaacttcttgtaaagttattccctctttatgagtttcacctaataaagaagctatatct tctttatcagtagctaatgccatacaagcagcatctttaacgaacactttgaagtcttcg tttttagcaacgaaatctgtctctgagttaacttctaccatagaagcaactgtattatca tcattcatttctattgcaactagaccttcagcagcaactctaccagcttttttagcagct tttgataatcctttttctcttaataaatctactgctttttccatgtttccttcagcttct tgtaaagctttcttgcagtccatcattcctgcgcctgtactttctcttaactcttttacc atttgagcagttatattagccattttttaagtttcctcctacttattctattccatatta taaatggtaagggcgacccttaccatttaattgtcaaattattattcttggtcttcagct acttcttcctcagcaccttgtctaccttcaattacagctgttgccatagcaccagttatt aattttacggctcttatagcgtcatcatttcctggtatagcaaagtctaattgttctggg tcacagttagtatcaactataccaactactggtatacctaatctatgagcttcttgaata gctatgttttcttttcttgggtcaactacgaacattgcacctggtaattcaggcatgtct tttattccacctaagtatttttctagtttttctttttcagctcttaattttataacttct tttttaggaagaacattaaatacgccttcttcttccattttttctaattctcttaattta tttattcttgtttttatagttttgtggtttgttaacattccacctaaccatctttcatta acaaagtacattccacatctttcagcttcatcttttatcgcatcttgagcttgtttttta gttcctacgaataagattggctttcctgtttcagctacttctttagtgaacttgtaagct tcttcaacttttttaactgttttttgtaagtcgattatatatattccatttctctctgtg aatatatacttagccattttagggttccatcttcttgtttggtgaccaaagtgaacacct gcttctaataattgtttcattgatattactgacatatcttacctcctggttttatacctc cagcttgatcttctccctaaaaaaccatgtaataggcaccttttaaggatcccaatgctg tgtgtgatttattttattttttcacctctagtagtatatcacagaggtgaagaaataaca atattttttccatattttctatttttatatttttttgtgtattttataccattttttgaa tttaatttgcaaatttcatttttaattttgtttttaatgatacgttatctatactattat tacttactatatctacacttccaagtaagtcacctgaattagtataatattttataatac ccatagtatcaccttttttaacagggtactctatatttttaatcttaacttctgatttta tactttcatcatcttttaatattgtataaagttcatcttttgcttttaatgtaacctcta actctttcattccttttatatatttcttaccaataaagctatctttatcaattacttttt tcatattgaaattttcttttccatatttcagtagagctaatgaagcagaggttcttttat ttttatggttagtacctaatacaacccctattactctacgttttttctcatttttatcat ttttatttacaaccatagaaaatgataagcaatatccagcattgccagtatatccagttt ttataccatctacttctggtataattcttaataatgcatttgtattgcttttttcaaaac ttctatctgaatttgtatatgtctccatatcagttatagctgttacttgtttttcataat ggtcaaacatgtattttccaagaatagctatatcttttgcagtagagatattttcttttg ctggttttttggggttgcttaaatcgtatattggaagaccatttggatttagaaaatgtg tattactcattcctatttcttttgcttttttattcattctatctacaaatgcttctttcg ttttacaaatatgttttgctatagcaattgccgcatcatttcctgatacaatcataagac ctctcataagctctataagtggcacttcttcaccatctttaagtttataacttgaccctt ttactgatgcaatagatttgtctatttttactttatcagtttcttttacttctttatttt caatagcttctattgcaagtaaaaaagtcatcatcttacttaaactagctaatggtacct tcatatcaggttctttactatataaaactctacctgtttcttggtctataagtatagatg tttttgaatacttgtctacagatttatcatctgcatatgaataatttggtattataaaaa ctagaatcatagctaatgatataattttttttagtgcatttttcaaatttttcaccttct tggattattaagtatatttatatttaaattttccctatttagtccaatttatatctagta attaatacctatccatatttacacaaatattaccttatcattcttttaataatcacagat gcccaaattgctcctattgtaactccaaaaaatacttctatacctgccaatgctttccca atcaaacttgtagcaaccatatctccatatcctactgtactaaatgtagccatgctaaaa taccataaatccatatacattctgaaaatctcacttagtgagtaatcacctatattgttt atatctaaagctacaagtgtgctatttgaactttctatgcctacaaataagtataataaa gcaaaaacacttattattgctataataactaataatatattccatggcttttctccataa cctgttgtgtaacgtgctatttggtcaaaaaatttttcaactaaataatcactgaaagta ggataattagaacgtttcattattttactactataaattctttccttataatagtaaaat cctatcatctcatattctccaatttttgttgcttgatttctagctattctataatttatc ttgccatgctcatactcactttttccatattcaacattctttaacacaaattttgtacac atgctaaaaattattccatccattcgtggaaaattttctactttattaactaccaaatca ggtcctttaaatttcactttttcaaatatacggtcatttatatagtgtttactaaatatg gttctattaaaatcacagttttctaagaatacacaaccattaaataaaactttatctcta aattctgtatagttaaaaataatattctttttaaaaatatattttttaaaatttgctttt tgtttaaatatggattcagaaaaatccagtattttataattgtaagttaatatttcttcc gcattaaatttattttcaaaaacaaatccattaaattcacttatctcttctttatgaaga gtatccatcatcaactgtatctcttcatcagacttattttctttatgaaagatacaatat ccagaagaatctgcttctctatgacatttttttctctcatctattttagatatccattta caattcataaatatatatcctccagtacaaaacaattattactattttgtattagtttgg atattattttattttatatacttaaatagttacaaaatatatattagattcttagtttta aatttttaatctacttcattgtgcttttaatttgtttcatataaaaaataataaatttta tatactttgatttatttatatattaaatatgattctaaaacttacttatcatttttaagt aattttgtaactatatttaatgctactaaatcatccataaatcctattgggaacacgaag tctggaatcacatctgttgatataacaaagtaaagtagcatacttccaatcaataaatat ttctttattgtaagtccatctgtacaaaaatcagcatacatttgtcttaatctatctgta aattgaccttgtttttcaatagaatctatttttttattaaaattatcaaaaagtaatttt ttaccttcatctgtttggacatataacttacacttacttaactctttttcaatatttcca ttaaagttcttatcattgattaaatttgcaaatccaagaatatcatcaaagttactaaaa tcactatctgcattaaatatttgattattgctgtttctaaattcatatcctgaagctttc aacagttcttctaggttaatatttaaatgtattgccatcttttctaaatgatttatattt ggcttttgtttattattagctatacgagatatagtagatttatcaattccacttttttta cttagttctcccattgataattctttttcatctaataaaactttcaacaaatcaccgaaa ttcccaaccttactatgttgttccattattttcacctgctttattatgattggttttata ttattatatgatatgattcttttgttatttaggtgttgtataatgttgaaattttatcaa caatttattggattatctgtaacaatttatccatttttacaatactataactaatataag tacaaaatttaagagaaaggatgttaatctactgtgattgaatcaattttattagttact tctctttgtatagatgcctttgtgacaagctttggatatggcgtaaataaagttaaagtt cccttatattcaaatataattataagcgtagtttgttcagctattttagcaatatcgctt tttgcaggtacaatagttagagactttttacctcaaaatataacaatgttaatatgtttc tttattttatttttattaggaagtgctagactaattgaaagtttttttaaatcttatttt aagaaaaaatctatacactcaaagaattataattttaatatgttagaccttaaattaaat tttaatgtaagtatcgaacctgatgtcttagatacaagtaaatctaaagtgcttaaatct gctgaagcatttacacttgcacttgctttaagcttagatggattagctatcggttttggt agtggccttgtaggtgtgaattatatacaagttattctattttctttaatatcaaatata attgcagtattacttggttgtttactaggaaatatgtttgttaaaaacgtaaatttaaac ttatcttggttaagtggtttaatcttgttagtcattggatttatgaagatatgttaataa gaaagcaatctaaagataaacttttctctttagattgctttcttttgtgctttttatatt tattttctattctctctaatttctttctgaatctttttaagagctttttttgaacctctt tgaatatctttttctaattttctttctttaaaactagtaaataatacatctaaatcatac ccttctggatacaattctgatgcttttatgctaagttgtaatctttttatatttactgaa ataaaattatcattaaacaatacttctacattattaaacttgtccataggcttatataca attccaaaatcatcttcatctagtaattttaccttatcccctacattataatctgtatag tttaaaatgacttcagaactatttttatcttcaatattagattgtagcttacttctttta actaaatctaaattgtagtttctatcaattacatattctttagctctatctaaaactcta ttttttattcccatttttttagaaataaaaagagcattactatcttcagattttccaata gttaacttatacaatggttctaacgtttctttatcaaacatcataccagcattttcaaat tctggatgcaatgtagcaaacttttttatctctccataatgagttgatgctatagttata cagcccattttgtaaaactcttctaataatgatattgctaaaccagctccttcattaggt tcagttccacttcctatttcatcaaacagaacaagagtagaattatttgataaactcata atctctgcaatattttttatatgtgatgaaaaagtacttaaggcattttcaatactttga ttatcccctatatctacaaaaactttttcaaatacactaaattcactaccttcttttgca gaaatatcaaatccacattgaaccattaaagttagtaaaccaacagtcttaagggttaca gtttttcctcctgcattaggacctgttattataagacttctataatttttgcctatttca aaatctaaaggtactgcatctcctgttagaagtggatgtttacctttaattatttttata tagccattattatttatttttggagtaattccttttattttttgactatacttagctttt gcaaataccatatcgtattctgaaagtatctctatatttaattttatctgacttatcttc tcaaatataagttctgttaaataagataatattttgtattcttcaatagtttcatcagct tttaacatagttaactctgtacttaaatttgaaacactaataggttcaataaataccgta tttccttttgatgatgtatctaatatagtaccattaacttcatttttataagaagattta attggtattacatatctatcatttcttttacttattataaactcttgtatatacttttta tttacagttgatgttataaatttatttaatctatcttttatctttccttctgtaatttct atatttcgtcttatcttttttaattctttactagcattagaatcaactttattagatttt atacagtaatttatctcatcttctatacttttacattctgttatatttaaggcataagaa cttaatgtaggtgaataaaattctttttctaacataaaagctttcatcttcctacaacct cttaaaaaatcttcaatatttacaagttcaacaggttctattatcattcctttttcaatt ttatctattgtagaacctgcattaaacaatccttcaagtggtatgtgattactattttca attatctttctagcttctttattttctgctaatttccttcttactactccaatattccca ctaggagttaatttatctattaaattttttcctagcgaacttacacaatgtatttttatt aagtctttaacttcatttagttgtaatctttcaaatgtattactattcattattttttct cctttatttataagtcatcgtcttttaaatcaccctatcatttactttgataatagttat tttgcgaacaacttaataaataaggagttattatatatcaaactccttatttattaagaa gtttaactccggactcattaatgttagtattttttttcataaaacacttctccttttcta ttcttatttaaacacttatatcagtgcttctaatattattccataaattatatatttatg tcaataaaaataatgtcattaatgtttttgtacagtgaaaatttttatagtgaaaataag cttatactttcatttatatttgggaatcacttatattgtcatcaattcatgtatgtgcat tttccaatacagtctaactttgtaatcattatatatcaaagaatttagctctataaatta tcgtctctacaaaataaaaaaatagctaataataaaacacttttaaatgttctataaaat tagctatttataatataattttaatcttttttaactttaaaaat |