Block details | |
---|---|
fasta | C_difficile_CD00275_1A_021018.fasta |
contig | u00000crpx_c_021018 |
start | 2344899 |
length | 14863 |
strand | + |
type | core |
seq | tatttattaaaaattaatcaatttgaaaaaagttatgatataggaatttttaaaaatgaa caatcaatatataaatttattgaaaaaataccctttgtaaaaaaagataatagtaatttt aattatacaaattactatatggaatttgaagatattcctgaatattatgaagtaaatttc aataattatttatatattattaccaggttttcattcattccagatggaactgagatattt tttacttgggaagaaatccattgttgggatgaaaaagttgctaccgagaaaacttttata aatggcgaaacattagtggattcatataactttccaaataatgaagtgaaagactacata caaaagcgagaatcactatatatagaaacaaaaaaatattatgaagaaaaaggattaaaa attgagagacatgcactcggttcagaagatggtgaatatgttgaacttacaaatgattct atactttatttactagatatagaagcggttgaaataagagaacaatcaaaaaatatagaa gaatttctatataagtacaaaaaacgttttaaataatttatattttaaaatacataacaa tacattgagtcatttaacgagatataaaatgactcaatgtatagactgataaaaataatt atattattttttagttacatatttgttaaaaaattctttttcttctatcggtttagaaaa ataaaacccttgtcctacatcacatttaactgtatttaaaaattccaagtcttttttagt ttcaataccttcacatacaacagacatgcctatacgatgtgacatttcaataatacactg aataatactatatactttctcccggttaaatgtttctttaagtaagcttttatctaactt caatccattaatagatagagaacataaaagacttaatgaagagtatcctgatccaaaatc atccattgaaattaaaaatcctaactttttaagctcctctaaaatcgaaataactggttg agatatttcattaaaagcactttcagttacctctatctctatatacttaaaaggaatttc atattctttaacagtatctaaaaacctttgataaaaactattttggtaaatagtaaccct tgaaaaattaactgcaatcggatatgtatattgattttttttcataaacgttttttttac aaatgaacacgctttttttaacatataaaagtccaattcaataataaatccacttttttc aaacaatggaataaattcatctggtgataaaaaaccaagttctggagaaaaccatcttac aagagcttctgcgctcacaacatttaaagaagatatttgaaatttaggttgcaaatacat atgaaattcttcattttctatcgctttatacatataattataaatactattttccatttg taactgttttaacagattttcattataccatactgtggaggaaattcctcttgttttact taccttgtgtgcaatatttgccttatccatcatagaattgatggatttataacctaaatt atcaatttcaactaagtacgctcctatacaataagatatagtttgagttacattcatatc taattcagagattatagcattagttagcatttcccgaatatcctctaaaagagaatctct atattttgcaagtattacaaaattatctgaaccaattcttgcacaagtttctttgatatt aaaagttttagaaagtgcagctgcaactattattagaactttatctccatattcatatcc atgtgtatcattaatatatttaaaattgtcaatatcaatatttagcagtacatactcttt gttagatgcattgtgcaaaatttcaatcgctctgttttcaaatgcaacctgattttttat ttttgttaaattatcagtataaaatattcttttaaacctttttttattataatattccca aattaaaagacttgttgttgagaatataagataaataaatagtgcagtagcaaaagaata caattttgcattagagtgtttttcagatataaaaacaatttgattagacaacacagaata ctcttcactcaatttatataatttatcacctgaagcaccatttctaacttttataatttc tttcttcatagattcccacatagaatccatttgatttagtttttgttgaaattctttatt atcacatctttgaaatccattttctccattacctgttcttagctttatcagaatattatc cagtcgttttattaagtcatcatttctttcattattcaattcttgcttaacaaccttttg agtttcactgcgaatagtaccagtgtgacttataattttaatatgctctatactgtgata tagagaaaatataaaaagaataataataactagccaaatagcagaataaattaaaaaatc atattttttcttcattattgttacctcatttgtaatatatataatttgcaaataatcaat ctcttataaaaaatgattatcaatattttacagtgatatgtatttatcttaaatagttta atcatttataccctataaattatacaaattcatcacctccaacacaaacagcaatatacg tttttctaaaatttctttttaaacattcatcaacactatcattaaatcatttttaaattg ctcaattaatttactgcatcacttcttttcttataaaatatcaccccaataatatatttg tataatgtctttatgtctctttttaaatttggcatatacataatctatattttaataaat aattaaaatactatttacctacaatttaactctttgaatttattttatcatattatgtaa atatattccttttttttggtatattacttaaattatatctatttttgtgcaataagacca ataatttacttatttcttattaattatatttaaaaataaaatttataaatggataataaa ttagttacatttatacatatatattataaatatataataaagctaaaaatatcgaaatta ttaaacaaaaaaatattttttaatgatagttacagtataaaaaatatactcactacaaat atagtatactattataaagtaatacctattcttatacaattccccaaggtcttctaaatt tttgaacaatgaaaatagccatgtaactaataactgcagaatatctctgcatttaaaagt tacatagctattttcattactagcaattatagattgctcttttaaatccaaccaatcttt atctaataaaaaatttaatcgcactatatacaaaaggtgcaactaatataacactatcaa atctatctaatatacccccatgaccaggtattatctttccataatcctttatccctacat atctctttatagaagatgcaaataaatctcctaattgagctattacacttcctatacttc ctattatcgctaattgaagcaaatcaatgccaaataaatatccaaataaaatacaacaaa gtgtacttcctattattcctccaatagctccttctatagtctttttaggactaactttag gaattagcttatgttttccaagtaaataaccactaaaatatgcaaatatatctgtcataa aagatatcacaaatataagccatacatatatactacctttttcaaatccatttatagtta taattataaaatctaaaaatactcctatataaaaaactcctaaaaacgtaatcgaaacat ctataacattgtttttgcccatcaacatataaattatacttgctaaaaataaaataaaaa ttactgcataagtatattctaatggtaaattaaaaatattttttacagctaaataaatag aaaataaatatcctataatgaatattggatgtacatcttttattttaaatgccttataaa actcatgcaatgcaatataaactattgctgtctcagctatatatagaggaatacctccat atacaacaaatagaaataatggaaccagagctagtgaagcaataattcttgtaagcataa aataatctccttacttaagtcctccaaatcttctatcccttctttgatatacgtatatag ccttctgtagttcttcttttttaaaatcaggccaatgtatatcagtaaagtaaaactcag aataagcaacttcccaaagtaaaaagttactcaatctttgttcaccacttgttcttatta ccaagtctggatctggtatagactttgtgcttaaatagttttttataatatcttcatcaa tattgtttatatctattttaccactttcacaattttttactatatctataagagcatttt ttatatctgctctacttccgtagtttaatgctaaatttaagttaactcctgtattgtttt ttgtcagttccttagctgagtttaattctcttatacaagtttttggtaaagcacttatat ctcctatagcagttacttttacattgttttggtgaagttcagctatttcatttcttaagt atgtagataataagttcataagtgtgtcaacttcaagtttcggtcttttccagttttctg ttgaaaatgcatataatgttaagtgcttaacacctaattttgagcattcttttactatat ctcttatagtttctactccagccttatgtcctgcagttcttggaagaaatctagcttttg cccatcttccatttccatccattataatagcaatatgagtaggtatgttatttaagtcta tatcatatataatgttgttattcatattttgcctccaatattgttctgactccttaaact aaggagtcagaaaagtatgtgattatcagttctacactatcacctatctcagatattttt ataactctaggaactacaagtttttctttatcctttttaccttcaatagattttacggta taatttatattttgctcatcaaaatattgttttacctcatctacatgaagacctaaaagg ttataatattttttcaatattatacctccattatatccttttcttttttagataataatg tatctatttcttttataaatttatcagtcattttttgaacttcatcttgtgcttttttta attcatcttcagttaattctccgcctttttccatctttttaatcttctcattggcgtctc ttctttcatttcttattctaactttaaattcttctgcagctttactagcttttttagcta attcttttcttctttcttctgttaaagcaggtacagaaagtcttataacctcaccatcat ttgatggatttaatcctaagtctgagttagctatcgctttttctatttcatgcatagcag atttatcccaaggagatatcattaatattcttggttctggtacagatatagcacctattt gatttattggagttggagttccataataatcaactcttattttgtctagcatttgtgcat tagctcttcctgctcttatagttccaaattcaaactttaaagcatcaattgtcccattca ttttctcttctaattgcttatgtatttccagtttcataattttactcctccttcattctt cattattttacagtagttcctatattttcgccttttactgctcttattatattctctgtt gtaagctcaaatacctttattggaattttattatccatacataaagatgtagctgtagaa tccattacttttaattctttctgtataacttccatgtaacttaattctgtaaatttctta gcatctgcatgtacttttggatccttgtcatatactgcatcaacatttttagctaacaat ataacttctgcttccatctcagcagcacgtaaagcagcagttgtatctgttgtaaagtaa gggtttcctgttcctgcaccaaatataacaactctttccttttctaagtgtctaactgct cttcttcttatatatggttctgcaatttgtctcatgtctatagcagtttgaactcttgta gcaacatctatattttctagtgcatcctgtagcgccattgcattcataactgtagctaac attcctatatagtcagcagtagttctgtccattccttcactggttctgcctctccagaag tttcctccacctactactacagctacttcaacacctatttcttgtattttttttatagca atagcaatatcattaactacatcattatttataccaaaacctctttctcctgctaatgct tctccacttaattttaacaatacccttttgtacattggtttatccatcagaaacctccta tttcaatccttcatatccaattttttctattttttaaaaaagagaacacctgcgtgttct ctctttggttattacttaagttgcttagcaacttcttctgcaaagttttcttctctcttt tgtataccttcaccaacttcgaatctcacaactttaacaacttttatatcagaacctact gccttagcaacatcagcaactaattgtttaacagttatatctggatttttaacgaaagtt tgctctaataaacaaacctcttttaattctttttctaatcttcctttaaccattttttca actatattagctggttttccttcatttaaagcttgttgagttaatacttctgtttcatgt gctatgtattcagcatctacttcatctcttgaaacatacttaggattcatagcagcaact tgcatagctacatctttacctaattctaaaactttagcatctctagcttctgtttccatt tcaacaagaacacctatttttccaccaccgtgaatgtatccagcaacttgtccattagtt acaactttagcaaatcttctaaagtctaatttctcacctatttttgcaactctattattt aaaacttcttgtaaagttattccctctttatgagtttcacctaataaagaagctatatct tctttatcagtagctaatgccatacaagcagcatctttaacgaacactttgaagtcttcg tttttagcaacgaaatctgtctctgagttaacttctaccatagaagcaactgtattatca tcattcatttctattgcaactagaccttcagcagcaactctaccagcttttttagcagct tttgataatcctttttctcttaataaatctactgctttttccatgtttccttcagcttct tgtaaagctttcttgcagtccatcattcctgcgcctgtactttctcttaactcttttacc atttgagcagttatattagccattttttaagtttcctcctacttattctattccatatta taaatggtaagggcgacccttaccatttaattgtcaaattattattcttggtcttcagct acttcttcctcagcaccttgtctaccttcaattacagctgttgccatagcaccagttatt aattttacggctcttatagcgtcatcatttcctggtatagcaaagtctaattgttctggg tcacagttagtatcaactataccaactactggtatacctaatctatgagcttcttgaata gctatgttttcttttcttgggtcaactacaaacattgcacctggtaattcaggcatgtct tttattccacctaagtatttttctagtttttctttttcagctcttaattttataacttct tttttaggaagaacattaaatacgccttcttcttccattttttctaattctcttaattta tttattcttgtttttatagttttgtggtttgttaacattccacctaaccatctttcatta acaaagtacattccacatctttcagcttcatcttttatcgcatcttgagcttgtttttta gttcctacgaataagattggctttcctgtttcagctacttctttagtgaacttgtaagct tcttcaacttttttaactgttttttgtaagtcgattatatatattccatttctctctgtg aatatatacttagccattttagggttccatcttcttgtttggtggccaaagtgaacacct gcttctaataattgtttcattgatattactgacatatcttacctcctggttttatacctc cagcttgatcttctccctaaaaaaccatgtaataggcaccttttaaggatcccaatgctg tgtgtgatttattttattttttcacctctagtagtatatcacagaggtgaagaaataaca atattttttccatattttctatttttatatttttttgtgtattttataccattttttgaa tttaatttgcaaatttcatttttaattttgtttttaatgatacgttatctatactattat tacttactatatctacacttccaagtaagtcacctgaattagtataatattttataatac ccatagtatcaccttttttaacagggtactctatatttttaatcttaacttctgatttta tactttcatcatcttttaatattgtataaagttcatcttttgcttttaatgtaacctcta actctttcattccttttatatatttcttaccaataaagctatctttatcaattacttttt tcatattgaaattttcttttccatatttcagtagagctaatgaagcagaggttcttttat ttttatggttagtacctaatacaacccctattactctacgttttttctcatttttatcat ttttatttacaaccatagaaaatgataagcaatatccagcattgccagtatatccagttt ttataccatctacttctggtataattcttaataatgcatttgtattgcttttttcaaaac ttctatctgaatttgtatatgtctccatatcagttatagctgttacttgtttttcataat ggtcaaacatgtattttccaagaatagctatatcttttgcagtagagatattttcttttg ctggttttttggggttgcttaaatcgtatattggaagaccatttggatttagaaaatgtg tattactcattcctatttcttttgcttttttattcattctatctacaaatgcttctttcg ttttacaaatatgttttgctatagcaattgccgcatcatttcctgatacaatcataagac ctctcataagctctataagtggcacttcttcaccatctttaagtttataacttgaccctt ttactgatgcaatagatttgtctatttttactttatcagtttcttttacttctttatttt caatagcttctattgcaagtaaaaaagtcatcatcttacttaaactagctaatggtacct tcatatcaggttctttactatataaaactctacctgtttcttggtctataagtatagatg tttttgaatacttgtctacagatttatcatctgcatatgaataatttggtattataaaaa ctagaatcatggctaatgatataattttttttagtgcatttttcaaatttttcaccttct tggattattaagtatatttatatttaaattttccctatttagtccaatttatatctagta attaatacctatccatatttacacaaatattaccttatcattcttttaataatcacagat gcccaaattgctcctattgtaactccaaaaaatacttctatacctgccaatgctttccca atcaaacttgtagcaaccatatctccatatcctactgtactaaatgtagccatgctaaaa taccataaatccatatacattttgaaaatctcacttagtgagtaatcacctatattgttt atatctaaagctacaagtgtgctatttgaactttctatgcctacaaataagtataataaa gcaaaaacacttattattgctataataactaataatatattccatggcttttctccataa cctgttgtgtaacgtgctatttggtcaaaaaatttttcaactaaataatcactgaaagta ggataattagaacgtttcattattttactactataaattctttccttataatagtaaaat cctatcatctcatattctccaatttttgttgcttgatttctagctattctataatttatc ttgccatgttcatactcactttttccatattcaacattctttaacacaaattttgtacac atgctaaaaattattccatccattcgtggaaaattttctactttattaactaccaaatca ggtcctttaaatttcactttttcaaatatacggtcatttatatagtttttactaaatatg cttctattaaaatcacagttttctaagaatacacaaccattaaataaaactttatctcta aattctgtatagttaaaaataatattctttttaaaaatatattttttaaaatttgctttt tgtttaaatatggattcagaaaaatccagtattttataattgtaagttaatatttcttcc gcattaaattcattttcaaaaacaaatccattaaattcacttatctcttctttatgaata gtatccatcatcaattgtatttcttcatcagacttattttctttatgaaagatacaatat ccagaagaatctgcttctctatgacatttttttctctcatctattttagatatccattta caattcataaatatatatcctccagtacaaaacaattattactattttgtattagtttgg atattattttattttatatacttaaatagttacaaaatatatattagattcttagtttta aatttttaatctatttcattgtgctcttaatttgtttcatataaaaaataataaatttta tatactttgatttatttatatattaaatatgattctaaaacttacttatcatttttaagt aattttgtaactatatttaatgctactaaatcatccataaatcctattgggaacacgaag tctggaatcacatctgttgatataacaaagtaaagtagcatacttccaatcaataaatat ttctttattgtaagtccatctgtacaaaaatcagcatacatttgtcttaatctatctgta aattgaccttgtttttcaatagaatctatttttttattaaaattatcaaaaagtaatttt ttaccttcatctgtttggacatataacttacacttacttaactctttttcaatatttcca ttaaagttcttatcattgattaaatttgcaaatccaagaatatcatcaaagttactaaaa tcactatctgcattaaatatttgattattgctgtttctaaattcatatcctgaagctttc aacagttcttctaggttaatatttaaatgtattgccatcttttctaaatgatttatattt ggcttttgtttattattagctatacgagatatagtagatttatcaattccacttttttta cttagttctcccattgataattctttttcatctaataaaatcttcaacaaatcaccgaaa ttcccaaccttattattttgttccattattttcacccgctttattatgattggttttata ttattatatgatatgattcttttgttatttaggtgttgtatgatgttggaattttatcaa caatttattggattatctgtaacaatttatccatttttacaatactataactaatataag tacaaaatttaagagaaaggatgttaatctactgtgattgaatcaattttattagttact tctctttgtatagatgcctttgtgacaagctttggatatggcgtaaataaagttaaagtt cccttatattcaaatataattataagcgtagtttgttcagctattttagcaatatcgctt tttgcaggtacaatagttagagactttttacctcaaaatataacaatgttaatatgtttc tttattttatttttattaggaagtgctagactaattgaaagtttttttaaatcttatttt aagaaaaaatctatacactcaaagaattataattttaatatgttagaccttaaattaaat tttaatgtaagtatcgaacctgatgtcttagatacaagtaaatctaaagtgcttaaatct gctgaagcatttacacttgcacttgctttaagcttagatggattagctatcggttttggt agtggccttgtaggtgtgaattatatacaagttattctattttctttaatatcaaatata attgcagtattacttggttgtttactaggaaatatgtttgttaaaaacgtaaatttaaac ttatcttggttaagtggtttaatcttgttagtcattggatttatgaagatatgttaataa gaaagcaatctaaagataaacttttctctttagattgctttcttttgtgctttttatatt tattttctattctctctaatttctttctgaatctttttaagagctttttttgaacctctt tgaatatctttttctaattttctttctttaaaactagtaaataatacatctaaatcatac ccttctggatacaattctgatgcttttatgctaagttgtaatctttttatatttactgaa ataaaattatcattaaacaatacttctacattattaaacttgtccataggcttatataca attccaaaatcatcttcatctagtaattttaccttatcccctacattataatctgtatag tttaaaatgacttcagaactatttttatcttcaatattagattgtagcttacttctttta actaaatctaaattgtaatttctatcaattacatactctttagctctatctaaaactcta ttttttattcccatttttttagaaataaaaagagcattactatcttcagattttccaata gttaacttatacaatggttctaacgtttctttatcaaacatcataccagcattttcaaat tctggatgcaatgtagcaaacttttttatctctccataatgagttgatgctatagttata catcccattttgtaaaactcttctaataatgatattgctaaaccagctccttcattaggt tcagttccacttcctatttcatcaaacagaacaagagtagaattatttgataaactcata atctctgcaatattttttatatgtgatgaaaaagtacttaaggcattttcaatactttga ttatcccctatatctacaaaaactttttcaaatacactaaattcactaccttcttttgca gaaatatcaaatccacattgaaccattaaagttagtaaaccaacagtcttaagggttaca gtttttcctcctgcattaggacctgttattataagacttctataatttttgcctatttca aaatctaaaggtactgcatctcctgttagaagtggatgtttacctttaattatttttata tagccattattatttatttttggagtaattccttttattttttgactatacttagctttt gcaaataccatatcgtattctgaaagtatctctatatttaattttatctgacttatcttc tcaaatataagttctgttaaataagataatattttgtattcttcaatagtttcatcagct tttagcatagttaactctgtacttaaatttgaaacactaataggttcaataaatacagta tttccttttgatgatgtatctaatatagtaccattaacttcatttttataagaagattta attggtattacatatctatcatttcttttacttattataaactcttgtatatacttttta tttacagttgatgttataaatttatttaatctatcttttatctttccttctgtaatttct atatttcgtcttatcttttttaattctttactagcattagaatcaactttattagatttt atacagtaatttatctcatcttctatacttttacattctgttatatttaaggcataagaa cttaatgtaggtgaataaaattctttttctaacataaaagctttcatcttcctacaacct cttaaaaaatcttcaatatttacaagttcaacaggttctattatcattcctttttcaatt ttatctattgtagaacctgcattaaacaatccttcaagtggtatgtgattactattttca attatctttctagcttctttattttctgctaatttccttcttactactccaatattccca ctaggagttaatttatctattaaattttttcctagtgaacttacacaatgtatttttatt aagtctttaacttcatttagttgtaatctttcaaatgtattactattcattattttttct cctttatttataagttatcgtcttttaaatcaccctatcatttactttgataatagttat tttgcgaacaacttaataaataaggagttattatatatcaaactccttatttattaagaa gtttaactccggactcattaatgttagtattttttttcataaaacacttctccttttcta ttcttatttaaacacttatatcagtgcttctaatattattccataaattatatatttatg tcaataaaaataatgtcattaatgtttttgtacagtgaaaatttttatagtgaaaataag cttatactttcatttatattttggaatcacttatattgtcatcaattcatgtatgtgcag tttccaatacagtctaactttgtaatcattatatatcaaagaatttagctctataaatta tcgtctctacaaaataaaaaaatagctaataataaaacacttttaaatgttccataaaat tagctatttataatataattttaatcttttttaactttaaaaat |