Block details | |
---|---|
fasta | C_difficile_CD00126_2A_027655.fasta |
contig | u00000crpx_c_027655 |
start | 2304837 |
length | 14863 |
strand | + |
type | core |
seq | tatttattaaaaattaatcaatttgaaagaagctatgatataggaatttttaaaaatgaa caatcaatatataaatttattgaaaaaataccctttgtaaaaaaagataatagtaatttt aattatacaaattactatatggaatttgaagatattcctgaatattatgaagtaaatttc aataattatttatatattattaccaggttttcattcattccagatggaactgagatattt tttacttgggaagaaatccattattgggatgaaaaagttgctaccgagaaaacttttata aatggcgaaacattagtggattcatataactttccaaataatgaagtgaaagactacata caaaagcgagaatcattatatatagaaacaaaaaaatattatgaagaaaaaggattaaaa attgagagacatgcactcggttcagaagatggtgaatatgttgaacttacaaatgattct atactttatttactagatatagaagcagttgaaataagagaacaatcaaaaaatatagaa gaatttctatataagtacaaaaaacgttttaaataatttatattttaaaatacataacaa tacattgagtcatttaacgaaatataaaatgactcaatgtatagactgataaaaataatt atattattttttagttacatatttgttaaaaaattctttttcttctatcggtttagagaa ataaaacccttgtcctacatcacatttaactgtatttaaaaattccaagtcttttttagt ttcaataccttcacatacaacagacatgcctatacgatgtgacatttcaataatacactg aataatactatatactttctcccggttaaatgtttctttaagtaagcttttatctaactt caatccattaatagatagagaacataaaagacttaatgaagagtatcctgatccaaaatc atccatcgaaattaaaaatcctaactttttaagctcctctaaaatcgaaataactggttg agatatttcattaaaagcactttcagttacctctatctctatatacttaaaaggaatttc atattctttaacagtatctaaaaacctttgataaaagctattttggtaaatagtaaccct tgaaaaattaactgcaatcggatatgtatattgattttttttcataaacgttttttttac aaatgaacacgctttttttaacatataaaagtccaattcaataataaatccacttttttc aaacaatggaataaattcatctggtgataaaaaaccaagttctggagaaaaccatcttac aagagcttctgcgcttacaacatttaaagaagatatttgaaatttaggttgcaaatacat atgaaattcttcattttctatcgctttatacatataattataaatactattttccatttg taactgttttaacagattttcattataccatactgtggaggaaattcctcttgttttact taccttgtgtgcaatatttgccttatccattatagaattgatggatttataacctaaatt atcaatttcaactaagtacgctcctatacaataagatatagtttgagttacattcatatc taattcagagattatagcattagttagcatttcccgaatatcctctaaaagagaatctct atattttgcaagtattacaaaattatctgaaccaattcttgcacaagtttctttgatatt aaaagttttagaaagtgcagctgcaactattattagaactttatctccatattcatatcc atgtgtatcattaatatatttaaaattgtcaatatcaatatttagcagtacatactcttt gttagatgcattgtacaaaatttcaatcgctctgttttcaaatgcaacctgattttttat ttttgttaaattatcagtataaaatattcttttaaacctttttttattataatattccca aattaaaagacttattgttgagaatataagataaataaatagtgcagtagcaaaagaata caattttgcattagagtgtttttcagatataaaaacaatttgattagacaacacagaata ctcttcactcaatttatataatttatcacctgaagcaccatttctaacttttataatttc tttcttcatagattcccacatagaatccatttgatttagtttttgttgaaattctttatt atcacatctttgaaatccattttctccattacctgttcttagctttatcagaatattatc cagtcgttttatcaagtcatcatttctttcattattcaattcttgcttaacaaccttttg agtttcactgcgaatagtaccagtgtgacttataattttaatatgctctatactatgata tagagaaaatataaaaaaaataataataactagccaaatagcagaataaattaaaaaatc atattttttcttcattattgttacctcatttgtaatatatataatttgcaaataatcaat ctcttataaaaaatgattatcaatattttacagtgatatgtatttatcttaagtagttta atcatttataccctataaattatacaaattcatcacctccaacacaaacagcaatatacg tttttctaaaatttctttttaaacattcatcaacactatcattaaatcatttttaaattg ctcaattaatttactgcatcacttcttttcttataaaatatcaccccaataatatatttg tataatgtctttatgtctctttttaaatttggcatatacataatctatattttaataaat aattaaaatactatttacctacaatttaactctttgaatttattttatcatattatgtaa atatattccttttttttggtatattacttaaattatatctatttttgtgcaataagacca ataatttacttatttcttattaattatatttaaaaataaaatttataaatggataataaa ttagttacatttatacatatatattataaatatataataaagctaaaaatatcgaaatta ttaaacaaaaaaatattttttaatgatagttatagtataaaaaatatactcactacaaat atagtatactattataaagtaatacttattcttataaaattccccaaggtcttctaaatt tttgaacaatgaaaatagccatgtaactaataactgcagaatatctctgcatttaaaagt tacatagctattttcattactagcaattatagattgctcttttaaatccaaccaatcttt atctaataaaaaatttaatcgcactatatacaaaaggtgcaactaatataacactatcaa atctatctaatatacccccatgaccaggtattatctttccataatcctttatccctacat atctctttatagaagatgcaaataaatctcctaattgagctattacacttcctatacttc ctattatcgctaattgaagcaaatcaatgccaaataaatatccaaataaaatacaacaaa gtgtacttcctattattcctccaatagctccttctatagtctttttaggactaactttag gaattagcttatgttttccaagtaaataaccactaaaatatgcaaatatatctgtcataa aagatatcacaaatataagccatacatatatactacctttttcaaatccatttatagtta taattataaaatctaaaaatactcctatataaaaaactcctaaaaacgtaatcgaaacat ctataacattgtttttgcccatcaacatataaattatacttgctaaaaataaaataaaaa ttactgcataagtatattctaatggtaaattaaaaatattttttacagctaaataaatag aaaataaatatcctataatgaatattggatgtacatcttttattttaaatgccttataaa actcatgcaatgcaatataaactattgctgtctcagctatatatagaggaatacctccat atacaacaaatagaaataatggaaccagagctagtgaagcaataattcttgtaagcataa aataatctccttacttaagtcctccaaatcttctatcccttctttgatatacgtatatag ccttctgtagttcttcttttttaaaatcaggccaatgtatatcagtaaagtaaaactcag aataagcaacttcccaaagtaaaaagttactcaatctttgttcaccacttgttcttatta ccaagtctggatctggtatagactttgtgcttaaatagttttttataatatcttcatcaa tattgtttatatctattttaccactttcacaattttttactatatctataagagcatttt ttatatctgctctacttccgtagtttaatgctaaatttaagttaactcctgtattgtttt ttgtcagttccttagctgagtttaattctcttatacaagtttttggtaaagcacttatat ctcctatagcagttacttttacattgttttggtgaagttcagctatttcatttcttaagt atgtagataataagttcataagtgtgtcaacttcaagtttcggtcttttccagttttctg ttgaaaatgcatataatgttaagtgcttaacacctaattttgagcattcttttactatat ctcttatagtttctactccagccttatgtcctgcagttcttggaagaaatctagcttttg cccatcttccatttccatccattataatagcaatatgagtaggtatgttatttaagtcta tatcatatataatgttgttattcatattttgcctccaatattgttctgactccttaaact aaggagtcagaaaagtatgtgattatcagttctacactatcacctatctcagatattttt ataactctaggaactacaagtttttctttatcctttttaccttcaatagattttacggta taatttatattttgctcatcaaaatattgttttacctcatctacatgaagacctaaaagg ttataatattttttcaatattatacctccattatgtccttttcttttttagataataatg tatctatttcttttataaatttatcagtcattttttgaacttcatcttgtgcttttttta attcatcttcagttaattctccgcctttttccatctttttaattttctcattggcgtctc ttctttcatttcttattctaactttaaattcttctgcagctttactagcttttttagcta attcttttcttctttcttctgttaaagcaggtacagaaagtcttataacctcaccatcgt ttgatggatttaatcctaagtctgagttagctatcgctttttctatttcatgcatagcag atttatcccaaggagatatcattaatattcttggttctggtacagatatagcacctattt gatttattggagttggagttccataataatcaactcttattttgtctagcatttgtgcat tagctcttcctgctcttatagttccaaattcaaactttaaagcatcaattgtcccattca ttttctcttctaattgcttatgtatttccagtttcataattttactcctccttcattctt cattattttacagtagttcctatattttcgccttttactgctcttattatattctctgtt gtaagctcaaatacctttattggaattttattatccatacataaagatgtagctgtagaa tccattacttttaattctttctgtataacttccatgtaacttaattctgtaaatttctta gcatctgcatgtacttttggatccttgtcatatactgcatcaacatttttagctagcaat ataacttctgcttccatctcagcagcacgtaaagcagcagttgtatctgttgtaaagtaa gggtttcctgttcctgcaccaaatataacaactctttccttttctaagtgtctaactgct cttcttcttatatatggttctgcaatttgtctcatgtctatagcagtttgaactcttgta gcaacatctatattttctagtgcatcctgtagcgccattgcattcataactgtagctaac attcctatatagtcagcagtagttctatccattccttcactggttctgcctctccagaag tttcctccacctactactacagctacttcaacacctatttcttgtattttttttatagca atagcaatatcattaactacatcattatttataccaaaacctctttctcctgctaatgct tctccacttaattttaacaatacccttttgtacattggtttatccatcagaaacctccta tttcaatccttcatatccaattttttctattttttaaaaaagagaacacctgcgtgttct ctctttggttattacttaagttgcttagcaacttcttctgcaaagttttcttctctcttt tgtataccttcaccaacttcgaatctcacaactttaacaacttttatatcagaacctact gccttagcaacatcagcaactaattgtttaacagttatatctggatttttaacgaaagtt tgctctaataaacaaacctcttttaattctttttctaatcttcctttaaccattttttca actatattagctggttttccttcatttaaagcttgttgagttaatacttctgtttcatgt gctatgtattcagcatctacttcatctcttgaaacatacttaggattcatagcagcaact tgcatagctacatctttacctaattctaaaactttagcatctctagcttctgtttccatt tcaacaagaacacctatttttccaccaccgtgaatgtatccagcaacttgtccattagtt acaactttagcaaatcttctaaagtctaatttctcacctatttttgcaactctattattt aaaacttcttgtaaagttattccctctttatgagtttcacctaataaagaagctatatct tctttatcagtagctaatgccatacaagcagcatctttaacgaacactttgaagtcttcg tttttagcaacgaaatctgtctctgagttaacttctaccatagaagcaactgtattatca tcattcatttctattgcaactagaccttcagcagcaactctaccagcttttttagcagct tttgataatcctttttctcttaataaatctactgctttttccatgtttccttcagcttct tgtaaagctttcttgcagtccatcattcctgcgcctgtactttctcttaactcttttacc atttgagcagttatattagccattttttaagtttcctcctacttattctattccatatta taaatggtaagggcgacccttaccatttaattgtcaaattattattcttggtcttcagct acttcttcctcagcaccttgtctaccttcaattacagctgttgccatagcaccagttatt aattttacggctcttatagcgtcatcatttcctggtatagcaaagtctaattgttctggg tcacagttagtatcaactataccaactactggtatacctaatctatgagcttcttgaata gctatgttttcttttcttgggtcaactacgaacattgcacctggtaattcaggcatgtct tttattccacctaagtatttttctagtttttctttttcagctcttaattttataacttct tttttaggaagaacattaaatacgccttcttcttccattttttctaattctcttaattta tttattcttgtttttatagttttgtggtttgttaacattccacctaaccatctttcatta acaaagtacattccacatctttcagcttcatcttttatcgcatcttgagcttgtttttta gttcctacgaataagattggctttcctgtttcagctacttctttagtgaacttgtaagct tcttcaacttttttaactgttttttgtaagtcgattatatatattccatttctctctgtg aatatatacttagccattttagggttccatcttcttgtttggtgaccaaagtgaacacct gcttctaataattgtttcattgatattactgacatatcttacctcctggttttatacctc cagcttgatcttctccctaaaaaaccatgtaataggcaccttttaaggatcccaatgctg tgtgtgatttattttattttttcacctctagtagtatatcacagaggcgaagaaataaca atattttttccatattttctatttttatatttttttgtgtattttataccattttttgaa tttaatttgcaaatttcatttttaattttgtttttaatgatacgttatctatactattat tacttactatatctacacttccaagtaagtcacctgaactagtataatattttataacac ccatagtatcaccttttttaacagggtactctatatttttaatcttaacttctgatttta tactttcatcatcttttaatattgtataaagttcatcttttgcttttaatgtaacctcta actctttcattccttttatatatttcttaccaataaagctatctttatcaattacttttt tcatattgaaattttcttttccatatttcagtagagctaatgaagcagaggttcttttat ttttatggttagtacctaatacaacccctattactctacgttttttctcatttttctcat ttttatttacaaccatagaaaatgataagcaatatccagcattgccagtatatccagttt ttataccatctacttctggtataattcttaataatgcatttgtattgcttttttcaaaac ttctatctgaatttgtatatgtctccatatcagttatagctgttacttgtttttcataat ggtcaaacatgtattttccaagaatagctatatcttttgcagtagagatattttcttttg ctggttttttggggttgcttaaatcgtatattggaagaccatttggatttagaaaatgtg tattactcattcctatttcttttgcttttttattcattctatctacaaatgcttctttcg ttttacaaatatgttttgctatagcaattgccgcatcatttcctgatacaatcataagac ctctcataagctctataagtggcacttcttcaccatctttaagtttataacttgaccctt ttactgatgcaatagatttgtctatttttaccttatcagtttcttttacttctttatttt caatagcttctattgcaagtaaaaaagtcatcatcttacttaaactagctaatggtacct tcatatcaggttctttactatataaaactctacctgtttcttggtctataagtatagatg tttttgaatacttgtctacagatttaccatctgcatatgaataatttggtattataaaaa ctagaatcatggctaatgatataattttttttagtgcatttttcaaatttttcaccttct tggattattaagtatatttatatttaaattttccctatttggtccaatttatatctagta attaatacctatccatatttacacaaatattaccttatcattcttttaataatcacagat gcccaaattgctcctattgtaactccaaaaaatacttctatacctgccaatgctttccca atcaaacttgtagcaaccatatctccatatcctactgtactaaatgtagccatgctaaaa taccataaatccatatacattttgaaaatctcacttagtgagtaatcacctatattgttt atatctaaagctacaagtgtgctatttgaactttctatgcctacaaataagtataataaa gcaaaaacacttattattgctataatcactaataatatattccatggcttttctccataa cctgttgtgtaacgtgctatttggtcaaaaaatttttcaactaaataatcactgaaagta ggataattagaacgtttcattattttactactataaattctttccttataatagtaaaat cctatcatctcatattctccaatttttgttgcttgatttctagctattctataatttatc ttgccatgctcatactcactttttccatattcaacattctttaacacaaattttgtacac atgctaaaaattattccatccattcgtggaaaattttctactttattaactaccaaatca ggtcctttaaatttcactttttcaaatatacggtcatttatatagtttttactaaatatg gttctattaaaatcacagttttctaagaatatacaaccattaaataaaactttatctcta aattctgtatagttaaaaataatattctttttaaaaatatattttttaaaatttgctttt tgtttaaatatggattcagaaaaatccagtattttataattgtaagttaatatttcttcc gcattaaattcattttcaaaaacaaatccattaaattcacttatctcttctttatgaata gtatccatcatcaactgtatctcttcatcagacttattttctttatgaaagatacaatat ccagaagaatctgcttctctatgacatttttttctctcatctatcttagatatccattta caattcataaatatatatcctccagtacaaaacaattattactattttgtattagtttgg atattattttattttatatacttaaatagttacaaaatatatattagattcttagtttta aatttttaatctacttcattgtgcttttaatttgtttcatataaaaaataataaatttta tatactttgatttatttatatattaaatattattctaaaacttacttatcatttttaagt aattttgtaactatatttaatgctactaaatcatccataaatcctattgggaacacgaag tctggaatcacatctgttgatataacaaagtaaagtagcatacttccaatcaataaatat ttctttattgtaagtccatctgtacaaaaatcagcatacatttgtcttaatctatctgta aattgaccttgtttttcaatagaatctatttttttattaaaattatcaaaaagtaatttt ttaccttcatctgtttggacatataacttacacttacttaactctttttcaatatttcca ttaaagttcttatcattgattaaatttgcaaatccaagaatatcatcaaagttactaaaa tcactatctgcattaaatatttgattattgctgtttctaaattcatatcctgaagctttc aacagttcttctaggttaatatttaaatgtattgccatcttttctaaatgatttatattt ggcctttgtttattattagctatacgagatatagtagatttatcaattccacttttttta cttagttctcccattgataattctttttcatctaataaaactttcaacaaatcaccgaaa ttcccaaccttactatgttgttccattattttcacctgctttattatgattggttttata ttatatgatatgattcttttgttatttaggtgttgtatgatgttgaaattttatcaacaa tttattggattatctgtaacaatttatccatttttacaatactataactaatataagtac aaaatttaagagaaaggatgttaatctactgtgattgaatcaattttattagttacttct ctttgtatagatgcctttgtgacaagctttggatatggagtaaataaagttaaagttccc ttatattcaaatataattatcagcgtagtttgttcagctattttagcaatatcgcttttt gcaggtacaatagttagagattttttacctcaaaatataacaatgttaatatgtttcttt attttatttttattaggaagtgctagactaattgaaagtttttttaaatcttattttaag aaaaaatctatacactcaaagaattataattttaatatgttagaccttgaattaaatttt aatgtaagtatcgaacctgatgtcttagatacaagtaaatctaaagtgcttaaatctgct gaagcatttacacttgcacttgctttaagtttagatggattagctatcggttttggtagt ggccttgtaggtgtgaattatatacaagttattctattttctttaatatcaaatataatt gcagtattacttggttgtttactaggaaatatgtttgttaaaaacgtaaatttaaactta tcttggttaagtggtttaatcttgttagtcattggatttatgaagatatgttaataagaa agcaatctaaagataaacttttctctttagattgctttcttttgtgctttttatatttat tttctattctctctaatttctttctgaatctttttaagagctttttttgaacctctttga atatctttttctaattttctttctttaaaactagtaaataatacatctaaatcataccct tctggatacaattctgatgcttttatgctaagttgtaatctttttatatttactgaaata aaattatcattaaacaatacttctacattattaaacttgtccataggcttatatacaatt ccaaaatcatcttcatctagtaattttaccttatcccctacattataatctgtatagctt aaaatgacttcagaactatttttatcttcaatattagattgtagcttacttcttttaact aaatctaaattgtagtttctatcaattacatattctttagctctatctaaaactctattt tttattcccatttttttagaaataaaaagagcattactatcttcagattttccaatagtt aacttatacaatggttctaacgtttctttatcaaacatcataccagcattttcaaattct ggatgtaatgtagcaaacttttttatctctccataatgagttgatgctatagttatacat cccattttgtaaaactcttctaataatgatattgctaaaccagctccttcattaggttca gttccacttcctatttcatcaaacagaacaagagtagaattatttgataaactcataatc tctgcaatattttttatatgtgatgaaaaagtacttaaggcattttcaatactttgatta tcccctatatctacaaaaactttttcaaatacactaaattcactaccttcttttgcagaa atatcaaatccacattgaaccattaaagttagtaaaccaacagtcttaagggttacagtt tttcctcctgcattaggacctgttattataagacttctataatttttgcctatttcaaaa tctaaaggtactgcatctcctgttagaagtggatgtttacctttaattatttttatatag ccattattatttatttttggagtaattccttttattttttgactatacttagcttttgca aataccatatcgtattctgaaagtatctctatatttaattttatctgacttatcttctca aatataagttctgttaaataagataatattttgtattcttcaatagtttcatcagctttt agcatagttaactctgtacttaaatttgaaacactaataggttcaataaatacagtattt ccttttgatgatgtatctaatatagtaccattaacttcatttttataagaagatttaatt ggtattacatatctatcatttcttttacttattataaactcttgtatatactttttattt acagttgatgttataaatttatttaatctatcttttatctttccttctgtaatttctata tttcgtcttatcttttttaattctttactagcattagaatcaactttattagattttata cagtaatttatctcatcttctatacttttacattctgttatatttaaagcataagaactt aatgtaggtgaataaaattctttttctaacataaaagctttcatcttcctacaacctctt aaaaaatcttcaatatttacaagttcaacaggttctattatcattcctttttcaatttta tctattgtagaacctgcattaaacaatccttcaagtggtatgtgattactattttcaatt atctttctagcttctttattttctgctaatttccttcttactactccaatattcccacta ggagttaatttatctattaaattttttcctagcgaacttacacaatgtatttttattaag tctttaacttcatttagttgcaatctttcaaatgtattactattcattattttttctcct ttatttataagtcatcgtcttttaaatcaccctatcatttactttgataatagttatttt gcgaacaacttaataaataaggagttattatatatcaaactccttatttattaagaagtt taactccggactcattaatgttagtattttttttcataaaacacttctccttttctattc ttatttaaacacttataccagtgcttctaatattattccataaattatatatttatgtca ataaaaataatgttattaatgtttttgtacagtgaaaatttttatagtgaaaataagctt atactttcatttatattttggaattacttatattgtcatcaattcatgtatgtgtagttt ccaatacaatctaactttgtaatcattatatatcaaagaatttagctctataaattatcg tctctataaaataaaaaaatagctaataataataaaacacttttaaatgttccataaaat tagctatttataatataattttaatcttttttaactttaaaaat |