Block details
fasta C_difficile_CD00076_1A_020700.fasta
contig u00000crpx_c_020700
start 2144160
length 13026
strand +
type core
seq gaatttacactcgatgtacgctcttgttcacaagaaattcttgataattctgtagaaaag
atatttaatgaaatatcacatatatgtgaaaatagaaaacttaattatacaagtgaactt
gcttttgaaaatgttcctgtaccatgttctaataaaataacaaaaatcatagaaaaaagt
tttatagatttaaatcttaatcctttttatatttatagtggtgctggccatgatgctcag
gaaatggataatataactgatattggtatggtatttataagatgcgctgggggcgtaagt
cataatcctaatgaaagtgtctctgtagatgacttggatactgctgtaaaaatattttta
aaaatactagataatcttgatttaaaataattcttatataagaaagtatattaaaatata
taatctaaaaaatcactttatatttatattatataagtgtacaatataatctattataaa
atataattttatgcttttatagatttttattttatacataaatatatttatatataaagg
agataatttttatgaatgaaaaattaattggtattttggctggaatgggtccaaggtcaa
cagccccttttgttgatttaattattgatgagtgtcaatctcaatatggagcaaaatatg
atgatgaatttccaaagatgatgatatattcattacctaccccattttatattgaccgtc
caataaatcatgaccttatgaaagaaactataattgatggattacaaaagcttgaatcaa
ctggtgtaaattttattgcaatgccatgcaattcagcacatatatactttaaagaattaa
aagagtctattaatataccaatattaaatattgtagaagaaacagttaaaaaattaccta
ctatctcacaaaaagtaactcttttttcgactagttcaacttttgagtctacaatttacc
agaatggtataatacataatggacatgaatttatatttaaagatgaatggcaaataaaat
taaacaatcttattcaaaatataaaaatggataaagaaaatccacacaatattgatattt
ggaataaacttattgaagatgttaaaaatgaatctatagaaaatatagtaattgcttgta
ctgatttaaatgtagttttagaaaaatcatatccttcaataaatattgttgattcatcaa
aatgcttggctgaatcagttgtcaataaatatctaaaattagttaaataaatttttcata
cactatattataaaaaatatatgttataagtttattttaaatagtatagacttataacat
atatcatagtttcttgacaatatagaaattaaccatgtatttcattatattaataaaaag
gataccaaaaatggtatccttcataaatatttatatgtttatttataaaaataatcatat
atttattactttactacacctaaacaatattattcaagtgtattcatagagttagaaaat
tcttgtcctgctgtaacaagattagataacaatacatcagctactgcatcatttactgaa
cttattatccatttattatcctttttagaacattcaaactctacattttttgtaacataa
gtctctttaacgcttttttgtttttctttcataattgatactaacatttcagttgttttc
tcatcagttaagtcttgtcctgaaaaactcataccaatcatctttgtaaatgcctcagct
actatttcttgaagtaatggtgttgaatctataaatttacattctactttgattgtagcc
ttatcacctttaacctcgctgtcttttattgtatatgtgattttagatgcattctgtttt
agataatctaaaacatattgggcatttgggtcttttgtatctaattcctttaatatatcc
ttatatttttcgtcattattttccattaccttattcatgccttcaaagtcaaactttttc
gcactgttaaaaaaactatcaattgtatcttctggttttgcacttgaacatgctgttaaa
gatattgctaataaaaaagttgttaaagctaatatgatttttttcatatctcaaatcctc
cctcttaatttgttgatacataagttattttaacatataatgagagtttttgaataatat
atttaaaatattttataaattttcattaaagtaaagtctatattaaaacatatctatatt
aaattattgttcatatttacatcagtcatagtagaaaccataacagcttttattgtatgc
attctattttcagcttcttcaaatacctttgaatattttgaattaaatacctcgtttgta
acctctaattctgataatccgaacttttcataaatctcctgagcaaccttagtttctaaa
tcatgaaatgctggaagacagtgtaaaaatataacattttcattttcagttttctttatc
atatccatatttacttgataatctttaagttgatttattcttgcttcatattgctcctct
tctcccatagaaacccatacatctgtatatataacatctgcacctttaacatcatcaata
ttttcagtcaacattatatctcctttggatttcttggctatttccttcatttccttaacc
aattcttcatttggccaaagttccttaggtgctagtgctacgaaatgtattcccatttta
gcacatcctatcatcagtgagttccccatattatttctagcatcaccaacatatacaaat
ttaactttattcaaatctttatctacattttcaattactgttaaaaaatctgccagtatt
tgtgttggatgatattcatctgtaagtccattccaaacaggtacaccagaatattttgct
agactttcaactgtttcttgtttaaagcctctaaattctattccatcatagaatcttcct
agaacttttgctgtatctgatacagactcttttttacccatatgacaatcatttggacct
agataagttacatgtgctccttcatcatgagctgctacttcaaatgaacatctagttctt
gttgatgttttctcaaataataaagctatattttttccttgtagcaaatcgccttttata
ccaacttttttcttagtttttaaataacttgataaagttaataaatatctaatctcttct
tttgtaaaatcctttaatgtcaaaaaactcttaccttttaaacttatattattcatatta
attcgccccttcttataaactttttaaattcaattaaacttgttagcactttactttttt
atttacttctaatttttatctttaatcaactattttttgaatatttagttaatttctagt
aatatatcttttaggatttcaagagcctcatctatttccttataactgattgttaatggt
ggtaaaaatctcaatacattttttccagcagtcaaaataagcaatcctttttttctagct
ttctcttctataatactagattcaatattagtttcaattcctatcattagaccaatacct
tttgtctttaatataactttgttattaaaactttcaatagattttcttatataatttcct
ttttctaatacttcattataaaagccatctttagatatctcatctaatacaactgaagct
gccaccatagctaataaattacctccaaaagttgtaccttggtctccttttcctagtact
tttgaaagttttttatttaccaatactcctcctactggtattcctgctcccaaccctttt
gctacggtaactatatctggttttacatcaaaatattcatagccaaaaagtttaccagtt
cttcctataccgcattggacttcatcaaaaatcactacaatatccttttcttgacatatt
tttactatttccaaaacataatctttttcaagaacattaactccaccttcgccttgaatc
gcttcaagaattattgcacaaactgtggaatcaagattattttttaaatcttcaatatta
tttctttctatatatttaaaaccttcgggaagaggataaaaatacttatggtatttgtcc
ataccagttgccattaaagacatcattgttctaccatgaaaagagtcttttaaacttatg
atagttcctctaccattaccatatttgtcactactatactttcttgctattttgaatgct
gtttcatttgcttctgttccagaattacaaaaatatactttagccattccacttgaatta
attattttctctcctgaatacaacactggctcattaaaatataaatttgaagtatgtaat
aatttatctacttgctcttttagagcattctttaaattactattactatacccaagagaa
gatactccatatccacttgtaaaatctatatatttattgccattagtatcaaaaaaacaa
cttccttcaccataatctatgacaaaattgggttggttatatgtatctataaaatattca
ttccattttgaaattgtattgtcgttattcattcttattctcccctcttaaacttataat
tttattcagtttcttttcttattaatgtacctattccactatcagtaaatagctctgtta
ttatagaatgtggaactcttccatccaaaatatgtaccctatttactccgttatttaagg
catctacgcatccctctattttaggtatcatacctccagtaattataccttcttcaaata
atttatcaacatcctctaatataacttctgttattaatgatttttcttcatctggctctc
ttaacaaaccagggacatctgtaagaagtatcaatttatctgcatttaactctttagcta
tagcagaagctgctgtgtcaccatttatattataagtctctccatcatctccaacaccta
tagttgcaattactgaaatataacctgactttagacaagattctataagctcaacattta
cttttttgatttctcctacaaatccaagttcataatttttatatgggtcacataaaatca
tattattatctattccacaaagccctactgcttttccaccttttgtatgtattttattta
ctaagtctttattaacctttccagcaagtaccatttttacaatttccatggtctcttcat
ctgtatatctaagaccatttacaaatttactttctatatccacttttgctagcatcttat
tgatttctgcccctccaccatgtactaaaactatattgattccaacataactcattaaca
caaggtcttccataacagattcttttagaccatcttttttcattgcacttccaccatact
taactacaatagtctttccctgatgtttttctatatatggtaaagcttctataagtgtat
ttgctttttctatattaatcattaaagtatatcctcctaatttctataacttccatttat
tcttacataatcatagcttaaatcacatccccatgcatttcctctggcattgcccatatt
taaatctactaatatacttatttcgtcatcttcaaggattttttttgctttttcctcatt
aaaatctaatccatttccatttttacatacttcaatatatcctttcatactctcaaaaat
aatatcaactttttccatatctatttcttcacctgcataacctaaagcacacagtattct
accccaatttgcgtcagctccaaatacagctgtctttactaatgaagaagatataactgt
ttttgctaattttactgcatgttcttcacttaatgctccatttatatagcattcaattag
ttttgtacatccttctccatcttttgcaacaagtttagcaagttctatacagacatatgt
aagtgcactcaaaaatacttgataatgttcatcttttttgtttattctatcattttttgc
ttttccatttgctagaatcattaccatatcattagtacttgtatctccatctacactaac
tctattaaaacttttgtcaacagcaatttttaaagcttcttttagcaaaactccatcaat
atttgcatctgtagttataaatcctaacgttgttgccatattaggatgtatcatgccaga
accttttgccatacctccaatagttatttttttatctccatacattattgctactgctat
ttctttttttataatatcagttgtcataatagcttctcttgctccaatatgaccttgttt
acttagattattcactaattcatccatattttcttctattaaatctatatttaatggctt
tcctataacacctgtagatgcaaccaaaacatcactttctttaatatttaatttatcact
ggtgaatttagccattttataagcatttataagtccttcttttccattaaaggtattagc
attagcactatttactatgatagcttgtgcttttccatttttaatgtgttcctgtgtaac
ataaacaggattgccctttactttattttgagttactactgctgctgcatcacataaaac
atctgaataaaccaaagctaaatctcttttttctttattttttctcaagccacagtgaat
ccctgaagcaaaaaatccttctgaaactgtaactccaccctttataatctccatatttat
cctcctaattatatgagtttagtattttttatttctaaaatgatggtgcaatatttttta
aacctgtattttcttcaataccaaatattatattcatgttttgtatagcttgacctgctg
ctcccttaatcatattatctatagctgaacagattatcaatgtatctccattttcatgta
atgatattacacatttatttgagaatctaacattctttaaagaagctaccttatctaatg
gaagaatttctataaattctttaaattcataataatcagttaatttcctatgtatatcat
ttatagaaatattatcttcttttgtacaatatatagttgataagattcccctatttactg
ggattaagtttggtgtaaaaactacacttactttttctttgcaggattcacttaaatttt
gttctatttctggagtatgtctgtgcttccctattttatatgcagtgatattttcattaa
cctccgtaaagtgactactaatcgataattctctaccagcacctgtaagacctgatttag
aatcaattattatattattattttttatcaatttagaacttagtaatggcatcaatggta
aagaaatactagttggataacatccaggatttgcaattatatctgcatcttttatatctt
ctttgtatatttcacttaatccatatacagcttttttatgtaagattttatctataaaag
atactccataccatttactatatacttcttcatcttttattctaaagtcagcacctaaat
ctataactttctttttcgatttaattgcctttattacaaacttttcactaactccatgtg
gaagggctgtaaatacaacatcacacatatctataactttttcattttctatacatatca
tgttatttttatatcctatacttggatatatatcaactatatcttttccaacatacgaat
ttgaacctatcgctgtcacttcgactttatcatgattcattaataatctaatcaactctg
ccccgacatatccagttgcaccaataataccaacttttattttattcattttgttccctc
catttttatattcaaatagtcttaaaatcctatctttccactttactatatgataatcat
ttgataatacgtagattaaaatactctaattaaaacaaaaaaccccttagcattataaat
actaagaggcgattttccgcggtaccactcttattggtaaaattacaataatcattaaaa
ctcaaattaaaaagtatctacaaaatgtacatttaaaattaaaaaagcctcttggtcaaa
gaccaagagacgaatatacacccgcgttaccactctaattgataagataatcttacccac
tctaatctcttaaggcgagattcaccaattaccatactattacttctggtaatctcctcc
aaagctctattcacaataaaattcgttactaggcttccaccattcccagctctctatcaa
ctagctttatgctactctctttttcacaggatttcaatttattttcttattgttttatat
gatagtttatttttttaactttgtcaatataatttttaaatttttggaaatattttctat
atggttaatttccagcattttgtatctaaattgcgatataatttttatatttcattcgtc
aatttaaaaaacatccaaaatatattaaattataaaataatatattttcaaaatacaata
tttacatctctttttagttaaattttttaatgttggtatctaaaaatttctcaatctttt
tctcagaaagtatctcgttggttacaaattcaccattaaaaaaaagactgtatgtagtaa
atggtgcaggagcattttgtgcttcttttgctgtttcgaattttataagatttacatcaa
tacctctagaatttgcaatttttttcaaaataggagcatatttttccgtatgtggacact
gattactgtaatataaaactataccgttctcatttaattttcttttttttacacaattct
taaaatatggaataggagcattatcagtaaaaggaaaatataatagctcataatttggtt
ctgatgtatctgctaaacaaaagtccttatattttagatatttagcatcagataaaaaag
gcatttttttactagacgaaagcacaactaatccatatttaccttttgattttgcatcat
caacacactcttgtagcaatagattagaatatccttgacccttaaattttccagatatcc
aaaaacagttaataaatatataattgtccgcagtaataggacaccatgcattttctgctg
gaatatattctataaaagctttacctcttacatcaaatcgtttaaagactagacctttat
caaaattatttttcatccaagcttttttagaaaaaacacaattttctccttttttttcag
aaattgaacaacatatatgttcattgtcaatattatttatatttatatcaataatctgca
tacttatctccttttctaattgcataataatttttaaatatattctatatatttttatct
taatattttgaatacaacaacatcatgtcatatatatttttattttacataatattattt
taagattatctgaattattaaattgtatatataattaaatacattctatggtctaactac
actataatataaattatatattatcataatattctaaatttataaaacaaattgtattga
attgaatttatttaagatatataattataattaaaataataataaaggtgttgtttataa
tgttcaaagaatacttaataagagaattaaaagaagatgatattaaaaatgcattagact
taatctggaacgtatttgaagaatttgaatctccagattattgtgatgaaggaattacga
catttcatcaatttatagaatataactctattattgaaaaaatcaaagaaaaaactctct
tcttttggggttgttttgactctaaaaaacttattggagtcttagctattagaaatttaa
atcatatatgtatgttatttgtagataaaaactatcataaacatggtgttgcaaaaaaat
taatgactacaggcatacaatactgtatttgtaataaatttaatttaactgaaataactg
taaattcatcaccttatgctgttgaagtttatcataaattaggatttaaagatactgctg
ttgagcaaattgttgacggtatacgttttacacctatgaaattgttaatataataaatta
aataaaaagcaaagtctcttaaatattttatagttactttgcttttaaaccaagatttaa
aataatactatcttttttgttttttaataatatactttaaaatccttactaatatgaact
ataatttattttttgatatcctttttgattaacatataaattaattcaattattaaacat
aaactatgttgtttctctttatatctcttctttgtaaacaatattgggcatttgaaaata
aatattcttaaaatatactgttctcctgttgattttcctttggtacaaatgataaaaatt
taatttacatgccccataatgaagtgttcaataaataagttaaaataatttatttacctc
cttaatcatattttttatgaatacctaataacacagtatcaatagaatcggctaaacctt
ttatagcttcttctttactcaaaagtgatttcccaagttgcaaagtcgaataaccatgaa
gtacactcattattaagtttaatacttcacctgtattctttgtatttagattacaagaaa
gaataagtttttctaataaggatttatattcatcaaagatttctaatgtttcattatttc
catgccaagtagcccactgaattgtttcataaacaccaggattagaaattataaaattaa
agtatgctatacttatacactttatagctgtatctccaaaatttccaatagtcgccttta
tcatttgactattcatctctctcattcctttatgagctacttcaagtaataaatcatcta
gactttctatatgattgtacaaagatggtgtacgtattcctagcttttctgcaataactt
ttaaagaaactttgttaagcccatctttattaactatatctgatgtagcttgtataacta
tttctctactaacacgcatgattttccctctttcatttaaaattaattactttattagtt
tagctaatctaattagtttcgtcaattattgtaatttataaaattctttatactattata
aaatcttgacagtttaattataatttaatataatactaattgaattagttttaatactaa
tataattagtattatattaaattctatattacaacattattttatagtttgattaattta
acaatcactaatatatcaaactgaaaggagatttttatggaaaaaaaatatttcgaaatt
catggagttccttcaatcctttggggaaatccttcaagtaaattatatatttacatacat
ggacaatgtggcaataaagaggaggctgaagcttttgctaatattgcagttccacatgag
tgtcaagttttaagtgttgatttgcctgaacatggagaacgtaaaagagaaaaaaattca
tttaacccatggcatgttgttccagaattagtatctattatggaatatgcaaagtgccac
tggaatcaaatttcgttatatgcaaatagcattggagcatggtttagtatgttaagcttt
gaaaaagagaacttaagagagtgtatttttgtatctccaattctagatatgcaacagctc
atttcaaatatgatgctttgggcaaatgtatcagaagaacagcttaaacatgaactaatt
atcccaacttcatttgggcatactctttcatgggaatatctacaatatgtaaaacaacat
cctatcactcaatggaatgtaccaacaaaaatattatatggtaaacatgatgaacttact
gaaatcggtgttgtagagaaatttgtagaaaagtttaattgcaaccttactattatagaa
aatggcaaacattggtttaacacaccacaagaattaaattcattatatgaatggttaaat
actttagttaaataaaaaataattatattattaatatgattaaattatttataaatgtta
tttaattaattttattttagcattattaaaataactacataaagaataaattagttatta
ttaaagaaattaaaagtatatagagtattaataattttttaataattagttattatagaa
aaaagagggatataatattgtctccctctctttcttctgtaatattatataatttttatt
tatcactctcaataaattatagttatctacaaaattcaatctttaatacactattaatat
attgtgatattaatattacagtattaaataaaatctaataaaattaactataaaatatct
attatataaatatccactcttatgtttgaaatccgtcatatagttttatccttcttatct
tttatatcaataactttttttaataaaattgacaaaactaaagtaaaaaaccttattgat
aatgaaacaaatgatactataagttctgatattatagtaattgcatataaatagacatca
taaaaataatataatattgtcactataaaattaaatgtaaaaatctcaaatctaactaaa
tacacatataggtattttttaagtttttaggtatttcttctgaaaatgatttattgattg
ataccaatttacataatctttttaatataaacaatgatacaatatatgggacagcacata
tgtatatagctacttatattacatattacagttggcatattcgtatttgtaatgcttata
ccaattttaaaatacaccatcagtactaatggtattaaaataatctataataaagttaaa
attattccaattagtacaatattatttaatattttacaactcatattcttttttatataa
atttaccaccttatacattcttatttttagtgtatattacaatggttttatatattatat
caataatttattattgaaattcaataaattgtatattataatcaataatatactttatat
aaaggagatgatattttatgattacaaaattttttagtaatatattatcagtatttctat
attttctattatcacttttaggagttgctggtataatattcttatgtatgatacctatgt
ttttatatgattttagttctgacaaagtaatcgctttaattgcaagaatactatattttt
ctgacta