Block details
fasta C_difficile_CD00133_1A_020483.fasta
contig u00000crpx_c_020483
start 2060306
length 12691
strand +
type core
seq taatatactatatcaagcaacattaggagctcaaattccagttaatacaaacgcaccaga
atggaaagaagtaggtactgtgattaattctcaaaataataatcaacttacagtagaatt
ttttagtgaaggagaaagcgccattggaaatgactatgctatagatgatgtttctttaag
agaaatagctgttccaacttttactccaataaaaacaagtaacacagaaactgctaatgt
aggtgatataatcacatatacagttacattagataatacttgtgatagccctttaactaa
tgtattttttagggatttaattccaaatggtttagagtttatacctggaactgtaacggt
tgatggagtatctgtaccaggagtagaccctaatacaggtttcccacttccagatattgg
aggaggaacaggggttgaagtaacttttgatgttgtggttgaaagtattcctaacccaaa
tcctactaataatatagctaatatagattactcttatacacctgtagaaggcggtatacc
aaatgatttttcagtagattctaatccagttcctgttgaagtaatctcagcagatattga
agttacaaaattatctgaacctactatagtgaatccaggagaggaattaatatacactat
aaaagtagtaaataatggaccattcccatctgaaaatgtggttttaacagatgatgtacc
agcttctattataaatccagagtattcattagatggaggagtaacttttcaaccatggac
tggaagtttaaatatagggacattagaagtaggagagacaagagttattataattagggg
tattgtaaatccatcaacagtaggaattataacaaatacagctgtagtatcttcaactac
agcagacccaaaccttaataataatacatctacaatagagacagaagtgaatttattagc
agatattttagtaatgaaaacagcagaacctaattcagctgttccaggtactttattgag
atatactattcaagtagaaaacttaggaccagcaaatgctgaaaatgtaatattaaatga
tgatattccagcttctattataaatccagaatattcattggatggaggagcaagttttca
accatggaatggaagtcttaatataggaactttaaactctggaatttcattaacagtttt
aattcaaggaacagttagtttaaattcttcagaatatatagtaaatacagcaacagtttc
ttcaactacacctgacccagatttaagcaacaatatatctaccattattacaccagttaa
cccacaagcaggtatttctattataaaagtagctgacgaggatgtagctgttccaggaga
agaatttgtatatacaattgaaatttttaatgaaggaccatctaatgctacgaatgtagt
tttaacagatgatataccagatgttattttaaatccagaatattcattggatggaggagc
aactttccaaccatggactggaagtcttaatataggtacagttgcaccagggcaattaat
aagaattatcataaagggattagtaagttcaactgctacaggagatattactaatacagc
agaagtaagtgcagatgtaccagaaccagttacggattcatcaacagtgacaactcctat
agttccatcagcagatatagaagtaataaaaactagcaatatggatacagcagttccagg
agaaacttttagttatactataacagttacaaatttaggaccatctgctgcacaaagtat
cgttttgacagatgatataccagatgttattttaaatccagagtattcattggatggagg
agtaactttccaaccatggaatggaaatcttagtataggcactttggatgctggagaaat
aagaagtattataataagaggaacagtgagccagacagcagtaggtacaattataaatac
agcaacagtaagttcacctacacctgacccaaatccagataataatacttcaacagatga
aacagatataagtccattagcagatatttctgtgataaaaggcaacgaaccagttgctat
accagggggaagatttatttatggaattgaaattgcaaatgcaggaccatcttttgcaga
gaacgtaactttaacagataatataccagcttctattttaaatccagagtactcaataga
taatggagtgactttccaaccatggaatggaagccttaatataggtactttagatgctgg
agagataagaaatatcataataaggggaacagtaagtcaaacagcaataggcacaattgt
aaatacagcaacagtaagttcaactacacctgacccaaatctaaataacaatacttcaac
atcagaagcagaggtaagttcatcagcagatatttctgtagtaaaacgaagcaatcagac
tgttgttgtaccaggagatgtactagactatacaattgaggtgagaaatgcaggaccttc
tactgctcagaacgtaactttaacagataatataccagcttctattttaagtccagaata
ttcaatagataatggagtgacttttcaaccatggaatggaagtcttagtataggcacttt
agatgctggagagataagaaatattataataaggggaatagtaagtcaaacagcaatagg
tacaattataaatacagcaacagtaagttcaactacacctgacccaaatccagataataa
tacttcaacagatgaaatagatataagttcatcagcagatatttctgtaataaaattagc
aaataaaacagaagcatgtgtaggagagcaaatagattttgtaatagtagtatcaaatgc
aggaccagaaaatgctcaaaatgttactttaatagacaatgtttcagataagcttaagaa
agcagtattttcacttgatagaggtgtaagtttccaaccatggactggaagtcttaatat
aggtacactaccagctggaactttaagagtgattatattaagaggaattataaaatcaac
atgtcttgatagattaacaaatattgcagaagttacttcaacaacaccagattcaaacct
taacaataatatatcaagagtgcaagtagaaataaaacaatgttgttgtaatgattgctg
ttgtaacaactgtagtaattgttgttgcaatgattgtggttgtaaagattgttgctgtaa
ttgttgtaaaaatgacttttggtgttgattttataaaataattttgtataccttaaatta
aactgaaataaaaaataaattcacatatgagtaaaatattttataaatattaataaattt
tctatctttgatatggaccacattcgtaatactagttattaaatgaagtggtccttttta
attcattaaaattatttattctaattaaattttaaatgtattaaataattttaatttttt
ataaaaaatattgatatgttatttatattaaagtttagatatctaaaaatacttttagaa
tttattatattatgttaattttttatatcttataaggattgtatttttctaactataaaa
atagtattatacttatatttaaaaataaaagaattttattcctattgtgtaaagtgagaa
tactattttcttatattggtataataatagtaaatctataatatagaaaagaggtatttc
tagtatgcatgaaaataaaaagaatctattagacggaagcttagctcaatataatgatac
agcagttccaaaaataccagtatttgctggtaacgatataacttcagaagtttattattt
taaacctaatcaagttcttaatgctcatagacaccctaatggtgaacaaatatttgtgtt
cctaaaaggagaaggtaaaatgaaacttggtgagcatgaatgtgatgtaaaaaacggcga
tactgtatttgtaccaacaggagagtggcatgaaattactaatggaagcaatgaagaaat
ggtagccgttcaaattacaaaaattaatgctggagcagaatacagaggatagatatataa
gtacagttagtactttaatatctattttattatataaactttaatctcaaatataaaaag
agtcttttaaaaggctctttttatatttttgttaattttcattataaaaacaagaaaata
tctagctaaaactaatatattttatttaatattttttatagcattgtttgcaaactcagt
atttacgatatctttataaggtgcttccttatctagttctttagcttctttcataacagt
catcaatttcttcaaaccttcctcttttaatacaggattttgagaccatgcatctattga
tttatatctatctacaactgttgttaaatcttctaaagatatatcttcaaagaaaggttg
catagccttagctacttctttgctagatgcttgttgaatccataattgacctttataaac
agcgtttgtaaatctttgaattaaatctttattgtttttcatgtatgatctcgtagtaga
gtatgctgtaaaaggtatttctccagaatcttttcctatagatgtaactatatatccact
accttctttttccattgctgttgctgtaggttcaaatgctgttgtaaagtcaccctctcc
acctgcaaaagctccagccattacaccaaattgtacatcagttcttacattaacattgcc
tgcttttagattttctccaatagtaagacctttttcttttagaacatattcaaaagtcat
tagtggaactccaccttttctaccacctaatatttctgttccttttaaatcattgtaaga
gaaattaggcatttttttcctagcaactagaaaactaccatctctttttgtcaattgagc
aaagttcactgcataatcgtttttgttttgattatatacatatatagatgcttcaggacc
cattaaacctacgtttgcttcacctgaaatcaaagctgccatagttttatctgcaccttg
ggtatttataaggtcaatctttataccttcatcttcaaagaatcctttcgtaatagcagc
atactgtggagcataaaaaacagagtgagtaacttctgctatagttactttatccagatt
tttagacgaagaagattcatcttttttgtcattagagttaaaatcacatccagttagaca
tattgtacttacaatgatagagcttgctattgcgactatttttttaaacataataaatac
ctcccataagacatacgaatagtatatagtattaaatatttattgtagttgttacaaaaa
tgtatctatacttataatatttctacaaaaacttaataataattttcagttttatgttta
gttttttcagtaatgtgtaatattggataaattatattgattatttataaactaagtaat
aaaattaaaataatatcacttttttgtctattatatataaggaaaaattttttaataata
taaatcatattcatttatattattaaaaaatttgtttatagaaacttttattattttata
taaaagtgataaaaacttatattttgtatttaatagagtgttgctaagtgaatatattta
aaatggaggaaactttatgaaacaaaataaatatgatgatgatagattttttaataaata
cagtaaaatggaacgttctacaaatggattagcaggtgctggagaatggcatgttttaaa
aaaaatgttacctgatttcaaaggaaaaagagttttagatttaggatgtggatttggatg
gcattgtcaatatgcagttgagaatggagcaatttctgctgttggagttgatatttcaga
aaaaatgttaaaagaagctagaaacaaaacgcaacttgataatataaattacatatgtat
gcctattgaagatattaattttccaaaagatagttttgatgtagttattagttccttggc
atttcattatattcaatcatttgaagatatatgtaagaatataagtaattgtctttcaaa
taaaggtaattttgtattttctgttgaacatcctatatttactgcatatggaagtcaaga
gtggtactgtgataaagatggaaataatctacactggccagtagatagatattttgaaga
aggagtacgtaagtcaaattttctaggagaagaggttataaaatatcataaaacattaac
aacttatttaaatacgttaatgaaaacaggatttgaaatattagaaattattgaacctca
accagaagaaaaactgttagatacaattcctgatatgaaagatgagctacgtagacctat
gatgttacttgtatctgcaaaaaaaagataagtaaatataaataatcattattgtagaaa
aaaagttgtagaaaataattacactaatggagatgattataccagtggtattaattacac
cagtagtaaggaggcaaaagcattcgttgcttttgccattttttaagttgcaattatact
tctacgtagtatatttcgtttccattttcttctataagctttttcatatcttcaaatttt
aaaaatacagtagcagtattatcatttggatgtatacctattttatccatttttaataaa
tccttatcaaatacaacttttacaacagcctctttatcatttaatataccaaaaggagtc
acagctcctttagtaagtttcaagtatttttgaagtctttcttctgatgcaaaactaaga
ggtttactatcaatttgttgacgaatatcttttaaatctgcttttttgtctttacctaat
acaactaaaaaatgttcttttcctttagcatcacgaagaaataggttttttacaacaaat
tccatatgtaatgtttttaattcttccatttcttcaattgtataaactggtggatgattt
acagcctcataaggtatgcttaactcatctaattttttatatacttcctgttgttgattg
ttcatgatttcctcccattagaaatttattttatatataaataatattatcacagaaaac
tttaaaagaaaacgttttatataatatagacaatagattatatttttataaagaagcaag
aatactcaataaaacttaaagaaattaaacgatttctaaaaataccttgaaaatagaacc
ttatttgccatttataaattatataaaaagggattatataaagtcatatatgaaaaaact
atattatactatcttttctttttggaataaactatactttaaatatagatatttaattta
aataaattttacagtattaatagtaaattatcttagaaaggaatgtgctttatatgtcta
cagacaaagttgttggaatcatagatgaagaaacggcagaacttgcaggaattgaatata
ctggtaaaatttatgcttcttctggtgttataaaacatataaagaaaaaacatagatgtc
aactgagtaaggatatttttaatgatataatagacactataaaaatggtattaaagtcac
ctgaatatataggaagtcatcctaaaaaacctggaaaaagtgtggagtttataaaaaaaa
ttgatgattatattttagtagctacagaattagatacaaaaaaaggatatttatatgtat
cttcaatgtatgctataaaagaagcaaaattagaaagtagagtaaacagtggaagagtaa
aacaatatgatggttaacataatattattaattttccctaaaatattgaaaaatattatt
atataagttataatattaatatacacgtagatatttattagttagatttgaggttggaaa
aggcacccaatacgctactatagagtagttaatagagatgcaggatacgccgccctgcca
aatctaattaaattaaaaagagaggattaattcctctcttattgtttttttgagatacta
atttaatctataatagaaagattgaaggtcgtttatacaaaaaaattttcagttatatac
attaaactaattaaataagatatttataatctatatgtgatacatattatatattaataa
aagaaaaatatatagaaaatccttataaaaatttaaattgtaatgaataggaagtaatta
aaaagaatttttattgatttttaaaaatttagttagaaactatatcattatggtaaaaaa
tgtattataatgtttagaaatattataataaggagcgattaaacatgaatctatcgaaga
aaatagaagataaaagaaaagctaaacagagagctgaaaaagttaagaaagctaaaattg
ctacagctggtgtggtattaggagctgttactggtgcagtgagtggagtacttttggctc
ctaaatctggaaaagaaacaagagaggatataaaagatgcttcacaacaaattgctgaaa
agataaatatgaaaactgtagatgtaaaaggcaaagtatctgagaagctagaggataaaa
aaggaaactttatagaatcaaagaaaaaaataaaaaaatatatagataacaaaaagagtg
ttgaaaattctagtgaggaagataaaataatagatatagttgaaccagttagtgttactg
aggaataatatggacaatacaataacgattaacataagtataatatatgtattattagct
atacttgcttgtattgctttagtttatttaattattgtacttgttaaactacataagatt
ttaaataatgttggaactatgttaaatgaaaatactcaaaatataaatacaactttaaat
aatcttcctaatgttgtagaaacttttggagaagtaggagaaaatatgaaagatgtaaca
gaagtagttactgaagttacagcagattttcttgttactaaagacagtgtcaaatcaaat
atggatgttatagttgatatattgactataattaaaaacatttttgtagataaaaaataa
taagttaatataaaataagcctataagatataatttaaacgaccttaaaatagcatttat
aaggtcgttttttattagcttgatttgacactatgtgtttttaataattggtaatattcc
tctttatcatttgaacatatatatctatgcttgttgtttcaattacatccataagaacat
ctttacattcaagctcaaaatcttccattccttctaaatattcatcatcttcatcaaaaa
agatataagaattatatagccattcttcaaatttttcttcaagtatatcccaatacgaac
tccaaaataatccacaacctgatatataagatgctctactttgatttatataaacctcat
ttagaagcttttgtaatctactgctataaagaaaatctgctcttccactgcttgatatta
attcatttaaatcttctattgacattaattcaactttaccacttttatcataaggagtat
aattttcatcaacccatttatgtggtttgttttctctgcatactgttgctatcaactcta
caacttttgttcttatcatttttttatcctaacttatttattttttataaaataatcatg
attttataatttatctatttcttgtaatgctaatttaacagtttcatatctatcagcacc
atttattactacatcaccttttacaagtttattagcttctccacctacaacataaacctt
tttacctaaaccttgcttataactagacgcctcaattattaaagaatctttcaattgcca
atgtaaaatctgagcagccactttatcagcatcacctgtataaacgattacattttcata
cactttattttcccctcccccttgagaatttgatatagatttgtttagtataccttctgc
tatcaatttagcaactttatctttattattaacataataatctgtatctgctttactatc
tacaaaacatacttctattaatattgctggtgcaatagtatgattaagccaataaagacc
tctaacatcagactttgcacccctatctttgaatactgtagctaacctagtattcactct
ttctgcataggttttgccattattagtcttatatattgtttctgtccctactggagttga
agttgtagcatttgaattaaaatgaatctgaacagccaaatcagtttcctgtttatttgc
tatagcacattggtctgctaaatgattacttgattcatcaactcttcctgtataaacagt
agctccacctattttaagccatttaacaattaagtcattcagtattcttgtttctttgct
ttcgtttatatacccaacagctcctgtaccttttccaattaaagtgtgccctggtattat
tactactttcaaactaacatctcctttacaattaaatttaacttctatttaatatatgca
taacctagaattttgtttctttttatatcttatacttttattataacccattttgtaaaa
atatagaatattaagtaaataatgttaaaattataattttgtatataagacattacttga
ttgcaataattttatagcatattcatctattctatatccagttctataatatatatgttt
aattccagcttgaattatagccttagtacaatttaagcaaggaaagtgagttacataaat
agagcaatttttaactgaaataccttcttttgcacaataataaagggcattttgttcagc
gtgaatggttctaatacaatgtccatctctcatttcatgaccaacttcactacaatgctt
atctccagaaatactaccattatatccagtagacactattctgttttctgaattgacaat
tatagctcctacataagctctatcacaagttcctctttcagctactgtttcgcacagtct
cataaaatattcttgccatgagcatctattttcaagttttttattcaaattatatacctc
caaaacttatatctaatatataagatttataccttaaaaataatattaaaaacaaattta
tacgataaataaaatttattaatactgtttttagtctaaattatttcattttaaattaaa
gttacaaggaatctaaaattatatacatctttcttcgtaatatgaatgttacaatataaa
aaactgtctcaataaaatagagacagttttacagtcaaagtttataatacaagttcatat
ttttctttaaattcttttacagcttcgggccattccttttgttctgtaatacctttttct
ttagctattttaattgcaatctctcttatcattgcagcgccttctaatattcccattttt
aatctcccttcaaatatctttttgtatagaatataaatagtgctaagatttattacatgc
tgcatatacaatatctatacaacacataacttgtaaattccttttattttcatacgtctt
taaccgacatataattatattcaataagttttaaaattatgaactcaattataattattt
ttatttttttagaatctaaacactaaaaattgtaggtaaatttgtcttatgcctttataa
atatttctacagttttaattactggacatatctatttttattataaaaagcgcttaaaaa
tcgagaatatccgcataaaaactgtatataagcaaaacggttaaaggaaaaagaagaaat
ttacttgaatgttaaaatgcgttgcttgaagcaatgggcagttttgcctataatatcggt
aacaactgaaagaaaggtggttagccctaatgttaagcgaaaacattaaaacaatcagga
agtcaaaaggactttcacaacaagaacttgctatcaaactgaatgtagtgcgacaaacaa
tatctaaatgggaacaaggactgtcggttcccgattctgatatgttgatttccatatcag
aggtgcttgaaacgcccgtaagcactttacttggagaaactattgttgagtcggaagttg
atagcttaaaagtgatttctgaaaaattagagattataaacttgcaacttgcacaaagaa
aaaacatgagaagaaaaatgtttcattggttatttattttattatgtgcagtcatattaa
tagtttttgtggtcttagggggactaaatagtccttacttggattggaattataccgacc
ctgaaactgctgtttttggagtagcttttcatgcttttgagtggctatttgtcagattag
taccgattgtccttataggagcaattattggaatctttttgacacgtaagaaaatatgaa
gtaactctgctttttataatacagcaagcgttccttaaaagtgtcattctacatggcaat
cgaggacaactatgtaaggaagaacctttttgatttccaactaagcgaagttattgagga
cgacagtaagaccaaaaccgcattaagtaaagtataggaaacaagactgctggacttata
ctctcatgcgtcagatgcaggaaatgcgaggtctggtagcatgatttacaacgatttgta
caacgactacgagtagaaatatatggagataagtattatctacgaaatcagaaaagaaat
gacttgataatttactcatgttataattattgatgtgaaatgaataaatcaaaattcctt
tttgggatttaacaataaggaaaaagtgaatg