| Block details | |
|---|---|
| fasta | C_difficile_CD00058_1A_022457.fasta |
| contig | u00000crpx_c_022457 |
| start | 2237863 |
| length | 15306 |
| strand | + |
| type | core |
| seq | ccatctctttcaagatactttaattcttgtgacagtatcttatgacttatatgaacaact tctttttttaattgactgtaacgtattggctcttgttttaaaatatgccataaaataatt gccctccatttacttcctatcacagtcatggtaaaaccaattgaacaattaaaatctttt tgtctttcttcaatatttggaaattcttcaaaattattatctatatccatctcaatcctc tctttcaaaatagtaagtatctaactaaaaagtgcattcttgtttagcgtactaattcgt aatataatcttgattgtagtatagagccttacataatactacttttttagatgtatatgt ttaaactttaatatagacatatgttattttattaattttatttaaacagataataataaa taataatttatctcaagttttctatgtagataaactaatctaatgtttagaaaggattat ataatatgaataaaaaatttcgtctttatcaagttgactcattacaaaagaaaaatttac aggtaatccagctggtgtaattacaaatgctgatggcttatctgaatcacaaatgcaaaa aatagcaagagaattaaataattcagaaactgcttttattttcaataacttggctaaaaa tcatcaagaaaattatgatgtacatatcagattttttacactaactaatgaggttcctat atgtggtcatgctactattgctgcccattatgttagagcagtagaaaaccaattcaataa caaaacagtatttcaaaaaactagtgctggaatattaccagttgatattataaaaaagat aatgattatgaaataattatgacacaaggaaaaattgaagtatctccaccgttacaacaa acctatcaaaaaagattacttaatgcatttggtattttaaaggaagatattcgtacagat tgtcctattgccatatcatctacaggacattcaaaagttatgattggaataaaggaatta tcaacattaaatagtttatctccaaatttatatgaattatcgaaaataagtcaagaaata aaatgtaatggatattatatttttacattacataataaagaaactctacaagttcatgga agaatgtttgctcctgcaattggtatttcagaagaccctgttacaggaaatgctaatgga cccttaggtgcgtaccttgtacattataaagtaatacctacacccaacacagagtttata tttgaagcagttcaaggagaaacaataaaacgcaaaggcaagatgttagtaaaagtaatt attttagataataaaccagttgaagtaaaaataattggaaaagctgtaattgcattctca acaaacatagaaatctaattatagattccttctaagtaaatttttgaactttttaatact aatttaataacaaactaatttatatacaatcaaattaatttttttattatttgttaatat atatttatcattatattatataataatatagatagttactatatcttataattagataaa tcataattatatattattgttaaaactcaattatataatttttaataatattattttagg aggtaaaaatgataaacgatattaaaaataaattcaaaaattacaaaccatatataaatg gatacaagaatatgaagagagcatctgttttaattccaatagtagaaataaataacacac actatatattatttgaagttcgctcaaaaaatttgaagcatcaacctagcgaaatttctt ttccaggtggtaaaatagaatcaggtgagactccatatgaagctgttattagagaaactt gtgaggaacttggaacttttagtgacaatatagaagtaatatcaagtcttgacctcctta taacaccagtaaagtttatcatacatccatacttaggatatataaaaaatattaataatt taaatataaacaaggatgaagttgaccatacttttttggttcctataaaatatcttttag agaatcctccaaatacttatagtaatactgtaaaagtttttccagacgaaaatctaccat atggttcaattccaaaccaaaaagattataaatttgaaagtggaagttatcctattctgt tttataaatataaagattatgtaatttggggaatgacagcaaaaatactagaaaactttt taaattttttatcagaataacactcataataaatcatcaaaacttttacataagaaattt ataaaagtttctaaatttaacaattctaaaatatcaataactatattttgtagcactttt ttattttattattgtttgaatatttgatggttttcaatgcaatttcaacataaatactat gtattagtgtatactgttgatgaattaaagtatgataatctatttaataaagtatgaagt aaatgattttaatgtgcctttatggtaaaattactaataagtaataaaattaattaaaat atatggaggtgcttataatgtttgctgtaggatttgttgttataattgcacttgcctttt tcattttaagtgtactattatttaatggaaaagccagtatgctactagcaggttataact ctatgagtaagaaagaaaaagcacgatatgataaaaaaaaattatgtagaagttctagca ttgttacttttattgtctctataatgctatttattatggcgtttttgggatatagaatag agagtggtcaaatggacgaaaaaaaaatggttcccttttctataatatttataatagtca tactttccagtgtattttttaatatcctctactctaacaaaaaatgtaaaaaataaatag ttgtaagttgagcagttaattataaaagattgactgctttttcatgtatattgactactc ttattaaatattttaacatttaaaaatctatgtaaaaataatgaatatagtacaaacttc taataatgattttacctttgtggttacagtccactatatataatttaatatgataacagg gaattactaatgacaactaggtaagcttttataaaatataataaaacaaaaatagatgta caatgaaattatatcttatatcaaatttatttttattaatagcaaaaacttacattagca taacatatgacaaattcgcttaaaataaaaatttttaatataatttgttctatagtacat ctattttgattagtttacataattttattattttgtacaatattaattatttactaatat cccatttaatgaaaaagttctaggttcagtaatttttaccataactaatttaccaattaa atcatcatttccaccttcgaaatttacgagtttattttgtctagttctaccagcaaactt attttcattatttttacttcttccttcaactagaacttcaactattctatctttatatcc atcatttatttctgcagaaatcctatttacagcttctaacaccctattaaatctatcatg ctttatatcttctggtatttgattttccattttagcagcaggagttccctgtcttttaga ataaataaatgtaaaagctgaatcatatctaactttttcaaccacatctaaagtgtccaa taaatcttcttctgtttctcctgggaaaccaatcattaagtctgtagaaaaagcaatacc tggaacttcctttttagctttttctattatttctaaataatattcctttgtataatgtct attcatttttttcaaaaggctactgcttccacattgtattggtagatgtaaaaactcaca caccttatcacaatctctaattgcgtatattacttcatcagatatatcttttggatgaga tgtcataaatcgaaccctttcaattccttctatatcattcacttttcttaaaagttctga gaatgaaactggattttcaagtgtcttaccataagaatctacattttgtccaagtaaagt gatttctttcgttccatttgcaacaagctcttttatctcgttaattatatcttcaggagt tctacttctttctcttcctcttgtgtatgggactatacaatatgtgcagaaattattgca tccatacattatatttacaaatgcttttaattcaaattttctattacttctaagaccttc tattacttctccatccacatcccatacatccactaacattttgtcagaatttattgattc tgtaagtaattgcggaaatttatatagattatgtgttccaaatataaggtctacatgttt atatttttttcttaattcctctacaacatgtggttgttgcatcatacatccacatacagc tattttcatatctggattttttccttttagatgttttaattgtcctaagttaccatacac ttttagctctgcattttctctaactgcacaggtgttatatattattaaatcactttcttc aaccatcattgacatttggtatcccatctcttctaacattgaacataatttttctgaatc atgttcattcatttgacacccgaaggtttgagtaaacacgagttttctctttccagttct gttgaagtattcttcattttgtctgtgtatttgttctatatatttatcttgttcttgtat tttctctataggtattgttacttgttttcttttgctcacgtctattcctcctagttaatt tcttatattacacataaccttaattatatcaaataagaaaaatcttttaaagatattatt atttttctagttgtgttttaatagtaaatctaatgatttatatatactatatttctaaaa tataaaatcatataattattataataataaaaagatgttttaaattaaaacttaaaacac ctttccttaaataaaatatatgatttactattaaatacaattacatctattcattttcaa ttaaataacaatcatttaatattaaatattgaccttcctcaaccgttatatatcttcttc ctgaaaaagtatcattagtaactattccctctgcattacctaagctatcatttctaactt cataatatgcatcagaagaatttgacattataatatattctccagcaggaatttctaatc caattttatacataccatttccaaacttaccattcttggccttctgggctttagcatact ttgctaatgtcattgttgaatcctcaattttaatatattgaccattctttaaggtgatat atctagtcccactaaaaatatcatttgaaagtatactatcagcattacctgtactatcac ttgtaacttcataataagaagcataacttcctgagtttgaagttattaagtattcacctg ctgatatatcttttccaaccttatacattccatcttttatagtctttgtagtaggtttaa cattttttacaaccccagtattaatatctccaattccatttgttatatttaaacactgtt gtactatatttgaatctatatatcctatagaagttatcttcttagcattttttaaaatgc ttttattgctaccatcattaactaaaaccattggaccatgttttgataaagaagatccta caagtgcatttgttaattcataagctccagctatataaaactctctagcatccttataaa acttatttattattgctttattagtttcaaaacgagtactcccccctagtctagtagatt tagtattgtttactaaagtggtactcattgaagctgttcctcctattacataagacttta aaccactagttgaaaaaggtatactttgtccattagtaagaattattggtgctttatctc ttgctgctacagatgcaatacttatagcatctgcttctcctttatatgcattggttagca taacagtattgactttttttattgaatttatttcttttgcaacattataacttgttttta ttctgtcatttcccttaattcttacaactttcattttcttagattttaatgaattttcga cagatgtactaatagaatatgttcctccaattatataaacttttgatacattttttaatc ttgcagatgtctcagttggtatagtatttttttcagttaatagtataggggcatttaaag ctcctgctagtccacttgcacttaatccatctgcaatagagttactagtattaattaata tagcagttttatatgcatttttatctgctattttacctgctatttcatacttattttttc cttgtattttttctacagatgatattgcatctactaattgaatatttgcaaatacaaaag aaatacttaaagtcaatgttaatattcttttatagaatttcataataaaattgtccccct cataataaatttttaatatataaatacatattcttaaattagttatgtacttaacaaact tatgtaaaattgcaaattatattaagtatattacaaataaatattaatacaattattcat ttagctataattgtatttacatttatattaaaaatcaactagatttgtataaatacttat aattatatttttattcttaatattttttttattatgttattttaatagatttatttttct tttttaagcatagagatgtatttttccatatattctatttctattatagtttcgcttatt taattcacccaaaatttcacttaatattagaattttaaatcttttactaaaacagacttt tatagttctattaaaattttttactaaactttattttttactatgaattatctatttttt ttggctaaatttaagcaagtttttcacaaaaaatatatacattactatatttttaaaact ttataaatatataattgatttaattggaaattttagtgtattcaaaaaatgagaaatcag aggagattaatataaaaatttatcttgaaaagtcaattaaatatatcttatatttaataa ctacaaatgagatacatataagaatattatataggtatgataatttatctgttaaattaa gtgtaattggtactatataaatattttattaaaaataaatatataataccaaatctttaa acaacataagaataaaatagttataatctactttattcttatgttatttagttattataa tgctttataaagtaaaatattatttcgtgtttaagcttgataactaactcttcttattga tagactaacaatcttgaataaaaatattcctgcaactagatttattaaaacagctggtaa tactactgctaagaataaagctgtaaatgaagcccctggaagaccaactatagcttgagc tgctaataaaaagatagttccacttacaagagttcctattggcattattattgcaactac tacagtatcttgtgttttcttagctaatttttttataaaaggcatattataactaatatt cattaataaaaatactatatttgctgtaagagttttatctattacattaggaatttgacc tcccggaaaacttgatgtaagtgctgtaaatattcctgttactatacccgctatcaaaca agttttataatcatctctatttaaaaccaatattacaaataacattgctagtggtacatc tggcttcattggtaatcctatagctggtgtgatttgatgtattaataatcccatcgctaa aagtattgcatttaaagttaatttttttgtatttgttttcattttttgtacttcctccta tttttttaattttcaatttatttttttgccaacctactatatcatcatctttagcttttg aaattcataacatctttctcaccaccttctatcttttaaattttcagtaaaataaaaaac tccgtcctaaactaataggacggagattatccgcgttgccacctaaattatataaaaatt aatataaaattcaattttcatacatctcattatcaggtacttacataccttattcgctat aacgtgcgactgacgataaagtctactctcaaaactatgatttcaatttattcctctaag ggccattcatcaaattttttcttgctaagattccaccatcctcagctctctatactgaac ctaaatttaactactcttccttgtcataggatttaatttattgtattgaattttgttgtt aaaataataatattcttttttctaaaaaatgtcaatacctttttataaaaaatatatttt gtaatctattttttataaaaaaagtaaattatactatacatttcttttcatatacaaaat tctatgaataattactttaatggtctaatagtctgctctttggctctaattcttcttata ttaattttgtgaataactgttgatgtaattttatattttgattcatgaggaattaaattc ttcaaagttaattaagtacatttatcaataaatttacttaattaaccatcatttaatact cattcctgtatttatatgcctcctttgaaacagaatattactccattttaattacatcat attattaaatagataccaatgattaaaaaaatgatattcttttaattatttttagtaaaa ttttttcttctttcttttaataaatattagcactactaaaactataaccaaaaatatgac tattatgaacaatattaattttgttaggatattatgtcttcttgcgttttgtcttttata tttatttatagtttgatatccatactttttagttcttatacttcgttttttcaactttac tttacttttattatatttcctacttttatgtctacttttagatttaatagttttaaattt agtattatcatatgtataattctcttttattgaagaaatgtatacactagactcaataat agcttctgcttctacttgtaatggatttataatgctgattataagtagaaaagatatagc tatcccaatcaattttttcttcttattcatattttccccctcataaaaatttttaactag ttcattataatatatatataactaaaaattacaaattttttcaagtttcttatatatctt attatctttaatattatttttattatcataacttttactttttttaagatttttcaaagt agtattaatttatgatacttggtgtataaagtataagttaaatctactttcaattaaatt taccatttataattactttataataaaaataaattagttaatttattctctttagttctg ttataatgtttctacaaaaaagaatcccattaatgggattcttttttgtgatttattaat atatttaaagcttgctagtatcgtattataaacttaaatgctcttctatgtattgattat atacatatccagaatatcgtttttcatttttattgatattaactcttgcccattttccaa cgctataacatacttcaactttaaaaccatcagggattgtagttataactttagattcta atgttctatcatttctaagttctaaacttaatccatttgttcttatatttcctatgtaat tcttttttctattttttattgtatcattactattgtttttagcattacttaatctttcta aatatttataaagtaaccaacctttgtcataattactctcaacttctgcccatattccat ctacacactttaacttaacaattttaccttctggtatactttttaatttcaaactattta tgtctggtttttctcttaaattcaatttaattttagtcttaaaattgatgctagatttgc gaaaattttttaacattaattcagatatcatcttaagccctcctcttgccaaatattaag ttattaaaatatataactctaaaaatacttttaacaaaaagaattattatctttttggca actggctgacatgacctttattacataaagattttagtccctatagttttgcgtcattag atttatctaatattgcctatatctgaataataacataatttgaacaattaaaaaataata ttacctcaaattttatattatttaaatataaattaaatttttaattaataataatcaaaa aatatctttatatttattcaattactgttctttatagtcaatataaaagacagtaattta tctatagtgttacttatattttatatatatggctatttttcaacattttacaatatataa catttatttttttaacttttgtcagtaaaatgtcagcaaaacactttatccacaattttt atataagttttccacaacttatcaccaatattatccacataaaaaaggtagcacttatat tattagctaccttttatttattaatctttatatttccagctttttatccaacttcctatt tctattattttttcttcagttatttcttctccatcatgtaattttgaaattaattctgat aaaggattgttatgtaaacctctaaaaactctttttccctctattttgagatattctctc tcttttattaatactgtatagtgtacatgcctcccaattctctatgatattaaaaaacct tttttggttaatctagctaaaagtataattgtagttgtatgcttccaaccatatgttttt tctatttcatctgcaacatcttttgatattacagttttataaccagtatgccatatgcat ttcataatttttaattctgtatctggtaattttttatttagcataatatattccttcttt caatttatgtcacttcttcaaatttatctagcttaaattataataggagctttttagaac aaaaactatatttaatttttaccaggtactctacgtgtttagtctgtttttaagtgtaaa ataatgttcatatctataaatttatttaactttcaaacaatcctgttgaataataactaa ttctattgtattattttagttgtagaataaaactaaatcggcaaaactagagaaatttag tgacgcaaagctatagggactaagacttatataaatatcttatgagttatgtcagccagt tgccaaagagatagtgttctttttgtttttatgaaagttttttagggggataataattta tatgtttggaaataaaatggataaatgtacacatgtattgactgcttatattagcagttc gtatgattattgtaattttttagatacacagttagatgattttatattagagtacggaga aaatgtagtagagtcttgtttacaccaagtaatggtattggtaagtaagtataattagat agacattgatttctagaaaaccctttttagttttatctacatttatattaatatatagca atgtaaaacgtttaaatatatttttaatattaagaataattaaaatgttaactaaaaaat ataattaagtagacatttctattaatctatgatacaatagtatttgtggtaatacacaat taaatcaagtatatcttgatataggttaataggagtatttttaatgaataatggaatagt gaaatggtttaataatgaaaaaggattcggttttatatcaatggaaggtagagatgatgt gtttgctcatttctcagctatacaaacttcaggatttaaatcattagaagaaggtcaaca agtaagctttgatatagttaaaggtgctagaggtcctcaagcagaaaatataactatatt ataatatatagatttttcgggaaagactctttttagagtctttttttattgttaatatat gtaagataatcattggtgaagtaaataaggtatattgagtaatgttcttgatagtttata tgctaatgaatttcaaaaaaataagcactcctataaaaagagtgctcttaatgtaaatat aaaccttcattggtccagcctaataccccgtattctccaagttttaactcttttttatat acattatcactttcagccatatctaacacaatcatttcttctttagaatcaatttgtaaa atatgaggactgtgtgttgtgacaattatttgtgtttttgggagaattgtttttaatgta ataaaaattttacataccacatagttgatataaaacttaagactagcagactcataagca attagttgcctctctttacataccacatagttgatataaaacctagaggctctcagagaa gttataagatgtttagtaactttacataccacatagttgatataaaactccaaaataaac ttagcatctccaatgtttacacatatacaatgctcttaaaattgcagtgaacgcgcaata ttgcaattgataatacttatcatatattctcaataccttatatttcaactgctaaacctc aatttatcacaaatatcgctcactgcaaaatttctatatttttattatatcatagcatat aattaatattttcaattaatttttacatttaattatgtttaaattctataataatgcaac tttaatgtttcttcctggaactaatataaaaactatttcagaaagattaggtcatgcaga tataaaaataactatgaatagctactctcagtttttagaagagatggacagagaagcatt tgaaaatttgagcaaaatactatttattgtattttaaagaagatgacttattcaatattt gatgctagaatataattaataaaaatttaattataggtgattgtattatgaatattatta aaagcataactttactcttaacattattaattgtgatattaatgacaggctgttccccaa gagaaagtgctagtgaagttgcaaaaaaatatattgataagatgaactctggtgactatg aaacagcatatagtttattaagtaaagatagtaaaaaaaaaattagtatagaaaatcttg aagaatttcaaaatattttagttagtacaaaaagaataattagttataaaataggtaaag aaaaaatcataaaaaaatataaacatgatggaaaagaatataaaaatgttgttaaattag aagaaacttttaatataaaaaaccttctttataaaaaagatgattctctaaaagtaaata gatattttgtagttgaaaataacaaatacaagctattattgtatgaaagtttcaaaaaag aatttggtattaatagtatggaccttgctcaacttaagcttaatgattttggactaaaat actttaaagaagttgaccttatactaaaaaaagctattgctattaatcctactgattcaa agctttattatgcccaagcatgtaattatatgaattttgatggatttcctggttattcag atacaacatataatgctttagattcaattaataaatctttaaagtatttagataaaaatg attctgactacaaaaaaaatgcaagtaatatatataacttaaaaggagttattcttatgt ttcacaaaagatttgatgaagcacaacaatatttaaataaagccttatactttaacaaag ataatgaagacccaaaatataatctaaatacaataaaaaaacatctaaactagatattta atttttgaatttataaaatatttttttatgtataattcagcactgaatcataatctctac taaactaattacaagtttaaattataaagacttatttctatataaatattactctataac aataagtttcttatttaaattttaaaatattatctaaaaatcataaaaaagaaggtataa agagctaccctcaagctcaatataccttataaatatctaaacttcattttttactaattt ttctatatctttgataatatgttctttagatttttttccagctatggcatcaaaaattgc aacagcctttttctctccaaacttttctgctacatcattaaagtctaaaaatctaacact ttcttttggtttaccaaacatataacacctctcatacatttttatatatttattataact tctatagacttatttttcaccaataaacgttagacaaattagtccctttatttttttaaa ctagctttaccttcaaaattcttaacaaaaacagtttattctactctataaataaaaata gacaatttaatttgtaggaaactgataatagaatacagtaaataaaactttgtttaatct atctgaaaaagttatctattaaaactgctatgaatttataaagaatattctagttcataa aaatacaaatatgtaaatataatcaccttaatattaatttatttaaaataaaaaatgtat aaaagatttaataatgacaatatactattctcaatacaatctatgatgtaaataatttaa aactgctatattatttaaaaatttatatttatatatgcaattctaaaaacttaataagaa gtgaacttagaaaataaagcttaatttcaaagacttaaatagactattattattagtcta aataaactacgtctatcaaaattatatattaaattcttctaaaatttttattgcaaatct tgcgtttggatatgtaatagacccgccaccaattacacctatttttatagcttctataat ttcatctttacttgctccagaattaatacaaccctcaatatgataacaaatacactcatc acatcggcttaaaattgaaatagctagtcccattaattccttattttttttacttatagc cccttctgaataagtcttatcatcaagacttccaaatactctaaaaaactcatctgtttc gcttaattttttattgtaaaataccctatattctttcatttctctagtattcatcttcta cctcctatgtttttcttataagaatatcacaccgtacttatattttcaacattaaataca aattttcattttatgttcattagcctaatttatattattttttgaaatctcaataagtta tcatataagtaagattttttcagaactaaaatagaaatcttagtaatttctttattatct atctcagttctgaaatatattattcttatccaaacattattatagtgattaattatatta gttatttttacctgaaattttatacatcaaataagaatatataaatggtagtattacaat tacaaagattacaaagatattataaaaaggaatattaataaatgcattaataattaataa tattccaccaataagccaaatccatccagctaaatggtgtgtcttattccaattatcttc atcatta |