Block details
fasta C_difficile_CD00133_1A_020483.fasta
contig u00000crpx_c_020483
start 2160156
length 15376
strand +
type core
seq ccatctctttcaagatactttaattcttgtgacagtatcttatgacttatatgaacaact
tctttttttaattgactgtaacgtattggctcttgttttaaaatatgccataaaataatt
gccctccatttacttcctatcacagtcatggtaaaaccaattgaacaattaaaatctttt
tgtctttcttcaatatttggaaattcttcaaaattattatctatatccatctcaatcctc
tctttcaaaatagtaagtatctaactaaaaagtgcattcttgtttagcgtactaattcgt
aatataatcttgattgtagtatagagccttacataatactacttttttagatgtatatgt
ttaaactttaatatagacatatgttattttattaattttatttaaacagataataataaa
taataatttatctcaagttttctatgtagataaactaatctaatgtttagaaaggattat
ataatatgaataaaaaatttcgtctttatcaagttgactcattacaaaagaaaaatttac
aggtaatccggctggtgtaattacaaatgctgatggcttatctgaatcacaaatgcaaaa
aataacaagagaattaaataattcagaaactgcttttattttcaataacttggctaaaaa
tcatcaagaaaattatgatgtacatatcagattttttacactaactaatgaggttcctat
atgtggtcatgctactattgctgcccattatgttagagcagtagaaaaccaattcaataa
caaaacagtatttcaaaaaactggtgctggaatattaccagttgatattataaaaaaaga
taatgattatgaaataattatgacacaaggaaaaattgaagtatctccaccattacaaca
aacctatcaaaaaagattacttaatgcatttggtattttaaaggaagatattcgtacaga
ttgtcctattgccatatcatctacaggacattcaaaagttatgattggaataaaggaatt
atcaacattaaatagtttatctccaaatttatatgaattatcgaaaataagtcaagaaat
aaaatgtaatggacattatatttttacattacataataaagaaactctacaagttcatgg
aagaatgtttgctcctgcaattggtatttcagaagaccctgttacaggaaatgctaatgg
acccttaggtgcgtaccttgtacattataaagtaatacctacacccaacacagagtttat
atttgaagcagttcaaggagaagcaataaacgcaaaggcaagatgttagtaaaagtaatt
attttagataataagccagttgaagtaaaaataattggaaaagctgtaattgcattctca
acaaacatagaaatctaattatagattccttctaagtaaatttttgaactttttaatact
aatttaataacaaactaatttatatacaatcaaattaatttttttattatttgttaatat
atatttatcattatattatataataatatagatagttactatatcttataattagataaa
tcataattatatattattgttaaaactcaattatataatttttaataatattattttagg
aggtaaaaatgataaacgatattaaaaataaattcaaaaattacaaaccatatataaatg
gatacaagaatatgaagagagcatctgttttaattccaatagtagaaataaataacacac
actatatattatttgaagttcgctcaaaaaatttgaagcatcaacctagcgaaatttctt
ttccaggtggtaaaatagaatcaggtgagactccatatgaagctgttattagagaaactt
gtgaggaacttggaacttttagtgacaatatagaagtaatatcaagtcttgacctcctta
taacaccagtaaagtttatcatacatccatacttaggatatataaaaaatattaataatt
taaatataaacaaggatgaagttgaccatacttttttagttcctataaaatatcttttag
agaatcctccaaatacttatagtaatactgtaaaagtttttccagatgaaaatctaccat
atggttcaattccaaaccaaaaagattataaatttgaaagtggaagttatcctattctgt
tttataaatataaagattatgtgatttggggaatgacagcaaaaatactagaaaactttt
taaattttttatcagaataacactcataataaattatcaaaacttttacataagaaattt
ataaaagtttctaaatttaacaattctaaaatatcaataactatattttgtagcactttt
ttattttattattgtttgaatatttgatggttttcaatgcaatttcaacataaatactat
gtattagtgtatactgttgatgaattaaagtatgataatctatttaataaagtatgaagt
aaatgattttaatgtgcctttatggtaaaattactaataagtaataaaattaattaaaat
atatggaggtgcttataatgtttgctgtaggatttgttgttataattgcacttgcctttt
tcattttaagtgtactattatttaatggaaaagccagtatgctactagcaggttataact
ctatgagtaagaaagaaaaagcacgatacgataaaaaaaaattatgtagaagttctagca
ttgttacttttattgtctctataatgctatttattatggcgtttttgggatatagaatag
agagtggtcaaatggacgaaaaaaaaatggttcccttttctataatatttataatagtca
tactttccagtgtattttttaatatcctctactctaacaaaaaatgtaaaaaataaatag
ttgtaagttgagcagttaattataaaagattgactgctttttcatgtatattgactactc
ttattaaatattttaacatttaaaatctatgtaaaaataatgaatatagtacaaacttct
aataatgattttacctttgtggttacagtccactatatataatttaatatgataacaggg
aattactaatgacaactaggtaagcttttataaaatataataaaacaaaaatagatgtac
aatgaaattatatcttatatcaaatttatttttattaatagcaaaaacttacattagcat
aacatatgacaaattcgcttaaaataaaaattttaaatataatttgttctatagtacatc
tattttgattagtttacataattttattattttgtacaatattaattatttactaatatc
ccatttaatgaaaaagttctaggttcagtaattttgaccataactagcttaccaattaaa
tcatcatttccaccttcgaaatttacgagtttattttgtctagttctaccagcaaactta
ttttcattatttttacttcttccttcaactagaacttcaactattctatctttatatcca
tcatttatttctgcagaaatcctatttacagcttctaacaccctattaaatctatcatgc
tttatatcttctggtatttgattttccattttagcagcaggagttccctgtcttttagaa
taaataaatgtaaaagctgaatcatatctaactttttcaaccacatctaaagtgtccaat
aaatcttcttctgtttctcctgggaaaccaatcattaagtctgtagaaaaagcaatacct
ggaacttcctttttagctttttctattatttctaaataatattcctttgtataatgtcta
ttcatttttttcaaaaggctactgcttccacattgtattggtagatgtaaaaactcgcac
accttatcacaatctctaattgcgtatattacttcatcagatatatcttttggatgagat
gtcataaatcgaaccctttcaattccttctatatcattcacttttcttaaaagttctgag
aatgaaactggattttcaagtgtcttaccataagaatctacattttgtccaagtaaagtg
atttctttcgttccatttgcaacaagctcttttatctcgttaattatatcttcaggagtt
ctacttctttctcttcctcttgtgtatgggactatacaatatgtgcagaaattattgcat
ccatacattatatttacaaatgcttttaattcaaattttctattacttctaagaccttct
attacttctccatccacatcccatacatccactaacattttgtcagaatttattgattct
gtaagtaattgcggaaatttatatagattatgtgttccaaatataaggtctacatgttta
tatttttttcttaattcctctacaacatgtggttgttgcatcatacatccacatacagct
attttcatatctggattttttccttttagatgttttaattgtcctaagttaccatacact
tttagctctgcattttctctaactgcacaggtgttatatattattaaatcactttcttca
accatcattgacatttggtatcccatctcttctaacattgaacataatttttctgaatca
tgttcattcatttgacacccgaaggtttgagtaaacacgagttttctctttccagttctg
ttgaagtattcttcattttgtctgtgtatttgttctatatatttatcttgttcttgtatt
ttctctataggtattgttacttgttttcttttgctcacgtctattcctcctagttaattt
cttatattacacataaccttaattatatcaaataagaaaaatcttttaaagatattatta
tttttctagttgtgttttaatagtaaatctaatgatttatatatactatatttctaaaat
ataaaatcatataattattataataataaaaagatgttttaaattaaaacttaaaacatc
tttccttaaataaaatatatgatttactattaaatacaattacatctattcattttcaat
taaataacaatcatttaatattaaatattgatcttcctcaaccgttatatatcttcttcc
tgaaaaagtatcattagtaactattccctctgcattacctaagctatcatttctaacttc
ataatatgcatcagaagaatttgacattataatatattctccagcaggaatttctaatcc
aattttatacataccatttccaaacttaccattcttggccttctgggctttagcatactt
tgctaatgtcattgttgaatcctcaattttaatatattgaccattctttaaggtgatata
tctagtcccactaaaaatatcatttgaaagtatactatcagcattacctgtactatcact
tgtaacttcataataagaagcataacttcctgagtttgaagttattaagtattcacctgc
tgagatatcttttccaaccttatacattccatcttttatagtctttgtagtaggtttaac
attttttacaaccccagtattaatatctccaattccatttgttatatttaaacactgttg
tactatatttgaatctatatatcctatagaagttatcttcttagcattttttaaaatgct
tttattgctaccatcattaactaaaaccattggaccatgttttgataaagaagatcctac
aagtgcatttgttaattcataagctccagctatataaaactctctagcatccttataaaa
cttatttattattgctttattagtttcaaaacgagtactcccccctagtctagtagattt
agtattgtttactaaagtggtactcattgaagctgttcctcctattacataagactttaa
accactagttgaaaaaggtatactttgtccattagtaagaattattggtgctttatctct
tgctgctacagatgcaatacttatagcatctgcttctcctttatatgcattggttagcat
aacagtattgactttttttattgaatttatttcttttgcaacattataacttgtttttat
tctgtcatttcccttaattcttacaactttcattttcttagattttaatgaattttcgac
agatgtactaatagaatatgttcctccaattatataaacttttgatacattttttaatct
tgcagatgtctcagttggtatagtatttttttcagttaatagtataggggcatttaaagc
tcctgctagtccacttgcacttaatccatctgcaatagagttactagtattaattaatat
agcagttttatatgcatttttatctgctattttacctgctatttcatacttattttttcc
ttgtattttttctacagatgatattgcatctactaattgaatatttgcaaatacaaaaga
aatacttaaagtcaatgttaatattcttttatagaatttcataataaaattgtccccctc
ataataaatttttaatatataaatacatattcttaaattagttatgtacttaacaaactt
atgtaaaattgcaaattatattaagcatattacaaataaatattaatacaattattcatt
tagctataattgtatttacatttatattaaaaatcaactagatttgtataaatacttata
attatatttttattcttaatattttttttattatgttattttaatagatttatttttctt
ttttaagcatagagatgtatttttccatatattctatttctattatagtttcgcttattt
aattcacccaaaatttcacttaatattagaattttaaatcttttactaaaacagactttt
atagttctattaaacttttttactaaactttattttatactatgaattatctattttttt
tggctaaatttaagcaagtttttcacaaaaaatatatacattactatatttttaaaactt
tataaatatataattgatttaattggaaattttagtgtattcaaaaaatgagaaatcaga
ggagattaatataaaaatttatcttgaaaagtcaattaaatatattttatatttaataac
tacaaatgagatacatataagaatattatataggtatgataatttatctgttaaattaag
tgtaattggtactatataaatattttattaaaaataaatatataataccaaatctttaaa
caacataagaataaaatagttataatctactttattcttatgttatttagttattataat
gctttataaagtaaaatattatttcgtgtttaagcttgataactaactcttcttattgat
agactaacaatcttgaataaaaatattcctgcaactagatttattaaaacagctggtaat
actactgctaagaataaagctgtaaatgaagcccctggaagaccaactatagcttgagct
gctaataaaaagatagttccacttacaagagttcctattggcattattattgcaactact
acagtatcttgtgttttcttagctaatttttttataaaaggcatattataactaatattc
attaataaaaatactatatttgctgtaagagttttatctattacattaggaatttgacct
cccggaaaacttgatgtaagtgctgtaaatattcctgttactatacccgctatcaaacaa
gttttataatcatctctatttaaaaccaatattacaaataacattgctagtggtacatct
ggcttcattggtaatcctatagctggtgtgatttgatgtattaataatcccatcgctaaa
agtattgcatttaaagttaatttttttgtatttgttttcattttttgtacttcctcctat
ttttttaattttcaatttatttttttgccaacctactatatcatcatctttagcttttga
aattcataacatctttctcaccaccttctatcttttaaattttcagtaaaataaaaaact
ccgtcctaaactaataggacggagattatccgcgttgccacctaaattatataaaaatta
atataaaattcaattttcatacatctcattatcaggtacttacataccttattcgctata
acgtgcgactgacgataaagtctactctcaaaactatgatttcaatttattcctctaagg
gccattcatcaaattttttcttgctaagattccaccatcctcagctctctatactgaacc
taaatttaactactcttccttgtcataggatttaatttattgtattgaattttgttatta
aaataatgatattcttttttctaaaaaatgtcaatacctttttataaaaaatatattttg
taatctattttttataaaaaaagtaaattatactatacatttcttttcatatacaaaatt
ctatgaataattactttaatggtctaatagtctgctctttggctctaattcttcttatat
taattttgtgaataactgttaatgtaattttatattttgattcatgaggaattaaattct
tcaaagttaattaagtacctttatcaataaatttacttaattaaccatcatttaatactc
attcctgtatttatatgcctcctttgaaacagaatattactccattttaattacatcata
ttattaaatagataccaatgattaaaaaaatgatattcttttaattatttttagtaaaat
tttttcttctttcttttaataaatattagcactactaaaactataatcaaaaatatgact
attatggacaatattaattttgttaggatattatgtcttcttgcgttttgtcttttatat
ttatttatagtttgatatccatactttttagttcttatacttcgttttttcaactttact
ttacttttattatatttcctacttttatgtctacttttagatttaatagttttaaattta
gtattatcatatgtataattctcttttattgaagaaatgtatacactagactcaataata
gcttctgcttctacttgtaatggatttataatgctgattataagtagaaaagatatagct
atcccaatcaattttttcttcttattcatattttccccctcataaaaatttttaactagt
tcattataatatatatataactaaaaattacaaattttttcaagtttcttatatatctta
ttatctttaatattatttttattatcataacttttactttttttaagatttttcaaagta
gtattaatttatgatacttggtgtataaagtataagttaaatctactttcaattaaattt
accatttataattactttataataaaaataaattagttaatttattctctttagttctgt
tataatgtttctacaaaaaagaatcccattaatgggattcttttttgtgatttattaata
tatttaaagcttgctagtatcgtattataaacttaaatgctcttctatgtattgattata
tacatatccagaatatcgtttttcatttttattgatattaactcttgcccattttccaac
gctataacatacttcaactttaaaaccatcagggattgtagttataactttagattctaa
tgttctatcatttctaagttctaaacttaatccatttgttcttatatttcctatgtaatt
cttttttctattttttattgtatcattactattgtttttagcattacttaatctttctaa
atatttataaagtaaccaacctttgtcataattactctcaacttctgcccatattccatc
tacacactttaacttaacaattttaccttctggtatactttttaatttcaaactatttat
gtctggtttttctcttaaattcaatttaattttagtcttaaaattgatgctagatttgcg
aaaattttttaacattaattcagatatcatcttaagccctcctcttgccaaatattaagt
tattaaaatatataactctaaaaatacttttaacaaaaagaattattatctttttggcaa
ctggctgacatgacctttattacataaagattttagtccctatagttttgcgtcattaga
tttatctaatattgcctatatctgaataataacataatttgaacaattaaaaaataatat
tacctcaaattttatattatttaaatataaattaaatttttaattaataataatcaaaaa
atatctttatatttattcaattactgttctttatagtcaatataaaagacagtaatttat
ctatagtgttacttatattttatatatatggctatttttcaacattttacaatatatata
acatttatttttttaacttttgtcagtaaaatgtcagcaaaacactttatccacaatttt
tatataagttttccacaacttatcaccaatattatccacataaaaaaggtagcacttata
ttattagctaccttttatttattaatctttatatttccagctttttatccaacttcctat
ttctattattttttcttcagttatttcttctccatcatgtaattttgaaattaattctga
taaaggattgttatgtaaacctctaaaaactctttttccctctattttgagatattctct
ctcttttattaatactgtatagtgtacatgcctcccaattctctatgatattaaaaaacc
ttttttggttaatctagctaaaagtataattgtagttgtatgcttccaaccatatgtttt
ttctatttcatctgcaacatcttttgatattacagttttataaccagtattccatatgca
tttcataatttttaattctgtatctggtaattttttatttagcataatatattccttctt
tcaatttatgtcacttcttcaaatttatctagcttaaattataataggagctttttagaa
caaaaactatatttaatttttaccaggtactctacgtgtttagtctgtttttaagtgtaa
aataatattcatatctataaatttatttaactttcaaacaatcctgttgaataataacta
attctattgtattattttagttgtagaataaaactaaatcggcaaaactagagaaattta
gtgacgcaaagctatagggactaagacttatataaatatcttatgagttatgtcagccag
ttgccaaagagatagtgttctttttgtttttatgaaagttttttagggggataataattt
atatgtttggaaataaaatggataaatgtacacatgtattgactgcttatattagcagtt
cgtatgattattgtaattttttagatacacagttagatgattttatattagagtacggag
aaaatgtagtagagtcttgtttacaccaagtaatggtattggtaagtaagtataattaga
tagacattgatttctagaaaaccctttttagttttatctacatttatattaatatatagc
aatgtaaaacgtttaaatatatttttaatattaagaataattaaaatgttaactaaaaaa
tataattaagtagacatttctattaatctatgatacaatagtatttgtggtaatacacaa
ttaaatcaagtatatcttgatataggttaataggagtatttttaatgaataatggaatag
tgaaatggtttaataatgaaaaaggattcggttttatatcaatggaaggtagagatgatg
tgtttgctcatttctcagctatacaaacttcaggatttaaatcattagaagaaggtcaac
aagtaagctttgatatagttaaaggtgctagaggtcctcaagcagaaaatataactatat
tataatatatagatttttcgggaaagactctttttagagtctttttttattgttaatata
tgtaagataatcattggtgaagtaaataaggtatattgagtaatgttcttgatagtttat
atgctaatgaatttcaaaaaaataagcactcctataaaaagagtgctcttaatgtaaata
taaaccttcattggtccagcctaataccccgtattctccaagttctaactcttttttata
tacattatcactttcagccatatctaacacaatcatttcttctttagaatcaatttgtaa
aatatgaggactgtgtgttgtgacaattatttgtgtttttgggagaattgcttttaatgt
aataaaaattttacataccacatagttgatataaaactattaagttttctatgtttatat
tcatattcaaacaactttacataccacatagttgatataaaaccttagtgtataaacatc
ctttaaggtcaataggctcttgtctttacataccacatagttgatataaaacatgtagtt
gttactttccagctacactcatgctccactttacataccacatagttgatataaaacccc
aaaataaacttagcatctccaatgtttacacatatacaatgctcttaaaattgcagtgaa
cgcgcaatagtgcaattgataatacttattatatattctcaatgccttatatttcaactg
ctaaacctcaatttgtcacaaatatcgctcactgcaaaatttctatatttttattatatc
ataacatataattaatattttcaattaatttttacatttaattatgtttaaattctataa
taatgcaactttaatgtttctttctggaactaatataaaaactatttcagaaagattagg
tcatgcagatataaaaataactatgaatagctactctcagtttttagaagagatggacag
agaagcatttgaaaatttgagcaaaatactatttattgtattttaaagaagatgacttat
tcaatatttgatgctagaatataattaataaaaatttaattataggtgattgtattatga
atattattaaaagcataactttactcttaacattattaattgtgatattaatgacaggct
gttccccaagagaaagtgctagtgaagttgcaaaaaaatatattgataagatgaactctg
gtgactatgaaacagcatatagtttattaagtaaagatagtaaaaaaaaaattagtatag
aaaatcttgaagaatttcaaaatattttagttagtacaaaaagaataattagttataaaa
taggtaaagaaaaaatcataaaaaaatataaacatgatggaaaagaatataaaaatgttg
ttaaattagaagaaacttttaatataaaaaaccttctttataaaaaagatgattctctaa
aagtaaatagatattttgtagttgaaaataacaaatacaagctattattgtatgaaagtt
tcaaaaaagaatttggtattaatagtatggaccttgctcaacttaagcttaatgattttg
gactaaaatactttaaagaagttgaccttatactaaaaaaagctattgctattaatccta
ctgattcaaagctttattatgcccaagcatgtaattatatgaattttgatggatttcctg
gttattcagatacaacatataatgctttagattcaattaataaatctttaaagtatttag
ataaaaatgattctgactacaaaaaaaatgcaagtaatatatataacttaaaaggagtta
ttcttatgtttcacaaaagatttgatgaagcacaacaatatttaaataaagccttatact
ttaacaaagataatgaagacccaaaatataatctaaatacaataaaaaaacatctaaact
agatatttaatttttgaatttataaaatatttttttatgtataattcagcactgaatcat
aatctctactaaactaattacaagtttaaattataaagacttatttctatataaatatta
ctctataacaataagtttcttatttaaattttaaaatattatctaaaaatcataaaaaag
aaggtataaagagctaccctcaagctcaatataccttataaatatctaaacttcattttt
tactaatttttctatatctttgataatatgttctttagatttttttccagctatggcatc
aaaaattgcaacagcctttttctctccaaacttttctgctacatcattaaagtctaaaaa
tctaacactttcttttggtttaccaaacatataacacctctcatacatttttatatattt
attataacttctatagacttatttttcaccaataaacgttagacaaattagtccctttat
ttttttaaactagctttaccttcaaaattcttaacaaaaacagtttattctactctataa
ataaaaatagacaatttaatttgtaggaaactgataatagaatacagtaaataaaacttt
gtttaatctctctgaaaaagttatctattaaaactgctatgaatttataaagaatattct
agttcataaaaatacaaatatgtaaatataatcaccttaatattcaatttatttaaaata
aaaaatgtataaaagatttaataatgacaatatactattctcaatacaatatatgatgta
aataatttaaaactactatattatttaaaaatttatatttatatatgcaattctaaaaac
ttaataagaagtgaacttagaaaataaagcttaatttcaaagacttaaatagactattat
tattagtctaaataaactacgtctatcaaaattatatattaaattcttctaaaattttta
ttgcaaatcttgcgtttggatatgtaatagacccgccaccaattacacctatttttatag
cttctataatttcatctttacttgctccagaattaatacaaccctcaatatgataacaaa
tacactcatcacatcggcttaaaattgaaatagctagtcccattaattccttattttttt
tacttatagccccttctgaataagtcttatcatcaagacttccaaatactctaaaaaact
catctgtttcgcttaattttttattgtaaaatcccctatattctttcatttctctagtat
tcatcttctacctcctatgtttttcttataagaatatcacactgtacttatattttcaat
attaaatacaaattttcattttatgttcattagcctaatttatattattttttgaaatct
caataagttatcatataagtaagattttttcagaactaaaatagaaatcttagtaatttc
tttattacctatctcagttctgaaatatattattcttatccaaacattattatagtgatt
aattatattagttatttttacctgaaattttatacatcaaataagaatatataaatggta
gtattacaattacaaagattacaaagatattataaaaaggaatattaataaatgcattaa
taattaataatattccaccaataagccaaatccatccagctaaatggtgtgtcttattcc
aattatcttcatcattc