Block details | |
---|---|
fasta | C_difficile_CD00121_1A_020916.fasta |
contig | u00000crpx_c_020916 |
start | 2186548 |
length | 15328 |
strand | + |
type | core |
seq | ccatctctttcaagatactttaattcttgtgacagtatcttatgacttatatgaacaact tctttttttaattgactgtaacgtattggctcttgttttaaaatatgccataaaataatt gccctccatttacttcctatcacagtcatggtaaaaccaattgaacaattaaaatctttt tgtctttcttcaatatttggaaattcttcaaaattattatctatatccatctcaatcctc tctttcaaaatagtaagtatctaactaaaaagtgcattcttgtttagcgtactaattcgt aatataatcttgattgtagtatagagccttacataatactacttttttagatgtatatgt ttaaactttaatatagacatatgttattttattaattttatttaaacagataataataaa taataatttatctcaagttttctatgtagataaactaatctaatgtttagaaaggattat ataatatgaataaaaaatttcgtctttatcaagttgactcattacaaaagaaaaatttac aggtaatccagctggtgtaattacaaatgctgatggcttatctgaatcacaaatgcaaaa aatagcaagagaattaaataattcagaaactgcttttattttcaataacttggctaaaaa tcatcaagaaaattatgatgtacatatcagattttttacactaactaatgaggttcctat atgtggtcatgctactattgctgcccattatgttagagcagtagaaaaccaattcaataa caaaacagtatttcaaaaaactagtgctggaatattaccagttgatattataaaaaaaga taatgattatgaaataattatgacacaaggaaaaattgaagtatctccaccgttacaaca aacctatcaaaaaagattacttaatgcatttggtattttaaaggaagatattcgtacaga ttgtcctattgccatatcatctacaggacattcaaaagttatgattggaataaaggaatt atcaacattaaatagtttatctccaaatttatatgaattatcgaaaataagtcaagaaat aaaatgtaatggatattatatttttacattacataataaagaaactctacaagttcatgg aagaatgtttgctcctgcaattggtatttcagaagaccctgttacaggaaatgctaatgg acccttaggtgcgtaccttgtacattataaagtaatacctacacccaacacagagtttat atttgaagcagttcaaggagaaacaataaaacgcaaaggcaagatgttagtaaaagtaat tattttagataataaaccagttgaagtaaaaataattggaaaagctgtaattgcattctc aacaaacatagaaatctaattatagattccttctaagtaaatttttgaactttttaatac taatttaataacaaactaatttatatacaatcaaattaatttttttattatttgttaata tatatttatcattatattatataataatatagatagttactatatcttataattagataa atcataattatatattattgttaaaactcaattatataatttttaataatattattttag gaggtaaaaatgataaacgatattaaaaataaattcaaaaattacaaaccatatataaat ggatacaagaatatgaagagagcatctgttttaattccaatagtagaaataaataacaca cactatatattatttgaagttcgctcaaaaaatttgaagcatcaacctagtgaaatttct tttccaggtggtaaaatagaatcaggtgagactccatatgaagctgttattagagaaact tgtgaggaacttggaacttttagtgacaatatagaagtaatatcaagtcttgacctcctt ataacaccagtaaagtttatcatacatccatacttaggatatataaaaaatattaataat ttaaatataaacaaggatgaagttgaccatacttttttggttcctataaaatatctttta gagaatcctccaaatacttatagtaatactgtaaaagtttttccagacgaaaatctacca tatggttcaattccaaaccaaaaagattataaatttgaaagtggaagttatcctattctg ttttataaatataaagattatgtaatttggggaatgacagcaaaaatactagaaaacttt ttaaattttttatcagaataacactcataataaatcatcaaaacttttacataagaaatt tataaaagtttctaaatttaacaattctaaaatatcaataactatattttgtagcacttt tttattttattattgtttgaatatttgatggttttcaatgcaatttcaacataaatacta tgtattagtgtatactgttgatgaattaaagtatgataatctatttaataaagtatgaag taaatgattttaatgtgcctttatggtaaaattactaataagtaataaaattaattaaaa tatatggaggtgcttataatgtttgctgtaggatttgttgttataattgcacttgccttt ttcattttaagtgtactattatttaatggaaaagccagtatgctactagcaggttataac tctatgagtaagaaagaaaaagcacgatacgataaaaaaaaattatgtagaagttctagc attgttacttttattgtctctataatgctatttattatggcgtttttgggatatagaata gagagtggtcaaatggacgaaaaaaaaatggttcccttttctataatatttataatagtc atactttccagtgtattttttaatatcctctactctaacaaaaaatgtaaaaaataaata gttgtaagttgagcagttaattataaaagattgactgctttttcatgtatattgactact cttattaaatattttaacatttaaaaatctatgtaaaaataatgaatatagtacaaactt ctaataatgattttacctttgtggttacagtccactatatataatttaatatgataacag ggaattactaatgacaactaggtaagcttttataaaatataataaaacaaaaatagatgt acaatgaaattatatcttatatcaaatttatttttattaatagcaaaaacttacattagc ataacatatgacaaattcgcttaaaataaaaatttttaatataatttgttctatagtaca tctattttgattagtttacataattttattattttgtacaatattaattatttactaata tcccatttaatgaaaaagttctaggttcagtaatttttaccataactaatttaccaatta aatcatcatttccaccttcgaaatttacgagtttattttgtctagttctaccagcaaact tattttcattatttttacttcttccttcaactagaacttcaactattctatctttatatc catcatttatttctgcagaaatcctatttacagcttctaacaccctattaaatctatcat gctttatatcttctggtatttgattttccattttagcagcaggagttccctgtcttttag aataaataaatgtaaaagctgaatcatatctaactttttcaaccacatctaaagtgtcca ataaatcttcttctgtttctcctgggaaaccaatcattaagtctgtagaaaaagcaatac ctggaacttcctttttagctttttctattatttctaaataatattcctttgtataatgtc tattcatttttttcaaaaggctactgcttccacattgtattggtagatgtaaaaactcac acaccttatcacaatctctaattgcgtatattacttcatcagatatatcttttggatgag atgtcataaatcgaaccctttcaattccttctatatcattcacttttcttaaaagttctg agaatgaaactggattttcaagtgtcttaccataagaatctacattttgtccaagtaaag tgatttctttcgttccatttgcaacaagctcttttatctcgttaattatatcttcaggag ttctacttctttctcttcctcttgtgtatgggactatacaatatgtgcagaaattattgc atccatacattatatttacaaatgcttttaattcaaattttctattacttctaagacctt ctattacttctccatccacatcccatacatccactaacattttgtcagaatttattgatt ctgtaagtaattgcggaaatttatatagattatgtgttccaaatataaggtctacatgtt tatatttttttcttaattcctctacaacatgtggttgttgcatcatacatccacatacag ctattttcatatctggattttttccttttagatgttttaattgtcctaagttaccataca cttttagctctgcattttctctaactgcacaggtgttatatattattaaatcactttctt caaccatcattgacatttggtatcccatctcttctaacattgaacataatttttctgaat catgttcattcatttgacacccgaaggtttgagtaaacacgagttttctctttccagttc tgttgaagtattcttcattttgtctgtgtatttgttctatatatttatcttgttcttgta ttttctctataggtattgttacttgttttcttttgctcacgtctattcctcctagttaat ttcttatattacacataaccttaattatatcaaataagaaaaatcttttaaagatattat tatttttctagttgtgttttaatagtaaatctaatgatttatatatactatatttctaaa atataaaatcatataattattataataataaaaagatgttttaaattaaaacttaaaaca cctttccttaaataaaatatatgatttactattaaatacaattacatctattcattttca attaaataacaatcatttaatattaaatattgatcttcctcaaccgttatatatcttctt cctgaaaaagtatcattagtaactattccctctgcattacctaagctatcatttctaact tcataatatgcatcagaagaatttgacattataatatattctccagcaggaatttctaat ccaattttatacataccatttccaaacttaccattcttggccttctgggctttagcatac tttgctaatgtcattgttgaatcctcaattttaatatattgaccattctttaaggtgata tatctagtcccactaaaaatatcatttgaaagtatactatcagcattacctgtactatca cttgtaacttcataataagaagcataacttcctgagtttgaagttattaagtattcacct gctgagatatcttttccaaccttatacattccatcttttatagtctttgtagtaggttta acattttttacaaccccagtattaatatctccaattccatttgttatatttaaacactgt tgtactatatttgaatctatatatcctatagaagttatcttcttagcattttttaaaatg cttttattgctaccatcgttaactaaaaccattggaccatgttttgataaagaagatcct acaagtgcatttgttaattcataagctccagctatataaaactctctagcatccttataa aacttatttattattgctttattagtttcaaaacgagtactcccccctagtctagtagat ttagtattgtttactaaagtggtactcattgaagctgttcctcctattacataagacttt aaaccactagttgaaaaaggtatactttgtccattagtaagaattattggtgctttatct cttgctgctacagatgcaatacttatagcatctgcttctcctttatatgcattggttagc ataacagtattgactttttttattgaatttatttcttttgcaacattataacttgttttt attctgtcatttcccttaattcttacaactttcattttcttagattttaatgaattttcg acagatgtactaatagaatatgttcctccaattatataaacttttgatacattttttaat cttgcagatgtctcagttggtatagtatttttttcagttaatagtataggggcatttaaa gctcctgctagtccacttgcacttaatccatctgcaatagagttactagtattaattaat atagcagttttatatgcagttttatatgcagttttatatgcatttttatctgctatttta cctgctatttcatacttattttttccttgtattttttctacagatgatattgcatctact aattgaatatttgcaaatacaaaagaaatacttaaagtcaatgttaatattcttttatag aatttcataataaaattgtccccctcataataaatttttaatatataaatacatattctt aaattagttatgtacttaacaaacttatgtaaaattgcaaattatattaagtatattaca aataaatattaatacaattattcatttagctataattgtatttacatttatattaaaaat caactagatttgtataaatacttataattatatttttattcttaatattttttttattat gttattttaatagatttatttttcttttttaagcatagagatgtatttttccatatattc tatttctattatagtttcgcttatttaattcacccaaaatttcacttaatattagaattt taaatcttttactaaaacagacttttatagttctattaaaattttttactaaactttatt ttttactatgaattatctatttttttggctaaatttaagcaagtttttcacaaaaaatat atacattactatatttttaaaactttataaatatataattgatttaattggaaattttag tgtattcaaaaaatgagaaatcagaggagattaatataaaaatttatcttgaaaagtcaa ttaaatatatcttatatttaataactacaaatgagatacatataagaatattatataggt atgataatttatctgttaaattaagtgtaattggtactatataaatattttattaaaaat aaatatataataccaaatctttaaacaacataagaataaaatagttataatctactttat tcttatgttatttagttattataatgctttataaagtaaaatattatttcgtgtttaagc ttgataactaactcttcttattgatagactaacaatcttgaataaaaatattcctgcaac tagatttattaaaacagctggtaatactactgctaagaataaagctgtaaatgaagcccc tggaagaccaactatagcttgagctactaataaaaagatagttccacttacaagagttcc tattggcattattattgcaactactacagtatcttgtgttttcttagctaatttttttat aaaaggcatattataactaatattcattaataaaaatactatatttgctgtaagagtttt atctattacattaggaatttgacctcccggaaaacttgatgtaagtgctgtaaatattcc tgttactatacccgctatcaaacaagttttataatcatctctatttaaaaccaatattac aaataacattgctagtggtacatctggcttcattggtaatcctatagctggtgtgatttg atgtattaataatcccatcgctaaaagtattgcatttaaagttaatttttttgtatttgt tttcattttttgtacttcctcctatttttttaattttcaatttatttttttgccaaccta ctatatcatcatctttagcttttgaaattcataacatctttctcaccaccttctatcttt taaattttcagtaaaataaaaaactccgtcctaaactaataggacggagattatccgcgt tgccacctaaattatataaaaattaatataaaattcaattttcatacatctcattatcag gtacttacataccttattcgctataacgtgcgactgacgataaagtctactctcaaaact atgatttcaatttattcctctaagggccattcatcaaattttttcttgctaagattccac catcctcagctctctatactgaacctaaatttaactactcttccttgtcataggatttaa tttattgtattgaattttgttttaaaataataatattcttttttctaaaaaatgtcaata cctttttataaaaaatatattttgtaatctattttttataaaaaaagtaaattatactat acatttcttttcatatacaaaattctatgaataattactttaatggtctaatagtctgct ctttggctctaattcttcttatattaattttgtgaataactgttgatgtaattttatatt ttgattcatgaggaattaaattcttcaaagttaattaagtacatttatcaataaatttac ttaattaaccatcatttaatactcattcctgtatttatatgcctcctttgaaacagaata ttactccattttaattacatcatattattaaatagataccaatgattaaaaaaatgatat tcttttaattatttttagtaaaattttttcttctttcttttaataaatattagcactact aaaactataaccaaaaatatgactattatgaacaatattaattttgttaggatattatgt cttcttgcgttttgtcttttatatttatttatagtttgatatccatactttttagttctt atacttcgttttttcaactttactttacttttattatatttcctacttttatgtctactt ttagatttaatagttttaaatttagtattatcatatgtataattctcttttattgaagaa atgtatacactagactcaataatagcttctgcttctacttgtaatggatttataatgctg attataagtagaaaagatatagctatcccaatcaattttttcttcttattcatattttcc ccctcataaaaatttttaactagttcattataatatatataactaaaaattacaaatttt ttcaagtttcttatatatcttattatctttaatattatttttattatcataacttttact ttttttaagatttttcaaagtagtattaatttatgatacttggtgtataaagtataagtt aaatctactttcaattaaatttaccatttataattactttataataaaaataaattagtt aatttattctctttagttctgttataatgtttctacaaaaaagaatcccattaatgggat tcttttttgcgatttattaatatatttaaagcttgctagtatcgtattataaacttaaat gctcttctatgtattgattatatacatatccagaatatcgtttttcatttttattgatat taactcttgcccattttccaacgctataacatacttcaactttaaaaccatcagggattg tagttataactttagattctaatgttctatcatttctaagttctaaacttaatccatttg ttcttatatttcctatgtaattcttttttctattttttattgtatcattactattgtttt tagcattacttaatctttctaaatatttataaagtaaccaacctttgtcataattactct caacttctgcccatattccatctacacactttaacttaacaattttaccttctggtatac tttttaatttcaaactatttatgtctggtttttctcttaaattcaatttaattttagtct taaaattgatgctagatttgcgaaaattttttaacattaattcagatatcatcttaagcc ctcctcttgccaaatattaagttattaaaatatataactctaaaaatacttttaacaaaa agaattattatctttttggcaactggctgacatgacctttattacataaagattttagtc cctatagttttgcgtcattagatttatctaatattgcctatatctgaataataacataat ttgaacaattaaaaaataatattacctcaaattttatattatttaaatataaattaaatt tttaattaataataatcaaaaaatatctttatatttattcaattactgttctttatagtc aatataaaagacagtaatttatctatagtgttacttatattttatatatatggctatttt tcaacattttacaatatataacatttatttttttaacttttgtcagtaaaatgtcagcaa aacactttatccacaatttttatataagttttccacaacttatcaccaatattatccaca taaaaaaggtagcacttatattattagctaccttttatttattaatctttatatttccag ctttttatccaacttcctatttctattattttttcttcagttatttcttctccatcatgt aattttgaaattaattctgataaaggattgttatgtaaacctctaaaaactctttttccc tctattttgagatattctctctcttttattaatactgtatagtgtacatgcctcccaatt ctctatgatattaaaaaaccttttttggttaatctagctaaaagtataattgtagttgta tgcttccaaccatatgttttttctatttcatctgcaacatcttttgatattacagtttta taaccagtatgccatatgcatttcataatttttaattctgtatctggtaattttttattt agcataatatattccttctttcaatttatgtcacttcttcaaatttatctagcttaaatt ataataggagctttttagaacaaaaactatatttaatttttaccaggtactctacgtgtt tagtctgtttttaagtgtaaaataatgttcatatctataaatttatttaactttcaaaca atcctgttgaataataactaattctattgtattattttagttgtagaataaaactaaatc ggcaaaactagagaaatttagtgacgcaaagctatagggactaagacttatataaatatc ttatgagttatgtcagccagttgccaaagagatagtgttctttttgtttttatgaaagtt ttttagggggataataatttatatgtttggaaataaaatggataaatgtacacatgtatt gactgcttatattagcagttcgtatgattattgtaattttttagatacacagttagatga ttttatattagagtacggagaaaatgtagtagagtcttgtttacaccaagtaatggtatt ggtaagtaagtataattagatagacattgatttctagaaaaccctttttagttttatcta catttatattaatatatagcaatgtaaaacgtttaaatatatttttaatattaagaataa ttaaaatgttaactaaaaaatataattaagtagacatttctattaatctatgatacaata gtatttgtggtaatacacaattaaatcaagtatatcttgatataggttaataggagtatt tttaatgaataatggaatagtgaaatggtttaataatgaaaaaggattcggttttatatc aatggaaggtagagatgatgtgtttgctcatttctcagctatacaaacttcaggatttaa atcattagaagaaggtcaacaagtaagctttgatatagttaaaggtgctagaggtcctca agcagaaaatataactatattataatatatagatttttcgggaaagactctttttagagt ctttttttattgttaatatatgtaagataatcattggtgaagtaaataaggtatattgag taatgttcttgatagtttatatgctaatgaatttcaaaaaaataagcactcctataaaaa gagtgctcttaatgtaaatataaaccttcattggtccagcctaataccccgtattctcca agttttaactcttttttatatacattatcactttcagccatatctaacacaatcatttct tctttagaatcaatttgtaaaatatgaggactgtgtgttgtgacaattatttgtgttttt gggagaattgtttttaatgtaataaaaattttacataccacatagttgatataaaactta agactagcagactcataagcaattagttgcctctctttacataccacatagttgatataa aacctagaggctctcagagaagttataagatgtttagtaactttacataccacatagttg atataaaactccaaaataaacttagcatctccaatgtttacacatatacaatgctcttaa aattgcagtgaacgcgcaatattgcaattgataatacttatcatatattctcaatacctt atatttcaactgctaaacctcaatttatcacaaatatcgctcactgcaaaatttctatat ttttattatatcatagcatataattaatattttcaattaatttttacatttaattatgtt taaattctataataatgcaactttaatgtttcttcctggaactaatataaaaactatttc agaaagattaggtcatgcagatataaaaataactatgaatagctactctcagtttttaga agagatggacagagaagcatttgaaaatttgagcaaaatactatttattgtattttaaag aagatgacttattcaatatttgatgctagaatataattaataaaaatttaattataggtg attgtattatgaatattattaaaagcataactttactcttaacattattaattgtgatat taatgacaggctgttccccaagagaaagtgctagtgaagttgcaaaaaaatatattgata agatgaactctggtgactatgaaacagcatatagtttattaagtaaagatagtaaaaaaa aaattagtatagaaaatcttgaagaatttcaaaatattttagttagtacaaaaagaataa ttagttataaaataggtaaagaaaaaatcataaaaaaatataaacatgatggaaaagaat ataaaaatgttgttaaattagaagaaacttttaatataaaaaaccttctttataaaaaag atgattctctaaaagtaaatagatattttgtagttgaaaataacaaatacaagctattat tgtatgaaagtttcaaaaaagaatttggtattaatagtatggaccttgctcaacttaagc ttaatgattttggactaaaatactttaaagaagttgaccttatactaaaaaaagctattg ctattaatcctactgattcaaagctttattatgcccaagcatgtaattatatgaattttg atggatttcctggttattcagatacaacatataatgctttagattcaattaataaatctt taaagtatttagataaaaatgattctgactacaaaaaaaatgcaagtaatatatataact taaaaggagttattcttatgtttcacaaaagatttgatgaagcacaacaatatttaaata aagccttatactttaacaaagataataaagacccaaaatataatctaaatacaataaaaa aacatctaaactagatatttaatttttgaatttataaaatatttttttatgtataattca gcactgaatcataatctctactaaactaattacaagtttaaattataaagacttatttct atataaatattactctataacaataagtttcttatttaaattttaaaatattatctaaaa atcataaaaaagaaggtataaagagctaccctcaagctcaatataccttataaatatcta aacttcattttttactaatttttctatatctttgataatatgttctttagatttttttcc agctatggcatcaaaaattgcaacagcctttttctctccaaacttttctgctacatcatt aaagtctaaaaatctaacactttcttttggtttaccaaacatataacacctctcatacat ttttatatatttattataacttctatagacttatttttcaccaataaacgttagacaaat tagtccctttatttttttaaactagctttaccttcaaaattcttaacaaaaacagtttat tctactctataaataaaaatagacaatttaatttgtaggaaactgataatagaatacagt aaataaaactttgtttaatctatctgaaaaagttatctattaaaactgctatgaatttat aaagaatattctagttcataaaaatacaaatatgtaaatataatcaccttaatattcaat ttatttaaaataaaaaatgtataaaagatttaataatgacaatatactattctcaataca atctatgatgtaaataatttaaaactactatattatttaaaaatttatatttatatatgc aattctaaaaacttaataagaagtgaacttagaaaataaagcttaatttcaaaggcttaa atagactattattattagtctaaataaactacgtgtatcaaaattatatattaaattctt ctaaaatttttattgcaaatcttgcgtttggatatgtaatagaccctccaccaattacac ctatttttatagcttctataatttcatctttacttgctccagaattaatacaaccctcaa tatgataacaaatacactcatcacatcggcttaaaattgaaatagctagtcccattaatt ccttattttttttacttatagccccttctgaataagtcttatcatcaaggcttccaaata ctctaaaaaactcatctgtttcacttaattttttattgtaaaatcccctatattctttca tttctctagtattcatcttctacctcctatttttttcttataagagtatcacactgtact tatattttcaatattaaatacaaattttcattttatgttcattagcctaatttatattat tttttgaaatctcaataagttatcatataagtaagattttttcagaactaaaatagaaat ctcagtaatttctttattatctatctcagttctgaaatatattattcttatccaaacatt attatagtgattaattatattagttatttttacctgaaattttatacatcaaataagaat atacaaatggtagtattacaattacaaagattacaaagatattataaaaaggaatattaa taaatgcattaataattaataatattccaccaataagccaaatccatccagctaaatggt gtgtcttattccaattatcttcatcatta |