Block details
fasta C_difficile_CD00148_1A_020479.fasta
contig u00000crpx_c_020479
start 2145840
length 13027
strand +
type core
seq gaatttactcttgatgtacgctcttgttcacaagaaattcttgataattctgtagaaaag
atatttaatgaaatatcacatatatgtgaaaatagaaaacttaattatacaagtgaactt
gcttttgaaaatgttcctgtaccatgttctaataaaataacaaaaatcatagaaaaaagt
tttatagatttaaatcttaatcctttttatatttatagtggtgctggccatgatgctcag
gaaatggataatataactgatattggtatggtatttataagatgcgctgggggcgtaagt
cataatcctaatgaaagtgtttctgtagatgacttggatactgctgtaaaaatattttta
aaaatactagataatcttgatttaaaataattcttatataagaaagtatattaaaatata
taatctaaaaaatcactttatatttatattatataagtgtacaatataatctattataaa
atataattttatgcttttatagatttttattttatacataaatatatttatatataaagg
agataatttttatgaatgaaaaattaattggtattttggctggaatgggtccaaggtcaa
cagccccttttgttgatttaattattgatgagtgtcaatctcaatatggagcaaaatatg
atgatgaatttccaaagatgatgatatattcattacctaccccattttatattgaccgtc
caataaatcatgaccttatgaaagaaactataattgatggattacaaaagcttgaatcaa
ctggtgtaaattttattgcaatgccatgcaattcagcacatatatactttaaagaattaa
aagagtctattaatataccaatattaaatattgtagaagaaacagttaaaaaattaccta
ctatctcacaaaaagtaactcttttttcgactagttcaacttttgagtctacaatttacc
agaatggtataatacataatggacatgaatttatatttaaagatgaatggcaaataaaat
taaacaatcttattcaaaatataaaaatggataaagaaaatccacacaatattgatattt
ggaataaacttatcgaagatgttaaaaatgaatctatagaaaatatagtaattgcttgta
ctgatttaaatgtagttttagaaaaatcatatccttcaataaatattgttgattcatcaa
aatgcttggctgaatcagttgtcaataaatatctaaaattagttaaataaatttttcata
cactatattataaaaaatatatgttataagtttattttaaatagtatagacttataacat
atatcatagtttcttgacaatatagaaattaaccatgtatttcattatattaataaaaag
gataccaaaaatggtatccttcataaatatttatatgtttatttataaaaataatcatat
atttattactttactacacctaaacaatattattcaagtgtattcatagagttagaaaat
tcttgtcctgctgtaacaagattagataacaatacatcagctactgcatcatttactgaa
cttattatccatttattatcctttttagaacattcaaactctacattttttgtaacataa
gtctctttaacgcttttttgtttttctttcataattgatactaacatttcagttgttttc
tcatcagttaagtcttgtcctgaaaaactcataccaatcatctttgtaaatgcctcagct
actatttcttgaagtaatggtgttgaatctataaatttacattctactttgattgtagcc
ttatcacctttaacctcgctgtcttttattgtatatgtgattttagatgcattctgtttt
agataatctaaaacatattgggcatttgggtcttttgtatctaattcctttaatatatcc
ttatatttttcgtcattattttccattaccttattcatgccttcaaagtcaaactttttc
gcactgttaaaaaaactatcaattgtatcttctggttttgcacttgaacatgctgttaaa
gatattgctaataaaaaagttgttaaagctaatatgatttttttcatatctcaaatcctc
cctcttaatttgttgatacataagttattttaacatataatgagagtttttgaataatat
atttaaaatattttataaattttcattaaagtaaagtctatattaaaacatatctatatt
aaattattgttcatatttacatcagtcatagtagaaaccataacagcttttattgtatgc
attctattttcagcttcttcaaatacctttgaatattttgaattaaatacctcgtttgta
acctctaattctgataatccgaacttttcataaatctcctgagcaaccttagtttctaaa
tcatgaaatgctggaagacagtgtaaaaatataacattttcattttcagttttctttatc
atatccatatttacttgataatctttaagttgatttattcttgcttcatattgctcctct
tctcccatagaaacccatacatctgtatatataacatctgcacctttaacatcatcaata
ttttcagtcaacattatatctcctttggatttcttggctatttccttcatttccttaacc
aattcttcatttggccaaagttccttaggtgctagtgctacgaaatgtattcccatttta
gcacatcctatcatcagtgagtttcccatattatttctagcatcaccaacatatacaaat
ttaactttattcaaatctttatctacattttcaattactgttaaaaaatctgccagtatt
tgtgttggatgatattcatctgtaagtccattccaaacaggtacaccagaatattttgct
agactttcaactgtttcttgtttaaagcctctaaattctattccatcatagaatcttcct
agaacttttgctgtatctgatacagactcttttttacccatatgacaatcatttggacct
agataagttacatgtgctccttcatcatgagctgctacttcaaatgaacatctagttctt
gttgatgttttctcaaataataaagctatattttttccttgtagcaaatcgccttttata
ccaacttttttcttagtttttaaataacttgataaagttaataaatatctaatctcttct
tttgtaaaatcctttaatgtcaaaaaactcttaccttttaaacttatattattcatatta
attcgccccttcttataaactttttaaattcaattaaacttgttagcactttactttttt
atttacttctaatttttatctttaatcaactatttcttgaatatttagttaatttctagt
aatatatcttttaggatttcaagagcctcatctatttccttataactgattgttaatggt
ggtaaaaatctcaatacattttttccagcagtcaaaataagcaatcctttttttctagct
ttctcttctataatactagattcaatattagtttcaattcctatcattagaccaatacct
tttgtctttaatataactttgttattaaaactttcaatagattttcttatataatttcct
ttttctaatacttcattataaaagccatctttagatatctcatctaatacaactgaagct
gccaccatagctaataaattacctccaaaagttgtaccttggtctccttttcctagtact
tttgaaagttttttatttaccaatactcctcctactggtattcctgctcccaaccctttt
gctacggtaactatatctggttttacatcaaaatattcatagccaaaaagtttaccagtt
cttcctataccgcattggacttcatcaaaaatcactacaatatccttttcttgacatatt
tttactatttccaaaacataatctttttcaagaacattaactccaccttcgccttgaatc
gcttcaagaattattgcacaaactgtggaatcaagattattttttaaatcttcaatatta
tttctttctatatatttaaaaccttcgggaagaggataaaaatacttatggtatttgtcc
ataccagttgccattaaagacatcattgttctaccatgaaaagagtcttttaaacttatg
atagttcctctaccattaccatatttgtcactactatactttcttgctattttgaatgct
gtttcatttgcttctgttccagaattacaaaaatatactttagccattccacttgaatta
attattttctctcctgaatacaacactggctcattaaaatataaatttgaagtatgtaat
aatttatctacttgctcttttagagcattctttaaattactattactatacccaagagaa
gatactccatatccacttgtaaaatctatatatttattgccattagtatcaaaaaaacaa
cttccttcaccataatctatgacaaaattgggttggttatatgtatctataaaatattca
ttccattttgaaattgtattgtcgttattcattcttattctcccctcttaaacttataat
tttattcattttcttttcttattaatgtacctattccactatcagtaaatagctctgtta
ttatagaatgtggaactcttccatccaaaatatgtaccctatttactccgttatttaggg
catctacgcatccctctattttaggtatcatacctccagtaattataccttcttcaaata
atttatcaacatcctctaatataacttctgttattaatgatttttcttcatctggctctc
ttaacaaaccagggacatctgtaagaagtattaatttatctgcatttaactctttagcta
tagcagaagctgctgtgtcaccatttatattataagtctctccatcatctccaacaccta
tagttgcaattactgaaatataacctgactttagacaagattctataagctcaacattta
cttttttgatttctcctacaaatccaagttcataatttttatatgggtcacataaaatca
tattattatctattccacaaagccctactgcttttccaccttttgtatgtattttattta
ctaggtctttattaacctttccagcaagtaccatttttacaatttccatggtctcttcat
ctgtatatctaagaccatttacaaatttactttctatatccacttttgctagcatcttat
tgatttctgcccctccaccatgtactaaaactatattgattccaacataactcattaaca
caaggtcttccataacagattcttttagaccatcttttttcattgcacttccaccatact
taactacaatagtctttccctgatgtttttctatatatggtaaagcttctataagtgtat
ttgctttttctatattaatcattaaagtatatcctcctaatttctataacttccatttat
tcttacataatcatagcttaaatcacatccccatgcatttcctctggcattgcccatatt
taaatctactaatatacttatttcgtcatcttcaaggattttttttgctttttcctcatt
aaaatctaatccatttccatttttacatacttcaatatatcctttcatactctcaaaaat
aatatcaactttttccatatctatttcttcacctgcataacctaaagcacacagtattct
accccaatttgcgtcagctccaaatacagctgtctttactaatgaagaagatataactgt
ttttgctaattttactgcatgttcttcacttaatgctccatttatatagcattcaattag
ttttgtacatccttctccatcttttgcaacaagtttagcaagttctatacagacatatgt
aagtgcactcaaaaatacttgataatgttcatcttttttgtttattctatcattttttgc
ttttccatttgctagaatcattaccatatcattagtacttgtatctccatctacactaac
tctattaaaacttttgtcaacagcaatttttaaagcttcttttagcaaaactccatcaat
atttgcatctgtagttataaatcctaacgttgttgccatattaggatgtatcataccaga
accttttgccatacctccaatagttatttttttatctccatacattattgctactgctat
ttctttttttataatatcagttgtcataatagcttctcttgctccaatatgaccttgttt
acttagattattcactaattcatccatattttcttctattaaatctatatttaatggctt
tcctataacacctgtagatgcaaccaaaacatcactttctttaatatttaatttatcact
ggtgaatttagccattttataagcatttataagtccttcttttccattaaaggtattagc
attagcactatttactatgatagcttgtgcctttccatttttaatgtgttcctgtgtaac
ataaacaggattgccctttactttattttgagttactactgctgctgcatcacataaaac
atctgaataaaccaaagctaaatctcttttttctttattttttctcaagccacagtgaat
ccctgaagcaaaaaatccttctgaaactgtaactccaccctttataatctccatatttat
cctcctaattatatgagtttagtattttttatttctaaaatgatggtgcaatatttttta
aacctgtattttcttcaataccaaatattatattcatgttttgtatagcttgacctgctg
ctcccttaatcatattatctatagctgaacagattatcaatgtatctccattttcatgta
atgatattacacatttatttgagaatctaacattctttaaagaagctaccttatctaatg
gaagaatttctataaattctttaaattcataataatcagttaatttcctatgtatatcat
ttatagaaatattatcttcttttgtacaatatatagttgataagattcccctatttactg
ggattaagtttggtgtaaaaactacacttactttttctttgcaggattcacttaaatttt
gttctatttctggagtatgtctgtgtttccctattttatatgcagtgatattttcattaa
cctccgtaaagtgactactaatcgataattctctaccagcacctgtaagacctgatttag
aatcaattattatattattattttttatcaatttagaacttagtaatggcatcaatggta
aagaaatactagttggataacatccaggatttgcaattatatctgcatcttttatatctt
ctttgtatatttcacttaatccatatacagcttttttatgtaagattttatctataaaag
atactccataccatttactatatacttcttcatcttttattctaaagtcagcacctaaat
ctataactttctttttcgatttaattgcctttattacaaacttttcactaactccatgtg
gaagggctgtaaatacaacatcacacatatctataactttttcattttctatacatatca
tgttatttttatatcctatacttggatatatatcaactatatcttttccaacatacgaat
ttgaacctatcgctgtcacttcgactttatcatgattcattaataatctaatcaactctg
ccccgacatatccagttgcaccaataataccaacttttattttattcattttgttccctc
catttttatattcaaatagtcttaaaatcctatctttccactttactatatgataatcat
ttgataatacgtagattaaaatactctaattaaaacaaaaaaccccttagcattataaat
actaagaggcgattttccgcggtaccactcttattggtaaaattacaataatcattaaaa
ctcaaattaaaaagtatctacaaaatgtacatttaaaattaaaaaagcctcttggtcaaa
gaccaagagacgaatatacacccgcgttaccactctaattgataagataatcttacccac
tctaatctcttaaggcgagattcaccaattaccatactattacttctggtaatctcctcc
aaagctctattcacaataaaattcgttactaggcttccaccattcccagctctctatcaa
ctagctttatgctactctctttttcacaggatttcaatttattttcttattgttttatat
gatagtttatttttttaactttgtcaatataatttttaaatttttggaaatattttctat
atggttaatttccagcattttgtatctaaattgagatataatttttatatttcattcgtc
aatttaaaaaacatccaaaatatattaaattataaaataatatattttcaaaatacaata
tttacatctctttttagttaaattttttaatgttggtatctaaaaatttcccaatctttt
tctcagaaagtatctcgttggttacaaattcaccattaaaaaaaagactgtatgtagtaa
atggtgcaggagcattttgtgcttcttttgctgtttcgaattttataagatttacatcaa
tacctctagaatttgcaatttttttcaaaataggagcatatttttccgtatgtggacact
gattactgtaatataaaactataccgttctcatttaattttcttttttttaaacaattct
taaaatatggaataggagcattatcagtaaaaggaaaatataatagctcataatttggtt
ctgatgtatctgctaaacaaaagcccttatattttagatatttagcatcagataaaaaag
gcatttttttactagacgaaagcacaactaatccatatttaccttttgattttgcatcat
caacacactcttgtagcaatagattagaatatccttgacccttaaattttccagatatcc
aaaaacagttaataaatatataattgtccgcagtaataggacaccatgcattttctgctg
gaatatattctataaaagctttacctcttacatcaaatcgtttaaagactagacctttat
caaaattatttttcatccaagcttttttagaaaaaacacaattttctccttttttttcag
aaattgaacaacatatatgttcattgtcaatattatttatatttatatcaataatctgca
tacttatctccttttctaattgcataataatttttaaatatattctatatatttttatct
taatattttgaataacaacaacatcatgtcatatatatttttattttacataatattatt
ttaagattatctgaattattaaattgtatatataattaaatacattctatggtctaacta
cactataatataaattatatattatcataatattctaaatttataaaacaaattgtattg
aattgaatttatttaagatatataattataattaaaataataataaaggtgttgtttata
atgttcaaagaatacttaataagagaattaaaagaagatgatattaaaaatgcattagac
ttaatctggaacgtatttgaagaatttgaatctccagattattgtgatgaaggaattacg
acatttcatcaatttatagaatataactctattattgaaaaaatcaaagaaaaaactctc
ttcttttggggttgttttgactctaaaaaacttattggagtcttagctattagaaattta
aatcatatatgtatgttatttgtagataaaaactatcataaacatggtgttgcaaaaaaa
ttaatgactacaggcatacaatactgtatttgtaataaatttaatttaactgaaataact
gtaaattcatcaccttatgctgttgaagtttatcataaattaggatttaaagatactgct
gttgagcaaattgttgacggtatacgttttacacctatgaaattgttaatataataaatt
aaataaaaagcaaagtctcttaaatattttatagttactttgcttttaaaccaagattta
aaataatactatcttttttgttttttaataatatactttaaaatccttactaatatgaac
tataatttattttttgatatcctttttgattaacatataaattaattcaattattaaaca
taaactatgttgtttctctttatatctcttctttgtaaacaatattgggcatttgaaaat
aaatattcttaaaatatactgttctcctgttgattttcctttggtacaaatgataaaaat
ttaatttacatgccccataatgaagtgttcaataaataagttaaaataatttatttacct
ccttaatcatattttttatgaatacctaataacacagtatcaatagaatcgactaaacct
tttatagcttcttctttactcaaaaatgatttcccaagttgcaaagtcgaataaccatga
agtacactcattattaagtttaatacttcacctgtattctttgtatttagattacaagaa
agaataagtttttctaataaggatttatattcatcaaagatttctaatgtttcattattt
ccatgccaagtagcccactgaattgtttcataaacaccaggattagaaattataaaatta
aagtatgctatacttatacactttatagctgtatctccaaaatttccaatagccgccttt
atcatttgactattcatctctctcattcctttatgagctacttcaagtaataaatcatct
agactttctatatgattgtacaaagatggtgtacgtattcctagcttttctgcaataact
tttaaagaaactttgttaagcccatctttattaactatatctgatgtagcttgtataact
atttctctactaacacgcatgattttccctctttcatttaaaattaattactttattagt
ttaactaatctaattagtttcgtcaattattgtaatttataaaattctttatactattat
aaaatcttgacagtttaattataatttaatataatactaattgaattagttttaatacta
atataattattattatattaaattctatattacaacattattttatagtttgattaattt
aacaatcactaatatatcaaactgaaaggagatttttatggaaaaaaaatatttcgaaat
tcatggagttccttcaatcctttggggaaatccttcaagtaaattatatatttacataca
tggacaatgtggcaataaagaggaggctgaagcttttgctaatattgcagttccacatga
gtgtcaagttttaagtgttgatttgcctgaacatggagaacgtaaaagagaaaaaaattc
atttaacccatggcatgttgttccagaattagtatctattatggaatatgcaaagtgcca
ctggaatcaaatttcgttatatgcaaatagcattggagcatggtttagtatgttaagctt
tgaaaaagagaacttaagagagtgtatttttgtatctccaattctagatatgcaacagct
catttcaaatatgatgctttgggcaaatgtatcagaagaacagcttaaacatgaactaat
tatcccaacttcatttgggcatactctttcatgggaatatctacaatatgtaaaacaaca
tcctatcactcaatggaatgtaccaacaaaaatattatatggtaaacatgatgaacttac
tgaaatcggtgttgtagagaaatttgtagaaaagtttaattgcaaccttactattataga
aaatggcaaacattggtttaacacaccacaagaattaaattcattatatgaatggttaaa
tactttagttaaataaaaaataattatattattaatatgattaaattatttataaatgtt
atttaattaattttattttagcattattaaaataactacataaagaataaattagttatt
attaaagaaattaaaagtatatagagtattaataattttttaataattagttattataga
aaaaagagggatataatattgtctccctctctttcttctgtaatattatataatttttat
ttatcactctcaataaattatagttatctacaaaatttaatctttaatacattattaata
tattgtgatattaatattacagtattaaataaaatctaataaaattaactataaaatatc
tattatataaatatccactcttatgtttgaaatccgtcatatagttttatccttcttatc
ttttatatcaataacttttttttataaaattgacaaaactaaagtaaaaaaccttattga
taatgaaacaaatgatactataagttctgatattatagtaattgcatataaatagacatc
ataaaaataatataatattgtcactataaaattaaatgtaaaaatctcaaatctaactaa
atacacatataggtattttttaagtttttaggtatttcttctgaaaatgatttattgatt
gataccaatttacataatctttttaatataaacaatgatacaatatatgggacagcacat
atgtatatagctacttatattacatattacagttggcatattcgtatttgtaatgcttat
accaattttaaaatacaccatcagtactaatggtattaaaataatctataataaagttaa
aattattccaattagtacaatattatttaatattttacaactcatattcttttttatata
aatttaccaccttatacattcttatttttagtgtatattacaatggttttatatattata
tcaataatttattattgaaattcaataaattgtatattataatcaataatatactttata
taaaggagatgatattttatgattacaaaattttttagtaatatattatcagtatttcta
tattttctattatcacttttaggagttgctggtataatattcttatgtatgatacctatg
tttttatatgattttagttctgacaaagtaatcgctttaattgcaagaatactatatttt
tctgacta