Block details | |
---|---|
fasta | C_difficile_CD00108_1A_020476.fasta |
contig | u00000crpx_c_020476 |
start | 2144173 |
length | 13026 |
strand | + |
type | core |
seq | gaatttacactcgatgtacgctcttgttcacaagaaattcttgataattctgtagaaaag atatttaatgaaatatcacatatatgtgaaaatagaaaacttaattatacaagtgaactt gcttttgaaaatgttcctgtaccatgttctaataaaataacaaaaatcatagaaaaaagt tttatagatttaaatcttaatcctttttatatttatagtggtgctggccatgatgctcag gaaatggataatataactgatattggtatggtatttataagatgcgctgggggcgtaagt cataatcctaatgaaagtgtctctgtagatgacttggatactgctgtaaaaatattttta aaaatactagataatcttgatttaaaataattcttatataagaaagtatattaaaatata taatctaaaaaatcactttatatttatattatataagtgtacaatataatctattataaa atataattttatgcttttatagatttttattttatacataaatatatttatatataaagg agataatttttatgaatgaaaaattaattggtattttggctggaatgggtccaaggtcaa cagccccttttgttgatttaattattgatgagtgtcaatctcaatatggagcaaaatatg atgatgaatttccaaagatgatgatatattcattacctaccccattttatattgaccgtc caataaatcatgaccttatgaaagaaactataattgatggattacaaaagcttgaatcaa ctggtgtaaattttattgcaatgccatgcaattcagcacatatatactttaaagaattaa aagagtctattaatataccaatattaaatattgtagaagaaacagttaaaaaattaccta ctatctcacaaaaagtaactcttttttcgactagttcaacttttgagtctacaatttacc agaatggtataatacataatggacatgaatttatatttaaagatgaatggcaaataaaat taaacaatcttattcaaaatataaaaatggataaagaaaatccacacaatattgatattt ggaataaacttattgaagatgttaaaaatgaatctatagaaaatatagtaattgcttgta ctgatttaaatgtagttttagaaaaatcatatccttcaataaatattgttgattcatcaa aatgcttggctgaatcagttgtcaataaatatctaaaattagttaaataaatttttcata cactatattataaaaaatatatgttataagtttattttaaatagtatagacttataacat atatcatagtttcttgacaatatagaaattaaccatgtatttcattatattaataaaaag gataccaaaaatggtatccttcataaatatttatatgtttatttataaaaataatcatat atttattactttactacacctaaacaatattattcaagtgtattcatagagttagaaaat tcttgtcctgctgtaacaagattagataacaatacatcagctactgcatcatttactgaa cttattatccatttattatcctttttagaacattcaaactctacattttttgtaacataa gtctctttaacgcttttttgtttttctttcataattgatactaacatttcagttgttttc tcatcagttaagtcttgtcctgaaaaactcataccaatcatctttgtaaatgcctcagct actatttcttgaagtaatggtgttgaatctataaatttacattctactttgattgtagcc ttatcacctttaacctcgctgtcttttattgtatatgtgattttagatgcattctgtttt agataatctaaaacatattgggcatttgggtcttttgtatctaattcctttaatatatcc ttatatttttcgtcattattttccattaccttattcatgccttcaaagtcaaactttttc gcactgttaaaaaaactatcaattgtatcttctggttttgcacttgaacatgctgttaaa gatattgctaataaaaaagttgttaaagctaatatgatttttttcatatctcaaatcctc cctcttaatttgttgatacataagttattttaacatataatgagagtttttgaataatat atttaaaatattttataaattttcattaaagtaaagtctatattaaaacatatctatatt aaattattgttcatatttacatcagtcatagtagaaaccataacagcttttattgtatgc attctattttcagcttcttcaaatacctttgaatattttgaattaaatacctcgtttgta acctctaattctgataatccgaacttttcataaatctcctgagcaaccttagtttctaaa tcatgaaatgctggaagacagtgtaaaaatataacattttcattttcagttttctttatc atatccatatttacttgataatctttaagttgatttattcttgcttcatattgctcctct tctcccatagaaacccatacatctgtatatataacatctgcacctttaacatcatcaata ttttcagtcaacattatatctcctttggatttcttggctatttccttcatttccttaacc aattcttcatttggccaaagttccttaggtgctagtgctacgaaatgtattcccatttta gcacatcctatcatcagtgagttccccatattatttctagcatcaccaacatatacaaat ttaactttattcaaatctttatctacattttcaattactgttaaaaaatctgccagtatt tgtgttggatgatattcatctgtaagtccattccaaacaggtacaccagaatattttgct agactttcaactgtttcttgtttaaagcctctaaattctattccatcatagaatcttcct agaacttttgctgtatctgatacagactcttttttacccatatgacaatcatttggacct agataagttacatgtgctccttcatcatgagctgctacttcaaatgaacatctagttctt gttgatgttttctcaaataataaagctatattttttccttgtagcaaatcgccttttata ccaacttttttcttagtttttaaataacttgataaagttaataaatatctaatctcttct tttgtaaaatcctttaatgtcaaaaaactcttaccttttaaacttatattattcatatta attcgccccttcttataaactttttaaattcaattaaacttgttagcactttactttttt atttacttctaatttttatctttaatcaactattttttgaatatttagttaatttctagt aatatatcttttaggatttcaagagcctcatctatttccttataactgattgttaatggt ggtaaaaatctcaatacattttttccagcagtcaaaataagcaatcctttttttctagct ttctcttctataatactagattcaatattagtttcaattcctatcattagaccaatacct tttgtctttaatataactttgttattaaaactttcaatagattttcttatataatttcct ttttctaatacttcattataaaagccatctttagatatctcatctaatacaactgaagct gccaccatagctaataaattacctccaaaagttgtaccttggtctccttttcctagtact tttgaaagttttttatttaccaatactcctcctactggtattcctgctcccaaccctttt gctacggtaactatatctggttttacatcaaaatattcatagccaaaaagtttaccagtt cttcctataccgcattggacttcatcaaaaatcactacaatatccttttcttgacatatt tttactatttccaaaacataatctttttcaagaacattaactccaccttcgccttgaatc gcttcaagaattattgcacaaactgtggaatcaagattattttttaaatcttcaatatta tttctttctatatatttaaaaccttcgggaagaggataaaaatacttatggtatttgtcc ataccagttgccattaaagacatcattgttctaccatgaaaagagtcttttaaacttatg atagttcctctaccattaccatatttgtcactactatactttcttgctattttgaatgct gtttcatttgcttctgttccagaattacaaaaatatactttagccattccacttgaatta attattttctctcctgaatacaacactggctcattaaaatataaatttgaagtatgtaat aatttatctacttgctcttttagagcattctttaaattactattactatacccaagagaa gatactccatatccacttgtaaaatctatatatttattgccattagtatcaaaaaaacaa cttccttcaccataatctatgacaaaattgggttggttatatgtatctataaaatattca ttccattttgaaattgtattgtcgttattcattcttattctcccctcttaaacttataat tttattcagtttcttttcttattaatgtacctattccactatcagtaaatagctctgtta ttatagaatgtggaactcttccatccaaaatatgtaccctatttactccgttatttaagg catctacgcatccctctattttaggtatcatacctccagtaattataccttcttcaaata atttatcaacatcctctaatataacttctgttattaatgatttttcttcatctggctctc ttaacaaaccagggacatctgtaagaagtatcaatttatctgcatttaactctttagcta tagcagaagctgctgtgtcaccatttatattataagtctctccatcatctccaacaccta tagttgcaattactgaaatataacctgactttagacaagattctataagctcaacattta cttttttgatttctcctacaaatccaagttcataatttttatatgggtcacataaaatca tattattatctattccacaaagccctactgcttttccaccttttgtatgtattttattta ctaagtctttattaacctttccagcaagtaccatttttacaatttccatggtctcttcat ctgtatatctaagaccatttacaaatttactttctatatccacttttgctagcatcttat tgatttctgcccctccaccatgtactaaaactatattgattccaacataactcattaaca caaggtcttccataacagattcttttagaccatcttttttcattgcacttccaccatact taactacaatagtctttccctgatgtttttctatatatggtaaagcttctataagtgtat ttgctttttctatattaatcattaaagtatatcctcctaatttctataacttccatttat tcttacataatcatagcttaaatcacatccccatgcatttcctctggcattgcccatatt taaatctactaatatacttatttcgtcatcttcaaggattttttttgctttttcctcatt aaaatctaatccatttccatttttacatacttcaatatatcctttcatactctcaaaaat aatatcaactttttccatatctatttcttcacctgcataacctaaagcacacagtattct accccaatttgcgtcagctccaaatacagctgtctttactaatgaagaagatataactgt ttttgctaattttactgcatgttcttcacttaatgctccatttatatagcattcaattag ttttgtacatccttctccatcttttgcaacaagtttagcaagttctatacagacatatgt aagtgcactcaaaaatacttgataatgttcatcttttttgtttattctatcattttttgc ttttccatttgctagaatcattaccatatcattagtacttgtatctccatctacactaac tctattaaaacttttgtcaacagcaatttttaaagcttcttttagcaaaactccatcaat atttgcatctgtagttataaatcctaacgttgttgccatattaggatgtatcatgccaga accttttgccatacctccaatagttatttttttatctccatacattattgctactgctat ttctttttttataatatcagttgtcataatagcttctcttgctccaatatgaccttgttt acttagattattcactaattcatccatattttcttctattaaatctatatttaatggctt tcctataacacctgtagatgcaaccaaaacatcactttctttaatatttaatttatcact ggtgaatttagccattttataagcatttataagtccttcttttccattaaaggtattagc attagcactatttactatgatagcttgtgcttttccatttttaatgtgttcctgtgtaac ataaacaggattgccctttactttattttgagttactactgctgctgcatcacataaaac atctgaataaaccaaagctaaatctcttttttctttattttttctcaagccacagtgaat ccctgaagcaaaaaatccttctgaaactgtaactccaccctttataatctccatatttat cctcctaattatatgagtttagtattttttatttctaaaatgatggtgcaatatttttta aacctgtattttcttcaataccaaatattatattcatgttttgtatagcttgacctgctg ctcccttaatcatattatctatagctgaacagattatcaatgtatctccattttcatgta atgatattacacatttatttgagaatctaacattctttaaagaagctaccttatctaatg gaagaatttctataaattctttaaattcataataatcagttaacttcctatgtatatcat ttatagaaatattatcttcttttgtacaatatatagttgataagattcccctatttactg ggattaagtttggtgtaaaaactacacttactttttctttgcaggattcacttaaatttt gttctatttctggagtatgtctgtgcttccctattttatatgcagtgatattttcattaa cctccgtaaagtgactactaatcgataattctctaccagcacctgtaagacctgatttag aatcaattattatattattattttttatcaatttagaacttagtaatggcatcaatggta aagaaatactagttggataacatccaggatttgcaattatatctgcatcttttatatctt ctttgtatatttcacttaatccatatacagcttttttatgtaagattttatctataaaag atactccataccatttactatatacttcttcatcttttattctaaagtcagcacctaaat ctataactttctttttcgatttaattgcctttattacaaacttttcactaactccatgtg gaagggctgtaaatacaacatcacacatatctataactttttcattttctatacatatca tgttatttttatatcctatacttggatatatatcaactatatcttttccaacatacgaat ttgaacctatcgctgtcacttcgactttatcatgattcattaataatctaatcaactctg ccccgacatatccagttgcaccaataataccaacttttattttattcattttgttccctc catttttatattcaaatagtcttaaaatcctatctttccactttactatatgataatcat ttgataatacgtagattaaaatactctaattaaaacaaaaaaccccttagcattataaat actaagaggcgattttccgcggtaccactcttattggtaaaattacaataatcattaaaa ctcaaattaaaaagtatctacaaaatgtacatttaaaattaaaaaagcctcttggtcaaa gaccaagagacgaatatacacccgcgttaccactctaattgataagataatcttacccac tctaatctcttaaggcgagattcaccaattaccatactattacttctggtaatctcctcc aaagctctattcacaataaaattcgttactaggcttccaccattcccagctctctatcaa ctagctttatgctactctctttttcacaggatttcaatttattttcttattgttttatat gatagtttatttttttaactttgtcaatataatttttaaatttttggaaatattttctat atggttaatttccagcattttgtatctaaattgcgatataatttttatatttcattcgtc aatttaaaaaacatccaaaatatattaaattataaaataatatattttcaaaatacaata tttacatctctttttagttaaattttttaatgttggtatctaaaaatttctcaatctttt tctcagaaagtatctcgttggttacaaattcaccattaaaaaaaagactgtatgtagtaa atggtgcaggagcattttgtgcttcttttgctgtttcgaattttataagatttacatcaa tacctctagaatttgcaatttttttcaaaataggagcatatttttccgtatgtggacact gattactgtaatataaaactataccgttctcatttaattttcttttttttacacaattct taaaatatggaataggagcattatcagtaaaaggaaaatataatagctcataatttggtt ctgatgtatctgctaaacaaaagtccttatattttagatatttagcatcagataaaaaag gcatttttttactagacgaaagcacaactaatccatatttaccttttgattttgcatcat caacacactcttgtagcaatagattagaatatccttgacccttaaattttccagatatcc aaaaacagttaataaatatataattgtccgcagtaataggacaccatgcattttctgctg gaatatattctataaaagctttacctcttacatcaaatcgtttaaagactagacctttat caaaattatttttcatccaagcttttttagaaaaaacacaattttctccttttttttcag aaattgaacaacatatatgttcattgtcaatattatttatatttatatcaataatctgca tacttatctccttttctaattgcataataatttttaaatatattctatatatttttatct taatattttgaatacaacaacatcatgtcatatatatttttattttacataatattattt taagattatctgaattattaaattgtatatataattaaatacattctatggtctaactac actataatataaattatatattatcataatattctaaatttataaaacaaattgtattga attgaatttatttaagatatataattataattaaaataataataaaggtgttgtttataa tgttcaaagaatacttaataagagaattaaaagaagatgatattaaaaatgcattagact taatctggaacgtatttgaagaatttgaatctccagattattgtgatgaaggaattacga catttcatcaatttatagaatataactctattattgaaaaaatcaaagaaaaaactctct tcttttggggttgttttgactctaaaaaacttattggagtcttagctattagaaatttaa atcatatatgtatgttatttgtagataaaaactatcataaacatggtgttgcaaaaaaat taatgactacaggcatacaatactgtatttgtaataaatttaatttaactgaaataactg taaattcatcaccttatgctgttgaagtttatcataaattaggatttaaagatactgctg ttgagcaaattgttgacggtatacgttttacacctatgaaattgttaatataataaatta aataaaaagcaaagtctcttaaatattttatagttactttgcttttaaaccaagatttaa aataatactatcttttttgttttttaataatatactttaaaatccttactaatatgaact ataatttattttttgatatcctttttgattaacatataaattaattcaattattaaacat aaactatgttgtttctctttatatctcttctttgtaaacaatattgggcatttgaaaata aatattcttaaaatatactgttctcctgttgattttcctttggtacaaatgataaaaatt taatttacatgccccataatgaagtgttcaataaataagttaaaataatttatttacctc cttaatcatattttttatgaatacctaataacacagtatcaatagaatcggctaaacctt ttatagcttcttctttactcaaaagtgatttcccaagttgcaaagtcgaataaccatgaa gtacactcattattaagtttaatacttcacctgtattctttgtatttagattacaagaaa gaataagtttttctaataaggatttatattcatcaaagatttctaatgtttcattatttc catgccaagtagcccactgaattgtttcataaacaccaggattagaaattataaaattaa agtatgctatacttatacactttatagctgtatctccaaaatttccaatagtcgccttta tcatttgactattcatctctctcattcctttatgagctacttcaagtaataaatcatcta gactttctatatgattgtacaaagatggtgtacgtattcctagcttttctgcaataactt ttaaagaaactttgttaagcccatctttattaactatatctgatgtagcttgtataacta tttctctactaacacgcatgattttccctctttcatttaaaattaattactttattagtt tagctaatctaattagtttcgtcaattattgtaatttataaaattctttatactattata aaatcttgacagtttaattataatttaatataatactaattgaattagttttaatactaa tataattagtattatattaaattctatattacaacattattttatagtttgattaattta acaatcactaatatatcaaactgaaaggagatttttatggaaaaaaaatatttcgaaatt catggagttccttcaatcctttggggaaatccttcaagtaaattatatatttacatacat ggacaatgtggcaataaagaggaggctgaagcttttgctaatattgcagttccacatgag tgtcaagttttaagtgttgatttgcctgaacatggagaacgtaaaagagaaaaaaattca tttaacccatggcatgttgttccagaattagtatctattatggaatatgcaaagtgccac tggaatcaaatttcgttatatgcaaatagcattggagcatggtttagtatgttaagcttt gaaaaagagaacttaagagagtgtatttttgtatctccaattctagatatgcaacagctc atttcaaatatgatgctttgggcaaatgtatcagaagaacagcttaaacatgaactaatt atcccaacttcatttgggcatactctttcatgggaatatctacaatatgtaaaacaacat cctatcactcaatggaatgtaccaacaaaaatattatatggtaaacatgatgaacttact gaaatcggtgttgtagagaaatttgtagaaaagtttaattgcaaccttactattatagaa aatggcaaacattggtttaacacaccacaagaattaaattcattatatgaatggttaaat actttagttaaataaaaaataattatattattaatatgattaaattatttataaatgtta tttaattaattttattttagcattattaaaataactacataaagaataaattagttatta ttaaagaaattaaaagtatatagagtattaataattttttaataattagttattatagaa aaaagagggatataatattgtctccctctctttcttctgtaatattatataatttttatt tatcactctcaataaattatagttatctacaaaattcaatctttaatacactattaatat attgtgatattaatattacagtattaaataaaatctaataaaattaactataaaatatct attatataaatatccactcttatgtttgaaatccgtcatatagttttatccttcttatct tttatatcaataactttttttaataaaattgacaaaactaaagtaaaaaaccttattgat aatgaaacaaatgatactataagttctgatattatagtaattgcatataaatagacatca taaaaataatataatattgtcactataaaattaaatgtaaaaatctcaaatctaactaaa tacacatataggtattttttaagtttttaggtatttcttctgaaaatgatttattgattg ataccaatttacataatctttttaatataaacaatgatacaatatatgggacagcacata tgtatatagctacttatattacatattacagttggcatattcgtatttgtaatgcttata ccaattttaaaatacaccatcagtactaatggtattaaaataatctataataaagttaaa attattccaattagtacaatattatttaatattttacaactcatattcttttttatataa atttaccaccttatacattcttatttttagtgtatattacaatggttttatatattatat caataatttattattgaaattcaataaattgtatattataatcaataatatactttatat aaaggagatgatattttatgattacaaaattttttagtaatatattatcagtatttctat attttctattatcacttttaggagttgctggtataatattcttatgtatgatacctatgt ttttatatgattttagttctgacaaagtaatcgctttaattgcaagaatactatattttt ctgacta |