Block details
fasta C_difficile_CD00111_1A_020922.fasta
contig u00000crpx_c_020922
start 2162089
length 15311
strand +
type core
seq ccatctctttcaagatactttaattcttgtgacagtatcttatgacttatatgaacaact
tctttttttaattgactgtaacgtattggctcttgttttaaaatatgccataaaataatt
gccctccatttacttcctatcacagtcatggtaaaaccaactgaacaattaaaatctttt
tgtctttcttcaatatttggaaattcttcaaaattattatctatatccatctcaatcctc
tctttcaaaatagtaagtatctaactaaaaagtgcattcttgtttagcgcactaattcgt
aatataatcttgattgtagtatagagccttacataatactacttttttagatgtatatgt
ttaaactttaatatagacatatgttattttattaattttatttaaacagataataataaa
taataatttatctcaagttttctatgtagataaactaatctaatgtttagaaaggattat
ataatatgaataaaaaatttcgtctttatcaagttgactcattacaaaagaaaaatttac
aggtaatccagctggtgtaattacaaatgctgatggcttatctgaatcacaaatgcaaaa
aatagcaagagaattaaataattcagaaactgcttttattttcaataacttggctaaaaa
tcatcaagaaaattatgatgtacatatcagattttttacaccaactaatgaggttcctat
atgtggtcatgctactattgctgcccattatgttagagcagtagaaaaccaattcaataa
caaaacagtatttcaaaaaactggtgctggaatattaccagttgatattataaaaaaaga
taatgattatgaaataattatgacacaaggaaaaattgaagtatctccaccattacaaca
aacctatcaaaaaagattacttaatgcatttggtattttaaaggaagatattcgtacaga
ttgtcctattgccatatcatctacaggacattcaaaagttatgattggaataaaggaatt
atcaacattaaatagtttatctccaaatttatatgaattatcgaaaataagtcaagaaat
aaaatgtaatggatattatatttttacattacataataaagaaactctacaagttcatgg
aagaatgtttgctcctgcaattggtatttcagaagaccctgttacaggaaatgctaatgg
acccttaggtgcgtaccttgtacattataaagtaatacctacacccaacacagagtttat
atttgaagcagttcaaggagaagcaataaaacgcaaaggcaagatgttagtaagagtaat
tattttagataataagccagttgaagtaaaaataattggaaaagctgtaattgcattctc
aacaaacatagaaatctaattatagattccttctaagtaaatttttgaactttttaatac
taatttaataacaaactaatttatatacaatcaaattaatttttttattatttgttaata
tatatttatcattatattatataataatatagatagttactatatcttataattagataa
atcataattatatattattgttaaaactcaattatataatttttaataatattattttag
gaggtaaaaatgataaacgatattaaaaataaattcaaaaattacaaaccatatataaat
ggatacaagaatatgaagagagcatctgttttaattccaatagtagaaataaataacaca
cactatatattatttgaagttcgctcaaaaaatttgaagcatcaacctagcgaaatttct
tttccaggtggtaaaatagaatcaggtgagactccatatgaagctgttattagagaaact
tgtgaggaacttggaacttttagtgacaatatagaagtaatatcaagtcttgacctcctt
ataacaccagtaaagtttatcatacatccatacttaggatatataaaaaatattaataat
ttaaatataaacaaggatgaagttgaccatacttttttggttcctataaaatatctttta
gagaatcctccaaatacttatagtaatactgtaaaagtttttccagatgaaaatctacca
tatggttcaattccaaaccaaaaagattataaatttgaaagtggaagttatcctattctg
ttttataaatataaagattatgtaatttggggaatgacagcaaaaatactagaaaacttt
ttaaattttttatcagaataacactcataataaattatcaaaacttttacataagaaatt
tataaaagtttctaaatttaacaattctaaaatatcaataactatattttgtagcacttt
tttattttattattgtttgaatatttgatggttttcaatgcaatttcaacataaatacta
tgtattagtgtatactgttgatgaattaaagtatgataatctatttaataaagtatgaag
taaatgattttaatgtgcctttatggtaaaattactaataagtaataaaattaattaaaa
tatatggaggtgcttataatgtttgctgtaggatttgttgttataattgcacttgccttt
ttcattttaagtgtactattatttaatggaaaagccagtatgctactagcaggttataac
tctatgagtaagaaagaaaaagcacgatacgataaaaaaaaattatgtagaagttctagc
attgttacttttattgtctctataatgctatttattatggcgtttttgggatatagaata
gagagtggtcaaatggatgaaaaaaaaatggttcccttttctataatatttataatagtc
atactttccagtgtattttttaatatcctctactctaacaaaaaatgtaaaaaataaata
gttgtaagttgagcagttaattataaaagattgactgctttttcatgtatattgactact
cttattaaatattttaacatttaaaaatctatgtaaaaataatgaatatagtacaaactt
ctaataatgattttacctttgtggttacagtccactatatataatttaatatgataacag
ggaattactaatgacaactaagtaaacttttataaaatataataaaacaaaaatagatgt
acaatgaaattatatcttatatcaaatttatttttattaatagcaaaaacttacattagc
ataacatatgacaaattcgcttaaaataaaaatttttaatataatttgttctatagtaca
tctattttgattagtttacataattttattattttgtacaatattaattatttactaata
tcccatttaatgaaaaagttctaggttcagtaattttgaccataactagcttaccaatta
aatcatcatttccaccttcgaaatttacgagtttattttgtctagttctaccagcaaact
tattttcattatttttacttcttccttcaactagaacttcaactattctatctttatatc
catcatttatttctgcagaaatcctatttacagcttctaacaccctattaaatctatcat
gctttatatcttctggtatttgattttccattttagcagcaggagttccctgtcttttag
aataaataaatgtaaaagctgaatcatatctaactttttcaaccacatctaaagtgtcca
ataaatcttcttctgtttctcctgggaaaccaatcattaagtctgtagaaaaagcaatac
ctggaacttcctttttagccttttctattatttctaaataatattcctttgtataatgtc
tattcatttttttcaaaaggctactgcttccacattgtattggtagatgtaaaaactcgc
acaccttatcacaatctctaattgcgtatattacttcatcagatatatcttttggatgag
atgtcataaatcgaaccctttcaattccttctatatcattcacttttcttaaaagttctg
agaatgaaactggattttcaagtgtcttaccataagaatctacattttgtccaagtaaag
tgatttctttcgttccatttgcaacaagctcttttatctcgttaattatatcttcaggag
ttctacttctttctcttcctcttgtgtatgggactatacaatatgtgcagaaattattgc
atccatacattatatttacaaatgcttttaattcaaattttctattacttctaagacctt
ctattacttctccatccacatcccatacatccactaacattttgtcagaatttattgatt
ctgtaagtaattgcggaaatttatatagattatgtgttccaaatataaggtctacatgtt
tatatttttttcttaattcctctacaacatgtggttgttgcatcatacatccacatacag
ctattttcatatctggattttttccttttagatgttttaattgtcctaagttaccataca
cttttagctctgcattttctctaactgcacaggtgttatatattattaaatcactttctt
caaccatcattgacatttggtatcccatctcttctaacattgaacataatttttctgaat
catgttcattcatttgacacccgaaggtttgagtaaacacgagttttctctttccagttc
tgttgaagtattcttcattttgtctgtgtatttgttctatatatttatcttgttcttgta
ttttctctataggtattgttacttgttttcttttgctcacgtctattcctcctagttaat
ttcttatattacacataaccttaattatatcaaataagaaaaatcttttaaagatattat
tatttttctagttgtgttttaatagtaaatctaatgatttatatatactatatttctaaa
atataaaatcatataattattataataataaaaagatgttttaaattaaaacttaaaaca
tctttccttaaataaaatatatgatttactattaaatacaattacatctattcattttca
attaaataacaatcatttaatattaaatattgaccttcctcaaccgttatatatcttctt
cctgaaaaagtatcattagtaactattccctctgcattacctaagctatcatttctaact
tcataatatgcatcagaagaatttgacattataatatattctccagcaggaatttctaat
ccaattttatacataccatttccaaacttaccattcttggccttctgggctttagcatac
tttgctaatgtcattgttgaatcctcaattttaatatactgaccattctttaaggtgata
tatctagtcccactaaaaatatcatttgaaagtatactatcagcattacctgtactatca
cttgtaacttcataataagaagcataacttcctgagtttgaagtaattaagtattcacct
gctgatatatcttttccaaccttatacattccatcttttatagtctttgtagtaggttta
acattttttacaaccccagtattaatatctccaattccatttgttatatttaaacactgt
tgtactatatttgaatctatatatcctatagaagttatcttcttagcattttttaaaatg
cttttattgctaccatcattaactaaaaccattggaccatgttttgataaagaagatcct
acaagtgcatttgttaattcataagctccagctatataaaactctctagcatccttataa
aacttatttattattgctttattagtttcaaaacgagtactcccccctagtctagtagat
ttagtattgtttactaaagtggtactcattgaagctgttcctcctattacataagacttt
aaaccactagttgaaaaaggtatactttgtccattagtaagaattattggtgctttatct
cttgctgctacagatgcaatacttatagcatctgcttctcctttatatgcattggttagc
ataacagtattgactttttttattgaatttatttcttttgcaacattataacttgttttt
attctgtcatttcccttaattcttacaactttcattttcttagattttaatgaattttcg
acagatgtactaatagaatatgttcctccaattatataaacttttgatacattttttaat
cttgcagatgtctcagttggtatagtatttttttcagttaatagtataggggcatttaaa
gctcctgctagtccacttgcacttaatccatctgcaatagagttactagtattaattaat
atagcagttttatatgcatttttatctgctattttacctgctatttcatacttatttttt
ccttgtattttttctacagatgatattgcatctactaattgaatatttgcaaatacaaaa
gaaatacttaaagtcaatgttaatattcttttatagaatttcataataaaattgtccccc
tcataataaatttttaatatataaatacatattcttaaattagttatgtacttaacaaac
ttatgtaaaattgcaaattatattaagcatattacaaataaatattaatacaattattca
tttagctataattgtatttacatttatattaaaaatcaactagatttgtataaatactta
taattatatttttattcttaatattttttttattatgttattttaatagatttatttttc
ttttttaagcatagagatgtatttttccatatattctatttctattatagtttcgcttat
ttaattcacccaaaatttcacttaatattagaattttaaatcttttactaaaacagactt
ttatagttctattaaaattttttactaaactttattttatactatgaattatctattttt
tttggctaaatttaagcaagtttttcacaaaaaatatatacattactatatttttaaaac
tttataaatatataattgatttaattggaaattttagtgtattcaaaaaatgagaaatca
gaggagattaatataaaaatttatcttgaaaagtcaattaaatatattttatatttaata
actacaaatgagatacatataagaatattatataggtatgataatttatctgttaaatta
agtgtaattggtactatataaatattttattaaaaataaatatataataccaaatcttta
aacaacataagaataaaatagttataatctactttattcttatgttatttagttattata
atgctttataaagtaaaatattatttcgtgtttaagcttgataactaactcttcttattg
atagactaacaatcttgaataaaaatattcctgcaactagatttattaaaacagctggta
atactactgctaagaataaagctgtaaatgaagcccctggaagaccaactatagcttgag
ctgctaataaaaagatagttccacttacaagagttcctattggcattattattgcaacta
ctacagtatcttgtgttttcttagctaatttttttataaaaggcatattataactaatat
tcattaataaaaatactatatttgctgtaagagttttatctattacattaggaatttgac
ctcccggaaaacttgatgtaagtgctgtaaatattcctgttactatacccgctatcaaac
aagttttataatcatctctatttaaaaccaatattacaaataacattgctagtggtacat
ctggcttcattggtaatcctatagctggtgtgatttgatgtattaataatcccatcgcta
aaagtattgcatttaaagttaatttttttgtatttgttttcattttttgtacttcctcct
atttttttaattttcaatttatttttttgccaacctactatatcatcatctttagctttt
gaaattcataacatctttctcaccaccttctatcttttaaattttcagtaaaataaaaaa
ctccgtcctaaactaataggacggagattatccgcgttgccacctaaattatataaaaat
taatataaaattcaattttcatacatctcattatcaggtacttacataccttattcgcta
taacgtgcgactgacgataaagtctactctcaaaactatgatttcaatttattcctctaa
gggccattcatcaaattttttcttgctaagattccaccatcctcagctctctatactgaa
cctaaatttaactactcttccttgtcataggatttaatttattgtattgaattttgttgt
taaaataatgatattcttttttctaaaaaatgtcaatacctttttataaaaaatatattt
tgtaatctattttttataaaaaaagtaaattatactatacatttcttttcatatacaaaa
ttctatgaataattactttaatggtctaatagtctgctctttggctctaattcttcttat
attaattttgtgaataactgttaatgtaattttatattttgattcatgaggaattaaatt
cttcaaagttaattaagtacctttatcaataaatttacttaattaaccatcatttaatac
tcattcctgtatttatatgcctcctttgaaacagaatattactccattttaattacatca
tattattaaatagataccaatgattaaaaaaatgatattcttttaattatttttagtaaa
attttttcttctttcttttaataaatattagcactactaaaactataatcaaaaatatga
ctattatggacaatattaattttgttaggatattatgtcttcttgcgttttgtcttttat
atttatttatagtttgatatccatactttttagttcttatacttcgttttttcaacttta
ctttacttttattatatttcctacttttatgtctacttttagatttaatagttttaaatt
tagtattatcatatgtataattctcttttattgaagaaatgtatacactagactcaataa
tagcttctgcttctacttgtaatggatttataatgctgattataagtagaaaagatatag
ctatcccaatcaattttttcttcttattcatattttccccctcataaaaatttttaacta
gttcattataatatatatataactaaaaattacaaattttttcaagtttcttatatatct
tattatctttaatattatttttattatcataacttttactttttttaagatttttcaaag
tagtattaatttatgatacttggtgtataaagtataagttaaatctactttcaattaaat
ttaccatttataattactttataataaaaataaattagttaatttattctctttagttct
gttataatgtttctacaaaaaagaatcccattaatgggattcttttttgtgatttattaa
tatatttaaagcttgctagtatcgtattataaacttaaatgctcttctatgtattgatta
tatacatatccagaatatcgtttttcatttttattgatattaactcttgcccattttcca
acgctataacatacttcaactttaaaaccatcagggattgtagttataactttagattct
aatgttctatcatttctaagttctaaacttaatccatttgttcttatatttcctatgtaa
ttcttttttctattttttattgtatcattactattgtttttagcattacttaatctttct
aaatatttataaagtaaccaacctttgtcataattactctcaacttctgcccatattcca
tctacacactttaacttaacaattttaccttctggtatactttttaatttcaaactattt
atgtctggtttttctcttaaattcaatttaattttagtcttaaaattgatgctagatttg
cgaaaattttttaacattaattcagatatcatcttaagccctcctcttgccaaatattaa
gttattaaaatatataactctaaaaatacttttaacaaaaagaattattatctttttggc
aactggctgacatgacctttattacataaagattttagtccctatagttttgcgtcatta
gatttatctaatattgcctatatctgaataataacataatttgaacaattaaaaaataat
attacctcaaattttatattatttaaatataaattaaatttttaattaataataatcaaa
aaatatctttatatttattcaattactgttctttatagtcaatataaaagacagtaattt
atctatagtgttacttatattttatatatatggctatttttcaacattttacaatatata
taacatttatttttttaacttttgtcagtaaaatgtcagcaaaacactttatccacaatt
tttatataagttttccacagcttatccccagtattatccacataaaaaaggtagctctta
cattattagctaccttttatttactaatcttcatatttccagctttttatccaacttcct
atttctattattttttcttcagttatttcttctccatcatgtaattttgaaattaattct
gataaaggattgttatgtaaacctctaaaaactctttttccctctattttgagatattct
ctctcttttattaatactgtatagtgtacatgcctcccaattctctatgatattaaaaaa
ccttttttggttaatctagctaaaagtataattgtagttgtatgcttccaaccatatgtt
ttttctatttcatctgcaacatcttttgatattacagttttataaccagtattccatatg
catttcataatttttaattctgtatctggtaattttttatttagcataatatattccttc
tttcaatttatgtcacttcttcaaatttatctagcttaaattataataggagctttttag
aacaaaaactatatttaatttttaccaggtactctacgtgtttagtctgtttttaagtgt
aaaataatgttcatatctataaatttatttaactttcaaacaatcctgttgaataataac
taattctattgtattattttagttgtagaataaaactaaatcggcaaaactagagaaatt
tagtgacgcaaagctatagggactaagacttatataaatatcttatgagttatgtcagcc
agttgccaaagagatagtgttctttttgtttttatgaaagttttttagggggataataat
ttatatgtttggaaataaaatggataaatgtacacatgtattgactgcttatattagcag
ttcgtatgattattgtaattttttagatacacaattagatgattttatattagagtacgg
agaaagtgtagtagagtcttgtttacaccaagtgatggtattggtaagtaagtataatta
gatagacattgatttctagagaaccctttttagttttatctacatttatattaatatata
gcaatgtaaaacgcttaaatatatttttaatattaagaataattaaaatgttaactaaaa
aatataattaagtagacatttctattaatctatgatacaatagtatttgtggtaatacac
aattaaatcaagtatatcttgatataggttaataggagtatttttaatgaataatggaat
agtgaaatggtttaataatgaaaaaggattcggttttatatcaatggaaggtagagatga
tgtgtttgctcatttctcagctatacaaacttcaggatttaaatcattagaagaaggtca
acaagtaagctttgatatagttaaaggtgctagaggtcctcaagcagaaaatataactat
attataatatatagatttttcgggaaagactctttttagagtctttttttattgttaata
tatgtaagataatcattggtgaagtaaataaggtatattgagtaatgttcttgatagttt
atatgctaatgaatttcaaaaaaataagcactcctataaaaagagtgctcttaatgtaaa
tataaaccttcattggtccagcctaataccccgtattctccaagttctaactatttttta
tatacattatcactttcatccatatctaacacaattatttcttctttagaatcaatttgt
aaaatatgaggactgtgtgttgtgacaattatttgtgtttttaggagaattgcttttaat
gtaataaaaattttacataccacatagttgatataaaactataataattacataagattg
taataataagacttatctttacataccacatagttgatataaaacaatgaaattaacata
caagagactaagacaattaaaatctttacataccacatagttgatataaaaccccaaaat
aaacttagcatctccaatgtttacacatatacaatgctcttaaaattgcagtgaacgcgc
aatagtgcaattgataatacttattatatattctcaatgccttatatttcaactgctaaa
cctcaatttgtcacaaatatcgctcactgcaaaatttctatatttttattatatcataac
atataattaatattttcaattaatttttacatttaattatgtttaaattctataataatg
caactttaatgtttctttctggaactaatataaaaactatttcagaaagattaggtcatg
cagatataaaaataactatgaatagctactctcagtttttagaagagatggacagagaag
catttgaaaatttgagcaaaatactatttattatattttaaagaagatgacttattcaat
atttgatgctagaatataattaataaaaatttaattataggtgattgtattatgaatatt
attaaaagcataactttactcttaacattattaattgtgatattaatgacaggctgttcc
ccaagagaaagtgctagtgaagttgcaaaaaaatatattgataagatgaactctggtgac
tatgaaacagcatatagtttattaagtaaagatagtaaaaaaaaaattagtatagaaaat
cttgaagaatttcaaaatattttagttagtacaaaaagaataattagttataaaataggt
aaagaaaaaatcataaaaaaatataaacatgatggaaaagaatataaaaatgttgttaaa
ttagaagaaacttttaatataaaaaaccttctttataaaaaagatgattctctaaaagta
aatagatattttgtagttgaaaataacaaatacaagctattattgtatgaaagtttcaaa
aaagaatttggtattaatagtatggaccttgctcaacttaagcttaatgattttggacta
aaatactttaaagaagttgaccttatactaaaaaaagctattgctattaatcctactgat
tcaaagctttattatgcccaagcatgtaattatatgaattttgatggatttcctggttat
tcagatacaacatataatgctttagattcaattaataaatctttaaagtatttagataaa
aatgattctgactacaaaaaaaatgcaagtaatatatataacttaaaaggagttattctt
atgtttcacaaaagatttgatgaagcacaacaatatttaaataaagccttatactttaac
aaagataatgaagacccaaaatataatctaaatacaataaaaaaacatctaaactagata
tttaatttttgaatttataaaatatttttttatgtataattcagcactgaatcataattt
ctactaaactaattacaagtttaaattataaagacttatttctatataaatattactcta
taacaataagtttcttatttaaattttaaaatattatctaaaaatcataaaaaagaaggt
ataaagagctaccctcaagctcaatataccttataaatatctaaacttcattttttacta
atttttctatatctttgataatatgttctttagatttttttccagctatggcatcaaaaa
ttgcaacagcctttttctctccaaacttttctgctacatcattaaagtctaaaaatctaa
cactttcttttggtttaccaaacatataacacctctcatacatttttatatatttattat
aacttctatagacttatttttcaccaataaacgttagacaaattagtccctttatttttt
taaactagctttaccttcaaaattcttaacaaaaacagtttattctactctataaataaa
aatagacaatttaatttgtaggaaactgataatagaatacagtaaataaaactttgttta
atctatctgaaaaagttatctattaaaactgctatgaatttataaagaatattctagttc
ataaaaatacaaatatgtaaatataatcaccttaatattcaatttatttaaaataaaaaa
tgtataaaagatttaataatgacaatatactattctcaatacaatctatgatgtaaataa
tttaaaactactatattatttaaaaatttatatttatatatgcaattctaaaaacttaat
aagaagtgaacttagaaaataaagcttaatttcaaagacttaaatagactattattatta
gtctaaataaactacgtctatcaaaattatatattaaattcttctaaaatttttattgca
aatcttgcgtttggatatgtaatagacccgccaccaattacacctatttttatagcttct
ataatttcatctttacttgctccagaattaatacaaccctcaatatgataacaaatacac
tcatcacatcggcttaaaattgaaatagctagtcccattaattccttattttttttgctt
atagccccttctgaataagtcttatcatcaagacttccaaatactctaaaaaactcatct
gtttcgcttaattttttattgtaaaatcccctatattctttcatttctctagtattcatc
ttctacctcctatgtttttcttataagaatatcacaccgtacttatattttcaatattaa
atacaaattttcattttatgttcattagcctaatttatattattttttgaaatctcaata
agttatcatataagtaagattttttcagaactaaaatagaaatcttagtaatttctttat
tatctatctcagttctgaaatatattattcttatccaaacattattatagtgattaatta
tattagttatttttacctgaaattttatacatcaaataagaatatataaatggtagtatt
acaattacaaagattacaaagatattataaaaaggaatattaataaatgcattaataatt
aataatattccaccaataagccaaatccatccagctaaatggtgtgtcttattccaatta
tcttcatcatta