Block details | |
---|---|
fasta | C_difficile_CD00148_1A_020479.fasta |
contig | u00000crpx_c_020479 |
start | 2145840 |
length | 13027 |
strand | + |
type | core |
seq | gaatttactcttgatgtacgctcttgttcacaagaaattcttgataattctgtagaaaag atatttaatgaaatatcacatatatgtgaaaatagaaaacttaattatacaagtgaactt gcttttgaaaatgttcctgtaccatgttctaataaaataacaaaaatcatagaaaaaagt tttatagatttaaatcttaatcctttttatatttatagtggtgctggccatgatgctcag gaaatggataatataactgatattggtatggtatttataagatgcgctgggggcgtaagt cataatcctaatgaaagtgtttctgtagatgacttggatactgctgtaaaaatattttta aaaatactagataatcttgatttaaaataattcttatataagaaagtatattaaaatata taatctaaaaaatcactttatatttatattatataagtgtacaatataatctattataaa atataattttatgcttttatagatttttattttatacataaatatatttatatataaagg agataatttttatgaatgaaaaattaattggtattttggctggaatgggtccaaggtcaa cagccccttttgttgatttaattattgatgagtgtcaatctcaatatggagcaaaatatg atgatgaatttccaaagatgatgatatattcattacctaccccattttatattgaccgtc caataaatcatgaccttatgaaagaaactataattgatggattacaaaagcttgaatcaa ctggtgtaaattttattgcaatgccatgcaattcagcacatatatactttaaagaattaa aagagtctattaatataccaatattaaatattgtagaagaaacagttaaaaaattaccta ctatctcacaaaaagtaactcttttttcgactagttcaacttttgagtctacaatttacc agaatggtataatacataatggacatgaatttatatttaaagatgaatggcaaataaaat taaacaatcttattcaaaatataaaaatggataaagaaaatccacacaatattgatattt ggaataaacttatcgaagatgttaaaaatgaatctatagaaaatatagtaattgcttgta ctgatttaaatgtagttttagaaaaatcatatccttcaataaatattgttgattcatcaa aatgcttggctgaatcagttgtcaataaatatctaaaattagttaaataaatttttcata cactatattataaaaaatatatgttataagtttattttaaatagtatagacttataacat atatcatagtttcttgacaatatagaaattaaccatgtatttcattatattaataaaaag gataccaaaaatggtatccttcataaatatttatatgtttatttataaaaataatcatat atttattactttactacacctaaacaatattattcaagtgtattcatagagttagaaaat tcttgtcctgctgtaacaagattagataacaatacatcagctactgcatcatttactgaa cttattatccatttattatcctttttagaacattcaaactctacattttttgtaacataa gtctctttaacgcttttttgtttttctttcataattgatactaacatttcagttgttttc tcatcagttaagtcttgtcctgaaaaactcataccaatcatctttgtaaatgcctcagct actatttcttgaagtaatggtgttgaatctataaatttacattctactttgattgtagcc ttatcacctttaacctcgctgtcttttattgtatatgtgattttagatgcattctgtttt agataatctaaaacatattgggcatttgggtcttttgtatctaattcctttaatatatcc ttatatttttcgtcattattttccattaccttattcatgccttcaaagtcaaactttttc gcactgttaaaaaaactatcaattgtatcttctggttttgcacttgaacatgctgttaaa gatattgctaataaaaaagttgttaaagctaatatgatttttttcatatctcaaatcctc cctcttaatttgttgatacataagttattttaacatataatgagagtttttgaataatat atttaaaatattttataaattttcattaaagtaaagtctatattaaaacatatctatatt aaattattgttcatatttacatcagtcatagtagaaaccataacagcttttattgtatgc attctattttcagcttcttcaaatacctttgaatattttgaattaaatacctcgtttgta acctctaattctgataatccgaacttttcataaatctcctgagcaaccttagtttctaaa tcatgaaatgctggaagacagtgtaaaaatataacattttcattttcagttttctttatc atatccatatttacttgataatctttaagttgatttattcttgcttcatattgctcctct tctcccatagaaacccatacatctgtatatataacatctgcacctttaacatcatcaata ttttcagtcaacattatatctcctttggatttcttggctatttccttcatttccttaacc aattcttcatttggccaaagttccttaggtgctagtgctacgaaatgtattcccatttta gcacatcctatcatcagtgagtttcccatattatttctagcatcaccaacatatacaaat ttaactttattcaaatctttatctacattttcaattactgttaaaaaatctgccagtatt tgtgttggatgatattcatctgtaagtccattccaaacaggtacaccagaatattttgct agactttcaactgtttcttgtttaaagcctctaaattctattccatcatagaatcttcct agaacttttgctgtatctgatacagactcttttttacccatatgacaatcatttggacct agataagttacatgtgctccttcatcatgagctgctacttcaaatgaacatctagttctt gttgatgttttctcaaataataaagctatattttttccttgtagcaaatcgccttttata ccaacttttttcttagtttttaaataacttgataaagttaataaatatctaatctcttct tttgtaaaatcctttaatgtcaaaaaactcttaccttttaaacttatattattcatatta attcgccccttcttataaactttttaaattcaattaaacttgttagcactttactttttt atttacttctaatttttatctttaatcaactatttcttgaatatttagttaatttctagt aatatatcttttaggatttcaagagcctcatctatttccttataactgattgttaatggt ggtaaaaatctcaatacattttttccagcagtcaaaataagcaatcctttttttctagct ttctcttctataatactagattcaatattagtttcaattcctatcattagaccaatacct tttgtctttaatataactttgttattaaaactttcaatagattttcttatataatttcct ttttctaatacttcattataaaagccatctttagatatctcatctaatacaactgaagct gccaccatagctaataaattacctccaaaagttgtaccttggtctccttttcctagtact tttgaaagttttttatttaccaatactcctcctactggtattcctgctcccaaccctttt gctacggtaactatatctggttttacatcaaaatattcatagccaaaaagtttaccagtt cttcctataccgcattggacttcatcaaaaatcactacaatatccttttcttgacatatt tttactatttccaaaacataatctttttcaagaacattaactccaccttcgccttgaatc gcttcaagaattattgcacaaactgtggaatcaagattattttttaaatcttcaatatta tttctttctatatatttaaaaccttcgggaagaggataaaaatacttatggtatttgtcc ataccagttgccattaaagacatcattgttctaccatgaaaagagtcttttaaacttatg atagttcctctaccattaccatatttgtcactactatactttcttgctattttgaatgct gtttcatttgcttctgttccagaattacaaaaatatactttagccattccacttgaatta attattttctctcctgaatacaacactggctcattaaaatataaatttgaagtatgtaat aatttatctacttgctcttttagagcattctttaaattactattactatacccaagagaa gatactccatatccacttgtaaaatctatatatttattgccattagtatcaaaaaaacaa cttccttcaccataatctatgacaaaattgggttggttatatgtatctataaaatattca ttccattttgaaattgtattgtcgttattcattcttattctcccctcttaaacttataat tttattcattttcttttcttattaatgtacctattccactatcagtaaatagctctgtta ttatagaatgtggaactcttccatccaaaatatgtaccctatttactccgttatttaggg catctacgcatccctctattttaggtatcatacctccagtaattataccttcttcaaata atttatcaacatcctctaatataacttctgttattaatgatttttcttcatctggctctc ttaacaaaccagggacatctgtaagaagtattaatttatctgcatttaactctttagcta tagcagaagctgctgtgtcaccatttatattataagtctctccatcatctccaacaccta tagttgcaattactgaaatataacctgactttagacaagattctataagctcaacattta cttttttgatttctcctacaaatccaagttcataatttttatatgggtcacataaaatca tattattatctattccacaaagccctactgcttttccaccttttgtatgtattttattta ctaggtctttattaacctttccagcaagtaccatttttacaatttccatggtctcttcat ctgtatatctaagaccatttacaaatttactttctatatccacttttgctagcatcttat tgatttctgcccctccaccatgtactaaaactatattgattccaacataactcattaaca caaggtcttccataacagattcttttagaccatcttttttcattgcacttccaccatact taactacaatagtctttccctgatgtttttctatatatggtaaagcttctataagtgtat ttgctttttctatattaatcattaaagtatatcctcctaatttctataacttccatttat tcttacataatcatagcttaaatcacatccccatgcatttcctctggcattgcccatatt taaatctactaatatacttatttcgtcatcttcaaggattttttttgctttttcctcatt aaaatctaatccatttccatttttacatacttcaatatatcctttcatactctcaaaaat aatatcaactttttccatatctatttcttcacctgcataacctaaagcacacagtattct accccaatttgcgtcagctccaaatacagctgtctttactaatgaagaagatataactgt ttttgctaattttactgcatgttcttcacttaatgctccatttatatagcattcaattag ttttgtacatccttctccatcttttgcaacaagtttagcaagttctatacagacatatgt aagtgcactcaaaaatacttgataatgttcatcttttttgtttattctatcattttttgc ttttccatttgctagaatcattaccatatcattagtacttgtatctccatctacactaac tctattaaaacttttgtcaacagcaatttttaaagcttcttttagcaaaactccatcaat atttgcatctgtagttataaatcctaacgttgttgccatattaggatgtatcataccaga accttttgccatacctccaatagttatttttttatctccatacattattgctactgctat ttctttttttataatatcagttgtcataatagcttctcttgctccaatatgaccttgttt acttagattattcactaattcatccatattttcttctattaaatctatatttaatggctt tcctataacacctgtagatgcaaccaaaacatcactttctttaatatttaatttatcact ggtgaatttagccattttataagcatttataagtccttcttttccattaaaggtattagc attagcactatttactatgatagcttgtgcctttccatttttaatgtgttcctgtgtaac ataaacaggattgccctttactttattttgagttactactgctgctgcatcacataaaac atctgaataaaccaaagctaaatctcttttttctttattttttctcaagccacagtgaat ccctgaagcaaaaaatccttctgaaactgtaactccaccctttataatctccatatttat cctcctaattatatgagtttagtattttttatttctaaaatgatggtgcaatatttttta aacctgtattttcttcaataccaaatattatattcatgttttgtatagcttgacctgctg ctcccttaatcatattatctatagctgaacagattatcaatgtatctccattttcatgta atgatattacacatttatttgagaatctaacattctttaaagaagctaccttatctaatg gaagaatttctataaattctttaaattcataataatcagttaatttcctatgtatatcat ttatagaaatattatcttcttttgtacaatatatagttgataagattcccctatttactg ggattaagtttggtgtaaaaactacacttactttttctttgcaggattcacttaaatttt gttctatttctggagtatgtctgtgtttccctattttatatgcagtgatattttcattaa cctccgtaaagtgactactaatcgataattctctaccagcacctgtaagacctgatttag aatcaattattatattattattttttatcaatttagaacttagtaatggcatcaatggta aagaaatactagttggataacatccaggatttgcaattatatctgcatcttttatatctt ctttgtatatttcacttaatccatatacagcttttttatgtaagattttatctataaaag atactccataccatttactatatacttcttcatcttttattctaaagtcagcacctaaat ctataactttctttttcgatttaattgcctttattacaaacttttcactaactccatgtg gaagggctgtaaatacaacatcacacatatctataactttttcattttctatacatatca tgttatttttatatcctatacttggatatatatcaactatatcttttccaacatacgaat ttgaacctatcgctgtcacttcgactttatcatgattcattaataatctaatcaactctg ccccgacatatccagttgcaccaataataccaacttttattttattcattttgttccctc catttttatattcaaatagtcttaaaatcctatctttccactttactatatgataatcat ttgataatacgtagattaaaatactctaattaaaacaaaaaaccccttagcattataaat actaagaggcgattttccgcggtaccactcttattggtaaaattacaataatcattaaaa ctcaaattaaaaagtatctacaaaatgtacatttaaaattaaaaaagcctcttggtcaaa gaccaagagacgaatatacacccgcgttaccactctaattgataagataatcttacccac tctaatctcttaaggcgagattcaccaattaccatactattacttctggtaatctcctcc aaagctctattcacaataaaattcgttactaggcttccaccattcccagctctctatcaa ctagctttatgctactctctttttcacaggatttcaatttattttcttattgttttatat gatagtttatttttttaactttgtcaatataatttttaaatttttggaaatattttctat atggttaatttccagcattttgtatctaaattgagatataatttttatatttcattcgtc aatttaaaaaacatccaaaatatattaaattataaaataatatattttcaaaatacaata tttacatctctttttagttaaattttttaatgttggtatctaaaaatttcccaatctttt tctcagaaagtatctcgttggttacaaattcaccattaaaaaaaagactgtatgtagtaa atggtgcaggagcattttgtgcttcttttgctgtttcgaattttataagatttacatcaa tacctctagaatttgcaatttttttcaaaataggagcatatttttccgtatgtggacact gattactgtaatataaaactataccgttctcatttaattttcttttttttaaacaattct taaaatatggaataggagcattatcagtaaaaggaaaatataatagctcataatttggtt ctgatgtatctgctaaacaaaagcccttatattttagatatttagcatcagataaaaaag gcatttttttactagacgaaagcacaactaatccatatttaccttttgattttgcatcat caacacactcttgtagcaatagattagaatatccttgacccttaaattttccagatatcc aaaaacagttaataaatatataattgtccgcagtaataggacaccatgcattttctgctg gaatatattctataaaagctttacctcttacatcaaatcgtttaaagactagacctttat caaaattatttttcatccaagcttttttagaaaaaacacaattttctccttttttttcag aaattgaacaacatatatgttcattgtcaatattatttatatttatatcaataatctgca tacttatctccttttctaattgcataataatttttaaatatattctatatatttttatct taatattttgaataacaacaacatcatgtcatatatatttttattttacataatattatt ttaagattatctgaattattaaattgtatatataattaaatacattctatggtctaacta cactataatataaattatatattatcataatattctaaatttataaaacaaattgtattg aattgaatttatttaagatatataattataattaaaataataataaaggtgttgtttata atgttcaaagaatacttaataagagaattaaaagaagatgatattaaaaatgcattagac ttaatctggaacgtatttgaagaatttgaatctccagattattgtgatgaaggaattacg acatttcatcaatttatagaatataactctattattgaaaaaatcaaagaaaaaactctc ttcttttggggttgttttgactctaaaaaacttattggagtcttagctattagaaattta aatcatatatgtatgttatttgtagataaaaactatcataaacatggtgttgcaaaaaaa ttaatgactacaggcatacaatactgtatttgtaataaatttaatttaactgaaataact gtaaattcatcaccttatgctgttgaagtttatcataaattaggatttaaagatactgct gttgagcaaattgttgacggtatacgttttacacctatgaaattgttaatataataaatt aaataaaaagcaaagtctcttaaatattttatagttactttgcttttaaaccaagattta aaataatactatcttttttgttttttaataatatactttaaaatccttactaatatgaac tataatttattttttgatatcctttttgattaacatataaattaattcaattattaaaca taaactatgttgtttctctttatatctcttctttgtaaacaatattgggcatttgaaaat aaatattcttaaaatatactgttctcctgttgattttcctttggtacaaatgataaaaat ttaatttacatgccccataatgaagtgttcaataaataagttaaaataatttatttacct ccttaatcatattttttatgaatacctaataacacagtatcaatagaatcgactaaacct tttatagcttcttctttactcaaaaatgatttcccaagttgcaaagtcgaataaccatga agtacactcattattaagtttaatacttcacctgtattctttgtatttagattacaagaa agaataagtttttctaataaggatttatattcatcaaagatttctaatgtttcattattt ccatgccaagtagcccactgaattgtttcataaacaccaggattagaaattataaaatta aagtatgctatacttatacactttatagctgtatctccaaaatttccaatagccgccttt atcatttgactattcatctctctcattcctttatgagctacttcaagtaataaatcatct agactttctatatgattgtacaaagatggtgtacgtattcctagcttttctgcaataact tttaaagaaactttgttaagcccatctttattaactatatctgatgtagcttgtataact atttctctactaacacgcatgattttccctctttcatttaaaattaattactttattagt ttaactaatctaattagtttcgtcaattattgtaatttataaaattctttatactattat aaaatcttgacagtttaattataatttaatataatactaattgaattagttttaatacta atataattattattatattaaattctatattacaacattattttatagtttgattaattt aacaatcactaatatatcaaactgaaaggagatttttatggaaaaaaaatatttcgaaat tcatggagttccttcaatcctttggggaaatccttcaagtaaattatatatttacataca tggacaatgtggcaataaagaggaggctgaagcttttgctaatattgcagttccacatga gtgtcaagttttaagtgttgatttgcctgaacatggagaacgtaaaagagaaaaaaattc atttaacccatggcatgttgttccagaattagtatctattatggaatatgcaaagtgcca ctggaatcaaatttcgttatatgcaaatagcattggagcatggtttagtatgttaagctt tgaaaaagagaacttaagagagtgtatttttgtatctccaattctagatatgcaacagct catttcaaatatgatgctttgggcaaatgtatcagaagaacagcttaaacatgaactaat tatcccaacttcatttgggcatactctttcatgggaatatctacaatatgtaaaacaaca tcctatcactcaatggaatgtaccaacaaaaatattatatggtaaacatgatgaacttac tgaaatcggtgttgtagagaaatttgtagaaaagtttaattgcaaccttactattataga aaatggcaaacattggtttaacacaccacaagaattaaattcattatatgaatggttaaa tactttagttaaataaaaaataattatattattaatatgattaaattatttataaatgtt atttaattaattttattttagcattattaaaataactacataaagaataaattagttatt attaaagaaattaaaagtatatagagtattaataattttttaataattagttattataga aaaaagagggatataatattgtctccctctctttcttctgtaatattatataatttttat ttatcactctcaataaattatagttatctacaaaatttaatctttaatacattattaata tattgtgatattaatattacagtattaaataaaatctaataaaattaactataaaatatc tattatataaatatccactcttatgtttgaaatccgtcatatagttttatccttcttatc ttttatatcaataacttttttttataaaattgacaaaactaaagtaaaaaaccttattga taatgaaacaaatgatactataagttctgatattatagtaattgcatataaatagacatc ataaaaataatataatattgtcactataaaattaaatgtaaaaatctcaaatctaactaa atacacatataggtattttttaagtttttaggtatttcttctgaaaatgatttattgatt gataccaatttacataatctttttaatataaacaatgatacaatatatgggacagcacat atgtatatagctacttatattacatattacagttggcatattcgtatttgtaatgcttat accaattttaaaatacaccatcagtactaatggtattaaaataatctataataaagttaa aattattccaattagtacaatattatttaatattttacaactcatattcttttttatata aatttaccaccttatacattcttatttttagtgtatattacaatggttttatatattata tcaataatttattattgaaattcaataaattgtatattataatcaataatatactttata taaaggagatgatattttatgattacaaaattttttagtaatatattatcagtatttcta tattttctattatcacttttaggagttgctggtataatattcttatgtatgatacctatg tttttatatgattttagttctgacaaagtaatcgctttaattgcaagaatactatatttt tctgacta |