Block details
fasta C_difficile_CD00005_1A_020472.fasta
contig u00000crpx_c_020472
start 1023995
length 13072
strand +
type core
seq tcttacaaattttaatatttgcagtaatttctatagcaatgttagtcgtagctactaaaa
aaatagtaaaaaaagataaaggctataaatctaacactaatttacaagcaatgatgtcta
aaaaaggtattgttacagaagagatttctccaaataacacaggtctagttgtagttgaac
atgaaacatggacggctatttctatagatggtgaaaagatagaaaaaggttctacagtag
aagtattaaaaattgaaggggtaaaattagttgttaaaaaagtagacgccacagttaatg
tgacaaaccaatagaataaaggaggatttatagtatgggtactaaaattgttttaagtat
tgtattaatagtagtagtcgtagcaataagtttaacttgtataagagttataaaacaatc
taaagtaggtataataatgagacttggtaagtttcaaaaagtagctgaaacaggtgtaca
tttcttaataccatttttagataaaatggcatatgtaattgaccttagagaaattgtaat
agattttccacctcaaccagttataactaaagataatgtaactatgcagattgatacagt
tgtatattataaagttacagacccagttagatatgtgtttgagatagctaatccaatagc
tgctattgaaaatttaacagctacaacactaagaaatataattggtgaacttgatttaga
tgaaacattaacatcaagagatataataaatgtaaaaatgagaactatccttgatgaagc
aacagataaatggggtataaaagtaaatagagtagagttaaaaaatataatgcctcctca
ggatattcaagttgcaatggaaaaacaaatgagagcagaaagagaaagaagagaggcaat
acttcaagcagaaggtaataagtcagctgcaatacttcaagcagaaggtgaaaaacaatc
tgcaatattaacagcagaagccaaaaaagaagctatggtacgtgtagcagaaggtgaaaa
agaatctgctatattagtggcagaaggtgaagctgaagctataagacagacagctattgc
taaggcacaaggtgaagctgaaatgataaaaagaactcaaatggcaacagcagaaggttt
aaaattagttttttcagcaatgaaagaggctgatatagacaataatattctagcattaaa
atctatggaagctcttgaaaaaatggctgaaggtaagtcaacaaaactggttttaccttc
agaagcagttaatttcctaggaacattcaaaggaataaaggaagttatgagtgatgataa
caaagaagtacttgatataaaagaagttttaaatgataatgaatcattaaaaaaataaaa
gagttttgttatcataggaaggatatggaaattaaaggtcgaattaattaaatatagcac
aaaaatgcacgttgaaaagaagaggacttataaatttttaagtcttcttctttgttttta
ttagaaagatgaaattataaaaataaattaacagaatctttatacaatttatcctttact
aatgtaaaaagtgttatataatataatataaaacatatagcaaataagcatggttttagt
tagtctatttatattattaatatatatttataaaaatataaacattaatactaagaaaac
taataaataatttaaaagtttatatccttttgtttaaattatagacaaagaagtatcaat
taaaaaataaagttgattaataattacttgattttctttggataattatttaacaaatat
tagattatattttgctattacgaatttaacaaattaaaaaataagcatgttcatatgaca
caaaggatttataaaaaatgtttttatatttataaaataaaatttgtattattttttaac
caataattgaatattaataaatactatagtgcttatggaaaataatgtatacgtcggtaa
gtccattatggggtatacattatatcaattgtatagttgatattattttatttttattaa
ggtattatttaagcaacatttatacacgacatttattgactgataaagtttataaaagta
aaaatgcaattataaatattaattactagatgaggggagtgtcattaaatgaaaaaagag
atgttagctatgattttggcaggagggcaaggttcaagattaggtgtttttacaaaaaga
attgccaaaccagctgtatcatttggaggtaagtatagaattatagattttgtgttaagc
aattgttcaaactctggtattgatactgtaggtgttttaactcaatatagaccgttgata
ttaaattcacatataggcatgggaagtcattgggatttggacagaataaatggtggtgtc
tatgttttacaaccatttatgaatgaaaaagaaggaaattggtataatggtacagcacat
gcgatatatcaaaatatggactttgtagatacctataatccagaatatgtattgatatta
tctggtgaccatatatacaagatggattatagcaaaatgttaaaatttcataaggaaaaa
ggctctaaagctacaatagcagtgattgaagttccttgggatgaagcttcaagatttggg
ataatgaatacaaatgaagattcaagtatctatgaatttgaagaaaaaccaagtgaacct
aagagcaatttggcatctatgggagtatacatatttgattggaaaatgttgagaaattat
tttaaggaagcagaaaaaaatccagaaataaattatgatgattttggaaaaaatttaata
cctaaaatgttagaagataatgttggaatgtatgcttatccatttaaaggatactggaga
gatgtaggaactatacaaagtctatgggatgctaatatggatataataaaatctccagaa
acacttgatttagcagaccctaagtggaagatatatacaaatactatggcaatgcctcca
caatatataggtaaaaatgcaaatgttcatagatcaatgatagctgatggttgtagaatt
ttaggtgaagtaggtaactctgtattatcacatggagttgttgttggtaaaggaagtaaa
gtaattgattcagtaataatgccaaatgttgtaataggtgaaaatgtaactatagaaaaa
gctatgataggtgagtgtgcaactataaatgataatgttcagataaagaatgtaaataat
gaaataaatgtagtttctgagtatgaaaatatcgaacctagatgcgtattaatagaagga
ggtctttaagatgagaaatgaatgtttagggataataaatttaaacaaaaaaggagaccc
agcaataaacaaacttaactatggaagaccaatagcatctacaccaatagctggaagata
tagaataatagactttgctttatctaatatgataaattcaggaatcactaaagttggaat
attcgcaaaagaaaaatacagatcattaacagaccatataggtagtggtaaagattggga
tttaagtagaaaaaaaggtggcctatcaatttttagtccagaaaacactaagtatagaaa
tacttactcacatagagaaggtgatatatatactatcttagctaatctagattatataga
aaagagtgaagaagaatatattttaatagctccaagctatatgctatgcaatttaaatta
ttctcaagcattggaataccataaaaaatctcataatgatataactataatatataaaaa
tgtaaataatgcaaataaagattttgctggtaacttaactctaaatttagatagtaacaa
tagggtaataaatgtaggaaataatttaggtaagttccctagagcaaacatatgtatgga
gacatatattatgaagcgtgaagattttgttgaatgtatatataacattgtaaataaagg
caattattgttatttagaagaatttattattgaagaagcagaaaatatgaaaataggagc
ctatgaatatacaggatatctaaaatgtgtaaattctgttgaatcatattttgaaatgag
caaagatttattaaatttagaagttgcagatgaattattatattctgaaagaaagatatt
tacaaaagaaaagaatgaatcacctacaatttatacagatagtgctaaagtagaaaatag
ctttatagcatctggttgtttaatagaaggtactgtaaaagatagtatcatatttagaaa
ggtaaatgttgaaaaaggaacagttatagagaactcaatagtaatgcaaaattgtgtaat
aaagtcaaatgcaaaactatataatgcaatattagataaaaatacgagtgtatcaaatgg
gaaagaattaagaggagatgaaaaatatcctcttgtagtggaaaagaatacaaatatata
aataaattttttagaagggggaatgactaatgaaggttttttatgtaacagcagagtgtt
ggccctttgcaaaaactggaggattaggagatgtttcttatgcattgcctaaagaattaa
aaaaagaaggtgtagatgtaagggtaataatgcccaaatattcaactataccaagttatt
taaaagatcaactaaaagaaatagctgtgtttagtgtacgtgttggatggagaaatcaat
actgtggtcttttagaaatggaattagatggtgtaaaattttactttatagataatgaat
tttattttagaagagaagatgaaagaaagagtatctatggatatggagatgatgcagaaa
gatatactttctttacagatgcagttttagaagctataagtagaattgatttttatccag
atgtaatacatataaatgattggcatacagggatgttaccattaattctaaaagaaagat
atgcaacccttgaggggtataaaaatataaaaactatgtatactatacataatctccaat
atcaaggtgtatttgataagcatgttttatatgatatattggacttaccacaaaaatact
ttgataatggagatatagagtattatggctcaataaattttatgaaagctggtataaatt
ttgcagataaaattataactgttagtcctacttatgcaaatgaaatacaaacatcttttt
atggtgaacaattagatggattacttagaaaagagtcaggaaaattaaaaggtatattaa
atggtatagattatgatttaaatgaccctgcaaaagataaagatatatttgttcattatg
atgtagactcaattgacaaaaaagtagaaaataaattgagattacaagatatattgggac
ttaaaaaagattcatctattccgttgataggtatagtttcgagattagtttctcaaaaag
gatttgatttaatagcatacatgatgccagaacttatgagagaagatttacagattgtcg
ttttaggaactggagaacatcaatatcaatcaatgttcaactattacgattctaattttt
cagataaagtatcagctagaattacttttaatgcatcattggctcaacagatatatgctg
caagtgatatgttcttaatgccatcattatttgagccttgtggtataggtcaaatgttag
ctatgagatatggttctttaccaatagttagagagactggagggcttagagatacagtaa
caccttataataaatttactggagaaggcaatggatttagttttaaaaattacaatgctc
atgagatgtttttctgtttgaaaaatgcaatcaaagtatttaaggacaaagaaaaatgga
ttaaattagttgaaaatgcaatgaaaacagataatagttggaaaaaatcagctaaggagt
atatagaaacatatagagacatatgtgattaaaggagtggtttttttggtaacaataagc
aaaaagaaattcaagcaaaaatttgaagtaaaaatgtatagcttatatgcacaatctatc
aaggaagctactgatgaacaattgttaaatgtattatgtagtctattgaaagatgagata
gcaaaaaaatgggttgctacaaagttagataagaaaaaagaagtttattattttagttta
gaatttttaatagggagacagttaaaatctaatttattaaatttaaatattgaagaagaa
gttagagaaggtttatctgaattaggaatcaacttggatgatttaattgaaactgaagta
gacccagccttaggaaatggtggacttggtagattagcagcttgctttttagattctatg
gcatctttgaacataagtggtcaaggatatggaataaggtataaatatggtctgtttgaa
caaaaatttgtaaatggttatcaggtagaagtgcctgataactggcttacagaaggacga
tatgcatgggaaactgtaagaccaaatgaagcaacaatggtgaagtttggtggtgaggta
gaattaatcaaggaaggtagtcatttaaaagtaattcataaaaactaccttcctgtaatg
gcaatgccttatgatataccaataatcggataccaaaaccaatgtataaatactttaaga
ttgtttaagagtgaaataccaaagagagattttggtgaacttacctcaaatgctctaaat
tattctggtagctatgaagaggctttaaaacataagtattatactgaggaaatatcacag
gtattatatcctgatgattcaaactatgcaggtaagttgttgaggttgaaacaagaatac
ttttttgtaagtgcagggatacaagatataataagaaaatataaaaagaacaaattaaat
attaataatttattcgataaggtagcaattcatataaatgatacacatcctaccttatgc
ataccagaacttatgagaattttgcttgatgaagaaaatttatcttgggatgaagcatgg
gaaataactaaaaaaacagtgtcctatactaatcatactataatgtcagaagcaatggaa
aaatggcctgtaagtatgatgaaagagctattaccaagaatttatatgataatagaagaa
ataaatagaagatatgtagaggaattaaataataaaggatatgaccaagatagaataaaa
agaatgagtataatagactgtgacaatatcaatatggcaaacttatgtattgtcacaagt
catagtgtaaatggagttgctaagcttcatactcatattcttgaaacagaggtattaaaa
gatttctatcaagatgaaccaaataaatttaataataagactaatggaattgcacatagg
cgatggcttataagttcaaatcctcaacttagcaatttaattacagatttaattggtgat
tcatggaagaaagatacattacaattaaaaaatattgaaaaatttaaaaatgattcctct
gttttacaaagacttgatgatataaaatacaataataaagcaaatctagcaaagtttata
aaagataaatacgatttaaatgtagacccaagttcgatatttgatgttcaagttaagaga
ttgcatgcgtataaaagacagttactgaatatatttaatgtacttcatatgtatcatgaa
ttacttgataatcctaatttgaatcttgacccaagaacttttatatttggcgcaaaagca
gcaccaggatattatttggctaaatgtataattaaatttataaattctgttgcaagtact
ataaataatgatgttagagtaaaggacaagttaaaagtagtatttttagagaattatgga
gtatcattagcagaaataataataccagcagcaaatgttagtgagcaaatttcaactaca
actaaggaagcatctggaacaagtaatatgaagtttatgatgaatggtgctataactttg
gctacacttgacggtgcaaatgtagagatatgtgaacaggttggtaaagaaaatatgttt
ttatttggacttagtgcagaacaagtactaaattataataaatatggtggatattcttca
cttgacctatatcattctaatatggatataaaaagggtagtagatgatttaataaatgga
tttattcctaatcttggcgaagaaggaagaagtatttataattcactcactacttacaat
gatgagtattttgtattgagagattttgaaaattatggtcaagctcaagcagatataaac
aggttatatagagataaagaaaaatggaataaaatgtctttagttaatatagctaactct
ggatttttttcttctgatagaacaatttctgagtatgcaaaagacatttggtttaaaagg
gtgtgattaaatgcaaagtgtaatagaatataactcttgggataaaaattttaaggctcc
gtttggagctttaaaatttgatgaggaattgaccatttgtgttaaagtaaatgagggata
caatatcaagtctatttccctagaaataaatagagaagaagaaatgagaacaataacttt
aaatgaagaattagataatgataaacttggaaagtgcttttgtggtaagattgaaaagtt
tgatggtacaggtgtttatttttattactttaaagttgatgttgaaatggatggtcaaat
aaagactttattttatggaaaaaacagagataatggatattcttgtgaatataattatag
tgatattaataaatatcaaatcactgtttataaagattttaaagtaccaacatggtacaa
agaaggaatactttatcatatatttgtagatagattcaataatggaaatcgtagtggtaa
ggttgataatcctaaaaaaaatagtttcatatatggaaattgggaagatacacctatgta
cataaaggatagtcaaggggatgttataagatgggatttccatggtggaaatttaagagg
gataatcaataaacttggatatttaaaaaaattaggtgtaagtatactatatctaagccc
tatatttgaagcctctagtaatcataagtatgatacaggtgactataaaaaaattgaccc
aatgtttggagatgaagatacatttaaagaacttattgataaagcaaaagaaaaaggtat
atcaatagtattagatggagtttttagtcatactggagcagatagtaaatattttaatat
gtatggaaactataatagtttaggagcatatcaatctaaagaatctccatattattcatg
gtatatgtttgaagaatttcctcaaaaatataaaagttggtgggatgttaagacattgcc
aaatataaatgaattagaacatagctatatggattatataatatatgacaatgatagcgt
tataaataaatgggtaaatatgggtattaagggctggagactagatgttgcagacgaatt
accaactaagtttataagagagttaaaaaaggaattaaaaaaggcagatgatgactcaat
tcttataggtgaagtatgggaagatgcatcaaataagattagctatggtcagagaagaag
ttatttattaggtgaagaattagattctgttatgggttatccttttagaaataacatgtt
ttctttcttaaaaggagaaattaattcatatgaactttgtaatagatatatgcagattaa
agaaaattatccaaaagaatcatttaggtctaatttaaatttaattggaacacatgatgt
tacaagagctaaaacggaattaaatgatgatgtagatttagtgaagcttgctgtagctat
acagatgacatttgaaggagtaccatatatatattatggagatgaagcaggtctttgtgg
aggtgttgatccagataatagaagaacttatccatggaaaaatgaagacgaagatatgct
taatttttatagagatgttataaaaattagaaataagaataaacttttaagttctggaaa
tacagaatttatatatactaataatgattctgtattttcttttattagagttaatgaaaa
taatgatagaatgttaattttagtaaatagaagtgaaaatgtggaaagtatatcattatg
tatagagagtagttttattgaggaaatacctataaagtatagtcttaaaaatgcaaatag
tactatacaaattgaaaataatgagttgaaagtagatttagactctaaatcatttagaat
ttttagagtaaattaaatatctttttttagaaaaataaatagaaaataaggcgaatgtgg
aaagagttttgttttatcaaaactttttctactttttttgtataaattatcataagaatt
ttagtatttcaaaatattacaaagaagtataaaaaatatcataattgtgatattatataa
attagtaagataaaactgaactctctaccaaagttgtagggagatttaacttttataatc
ttaatatggaggaacgtcttatgaaggtagatccacttacaactcaagtatatgactata
tatcaaagaaaatccaaaatggagaatatgaagctaatcagagaattactgaatctgaga
tttgtaaatctatcggagttagtagaacaccagcgagagaagcattaactaggttagcag
gtgaaaatttactagaaaaaatacctaataagggatttgtagtaaaagaatttcaggaaa
aggagaaattagacacctattccgtaattggagtattggatgcgttagccggttcttcag
cattacaaaatttaactgaatcagacctagtaaaaatggaagaattaacagaaatgatgg
cggtctctataaagtataaaaattacaatagctatttaaaattaagtaatgaatttcacg
atatatacataactaaatcagataatcaggtgttagtaaatctattgaactctttaagat
ataattttatgtcaaagtcatatactagtgataatgaagatgagttatataaaatgttga
catacagcaataatcaacatattgaagtagtaaaatctatgagggagaatgatttagaaa
atgttgaaagaattttgagagaacattggaaaacgatacctatagcagagatgaaaaaag
agaagcttttataaagtttctctttattttttttataattttgttgttttactattaaat
attaaaggaaaaacaagaataaatttaactttaaatacaaataaaaactctaaggcacta
cgatagaataatgtatttaaattaacatatataaatcaatgaacttatagaattttaata
tcataaatatagaatttattttatcaattaaaaaatttaataaattttatattaaaatta
aaatacaaaaataggaaaattatttagtccaactaaaccaagaattttgatatgtgaaat
aagaataatataaaagtttagtaataaaatacttataaattaaaaatagtaaactcaaaa
gcttactaaaactcaaaaaagtaaaaaaaccaaaataataaaaaataagaaagtttataa
atactaagttttaaaaaaattaatataaacaacaaaaaattaaaaagtttataaatattg
atatagctaatgtatatgtttttgagtaacttcaaaaaaacacttgtaaaaatgctggga
tgttaatataataaatatcatgagtttaataaaagtaaaaataaaaaatagaaataataa
ataataaatattaaaaatatttgaatatagagaggagatgaatttgaaatcatggatagc
gagtttgcaaatgcagttgaattaagctatgagtgtgctccattattagagtcgttaaag
gaatactcagagaaagatatagcttgttttgatgtgcctggacatgtaaaaaatagaggt
gtagctatattaaataaatatctaggtgaaagtctcatgaaaatggatataaattcatca
ccaactatggataatgtatctgcgccaaatgggattataaaaaatgcacaagatttgtta
gcacaagcatatatggctgatgaggcattctttataacgaatggcacaactcaagcaata
catgcaatgattttgagtgttataaaaccaggtgaaaaagtattacttccaagaaacata
cataaatcagtaataaatgcgttaatactttgtggaggaataccaatatttatacaacca
gaatttgatgaaaaactaggtataagtttaaatattactcttgaaaaagttagaacagag
atagaaaaagattgtaatataaaagcattatttttccttaatccaacttactatggagtt
tgtgcagaccttgagagtattatagaactatgccataaaaataatgttttagtgttagtt
gatgaagctcatggtgcacattttccatttcatttagatttacctccttctgcaataagt
ttgggagctgacatggtagctgtaagtatacataaaactggaggagcattgacacaatct
tcagcactcttattgaatagagataatgtaagttttgaaaaggttcttcaatcaatcaat
atgctacaatcaacatcagcatcttatttgcttatggcaagtatagatggtgctagagtt
aatctagttgagaatggtgaaaagcaattgtcaaaagcattaaatctatctaggtatgca
aaatctaaattgaacaaaattgatggaataaaagttttatctacagaaatattgaaacaa
aaaggtgttaaatttatagatgaaacaaaattgtgtataaatgtaaaagaattaaatttg
actggatttgaagtatacgatttattatataaaaatttttcaattcaagtagaattggga
gattcatataatatactggcacttgtgtccattggaacaaataaatcagatatagataga
ttagtaaaggcactttctataattgcaaagatttatagaaaagaatcaacattaaatgaa
tttaatatggttcaaataaatccaattattaaacttaatccaagagaagctttttatgca
ccaaaggaaagtgtagaaatcaattcatgtatagatagaatttgtggagaatc