Block details
fasta C_difficile_CD00003_1A_021026.fasta
contig u00000crpx_c_021026
start 2194831
length 15347
strand +
type core
seq gaatttacactcgatgtacgctcttgttcacaagaaattcttgataattctgtagaaaag
atatttaatgaaatatcacatatatgtgaaaatagaaaacttaattatacaagtgaactt
gcttttgaaaatgttcctgtaccatgttctaataaaataacaaaaatcatagaaaaaagt
tttatagatttaaatcttaatcctttttatatttatagtggtgctggccatgatgctcag
gaaatggataatataactgatattggtatggtatttataagatgtgctgggggcgtaagt
cataatcctaatgaaagtgtttctgtagatgacttggatactgctgtaaaaatattttta
aaaatactagataatcttgatttaaaataatttttatataagaaagtatattaaaatata
taatctaaaaaatcactttatatttatattatacaagtgtacaatataatctattataaa
atataattttatgcttttatagatttttattttatacataaatatatttatatataaagg
agataatttttatgaatgaaaaattaattggtattttggctggaatgggtccaaggtcaa
cagccccttttgttgatttaattattgatgagtgtcaatctcaatatggagcaaaatatg
atgatgaatttccaaagatgatgatatattcattacctaccccattttatattgaccgtc
caataaatcatgaacttatgaaagaaactataattgatggattacaaaagcttgaatcaa
ctggtgtaaattttattgcaatgccatgcaattcagcacatatatactttaaagaattaa
aagagtctattaatataccaatattaaatattgtagaagaaacagttaaaaaattaccta
ctatctcacaaaaagtaactcttttttcgactagttcaacttttgagtctacaatttacc
agaatggtataatacataatggacatgaatttatatttaaagatgaatggcaaataaaat
taaacaatcttattcaaaatataaaaatggataaagaaaatccacacaatattgatattt
ggaataaacttatcgaagatgttaaaaatgaatctatagaaaatatagtaattgcttgta
ctgatttaaatgtagttttagaaaaatcatatccttcaataaatattgttgattcatcaa
aatgcttggctgaatcagttgtcaataaatatctaaaattagttaaataaatttttcatg
cactatattataaaaaatatatgttataagtttattttaaatagtatagacttataacat
atatcatagtttcttgacaatatagaaattaaccatgtatttcattatattaataaaaag
gataccaaaaatggtatccttcataaatatttatatgtttatttataaaaataatcatat
atttattactttactacacctaaacaatattattcaagtgtattcatagagttagaaaat
tcttgtcctgctgtaacaagattagataacaatacatcagctactgcatcatttactgaa
cttattatccatttattatcctttttagaacattcaaactctacagtttttgtaacataa
gtctctttaacgcttttttgtttttctttcataattgatactaacatttcagttgttttc
tcatcagttaagtcttgtcctgaaaaactcataccaatcatctttgtaaatgcctcagct
actatttcttgaagtaatggtgttgaatctataaatttacattctactttgattgtagcc
ttatcacctttaacctcgctgtcttttattgtatacgtgattttagatgcattctgtttt
agataatctaaaacatattgggcatttgggtcttttgtatctaattcctttaatatatcc
ttatatttttcgtcattattttccattaccttattcatgccttcaaagtcaaactttttc
gcactgttaaaaaaactatcaattgtatcttctggttttgcacttgaacatgctgttaaa
gatattgctaataaaaaagttgttaaagctaatatgatttttttcatatctcaaatcctc
cctcttaatttgttgatacataagttattttaacatataatgagagtttttgaataatat
atttaaaatattttataaattttcattaaagtaaagtctatattaaaacatatctatatt
aaattattgttcatatttacatcagtcatagtagaaaccataacagcttttattgtatgc
attctattttcagcttcttcaaatacctttgaatattttgaattaaatacctcgtttgta
acctctaattctgataatccgaacttttcataaatcttctgagcaaccttagtttctaaa
tcatgaaatgctggaagacagtgtaaaaatataacattttcattttcagttttctttatc
atatccatatttacttgataatctttaagttgatttattcttgcttcatattgctcctct
tctcccatagaaacccatacatctgtatatataacatctgcacctttaacatcatcaata
ttttcagtcaacattatatctcctttggatttcttggctatttccttcatttccttaacc
aattcttcatttggccaaagttccttaggtgctagtgctacgaaatgtattcccatttta
gcacatcctatcatcagtgagtttcccatattatttctagcatcaccaacatatacaaat
ttaactttattcaaatctttatctacattttcaattactgttaaaaaatctgccagtatt
tgtgttggatgatattcatctgtaagtccattccaaacaggtacaccagaatattttgct
agactttcaactgtttcttgtttaaagcctctaaattctattccatcatagaatcttcct
agaacttttgctgtatctgatacagactcttttttacccatatgacaatcatttggacct
agataagttacatatgctccttcatcatgagctgctacttcaaatgaacatctagttctt
gttgatgttttctcaaataataaagctatattttttccttgtagcaaatcgccttttatg
ccaacttttttcttagtttttaaataacttgataaagttaataaatatctaatctcttct
tttgtaaaatcctttaatgtcaaaaaactcttaccttttaaacttatattattcatatta
attcgccccttcttataaacttcttaaattcaattaaacttgttagcactttactttttt
atttacttctaatttttatctttaattaactattttttgaatatttagttaatctctagt
aatatatcttttaggatttcaagagcctcatctatttccttataactgattgttaatggt
ggtaaaaatctcaatacattttttccagcagtcaaaataagcaatcctttttttctagct
ttctcttctataatactagattcaatattagtttcaattcctatcattagaccaatacct
tttgtctttaatacaactttattattaaaactttcaatagattttcttatataatttcct
ttttctaatacttcattataaaaaccatctttagatatctcatctaatacaactgaagct
gccaccatagctaataaattacctccaaaagttgtaccttggtctccttttcctagtact
tttgaaagttttttatttaccaatactcctcctactggtattcctgctcccaaccctttt
gctacggtaactatatctggttttacatcaaaatattcatagccaaaaagtttaccagtt
cttcctataccgcattggacttcatcaaaaatcactacaatatccttttcttgacatatt
tttactatttccaaaacataatctttttcaagaacattaactccaccttcgccttgaatc
gcttcaagaattattgcacaaactgtggaatcaagattattttttaaatcttcaatatta
tttctttctatatatttaaaaccttcgggaagaggataaaaatacttatggtatttgtcc
ataccagttgccattaaagacatcattgttctaccatgaaaagagtcttttaaacttatg
atagttcctctaccattaccatatttgtcactactatactttcttgctattttgaatgct
gtttcatttgcttctgttccagaattacaaaaatatactttagccattccacttgaatta
attattttctctcctgaatacaacactggctcattaaaatataaatttgaagtatgtaat
aatttatctacttgctcttttagagcattctttaaattactattactatacccaagagaa
gatactccatatccacttgtaaaatctatgtatttattgccattagtatcaaaaaaacaa
cttccttcaccataatctatgacaaaattgggttggttatatgtatctataaaatattca
ttccattttgaaattgtattgttgttattcattcttattctcccctcttaaacttataat
tttattcattttcttttcttattaatgtacctattccactatcagtaaatagctctgtta
ttatagaatgtggaactcttccatccaaaatatgtaccctatttactccgttatttaagg
catctacgcatccctctattttaggtatcatacctccagtaattataccttcttcaaata
atttatcaacatcctctaatataacttctgttattaatgatttttcttcatctggctctc
ttaacaaaccagggacatctgtaagaagtatcaatttatctgcatttaactctttagcta
tagcagaagctgctgtgtcaccatttatattataagtctctccatcatctccaacaccta
tagttgcaattactgaaatataacctgactttagacaagattctataagctcaacattta
cttttttgatttctcctacaaatccaagttcataatttttatatgggtcacataaaatca
tattattatccattccacaaagccctactgcttttccaccttttgtatgtattttattta
ctaggtctttattaacctttccagcaagtaccatttttacaatttccatggtctcttcat
ctgtatatctaagaccatttacaaatttactttctatatccacttttgctagcatcttat
tgatttctgcccctccaccatgtactaaaactatattgattccaacataactcattaata
caaggtcttccataacagattcttttagaccatcttttttcattgcacttccaccatact
taactacaatagtctttccctgatgtttttctatatatggtaaagcttctataagtgtat
ttgctttttctatattaatcattaaagtatatcctcctaatttctataacttccatttat
tcttacataatcatagcttaaatcacatccccatgcatttcctctggcattgcccatatt
taaatctactaatatacttatttcgtcatcttcaaggattttttttgctttttcctcatt
aaaatctaatccatttccatttttacatacttcaatatatcctttcatactctcaaaaat
aatatcaactttttccatatctatttcttcacctgcataacctaaagcacacagtattct
accccaatttgcgtcagctccaaatacagctgtctttactaatgaagaagatataactgt
ttttgctaattttactgcatgttcttcacttaatgctccatttatataacattcaattag
ttttgtacatccttctccatcttttgcaacaagtttagcaagttctatacagacatatgt
aagtgcactcaaaaatacttgataatgttcatcttttttgtttattctatcattttttgc
ttttccatttgctagaatcatcaccatatcattagtacttgtatctccatctacactaac
tctattaaaacttttatcaacagcaattttcaaagcttcttttagcaaaactccatcaat
atttgcatctgtagttataaatcctaacgttgttgccatattaggatgtatcatgccaga
accttttgccatacctccaatagttatttttttatctccatacattattgctactgctat
ttctttttttataatatcagttgtcataatagcttctcttgctccaatatgaccttgttt
acttagattattcactaattcatccatattttcttctattaaatttatatttaatggctt
tcctatgacacctgtagatgcaaccaaaacatcattttctttaatatttaatttatcact
agtgaatttagccattttataagcatttataagtccttcttttccattaaaggtattagc
attagcactatttactatgatagcttgtgcttttccatttttaatgtgttcctgtgtaac
ataaacaggattgccctttactttattttgagttactactgctgctgcatcacataaaac
atctgaataaaccaaagctaaatctcttttttctttattttttctcaagccacagtgaat
ccctgaagcaaaaaatccttctgaaactgtaactccaccctttataatctccatatttat
cctcctaattatatgagtttagtattttttcattactaaaatgatggtgcaatatttttt
aaacctgtattttcttcaataccaaatattatattcatgttttgtatagcttgacctgct
gctcccttaatcatattatctatagctgaacagattatcaatgtatctccattttcatgt
aatgatatgacacatttatttgagaacctaacattctttaaagaagctaccttatctaat
gggagaacttctataaattctttaaattcataataatcagttaattttctatgtatatca
tttatagaaatattatcttcttttgtacaatatatagttgataagattcccctatttact
ggtattaagtttggtgtaaaaactacacttactttttctttgcaggattcacttaaattt
tgttctatttctggagtatgtctgtgtttccctattttatatgcagtgatattttcatta
acctccgtaaagtgactactaatcgataattctctaccagcacctgtaagacctgattta
gaatcaattattatattattattttttatcaatttagaacttagtaatggcatcaatggt
aaagaaatactagttggataacatccaggatttgcaattatatctgcatcttttatatct
tctttgtatatttcacttaatccatatacagcttttttatgtaagattttatctataaaa
gatactccataccatttactatatacttcttcatcttttattctaaagtcagcacctaaa
tctataactttctttttcgatttaattgcttttattacaaacttttcactaactccatgt
ggaagggctgtaaacacaacatcacacatatctataactttttcattttctatacatatc
atgttatttttatatcctatacttggatatatatcaactatattttttccaacatacgaa
tttgaacctattgctgtcacttcgactttatcatgattcattaataatctaatcaactct
gccccgacatatccagttgcgccaataataccaacttttattttattcattttgttccct
ccatttttatattcaaatagtattaaaattctatctttccactttactatatgataatca
tttgataatatgtagattaaaatattctaattaaaacaaaaaaccccttagcattataaa
tactaagaggcgattttccgcggtaccactctcattggtaaaattacaataatcattaaa
actcaaattaaaaagtatctacaaaatgtacatttaaaattaaaaaagcctcttggtcaa
agaccaagagacgaatatacacccgcgttaccactctaattgataagataatcttaccca
ctctaatctcttaaggcgagattcaccaattaccatactattacttctggtaatctcctc
caaagctctattcacaataaaattcgttactaggcttccaccattcccagctctctatca
actagctttatgctactctctttttcacaggatttcaatttattttcttattgttttata
tgatagtttatttttttaactttgtcaatataatttttaaatttttggaaatattttcta
tatggttaatttccagcattttgtatctaaattgagttataatctttatattatcattca
tcaacttaagaaatttccaaaatatattggattataaaataatgtaatctcaaaatacaa
tatttacatctatttttagttaaatttttttaatgttggtatctaaaaatttctcaatct
ttttctcagaaagtatctcgttggttacaaattcaccattaaaaaaaagactgtatgtag
taaatggtgcaggagcattttgtgcttcttttgctgtttcgaattttataagatttacat
caatacctctagaatttgcaatttttttcaaaataggagcatatttttctgtatgtggac
actgattactgtaatataaaactataccgttctcatttaattttcttttttttacacaat
tcttaaaacatggaataggagcattatcagtaaagggaaaatataatagctcataatttg
gttctgatgtatctgctaaacaaaagcccttatattttagatatttagcatcagataaaa
aaggcatttttttactagacgaaagcacaactaatccatatttaccttttgattttgcat
catcaacacactcttgtagcaatagattagaatatccttgacccttaaattttccagata
tccaaaaacagttaataaatatataattgtccgcagtaataggacaccatgcattttctg
ctggaatatattctataaaagctttacctcttacatcaaatcgtttaaaggctagacctt
tatcaaaattatttttcatccaagcttttttagaaaaaacacaattttctcctttttttt
cagaaattgaacagcatatatgtctactgtcaatattatttatatttatatctataatct
gcatacttatctccttttctaattacataataatttttaaatatattctatatattttta
tcttaatattttgaatacaacaacatcatgtcatatatatttttattttacataatatta
tttttagattatttgaattatcaaattgcatatataattaaatacattctaggtctaacc
acactatatataaactatatattatcataatattctaaatttataaaacaaattgtattg
aattaaatttatttaagatatataattataattataattaaaataataataaaggtgttg
tttataatgttcaaagaatacttaataagagaattaaaagaagatgatattaaaaatgca
ttagacttaatctggaatgtatttgaagaatttgaatctccagattattgtgatgaagga
attacgacatttcatcaatttatagaatataattctattattgaaaaaatcaaagaaaaa
acactcttcttttggggttgttttgactctaaaaaacttattggagtcttagctattaga
aatttaaatcatatatgtatgttatttgtagataaaaactatcataaacatggtgttgca
aaaaaattaatgactacaggcatacaatactgtatttgtaataaatttaatttaactgaa
ataactgtaaattcatcaccttatgctgttgaagtttatcataaattaggatttgaagat
attgctgttgagcaaattgttgacggtatacgttttacacctatgaaattgttaatataa
taaattaaataaaaagcaaagtctcttaaatattttatagttactttgcttttaaaccaa
gatttaaaataatactatcttttttgttttttaataatatactttaaaagccttactaat
atgaactataatttattttttgatatcctttttgattaacatataaattaattcaattat
taaacataaactatgttgtttctctttatatctcttctttgtaaacaatattgggcattt
gaaaataaatattcttaaaatatactgttctcctgttgattttcctttggtacaaatgat
aaaattttaatttacatgctccgtaatgaagtgtttaataaataagttaaaataatttat
ttacctccttaatcatattttttatgaatacctaataacacagtatcaatagaatcggct
aaaccttttatagcttcttctttactcaaaagtgatttcccaagttgcaaagtcgaataa
ccatgaagtacactcattattaagtttaatacttcacctgtattctttgtatttagatta
caagaaagaataagtttttctaataaggatttatattcatcaaagatttctaatgtttca
ttatttccatgccaagtagcccactgaattgtttcataaacaccaggattagaaattata
aaattaaagtatgctatacttatacactttatagctgtatctccaaaatttccaatagtc
gcctttatcatttgactattcatctctctcattcctttatgagctacttcaagtaataaa
tcatctagactttctatatgattgtacaaagatggtgtacgtattcctagcttttctgca
ataacttttaaagaaactttgttaagcccatctttattaactatatctgatgtagcttgt
ataactatttctctactaacacgcatgattttccctctttcatttaaaattaattacttt
attagtttagctaatctaattagtttcgtcaattattgtaatttataaaattctttatac
tcttataaaatcttgacagtttaattataatttaatataatactaattgaattagtttta
atactaatataattagtattatattaaattatatattacaacattattttatagtttgat
taattcaacaatcactaatatatcaaactgaaaggagatttttatggaaaaaaaatattt
cgaaattcatggagttccttcaatcctttggggaaatccttcaagtaaattatatattta
catacatggacaatgcggcaataaagaggaggctgaagcttttgctaatattgcagttcc
acatgagtatcaagttttaagtgttgatttgcctgaacatggagaacgtaaaagagaaaa
aaattcatttaacccatggcatgttgttccagaattagtatctattatggaatatgcaaa
gtgccactggaatcaaatttcgttatatgcaaatagcattggagcatggtttagtatgtt
aagctttgaaaaagagaacttaagagagtgtatttttgtatctccaattctagatatgca
acagctcatttcaaatatgatgctttgggcaaatgtatcagaagaacagcttaaacatga
actaattatcccaacttcatttgggcatactctttcatgggaatatctacaatatgtaaa
acaacatcctatcactcaatggaatgtaccaacaaaaatattatatggtaaacatgatga
acttactgaaatcggtgttgtagagaaatttgtagaaaagtttaattgcaaccttactat
tctggaaaatggcaaacattggtttaacacaccacaagaattaaattcattatatgaatg
gttaaatactttagttaaataaaaaataattatattattaatatgattaaattatttata
aatgttatttaattaattttattttagcattattaaaataactacataaagaataaatta
gttattattaaagaaattaaaagtatatagagtattaataattttttaataattagttat
tatagaaaaaagagggatataatattgtctccctctctttcttctgtaatattatataat
ttttatttatcactctcaataaattatagttatctacaaaattcaatctttaatacatta
ttaatatattgtgatattaatattacagtattaaataaaatctaataaaattaactataa
aatatctattatataaatatccactcttatgtttgaaatctgtcatatagttttatcctt
cttatcttttatatcaataactttttttaataaaattgacaaaacaaagtaaaaaacctt
attgataatgaaacaaatgatactataagttctgatattatagtaattgcatataaatag
acatcataacaataatataatattgtcactataaaattaaatgtaaaaatctccaatcta
actaaatacacatataggtattttttaagtttttaggtatttcttctgaaaatgatttat
tgattgataccaatttacataatctttttaatataaacaatgatacaatatatgggacag
cacatatgtatatagctacttatattacatattacagttggcatattcgtatttgtaatg
cttataccaattttaaaatacaccatcagtactaatggcattaaaataatctataataaa
gttaaaattattccaattagtacaatattatttaatattttacaactcatattctttttt
atataaatttaccaccttatacattcttatttttagtgtatattataatggttttatata
ttatatcaacaatttattattgaaattcaataaattatatattataatcaataatatact
ttatataaaggagatgatattttatgattacaaaattttttagtaatatattatcagtat
ttctatattttctattatcacttttaggagttgctggtataatattcttatgtatgatac
ctatgtttttatatgattttagttctgacaaagtaatcgctttaattgcaagaatactat
atttttctgactactttatagtcatcttattcttgatatttataattaatagtactaagt
attccccattcatacttgaaaatgtaaaaaggtttaaagtaatgggatgttgtttattga
taaacactataattgaatgtgtaattggttataactcaaatactagtcttataatgatat
ttggagataatagtggcggtatctcaccacttatggttatttcttttatatttgcactaa
tgtgctttgtaattgcagaaacatttgataaagctataaaaataaaagaagataatgatt
taacgatatagaggtgatgttatggcaatagtagttaacctagatgtaatgatggcaaaa
aggaaaatatcacttaaagatttggcagaaaaaatagatattacaaatgcaaatttatca
attttaaaaactggaaaagcaaaagctattagatttaccactctaaacgaaatttgcaaa
gctttagactgtcagccaggtgatatacttgaatatgtagaagatgaaaatgattaaaaa
agagtgtttagaaacactcttttttattatactatatgatttttattcttttactatatt
attgacattaatattaactttgtttaaagtcataacaaaatacgttctaagaaagaaact
gttcctttttctatttgttatccattacctataagaactgtatcacactaaatcatactt
ttaaattgataattttgccacagattcctatatacattcttttctacctaatatttattt
aaactgttagcaaaacatggaactttttcatttacttatacctccatttatattattgca
tagtttatagctacgtgttataaattacattattgatgatttatctaacatttgtaatct
tttagatactctttgaagttacaacactgttatactctaattaagtaaactaaatctgat
acaagttggtgattatatgaaaagaaaactttcaacctattttaaaggatatattttagg
tttatgtatagcatttttattatttacttttatattaaaaaaattaattatagaaaatat
cattggaataataattggaactggaattgcatttttactgatttacctatttaataaaaa
aagaaaataatattctataaaaaggtcttttagtgaatttacaaaaaattaataagaata
atatatacttagtatttaaaaagggtaacaactctctctagctgttaccttatatattta
tctatatctttagtattaagttttttaatttctacttttttaattatcaatttctgtatg
tagatatactaaaccttccaacttgagatttaaataacttttcaatctcataaactattc
tatacaccttattttcgtactctaaatcataatacacatttatttcacctatactgttta
cacttatcgtataatgttctttttctattatacatattcttccaaaatctgacaggtcat
tatctatcaattttaactgtttttttatttttgaaaaatctaatcttggaaatatgtcat
taggataaaaacttttattatatacaagcatttcatccaccccttatttattctatttat
atcattttataccctaattaataatttattaatcatctttttccatattattcaaattct
cttatataaaaacaaaatcaatttagaatatgtattattaaatataaagtgactcaatct
ttatttaataagaaaaaacatttatattacatataattaatataaaactaatgaagtggg
tgtatgaaagagaaaacacaattttaatttacattccatatagttaatataaaacagttg
tttttattttttctaaagagaaaaaactagactttacattccatatagttaatataaaac
tttctgtatattttagttgtgttttaatattataacactttacattccatatagttaata
taaaacatggcagtaactaagaagaaaactataccttttttattctttacattccatata
gttaatataaaacgaggaaattttatactaatgactgatgctagatttaactttacattc
catatagttaatataaaactattataaggagcattatacgaccaaaagccaaagcagctt
tacattccatatagttaatataaaacaagcaacagcaagagtcgcgacaacattaaaaac
ttcctttacattccatatagttaatataaaacctttatttttttctctatatcgagttcg
ccaaattcactctttacattccatatagttaatataaaacagtccagc