Block details | |
---|---|
fasta | C_difficile_CD00145_1A_021022.fasta |
contig | u00000crpx_c_021022 |
start | 2258230 |
length | 13026 |
strand | + |
type | core |
seq | gaatttactcttgatgtacgctcttgttcacaagaaattcttgataattctgtagaaaag atatttaatgaaatatcacatatatgtgaaaatagaaaacttaattatacaagtgaactt gcttttgaaaatgttcctgtaccatgttctaataaaataacaaaaatcatagaaaaaagt tttatagatttaaatcttaatcctttttatatttatagtggtgctggccatgatgctcag gaaatggataatataactgatattggtatggtatttataagatgcgctgggggcgtaagt cataatcctaatgaaagtgtttctgtagatgacttggatactgctgtaaaaatattttta aaaatactagataatcttgatttaaaataattcttatataagaaagtatattaaaatata taatctaaaaaatcactttatatttatattatataagtgtacaatataatctattataaa atataattttatgcttttatagatttttattttatacataaatatatttatatataaagg agataatttttatgaatgaaaaattaattggtattttggctggaatgggtccaaggtcaa cagccccttttgttgatttaattattgatgagtgtcaatctcaatatggagcaaaatatg atgatgaatttccaaagatgatgatatattcattacctaccccattttatattgaccgtc caataaatcatgaacttatgaaagaaactataattgatggattacaaaagcttgaatcaa ctggtgtaaattttattgcaatgccatgcaattcagcacatatatactttaaagaattaa aagagtctattaatataccaatattaaatattgtagaagaaacagttaaaaaattaccta ctatctcacaaaaagtaactcttttttcgactagttcaacttttgagtctacaatttacc agaatggtataatacataatggacatgaatttatatttaaagatgaatggcaaataaaat taaacaatcttattcaaaatataaaaatggataaagaaaatccacacaatattgatattt ggaataaacttatcgaagatgttaaaaatgaatctatagaaaatatagtaattgcttgta ctgatttaaatgtagttttagaaaaatcatatccttcaataaatattgttgattcatcaa aatgcttggctgaatcagttgtcaataaatatctaaaattagttaaataaatttttcatg cactatattataaaaaatatatgttataagtttattttaaatagtatagacttataacat atatcatagtttcttgacaatatagaaattaaccatgtatttcattatattaataaaaag gataccaaaaatggtatccttcataaatatttatatgtttatttataaaaataatcatat atttattactttactacacctaaacaatattattcaagtgtattcatagagttagaaaat tcttgtcctgctgtaacaagattagataacaatacatcagctactgcatcatttactgaa cttattatccatttattatcctttttagaacattcaaactctacattttttgtaacataa gtctctttaacgcttttttgtttttctttcataattgatactaacatttcagttgttttc tcatcagttaagtcttgtcctgaaaaactcataccaatcatctttgtaaatgcctcagct actatttcttgaagtaatggtgttgaatctataaatttacattctactttgattgtagcc ttatcacctttaacctcgctgtcttttattgtatatgtgattttagatgcattctgtttt agataatctaaaacatattgggcatttgggtcttttgtatctaattcctttaatatatcc ttatatttttcgtcattattttccattaccttattcatgccttcaaagtcaaactttttc gcactgttaaaaaaactatcaattgtatcttctggttttgcacttgaacatgctgttaaa gatattgctaataaaaaagttgttaaagctaatatgatttttttcatatctcaaatcctc cctcttaatttgttgatacataagttattttaacatataatgagagtttttgaataatat atttaaaatattttataaattttcattaaagtaaagtctatattaaaacatatctatatt aaattattgttcatatttacatcagtcatagtagaaaccataacagcttttattgtatgc attctattttcagcttcttcaaatacctttgaatattttgaattaaatacctcgtttgta acctctaattctgataatccgaacttttcataaatctcctgagcaaccttagtttctaaa tcatgaaatgctggaagacagtgtaaaaatataacattttcattttcagttttctttatc atatccatatttacttgataatctttaagttgatttattcttgcttcatattgctcctct tctcccatagaaacccatacatctgtatatataacatctgcacctttaacatcatcaata ttttcagtcaacattatatctcctttggatttcttggctatttccttcatttccttaacc aattcttcatttggccaaagttccttaggtgctagtgctacgaaatgtattcccatttta gcacatcctatcatcagtgagtttcccatattatttctagcatcaccaacatatacaaat ttaactttattcaaatctttatctacattttcaattactgttaaaaaatctgccagtatt tgtgttggatgatattcatctgtaagtccattccaaacaggcacaccagaatattttgct agactttcaactgtttcttgtttaaagcctctaaattctattccatcatagaatcttcct agaacttttgctgtatctgatacagactcttttttacccatatgacaatcatttggacct agataagttacatgtgctccttcatcatgagctgctacttcaaatgaacatctagttctt gttgatgttttctcaaataataaagctatattttttccttgtagcaaatcgccttttata ccaacttttttcttagtttttaaataacttgataaagttaataaatatctaatctcttct tttgtaaaatcctttaatgtcaaaaaactcttaccttttaaacttatattattcatatta attcgccccttcttataaactttttaaattcaattaaacttgttagcactttactttttt atttacttctaatttttatctttaatcaactatttcttgaatatttagttaatttctagt aatatatcttttaggatttcaagagcctcatctatttccttataactgattgttaatggt ggtaaaaatctcaatacattttttccagcagtcaaaataagcaatcctttttttctagct ttctcttctataatactagattcaatattagtttcaattcctatcattagaccaatacct tttgtctttaatacaactttgttattaaaactttcaatagattttcttatataatttcct ttttctaatacttcattataaaaaccatctttagatatctcatctaatacaactgaagct gccaccatagctaataaattacctccaaaagttgtaccttggtctccttttcctagtact tttgaaagttttttatttactaatactcctcctactggtattcctgctcccaaccctttt gctacggtaactatatctggttttacatcaaaatattcatagccaaaaagtttaccagtt cttcctataccgcattggacttcatcaaaaatcactacaatatccttttcttgacatatt tttactatttccaaaacataatctttttcaagaacattaactccaccttcgccttgaatc gcttcaagaattattgcacaaactgtggaatcaagattattttttaaatcttcaatatta tttctttctacatatttaaaaccttcgggaagaggataaaaatacttatggtatttgtcc ataccagttgccattaaagacatcattgttctaccatgaaaagagtcttttaaacttatg atagttcctctaccattaccatatttgtcactactatactttcttgctattttgaatgct gtttcatttgcttctgttccagaattacaaaaatatactttagccattccacttgaatta attattttctctcctgaatacaacactggctcattaaaatataaatttgaagtatgtaat aatttatctacttgctcttttagagcattctttaaattactattactatacccaagagaa gatactccatatccacttgtaaaatctatatatttattgccattagtatcaaaaaaacaa cttccttcaccataatctatgacaaaattgggttgattatatgtatctataaaatattca ttccattttgaaattgtattgtcgttattcattcttattctcccctcttaaacttataat tttattcattttcttttcttattaatgtacctattccactatcagtaaatagctctgtta ttatagaatgtggaactcttccatccaaaatatgtaccctatttactccgttatttaagg catctacgcatccctctattttaggtatcatacctccagtaattataccttcttcaaata atttatcaacatcctctaatataacttctgttattaatgatttttcttcatctggctctc ttaacaaaccagggacatctgtaagaagtatcaatttatctgcatttaactctttagcta tagcagaagctgctgtgtcaccatttatattataagtctctccatcatctccaacaccta tagttgcaattactgaaatataacctgactttagacaagattctataagctcaacattta cttttttgatttctcctacaaatccaagttcataatttttatatgggtcacataaaatca tattattatctattccacaaagccctactgcttttccaccttttgtatgtattttattta ctaggtctttattaacctttccagcaagtaccatttttacaatttccatggtctcttcat ctgtatatctaagaccatttacaaatttactttctatatccacttttgctagcatcttat tgatttctgcccctccaccatgtactaaaactatattgattccaacataactcattaaca caaggtcttccataacagattcttttagaccatcttttttcattgcacttccaccatact taactacaatagtctttccctgatgtttttctatatatggtaaagcttctataagtgtat ttgctttttctatattaatcattaaagtatatcctcctaatttctataacttccatttat tcttacataatcatagcttaaatcacatccccatgcatttcctctggcattgcccatatt taaatctactaatatacttatttcgtcatcttcaaggattttttttgctttttcctcatt aaaatctaatccatttccatttttacatacttcaatatatcctttcatactctcaaaaat aatatcaactttttccatatctatttcttcacctgcataacctaaagcacacagtattct accccaatttgcgtcagctccaaatacagctgtctttactaatgaagaagatataactgt ttttgctaattttactgcatgtgcttcacttaatgctccatttatatagcattcaattag ttttgtacatccttctccatcttttgcaacaagtttagcaagttctatacagacatatgt aagtgcactcaaaaatacttgataatgttcatcttttttgtttattctatcattttttgc ttttccatttgctagaatcattaccatatcattagtacttgtatctccatctacactaac tctattaaaacttttgtcaacagcaatttttaaagcttcttttagcaaaactccatcaat atttgcatctgtagttataaatcctaacgttgttgccatattaggatgtatcataccaga accttttgccatacctccaatagttatttttttatctccatacattattgctactgctat ttctttttttataatatcagttgtcataatagcttctcttgctccaatatgaccttgttt acttagattattcactaattcatccatattttcttctattaaatctatatttaatggctt tcctataacacctgtagatgcaaccaaaacatcactttctttaatatttaatttatcact ggtgaatttagccattttataagcatttataagtccttcttttccattaaaggtattagc attagcactatttactatgatagcttgtgcttttccatttttaatgtgttcctgtgtaac ataaacaggattgccctttactttattttgagttactactgctgctgcatcacataaaac atctgaataaaccaaagctaaatctcttttttctttattttttctcaagccacagtgaat ccctgaagcaaaaaatccttctgaaactgtaactccaccctttataatctccatatttat cctcctaattatatgagtttagtattttttatttctaaaatgatggtgcaatatttttta aacctgtattttcttcaataccaaatattatattcatgttttgtatagcttgacctgctg ctcccttaatcatattatctatagctgaacagattatcaatgtatctccattttcatgta atgatattacacatttatttgagaatctaacattctttaaagaagctatcttatctaatg gaagaatttctataaattctttaaattcataataatcagttaatttcctatgtatatcat ttatagaaatattatcttcttttgtacaatatatagttgataagattcccctatttactg ggattaagtttggtgtaaaaactacacttactttttctttgcaggattcacttaaatttt gttctatttctggagtatgtctgtgtttccctattttatatgcagtgatattttcattaa cctccgtaaagtgactactaatcgataattctctaccagcacctgtaagacctgatttag aatcaattattatattattattttttatcaatttagaacttagtaatggcatcaatggta aagaaatactagttggataacatccaggatttgcaattatatctgcatcttttatatctt ctttgtatatttcacttaatccatatacagcttttttatgtaagattttatctataaaag atactccataccatttactatatacttcttcatcttttattctaaagtcagcacctaaat ctataactttctttttcgatttaattgcctttattacaaacttttcactaactccatgtg gaagggctgtaaacacaacatcacacatatctataactttttcattttctatacatatca tgttatttttatatcctatacttggatatatatcaactatatcttttccaacatacgaat ttgaacctatcgctgtcacttcgactttatcatgattcattaataatctaatcaactctg ccccgacatatccagttgcaccaataataccaacttttattttattcattttgttccctc catttttatattcaaatagtcttaaaatcctatctttccactttactatatgataatcat ttgataatacgtagattaaaatactctaattaaaacaaaaaaccccttagcattataaat actaagaggcgattttccgcggtaccactcttattggtaaaattacaataatcattaaaa ctcaaattaaaaagtatctacaaaatgtacatttaaaattaaaaaagcctcttggtcaaa gaccaagagacgaatatacacccgcgttaccactctaattgataagataatcttacccac tctaatctcttaaggcgagattcaccaattaccatactattacttctggtaatctcctcc aaagctctattcacaataaaattcgttactaggcttccaccattcccagctctctatcaa ctagctttatgctactctctttttcacaggatttcaatttattttcttattgttttatat gatagtttatttttttaactttgtcaatataatttttaaatttttggaaatattttctat atggttaatttccagcattttgtatctaaattgcgatataatttttatatttcattcgtc aatttaaaaaacatccaaaatatattaaattataaaataatatattttcaaaatacaata tttacatctctttttaattaaattttttaatgttggtatctaaaaatttctcaatctttt tctcagaaagtatctcgttggttacaaattcaccattaaaaaaaagactgtatgtagtaa atggtgcaggagcattttgtgcttcttttgctgtttcgaattttataagatttacatcaa tacctctagaatttgcaatttttttcaaaataggagcatatttttccgtatgtggacact gattactgtaatataaaactataccattctcatttaattttctttgttttacacaattct taaaacatggaataggagcattatcagtaaagggaaaatataatagctcataatttggtt ctgatgtatctgctaaacaaaagtccttatattttagatatttagcatcagataaaaaag gcatttttttactagacgaaagcacaactaatccatatttaccttttgattttgcatcat caacacactcttgtagcaatagattagaatatccttgacccttaaattttccagatatcc aaaaacagttaataaatatataattgtccgcagtaataggacaccatgcattttctgctg gaatatattctataaaagctttacctcttacatcaaatcgtttaaagactagacctttat caaaattatttttcatccaagcttttttagaaaaaacacaattttctccttttttttcag aaattgaacaacatatatgttcattgtcaatattatttatatttatatcaataatctgca tacttatctccttttctaattgcataataatttttaaatatattctatatatttttatct taatattttgaatacaacaacatcatgtcatatatatttttattttacataatattattt taagattatctgaattattaaattgtatatataattaaatacattctatggtctaactac actataatataaattatatattatcataatattctaaatttataaaacaaattgtattga attgaatttatttaagatatataattataattaaaataataataaaggtgttgtttataa tgttcaaagaatacttaataagagaattaaaagaagatgatattaaaaatgcattagact taatctggaacgtatttgaagaatttgaatctccagattattgtgatgaaggaattacga catttcatcaatttatagaatataactctattattgaaaaaatcaaagaaaaaactctct tcttttggggttgttttgactctaaaaaacttattggagtcttagctattagaaatttaa atcatatatgtatgttatttgtagataaaaactatcataaacatggtgttgcaaaaaaat taatgactacaggcatacaatactgtatttgtaataaatttaatttaactgaaataactg taaattcatcaccttatgctgttgaagtttatcataaattaggatttaaagatactgctg ttgagcaaattgttgacggtatacgttttacacctatgaaattgttaatataataaatta aataaaaagcaaagtctcttaaatattttatagttactttgcttttaaaccaagatttaa aataatactatcttttttgttttttaataatatactttaaaatccttactaatatgaact ataatttattttttgatatcctttttgattaacatataaattaattcaattattaaacat aaactatgttgtttctctttatatctcttctttgtaaacaatattgggcatttgaaaata aatattcttaaaatatactgttctcctgttgattttcctttggtacaaatgataaaaatt taatttacatgccccataatgaagtgttcaataaataagttaaaataatttatttacctc cttaatcatattttttatgaatacctaataacacagtatcaatagaatcgactaaacctt ttatagcttcttctttactcaaaaatgatttcccaagttgcaaagtcgaataaccatgaa gtacactcattattaagtttaatacttcacctgtattctttgtatttagattacaagaaa gaataagtttttctaataaggatttatattcatcaaagatttctaatgtttcattatttc catgccaagtagcccactgaattgtttcataaacaccaggattagaaattataaaattaa agtatgctatacttatacactttatagctgtatctccaaaatttccaatagccgccttta tcatttgactattcatctctctcattcctttatgagctacttcaagtaataaatcatcta gactttctatatgattgtacaaagatggtgtacgtattcctagcttttctgcaataactt ttaaagaaactttgttaagcccatctttattaactatatctgatgtagcttgtataacta tttctctactaacacgcatgattttccctctttcatttaaaattaattactttattagtt taactaatctaattagtttcgtcaattattgtaatttataaaattctttatactattata aaatcttgacagtttaattataatttaatataatactaattaaattagttttaatactaa tataattagtattatattaaattctatattacaacattattttatagtttgattaattta ataatcactaatatatcaaactgaaaggagatttttatggaaaaaaaatatttcgaaatt catggagttccttcaatcctttggggaaatccttcaagtaaattatatatttacatacat ggacaatgtggcaataaagaggaggctgaagcttttgctaatattgcagttccacatgag tgtcaagttttaagtgttgatttgcctgaacatggagaacgtaaaagagaaaaaaattca tttaacccatggcatgttgttccagaattagtatctattatggaatatgcaaagtgccac tggaatcaaatttcgttatatgcaaatagcattggagcatggtttagtatgttaagcttt gaaaaagagaacttaagagagtgtatttttgtatctccaattctagatatgcaacagctc atttcaaatatgatgctctgggcaaatgtatcagaagaacagcttaaacatgaactaatt atcccaacttcatttgggcatactctttcatgggaatatctacaatatgtaaaacaacat cctatcactcaatggaatataccaacaaaaatattatatggtaaacatgatgaacttact gaaatcggtgttgtagagaaatttgtagaaaagtttaattgcaaccttactattgtagaa aatggcaaacattggtttaacacaccacaagaattaaattcattatatgaatggttaaat actttagttaaataaaaaataattatattattaatatgattaaattatttataaatgtta tttaattaattttattttagcattattaaaataactacataaagaataaattagttatta ttaaagaaattaaaagtatatagagtattaataattttttaataattagttattatagaa aaaagagggatataatattgtctccctctctttcttctgtaatattatataatttttatt tatcactctcaataaattatagttatctacaaaattcaatctttaatacattattaatat attgtgatattaatattacagtattaaataaaatctaataaaattaactataaaatatct attatataaatatccactcttatgtttgaaatccgtcatatagttttatccttcttatct tttatatcaataactttttttaataaaattgacaaaactaaagtaaaaaaccttattgat aatgaaacaaatgatactataagttctgatattatagtaattgcatataaatagacatca taaaaataatataatattgtcactataaaattaaatgtaaaaatctcaaatctaactaaa tacacatataggtattttttaagtttttaggtatttcttctgaaaatgatttattgattg ataccaatttacataatctttttaatataaacaatgatacaatatatgggacagcacata tgtatatagctacttatattacagttggcatattcgtatttgtaatgcttataccaattt taaaatacaccatcagtactaatagtattaaaataatctataataaagttaaaattattc caattagtacaatattatttaatattttacaactcatatccttttttatataaatttacc accttatacattcttatttttagtgtatattacaatggttttatatattatatcaatatt ttattattgaaattcaataaattatatattataatcaataatatactttatataaaggag atgatattttatgattacaaaattttttagtaatatattatcagtatttctatattttct attatcacttttaggagttgctggtataatattcttatgtatgatacctatgtttttata tgattttagttctgacaaagtaattgctttaattgcaagaatactatatttttctgacta ctttata |