Block details
fasta C_difficile_CD00145_1A_021022.fasta
contig u00000crpx_c_021022
start 2258230
length 13026
strand +
type core
seq gaatttactcttgatgtacgctcttgttcacaagaaattcttgataattctgtagaaaag
atatttaatgaaatatcacatatatgtgaaaatagaaaacttaattatacaagtgaactt
gcttttgaaaatgttcctgtaccatgttctaataaaataacaaaaatcatagaaaaaagt
tttatagatttaaatcttaatcctttttatatttatagtggtgctggccatgatgctcag
gaaatggataatataactgatattggtatggtatttataagatgcgctgggggcgtaagt
cataatcctaatgaaagtgtttctgtagatgacttggatactgctgtaaaaatattttta
aaaatactagataatcttgatttaaaataattcttatataagaaagtatattaaaatata
taatctaaaaaatcactttatatttatattatataagtgtacaatataatctattataaa
atataattttatgcttttatagatttttattttatacataaatatatttatatataaagg
agataatttttatgaatgaaaaattaattggtattttggctggaatgggtccaaggtcaa
cagccccttttgttgatttaattattgatgagtgtcaatctcaatatggagcaaaatatg
atgatgaatttccaaagatgatgatatattcattacctaccccattttatattgaccgtc
caataaatcatgaacttatgaaagaaactataattgatggattacaaaagcttgaatcaa
ctggtgtaaattttattgcaatgccatgcaattcagcacatatatactttaaagaattaa
aagagtctattaatataccaatattaaatattgtagaagaaacagttaaaaaattaccta
ctatctcacaaaaagtaactcttttttcgactagttcaacttttgagtctacaatttacc
agaatggtataatacataatggacatgaatttatatttaaagatgaatggcaaataaaat
taaacaatcttattcaaaatataaaaatggataaagaaaatccacacaatattgatattt
ggaataaacttatcgaagatgttaaaaatgaatctatagaaaatatagtaattgcttgta
ctgatttaaatgtagttttagaaaaatcatatccttcaataaatattgttgattcatcaa
aatgcttggctgaatcagttgtcaataaatatctaaaattagttaaataaatttttcatg
cactatattataaaaaatatatgttataagtttattttaaatagtatagacttataacat
atatcatagtttcttgacaatatagaaattaaccatgtatttcattatattaataaaaag
gataccaaaaatggtatccttcataaatatttatatgtttatttataaaaataatcatat
atttattactttactacacctaaacaatattattcaagtgtattcatagagttagaaaat
tcttgtcctgctgtaacaagattagataacaatacatcagctactgcatcatttactgaa
cttattatccatttattatcctttttagaacattcaaactctacattttttgtaacataa
gtctctttaacgcttttttgtttttctttcataattgatactaacatttcagttgttttc
tcatcagttaagtcttgtcctgaaaaactcataccaatcatctttgtaaatgcctcagct
actatttcttgaagtaatggtgttgaatctataaatttacattctactttgattgtagcc
ttatcacctttaacctcgctgtcttttattgtatatgtgattttagatgcattctgtttt
agataatctaaaacatattgggcatttgggtcttttgtatctaattcctttaatatatcc
ttatatttttcgtcattattttccattaccttattcatgccttcaaagtcaaactttttc
gcactgttaaaaaaactatcaattgtatcttctggttttgcacttgaacatgctgttaaa
gatattgctaataaaaaagttgttaaagctaatatgatttttttcatatctcaaatcctc
cctcttaatttgttgatacataagttattttaacatataatgagagtttttgaataatat
atttaaaatattttataaattttcattaaagtaaagtctatattaaaacatatctatatt
aaattattgttcatatttacatcagtcatagtagaaaccataacagcttttattgtatgc
attctattttcagcttcttcaaatacctttgaatattttgaattaaatacctcgtttgta
acctctaattctgataatccgaacttttcataaatctcctgagcaaccttagtttctaaa
tcatgaaatgctggaagacagtgtaaaaatataacattttcattttcagttttctttatc
atatccatatttacttgataatctttaagttgatttattcttgcttcatattgctcctct
tctcccatagaaacccatacatctgtatatataacatctgcacctttaacatcatcaata
ttttcagtcaacattatatctcctttggatttcttggctatttccttcatttccttaacc
aattcttcatttggccaaagttccttaggtgctagtgctacgaaatgtattcccatttta
gcacatcctatcatcagtgagtttcccatattatttctagcatcaccaacatatacaaat
ttaactttattcaaatctttatctacattttcaattactgttaaaaaatctgccagtatt
tgtgttggatgatattcatctgtaagtccattccaaacaggcacaccagaatattttgct
agactttcaactgtttcttgtttaaagcctctaaattctattccatcatagaatcttcct
agaacttttgctgtatctgatacagactcttttttacccatatgacaatcatttggacct
agataagttacatgtgctccttcatcatgagctgctacttcaaatgaacatctagttctt
gttgatgttttctcaaataataaagctatattttttccttgtagcaaatcgccttttata
ccaacttttttcttagtttttaaataacttgataaagttaataaatatctaatctcttct
tttgtaaaatcctttaatgtcaaaaaactcttaccttttaaacttatattattcatatta
attcgccccttcttataaactttttaaattcaattaaacttgttagcactttactttttt
atttacttctaatttttatctttaatcaactatttcttgaatatttagttaatttctagt
aatatatcttttaggatttcaagagcctcatctatttccttataactgattgttaatggt
ggtaaaaatctcaatacattttttccagcagtcaaaataagcaatcctttttttctagct
ttctcttctataatactagattcaatattagtttcaattcctatcattagaccaatacct
tttgtctttaatacaactttgttattaaaactttcaatagattttcttatataatttcct
ttttctaatacttcattataaaaaccatctttagatatctcatctaatacaactgaagct
gccaccatagctaataaattacctccaaaagttgtaccttggtctccttttcctagtact
tttgaaagttttttatttactaatactcctcctactggtattcctgctcccaaccctttt
gctacggtaactatatctggttttacatcaaaatattcatagccaaaaagtttaccagtt
cttcctataccgcattggacttcatcaaaaatcactacaatatccttttcttgacatatt
tttactatttccaaaacataatctttttcaagaacattaactccaccttcgccttgaatc
gcttcaagaattattgcacaaactgtggaatcaagattattttttaaatcttcaatatta
tttctttctacatatttaaaaccttcgggaagaggataaaaatacttatggtatttgtcc
ataccagttgccattaaagacatcattgttctaccatgaaaagagtcttttaaacttatg
atagttcctctaccattaccatatttgtcactactatactttcttgctattttgaatgct
gtttcatttgcttctgttccagaattacaaaaatatactttagccattccacttgaatta
attattttctctcctgaatacaacactggctcattaaaatataaatttgaagtatgtaat
aatttatctacttgctcttttagagcattctttaaattactattactatacccaagagaa
gatactccatatccacttgtaaaatctatatatttattgccattagtatcaaaaaaacaa
cttccttcaccataatctatgacaaaattgggttgattatatgtatctataaaatattca
ttccattttgaaattgtattgtcgttattcattcttattctcccctcttaaacttataat
tttattcattttcttttcttattaatgtacctattccactatcagtaaatagctctgtta
ttatagaatgtggaactcttccatccaaaatatgtaccctatttactccgttatttaagg
catctacgcatccctctattttaggtatcatacctccagtaattataccttcttcaaata
atttatcaacatcctctaatataacttctgttattaatgatttttcttcatctggctctc
ttaacaaaccagggacatctgtaagaagtatcaatttatctgcatttaactctttagcta
tagcagaagctgctgtgtcaccatttatattataagtctctccatcatctccaacaccta
tagttgcaattactgaaatataacctgactttagacaagattctataagctcaacattta
cttttttgatttctcctacaaatccaagttcataatttttatatgggtcacataaaatca
tattattatctattccacaaagccctactgcttttccaccttttgtatgtattttattta
ctaggtctttattaacctttccagcaagtaccatttttacaatttccatggtctcttcat
ctgtatatctaagaccatttacaaatttactttctatatccacttttgctagcatcttat
tgatttctgcccctccaccatgtactaaaactatattgattccaacataactcattaaca
caaggtcttccataacagattcttttagaccatcttttttcattgcacttccaccatact
taactacaatagtctttccctgatgtttttctatatatggtaaagcttctataagtgtat
ttgctttttctatattaatcattaaagtatatcctcctaatttctataacttccatttat
tcttacataatcatagcttaaatcacatccccatgcatttcctctggcattgcccatatt
taaatctactaatatacttatttcgtcatcttcaaggattttttttgctttttcctcatt
aaaatctaatccatttccatttttacatacttcaatatatcctttcatactctcaaaaat
aatatcaactttttccatatctatttcttcacctgcataacctaaagcacacagtattct
accccaatttgcgtcagctccaaatacagctgtctttactaatgaagaagatataactgt
ttttgctaattttactgcatgtgcttcacttaatgctccatttatatagcattcaattag
ttttgtacatccttctccatcttttgcaacaagtttagcaagttctatacagacatatgt
aagtgcactcaaaaatacttgataatgttcatcttttttgtttattctatcattttttgc
ttttccatttgctagaatcattaccatatcattagtacttgtatctccatctacactaac
tctattaaaacttttgtcaacagcaatttttaaagcttcttttagcaaaactccatcaat
atttgcatctgtagttataaatcctaacgttgttgccatattaggatgtatcataccaga
accttttgccatacctccaatagttatttttttatctccatacattattgctactgctat
ttctttttttataatatcagttgtcataatagcttctcttgctccaatatgaccttgttt
acttagattattcactaattcatccatattttcttctattaaatctatatttaatggctt
tcctataacacctgtagatgcaaccaaaacatcactttctttaatatttaatttatcact
ggtgaatttagccattttataagcatttataagtccttcttttccattaaaggtattagc
attagcactatttactatgatagcttgtgcttttccatttttaatgtgttcctgtgtaac
ataaacaggattgccctttactttattttgagttactactgctgctgcatcacataaaac
atctgaataaaccaaagctaaatctcttttttctttattttttctcaagccacagtgaat
ccctgaagcaaaaaatccttctgaaactgtaactccaccctttataatctccatatttat
cctcctaattatatgagtttagtattttttatttctaaaatgatggtgcaatatttttta
aacctgtattttcttcaataccaaatattatattcatgttttgtatagcttgacctgctg
ctcccttaatcatattatctatagctgaacagattatcaatgtatctccattttcatgta
atgatattacacatttatttgagaatctaacattctttaaagaagctatcttatctaatg
gaagaatttctataaattctttaaattcataataatcagttaatttcctatgtatatcat
ttatagaaatattatcttcttttgtacaatatatagttgataagattcccctatttactg
ggattaagtttggtgtaaaaactacacttactttttctttgcaggattcacttaaatttt
gttctatttctggagtatgtctgtgtttccctattttatatgcagtgatattttcattaa
cctccgtaaagtgactactaatcgataattctctaccagcacctgtaagacctgatttag
aatcaattattatattattattttttatcaatttagaacttagtaatggcatcaatggta
aagaaatactagttggataacatccaggatttgcaattatatctgcatcttttatatctt
ctttgtatatttcacttaatccatatacagcttttttatgtaagattttatctataaaag
atactccataccatttactatatacttcttcatcttttattctaaagtcagcacctaaat
ctataactttctttttcgatttaattgcctttattacaaacttttcactaactccatgtg
gaagggctgtaaacacaacatcacacatatctataactttttcattttctatacatatca
tgttatttttatatcctatacttggatatatatcaactatatcttttccaacatacgaat
ttgaacctatcgctgtcacttcgactttatcatgattcattaataatctaatcaactctg
ccccgacatatccagttgcaccaataataccaacttttattttattcattttgttccctc
catttttatattcaaatagtcttaaaatcctatctttccactttactatatgataatcat
ttgataatacgtagattaaaatactctaattaaaacaaaaaaccccttagcattataaat
actaagaggcgattttccgcggtaccactcttattggtaaaattacaataatcattaaaa
ctcaaattaaaaagtatctacaaaatgtacatttaaaattaaaaaagcctcttggtcaaa
gaccaagagacgaatatacacccgcgttaccactctaattgataagataatcttacccac
tctaatctcttaaggcgagattcaccaattaccatactattacttctggtaatctcctcc
aaagctctattcacaataaaattcgttactaggcttccaccattcccagctctctatcaa
ctagctttatgctactctctttttcacaggatttcaatttattttcttattgttttatat
gatagtttatttttttaactttgtcaatataatttttaaatttttggaaatattttctat
atggttaatttccagcattttgtatctaaattgcgatataatttttatatttcattcgtc
aatttaaaaaacatccaaaatatattaaattataaaataatatattttcaaaatacaata
tttacatctctttttaattaaattttttaatgttggtatctaaaaatttctcaatctttt
tctcagaaagtatctcgttggttacaaattcaccattaaaaaaaagactgtatgtagtaa
atggtgcaggagcattttgtgcttcttttgctgtttcgaattttataagatttacatcaa
tacctctagaatttgcaatttttttcaaaataggagcatatttttccgtatgtggacact
gattactgtaatataaaactataccattctcatttaattttctttgttttacacaattct
taaaacatggaataggagcattatcagtaaagggaaaatataatagctcataatttggtt
ctgatgtatctgctaaacaaaagtccttatattttagatatttagcatcagataaaaaag
gcatttttttactagacgaaagcacaactaatccatatttaccttttgattttgcatcat
caacacactcttgtagcaatagattagaatatccttgacccttaaattttccagatatcc
aaaaacagttaataaatatataattgtccgcagtaataggacaccatgcattttctgctg
gaatatattctataaaagctttacctcttacatcaaatcgtttaaagactagacctttat
caaaattatttttcatccaagcttttttagaaaaaacacaattttctccttttttttcag
aaattgaacaacatatatgttcattgtcaatattatttatatttatatcaataatctgca
tacttatctccttttctaattgcataataatttttaaatatattctatatatttttatct
taatattttgaatacaacaacatcatgtcatatatatttttattttacataatattattt
taagattatctgaattattaaattgtatatataattaaatacattctatggtctaactac
actataatataaattatatattatcataatattctaaatttataaaacaaattgtattga
attgaatttatttaagatatataattataattaaaataataataaaggtgttgtttataa
tgttcaaagaatacttaataagagaattaaaagaagatgatattaaaaatgcattagact
taatctggaacgtatttgaagaatttgaatctccagattattgtgatgaaggaattacga
catttcatcaatttatagaatataactctattattgaaaaaatcaaagaaaaaactctct
tcttttggggttgttttgactctaaaaaacttattggagtcttagctattagaaatttaa
atcatatatgtatgttatttgtagataaaaactatcataaacatggtgttgcaaaaaaat
taatgactacaggcatacaatactgtatttgtaataaatttaatttaactgaaataactg
taaattcatcaccttatgctgttgaagtttatcataaattaggatttaaagatactgctg
ttgagcaaattgttgacggtatacgttttacacctatgaaattgttaatataataaatta
aataaaaagcaaagtctcttaaatattttatagttactttgcttttaaaccaagatttaa
aataatactatcttttttgttttttaataatatactttaaaatccttactaatatgaact
ataatttattttttgatatcctttttgattaacatataaattaattcaattattaaacat
aaactatgttgtttctctttatatctcttctttgtaaacaatattgggcatttgaaaata
aatattcttaaaatatactgttctcctgttgattttcctttggtacaaatgataaaaatt
taatttacatgccccataatgaagtgttcaataaataagttaaaataatttatttacctc
cttaatcatattttttatgaatacctaataacacagtatcaatagaatcgactaaacctt
ttatagcttcttctttactcaaaaatgatttcccaagttgcaaagtcgaataaccatgaa
gtacactcattattaagtttaatacttcacctgtattctttgtatttagattacaagaaa
gaataagtttttctaataaggatttatattcatcaaagatttctaatgtttcattatttc
catgccaagtagcccactgaattgtttcataaacaccaggattagaaattataaaattaa
agtatgctatacttatacactttatagctgtatctccaaaatttccaatagccgccttta
tcatttgactattcatctctctcattcctttatgagctacttcaagtaataaatcatcta
gactttctatatgattgtacaaagatggtgtacgtattcctagcttttctgcaataactt
ttaaagaaactttgttaagcccatctttattaactatatctgatgtagcttgtataacta
tttctctactaacacgcatgattttccctctttcatttaaaattaattactttattagtt
taactaatctaattagtttcgtcaattattgtaatttataaaattctttatactattata
aaatcttgacagtttaattataatttaatataatactaattaaattagttttaatactaa
tataattagtattatattaaattctatattacaacattattttatagtttgattaattta
ataatcactaatatatcaaactgaaaggagatttttatggaaaaaaaatatttcgaaatt
catggagttccttcaatcctttggggaaatccttcaagtaaattatatatttacatacat
ggacaatgtggcaataaagaggaggctgaagcttttgctaatattgcagttccacatgag
tgtcaagttttaagtgttgatttgcctgaacatggagaacgtaaaagagaaaaaaattca
tttaacccatggcatgttgttccagaattagtatctattatggaatatgcaaagtgccac
tggaatcaaatttcgttatatgcaaatagcattggagcatggtttagtatgttaagcttt
gaaaaagagaacttaagagagtgtatttttgtatctccaattctagatatgcaacagctc
atttcaaatatgatgctctgggcaaatgtatcagaagaacagcttaaacatgaactaatt
atcccaacttcatttgggcatactctttcatgggaatatctacaatatgtaaaacaacat
cctatcactcaatggaatataccaacaaaaatattatatggtaaacatgatgaacttact
gaaatcggtgttgtagagaaatttgtagaaaagtttaattgcaaccttactattgtagaa
aatggcaaacattggtttaacacaccacaagaattaaattcattatatgaatggttaaat
actttagttaaataaaaaataattatattattaatatgattaaattatttataaatgtta
tttaattaattttattttagcattattaaaataactacataaagaataaattagttatta
ttaaagaaattaaaagtatatagagtattaataattttttaataattagttattatagaa
aaaagagggatataatattgtctccctctctttcttctgtaatattatataatttttatt
tatcactctcaataaattatagttatctacaaaattcaatctttaatacattattaatat
attgtgatattaatattacagtattaaataaaatctaataaaattaactataaaatatct
attatataaatatccactcttatgtttgaaatccgtcatatagttttatccttcttatct
tttatatcaataactttttttaataaaattgacaaaactaaagtaaaaaaccttattgat
aatgaaacaaatgatactataagttctgatattatagtaattgcatataaatagacatca
taaaaataatataatattgtcactataaaattaaatgtaaaaatctcaaatctaactaaa
tacacatataggtattttttaagtttttaggtatttcttctgaaaatgatttattgattg
ataccaatttacataatctttttaatataaacaatgatacaatatatgggacagcacata
tgtatatagctacttatattacagttggcatattcgtatttgtaatgcttataccaattt
taaaatacaccatcagtactaatagtattaaaataatctataataaagttaaaattattc
caattagtacaatattatttaatattttacaactcatatccttttttatataaatttacc
accttatacattcttatttttagtgtatattacaatggttttatatattatatcaatatt
ttattattgaaattcaataaattatatattataatcaataatatactttatataaaggag
atgatattttatgattacaaaattttttagtaatatattatcagtatttctatattttct
attatcacttttaggagttgctggtataatattcttatgtatgatacctatgtttttata
tgattttagttctgacaaagtaattgctttaattgcaagaatactatatttttctgacta
ctttata